專利名稱：百合屬est-ssr標(biāo)記及應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及分子生物學(xué)DNA標(biāo)記技術(shù)與應(yīng)用領(lǐng)域，特別涉及4個(gè)百合屬EST-SSR標(biāo)記及應(yīng)用。
背景技術(shù)：
分子標(biāo)記廣泛應(yīng)用于種質(zhì)資源遺傳多樣性分析以及 輔助育種工作中。百合屬的分子標(biāo)記研究始于1993年，然而限于科學(xué)技術(shù)發(fā)展的水平，之后的十多年在百合屬植物上開(kāi)發(fā)的標(biāo)記主要是以隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RAPD)為主的第一代分子標(biāo)記，這類標(biāo)記重復(fù)性較差。表達(dá)序列標(biāo)簽(Express sequence tag, EST)中含有許多簡(jiǎn)單重復(fù)序列(Simplesequence repeat, SSR),已經(jīng)成為普遍認(rèn)可的第二代分子標(biāo)記,具有重復(fù)性好,共顯性，易于檢測(cè)的特點(diǎn)。2008年和2011年，楊素_和Sung-Il Lee分別利用GeneBank公布的百合屬EST序列(分別為1688條和2235條)開(kāi)發(fā)了 12條和19條EST-SSR標(biāo)記。分子標(biāo)記的數(shù)量影響著種質(zhì)資源遺傳多樣性分析的準(zhǔn)確性和遺傳圖譜構(gòu)建的精確性，現(xiàn)有的百合屬分子標(biāo)記數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足百合屬分子生物學(xué)研究的需求。為開(kāi)發(fā)更多的標(biāo)記，本發(fā)明利用GeneBank公布的百合屬的3332條EST序列(截止2012年6月20日)以及MISA軟件尋找SSR，合成了 48對(duì)引物，經(jīng)5類百合品種和2個(gè)野生型百合共26個(gè)不同基因型百合篩選，得到4個(gè)不同于前人的具有多態(tài)性的通用型標(biāo)記。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明要解決的技術(shù)問(wèn)題是，克服現(xiàn)有技術(shù)中的不足，提供4個(gè)新的百合屬EST-SSR標(biāo)記及應(yīng)用。為了解決技術(shù)問(wèn)題，增加百合屬分子標(biāo)記的數(shù)量以應(yīng)用于今后的育種工作中，本發(fā)明提供了 4個(gè)新的分子標(biāo)記。所述百合屬EST-SSR標(biāo)記分別是一組引物對(duì)，其序列如SEQID NO: I 至 SEQ ID NO: 8 所示。本發(fā)明還提供了所述的百合屬EST-SSR標(biāo)記在百合屬植物種質(zhì)資源遺傳多樣性分析以及輔助育種中的應(yīng)用。本發(fā)明提供4個(gè)百合屬分子標(biāo)記，4個(gè)分子標(biāo)記的特征如表I所示表I百合屬EST-SSR標(biāo)記的特征(SEQ ID NO :1-8)
權(quán)利要求
1.一種百合屬EST-SSR標(biāo)記，其特征在于，該標(biāo)記是一組引物對(duì)，其序列如SEQ ID NO:I 和 SEQ ID NO: 2 所示。
2.一種百合屬EST-SSR標(biāo)記，其特征在于，該標(biāo)記是一組引物對(duì)，其序列如SEQ ID NO:3 和 SEQ ID NO: 4 所示。
3.一種百合屬EST-SSR標(biāo)記，其特征在于，該標(biāo)記是一組引物對(duì)，其序列如SEQ ID NO:5 和 SEQ ID NO: 6 所示。
4.一種百合屬EST-SSR標(biāo)記，其特征在于，該標(biāo)記是一組引物對(duì)，其序列如SEQ ID NO:7 和 SEQ ID NO: 8 所示。
5.權(quán)利要求I至4任意一項(xiàng)中所述的百合屬EST-SSR標(biāo)記在百合屬植物種質(zhì)資源遺傳多樣性分析以及輔助育種中的應(yīng)用。
全文摘要
本發(fā)明分子生物學(xué)DNA標(biāo)記技術(shù)與應(yīng)用領(lǐng)域，旨在提供4個(gè)百合屬EST-SSR標(biāo)記及應(yīng)用。該4個(gè)標(biāo)記分別是一組引物對(duì)，其序列如SEQ ID NO: 1-8所示。本發(fā)明的4個(gè)分子標(biāo)記在26個(gè)百合種或品種中有多態(tài)性，在26個(gè)百合種或品種中進(jìn)行的遺傳多樣性分析與百合屬植物分類常識(shí)相吻合(

圖1)，是穩(wěn)定存在的新標(biāo)記，可以直接將本發(fā)明所提供的4個(gè)引物對(duì)應(yīng)用于更多百合屬植物上，進(jìn)行種質(zhì)資源和遺傳多樣性分析。本發(fā)明的4 個(gè)分子標(biāo)記均來(lái)自于百合花發(fā)育相關(guān)基因EST序列，為克隆百合屬植物花發(fā)育相關(guān)基因、基因序列分析奠定了良好的基礎(chǔ)。
文檔編號(hào)C12N15/11GK102787115SQ201210270328
公開(kāi)日2012年11月21日 申請(qǐng)日期2012年7月30日 優(yōu)先權(quán)日2012年7月30日
發(fā)明者夏宜平, 杜方, 高中山 申請(qǐng)人:浙江大學(xué)