專利名稱：毛發(fā)形狀易感性基因的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及與毛發(fā)形狀相關(guān)的基因、以及對(duì)于毛發(fā)形狀的遺傳易感性的判定、毛發(fā)形狀類型的檢測和/或判定、以及用于對(duì)毛發(fā)形狀的調(diào)節(jié)有效的成分的篩選的標(biāo)記、以及該標(biāo)記的用途。
背景技術(shù)：
根據(jù)毛發(fā)的卷曲程度，人的自然毛發(fā)形狀一般可以分為直發(fā)、波浪發(fā)(wavy hair)、卷發(fā)(curly hair)、卷縮發(fā)(kinky hair,coiled hair)。因?yàn)槊l(fā)形狀和發(fā)型是作為人的身體特征而容易識(shí)別的特性之一，另外，也是決定人的第一印象的重要因素，所以成為不論男女老少在美容上都重要關(guān)心的事。在卷曲程度強(qiáng)的卷縮發(fā)和卷發(fā)的情況下，因?yàn)榘l(fā)型的自由度受到限制而出現(xiàn)不能形成期望的造型等煩惱。另一方面，即使在直發(fā)的情況下，又會(huì)出現(xiàn)沒有發(fā)量，容易看出素顏等煩惱。作為改變毛發(fā)形狀和發(fā)型的方法，廣泛進(jìn)行的有通過各種定型劑和吹風(fēng)機(jī)/燙發(fā)器進(jìn)行的理發(fā)、卷曲/拉直燙發(fā)處理等。但是雖然這些處理能夠有效地改變毛發(fā)的形狀，卻對(duì)決定毛發(fā)形狀的原因完全沒有效果。因此，這些解決對(duì)策不是根本的對(duì)策，只是一時(shí)的方法，要維持毛發(fā)的形狀以及發(fā)型的話需要頻繁地重復(fù)這些處理，反而會(huì)增大對(duì)毛發(fā)的傷害， 結(jié)果損壞美容上的價(jià)值。因此，期待開發(fā)出在毛發(fā)生長出來的時(shí)候就能改變毛發(fā)的形狀，從根本上調(diào)節(jié)毛發(fā)形狀的調(diào)節(jié)方法。探索決定毛發(fā)形狀的原因，希望在開發(fā)從根本上調(diào)節(jié)毛發(fā)形狀的調(diào)節(jié)方法上，認(rèn)定作為其原因的基因可以提供有用的信息。對(duì)于有關(guān)毛發(fā)形狀的因素和基因，在引起毛發(fā)形狀變化的遺傳病(非專利文獻(xiàn)1 ；3)和藥劑產(chǎn)生的后天的卷發(fā)(非專利文獻(xiàn)4)，或者卷發(fā)模型動(dòng)物(非專利文獻(xiàn)5、6)等中有報(bào)告。但是，其中展示的因素和基因只不過是表示對(duì)毛發(fā)形狀產(chǎn)生影響的一個(gè)特殊例子，很難認(rèn)為是決定人的自然毛發(fā)的形狀的原因。但是，近些年來基因組分析技術(shù)也有飛躍的進(jìn)步，疾病和基因之間的關(guān)聯(lián)性也慢慢被解開。特別是，不僅僅是在由單基因發(fā)生變異或者異常所產(chǎn)生的所謂遺傳病中，而且在以糖尿病、高血壓等生活習(xí)慣病為首的頻率高的常見疾病(Common Disease)這樣以低的外顯率(Penetrance 在某種基因中具有變異的個(gè)體患有某疾病的比例)為特征的多基因性疾病中，頻繁進(jìn)行使用了患病同胞對(duì)連鎖分析等的非參數(shù)連鎖分析方法的發(fā)病基因 (responsible gene)的探索(例如，參照非專利文獻(xiàn)7)。另外，世界上也在大力進(jìn)行基于常見疾病的疾病關(guān)聯(lián)基因的變異為頻率高的基因多態(tài)性(Common Variant)，雖然在健康人中也存在，但是在患者身上保有率顯著較高的假說(Common Disease-Common Variant)，通過使用了基因多態(tài)性(例如，SNP (Single Nucleotide Polymorphism)單核苷酸多態(tài)性) 的連鎖不平衡分析來尋找發(fā)病基因(例如，參照非專利文獻(xiàn)8)。進(jìn)一步，最近根據(jù)國際人類基因單倍體型圖計(jì)劃(The International HapMap Project)的進(jìn)展，整理了 4個(gè)人群體中100萬處以上的頻率高的一般多態(tài)性(SNP)的數(shù)據(jù)庫，不僅是對(duì)常見疾病，還對(duì)關(guān)系到取決于人種或者群體其表現(xiàn)型不同的一般特性、例如皮膚顏色和頭發(fā)顏色、眼睛顏色等的基因的研究也在進(jìn)行中(例如，參照非專利文獻(xiàn)9、10)。認(rèn)為關(guān)于人的自然毛發(fā)的形狀也是同樣，也是根據(jù)人種或者群體其表現(xiàn)型不同的一般的特性。概括來說，亞洲人種多為直發(fā)，非洲人種主要為卷縮發(fā)(或者卷發(fā))。印歐人種則為這中間的波浪發(fā)(wavy hair)特性的比例較高。對(duì)于此遺傳模式，Rostand，J等首先觀察，報(bào)告了相對(duì)于直發(fā)，卷發(fā)為常染色體(半)顯性的特性(非專利文獻(xiàn)11)。另外， NCBI的人的孟德爾式遺傳數(shù)據(jù)庫(0MIM、http://www. ncbi.nlm. nih. gov/omim/)中也有關(guān)于卷發(fā)特性的記載。但是，對(duì)于成為決定人的自然的頭發(fā)形狀的原因的基因，還沒有徹底地進(jìn)行系統(tǒng)的基因組分析研究，因此尚未發(fā)現(xiàn)?，F(xiàn)有技術(shù)文獻(xiàn)非專利文獻(xiàn)非專利文獻(xiàn)1 =Norgett EE et al.，Hum. Mol. Genet. 9 (18)，p. 2761-2766，2000非專利文獻(xiàn) 2 :Moller LB et al. , Hum. Mutat. 26 (2), p. 84-93, 2005非專利文獻(xiàn)3 =Kjaer Kff et al. , Am. J. Med. Genet. Α. 127A(2), p. 152-157，2004非專利文獻(xiàn)4 :Cullen SI et al. , Arch. Dermatol. 125 (2), p. 252-255,1989非專利文獻(xiàn)5 :Du X et al. Genetics. 166 (1)，p. 331-340，2004非專利文獻(xiàn)6:Mann GB et al. , Cell. 73(2), p. 249-61,1993非專利文獻(xiàn)7 =Hanis CL et al. , Nat. Genet. 13 (2)，pl61_166，1996非專利文獻(xiàn) 8 =Altshuler D et al.，Nat. Genet. 26 (1)，p. 76—80，2000非專利文獻(xiàn)9 =Sulem P et al. , Nat. Genet. 39(12), p. 1443-1452，2007非專利文獻(xiàn)10 :Sabeti PC et al.，Nature. 449 (7164)，p. 913-918，2007非專禾丨J文獻(xiàn) 11 :Rostand J et al. ,「An Atlas of Human Genetics」，Hutchinson Scientific&Technical, London,pp.26-29,196
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明提供一種毛發(fā)形狀易感性基因，其中，所述毛發(fā)形狀易感性基因是與以下單倍域相重疊的基因，并且是包含該單倍域的堿基序列的一部分或者全部的基因，其中，所述單倍域是在人1號(hào)染色體的lq32. 1 lq32. 2區(qū)域(D1S249 D1S2891)上的、通過對(duì)等位基因頻率在具有卷發(fā)特性的群體和具有非卷發(fā)特性的群體之間在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著不同的單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記進(jìn)行連鎖不平衡分析來確定的、并且由序列號(hào)1 3中任意一個(gè)所表示的堿基序列構(gòu)成的單倍域。另外，本發(fā)明還提供一種毛發(fā)形狀判定標(biāo)記，其中，所述毛發(fā)形狀判定標(biāo)記是包含以下部分堿基序列的寡核苷酸或者多核苷酸或者它們的互補(bǔ)鏈，其中，所述部分堿基序列是上述單倍域的堿基序列中的部分堿基序列，并且，所述部分堿基序列由連續(xù)的堿基序列構(gòu)成，所述連續(xù)的堿基序列含有一個(gè)以上的單核苷酸多態(tài)性，所述單核苷酸多態(tài)性包括等位基因頻率在具有卷發(fā)特性的群體和具有非卷發(fā)特性的群體之間在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著不同的單核苷酸多態(tài)性(SNP)、以及與該SNP連鎖的SNP。另外，本發(fā)明還提供一種對(duì)被檢測者的毛發(fā)形狀的遺傳易感性的判定方法，其中， 包括以下工序(a) (c)(a)調(diào)制來自被檢測者的基因組DNA的工序；
(b)從該基因組DNA中，檢測出存在于上述單倍域中，等位基因頻率在具有卷發(fā)特性的群體和具有非卷發(fā)特性的群體之間在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著不同的單核苷酸多態(tài)性(SNP)以及與該SNP連鎖的單核苷酸多態(tài)性(SNP)的工序；以及(c)在該檢測出的SNP的等位基因頻率在卷發(fā)者群體中比在非卷發(fā)者群體中在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著高的情況下，判定為該被檢測者具有卷發(fā)的遺傳素質(zhì)；在該被檢測出的SNP的等位基因頻率在任意非卷發(fā)者群體中比在卷發(fā)者群體中在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著高的情況下，判定為該被檢測者不具有卷發(fā)的遺傳素質(zhì)的工序。另外，本發(fā)明還提供一種對(duì)被檢測者的毛發(fā)形狀的遺傳易感性的判定方法，其中， 所述判定方法包含在來自被檢測者的基因組DNA中的序列號(hào)1 3所表示的堿基序列中的下述表中所示的堿基號(hào)的堿基中的任意一個(gè)以上中，識(shí)別該堿基是堿基(i)還是堿基 (ii)，在為堿基(i)的情況下，判定為被檢測者具有卷發(fā)的素質(zhì)，在為堿基(ii)的情況下， 判定為被檢測者不具有卷發(fā)的素質(zhì)的工序。[表 1]
權(quán)利要求
1.一種毛發(fā)形狀易感性基因，其中，所述毛發(fā)形狀易感性基因是與以下單倍域相重疊的基因，并且是包含該單倍域的堿基序列的一部分或者全部的基因，其中，所述單倍域是在人1號(hào)染色體的lq32. 1 lq32. 2區(qū)域(D1S249 D1S2891)上的、通過對(duì)等位基因頻率在具有卷發(fā)特性的群體和具有非卷發(fā)特性的群體之間在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著不同的單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記進(jìn)行連鎖不平衡分析來確定的、并且由序列號(hào)1 3中任意一個(gè)所表示的堿基序列構(gòu)成的單倍域。
2.如權(quán)利要求1中所述的毛發(fā)形狀易感性基因，其中，所述基因選自 CSRP1、NAV1、IP09、TMEM58 以及 NUCKS1。
3.一種毛發(fā)形狀判定標(biāo)記，其中，所述毛發(fā)形狀判定標(biāo)記是包含以下部分堿基序列的寡核苷酸或者多核苷酸或者它們的互補(bǔ)鏈，其中，所述部分堿基序列是權(quán)利要求1所述的單倍域的堿基序列中的部分堿基序列，并且，所述部分堿基序列由連續(xù)的堿基序列構(gòu)成，所述連續(xù)的堿基序列含有一個(gè)以上的單核苷酸多態(tài)性，所述單核苷酸多態(tài)性包括等位基因頻率在具有卷發(fā)特性的群體和具有非卷發(fā)特性的群體之間在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著不同的單核苷酸多態(tài)性(SNP)、以及與該SNP連鎖的 SNP。
4.如權(quán)利要求3中所述的毛發(fā)形狀判定標(biāo)記，其中，所述SNP是選自以下的堿基中的SNP (1)序列號(hào)1所表示的堿基序列中，堿基號(hào)1(dbSNP數(shù)據(jù)庫ID :rs576697、T或者C)、 1635 (rs645390、G 或者 A) ,2527 (rs3767542、G 或者 A)、以及 3766 (rs675508、C 或者 A)所表示的堿基；(2)序列號(hào)2所表示的堿基序列中，堿基號(hào)為7519(rs2271763、G或者A)、 16901 (rsl0920260,T 或者 G)、30270 (rsl6849387、A 或者 G) ,31333 (rsl2127375、C 或者 G)、 50038 (rsl495840、T或者A)、以及63008 (rsl0920269, G或者Τ)所表示的堿基；以及，(3)序列號(hào)3所表示的堿基序列中，堿基號(hào)為245 (rs3805、T或者G)、以及 60701(^823114、6或者々)所表示的堿基。
5.如權(quán)利要求3或4中所述的毛發(fā)形狀判定標(biāo)記，其中，所述毛發(fā)形狀判定標(biāo)記由10 601個(gè)堿基長度的連續(xù)堿基序列構(gòu)成。
6.一種對(duì)被檢測者的毛發(fā)形狀的遺傳易感性的判定方法，其中，包括以下工序(a) (c)(a)調(diào)制來自被檢測者的基因組DNA的工序；(b)從該基因組DNA中，檢測出存在于權(quán)利要求1所述的單倍域中的、等位基因頻率在具有卷發(fā)特性的群體和具有非卷發(fā)特性的群體之間在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著不同的單核苷酸多態(tài)性(SNP)以及與該SNP連鎖的單核苷酸多態(tài)性(SNP)的工序；以及(c)在該檢測出的SNP的等位基因頻率在卷發(fā)者群體中比在非卷發(fā)者群體中在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著高的情況下，判定為該被檢測者具有卷發(fā)的遺傳素質(zhì)；在該被檢測出的SNP的等位基因頻率在任意非卷發(fā)者群體中比在卷發(fā)者群體中在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著高的情況下，判定為該被檢測者不具有卷發(fā)的遺傳素質(zhì)的工序。
7. 一種對(duì)被檢測者的毛發(fā)形狀的遺傳易感性的判定方法，其中， 包括以下的工序在來自被檢測者的基因組DNA中的序列號(hào)1 3所表示的堿基序列中的下述表中所示的堿基號(hào)的堿基中的任意一個(gè)以上中，識(shí)別該堿基是堿基(i)還是堿基(ii)，在為堿基(i) 的情況下，判定為被檢測者具有卷發(fā)的素質(zhì)；在為堿基(ii)的情況下，判定為被檢測者不具有卷發(fā)的素質(zhì)的工序。 [表Π]
8.一種對(duì)被檢測者的毛發(fā)形狀的遺傳易感性的判定用試藥，其中，所述判定用試藥含有在嚴(yán)格的條件下與權(quán)利要求3 5中任一項(xiàng)所述的毛發(fā)形狀判定標(biāo)記雜交的探針和/或引物。
9.如權(quán)利要求8所述的試藥，其中，所述探針和/或引物與所述標(biāo)記中含有權(quán)利要求4所述的SNP的區(qū)域雜交。
10.一種對(duì)被檢測者的毛發(fā)形狀的遺傳易感性的判定用試劑盒，其中，所述判定用試劑盒含有權(quán)利要求8或9所述的試藥。
11.一種篩選毛發(fā)形狀調(diào)節(jié)劑的方法，其中，包括以下工序(a)和(b)(a)用被檢測物質(zhì)向含有權(quán)利要求1或者2中所述的毛發(fā)形狀易感性基因的細(xì)胞給藥的工序；以及(b)從給藥的被檢測物質(zhì)中，選擇能夠使存在于該毛發(fā)形狀易感性基因上或者其附近、 并且等位基因頻率在具有卷發(fā)特性的群體和具有非卷發(fā)特性的群體之間在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著不同的單核苷酸多態(tài)性(SNP)以及和該SNP連鎖的單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記的堿基的多態(tài)性變換為其它多態(tài)性的物質(zhì)作為毛發(fā)形狀調(diào)節(jié)劑的工序。
12.一種毛發(fā)形狀類型的標(biāo)記，其中，所述毛發(fā)形狀類型的標(biāo)記由多核苷酸或者其部分多核苷酸構(gòu)成；或者由多肽或者其部分多肽構(gòu)成，其中，所述多核苷酸由序列號(hào)42、序列號(hào)44或者序列號(hào)46所表示的堿基序列、與其互補(bǔ)的堿基序列構(gòu)成，所述多肽由序列號(hào)43、序列號(hào)45或者序列號(hào)47所表示的氨基酸序列構(gòu)成。
13.如權(quán)利要求12所述的標(biāo)記，其中，所述部分多核苷酸為15個(gè)堿基以上的多核苷酸。
14.一種用于擴(kuò)增權(quán)利要求12所述標(biāo)記的引物，其中，所述引物由多核苷酸的部分多核苷酸構(gòu)成，其中，所述多核苷酸由序列號(hào)42、序列號(hào)44或者序列號(hào)46所示的堿基序列或者與其互補(bǔ)的堿基序列構(gòu)成。
15.一種用于檢測權(quán)利要求12所述標(biāo)記的探針，其中，所述探針由多核苷酸或者其部分多核苷酸構(gòu)成，其中，所述多核苷酸由序列號(hào)42、序列號(hào)44或者序列號(hào)46所示的堿基序列或者與其互補(bǔ)的堿基序列構(gòu)成。
16.一種用于檢測權(quán)利要求12所述的標(biāo)記的抗體，其中，所述抗體特異性識(shí)別由序列號(hào)43、序列號(hào)45或者序列號(hào)47所示的氨基酸序列構(gòu)成的多肽或者其部分多肽。
17.一種毛發(fā)形狀類型的檢測和/或判定方法，其中，包括以下工序(a) (c)(a)測定在來自被檢測者的樣品中權(quán)利要求12所述的標(biāo)記的表達(dá)量的工序；(b)將該(a)的測定結(jié)果與非卷發(fā)者的測定結(jié)果相比較的工序；以及，(c)基于(b)的結(jié)果判斷毛發(fā)形狀類型的工序。
18.如權(quán)利要求17所述的方法，其中，所述來自被檢測者的樣品是由從被檢測者采集的活體樣品調(diào)制的RNA或者由該RNA轉(zhuǎn)錄的互補(bǔ)多核苷酸。
19.如權(quán)利要求17所述的方法，其中，所述工序(a)是使從被檢測者采集的活體樣品和權(quán)利要求16所述的抗體相接觸，測定與該抗體結(jié)合的該活體樣品中的權(quán)利要求12所述的標(biāo)記的量的工序。
20.如權(quán)利要求17 19中任一項(xiàng)所述的方法，其中，從被檢測者采集的活體樣品為來自上皮組織或者上皮細(xì)胞的活體樣品。
21.一種毛發(fā)形狀調(diào)節(jié)劑的評(píng)價(jià)或者選擇方法，其特征在于，包括以下(a) (d)的工序(a)使被檢測物質(zhì)與權(quán)利要求1所述的毛發(fā)形狀易感性基因或者由該基因編碼的蛋白質(zhì)可能表達(dá)的細(xì)胞相接觸的工序；(b)測定被接觸的細(xì)胞的該基因或者該蛋白質(zhì)的表達(dá)量的工序；(c)將(b)中測定的表達(dá)量與不接觸被檢測物質(zhì)的對(duì)照細(xì)胞的該基因或者該蛋白質(zhì)的表達(dá)量進(jìn)行比較的工序；(d)基于(c)的結(jié)果，選擇使該基因或者該蛋白質(zhì)的表達(dá)量減少或者增多的被檢測物質(zhì)作為毛發(fā)形狀調(diào)節(jié)劑的工序。
22.一種毛發(fā)形狀調(diào)節(jié)劑的評(píng)價(jià)或者選擇方法，其特征在于，包括以下的(a) (c)的工序(a)向權(quán)利要求1所述的毛發(fā)形狀易感性基因可能表達(dá)的細(xì)胞中，導(dǎo)入該毛發(fā)形狀易感性基因的表達(dá)控制區(qū)域和報(bào)告基因的融合基因，并在被檢測物質(zhì)的存在條件下以及不存CN 102549156 A在條件下培養(yǎng)該細(xì)胞的工序；(b)測定在被檢測物質(zhì)的存在條件下培養(yǎng)的細(xì)胞培養(yǎng)物中的報(bào)告基因表達(dá)產(chǎn)物的表達(dá)量，并將該量與在被檢測物質(zhì)的不存在條件下培養(yǎng)的細(xì)胞培養(yǎng)物中的報(bào)告基因表達(dá)產(chǎn)物的表達(dá)量進(jìn)行比較的工序；(C)基于所述(b)的比較結(jié)果，選擇使報(bào)告基因表達(dá)產(chǎn)物的表達(dá)量增減的被檢測物質(zhì)作為毛發(fā)形狀調(diào)節(jié)劑的工序。
23.一種毛發(fā)形狀調(diào)節(jié)劑的評(píng)價(jià)或者選擇方法，其特征在于，包括以下的(a) (c)的工序(a)使被檢測物質(zhì)和含有權(quán)利要求1所述的毛發(fā)形狀易感性基因編碼的蛋白質(zhì)的水溶液、細(xì)胞或者由該細(xì)胞調(diào)制的細(xì)胞組分接觸的工序；(b)測定接觸了該被檢測物質(zhì)的水溶液、細(xì)胞或者細(xì)胞組分中的該蛋白質(zhì)的機(jī)能或者活性，并將該機(jī)能或者活性與不接觸被檢測物質(zhì)的對(duì)照水溶液、對(duì)照細(xì)胞或者對(duì)照細(xì)胞組分中所述蛋白質(zhì)的機(jī)能或者活性比較的工序；(c)基于所述(b)的比較結(jié)果，選擇使該蛋白質(zhì)的機(jī)能或者活性增減的被檢測物質(zhì)作為毛發(fā)形狀調(diào)節(jié)劑的工序。
24.一種毛發(fā)形狀類型的調(diào)節(jié)方法，其特征在于，控制人的毛發(fā)發(fā)根部的權(quán)利要求1所述的毛發(fā)形狀易感性基因的表達(dá)。
全文摘要
本發(fā)明提供一種與毛發(fā)形狀相關(guān)的基因多態(tài)性和毛發(fā)形狀易感性基因，以及用于判定各個(gè)被檢測者中對(duì)毛發(fā)形狀的遺傳易感性的方法。所述毛發(fā)形狀易感性基因是與以下單倍域相重疊的基因，并且是包含該單倍域的堿基序列的一部分或者全部的基因，其中，所述單倍域是在人1號(hào)染色體的1q32.1～1q32.2區(qū)域(D1S249～D1S2891)上的、通過對(duì)等位基因頻率在具有卷發(fā)特性的群體和具有非卷發(fā)特性的群體之間在統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著不同的單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記進(jìn)行連鎖不平衡分析來確定的、并且由序列號(hào)1～3中任意一個(gè)所表示的堿基序列構(gòu)成的單倍域。
文檔編號(hào)C12N15/09GK102549156SQ20108004485
公開日2012年7月4日 申請(qǐng)日期2010年10月5日 優(yōu)先權(quán)日2009年10月5日
發(fā)明者吉田寬, 布施千繪, 有波忠雄, 田口浩之 申請(qǐng)人:花王株式會(huì)社