魚蝦多家系多分組保種方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于水產(chǎn)養(yǎng)殖技術(shù)領(lǐng)域，具體地說，是涉及一種魚蝦多家系多分組保種方 法。
【背景技術(shù)】
[0002] 在水產(chǎn)動物選擇育種體系中，家系保種是一個非常重要的環(huán)節(jié)。保種家系可以作 為育種群體的備份種質(zhì)，構(gòu)建下一世代家系。例如，如果混養(yǎng)群體由于養(yǎng)殖管理不當(dāng)，出現(xiàn) 大規(guī)模死亡；或者由于對混養(yǎng)群體進(jìn)行了病毒感染試驗，存活個體無法直接留種，可以利用 保種家系的個體作為親本，構(gòu)建下一世代家系。
[0003] 現(xiàn)有魚蝦家系保種時，采用單獨養(yǎng)殖的方法留種優(yōu)秀家系和個體。具體來說，是從 每個家系中選擇一部分個體，單獨養(yǎng)殖在一個或幾個保種池中，養(yǎng)殖后留種優(yōu)秀家系及個 體。
[0004] 采用家系獨立養(yǎng)殖，如果某個保種家系感染細(xì)菌或病毒病，由于每個家系單獨養(yǎng) 殖，并不會感染至其他家系，其他保種家系仍然處于無特定病原狀態(tài)（specific pathogen free，SPF)狀態(tài)，從而可以保持核心種質(zhì)的SPF狀態(tài)。但是這種家系獨立養(yǎng)殖也存在著缺 點，由于每個保種池都是一個小環(huán)境，家系的直接遺傳效應(yīng)、保種池的環(huán)境效應(yīng)以及同家系 個體間的競爭效應(yīng)等都混淆在一起，無法區(qū)分，如果通過這種保種方法留種家系和個體，難 以對目標(biāo)性狀進(jìn)行有效的遺傳評估，進(jìn)而嚴(yán)重影響魚蝦選擇育種的準(zhǔn)確度。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0005] 本發(fā)明的目的是提供一種魚蝦多家系多分組保種方法，以解決現(xiàn)有保種方法因直 接遺傳效應(yīng)、間接遺傳效應(yīng)、環(huán)境效應(yīng)等混淆在一起而導(dǎo)致遺傳評估數(shù)據(jù)不準(zhǔn)確、影響魚蝦 選擇育種準(zhǔn)確度的問題。
[0006] 為實現(xiàn)上述發(fā)明目的，本發(fā)明采用下述技術(shù)方案予以實現(xiàn)：
[0007] 一種魚蝦多家系多分組保種方法，其特征在于，所述方法包括：
[0008] 確定測試池數(shù)量：確定所有測試家系的數(shù)量f·，設(shè)置與所述測試家系數(shù)量相等的 測試池 t = f ;
[0009] 測定測試家系的目標(biāo)性狀值：將每個所述測試家系中的個體等分為g個分組，每 個分組包含k尾個體，測定并記錄所述每個分組內(nèi)每尾個體的目標(biāo)性狀值，計算每個分組 內(nèi)所有個體的目標(biāo)性狀平均值并記錄；
[0010] 家系分配：將所有所述測試家系的所有分組內(nèi)的個體以分組為單位、按照下述限 定條件分配到所述測試池中：每個所述測試家系的g個分組分別分配到g個不同的測試池 中，每個所述測試池均包括有g(shù)個不同家系的分組，任意兩個所述測試家系在每個所述測 試池中同時出現(xiàn)的次數(shù)不大于1 ;每個所述測試池內(nèi)所有g(shù)個所述測試家系的家系目標(biāo)性 狀變異系數(shù)不大于f個所述測試家系的家系目標(biāo)性狀變異系數(shù)和/或每個所述測試池內(nèi)的 所有個體的個體目標(biāo)性狀變異系數(shù)不大于f個所述測試家系內(nèi)的所有個體的個體目標(biāo)性 狀變異系數(shù)；每個所述測試池內(nèi)所有g(shù)個所述測試家系間的親緣系數(shù)平均值不大于f個所 述測試家系間的親緣系數(shù)平均值；所述個體目標(biāo)性狀變異系數(shù)為相關(guān)個體目標(biāo)性狀值的標(biāo) 準(zhǔn)差除以相關(guān)個體目標(biāo)性狀平均值，所述家系目標(biāo)性狀變異系數(shù)為相關(guān)家系目標(biāo)性狀值的 標(biāo)準(zhǔn)差除以相關(guān)家系目標(biāo)性狀平均值，家系目標(biāo)性狀值為該家系內(nèi)相關(guān)個體目標(biāo)性狀值的 平均值；
[0011] 測試池養(yǎng)殖測試家系：將按照上述限定條件分配到測試池中的測試家系進(jìn)行養(yǎng) 殖，達(dá)到指定養(yǎng)殖要求；
[0012] 測定達(dá)到指定養(yǎng)殖要求的存活家系的目標(biāo)性狀值：達(dá)到指定養(yǎng)殖要求后，測定并 記錄每個所述測試池內(nèi)存活個體的目標(biāo)性狀值；
[0013] 計算存活個體的直接遺傳效應(yīng)值和間接遺傳效應(yīng)值：依據(jù)上述家系分配分案、所 述存活個體的目標(biāo)性狀值和所述存活個體的系譜信息建立線性混合效應(yīng)模型，利用最佳線 性無偏預(yù)測法計算每個所述存活個體的直接遺傳效應(yīng)值和間接遺傳效應(yīng)值；
[0014] 計算綜合選擇指數(shù)：按照公式$ =氣+ (gxk- Dxa,.計算每個所述存活個體的綜 f 合育種值，按照公式A =i〇〇+i〇x 計算每個所述存活個體的個體綜合選擇指數(shù)；對 I cj^ J 屬于同一家系的存活個體的個體綜合選擇指數(shù)求平均值，獲得家系綜合選擇指數(shù)；
[0015] 其中，Ti表示第i個存活個體的綜合育種值，氣表示第i個存活個體的直接遺傳 效應(yīng)值，氣表示第i個存活個體的間接遺傳效應(yīng)值，I i表示第i個存活個體的個體綜合選 擇指數(shù)，f表示所有存活個體綜合育種值的平均值，σ τ表示所有存活個體綜合育種值的標(biāo) 準(zhǔn)差；
[0016] 選擇留種家系和留種個體：根據(jù)所述家系綜合選擇指數(shù)從高到低依次選擇一定數(shù) 量的家系作為留種家系，從留種家系內(nèi)根據(jù)所述個體綜合選擇指數(shù)從高到低依次選擇一定 數(shù)量的存活個體作為留種個體。
[0017] 優(yōu)選的，所述測試家系的數(shù)量f滿足：f多31 ;每個所述測試家系的分組數(shù)g滿足： 3 < g < 6 ;所述每個分組包含的個體數(shù)量k滿足：5 < k < 30。
[0018] 與現(xiàn)有技術(shù)相比，本發(fā)明的優(yōu)點和積極效果是：
[0019] 本發(fā)明通過設(shè)計新的保種分配方案，將多個測試家系進(jìn)行分組，以分組為單位進(jìn) 行分配養(yǎng)殖和保種測試，有效剖分出了個體的直接遺傳效應(yīng)和間接遺傳效應(yīng)，根據(jù)直接遺 傳效應(yīng)和間接遺傳效應(yīng)獲得的目標(biāo)性狀值充分利用了個體間的遺傳變異，準(zhǔn)確度高、結(jié)果 可靠、遺傳進(jìn)展性強，有助于降低后續(xù)魚蝦選擇育種過程中個體間競爭和提高選擇育種準(zhǔn) 確度。
[0020] 結(jié)合附圖閱讀本發(fā)明的【具體實施方式】后，本發(fā)明的其他特點和優(yōu)點將變得更加清 楚。
【附圖說明】
[0021] 圖1是本發(fā)明魚蝦多家系多分組保種方法一個實施例的流程圖。
【具體實施方式】
[0022] 為了使本發(fā)明的目的、技術(shù)方案及優(yōu)點更加清楚明白，以下將結(jié)合附圖和實施例， 對本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)說明。
[0023] 請參見圖1，該圖所示為本發(fā)明一種魚蝦多家系多分組保種方法一個實施例的流 程圖。具體而言，是對凡納濱對蝦采用多家系多分組保種的一個實施例。如圖1所示，該實 施例的方法包括如下的步驟：
[0024] 步驟1 :確定測試池數(shù)量。
[0025] 確定進(jìn)行測試的測試家系的數(shù)量f，設(shè)置與測試家系數(shù)量相等的測試池 t = f。
[0026] 凡納濱對蝦是目前我國養(yǎng)殖產(chǎn)量最高的對蝦品種，年養(yǎng)殖產(chǎn)量超過120萬噸，占 我國對蝦養(yǎng)殖總產(chǎn)量的80%以上。目前我國凡納濱對蝦種質(zhì)主要引自美國，國內(nèi)商品苗種 多為二代苗種或者多代自繁苗種。凡納濱對蝦產(chǎn)卵量大，苗種累代養(yǎng)殖后可能會產(chǎn)生近交 衰退現(xiàn)象。當(dāng)前我國養(yǎng)殖的凡納濱對蝦已經(jīng)出現(xiàn)了發(fā)病率與死亡率上升、生長速度下降、規(guī) 格參差不齊、形態(tài)畸形等種質(zhì)衰退的現(xiàn)象。培育生長快、抗逆性強的新品種（系）是當(dāng)前凡 納濱對蝦產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展亟待解決的關(guān)鍵問題。
[0027] 收獲體重一直是凡納濱對蝦遺傳改良的主要目標(biāo)性狀。利用凡納濱對蝦2012G1 代核心群性腺發(fā)育成熟的親蝦，通過人工授精技術(shù)，每個家系2-3尾雄蝦與來自不同家系 的2-3個雌蝦配對，建立了 105個全同胞家系。每個家系在一個單獨的170L圓通內(nèi)養(yǎng)殖， 幼體餌料由角毛藻、蝦片、螺旋藻、鹵蟲和配合飼料組成，每4小時投喂一次，投喂量和投喂 比例根據(jù)對蝦不同發(fā)育階段進(jìn)行調(diào)整。每天換水，換水量逐漸增加，仔蝦階段換水量達(dá)到 100%〇