專利名稱:一種PsPR10P956啟動子及其應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及一種啟動子及其應(yīng)用,特別涉及一種PsPR10P956啟動子及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
啟動子是DNA上結(jié)合RNA聚合酶并形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物的區(qū)域。外源基因在轉(zhuǎn)基因作物體內(nèi)的表達依靠啟動子對其的調(diào)控作用,表達量不足往往得不到理想轉(zhuǎn)基因植物。 因此,選擇合適的植物啟動子是增強外源基因表達首要問題。根據(jù)啟動子所控制的基因表達范圍和方式不同,啟動子可以分成組成型啟動子和特異性啟動子。在組成型表達啟動子的控制下,外源基因在轉(zhuǎn)基因植物的所有部位和所有的發(fā)育階段都會表達。外源基因在植物內(nèi)持續(xù)、高效的表達不但造成浪費,往往還會引起植物的形態(tài)發(fā)生改變,影響植物的生長和發(fā)育。為了使外源基因在植物體內(nèi)有效發(fā)揮作用,同時又可減少對植物的不利影響,近年來人們對特異性啟動子的研究越來越重視。隨著植物根特異性表達啟動子研究的不斷改進,現(xiàn)已分離了一些植物根特異性表達基因和增強序列,這些序列能在根部特異性或優(yōu)先激活從而啟動基因的表達,啟動子中存在負責(zé)根特異性表達的順式作用元件,受外來因素誘導(dǎo)或特定蛋白調(diào)控,包括組織特異性啟動子和誘導(dǎo)表達型啟動子。例如來自煙草的富含羥脯氨酸的糖蛋白(HRGP)基因,盡管其表達水平很低但是根特異性的,在煙草側(cè)根分化誘導(dǎo)過程中,在中柱鞘和內(nèi)皮層中其啟動子表現(xiàn)短時間活躍,特別是后期根發(fā)生組織細胞中活性強,屬于組織特異性啟動子。誘導(dǎo)表達是指植物細胞由于環(huán)境的變化而導(dǎo)致相關(guān)基因的表達。植物體內(nèi)存在著一套防御機制來對付不良環(huán)境,在這個過程中,環(huán)境誘導(dǎo)基因啟動子起著關(guān)鍵的作用。根對于植物從土壤中吸收水分和養(yǎng)分,維持正常生長具有重要作用。在環(huán)境脅迫下,最先受到影響的器官是根部組織,如果將根部誘導(dǎo)型特異性啟動子應(yīng)用于植物抗脅迫基因工程中,使抗性基因在根部細胞中特異表達,這樣就能降低能量消耗,使轉(zhuǎn)基因植物在獲得抗性的同時,又不影響正常的生長發(fā)育,對抗逆、抗病蟲的基因工程具有十分重要的意義。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明目的是提供一種能夠調(diào)控目的基因高效特異表達于植物的根部組織的 PsPR10P956啟動子,并應(yīng)用于植物抗逆基因工程。本發(fā)明采用的技術(shù)方案是一種I^raiOP956啟動子,所述啟動子含有下列任意一組核苷酸序列a、SEQ. ID. NO. 1所示的核苷酸序列;b、與SEQ. ID. NO. 1所示的核苷酸序列互補的序列;本發(fā)明也不排除對上述a或b所述序列進行一個或多個堿基的取代、缺失或修飾的核苷酸序列;或與上述a或b所述序列具有至少90%同源性的核苷酸序列。進一步,所述的I^raiOP956啟動子優(yōu)選為含有SEQ. ID. NO. 1所示的核苷酸序列的
啟動子。一種DNA構(gòu)建體,所述DNA構(gòu)建體包含所述的PsPR10P956啟動子以及與之進行可操作連接的基因序列。一種載體,所述載體含有所述的啟動子或所述的DNA構(gòu)建體。一種重組細胞,所述的重組細胞包含所述的啟動子或所述的DNA構(gòu)建體或所述的載體。進一步,所述的重組細胞優(yōu)選為重組大腸桿菌細胞或重組農(nóng)桿菌細胞。一種含有所述的啟動子或所述的DNA構(gòu)建體或所述的載體或所述重組細胞的植物愈傷組織或植物。進一步,所述的植物愈傷組織或植物優(yōu)選為煙草。所述的PsPR10P956啟動子在植物抗逆基因工程中的應(yīng)用。進一步,所述的I^raiOP956啟動子在植物抗逆基因工程中的應(yīng)用為Ι^Ι^10Ρ956 啟動子在抗逆轉(zhuǎn)基因煙草中的應(yīng)用將抗逆基因置于PsPR10P956啟動子下游,構(gòu)建植物表達載體,將載體導(dǎo)入煙草,得到抗逆轉(zhuǎn)基因煙草。本發(fā)明提供的啟動子核苷酸序列來自美洲東部白松(Pinus strobus) 0本發(fā)明利用同源克隆和RACE技術(shù)獲得美洲東部白松I3sI3RIO基因上游956bp序列啟動子,其核苷酸如SEQ. ID. NO. 1所示,具體方法如下本發(fā)明從美洲東部白松根中提取 DNA,根據(jù)國際基因庫(GenBank)中已經(jīng)發(fā)布的其它植物I3RlO基因上游DNA序列,設(shè)計引物,序列如下Fl =AAA AGCTTCTCGAGATGACTCTTRl :CATTTTCAACTCTCT CGCAACTA利用上述引物進行常規(guī)聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)。將PCR產(chǎn)物與克隆載體(pEASY-T) 連接轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5 α感受態(tài)細胞,然后篩選陽性重組子,進行序列測序,根據(jù)獲得的序列設(shè)計引物,引物序列如下F956 :AAAAGCTTGAATCAATACACCCCTCAAATR2 :AAGGATCCCATTTTCAACTCTCTCGCAAC以美洲東部白松根DNA為模板進行PCR擴增,將PCR產(chǎn)物與克隆載體(pEASY_T)連接轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5ci感受態(tài)細胞,然后篩選陽性重組子,進行序列測序,得到一個956bp 啟動子序列,將該序列命名為PsPR10P956。該啟動子序列SEQ. ID. NO. 1信.息如下
長度:956bp
類型核酸
鏈型雙鏈
來源美洲東部白松
-956GMTCMTACACCCCTCAAATGCACTTGGAGGGAATCGAACCTGGGTCTATGCTC
-901TMTACCATGTAGAGGTTTGTCGTTACACCAAAACTTGCAAGTGTTGATAAACTTCTAM
-841CGGTAAGATCCCCATGATGAMATTATGAATTGCATAGAAGTATGGTGATTACTCCAACA
-781AMTCTMTCCATCAATAAAMTGTACACAAACTMTTTTCATTTAATCTTTTTCTGCCC
-721ATTTAATAAAMGATCMAATTCTGGCAGCCGAATATTTGGTCTTTTGAACTTMCGAAT
-661ATATATATATCCACTGMAAGTCATTTTGAAATATATGCATTCCACGGTAGCGATGGCAC
-601GGCGTTGGTGMTGTAGAAGCCTTTGTAAGCAATTTACGGCGTCTTTGACATTTGTGTAT
-541CTCTTCTAGATGGGTTMCAACACGGACTGACAAMCCGCGGTGGTTAGGGAAGTTAGM
-481ACGATATTCATTGAAGGATCAGCCTGTAAATAAATAAATAAAAACAAATTATCCATTTCA
-421TGTCTTATCTTGTTATCTGGTCGTATCTACTCTTTGTCATTAATCGTCTCTGAMGTGGG
-361AACCGGMCCGGAATCGTCTCTTGTCATTAGATGAGAAGAGAAATAACAAATCACCATGG
-301GATCTAGAAACATCCATCCATTCCGTTTATTCAAAGTCAGCACACACAGTGGGGTCCGGG
-241GGATCGTTGTCCTTTAGGACTTATCGAAACCAGGCATGGAGCTCGGTATTGTCGGCCACA
-181AAGGCCMGGGTTCAATAAGMAACCCAAGTAGTTGGCATTATGTGCGTCCATCGGTCAG
-121TCCAAATAACMATAGTCACTTTCGAGTCTCATGTCATTACCTACGCGCTCTCTTTAATG
-61TACAGATTTTMAGGTTTGTMACGACTACTATAMTACGGGCTCGTCTAGTGCAGTTGA
-1GMCAAGGAGCTTTGTGCGATAATATTGAAGAAATATAAGTATTGTGTAGTTGCGAGAGA
60GTTGAAAATG啟動子序列SEQ. ID. NO. 1中負號表示啟動子序列,正號表示啟動子下游序列。與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的有益效果主要體現(xiàn)在本發(fā)明提供了一種新的 PsPR10P956啟動子,具有較高的根特異誘導(dǎo)表達活性,能夠提高下游基因根特異轉(zhuǎn)錄水平, 從而能夠應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因植物抗逆工程。
具體實施例方式下面結(jié)合具體實施例對本發(fā)明進行進一步描述,但本發(fā)明的保護范圍并不僅限于此基于本生煙草生長速度快、生活周期短、離體培養(yǎng)再生能力強和遺傳轉(zhuǎn)化效率高等特點,在下述實施例中以煙草為例對本發(fā)明進行了詳細說明。氨芐LB固體培養(yǎng)基、LB固體培養(yǎng)基、MS培養(yǎng)基、YEP培養(yǎng)基、YEP固體培養(yǎng)基、MS 預(yù)分化培養(yǎng)基、MS生根培養(yǎng)基、MS基本培養(yǎng)基、1/2MS培養(yǎng)基及其組成均為公知常識。實施例1 調(diào)控目的基因高效特異表達于植物的根部組織的美洲東部白松 ^Ι^10Ρ956啟動子的克隆1. DNA提取利用植物DNA提取試劑盒(TransGen,Bei jing)提取美洲東部白松基因組DNA,作為模板。2. PRlO基因上游DNA序列擴增利用引物Fl=AAA AGCTTCTCGAGATGACTCTT和Rl :CATTTTCAACTCTCT CGCAACTA進行 PCR 擴增,體系如下10XBuffer5y L,10mmoL/L dNTP 2 μ L, PCR 引物各 25pmol,DNA 模板 1 μ L (約200ng),Taq酶2U,加滅菌雙蒸水至50 μ L0PCR反應(yīng)步驟為94°C預(yù)變性5min ;93°C 變性30sec,50°C退火30sec,72°C延伸90sec,循環(huán)30次;最后72°C延伸lOmin。瓊脂糖凝膠電泳,利用膠回收試劑盒(TransGen,Beijing)回收片段,將所得片段連入pEASY_T載體(TransGen,Beijing),轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5 α感受態(tài)細胞CTransGen,Bei jing),然后利用氨芐LB固體培養(yǎng)基篩選陽性重組子,并進行PCR鑒定,然后進行序列測序,獲得一個1750bp 序列。3. PsPR10P956 啟動子獲得利用引物F956 :AAA AGC TTG AAT CAA TAC ACC CCT CAA AT 禾口 R2 :AAG GAT CCC ATT TTC AAC TCT CTC GCA AC 進行 PCR 擴增,體系如下10 XBuffer 5 μ L, 10mmoL/L dNTP2 uL, PCR引物各25pmol,DNA模板lyL(以步驟2獲得的1750bp序列為模板),Taq酶 2U,加滅菌雙蒸水至50 μ L。PCR反應(yīng)步驟為94°C預(yù)變性5min ;93°C變性30sec,50°C退火 30seC,72°C延伸70sec,循環(huán)30次;最后72°C延伸IOmin0 1 %瓊脂糖凝膠電泳,利用膠回收試劑盒回收片段,將所得片段連入pEASY-Τ載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5 α感受態(tài)細胞,然后利用氨芐LB固體培養(yǎng)基篩選陽性重組子,并進行PCR鑒定,然后進行序列測序,獲得一個 956bp序列,命名為PsPR10P956啟動子。實施例2 表達載體構(gòu)建及重組細胞的構(gòu)建1.根據(jù)實施例1分離的PsPR10P956啟動子核苷酸序列,設(shè)計引物正向引物5,-AAAAGCTTGAATCAATACACCCCTCAAAT-3,劃橫線部分為HindIII酶切位點反向引物5,-AAGGATCCCATTTTCAACTCTCTCGCAAC-3,劃橫線部分為BamH I酶切位點以該啟動子全長測序質(zhì)粒為模板,利用上述正向和反向引物進行PCR反應(yīng)。2.取PCR產(chǎn)物2 μ L與克隆載體pEASY-T載體(TransGen,Beijing)連接轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5 α感受態(tài)細胞(TRANS,北京),然后在含有卡那霉素(50mg/L)的LB固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)過夜,篩選陽性重組子,進行PCR鑒定,獲得陽性大腸桿菌。3.利用質(zhì)粒提取試劑盒(TRANS,北京)提取上述步驟2得到的陽性大腸桿菌的質(zhì)粒,將質(zhì)粒用HindIII和BamH I酶切,與用相同限制酶酶切的pBI121表達載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5 α感受態(tài)細胞,然后在含有卡那霉素(50mg/L)的LB固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)過夜,對生長出的菌落進行PCR鑒定和質(zhì)粒酶切鑒定,獲得表達載體pBI 121。4.取5μ 1表達載體pBI121,加入200μ 1農(nóng)桿菌感受態(tài)細胞(Agrobacterium tumefaciens),混勻;冰浴5min,再利用液氮冷凍lmin,迅速置于37°C水浴溫育5min,然后冰浴aiiin ;加入800 μ 1 YEB液體培養(yǎng)基,在,250r/min培養(yǎng)4 證;用移液器將菌液轉(zhuǎn)移至YEB固體選培養(yǎng)基(含100 μ g/ml利福平,50 μ g/ml卡那霉素)表面,均勻涂布于整個平板;倒置培養(yǎng)1 2d,可看到單克隆,挑取單菌落用微量堿法提取質(zhì)粒,進行PCR 和酶切檢測,獲得重組農(nóng)桿菌細胞。實施例3 轉(zhuǎn)基因植株的獲得(1)本生煙草(Nicotiana tabacum)種子,播種于MS培養(yǎng)基中,25°C培養(yǎng)至5_6片真葉期,備用。(2)挑取實施例2重組農(nóng)桿菌(攜帶重組質(zhì)粒的農(nóng)桿菌單菌落)接種于含50mg/L 的卡那霉素YEP培養(yǎng)基中,28°C,250rpm,振蕩培養(yǎng)4 至對數(shù)生長后期,將菌液用MS液體培養(yǎng)基稀釋10倍待用。(3)取步驟⑴煙草葉片剪切成5mmX 5mm小塊,置于MS預(yù)分化培養(yǎng)基中J8°C,光照為16h/d,2000Lux,預(yù)培養(yǎng)2d,獲得煙草葉片外植體。(4)將步驟(3)預(yù)培養(yǎng)的煙草葉片外植體浸入上述步驟(2)菌液中5 lOmin,用滅菌濾紙吸干多余菌液,轉(zhuǎn)入MS基本培養(yǎng)基,弱光,280C,共培養(yǎng)2d。(5)共培養(yǎng)后的煙草葉片外植體先用含氨芐青霉素250mg/L的無菌水洗滌3次,再用含氨芐青霉素250mg/L的MS培養(yǎng)基洗滌1次,然后用濾紙吸干,轉(zhuǎn)入含卡那霉素IOOmg/ L,氨芐青霉素250mg/L的MS培養(yǎng)基上,25°C恒溫培養(yǎng),芽長至Icm時,切下芽后,將芽轉(zhuǎn)入含卡那霉素50mg/L,氨芐青霉素250mg/L的MS生根培養(yǎng)基中,25°C恒溫培養(yǎng)促進生根,生根后,移入無菌土的花盆中,溫室中培養(yǎng)收種子,獲得的Tl、T2和T3代轉(zhuǎn)基因煙草種子。(6)轉(zhuǎn)基因陽性植株及其鑒定將上述步驟(5)中獲得的T1、T2和Τ3代轉(zhuǎn)基因煙草種子先用70%乙醇消毒30 60s,10%次氯酸鈉消毒15min,用滅菌水漂洗至少4次;去盡水加入0. 2%的瓊脂,將種子均勻分布到1/2MS培養(yǎng)基(含50mg/L卡那霉素)表面 ’轉(zhuǎn)入光照培養(yǎng)箱中培養(yǎng)10天,葉片顏色為綠色的幼苗即為陽性苗(煙草轉(zhuǎn)基因陽性植株),并提取煙草葉片基因組DNA,利用PCR驗證獲得轉(zhuǎn)基因陽性植株。實施例4 啟動子提高根部基因表達能力分析⑶S染色檢測發(fā)現(xiàn)I^raiOP956啟動子下游⑶S基因表達活性顯著提高,達到 1350pM mfmiiT1,具有較高的根特異表達能力。該基因可以轉(zhuǎn)化水稻等農(nóng)作物,提高其抗脅迫能力,具有重大的經(jīng)濟和社會價值。
權(quán)利要求
1.一種I^PR10P956啟動子,其特征在于所述啟動子含有下列任意一組核苷酸序列a、 SEQ. ID. NO. 1所示的核苷酸序列;b、與SEQ. ID. NO. 1所示的核苷酸序列互補的序列。
2.如權(quán)利要求1所述的I^raiOP956啟動子,其特征在于所述啟動子為含有SEQ. ID. NO. 1所示的核苷酸序列的啟動子。
3.一種DNA構(gòu)建體,其特征在于所述DNA構(gòu)建體包含權(quán)利要求1所述的PsPR10P956啟動子以及與之進行可操作連接的基因序列。
4.一種載體,其特征在于所述載體含有權(quán)利要求1所述的啟動子或權(quán)利要求3所述的 DNA構(gòu)建體。
5.一種重組細胞,其特征在于所述的重組細胞包含權(quán)利要求1所述的啟動子、權(quán)利要求3所述的DNA構(gòu)建體或權(quán)利要求4所述的載體。
6.如權(quán)利要求5所述的重組細胞,其特征在于所述的重組細胞為重組大腸桿菌細胞或重組農(nóng)桿菌細胞。
7.一種含有權(quán)利要求1所述的啟動子、權(quán)利要求3所述的DNA構(gòu)建體、權(quán)利要求4所述的載體或權(quán)利要求5所述重組細胞的植物愈傷組織或植物。
8.如權(quán)利要求7所述的植物愈傷組織或植物為煙草。
9.如權(quán)利要求1所述的PsPR10P956啟動子在植物抗逆基因工程中的應(yīng)用。
10.如權(quán)利要求9所述的I^raiOP956啟動子在植物抗逆基因工程中的應(yīng)用,其特征在于所述的應(yīng)用為I^raiOP956啟動子在抗逆轉(zhuǎn)基因煙草中的應(yīng)用將抗逆基因置于 PsPR10P956啟動子下游,構(gòu)建植物表達載體,將載體導(dǎo)入煙草,得到抗逆轉(zhuǎn)基因煙草。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種PsPR10P956啟動子、DNA構(gòu)建體、載體、重組細胞、植物愈傷組織或植物及所述的PsPR10P956啟動子在植物抗逆基因工程中的應(yīng)用,所述啟動子含有下列任意一組核苷酸序列a、SEQ.ID.NO.1所示的核苷酸序列;b、與SEQ.ID.NO.1所示的核苷酸序列互補的序列;本發(fā)明PsPR10P956啟動子具有較高的根特異誘導(dǎo)表達活性,能夠提高下游抗逆基因根特異轉(zhuǎn)錄水平,從而能夠增強轉(zhuǎn)基因植物抗逆能力。
文檔編號C12N5/10GK102392022SQ201110385580
公開日2012年3月28日 申請日期2011年11月28日 優(yōu)先權(quán)日2011年11月28日
發(fā)明者徐祥彬, 王慧中 申請人:杭州師范大學(xué)