專利名稱::使用brca1相關(guān)蛋白(brap)基因內(nèi)單核苷酸多態(tài)性判定炎癥性疾病的方法
技術(shù)領(lǐng)域:
:本發(fā)明涉及炎癥性疾病的診斷方法,該方法包含檢測存在于BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因中的基因多態(tài)性;還涉及該方法中使用的寡核苷酸、含有該寡核苷酸的炎癥性疾病診斷用試劑盒、以及它們的應(yīng)用。
背景技術(shù):
:即使生活方式變化以及新的藥理學(xué)研究進(jìn)展,包括心肌梗塞在內(nèi)的冠狀動脈疾病在很多國家仍成為主要的死亡原因。因此,人們強(qiáng)烈希望能夠鑒定其發(fā)病中的遺傳性以及環(huán)境性因子。已知共同(共通)的遺傳變異與罹患糖尿病或高血壓等生活方式病的危險(xiǎn)性顯著相關(guān)。鑒定多基因性疾病的易感基因可以有利用“連鎖”的方法以及利用“相關(guān)”的方法。連鎖分析是檢測疾病易感基因的基因座與基因標(biāo)記(主要是微衛(wèi)星)的基因座是否連鎖、即,研究基因座之間的關(guān)系;而相關(guān)性分析是檢測特定的基因標(biāo)記(主要是單核苷酸多態(tài)性SNP)的哪一個態(tài)(等位基因)與疾病相關(guān)、即,研究等位基因之間的關(guān)系。因此可以說,使用共同的變異作為標(biāo)記的相關(guān)性分析比疾病相關(guān)基因的局部存在的連鎖分析強(qiáng)很多。單核苷酸多態(tài)性(SNPs)是研究與疾病的易罹患性或藥物反應(yīng)性相關(guān)的基因時(shí)有用的多態(tài)性標(biāo)記。SNPs對基因產(chǎn)物的質(zhì)或量有直接影響,使某種疾病或藥物的嚴(yán)重副作用產(chǎn)生的危險(xiǎn)性增加。因此,期待通過研究多個SNPs,有助于疾病相關(guān)基因的鑒定或建立避免藥物副作用的診斷方法。關(guān)于基因變異與心肌梗塞的關(guān)系有以下方法分析淋巴毒素-a(LT-α)基因、IKappaB-Iike(IKBL)基因、或BATl基因的多態(tài)性,判定心肌梗塞的遺傳性因素的方法(W02004/015100號公報(bào));分析半乳凝素_2的多態(tài)性,判定心肌梗塞的遺傳性因素的方法(國際公開W02005/017200號公報(bào))等。還有人報(bào)道了醛脫氫酶2基因內(nèi)的SNP與心肌梗塞的相關(guān)性(S.Takagi等人.,HypertensRes.Vol.25,No.5(2002),677681頁)。但是這些報(bào)告中,樣品數(shù)、P值均不充分,數(shù)據(jù)的可靠性低。即,該文獻(xiàn)中,只是用少量的樣品數(shù)分析了ALDH2的SNP,因此可以認(rèn)為是基因分型錯誤,結(jié)果的可靠性低,其顯著性也低。如上所述,與心肌梗塞有關(guān)的基因變異的研究尚不足夠。非專利文獻(xiàn)1:S.Takagi等人.,HypertensRes.Vol.25,No.5(2002),677681頁專利文獻(xiàn)1國際公開W02004/015100號公報(bào)專利文獻(xiàn)2國際公開W02005/017200號公報(bào)
發(fā)明內(nèi)容發(fā)明所要解決的課題本發(fā)明要解決的課題是鑒定與心肌梗塞等炎癥性疾病的發(fā)病進(jìn)展相關(guān)的新型單4核苷酸多態(tài)性(SNP)。本發(fā)明進(jìn)一步要解決的課題是利用鑒定的SNP,提供心肌梗塞等炎癥性疾病的診斷方法、或炎癥性疾病的治療藥物的開發(fā)方法。解決課題的方法本發(fā)明人等為解決上述課題進(jìn)行了深入研究,結(jié)果通過鑒定BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因內(nèi)的單核苷酸多態(tài)性(SNP)與心肌梗塞的發(fā)病進(jìn)展相關(guān),完成了本發(fā)明。S卩,本發(fā)明提供以下的發(fā)明。(1)炎癥性疾病的判定方法,該方法包含檢測存在于BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因中的至少一種基因多態(tài)性。(2)炎癥性疾病的判定方法,該方法包含檢測存在于BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因中的至少一種單核苷酸多態(tài)性。(3)炎癥性疾病的判定方法,該方法包含檢測以下任意一種多態(tài)性(i)SEQIDNO1所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸的A/G多態(tài)性(NCBISNPDatabase中的登記號為rs3782886);(ii)SEQIDNO2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性(NCBISNPDatabase中的登記號為rsll066001);或(iii)與上述(i)或(ii)所述的多態(tài)性的連鎖不平衡的指標(biāo)r2為0.8以上(優(yōu)選為0.9以上)的連鎖不平衡狀態(tài)的多態(tài)性。(4)(1)(3)中任一項(xiàng)所述的方法,其中,炎癥性疾病是心肌梗塞。(5)寡核苷酸,該寡核苷酸可以與連續(xù)的至少10個核苷酸序列或其互補(bǔ)序列雜交,在(1)(4)中任一項(xiàng)所述的方法中作為探針使用,其中,上述連續(xù)的至少10個核苷酸序列或其互補(bǔ)序列含有SEQIDNO1所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸的A/G多態(tài)性、或SEQIDNO2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性。(6)寡核苷酸,該寡核苷酸可以擴(kuò)增連續(xù)的至少10個核苷酸序列和/或其互補(bǔ)序列,在(1)(4)中任一項(xiàng)所述的方法中作為引物使用,其中,上述連續(xù)的至少10個核苷酸序列和/或其互補(bǔ)序列含有SEQIDNO:1所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸的A/G多態(tài)性、或SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性。(7)(6)所述的寡核苷酸,其中,引物是正向引物和/或反向引物。(8)炎癥性疾病診斷用試劑盒,該試劑盒含有(5)(7)中任一項(xiàng)所述的寡核苷酸的1種以上。(9)(8)所述的試劑盒,其中,炎癥性疾病是心肌梗塞。(IO)BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的表達(dá)狀態(tài)的分析方法,該方法包含檢測SEQIDNO1所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸的A/G多態(tài)性、或SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性。(11)炎癥性疾病的治療藥物的篩選方法,該方法包含以下步驟在候選物質(zhì)的存在下,分析細(xì)胞內(nèi)的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的表達(dá)量或BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的功能,選擇抑制該表達(dá)量的物質(zhì)、或者抑制或修飾該功能的物質(zhì)。5(12)BRAP的轉(zhuǎn)錄活性的測定方法,該方法包含將BRAP基因片段導(dǎo)入細(xì)胞中,培養(yǎng)該細(xì)胞,分析該基因的表達(dá),其中,所述BRAP基因片段含有SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性。(13)抑制或促進(jìn)BRAP的轉(zhuǎn)錄活性的物質(zhì)的篩選方法,該方法包含將BRAP基因片段導(dǎo)入細(xì)胞中,在抑制或促進(jìn)BRAP轉(zhuǎn)錄活性的候選物質(zhì)的存在下培養(yǎng)該細(xì)胞,分析該基因的表達(dá),其中,所述BRAP基因片段含有SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性。(H)BRAP的轉(zhuǎn)錄控制因子的篩選方法,該方法包含使BRAP基因片段與預(yù)想存在BRAP的轉(zhuǎn)錄控制因子的試樣接觸,檢測上述片段與轉(zhuǎn)錄控制因子的結(jié)合,其中,所述BRAP基因片段含有SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性。發(fā)明效果根據(jù)本發(fā)明,新鑒定了與心肌梗塞等炎癥性疾病的發(fā)病進(jìn)展相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性(SNP)。通過利用本發(fā)明鑒定的SNP,可以提供心肌梗塞等炎癥性疾病的診斷方法、或炎癥性疾病的治療藥物的開發(fā)方法。圖1表示通過TAP法鑒定BRAP(a)、通過C0S7強(qiáng)制表達(dá)系統(tǒng)確認(rèn)BRAP和半乳凝素_2的結(jié)合(b)、以及血管平滑肌細(xì)胞中半乳凝素_2與BRAP的共同存在(c)。圖2是表示冠狀動脈血管平滑肌細(xì)胞中的BRAP內(nèi)含子3A/GSNP的螢光素酶測定(a)、冠狀動脈血管平滑肌細(xì)胞提取液中的BRAP內(nèi)含子3A/GSNP區(qū)的凝膠移位分析(b)、冠狀動脈血管內(nèi)皮細(xì)胞中的BRAP、ALDH2敲除帶來的NFκB活性的變化。具體實(shí)施例方式本發(fā)明中,鑒定出BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因產(chǎn)物與作為心肌梗塞等炎癥性疾病易感基因產(chǎn)物而已知的半乳凝素_2基因產(chǎn)物結(jié)合。通過利用本發(fā)明鑒定的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的SNP,可以得到心肌梗塞等炎癥性疾病的新型診斷、預(yù)防方法、以及治療藥物的開發(fā)。以下對于本發(fā)明的實(shí)施方案進(jìn)一步具體說明。[1]炎癥性疾病的判定方法本發(fā)明的方法是通過檢測存在于顯示與炎癥性疾病相關(guān)性的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因中的基因多態(tài)性、特別是單核苷酸多態(tài)性(SNPs),來判定炎癥性疾病是否發(fā)病、或者炎癥性疾病發(fā)病的可能性的方法。本發(fā)明中,“檢測存在于BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因中的至少一種基因多態(tài)性(單核苷酸多態(tài)性等)”是指(i)直接檢測該基因多態(tài)性(稱為基因側(cè)多態(tài)性)、以及(ii)檢測存在于上述基因的互補(bǔ)序列一側(cè)的基因多態(tài)性(稱為互補(bǔ)側(cè)多態(tài)性),由該檢測結(jié)果推定基因側(cè)多態(tài)性。但是,基因側(cè)的核苷酸與互補(bǔ)序列一側(cè)的核苷酸并不一定完全是互補(bǔ)的關(guān)系,因此更優(yōu)選直接檢測基因側(cè)多態(tài)性。存在于BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)2基因中的基因多態(tài)性的優(yōu)選具體例子有(i)SEQIDNO=I所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸的A/G多態(tài)性(NCBISNPDatabase中的登記號為rs3782886);(ii)SEQIDNO2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性(NCBISNPDatabase中的登記號為rsll066001);或(iii)與上述(i)或(ii)所述的多態(tài)性的連鎖不平衡的指標(biāo)r2為0.8以上(優(yōu)選為0.9以上)的連鎖不平衡狀態(tài)的多態(tài)性。需要說明的是,SEQIDNO=I中第90號的核苷酸r表示為A或G的任意一種。SEQIDNO2中第270號的核苷酸r表示為A或G的任意一種。與上述(i)或(ii)所述的多態(tài)性的連鎖不平衡的指標(biāo)r2為0.8以上(優(yōu)選為0.9以上)的連鎖不平衡狀態(tài)的多態(tài)性可以是BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因內(nèi)的該多態(tài)性、以及FLJ30092基因內(nèi)的該多態(tài)性,還可以是上述2種基因以外的基因內(nèi)的該多態(tài)性。其中FLJ30092基因是AF-I特異性蛋白質(zhì)磷酸酶基因。與上述(i)或(ii)所述的多態(tài)性的連鎖不平衡的指標(biāo)r2為0.8以上(優(yōu)選為0.9以上)的連鎖不平衡狀態(tài)的多態(tài)性的具體例子有FLJ30092基因內(nèi)的SNP(NCBISNPDatabase中的登記號為is2074356)、醛脫氫酶2家族(ALDH2)基因內(nèi)的2個SNP(NCBISNPDatabase中的登記號為rs671和rs4646776)等。例如,如后述的表4所示,SEQIDNO1所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸為A時(shí),則可以判定炎癥性疾病不發(fā)病、或者發(fā)病的可能性低。與此相對,SEQIDNO=I所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸為G時(shí),則可以判定炎癥性疾病發(fā)病、或發(fā)病的可能性高。本發(fā)明中,可以使用與上述⑴或(ii)所述的多態(tài)性的連鎖不平衡的指標(biāo)Δ2為0.8以上(優(yōu)選為0.9以上)的連鎖不平衡狀態(tài)的多態(tài)性。假設(shè)有2個連鎖的基因座。假設(shè)都存在兩個等位基因(如SNP的兩個等位基因座雙等位基因座),第一基因座的等位基因稱為1,2、第二基因座的等位基因稱為1,2(當(dāng)然第一基因座和第二基因座的等位基因1是不同的)。如果第一基因座和第二基因座沒有連鎖不平衡,則染色體具有第一基因座1,2的其中一個、還是第二基因座1,2的其中一個,這有四個單元型。各自單元型的頻率如下。[表1]單元型頻率單元型(笫一基因座-第二基因座)頻率~Πρ1-2ρ122-1p212-2p22這種情況下,各基因座的等位基因1,2的頻率如下。[表2]等位基因頻率“·”不是乘積的符號,而是點(diǎn)?!皃i·”是一個變數(shù)。如果沒有連鎖不平衡,則1-1的單元型的頻率是第一基因座、第二基因座的等位基因1的頻率的界值(関)。即沒有連鎖不平衡,則pll=pi·ρ·1但是如果有連鎖不平衡,則上式不成立。如下式所示,用D表示其偏離程度,則D=pll-pl·ρ·1這樣,四個單元型的頻率可以使用等位基因的頻率和D,如下表示。[表3]連鎖不平衡存在下的單元型頻率等位基因頻率將D稱為連鎖不平衡系數(shù)。D也可如下表示。D=pllp22-pl2p21沒有連鎖不平衡時(shí),D=0,D>0時(shí),稱為正的連鎖不平衡。以r作為重組比例,則D是每個世代以r的比例減少。S卩,以某一世代的連鎖不平衡系數(shù)為D,則η世代后的連鎖不平衡系數(shù)Dn為Dn=(l-r)nD實(shí)際上都希望所有的單元型頻率與等位基因頻率取0和1之間的值,因此D的范圍如下限定。S卩,D>0或D=O時(shí),D的可取的最大值是Dmax=min(pi·ρ·2,ρ2·ρ·1)D<0時(shí),D的可取的最小值是Dmin=max(_pl·ρ·1,_ρ2·ρ·2)因此如下所述,將連鎖不平衡系數(shù)用標(biāo)準(zhǔn)化的以下的值表示。D,=D/Dmax(D為正時(shí))D,=D/Dmin(D為負(fù)時(shí))[也有論文稱D<0時(shí),D,=_D/Dmin]上述定義時(shí),D’一定為正或0。[但是,[]內(nèi)則為D<0]除D或D’以外,還可使用以下的P。P2等于x2/n,常常用Δ2表示。Δ2=ρ2=D2/(pi·ρ2·ρ·Ip·2)8包括這些都是常用的連鎖不平衡的指標(biāo)t上述Δ2(或ρ2)與連鎖不平衡的指標(biāo)r2同含義。上述多態(tài)性中,對于其中的等位基因頻率,任意的患者群比任意的非罹患者群中都顯著高,這可用作本發(fā)明的診斷方法?;颊呷号c非罹患者群只要分別是含有可以產(chǎn)生統(tǒng)計(jì)學(xué)上可靠的結(jié)果的足夠數(shù)量的群即可,其大小(樣品數(shù))、各樣品的背景(例如籍貫、年齡、性別、疾病等)等沒有特別限定。本說明書中,疾病的“判定”是指判斷是否有疾病發(fā)病、判斷疾病發(fā)病的可能性(罹患危險(xiǎn)性的預(yù)想)、疾病的遺傳因素的研究等。疾病的“判定”可以將上述單核苷酸多態(tài)性的檢測方法的結(jié)果與根據(jù)需要的其它的多態(tài)性分析(VNTR或RFLP)和/或其它的檢查結(jié)果結(jié)合進(jìn)行。本說明書中,“炎癥性疾病”只要是可確認(rèn)誘導(dǎo)了已知與炎癥性病態(tài)相關(guān)的細(xì)胞粘著因子或細(xì)胞因子的疾病即可,沒有特別限定,例如有慢性類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、全身性紅斑狼瘡、炎癥性腸炎、各種變態(tài)反應(yīng)、細(xì)菌性休克、心肌梗塞或腦卒中等動脈硬化性疾病等,特別是心肌梗塞。(檢測對象)基因多態(tài)性的檢測對象優(yōu)選基因組DNA,還可以根據(jù)情況(即多態(tài)性位點(diǎn)及其相鄰區(qū)域的序列與基因組相同或完全互補(bǔ)時(shí))使用cDNA或mRNA。采集上述對象的試樣可以是任意的生物學(xué)試樣,例如有血液、髓液、精液、腹腔液、尿等體液;肝臟等組織細(xì)胞;毛發(fā)等體毛等?;蚪MDNA等可按照常規(guī)方法由這些試樣中提取、純化,進(jìn)行制備。(擴(kuò)增)檢測基因多態(tài)性時(shí),首先擴(kuò)增含有基因多態(tài)性的部分。擴(kuò)增例如通過PCR法進(jìn)行,也可以按照其它公知的擴(kuò)增方法、例如NASBA法、LCR法、SDA法、LAMP法等進(jìn)行。關(guān)于引物的選擇,例如是可以擴(kuò)增SEQIDNO:1或SEQIDNO2所示的序列中含有上述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的連續(xù)的至少10個核苷酸以上、優(yōu)選10100個核苷酸、更優(yōu)選1050個核苷酸的序列和/或其互補(bǔ)序列的引物。引物只要是為了擴(kuò)增含有上述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的規(guī)定核苷酸數(shù)的序列而發(fā)揮引物的功能即可,其序列中可以含有1或多個取代、缺失、添加。用于擴(kuò)增的引物可以選擇正向引物或反向引物的其中一方與單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)雜交,這樣可以只在試樣有一對等位基因型時(shí)擴(kuò)增。引物可根據(jù)需要用熒光物質(zhì)或放射性物質(zhì)等標(biāo)記。(基因多態(tài)性的檢測)基因多態(tài)性的檢測可通過與一對等位基因型特異性的探針雜交來進(jìn)行。探針可以根據(jù)需要用熒光物質(zhì)或放射性物質(zhì)等適當(dāng)?shù)氖侄芜M(jìn)行標(biāo)記。探針只要是含有上述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)、與被檢試樣雜交、具有在所采用的檢測條件下可檢測的程度的特異性即可,沒有特別限定。探針可以使用寡核苷酸,該寡核苷酸可以與SEQIDNO:1或SEQIDNO:2所示的序列中含有上述單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)的連續(xù)的10個核苷酸以上、優(yōu)選10100個核苷酸的序列、更優(yōu)選1050個核苷酸的序列或它們的互補(bǔ)序列進(jìn)行雜交。還優(yōu)選選擇單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)幾乎存在于探針的中心部的寡核苷酸。該寡核苷酸只要可發(fā)揮探針的功能,即、在與目標(biāo)等位基因型的序列雜交、但與其它等位基因型的序列不雜交的條件下進(jìn)行雜交即可,其序列中可以含有1或多個取代、缺失、添加。探針包含象RCA(滾環(huán)擴(kuò)增)法擴(kuò)增中使用的單鏈探針(掛鎖探針)那樣,與基因組DNA退火、通過形成環(huán)狀來滿足上述探針的條件的探針。本發(fā)明中使用的雜交條件是足以區(qū)分等位基因型的條件。例如,試樣為一個等位基因型時(shí)可雜交、而為其它等位基因型時(shí)則不雜交的條件,例如嚴(yán)格的條件。這里,“嚴(yán)格的條件”例如有分子克隆實(shí)驗(yàn)室手冊第2版(Sambrook等人.,1989)所記載的條件等。具體例如有在含有6XSSC(IXSSC的組成0.15MNaCUO.015M檸檬酸鈉,ρΗ7.0)、0·5%SDS,5Xdenhardt和100mg/ml鯡魚精子DNA的溶液中與探針一起在65°C下保溫過夜的條件等。探針可以將其一端固定在基板上,作為DNA芯片使用。此時(shí),DNA芯片中可以只固定與一個等位基因型對應(yīng)的探針,也可以固定與兩個等位型基因型對應(yīng)的探針?;蚨鄳B(tài)性的檢測可通過限制酶切片段長度多態(tài)性分析法(RFLPRestrictionfragmentlengthpolymorphism)進(jìn)行。該方法中,用限制酶來消化試樣核酸,根據(jù)單核苷酸多態(tài)性是哪一種基因型,其可能或未被限制酶切割,通過研究消化物的片段的尺寸來研究試樣核酸是否被該限制酶切割,由此分析試樣的多態(tài)性。基因多態(tài)性的檢測可以通過直接測序確定擴(kuò)增產(chǎn)物來進(jìn)行(直接測序法)。序列的確定例如可通過雙脫氧法、Maxam-Gilbert法等公知的方法來進(jìn)行?;蚨鄳B(tài)性的檢測還可以采用變性梯度凝膠電泳法(DGCEdenaturinggradientgelelectrophoresis)、單鏈構(gòu)象多態(tài)個生分析(SSCP:singlestrandconformationpolymorphism)、等位基因特異性PCR(allele_specificPCR)、ASO(allelespecificoligonucleotide,等位基因特異性寡核苷酸)的雜交法、錯配位點(diǎn)的化學(xué)切割(CCMchemicalcleavageofmismatches,化學(xué)裂角軍錯配)、HET(heteroduplexmethod,異源雙鏈法)法、PEX(primerextension,引物延伸)法、RCA(rollingcircleamplification,滾環(huán)擴(kuò)增)法等。[2]炎癥性疾病診斷用試劑盒作為上述引物和探針的寡核苷酸可以以含有該寡核苷酸的炎癥疾病診斷用試劑盒的形式提供,該試劑盒可以含有在上述基因多態(tài)性分析法中使用的限制酶、聚合酶、核苷三磷酸、標(biāo)記物、緩沖液等。[3]BRCA1相關(guān)蛋白(BRAP)的表達(dá)狀態(tài)的分析方法根據(jù)本發(fā)明,通過檢測上述單核苷酸多態(tài)性,可以分析BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的10表達(dá)狀態(tài)。例如在SEQIDNO2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸為G時(shí)(BRAP內(nèi)含子3270G),可以判斷BRAP的表達(dá)量高。與此相對,SEQIDNO2所示的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸為A時(shí)(BRAP內(nèi)含子3270A),可以判斷BRAP的表達(dá)量低。[4]炎癥性疾病的治療藥物的篩選方法根據(jù)本發(fā)明,通過在候選物質(zhì)存在下分析細(xì)胞內(nèi)BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的表達(dá)量、選擇抑制該表達(dá)量的物質(zhì),可以篩選炎癥性疾病的治療藥物。例如分析在候選物質(zhì)存在下細(xì)胞內(nèi)BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的表達(dá)量,可以選擇使該表達(dá)量減少的物質(zhì)。上述篩選的一個例子可通過以下步驟進(jìn)行使細(xì)胞與候選物質(zhì)接觸的步驟;分析細(xì)胞內(nèi)BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因的表達(dá)量的步驟;以及與候選物質(zhì)非存在下的條件比較,選擇使該基因的表達(dá)量變化的候選物質(zhì)作為炎癥性疾病的治療藥物的步驟。候選物質(zhì)可以使用任意的物質(zhì)。對候選物質(zhì)的種類沒有特別限定,可以是各個低分子合成化合物,也可以是存在于天然產(chǎn)物提取物中的化合物,或者還可以是化合物文庫、噬菌體展示文庫、組合文庫。候選物質(zhì)為低分子化合物,優(yōu)選為低分子化合物的化合物文庫。化合物文庫的構(gòu)建是本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的,還可以使用市售的化合物文庫。[5]BRCA1相關(guān)蛋白(BRAP)的轉(zhuǎn)錄活性的測定方法根據(jù)本發(fā)明,還可以將上述含有單核苷酸多態(tài)性的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因片段導(dǎo)入細(xì)胞、培養(yǎng)該細(xì)胞,通過分析該基因的表達(dá)來測定BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的轉(zhuǎn)錄活性。根據(jù)本發(fā)明的優(yōu)選方案,在上述BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因片段的下游結(jié)合報(bào)道基因,得到轉(zhuǎn)錄單元,將其導(dǎo)入細(xì)胞,培養(yǎng)該細(xì)胞,通過測定報(bào)道活性來分析該基因的表達(dá)。例如單核苷酸多態(tài)性存在于啟動子位點(diǎn)時(shí),在含有該單核苷酸多態(tài)性的基因的下游插入報(bào)道基因,培養(yǎng)導(dǎo)入了該體系的細(xì)胞,測定報(bào)道活性,則可以測定單核苷酸多態(tài)性導(dǎo)致的轉(zhuǎn)錄效率的差異。這里,報(bào)道基因使用螢光素酶、氯霉素、乙酰轉(zhuǎn)移酶、半乳糖苷酶等的基因。[6]抑制或促進(jìn)BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的轉(zhuǎn)錄活性的物質(zhì)的篩選方法本發(fā)明中,將上述含有單核苷酸多態(tài)性的BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的基因片段導(dǎo)入細(xì)胞,在抑制或促進(jìn)BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的轉(zhuǎn)錄活性的候選物質(zhì)的存在下培養(yǎng)該細(xì)胞,通過分析該基因的表達(dá),可以篩選抑制或促進(jìn)BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的轉(zhuǎn)錄活性的物質(zhì)。根據(jù)本發(fā)明的優(yōu)選方案,在上述BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)基因片段的下游結(jié)合報(bào)道基因,將所得轉(zhuǎn)錄單元導(dǎo)入細(xì)胞,培養(yǎng)該細(xì)胞,通過測定報(bào)道活性來分析該基因的表達(dá)。例如,在具有可見BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)表達(dá)量顯著高的單核苷酸多態(tài)性(例如BRAP內(nèi)含子3270G)的基因的下游插入報(bào)道基因,將導(dǎo)入了該體系的細(xì)胞在候選物質(zhì)的存在下或非存在下的兩種情況下進(jìn)行培養(yǎng),在候選物質(zhì)存在下進(jìn)行培養(yǎng)時(shí),如果報(bào)道活性降低,則該候選物質(zhì)可作為抑制BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)轉(zhuǎn)錄活性的物質(zhì)被選擇。這里,報(bào)道基因可以使用上述例舉的基因。候選物質(zhì)可以使用任意的物質(zhì)。對候選物質(zhì)的種類沒有特別限定,可以是各個低分子合成化合物,也可以是存在于天然產(chǎn)物提取物中的化合物,或者還可以是化合物文庫、噬菌體展示文庫、組合文庫。候選物質(zhì)為低分子化合物,優(yōu)選為低分子化合物的化合物文庫?;衔镂膸斓臉?gòu)建是本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的,還可以使用市售的化合物文庫。由上述篩選方法得到的抑制或促進(jìn)BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)轉(zhuǎn)錄活性的物質(zhì)也在本發(fā)明的范圍內(nèi)。上述抑制BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)轉(zhuǎn)錄活性的物質(zhì)可用作心肌梗塞治療藥物、抗炎癥藥、免疫抑制劑等各種藥物的候選物質(zhì)。[7]BRCA1相關(guān)蛋白(BRAP)的轉(zhuǎn)錄控制因子的篩選方法本發(fā)明中,還可以使上述含有單核苷酸多態(tài)性的基因片段與預(yù)想可能存在BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的轉(zhuǎn)錄控制因子的試樣接觸,通過檢測上述片段與轉(zhuǎn)錄控制因子結(jié)合,來篩選BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的轉(zhuǎn)錄控制因子。上述含有單核苷酸多態(tài)性的基因片段與預(yù)想可能存在BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的轉(zhuǎn)錄控制因子的物質(zhì)結(jié)合的檢測可通過凝膠移位法(電泳遷移率變動分析electrophoreticmobilityshiftassay,EMSA)>DNaseI足跡法等進(jìn)行,優(yōu)選凝膠移位法。凝膠移位法中,如果結(jié)合有蛋白質(zhì)(轉(zhuǎn)錄控制因子),則分子尺寸增大,電泳中DNA的遷移率降低,因此可以將用32P標(biāo)記的基因片段與轉(zhuǎn)錄控制因子混合進(jìn)行凝膠電泳。通過放射自顯影觀察DNA的位置,則有因子結(jié)合的DNA緩慢移動,因此可檢測出比平常的條帶緩慢移動的條帶。[8]BRCA1相關(guān)蛋白(BRAP)的抑制劑、修飾劑的篩選方法本發(fā)明中,分析候選物質(zhì)的存在下BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的功能,通過選擇抑制或修飾其機(jī)能的物質(zhì),可以篩選BRCAl相關(guān)蛋白的抑制劑、修飾劑。BRAP的功能可例舉與半乳凝素-2結(jié)合的功能、或者使NFkB的活性保持或提高的功能等,但并不限于此。因此,例如在候選物質(zhì)的存在下或非存在下,分析BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)與半乳凝素_2的結(jié)合狀態(tài),可以選擇抑制上述結(jié)合的物質(zhì)作為BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的抑制劑。或者在候選物質(zhì)的存在下或非存在下,測定表達(dá)BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的細(xì)胞、組織、器官或個體的NFkB的活性,可以選擇使NFkB活性降低的物質(zhì)作為BRCAl相關(guān)蛋白的抑制劑。通過以下實(shí)施例進(jìn)一步具體地說明本發(fā)明,但本發(fā)明并不受實(shí)施例的限定。實(shí)施例以下通過實(shí)施例進(jìn)一步詳細(xì)地說明本發(fā)明。[實(shí)施例1]與半乳凝素-2結(jié)合的蛋白質(zhì)-BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)的鑒定使用由HeLa細(xì)胞提取的蛋白質(zhì),通過串聯(lián)親和純化篩選與心肌梗塞易感基因產(chǎn)物半乳凝素_2結(jié)合的新型蛋白質(zhì)。具體而言,串聯(lián)親和純化操作是以Rigaut等人所述的方法(Rigaut,G.等人.Agenericproteinpurificationmethodforproteincomplexcharacterizationandproteomeexploration.NatureBiotechnol.17,10301032(1999))為基本,對該方法加以一些修正來實(shí)施。在pCMV-Myc載體(〉^、)中,構(gòu)建編碼TEV切割位點(diǎn)、S標(biāo)記和His標(biāo)記的融合表達(dá)盒作為TAP標(biāo)記序列。構(gòu)建的TAP載體在巨細(xì)胞病毒啟動子的控制下、在哺乳動物細(xì)胞內(nèi)與C末端TAP標(biāo)記一起表達(dá)N末端Myc標(biāo)記的靶蛋白。在150mm皿內(nèi)使用Fugene(口工),將半乳凝素-2TAP載體或作為負(fù)對照的TAP載體瞬時(shí)轉(zhuǎn)染HeLa細(xì)胞(t-一7>^^研究資源K>夕;自JCRB9004獲得)。使用每20ml中含有1個完全蛋白酶抑制片(Completeproteaseinhibitortablet)(口*Λ)以及5μg/mlMG_132(力卟匕.才夂的蛋白質(zhì)提取試劑”O(jiān)”),在冰上溶解轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,使用S-蛋白結(jié)合/洗滌緩沖液()”夕工>)稀釋為10倍。將提取物在4°C下用S-蛋白瓊脂糖()^夕工>)溫育1218小時(shí)。將瓊脂糖用S-蛋白質(zhì)結(jié)合/洗滌緩沖液洗滌3次,再用TEV蛋白酶分解緩沖液(含有150mMNaCl,0.1%ΝΡ_40、0·5mMEDTA禾口ImMDTT的IOmMTris,ρΗ8·0)洗滌,使用100單位的TEV蛋白酶(4>Ε卜π夕工>)在17°C下溫育2小時(shí),洗脫結(jié)合的TAP-標(biāo)記蛋白質(zhì)。洗脫的蛋白質(zhì)用磷酸鹽緩沖液透析,進(jìn)一步用TALON親和純化系統(tǒng)(”口>歹夕)純化。將這些蛋白質(zhì)復(fù)合物用SDS-PAGE和SimplyBlue(4>'卜α夕工>)洗脫、濃縮、并分析。將蛋白質(zhì)結(jié)合物用7卜々一卜的MALDI/T0F質(zhì)譜儀進(jìn)行分析。分析的結(jié)果,作為與半乳凝素_2結(jié)合的蛋白,是BRCAl相關(guān)蛋白(BRAP)(參照圖la)ο[實(shí)施例2]BRAP基因內(nèi)單核苷酸多態(tài)性與心肌梗塞的相關(guān)性已經(jīng)了解了半乳凝素-2與BRAP結(jié)合,顯示了BRAP的基因產(chǎn)物的功能變化可能與心肌梗塞易感性相關(guān),因此使用BRAP基因內(nèi)的單核苷酸多態(tài)性(SNPs),對患者(3362人)、對照(3823人)按照國際公開W02004/015100號公報(bào)所述的方法進(jìn)行病例-對照關(guān)聯(lián)研究。即,SNP的分型通過侵入者分析(Invaderassay)進(jìn)行、通過卡方檢驗(yàn)進(jìn)行分析。結(jié)果,BRAP基因內(nèi)的外顯子5第90號A>G的SNP(NCBISNPDatabase中的登記號為rs3782886)的minorhomozygote(GG等位基因)在心肌梗塞患者中顯著多(表4)。由此顯示了BRAP基因內(nèi)的外顯子5第90號A>G的SNP與心肌梗塞相關(guān)的可能性。該SNP(NCBISNPDatabase中的登記號為rs3782886)與該基因的內(nèi)含子3270A/GSNP(NCBISNPDatabase中的登記號為rsll066001)、以及在染色體上接近的基因醛脫氫酶2家族(ALDH2)基因內(nèi)的2個SNP(NCBISNPDatabase中的登記號為rs671和rs4646776)、FLJ30092基因內(nèi)的一個SNP(NCBISNPDatabase中的登記號為rs2074356)存在強(qiáng)的連鎖不平衡的關(guān)系,這可通過HapMap數(shù)據(jù)庫(http//hapmap.org/)確認(rèn)。還可見ALDH2基因內(nèi)的SNP(NCBISNPDatabase中的登記號為rs671)和FLJ30092基因內(nèi)的SNP(NCBISNPDatabase中的登記號為rs2074356)與心肌梗塞有較強(qiáng)的相關(guān)性。[表4]在心肌梗塞的12q24基因組區(qū)的SNPs的關(guān)聯(lián)性t3TO1596細(xì)3滅24t.O47.511SXUISte3823m.WJ7,614471573353鄉(xiāng)42,74δ,510,i講7150挪膽SOM6,71S87爾mtm46.944.58.6tmIW2243823S7.438,7S.S基因型統(tǒng)計(jì)*;優(yōu)勢比,**;可信區(qū)間[實(shí)施例3]對半乳凝素-2與BRAP在C0S7共強(qiáng)制表達(dá)體系中的結(jié)合的確認(rèn)在動物細(xì)胞內(nèi)構(gòu)建表達(dá)Myc標(biāo)記的半乳凝素_2和S-標(biāo)記的BRAP的載體,在C0S7細(xì)胞(猴腎細(xì)胞株)中共強(qiáng)制表達(dá),通過用特異性抗體免疫沉降來確認(rèn)有否與各表達(dá)蛋白纟口口。為了在哺乳動物細(xì)胞中共免疫沉降,使用Fugene將Myc標(biāo)記的半乳凝素_2和S-標(biāo)記的BRAP的表達(dá)質(zhì)粒瞬時(shí)轉(zhuǎn)染C0S7細(xì)胞(t-一7研究資源K>夕;自JCRB9127獲得)。在每40ml中含有1個完全蛋白酶抑制片EDTA(口*Λ)以及5μg/mlMG-132(力卟匕·才夕A)的溶解緩沖液(含有150mMNaCl,0.2%NP-40的20mMTris,ρΗ7·5)內(nèi)實(shí)施免疫沉降。轉(zhuǎn)染24小時(shí)后,使用S-蛋白(^K7->)或Myc瓊脂糖(寸>夕·々X)在4°C下對轉(zhuǎn)染的C0S7細(xì)胞進(jìn)行2小時(shí)的處理。將免疫沉降物用溶解緩沖液洗滌3次。使用由S-蛋白(7”'Π或抗Myc過氧化物酶共軛物(寸>夕夕>^)復(fù)合而成的辣根過氧化物酶,使免疫混合物可見。使用與BRAP的S標(biāo)記特異性結(jié)合的S-蛋白或與Myc-半乳凝素_2特異性結(jié)合的抗myc抗體進(jìn)行免疫沉降時(shí),半乳凝素-2或BRAP分別同時(shí)沉降(參照圖lb)。這表示具有半乳凝素_2與BRAP直接且特異性結(jié)合的可能性。[實(shí)施例4]BRAP與半乳凝素_2在血管平滑肌細(xì)胞中的共同存在將半乳凝素-2特異性抗體用熒光素標(biāo)記,以及將BRAP特異性抗體用羅丹明標(biāo)記,免疫染色冠狀動脈血管平滑肌細(xì)胞,通過共焦激光顯微鏡觀察半乳凝素_2和BRAP的表達(dá)。使用在大腸桿菌中合成的重組蛋白,在兔中制備多克隆抗人半乳凝素-2和BRAP免疫血清。使用EZ標(biāo)記蛋白質(zhì)標(biāo)記試劑盒(I^7—7),分別用熒光素和羅丹明標(biāo)記多克隆抗半乳凝素-2免疫血清以及BRAP。培養(yǎng)人冠狀動脈平滑肌細(xì)胞(HCASMC,力>Oν”^)并固定。然后與在含有3%牛血清白蛋白的磷酸鹽緩沖液溶液內(nèi)標(biāo)記的抗體一起培養(yǎng)該HCASMC。將檢樣用OLYMPUSFLU0VIEW共焦激光掃描顯微鏡(奧林匹斯)觀察。結(jié)果可觀察到半乳凝素-2與BRAP在細(xì)胞質(zhì)和核中共同存在(參照圖Ic)。[實(shí)施例5]冠狀動脈血管平滑肌細(xì)胞中的BRAP內(nèi)含子3SNP的螢光素酶測定構(gòu)建在pGL3基本載體(螢光素酶)中插入BRAP啟動子區(qū)(BRAP啟動子-螢光素因基型位性性因等顯隱基因基型位)±性因等顯隱基因基塑位lifct因等務(wù)隞基酶)得到的載體。進(jìn)一步在該載體中分別插入含有1次或3次SNP的A等位基因或G等位基因的寡核苷酸,將該構(gòu)建物轉(zhuǎn)染血管平滑肌細(xì)胞,進(jìn)行螢光素酶活性測定。為了構(gòu)建BRAP啟動子-pGL3基本載體(BRAP啟動子-螢光素酶),通過使用基因組DNA作為模板的PCR,擴(kuò)增由5’一側(cè)非編碼區(qū)第21號核苷酸至啟動子區(qū)-991號所對應(yīng)的DNA片段。將擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物在pGL3-基本載體(口^力‘)的kpnl和SacI限制酶切位點(diǎn)上沿5’-3’方向克隆。為了構(gòu)建含有BRAP啟動子-SNP-螢光素酶的載體,在BRAP螢光素酶的載體構(gòu)建物的MluI和XhoI限制酶切位點(diǎn)上克隆1或3次重復(fù)的雙鏈寡核苷酸(內(nèi)含子3的264278號),構(gòu)建載體。在HCASMC生長培養(yǎng)基、《千K研)中培養(yǎng)HCASMC。然后使用Nucleofector系統(tǒng)(77夕寸),將1μg載體構(gòu)建物以及0.1μgpRL-TK載體(轉(zhuǎn)染效率的內(nèi)部控制)轉(zhuǎn)染細(xì)胞。24小時(shí)后回收細(xì)胞,使用雙螢光素酶報(bào)道分析系統(tǒng)(口>#)測定螢光素酶活性。結(jié)果,G等位基因與A等位基因比較,可觀察到較強(qiáng)的螢光素酶活性,這顯示在具有G等位基因的個體中,BRAP的表達(dá)比A等位基因高(參照圖2a)。[實(shí)施例6]使用冠狀動脈血管平滑肌細(xì)胞核提取液、通過BRAP內(nèi)含子3SNP區(qū)序列寡核苷酸進(jìn)行凝膠移位分析按照已報(bào)道的方法,將由HCASMC制備的核酸提取物在牛血清白蛋白的存在下、以及與使用DIG凝膠移位試劑盒(π〉-)、用地高辛(DIG)-ll-ddUTP標(biāo)記的16個的寡核苷酸(BRAP的內(nèi)含子3的264276)的6個串聯(lián)拷貝一起進(jìn)行溫育。在室溫下不使用Poly[I(dc)]試劑進(jìn)行反應(yīng)。比較實(shí)驗(yàn)是在DIG標(biāo)記的寡核苷酸添加之前用核酸提取物預(yù)溫育非標(biāo)記的寡核苷酸(過量125倍)。使用非改性6%聚丙烯酰胺凝膠將蛋白質(zhì)/DNA復(fù)合物在0.5倍Tris/硼酸/EDTA(TBE)緩沖液內(nèi)進(jìn)行分離,然后轉(zhuǎn)移至硝基纖維素膜上。按照制備者的指示用化學(xué)熒光檢測系統(tǒng)(口〉Λ)檢測信號。結(jié)果可以確認(rèn)存在與A等位基因強(qiáng)烈結(jié)合的未知因子(參照圖2b)。[實(shí)施例7]冠狀動脈血管內(nèi)皮細(xì)胞中敲除BRAP和ALDH2的mRNA時(shí)的NFkB活性的變化使用BRAP和ALDH2的各2種siRNA敲除BRAP和ALDH2,將在NFkB特異性的E-選擇啟動子序列上結(jié)合有螢光素酶的載體(NFkB可以間接地用螢光素酶測定活性)轉(zhuǎn)染,測定螢光素酶活性。為了敲除BRAP和ALDH2的mRNA,使用了合成StealthTMRNAi寡核苷酸雙鏈(BRAP是使用BRAP-HSS112138和BRAP-112139,ALDH2是使用ALDH2-HSS100369和ALDH2-HSS100370)。使用StealthRNAi負(fù)對照含高GC的雙鏈(4>'卜口夕工>)作為陰性對照。在HCACE生長培養(yǎng)基中培養(yǎng)HCACE。將各StealthRNAi轉(zhuǎn)染細(xì)胞。24小時(shí)后,將各StealthRNAi、pNiFty質(zhì)粒載體以及通過Nucleofector系統(tǒng)(77夕寸)結(jié)合有NFkB特異性E-選擇性啟動子(4>e#7工>)的螢光素酶報(bào)道基因共轉(zhuǎn)染細(xì)胞。24小時(shí)后回收細(xì)胞,并通過雙螢光素酶報(bào)道分析系統(tǒng)測定螢光素酶活性。使用SYBRGreen和ABI7700測序儀對mRNA進(jìn)行定量。通過敲除BRAP,NFkB的活性降低,而敲除ALDH2則相反,NFkB的活性升高(參照圖2c)。產(chǎn)業(yè)實(shí)用性15通過利用本發(fā)明中鑒定的SNP,可以提供心肌梗塞等炎癥性疾病的診斷方法或炎癥性疾病的治療藥物的開發(fā)方法。權(quán)利要求炎癥性疾病的判定方法,該方法包含檢測存在于BRCA1相關(guān)蛋白基因中的至少一種基因多態(tài)性,其中上述BRCA1相關(guān)蛋白簡稱BRAP。2.炎癥性疾病的判定方法,該方法包含檢測存在于BRCAl相關(guān)蛋白基因中的至少一種單核苷酸多態(tài)性,其中上述BRCAl相關(guān)蛋白簡稱BRAP。3.炎癥性疾病的判定方法,該方法包含檢測以下任意一種多態(tài)性(i)SEQIDNO1所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸的A/G多態(tài)性,該多態(tài)性在NCBISNPDatabase中的登記號為3782886;(ii)SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性,該多態(tài)性在NCBISNPDatabase中的登記號為rsl1066001;或(iii)與上述⑴或(ii)所述的多態(tài)性的連鎖不平衡的指標(biāo)r2為0.8以上的連鎖不平衡狀態(tài)的多態(tài)性,其中上述BRCAl相關(guān)蛋白簡稱BRAP。4.權(quán)利要求13中任一項(xiàng)所述的方法,其中,炎癥性疾病是心肌梗塞。5.寡核苷酸,該寡核苷酸可以與連續(xù)的至少10個核苷酸序列或其互補(bǔ)序列雜交,在權(quán)利要求14中任一項(xiàng)所述的方法中作為探針使用,其中,上述連續(xù)的至少10個核苷酸序列或其互補(bǔ)序列含有SEQIDNO1所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸的A/G多態(tài)性、或SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性,其中上述BRCAl相關(guān)蛋白簡稱BRAP。6.寡核苷酸,該寡核苷酸可以擴(kuò)增連續(xù)的至少10個核苷酸序列和/或其互補(bǔ)序列,在權(quán)利要求14中任一項(xiàng)所述的方法中作為引物使用,其中,上述連續(xù)的至少10個核苷酸序列和/或其互補(bǔ)序列含有SEQIDNO:1所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸的A/G多態(tài)性、或SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性,其中上述BRCAl相關(guān)蛋白簡稱BRAP。7.權(quán)利要求6所述的寡核苷酸,其中,引物是正向引物和/或反向引物。8.炎癥性疾病診斷用試劑盒,該試劑盒含有權(quán)利要求57中任一項(xiàng)所述的寡核苷酸的1種以上。9.權(quán)利要求8所述的試劑盒,其中,炎癥性疾病是心肌梗塞。10.BRCAl相關(guān)蛋白的表達(dá)狀態(tài)的分析方法,該方法包含檢測SEQIDN0:1所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的外顯子5的核苷酸序列中第90號核苷酸的A/G多態(tài)性、或SEQIDNO2所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性,其中上述BRCAl相關(guān)蛋白簡稱BRAP。11.炎癥性疾病的治療藥物的篩選方法,該方法包含以下步驟在候選物質(zhì)的存在下,分析細(xì)胞內(nèi)的BRCAl相關(guān)蛋白的表達(dá)量或BRCAl相關(guān)蛋白的功能,選擇抑制該表達(dá)量的物質(zhì)、或者抑制或修飾該功能的物質(zhì),其中上述BRCAl相關(guān)蛋白簡稱BRAP。12.BRAP的轉(zhuǎn)錄活性的測定方法,該方法包含將BRAP基因片段導(dǎo)入細(xì)胞中,培養(yǎng)該細(xì)胞,分析該基因的表達(dá),其中,所述BRAP基因片段含有SEQIDNO2所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性,其中上述BRCAl相關(guān)蛋白簡稱BRAP。13.抑制或促進(jìn)BRAP的轉(zhuǎn)錄活性的物質(zhì)的篩選方法,該方法包含將BRAP基因片段導(dǎo)入細(xì)胞中,在抑制或促進(jìn)BRAP轉(zhuǎn)錄活性的候選物質(zhì)的存在下培養(yǎng)該細(xì)胞,分析該基因的表達(dá),其中,所述BRAP基因片段含有SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性,其中上述BRCAl相關(guān)蛋白簡稱BRAP。14.BRAP的轉(zhuǎn)錄控制因子的篩選方法,該方法包含使BRAP基因片段與預(yù)想存在BRAP的轉(zhuǎn)錄控制因子的試樣接觸,檢測上述片段與轉(zhuǎn)錄控制因子的結(jié)合,其中,所述BRAP基因片段含有SEQIDNO:2所示的BRCAl相關(guān)蛋白基因的內(nèi)含子3的核苷酸序列中第270號核苷酸的A/G多態(tài)性,其中上述BRCAl相關(guān)蛋白簡稱BRAP。全文摘要本發(fā)明的目的是鑒定與心肌梗塞等炎癥性疾病的發(fā)病進(jìn)展相關(guān)的新型單核苷酸多態(tài)性(SNP)。根據(jù)本發(fā)明,可以提供炎癥性疾病的判定方法,該方法包含檢測存在于BRCA1相關(guān)蛋白(BRAP)基因中的至少一種基因多態(tài)性。文檔編號C12N15/09GK101918552SQ20088012401公開日2010年12月15日申請日期2008年10月29日優(yōu)先權(quán)日2007年10月29日發(fā)明者中村祐輔,尾崎浩一,田中敏博申請人:獨(dú)立行政法人理化學(xué)研究所