專利名稱：一段白色念珠菌dna序列(2)特異性的確定及其應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及一段白色念珠菌(Candida albicans)DNA序列(2)的特異性確定及其應(yīng)用，屬于生物醫(yī)學技術(shù)領(lǐng)域。
本發(fā)明的技術(shù)方案為本發(fā)明利用現(xiàn)有的方法確定了長度為184bp的一段白色念珠菌(Candida albicans)特異DNA序列(2)及其PCR引物，用引物進行PCR擴增，其序列如下ccaaaatcaa ccaactgaag gtttcacatt attttctcat cgatcagctc ctaatggatt 60taaagttgcc ataatattat cagaattgaa tttacctttt aatacatttt ttttggattt 120taataatgga gaacaaagaa ctcctgaatt tgttaccata aaccctaatg ctagagtacc 180agca 184引物序列為1.5’-ccaaaatcaaccaactgaagg-3’2.5’-tgctggtactctagcattaggg-3’上述的白色念珠菌特異DNA序列(2)用于診斷白色念珠菌的基因芯片的探針序列，并通過上述的引物序列進行PCR擴增，標記后進行雜交檢測或直接用于PCR診斷。
用本發(fā)明建立的臨床檢測技術(shù)所使用的方法具有快速、準確、操作簡便、成本低等優(yōu)點。
圖2、圖2續(xù)是測序圖。其中圖2是測定的序列、圖2續(xù)是原始測序圖譜。
圖3是用Blast軟件對PCR擴增產(chǎn)物的測序結(jié)果與預(yù)計序列的比較分析。
圖4、圖4續(xù)(1)、圖4續(xù)(2)、圖4續(xù)(3)是基因數(shù)據(jù)庫中Blast搜索結(jié)果。
圖5.基因芯片雜交結(jié)果。
本發(fā)明可用于PCR方法或基因芯片方法進行白色念珠菌的臨床檢測。用本發(fā)明提供的序列進行PCR擴增，根據(jù)PCR方法獲得產(chǎn)物是否出現(xiàn)和大小判斷是否為白色念珠菌感染。也可用本序列為探針，作為基因芯片中的一個檢測位點，然后用本發(fā)明中的PCR引物序列擴增臨床標本，并標記后進行雜交檢測。
說明書序列表<110>昆明寰基生物芯片開發(fā)有限公司<120>一段白色念珠菌DNA序列(2)特異性的確定及其應(yīng)用<140><141><160>1<210>1<211>184<212>DNA<213>白色念珠菌(Candida albicans)<220><221>gene<222>(1)…(184)<400>1ccaaaatcaa ccaactgaag gtttcacatt attttctcat cgatcagctc ctaatggatt 60taaagttgcc ataatattat cagaattgaa tttacctttt aatacatttt ttttggattt 120taataatgga gaacaaagaa ctcctgaatt tgttaccata aaccctaatg ctagagtacc 180agca 18權(quán)利要求
1.一段白色念珠菌特異DNA序列(2)特異性的確定，其特征在于該序列的長度為184bp，序列及PCR引物如下ccaaaatcaa ccaactgaag gtttcacatt attttctcat cgatcagctc ctaatggatt 60taaagttgcc ataatattat cagaattgaa tttacctttt aatacatttt ttttggattt 120taataatgga gaacaaagaa ctcctgaatt tgttaccata aaccctaatg ctagagtacc 180agca 184引物序列為1.5’-ccaaaatcaaccaactgaagg-3’2.5’-tgctggtactctagcattaggg-3’
2.一段白色念珠菌DNA序列(2)特異性的應(yīng)用，其特征在于該序列用于診斷白色念珠菌的基因芯片的探針序列，并通過上述的引物序列進行PCR擴增，標記后進行雜交檢測或直接用于PCR診斷。
全文摘要
本發(fā)明涉及一段白色念珠菌DNA序列(2)特異性的確定及其應(yīng)用，屬于生物醫(yī)學技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明通過基因數(shù)據(jù)庫資料的搜尋和分析，確定了一段白色念珠菌DNA序列(2)的特異性及PCR擴增引物，該序列長度為184bp。通過對婦女生殖道白色念珠菌感染標本的PCR擴增，克隆，獲得該序列，測序證明與預(yù)計序列一致。再經(jīng)生物信息學方法分析，基因芯片雜交分析，結(jié)果證實了該序列對于白色念珠菌的特異性。本發(fā)明作為基因芯片診斷的探針及PCR擴增檢測序列，用于白色念珠菌的診斷。用本發(fā)明建立的臨床檢測技術(shù)所使用的方法具有快速、準確、操作簡便、成本低等優(yōu)點。
文檔編號C12Q1/68GK1465707SQ0211388
公開日2004年1月7日 申請日期2002年6月12日 優(yōu)先權(quán)日2002年6月12日
發(fā)明者譚德勇, 朱寶生 申請人:昆明寰基生物芯片開發(fā)有限公司