專利名稱:朝鮮淫羊藿的分子鑒定方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及中藥材來源品種鑒定技術(shù)領(lǐng)域,采用特異性引物進行PCR擴增鑒定的 分子方法。
二.
背景技術(shù):
中藥淫羊藿為來源于小檗科淫羊藿屬多個種植物的干燥地上部分,在我國有悠 久的使用歷史。其功效除了傳統(tǒng)的補腎壯陽祛風(fēng)濕之外,臨床上還被用于治療骨質(zhì)疏松、 更年期綜合癥、高血壓、冠心病等疾病,另外淫羊藿還具有增強免疫力、抗衰老、抗腫瘤、抗 艾滋病等作用,因此受到國內(nèi)外的廣泛關(guān)注。藥典規(guī)定藥材淫羊藿的來源物種包括淫羊 藿 Epimedium brevicornu Maxim.、箭葉淫羊藿 Epimedium sagittatum(Sieb. et Zucc.) Maxim.、柔毛淫羊藿Epimedium pubscens Maxim.、卓月鮮淫羊藿Epimedium koreanum Nakai 和巫山淫羊藿Epimediumwushanense T. S. Ying等5個種;《貴州省中藥材、民族藥材標(biāo) 準(zhǔn)》中還收載了粗毛淫羊藿Epimedium acuminamm Franch.、天平山淫羊藿Epimedium myrianthum Stearn、it嶺淫羊藿Epimedium leptorrhizum Steam禾口租毛淫羊藿Epimedium coactum H. R. Liang.,其來源之多在中藥中是很罕見的。不同植物來源的淫羊藿藥材其有 效成分的含量存在很大的差異,再加上藥材和飲片難以進行形態(tài)鑒別,這就對藥材質(zhì)量控 制造成了很大的障礙,這就需要尋找到一種穩(wěn)定可靠的方法將不同來源的淫羊藿藥材和飲 片加以鑒定區(qū)分。通過比較不同藥用淫羊藿品種的一段DNA堿基序列,找到了朝鮮淫羊藿 和其他藥用淫羊藿品種存在差異的一段序列,這種差異可以通過進行鑒定性PCR來區(qū)別。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是提供一種在藥用淫羊藿品種中準(zhǔn)確鑒定朝鮮淫羊藿的鑒定性PCR 分子鑒定方法,該方法包括朝鮮淫羊藿的特征性DNA堿基序列、兩對鑒定性PCR引物及其鑒 定方法。本發(fā)明的技術(shù)方案如下首先從各藥材中提取基因組DNA,然后利用該方法進行鑒定。本發(fā)明設(shè)計的朝鮮淫羊藿聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的鑒定引物DNA序列為引物 1 :kor. -aF :5,-CAGCGAACTTGTGAAAAACAC-3,引物 2 kor· -bR 5,-CGATAAGAGAACAAAGGGCTA-3,引物 3 kor· -bF 5,-CGAACTTGTGAAAAACAC-3,用全自動DNA合成儀按上述鑒定引物的DNA序列進行合成,即得到鑒定引物的白 色粉末結(jié)晶。中藥材朝鮮淫羊藿聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)鑒定的方法為1、藥材DNA的提取按照常規(guī)植物DNA的提取方法或者用市售植物基因組提取試 劑盒進行,用無菌去離子水溶解供試品DNA模版,并將模版濃度調(diào)整到能夠進行常規(guī)PCR反 應(yīng)的濃度;
2、模版DNA質(zhì)量的鑒定用另一對引物鑒別模版DNA的質(zhì)量,該對引物能夠擴增淫 羊藿屬植物的線粒體基因組nadl第2內(nèi)含子序列。引物的DNA序列為nadl-2intron-up 5’ -GGT CTT ATT CTT ATT GTG CGC CT-3,,nadl-2intron-low :5’ -TTC GTC TAT ACCAGA CCA TAA GG-3,。反應(yīng)體系為引物各OluM,IOul 的 2XPCR StarMix,模版DNA約 20ng,用無 菌去離子水補充反應(yīng)體積到20ul。PCR擴增程序為95°C預(yù)變性3min ;94°C變性30s,54°C 退火30s,72°C延伸2min,共30個循環(huán);72°C延伸lOmin。取5ul的PCR產(chǎn)物在瓊脂糖 凝膠(包括適量的溴化乙錠,即EB)檢測擴增結(jié)果。如果得到ISOObp左右的條帶,則表明 DNA模版合格,可以進行后續(xù)的鑒定試驗,如果沒有陽性條帶,則需要改進DNA提取方法,以 得到合格的模版DNA。對于模版DNA質(zhì)量的鑒定,也可以選擇其他能夠在淫羊藿屬植物中成 功擴增的引物對進行;3、鑒定性PCR反應(yīng)引物用無菌去離子溶解并稀釋至2umol/uL。以25uL反應(yīng)體 系為參照,各物品的用量為IOXPCR 反應(yīng)緩沖液 2.5uldNTPs (2. 5mM)1. 6ulprimer 1(2um)2ulprimer 2 (2um)2ulEasy Taq(5U/ul) 0. 3ulDNA 模版20ngddH20補充體積到25uL4、PCR反應(yīng)程序;在PCR儀上按照以下程序進行擴增反應(yīng)
94 0C30s 一 η
50 °C30s個循環(huán)
72 V1min J
72 °C5min5、電泳檢測取5uLPCR反應(yīng)液與IuL加樣緩沖液混合,1 %瓊脂糖凝膠電泳(含 0. 5%溴化乙錠)檢測PCR擴增產(chǎn)物;反應(yīng)體系可以因為酶的活性、模版DNA的質(zhì)量等原因進行調(diào)整;檢測結(jié)果有陽性條帶,則檢測對象為朝鮮淫羊藿;如果是陰性結(jié)果,則檢測對象不 是朝鮮淫羊藿,檢測結(jié)果參看說明書附圖1和附圖2。四、說明書
圖1 為引物組合Kor. -aF&Kor. _bR的PCR反應(yīng)產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果。1、 2為朝鮮淫羊藿樣品,3、4為粗毛淫羊藿樣品,5、6為黔嶺淫羊藿樣品,7、8為箭葉淫羊藿樣 品,9、10為柔毛淫羊藿樣品,11、12為巫山淫羊藿樣品,13、14為淫羊藿樣品,15、16為天平山淫羊藿樣品,M為DL2000 DNA marker ;圖2 為引物組合Kor. -bF&Kor. _bR的PCR反應(yīng)產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果。M 為DL2000DNAmarker,1、2為朝鮮淫羊藿樣品,3、4為粗毛淫羊藿樣品,5、6為黔嶺淫羊藿樣 品,7、8為箭葉淫羊藿樣品,9、10為柔毛淫羊藿樣品,11、12為巫山淫羊藿樣品,13、14為淫 羊藿應(yīng)聘,15、16為天平山淫羊藿樣品;圖3 用兩對引物分別對8份來自于藥材市場的朝鮮淫羊藿藥材進行PCR鑒定的 瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果。前8個為引物組合Kor. -bF&Kor. _bR的PCR擴增結(jié)果,其中7個 有陽性條帶,一個為陰性結(jié)果;后8個條帶為引物組合Kor. -aF&Kor. _bR的PCR擴增結(jié)果, 其中7個有陽性條帶,一個為陰性結(jié)果;該結(jié)果與形態(tài)鑒定結(jié)果一致,其中編號為1、2、3、4、 5、7、8的樣品為未經(jīng)炮制的生飲片,而編號為6的樣品為經(jīng)過羊油炙的飲片。五、實施例
1、從藥材市場上收集了來自于不同藥材公司的8份樣品,分別取30mg葉片材料, 在液氮中研磨,用天根生化科技(北京)有限公司的植物基因組DNA試劑盒提取總DNA。2、用弓I 物 nadl-2intron-up :5,-GGT CTT ATT CTT ATT GTG CGC CT-3,, nadl-2intron-low :5,-TTC GTC TAT ACC AGA CCA TAA GG-3,檢測提取的樣品總 DNA 的質(zhì) 量。反應(yīng)體系為引物各0. IuM, IOul的2 XPCR StarMix,模版DNA約20ng,用無菌去離子 水補充反應(yīng)體積到20ul。PCR擴增程序為95°C預(yù)變性3min ;94°C變性30s,54°C退火30s, 72°C延伸2min,共30個循環(huán);72°C延伸lOmin。取5ul的PCR產(chǎn)物在1 %瓊脂糖凝膠(包 括適量的溴化乙錠,即EB)檢測擴增結(jié)果。結(jié)果顯示5uL約20ng的總DNA能夠得到很好的 陽性結(jié)果,證實提取的總DNA質(zhì)量達到檢測要求;3、分別用鑒定引物Kor. -bF&Kor. -bR和Kor. -aF&Kor. -bR對8個樣本的總DNA進 行PCR擴增,反應(yīng)體系和PCR擴增程序如下IOXPCR 反應(yīng)緩沖液 2.5uldNTPs (2. 5mM)1. 6ulprimer 1 (2um)2ulprimer 2 (2um)2ulEasy Taq(5U/ul) 0. 3ulDNA 模版5ulddH20補充體積到25uL 4、分別取5ul的PCR擴增產(chǎn)物上樣,用1 %的瓊脂糖凝膠進行電泳,電泳后在凝膠 成像儀上檢測結(jié)果。結(jié)果參看說明書附圖3,顯示市售的8個朝鮮淫羊藿藥材中有7個得到 陽性條帶,1個為陰性結(jié)果,表明其中7個為朝鮮淫羊藿,而1個被誤售為朝鮮淫羊藿,經(jīng)專 家鑒定是原植物為 淫羊藿(Epimedium brevicornu)的藥材。
權(quán)利要求
一種來源為朝鮮淫羊藿Epimedium koreanum的中藥淫羊藿藥材聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)鑒定引物,其特征在于可分別用兩對鑒定引物kor.-aF&kor.-bR以及kor-bF&kor.-bR對朝鮮淫羊藿進行分子鑒定。鑒定引物DNA序列為kor.-aF5’-CAGCGAACTTGTGAAAAACAC-3’,kor.-bR5’-CGATAAGAGAACAAAGGGCTA-3’以及kor.-bF5’-CGAACTTGTGAAAAACAC-3’,用全自動DNA合成儀按上述鑒定引物的DNA序列進行合成,即得到鑒定引物的白色粉末結(jié)晶。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述鑒定引物鑒定朝鮮淫羊藿原植物以及來源于朝鮮淫羊藿的中 藥淫羊藿藥材和飲片的方法,其特征在于朝鮮淫羊藿聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)鑒定的步驟 為(1)藥材DNA的提取按照常規(guī)植物DNA的提取方法或者用市售植物基因組提取試劑 盒進行,用無菌去離子水溶解共試品DNA模版,并將模版濃度調(diào)整到能夠進行常規(guī)PCR反應(yīng) 的濃度;(2)模版DNA質(zhì)量的鑒定用另一對引物鑒別模版DNA的質(zhì)量,該對引物能夠擴增淫 羊藿屬植物的線粒體基因組nadl第2內(nèi)含子序列。弓丨物的DNA序列為nadl-2intron-up 5,-GGT CTT ATT CTT ATT GTG CGC CT-3,,nadl-2intron_low :5’ -TTC GTC TAT ACC AGA CCA TAA GG-3’。反應(yīng)體系為引物各 0. luM,IOul 的 2XPCR StarMix,模版 DNA 約 20ng, 用無菌去離子水補充反應(yīng)體積到20ul。PCR擴增程序為95°C預(yù)變性3min ;94°C變性30s, 54°C退火30s,72°C延伸2min,共30個循環(huán);72°C延伸lOmin。取5ul的PCR產(chǎn)物在瓊 脂糖凝膠(包括適量的溴化乙錠,即EB)檢測擴增結(jié)果。如果得到ISOObp左右的條帶,則 表明DNA模版合格,可以進行后續(xù)的鑒定試驗,如果沒有陽性條帶,則需要改進DNA提取方 法,以得到合格的模版DNA,對于模版DNA質(zhì)量的鑒定,也可以選擇其他能夠在淫羊藿屬植 物中成功擴增的引物對進行;(3)鑒定性PCR反應(yīng)引物用無菌去離子溶解并稀釋至2um0l/uL。以25uL反應(yīng)體系為 參照,各物品的用量為10XPCR反應(yīng)緩沖液 2. 5uldNTPs (2. 5mM) 1. 6ulprimer 1(2um) 2ulprimer 2(2um) 2ulEasy Taq(5U/ul) 0. 3ulDNA 模版20ngddH20補充體積到25uL(4)PCR反應(yīng)程序在PCR儀上按照以下程序進行擴增反應(yīng) (5)電泳檢測取5uLPCR反應(yīng)液與IuL加樣緩沖液混合,瓊脂糖凝膠電泳(含0. 5% 溴化乙錠)檢測PCR擴增產(chǎn)物;反應(yīng)體系可以因為酶的活性、模版DNA的質(zhì)量等原因進行調(diào)整; 檢測結(jié)果有陽性條帶,則檢測對象為朝鮮淫羊藿;如果是陰性結(jié)果,則檢測對象不是朝鮮淫羊藿。
全文摘要
本發(fā)明屬于中藥鑒定技術(shù)領(lǐng)域,是用于鑒定朝鮮淫羊藿的分子鑒定方法。發(fā)明方法設(shè)計的朝鮮淫羊藿聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的鑒定引物DNA序列為kor-aF5’-CGAACTTGTGAAAAACAC-3’,kor.-bR5’-CGATAAGAGAACAAAGGGCTA-3’以及kor.-bF5’-CAGCGAACTTGTGAAAAACAC-3’。本發(fā)明能夠?qū)崿F(xiàn)朝鮮淫羊藿原植物、藥材、生飲片和羊油炙飲片的快速、準(zhǔn)確鑒定。
文檔編號C12N15/11GK101886116SQ20091013666
公開日2010年11月17日 申請日期2009年5月12日 優(yōu)先權(quán)日2009年5月12日
發(fā)明者王川易, 肖培根, 郭寶林 申請人:中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所