專利名稱：一種新的宮頸組織特異性差異表達基因的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明專利屬于分子生物學或醫(yī)學診斷技術(shù)領(lǐng)域，涉及一種新的宮頸組織特異性差異表達基因。
背景技術(shù)：
宮頸癌是一種婦科惡性腫瘤，而早期發(fā)現(xiàn)是腫瘤有效治療的關(guān)鍵。維吾爾族婦女宮頸癌的發(fā)病率和和死亡率很高，列為新疆特高發(fā)腫瘤。由于現(xiàn)有腫瘤診斷技術(shù)固有的局限性，臨床收治的腫瘤患者中，中晚期居多，治療效果較差。腫瘤特異性差異表達基因可以成為腫瘤發(fā)生密切相關(guān)的早期預警分子標志物，是建立腫瘤早期分子診斷方法的重要前提。本發(fā)明相關(guān)的技術(shù)包括四個關(guān)鍵步驟:(I)收集病理確診的腫瘤、癌前病變患者及健康對照組織標本，制備組織RNA (Ribonucleic Acid,核糖核酸)，其組織RNA —般含有信使RNA (messenger RNA, mRNA)、核糖體 RNA (ribose RNA, rRNA)和轉(zhuǎn)移 RNA (transport RNA,tRNA) ；(2)選擇人類全基因組表達譜芯片，通過腫瘤與正常組織mRNA的差異表達譜分析，建立腫瘤及癌前病變組織特異性候選差異表達基因譜(mRNA譜)，并進一步在線數(shù)據(jù)庫、專業(yè)軟件及資源查新分析，鑒別出新的腫瘤特異性差異表達候選基因(mRNA) ；(3)以組織RNA為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶催化下，合成與其mRNA互補的脫氧核糖核苷酸(complementarydeoxyribonucleic acid, cDNA) ； (4)設(shè)計與合成每一種mRNA序列特異性引物后,利用cDNA模板、Taq DNA聚合酶及聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction, PCR)方法,檢測目的基因的mRNA表達水平，篩選出mRNA表達水平上具有顯著差異的候選基因，并淘汰無差異基因。在此，“引物”是指以DNA聚合酶催化反應(yīng)所必需的18-22寡聚核苷酸(堿基)分子，而“逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)”和“PCR”屬 于同一個檢測步驟的連續(xù)過程，一般統(tǒng)稱為RT-PCR。據(jù)既往文獻記載，通過宮頸癌組織的人類全基因組芯片研究，不同研究者發(fā)現(xiàn)了一系列宮頸癌組織特異性差異表達基因，并已公開報道。當時，人們所采用的人類全基因組表達譜芯片所含基因條數(shù)有限，而且對新疆維吾爾族婦女宮頸癌的相關(guān)研究報道幾乎空白。近期，隨著人類全基因組表達譜芯片技術(shù)的優(yōu)化與完善，芯片所含基因種類不斷增加。本發(fā)明采用新的人類全基因組表達譜芯片，對維吾爾族婦女宮頸癌組織進行篩查分析及單一基因表達水平的RT-PCR驗證，發(fā)現(xiàn)一系列尚未報道的宮頸癌組織特異性差異表達基因。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是克服現(xiàn)有技術(shù)中存在的缺陷，利用維吾爾族婦女宮頸癌及癌前病變組織RNA，通過高密度人類全基因組表達譜芯片及單一候選基因表達水平的RT-PCR鑒定，本發(fā)明提供至今尚未報道的宮頸癌組織特異性差異表達基因種類。其技術(shù)方案如下:一種新的宮頸組織特異性差異表達基因，包括6種宮頸癌特異性上調(diào)表達基因，SHISA2、SIXl、DTL、DSG2、NUP62CL和AP0BEC3B和5種宮頸癌特異性下調(diào)表達基因，F(xiàn)OSB,DNASE1L3、EGRl、ABI3BP和F0S。上述基因的基因(DNA)、RNA和蛋白質(zhì)序列信息如表I所/Jn ο表I 11種新的宮頸癌特異性差異表達基因的序列信息

權(quán)利要求
1.一種新的宮頸組織特異性差異表達基因，其特征在于，包括6種宮頸癌特異性上調(diào)表達基因，SHISA2、SIX1、DTL、DSG2、NUP62CL和AP0BEC3B和5種宮頸癌特異性下調(diào)表達基因，F(xiàn)OSB, DNAS E IL3, EGRU ABI3BP 和 F0S。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種新的宮頸組織特異性差異表達基因，包括6種宮頸癌特異性上調(diào)表達基因，SHISA2、SIX1、DTL、DSG2、NUP62CL和APOBEC3B和5種宮頸癌特異性下調(diào)表達基因，F(xiàn)OSB、DNASE1L3、EGR1、ABI3BP和FOS。上述基因的基因(DNA)、RNA和蛋白質(zhì)序列信息如表3。本發(fā)明對探索宮頸病變的發(fā)生與發(fā)展規(guī)律，建立宮頸癌早期臨床診斷方法，提高新疆宮頸癌的防治水平都具有重要意義。
文檔編號C12N15/12GK103243104SQ201310180798
公開日2013年8月14日 申請日期2013年5月10日 優(yōu)先權(quán)日2013年5月10日
發(fā)明者阿布力孜·阿布杜拉, 劉開江, 郭霞, 阿仙姑·哈斯木, 阿比達·阿不都卡德爾, 阿比班·艾庫拉, 阿麗葉古麗·艾皮熱, 吐爾遜帕夏·吾布力卡斯木, 希爾扎提·蘇萊曼, 瑪依拉·卡米力江, 武貴臻, 古麗扎熱葉·阿庫拉, 布威海麗且姆·阿巴拜科日 申請人:新疆醫(yī)科大學