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一種宮頸癌人半翼基因熒光定量rt-pcr試劑盒及非診斷性檢測方法

文檔序號:460867閱讀:307來源:國知局
一種宮頸癌人半翼基因熒光定量rt-pcr試劑盒及非診斷性檢測方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR試劑盒及非診斷性檢測方法,其中包括宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR的檢測的引物、探針的核苷酸序列設(shè)計,樣品要求的控制、樣品RNA提取液中微量hWAPL和β-actin基因DNA存在影響的消除、宮頸癌mRNA熒光PCR檢測——質(zhì)控品、定量參考品、內(nèi)參照質(zhì)控品等的制備和應(yīng)用,臨界值標(biāo)定,以及針對目前hWAPL基因mRNA熒光定量RT-PCR檢測方法,可能產(chǎn)生假陽性和假陰性的缺陷,提供一種宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR非診斷性檢測方法。該檢測方法具有特異、靈敏、穩(wěn)定、操作簡便的特點。
【專利說明】—種宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR試劑盒及非診斷性檢測方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明屬于分子生物學(xué)和實驗診斷學(xué)【技術(shù)領(lǐng)域】,具體涉及一種宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR試劑盒及非診斷性檢測方法。
【背景技術(shù)】
[0002]宮頸癌是女性最常見的生殖道惡性腫瘤之一,目前宮頸癌仍然是導(dǎo)致我國婦女死亡的主要原因之一,且宮頸癌的發(fā)生率有上升和年輕化趨勢。
[0003]目前,醫(yī)院普遍采用傳統(tǒng)的宮頸癌檢測是針對宮頸癌的具體癥狀或已有病變進(jìn)行TCT+HPV檢查,這種方法僅在形態(tài)上檢測癌細(xì)胞是否存在,不足以確證癌細(xì)胞,而對于沒有產(chǎn)生癌變的細(xì)胞,更不能檢測。宮頸癌基因檢測可以深入對癌細(xì)胞進(jìn)行剖析,對確認(rèn)癌細(xì)胞存在提供有力的證明。
[0004]hWAPL基因是Verni等在2000年發(fā)現(xiàn)果蠅體內(nèi)半翼基因,并在人體內(nèi)的存在同源序列。目前研究表明,hWAPL基因在宮頸癌組織中過度表達(dá)。hWAPL在宮頸癌組織中的表達(dá)水平顯著高于正常宮頸組織以及各類癌組織,相對于HPV感染來說,hWA PL的表達(dá)與宮頸癌關(guān)系可能更為密切。
[0005]目前文章發(fā)表的宮頸癌hWAPL基因熒光定量RT-PCR檢測方法,在于設(shè)計一對引物、熒光探針或SYBRGreenren的DNA染色,進(jìn)行熒光定量RT-PCR檢測,在質(zhì)量控制方法方面,僅局限于使用內(nèi)參基因。這些文章的研究僅停留在研究階段,距離在臨床檢測宮頸癌變,將此提高到一項實用性、可推廣、商品化技術(shù),還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠,特別在質(zhì)量控制層面研究更加不夠,由于質(zhì)量控制問題,在檢測臨床樣本時可能造成假陽性和假陰性,由此阻礙這項檢測方法在臨床樣本檢測的應(yīng)用和推廣。
[0006]本專利改進(jìn)現(xiàn)有hWA PL基因mRNA熒光定量RT — PCR技術(shù),使之具有特異、靈敏、穩(wěn)定、操作簡便等的特點,提出一種質(zhì)量控制系列方法的組合,這一系列質(zhì)控方法的組合消除了 hWA PL基因mRNA熒光定量RT-PCR檢測的假陽性和假陰性,提高了該檢測方法的準(zhǔn)確性和在臨床實驗診斷的實用性,并對其它基因mRNA熒光定量RT-PCR檢測的臨床實驗診斷的實用性提高,也有重要參考價值。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0007]本發(fā)明的目的在于提供了一種宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR試劑盒,包括:引物,熒光探針,陰性質(zhì)控品,陽性質(zhì)控品,DEPC水,hWAPL定量參考品,β -actin定量參考品,逆轉(zhuǎn)錄酶,逆轉(zhuǎn)錄緩沖液,RNasin, MgCl2, Taq酶,甘油,dNTP, PCR緩沖液。
[0008]本發(fā)明的目的是針對目前hWA PL基因mRNA熒光定量RT-PCR檢測方法,可能產(chǎn)生假陽性和假陰性的缺陷,提供一種宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR非診斷性檢測方法,具有特異、靈敏、穩(wěn)定、操作簡便等的特點。
[0009]為了達(dá)到上述目的, 本發(fā)明采取以下技術(shù)措施:[0010]一種宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR檢測試劑盒,包括:
[0011]引物,熒光探針,陰性質(zhì)控品,陽性質(zhì)控品,DEPC 7jC, hWAPL定量參考品,β -actin定量參考品,逆轉(zhuǎn)錄酶,逆轉(zhuǎn)錄緩沖液,RNasin, MgCl2, Taq酶,甘油,dNTP, PCR緩沖液。
[0012]所述的引物如下:
[0013]
【權(quán)利要求】
1.一種檢測宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR的引物和熒光探針,具體如下: hW~A5! - gatga agaac ttgac ctcaa t -3! hW~B5! - tccaa cagca caagt gagat tc -3! actin-A5! - tcctc cctgg agaag agcta c -3! actin-B5! - cactg tgttg gcgta caggt c -3! 基因特異性引物 hw_c5' -gttgt tccaa cagca caagt g~3f 基因特異性引物actin-c 5' -agaca gcact gtgtt ggcgt ac ~3f ; hW-RY 5, -FAM- acaca tggag gattg cattg tggc_TAMRA_3'; actin - Y 5! -FAM- acggc caggt catca ccatt ggc -TAMRA-3! 0
2.權(quán)利要求1所述引物和熒光探針在制備宮頸癌人半翼基因熒光定量RT-PCR試劑盒中的應(yīng)用。
3.利用權(quán)利要求1所述引物和熒光探針或權(quán)利要求2所述試劑盒檢測宮頸癌人半翼基因表達(dá)量的非診斷性檢測方法,具體如下: 1)提取RNA 按常規(guī)方法抽提樣本、陽性質(zhì)控品和陰性質(zhì)控品RNA ; 抽提的RNA —部分作為hWAPL和β -actin的空白對照; 樣本中疑似癌變的細(xì)胞與正常細(xì)胞數(shù)比例需大于10:1 ; 2)逆轉(zhuǎn)錄 hffAPLmRNA逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA引物序列如下: 基因特異性引物 hW_c: 51 -gttgt tccaa cagca caagt g-31 β -actin mRNA逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA引物序列如下: 基因特異性引物actin-c: 5' -agaca gcact gtgtt ggcgt ac -3! 3)熒光定量PCR:標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備及標(biāo)準(zhǔn)曲線斜率值的比值計算 將hWA PL基因和β — actin基因質(zhì)粒DNA 10倍稀釋,獲得各濃度的hWA PL基因和β — actin基因定量參考品,及其各濃度的與CT值的標(biāo)準(zhǔn)曲線和標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率,hWA PL基因和β — actin基因定量參考品的斜率比值R=hWA PL基因的DNA檢測標(biāo)準(zhǔn)曲線斜率/β —actin檢測標(biāo)準(zhǔn)曲線斜率; 所述的hWA PL基因定量參考品和β — actin基因定量參考品為含有靶基因的pUCm-T載體質(zhì)粒; hWAPL基因?qū)崟r熒光定量PCR檢測引物和探針如下: hff-Rl5' - gatga agaac ttgac ctcaa t -3' hff-R25' - tccaa cagca caagt gagat tc -3' hff-RY5' -FAM- acaca tggag gattg cattg tggc-TAMRA-3' β -actin基因?qū)崟r突光定量PCR檢測引物和探針序列和探針如下: actin-A5' - tcctc cctgg agaag agcta c -3' actin-B5' - cactg tgttg gcgta caggt c -3' actin - Y5' -FAM- acggc caggt catca ccatt ggc -TAMRA-3' 根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線計算樣品中hWAPL,β - actin基因的拷貝數(shù)/ml分別為Al和A2 ;空白對照中的hWAPL,β - actin基因的拷貝數(shù)分別為Alc和A2c ;4)檢測結(jié)果計算以hWAPL和β — actin基因的實際拷貝數(shù)/ml的比值判斷檢測結(jié)果,比值計算如下:B1/ B2= (Al-Alc) XR/ (A2_A2c)臨界值=2.5B1/ B2≥4 檢測結(jié)果判斷為陽性;B1/ B2 ≤ 2.5 檢測 結(jié)果判斷為陰性;.2.5<B1/ B2<4檢測比值在灰區(qū),需重測一次,如仍在2.5-4.0,檢測結(jié)果判斷為陽性。
【文檔編號】C12Q1/68GK103642926SQ201310680848
【公開日】2014年3月19日 申請日期:2013年12月13日 優(yōu)先權(quán)日:2013年12月13日
【發(fā)明者】李貴玲, 李亦武, 糜克永 申請人:武漢格瑞生物工程有限公司
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