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一種高效表達(dá)且易于純化β-甘露聚糖酶的基因工程菌株的構(gòu)建方法

文檔序號:398580閱讀:275來源:國知局
專利名稱:一種高效表達(dá)且易于純化β-甘露聚糖酶的基因工程菌株的構(gòu)建方法
技術(shù)領(lǐng)域
發(fā)明涉及一種高效表達(dá)且易于純化β -甘露聚糖酶的基因工程菌株的構(gòu)建方法, 屬于分子生物學(xué)和基因工程領(lǐng)域。
背景技術(shù)
β -甘露聚糖酶(β -mannanase EC3. 2. 1. 78)是一種半纖維素水解酶,以內(nèi)切方式降解β _1,4糖苷鍵,降解產(chǎn)物的非還原末端為甘露糖,其作用底物包括葡萄甘露聚糖, 半乳甘露聚糖及甘露聚糖等,甘露聚糖酶的來源非常廣泛,包括植物、細(xì)菌、真菌、 放線菌甚至軟體動物。β-甘露聚糖酶可消除食料中甘露聚糖的抗?fàn)I養(yǎng)作用,改善飼料的營養(yǎng)價值,以及配合其他的酶(木聚糖酶、蛋白酶)進(jìn)一步提高家畜的生產(chǎn)性能。是一種很有開發(fā)前景的新型飼料添加劑。此外,甘露聚糖酶在食品、保健、醫(yī)藥、造紙、紡織、石油開采和生物技術(shù)等方面有很大的應(yīng)用價值。利用產(chǎn)酶的微生物,采用基因工程技術(shù)進(jìn)行酶基因的克隆并使其高效表達(dá),然后采用發(fā)酵技術(shù)大規(guī)模生產(chǎn)是國內(nèi)外酶制劑研究的熱點領(lǐng)域,但高效表達(dá)的產(chǎn)物在分離純化的過程中依然存在困難,傳統(tǒng)的分離純化過于復(fù)雜,給工業(yè)化帶來額外的成本支出。枯草芽孢桿菌作為一種外源表達(dá)的宿主菌被廣泛的應(yīng)用到基因的克隆及過量的表達(dá),本發(fā)明是根據(jù)NCBI公布的基因序列設(shè)計引物,在下游引物上添加了組氨酸序列, 克隆得到的β -甘露聚糖酶基因manA^i與表達(dá)載體pMA5連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)Bacillus subtilis 168菌株,獲得重組菌株命名為BPM1003,成功構(gòu)建了一株高效表達(dá)且易于純化 β-甘露聚糖酶基因工程菌株命名為BPM1003,實現(xiàn)了 β-甘露聚糖酶的高效表達(dá)同時由于含有His-Tag而利于β-甘露聚糖酶的分離純化。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明主要研究內(nèi)容利用分子生物學(xué)技術(shù)獲得含有組氨酸序列的β -甘露聚糖酶基因,將其連與表達(dá)載體上轉(zhuǎn)化枯草芽孢桿菌,成功構(gòu)建基因工程菌株。在此基礎(chǔ)上,轉(zhuǎn)化Bacillussubtilis 168,構(gòu)建了一株高效表達(dá)的β -甘露聚糖酶基因工程菌株命名為 ΒΡΜ1003,利用親和層析法對表達(dá)的β -甘露聚糖酶通過Ni-NTA株純化,成功得到了純的 β -甘露聚糖酶,經(jīng)測定純化后的酶活力為3768. 7u/ml,并對酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了研究,以便為酶的應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。本發(fā)明的技術(shù)方案從Bacillus subtilis JNA(保藏號CTCC M 2009200)中提取染色體作為模板,根據(jù)設(shè)計好的引物及提前設(shè)計好的PCR擴(kuò)增條件和擴(kuò)增體系進(jìn)行PCR,利用凝膠回收試劑盒對PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化和回收。用PCR回收產(chǎn)物和質(zhì)粒pMA5進(jìn)行雙酶切,利用凝膠回收試劑盒回收雙酶切產(chǎn)物,利用T4DNA連接酶16°C過夜連接重組質(zhì)粒pMA5-manA2a,用連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)枯草芽孢桿菌168,挑取陽性轉(zhuǎn)化子到IOml液體LB培養(yǎng)基中,37°C搖床培養(yǎng)過夜,提取質(zhì)粒,酶切驗證正確后加入甘油,_20°C保藏備用,即成功構(gòu)建了基因工程菌BPM1003。 將凍管保藏的基因工程菌BPM1003按的接種量轉(zhuǎn)接到IOml液體LB培養(yǎng)基中,37°C搖床培養(yǎng)過夜。次日按2%的接種量轉(zhuǎn)接至50ml液體LB培養(yǎng)基中37°C搖床培養(yǎng)。發(fā)酵完成后,將發(fā)酵液4°C 8000r/min離心5min后棄上沉淀,將上清通過親和層析得到純酶液,粗酶液蛋白含量采用Bradford法測定,以BSA為標(biāo)準(zhǔn)蛋白。酶活的測定采用DNS法,經(jīng)測定純酶液的酶活力為3768. 7u/ml,比酶活是4579. 2u/mg,說明一株易于純化的β -甘露聚糖酶基因工程菌株構(gòu)建成功。本發(fā)明的有益效果甘露聚糖酶可消除食料中甘露聚糖的抗?fàn)I養(yǎng)作用,改善飼料的營養(yǎng)價值,以及配合其他的酶(木聚糖酶,蛋白酶)進(jìn)一步提高家畜的生產(chǎn)性能, 是一種很有開發(fā)前景的新型飼料添加劑。本發(fā)明構(gòu)建了一株甘露聚糖酶基因工程菌 ΒΡΜ1003,酶活力達(dá)到897.;3u/ml,是原始菌株的11. 7倍,實現(xiàn)了 β -甘露聚糖酶高效表達(dá); 利用親和層析法對表達(dá)的β -甘露聚糖酶通過M-NTA柱一步純化,經(jīng)測定純化后的酶活力為3768.7u/ml,SDS-PAGE蛋白電泳分析顯示成功得到了純的β -甘露聚糖酶,并對酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了研究,以便為酶的應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。


圖1 β -甘露聚糖酶manA的基因克隆驗證。1 :DL 2000degest marker ;2 β -甘露聚糖酶基因PCR產(chǎn)物。圖 2 重組質(zhì)粒 pMA5-manA 酶切驗證。Ml y -Hind III degest marker ;M2 :DL 2000degestmarkero圖3親和層析Ni-NTA柱純化得到純酶SDS-PAGE電泳圖。1 :Bacillus subtilis 168 ;2 :BPM1003 ;3 β -甘露聚糖酶;4 =Protein Marker。
具體實施例方式實施例1 β -甘露聚糖酶基因的克隆[1]根據(jù)NCBI公布的基因序列,利用DNAMAN軟件設(shè)計引物P1和Ρ2。P1 :5,-ATCGGATCCATGTTTAAGAAACATACGAT-3,P2 :5, -GGCACGCGTGTGGTGGTGGTGGTGGTGCTCAACGATTGGCGTTA-3,Bacillus subtilis JNA(保藏號 CTCC M 2009200)染色體 DNA 的提取,提取方法用接種環(huán)從新鮮的Bacillus subtilis JNA平板上挑取單菌落接種于LB液體培養(yǎng)基中,37°C振蕩過夜,次日取400 μ 1菌液,8000r/min離心3min,棄上清,用0. 5ml TE洗滌一次細(xì)胞,離心棄上清,再用0.5ml TE充分懸浮細(xì)胞,加入50 μ 1 10mg/ml的溶菌酶液,混勻, 37°C 水浴 2-3h,加入 100μ 110% SDS,混勻,37°C 保溫 30min,加入 50 μ 110mg/ml 的蛋白酶 K,65°C反應(yīng)3h,期間每隔半小時混勻一次,加入等體積飽和酚,混勻,8000r/min離心5min, 上清移入另一個離心管中,往上清液中加入等體積的飽和酚再次抽提,轉(zhuǎn)移上清到另一離心管中,加入等體積氯仿抽提兩次,8000r/min離心5min,將上清移入另一管中,加入2倍體積的無水乙醇和1/10體積的醋酸鈉,室溫放置5min,8000r/min離心2min,棄上清,用70% 乙醇懸浮細(xì)胞,離心,倒掉液體,倒置于吸水紙上,室溫晾干,用50 μ 1 TE溶解,-20°C保藏備用。
[2]以Bacillus subtilis JNA基因組DNA為模板,利用實施例1提供的引物做 PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增條件為94°〇,51^11,1個循環(huán);941,508,561,11^11 30s,72°C,Imin 30s, 35 個循環(huán);72°C,10min,l個循環(huán);15°C,lOmin,1個循環(huán)。擴(kuò)增體系:ddH20 17μ 1,模板2μ 1 引物 P1O. 5 μ 1,引物 P2O. 5 μ 1,dNTP Mix 2 μ 1,extaq-buffer 2· 5μ 1,ex—Taq 酶 O. 5 μ 1。 利用瓊脂糖凝膠回收盒對目的基因進(jìn)行回收,并進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳驗證(如圖1)。實施例2 重組質(zhì)粒pMA5-manA2a的構(gòu)建及轉(zhuǎn)化Bacillus subtilis 168構(gòu)建重組載體pMA5-manA2a,將實施例1 [2]中得到的β -甘露聚糖酶基因PCR產(chǎn)物與質(zhì)粒ΡΜΑ5同時用BamH I和Mlu I雙酶切,利用凝膠回收盒回收后進(jìn)行連接,連接體系目的基因酶切產(chǎn)物7. 5 μ 1,ρΜΑ5酶切產(chǎn)物0. 5 μ 1,T4DNA連接酶buffer 1 μ 1,T4DNA 連接酶1μ 1,16°C過夜連接。將連接好的重組質(zhì)粒pMA5-manA^i轉(zhuǎn)化到感受態(tài)Bacillus subtilisl68,轉(zhuǎn)化方法挑取Bacillus subtilis 168接種于5ml LB培養(yǎng),37°C搖床培養(yǎng)過夜;取IOOul過夜培養(yǎng)的菌液,接種于用50ml離心管配好的5ml SPI培養(yǎng)基中,37°C搖床培養(yǎng),當(dāng)菌株生長到對數(shù)末期時,快速取200 μ 1接種到aiil SPII培養(yǎng)基中,37°C 100r/min 搖床培養(yǎng)1. 5h加20ull00x EGTA溶液,于37°C 100r/min搖床培養(yǎng)lOmin,用1. 5ml離心管分裝成500ul每管,分別向管中加入質(zhì)粒,輕輕搖勻于37°C 100r/min搖床培養(yǎng)30min,將離心管轉(zhuǎn)移到250r/min搖床培養(yǎng)1. 5h,以4000r/min離心收集菌體,棄部分上清,留IOOul重懸菌體,涂布于相應(yīng)的抗性平板,37°C培養(yǎng)過夜,挑取陽性菌落。37°C搖床過夜培養(yǎng)后提取質(zhì)粒,酶切驗證(如圖2、獲得因工程菌株BPM1003。實施例3 產(chǎn)β -甘露聚糖酶重組菌株ΒΡΜ1003的表達(dá)檢測及純化將得到的產(chǎn)β -甘露聚糖酶重組菌株ΒΡΜ1003按2%的接種量接到新的50ml LB 液體培養(yǎng)基中,取發(fā)酵液,4°C 8000r/min離心5min后棄上沉淀,將上清通過Ni-NTA柱得到純酶液,取得到的純酶液IOul加相應(yīng)的上樣Marker作為樣品進(jìn)行SDS-PAGE檢測,其中 SDS-PAGE使用5%的分離膠和15%的濃縮膠,采用不連續(xù)垂直電泳,用考馬斯亮藍(lán)R250染色,以含有空載質(zhì)粒PMA5的Bacillus subtilis 168做空白對照(如圖3)。經(jīng)測定純化后的酶活力為3768. 7u/ml,是粗酶液酶活力的4. 2倍,比酶活達(dá)到4579. 2u/mg。
權(quán)利要求
1.一種高效表達(dá)且易于純化β-甘露聚糖酶的基因工程菌株的構(gòu)建方法,其特征是根據(jù)已知基因序列設(shè)計引物,并在引物下游添加組氨酸標(biāo)簽序列,從本實驗室篩選菌株枯草芽孢桿菌JNA(保藏號CTCC M 2009200)染色體中克隆得到的含信號肽同時含有組氨酸標(biāo)簽的β -甘露聚糖酶基因manA2a,獲得重組質(zhì)粒pMA5-manA2a,將該重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入到枯草芽孢桿菌Bacillus subtilis 168菌株中,獲得一株高效表達(dá)且易于純化β -甘露聚糖酶的基因工程菌株;
2.如權(quán)利要求1所述,其特征是根據(jù)NCBI公布的基因序列設(shè)計引物,并在下游引物上添加了組氨酸序列,用該引物在特定條件下擴(kuò)增β -甘露聚糖酶基因得到1099bp的特異性條帶,將其克隆到表達(dá)載體PMA5上,以枯草芽孢桿菌168為表達(dá)宿主,實現(xiàn)β -甘露聚糖酶基因的高效表達(dá)且易于純化;(1)β -甘露聚糖酶基因基因的克隆其特征是根據(jù)NCBI公布的全基因組核酸序列中β-甘露聚糖酶基因序列,設(shè)計引物Pl 和Ρ2Pl 5' -ATGTTTAAGAAACATACGAT-3‘ Bam H IΡ2 :5’ -TTAACGCCAATCGTTGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTG-3, Mlu I以枯草芽孢桿菌6-7總DNA為模板,利用上面提供的引物做PCR擴(kuò)增。(2)構(gòu)建重組質(zhì)粒pMA5-manAh將質(zhì)粒pMD18-manAh和質(zhì)粒pMA5分別用相應(yīng)酶切位點酶切,連接。(3)重組質(zhì)粒pMA5_manA2a 轉(zhuǎn)化 Bacillus subtilis 168重組質(zhì)粒?嫩5-11^1^加轉(zhuǎn)化83(^11118 subtilis 168,其特征是根據(jù)權(quán)利要求1中所述方法得到的重組質(zhì)粒pMA5-manA^i轉(zhuǎn)化感受態(tài)Bacillus subtilis 168菌株,利用卡那霉素抗性平板挑取陽性菌落,轉(zhuǎn)接到LB培養(yǎng)基中,37°C發(fā)酵培養(yǎng)12h,提取轉(zhuǎn)化子質(zhì)粒,酶切驗證,獲得重組菌株命名為Bacillus subtilis BPM1003。
3.甘露聚糖酶的表達(dá)及檢測,其特征在于將權(quán)利要求1中獲得的重組枯草芽孢桿菌發(fā)酵液離心后,取上清測定甘露聚糖酶酶活力,與原始菌株進(jìn)行比較,其特征是重組菌高效表達(dá)了 β -甘露聚糖酶,經(jīng)檢測其粗酶液的酶活可達(dá)到897. :3u/ml,是原始菌株酶活力的11. 7倍。
4.β -甘露聚糖酶的純化,其特征在于將權(quán)利要求2中的發(fā)酵液離心后上清直接通過M-NTA—步柱純化,成功的得到了純的β-甘露聚糖酶,實現(xiàn)了 β-甘露聚糖酶易于純化的目的,經(jīng)測定純化后的酶活力為3768. 7u/ml,是粗酶液酶活力的4. 2倍,比酶活達(dá)到 4579. 2u/mg。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種高效表達(dá)且易于純化β-甘露聚糖酶的基因工程菌株的構(gòu)建方法,其特征是根據(jù)NCBI公布的基因序列設(shè)計引物,在下游引物上添加了組氨酸序列,以Bacillus subtilis JNA染色體為模板克隆得到的β-甘露聚糖酶基因,用BamH I和Mlu I對PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒pMA5雙酶切,利用T4DNA連接酶于16℃過夜連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)Bacillus subtilis 168菌株,獲得重組菌株BPM1003,將離心后的發(fā)酵液通過Ni-NTA柱一步純化,得到了純的β-甘露聚糖酶,其酶活力達(dá)到3768.7u/ml,比酶活達(dá)到4579.2u/mg。
文檔編號C12R1/125GK102367448SQ201110289820
公開日2012年3月7日 申請日期2011年9月28日 優(yōu)先權(quán)日2011年9月28日
發(fā)明者劉項羽, 張顯, 徐美娟, 楊套偉, 饒志明 申請人:江南大學(xué)
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