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一種檢測黃牛fto基因單核苷酸多態(tài)性的方法

文檔序號:584621閱讀:212來源:國知局
專利名稱:一種檢測黃牛fto基因單核苷酸多態(tài)性的方法
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于分子遺傳學(xué)領(lǐng)域,涉及基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)的檢測,特別涉及 一種檢測黃牛FTO基因單核苷酸多態(tài)性的方法。
背景技術(shù)
單核苷酸多態(tài)性(SNP),是指在基因組上單個核苷酸的變異,形成的遺傳標(biāo)記,其 數(shù)量很多。包括置換、顛換、缺失和插入。理論上講,SNP既可能是二等位多態(tài)性,也可能是 3個或4個等位多態(tài)性,但實際上,后兩者非常少見,幾乎可以忽略。因此,通常所說的SNP 都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C、T,在其互補(bǔ)鏈上則為G、A),也可能是顛換 (C-A,G-T,C-G,A-T)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異,具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約 占2/3,其它幾種變異的發(fā)生機(jī)率相似。轉(zhuǎn)換的機(jī)率之所以高,可能是因為CpG 二核苷酸上 的胞嘧啶殘基是人類基因組中最易發(fā)生突變的位點,其中大多數(shù)是甲基化的,可自發(fā)地脫 去氨基而形成胸腺嘧啶。SNP在動物基因組中分布很廣泛,每一個核苷酸發(fā)生突變的概率大約為10-9。在 人類基因組中大概每1000個堿基就有一個SNP,人類基因組上的SNP總量大概是3X IO6個。 在基因組中,任何堿基均有可能發(fā)生變異,因此SNP既有可能在基因序列內(nèi),也有可能在基 因以外的非編碼序列上。總的來說,位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP比較少,因為在外顯子內(nèi),其變異 率僅及周圍序列的1/5。多項研究同時發(fā)現(xiàn)不同種族間SNPs的數(shù)目也是不同的,非洲人群 及非裔種族中SNPs數(shù)量最多,而其他種群的SNPs要少得多,因此通過比較亞群間等位基因 的頻率將有助于闡明種族的結(jié)構(gòu)和進(jìn)化。由于SNPs是二等位基因分子標(biāo)記,所以,理論上 在一個二倍體生物群體中,SNPs可能是由2個、3個或4個等位基因構(gòu)成,但實際上3個或 4個等位基因的SNPs很罕見,故SNPs通常被簡單地稱為二等位基因分子標(biāo)記。目前,主要采用幾種方法來檢測SNPs,即DNA序列測定方法、PCR-RFLP法、 PCR-SSCP與DNA測序結(jié)合法、AS-PCR方法、引物延伸法和寡核苷酸連接反應(yīng)等。在這些SNP 檢測技術(shù)中,DNA序列測定法是最為準(zhǔn)確的SNP檢測方法,但是,其檢測費用極其昂貴。同 時,在測序過程中需要大型測序儀器和非常熟練的技術(shù)經(jīng)驗,所以,DNA序列測定法不是一 種應(yīng)用于生產(chǎn)實際的理想SNP檢測方法;AS-PCR方法作為一種新型的SNP檢測方法,在未 來的應(yīng)用領(lǐng)域中具有非常廣闊的前景,但是,該方法需要設(shè)計特別的引物,且只能針對特定 的基因位點,同時,檢測過程中還存在誤檢的概率,因此,目前不具有普遍應(yīng)用的特點;而引 物延伸法和寡核苷酸連接反應(yīng)技術(shù)檢測SNP位點,需要平板讀數(shù)儀、基因芯片、微球陣列技 術(shù)和質(zhì)譜儀等檢測平臺,對于一般的分子實驗室來說可實施性不強(qiáng)。PCR-SSCP法原理是 單鏈DNA片段呈現(xiàn)復(fù)雜的空間折疊構(gòu)象,當(dāng)有一個堿基發(fā)生改變時,會或多或少地影響其 空間構(gòu)象,使構(gòu)象發(fā)生改變,空間構(gòu)象有差異的單鏈DNA分子在聚丙烯酰胺凝膠中受到的 阻力大小不同。因此,通過聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE),可以非常敏銳地將構(gòu)象上有差異的 分子分離開。PCR-SSCP技術(shù),提高了檢測突變方法的簡便性和靈敏性??旖?、安全,無需探 針制備、雜交、酶切等步驟,同時與測序方法相結(jié)合,增加了準(zhǔn)確性,也降低了單純測序方法的成本,已得到廣泛的研究和應(yīng)用。FTO基因是一種與肥胖相關(guān)的基因,也稱肥胖基因。近年來,研究報道,半數(shù)的歐 洲白人攜帶FTO基因風(fēng)險等位基因,能使肥胖風(fēng)險增加30%。大約有16%的人攜帶純合風(fēng) 險等位基因型,這種純合子使肥胖風(fēng)險增加67%。研究人員懷疑其他人群攜帶FTO風(fēng)險等 位基因的比例也與之相似。可能由于FTO基因會抑制新陳代謝,降低能量消耗效率,因而導(dǎo) 致肥胖。FTO基因使肥胖者“胃口大開”,難有飽腹感,從而過量進(jìn)食,導(dǎo)致肥胖。因此,研究 FTO基因遺傳變異和分子遺傳特征對動物生長發(fā)育的影響具有重要理論和實踐意義。目前,動物研究顯示FTO基因可以通過對成脂功能的調(diào)節(jié),來影響肥胖的發(fā)生。研 究報道FTO基因與人的肥胖相關(guān)。小鼠和牛中也證明FTO可導(dǎo)致動物的肥胖。迄今為止, 國內(nèi)外未見關(guān)于牛FTO基因遺傳變異的研究,由于中國黃牛FTO基因遺傳變異領(lǐng)域的研究 匱乏,該基因位點的功能研究及其遺傳變異與經(jīng)濟(jì)性狀(如體重、體高、體長等性狀)關(guān)聯(lián) 的研究仍是空白。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明解決的問題在于利用PCR-SSCP的方法檢測黃牛FTO基因的多態(tài)性,并將其 與生長性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,驗證表明其可以作為黃牛分子育種中輔助選擇的分子標(biāo)記,從 而加快良種選育速度。本發(fā)明是通過以下技術(shù)方案來實現(xiàn)一種檢測黃牛FTO基因單核苷酸多態(tài)性的方法,以包含F(xiàn)TO基因的待測黃牛全基 因組DNA為模板,以引物對P為引物,PCR擴(kuò)增黃牛FTO基因;對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物94 98°C 變性5 lOmin,再對變性后的擴(kuò)增片段進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳;根據(jù)電泳結(jié)果鑒定黃牛 FTO基因編碼區(qū)第783位的單核苷酸多態(tài)性;所述的引物對P為上游弓丨物gatgaaacattcctgac 17;下游弓丨物gctttgatccttgcattacc 20。所述的PCR擴(kuò)增反應(yīng)程序為94°C預(yù)變性 5min ;94°C變性 30s,57°C退火 30s,72°C延伸 30s,35 個循環(huán);72°C延 伸 IOmin0所述的聚丙烯酰胺凝膠電泳為質(zhì)量濃度為10%的聚丙烯酰胺凝膠。所述根據(jù)聚丙烯酰胺凝膠電泳結(jié)果鑒定黃牛FTO基因第783位的單核苷酸多態(tài)性 為GG基因型表現(xiàn)為3條電泳條帶,GC基因型的表現(xiàn)為5條電泳條帶。與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有以下有益的技術(shù)效果本發(fā)明根據(jù)FTO基因的序列設(shè)計引物,分別以3種黃牛品種的基因組DNA為模板, 進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序,測序后得到黃牛的FTO基因的部分序列與NCBI公 布的序列進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn)在編碼區(qū)第783位存在SNP多態(tài)性。針對上述第783位的SNP多態(tài)性,本發(fā)明還公開了其篩查和檢測方法,通過設(shè)計特 定的引物PCR擴(kuò)增包含SNP位點的基因片段,然后進(jìn)行高溫變性再進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電 泳鑒定,能夠簡單、快速、成本低、精確的檢測其單核苷酸的多態(tài)性。本發(fā)明對3個黃牛品種的SNP基因型進(jìn)行了檢測和基因頻率分析,對上述SNP位
4點與黃牛部分生長性狀(體長、體重和體高)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,該SNP位點的GG基因型可以 做為一個提高黃牛體長的候選分子遺傳標(biāo)記。


圖1為黃牛FTO基因部分編碼區(qū)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳結(jié)果圖;圖2為黃牛FTO基因包含編碼區(qū)第783位的多態(tài)位點的201bp PCR產(chǎn)物的聚丙烯 酰胺凝膠電泳結(jié)果圖;圖3為黃牛FTO基因SNP的不同基因型測序圖。
具體實施例方式本發(fā)明利用PCR-SSCP的方法對黃牛FTO基因編碼區(qū)第783位點錯義密碼子突變 可能產(chǎn)生編碼蛋白組成發(fā)生變化的單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行檢測,下面結(jié)合對本發(fā)明做進(jìn)一步 的詳細(xì)說明,所述是對本發(fā)明的解釋而不是限定。a、黃牛FTO基因含第四外顯子區(qū)域PCR引物的設(shè)計以NCBI所公布的牛(NC_007316. 3)序列為參考,利用Primer 5. 0設(shè)計能夠擴(kuò)增 包含黃牛FTO基因第四外顯子區(qū)域的PCR引物,其引物序列P為上游弓丨物gatgaaacattcctgac17;下游弓丨物gctttgatccttgcattacc 20;以引物P對不同種群來源的黃?;蚪M擴(kuò)增,能夠擴(kuò)增包含黃牛FTO基因 (NC_007316. 3序列)第四外顯子區(qū)域第21470892bp 21471092bp的201bp的基因片段, 擴(kuò)增后片段的電泳檢測如圖1所示,其中,泳道1 6為擴(kuò)增獲得的基因片段,泳道M為 Marker ;對擴(kuò)增的片段進(jìn)行測序鑒定后,與NCBI公布的序列進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn)在第70位核苷酸 (也即FTO基因編碼區(qū)第783位)存在G/C多態(tài)性;當(dāng)FTO基因編碼區(qū)第783bp由G突變?yōu)镃時,PCR擴(kuò)增FTO基因的該位置的三聯(lián) 密碼子從CAG改變?yōu)镃AC,導(dǎo)致編碼第261位的氨基酸由GLN突變?yōu)镠IS,從而形成錯義密 碼子突變。而當(dāng)有一個堿基發(fā)生改變時,會對其空間構(gòu)象產(chǎn)生影響,使構(gòu)象發(fā)生改變,空間 構(gòu)象有差異的單鏈DNA分子在聚丙烯酰胺凝膠中受到的阻力大小不同,這樣就可以通過聚 丙烯酰胺凝膠電泳對該位點SNP多態(tài)性進(jìn)行檢測。b、以引物P進(jìn)行PCR擴(kuò)增待測黃牛的FTO基因片段1、黃牛樣本的采集本發(fā)明具體以3個中國地方黃牛品種作為檢測對象,具體采集樣本見表1 河南南 陽牛(240),陜西秦川牛(144),河南平頂山市郟縣紅牛(151)。表1黃牛樣本的采集 2、血樣基因組DNA的提取、純化1)冷凍血樣(主要為血細(xì)胞)室溫解凍,轉(zhuǎn)移500 μ L至1. 5mL Eppendorf離心 管,加入等體積PBS液,充分混勻,12000r/min離心IOmin (4°C ),棄去上清液,重復(fù)上述步驟 至上清液透明、沉淀呈淡黃色;2)在離心管中加入DNA抽提緩沖液500 μ L,搖動,使血細(xì)胞沉淀脫離離心管管壁, 37°C 水浴 Ih ;3)加蛋白酶K至3yL(20mg/mL)并混勻,55°C過夜至澄清,尚未澄清者,可補(bǔ)加 ι μ L蛋白酶κ混勻繼續(xù)消化直至澄清;4)將反應(yīng)液冷卻至室溫,加Tris-飽和酚500 μ L,溫和搖動離心管20min,使其充 分混勻;4°C,12000r/min離心lOmin,將上清液轉(zhuǎn)入另一 1. 5mL離心管中,重復(fù)一次;5)加氯仿500 μ L,充分混勻20min,4°C,12000r/min離心lOmin,將上清液轉(zhuǎn)入另 一 1. 5mL離心管中;6)加氯仿、異戊醇混合液(24 1) 500 μ L,充分混勻20min, 4°C,12000r/min離心 lOmin,將上清液轉(zhuǎn)入另一 1. 5mL離心管中;7)加0. 1倍體積的NaAc緩沖液及2倍體積的冰冷的無水乙醇,混合轉(zhuǎn)動離心管, 直至白色的絮狀沉淀析出,_20°C保存30 60min ;8) 40C,12000r/min離心lOmin,棄去上清液,用70%冰冷乙醇漂洗DNA沉淀2次;9) 40C,12000r/min離心lOmin,棄去上清液,室溫下使乙醇揮發(fā)干凈;10)干燥后的DNA溶于80 100 μ L的TE液,4°C保存直至DNA完全溶解,0. 8%瓊 脂糖凝膠電泳檢測其質(zhì)量,-80°C保存。3. PCR 擴(kuò)增PCR反應(yīng)體系采用混合加樣法,即根據(jù)每一個反應(yīng)體系所需的各種組分的數(shù)量和 1次反應(yīng)所需的PCR反應(yīng)的個數(shù),算出各種反應(yīng)組分的總量,加入到1個1. 5mL離心管中,充 分混勻后瞬時離心,再分裝到每個0. 2mLEppendorfPCR管中,然后加入模板DNA,再瞬時離 心后進(jìn)行PCR擴(kuò)增;PCR反應(yīng)體系見表2 表2PCR反應(yīng)體系 25yL反應(yīng)體系包括0.625U Taq DNA聚合酶(北京天根科技有限公司), 2 X Buffer 12. 5μ L(內(nèi)含Mg2+、dNTPs等)(北京天根科技有限公司Mix),50ng/μ L含F(xiàn)TO 基因的黃?;蚪MDNA 0. 45 μ L,IOpmol/ μ L上、下游引物各0. 5 μ L ;PCR反應(yīng)程序94°C 預(yù)變性 5min;
94°C 變性 30 s,
57°C退火30 S, 夂30 35個循環(huán);
72 0C 延伸 30 s,^72°C延伸 IOmin ;對3個黃牛品種的535個樣本的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得535個個體的黃 牛FTO基因中包含該SNP位點的201bp的DNA片段。c、PCR產(chǎn)物經(jīng)過高溫變性后聚丙烯酰胺凝膠電泳分析1、擴(kuò)增產(chǎn)物的聚丙烯酰胺凝膠電泳1) 10%的聚丙烯酰胺凝膠(PAGE)的前期溶液的準(zhǔn)備蒸餾水5. 5mL、30%丙烯酰 胺 3. 25mL、10XTBE lmL、10% 的 APS 55 μ L、TEMED 10 μ L。2)配好上述溶液后,輕輕攪動,使其充分混勻。立即緩慢倒入已準(zhǔn)備好的玻璃板之 間,注意不要產(chǎn)生氣泡;倒好凝膠后,立即輕輕插入梳子,切勿在梳子齒下留有氣泡。3)待膠凝固后,拔掉梳子,將玻璃板轉(zhuǎn)到電泳槽上(Mini-PROTEAN 3),倒入 IX TBE緩沖液。4)取5yL PCR產(chǎn)物,加入5yL變性緩沖液(包含質(zhì)量分?jǐn)?shù)95%的甲酰胺、 0. 5mol/L的EDTA、質(zhì)量分?jǐn)?shù)0. 05%的溴酚蘭和質(zhì)量分?jǐn)?shù)0. 05%的二甲苯青),瞬時離心后 在PCR儀中94 98°C變性5 lOmin,取出后立即插入碎冰中,5min后全部上樣。5)用Mini-PROTEAN 3型電泳槽電泳時,在4°C條件下,先用300V電壓電泳10分 鐘,然后用200V電壓在4°C條件下電泳Ih。6)從電泳槽中吸出緩沖液,然后取出凝膠,用蒸餾水漂洗2 3次。7)用蒸餾水漂洗后,加入0. 硝酸銀脫色搖床上避光輕搖染色15min。8)加入少量顯色液(2%的碳酸鈉,每500mL溶液加ImL甲醛)預(yù)染30s,倒掉,然 后再倒入顯色液至浸沒凝膠,邊搖邊觀察,直到凝膠上顯現(xiàn)電泳帶。
9)待條帶清晰后,倒掉顯色液,用自來水沖洗凝膠終止顯色。2、聚丙烯酰胺凝膠分析銀染后聚丙烯酰胺凝膠利用BIO-RAD Gel Doc 2000凝膠成像系統(tǒng)照相分析,判斷 SNP的多態(tài)性FTO基因的第783bp由G突變?yōu)镃時,PCR擴(kuò)增的FTO基因產(chǎn)物產(chǎn)生不同的帶型。 由于黃牛為二倍體,所以黃?;蚪M的FTO基因的第783位的SNP多態(tài)性的聚丙烯酰胺凝 膠電泳結(jié)果如圖2所示783位為GG型表現(xiàn)為3條電泳條帶,GC型的表現(xiàn)為5條電泳條帶。 圖2所示的檢測樣本當(dāng)中,泳道1-6為GG基因型條帶,泳道7為GC基因型。3、不同基因型個體PCR產(chǎn)物的測序驗證對不同基因型個體PCR產(chǎn)物分別進(jìn)行正反雙向測序;同時,進(jìn)行SNP位置分析,結(jié) 果表明GC基因型的個體在FTO基因編碼區(qū)第783位的測序圖表示為G和C,如圖3a所示, 自左向右第4個峰為兩個峰;而GG基因型為G如圖3b所示自左向右第4個峰為單峰;CC 基因型在待測的群體樣本中沒有檢測到。d、黃牛FTO基因SNP位點的頻率統(tǒng)計分析1)基因和基因型頻率基因型頻率是指一個群體中某一性狀的某種基因型個體數(shù)占總個體數(shù)的比率。Paa =NAA/N,其中Paa代表某一位點的AA基因型頻率;Naa表示群體中具有AA基因型的個體數(shù); N為檢測群體的總數(shù)量。基因頻率是指一個群體中某一基因數(shù)對其等位基因總數(shù)的相對比率。計算的公式
可以寫成PA = (2NM+NAal+NAa2+NAa3+NAa4+......+NAan)/2N式中,Pa表示等位基因A頻率,Naa表示群體中具有AA基因型的個體數(shù)量,NAai表 示群體中具有Aai基因型個體數(shù)量,al-an為等位基因A的η個互不相同的復(fù)等位基因。本研究所涉及的等位基因為G和C,所以具體的基因頻率計算公式為Pg = (2Ngg+Ngc) /2NPc = (2NCC+NTC) /2N式中,Pe,Pc分別表示等位基因G和C等位基因的頻率,Ngg^Ngc和Nee分別表示GG、 GC和CC基因型的個體數(shù)量,N表示總?cè)后w數(shù)目。在不同黃牛品種FTO基因SNP中的G等位基因頻率變化幅度在97. 7% 99. 4%, C等位基因頻率變化幅度在0. 6% 2. 3%之間,具體如表3所示。表3黃牛FTO基因第783位SNP基因頻率分布表
8 e、黃牛FTO基因SNP位點基因效應(yīng)的關(guān)聯(lián)分析基因型數(shù)據(jù)基因型(GG和GC)生產(chǎn)數(shù)據(jù)南陽牛初生重,以及6月、12月、18月和24月的生長相關(guān)數(shù)據(jù)。關(guān)聯(lián)分析模型先對數(shù)據(jù)進(jìn)行描述分析,確定是否存在離群值,再利用最小二乘分析對數(shù)據(jù)進(jìn)行 校正;根據(jù)數(shù)據(jù)特征,應(yīng)用SPSS (13. 0)軟件的GLM過程分析基因型和對各性狀的效應(yīng)。在 對基因型效應(yīng)進(jìn)行分析時采用了固定模型Yijkl = μ +BFi+Monthj+Gk+eiju其中Yijkl為性狀觀察值,μ為總體均值,BFi為第i個品種的固定效應(yīng),Monthj為 第j個月觀測的固定效應(yīng),Gk為第k個單SNP標(biāo)記基因型的固定效應(yīng),eiJkl為隨機(jī)誤差。結(jié)果表明(如表4所示)在FTO基因編碼區(qū)的第783位點,在6月齡和24月齡 GG基因型的個體體長均高于GC基因型個體且差異顯著(P <0.05);說明GG基因型可以做 為一個提高黃牛體長的候選分子遺傳標(biāo)記,及時排除GC基因型個體將有利于優(yōu)質(zhì)種質(zhì)資 源的建立。表4FT0基因編碼區(qū)第783位SNP與南陽牛各月齡指標(biāo)之間的方差分析 注標(biāo)有不同的大寫字母表示差異極顯著(P < 0. 01)、標(biāo)有不同的小寫字母表示 差異顯著(P < 0. 05) ;Mean 士 SE,表示均值士標(biāo)準(zhǔn)誤。
權(quán)利要求
一種檢測黃牛FTO基因單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于,以包含F(xiàn)TO基因的待測黃牛全基因組DNA為模板,以引物對P為引物,PCR擴(kuò)增黃牛FTO基因;對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物94~98℃變性5~10min,再對變性后的擴(kuò)增片段進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳;根據(jù)電泳結(jié)果鑒定黃牛FTO基因編碼區(qū)第783位的單核苷酸多態(tài)性;所述的引物對P為上游引物gatgaaacattcctgac 17;下游引物gctttgatccttgcattacc20。
2.如權(quán)利要求1所述的檢測黃牛FTO基因單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于,所述的 PCR擴(kuò)增反應(yīng)程序為94°C預(yù)變性5min ;94°C變性30s,57°C退火30s,72°C延伸30s,30 35個循環(huán);72°C延 伸 IOmin0
3.如權(quán)利要求1所述的檢測黃牛FTO基因單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于,所述的 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的變性為將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物與等體積的變性緩沖液混合,瞬時離心后再94 98°C變性 5 IOmin ;所述的變性緩沖液包含質(zhì)量分?jǐn)?shù)95%的甲酰胺、0. 5mol/L的EDTA、質(zhì)量分?jǐn)?shù)0. 05%的 溴酚蘭和質(zhì)量分?jǐn)?shù)0. 05%的二甲苯青。
4.如權(quán)利要求1所述的檢測黃牛FTO基因單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于,所述的 聚丙烯酰胺凝膠電泳為質(zhì)量濃度為10%的聚丙烯酰胺凝膠。
5.如權(quán)利要求1所述的檢測黃牛FTO基因單核苷酸多態(tài)性的方法,其特征在于,根據(jù)電 泳結(jié)果鑒定黃牛FTO基因編碼區(qū)第783位的單核苷酸多態(tài)性為GG基因型表現(xiàn)為3條電泳 條帶,GC基因型的表現(xiàn)為5條電泳條帶。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種檢測黃牛FTO基因單核苷酸多態(tài)性的方法,以包含F(xiàn)TO基因的待測黃牛全基因組DNA為模板,以引物對P為引物,PCR擴(kuò)增黃牛FTO基因;對PCR產(chǎn)物進(jìn)行高溫變性后,再進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳;根據(jù)聚丙烯酰胺凝膠電泳結(jié)果鑒定黃牛FTO基因編碼區(qū)第783位(+1為翻譯起始位點)的單核苷酸多態(tài)性;由于FTO基因功能涉及體長和體高性狀,本發(fā)明提供的檢測方法為FTO基因的SNP與生長性狀關(guān)系的建立奠定了基礎(chǔ),以便用于中國黃牛肉用生長性狀的標(biāo)記輔助選擇(MAS),快速建立遺傳資源優(yōu)良的黃牛種群。
文檔編號C12Q1/68GK101906470SQ201010223349
公開日2010年12月8日 申請日期2010年7月9日 優(yōu)先權(quán)日2010年7月9日
發(fā)明者張寶, 張良志, 胡沈榮, 陳宏 , 雷初朝 申請人:西北農(nóng)林科技大學(xué)
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