一種砂梨基因檢測(cè)芯片的制作方法
【專利摘要】一種砂梨基因檢測(cè)芯片,包括砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列,其特征在于,砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列排列于帶正電荷硅烷化材料膜層上,至少有4個(gè)陣列,一個(gè)陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測(cè)探針,一個(gè)陣列可檢測(cè)一個(gè)品種;砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列又貼在基片上,組合形成砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片。
【專利說明】—種砂梨基因檢測(cè)芯片
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本實(shí)用新型涉及一種基因芯片,特別是一種砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片的結(jié)構(gòu),主要用于對(duì)砂梨品種的基因組DNA進(jìn)行PCR-RFLP系統(tǒng)檢測(cè)和DNA序列分析。
【背景技術(shù)】
[0002]砂梨是重要的經(jīng)濟(jì)樹種,但砂梨與絕大多數(shù)梨品種一樣,自花授粉結(jié)實(shí)率極低,有的甚至不結(jié)實(shí),表現(xiàn)出典型的配子體自交不親和性,當(dāng)不同品種異花授粉時(shí),自交不親和基因型相同也會(huì)出現(xiàn)結(jié)實(shí)率低或不結(jié)實(shí),這種現(xiàn)象在遺傳學(xué)上也歸屬于自交不親和現(xiàn)象;自交不親和性的本質(zhì)是成熟雌蕊分泌的一種RNase抑制其相同S基因型花粉在柱頭;因此現(xiàn)在很多研究梨的都在研究梨的S基因,在生產(chǎn)和育種上也需鑒定品種的S基因犁以確定品種間的親和性。在研究梨的S基因往往都是會(huì)通過基因芯片來進(jìn)行;基因芯片(genechip)(又稱DNA芯片、生物芯片)通過與一組已知序列的核酸探針雜交進(jìn)行核酸序列測(cè)定的方法,在一塊基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探針。當(dāng)溶液中帶有熒光標(biāo)記的核酸序列TATGCAATCTAG,與基因芯片上對(duì)應(yīng)位置的核酸探針產(chǎn)生互補(bǔ)匹配時(shí),通過確定熒光強(qiáng)度最強(qiáng)的探針位置,獲得一組序列完全互補(bǔ)的探針序列。據(jù)此可重組出靶核酸的序列。但現(xiàn)有的用于檢測(cè)砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片都是單個(gè)獨(dú)立的基因芯片,這樣在進(jìn)行檢測(cè)時(shí)需要準(zhǔn)備很多單個(gè)的基因芯片,可由于基因芯片本身比較小,因此很難以把握,一不小心就會(huì)使基因芯片出現(xiàn)故障,因此很有必要對(duì)此加以改進(jìn)。通過國(guó)內(nèi)專利文獻(xiàn)檢索發(fā)現(xiàn)有一些相關(guān)的文獻(xiàn)報(bào)道,與本實(shí)用新型有關(guān)的主要有以下一些:
[0003]1、專利號(hào)為CN201220371254.0,名稱為“基因芯片”的實(shí)用新型專利,該專利公開了一種基因芯片。本實(shí)用新型技術(shù)方案是芯片窗口中的基片的層級(jí)依次是上層為膜,下層為背襯層,膜采用的是尼龍膜,背襯層,為合成樹脂膠粘劑。本實(shí)用新型解決了現(xiàn)有的檢測(cè)各種疾病的生物芯片王要為蛋白芯片的缺陷。
[0004]2、專利號(hào)為CN201310166271.X,名稱為“一種電化學(xué)基因芯片”的發(fā)明新型專利,該專利公開了一種一種電化學(xué)基因芯片。其包括流體腔、通道模塊、與通道模塊相貼合的探針電路板,通道模塊上設(shè)有微流槽,通道模塊與探針電路板貼合后通過微流槽和探針電路板表面相接觸形成微流管道,流體腔與微流管道相通,探針電路板上沿著微流管道設(shè)有用于為電化學(xué)伏安掃描提供基準(zhǔn)參考電壓的參考電極、用于連通電化學(xué)激勵(lì)電路的輔助電極和用于連接檢測(cè)電路的工作電極,工作電極上固定有單分子層和DNA捕獲探針。
[0005]3、專利號(hào)為CN200720071634.1,名稱為“一種基因芯片”的實(shí)用新型專利,該專利公開了一種方便經(jīng)濟(jì)的組合型基因芯片,涉及生物芯片技術(shù)和體外臨床診斷檢測(cè)【技術(shù)領(lǐng)域】,由載體和覆蓋在載體上有鏤空反應(yīng)區(qū)的粘性膜組合而成。
[0006]上述這些專利雖然涉及到了基因芯片,可仔細(xì)分析可以看出,這些基因芯片都不是砂梨S基因CDNA檢測(cè)芯片,更沒有提出如何解決多個(gè)檢測(cè)芯片的排列問題。
實(shí)用新型內(nèi)容
[0007]本實(shí)用新型的目的在于針對(duì)現(xiàn)有砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片所存在的不足,提供一種新型的砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片,該種砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片可以將多個(gè)檢測(cè)芯片組合起來,且具有很好的使用效果。
[0008]為了實(shí)現(xiàn)上述目的,本實(shí)用新型所采取的技術(shù)措施是:一種砂梨基因檢測(cè)芯片,包括砂梨S基因CDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列,砂梨S基因CDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列排列于帶正電荷硅烷化材料膜層上,至少有4個(gè)陣列,一個(gè)陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測(cè)探針,一個(gè)陣列可檢測(cè)一個(gè)品種;砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列又貼在基片上,組合形成砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片。
[0009]進(jìn)一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列是粘貼在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
[0010]進(jìn)一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列是對(duì)稱排列在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
[0011]進(jìn)一步地,所述的帶正電荷硅烷化材料膜層被覆于基片上,基片的表面為玻片片基表面,片基表面被氨基修飾,帶正電荷,與CDNA上帶負(fù)電荷的磷酸基以離子鍵結(jié)合,將砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列牢固地固定于基片上。
[0012]進(jìn)一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列的每個(gè)陣列均含有200個(gè)陣點(diǎn),每個(gè)陣點(diǎn)就是具有一定濃度的固定于基片上的特異的檢測(cè)探針,砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片的每個(gè)陣列包含45個(gè)S基因特異的cDNA檢測(cè)探針,每個(gè)探針在陣列中點(diǎn)樣重復(fù)4次,2個(gè)無關(guān)基因(與S基因同源性極低的基因),2個(gè)管家基因(在梨的葉中表達(dá)穩(wěn)定的基因)作為對(duì)照,其片段長(zhǎng)度與S基因特異片段長(zhǎng)度一致,在芯片陣列中點(diǎn)樣各重復(fù)4次,空白點(diǎn)樣重復(fù)4次。
[0013]本實(shí)用新型的優(yōu)點(diǎn)在于,通過將砂梨S基因cDNA特異檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列排列于帶正電荷膜層上,通過砂梨基因檢測(cè)芯片與未知S基因型砂梨品種的葉cDNA雜交可鑒定該品種的S基因和S基因型,一個(gè)陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測(cè)探針,通過與未知S基因型砂梨品種的葉cDNA雜交可鑒定該品種的S基因和S基因型,一個(gè)陣列可檢測(cè)一個(gè)品種;可以實(shí)現(xiàn)一個(gè)芯片檢測(cè)多個(gè)品種,這樣可以大大減少芯片的個(gè)數(shù),提高檢測(cè)效率。
【專利附圖】
【附圖說明】
[0014]圖1,本實(shí)用新型的結(jié)構(gòu)示意圖。
【具體實(shí)施方式】
[0015]下面將結(jié)合附圖和實(shí)施例對(duì)本實(shí)用新型做進(jìn)一步的描述。
[0016]通過附圖可以看出本實(shí)用新型為一種一種砂梨基因檢測(cè)芯片,包括砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列3,砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列3排列于帶正電荷硅烷化材料膜2上,至少有4個(gè)陣列,一個(gè)陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測(cè)探針,一個(gè)陣列可檢測(cè)一個(gè)品種;砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列3又貼在基片I上,組合形成砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片4。
[0017]進(jìn)一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列3是粘貼在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
[0018]進(jìn)一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列是對(duì)稱排列在帶正電荷硅烷化材料膜層2上的。
[0019]進(jìn)一步地,所述的帶正電荷硅烷化材料膜層2被覆于基片I上,基片I的表面為玻片片基表面,片基表面被氨基修飾,帶正電荷,與cDNA上帶負(fù)電荷的磷酸基以離子鍵結(jié)合,將砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列牢固地固定于基片上。
[0020]進(jìn)一步地,所述的砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列3的每個(gè)陣列均含有200個(gè)陣點(diǎn),每個(gè)陣點(diǎn)就是具有一定濃度的固定于基片上的特異的檢測(cè)探針,砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片的每個(gè)陣列包含45個(gè)S基因特異的cDNA檢測(cè)探針,每個(gè)探針在陣列中點(diǎn)樣重復(fù)4次,2個(gè)無關(guān)基因(與S基因同源性極低的基因),2個(gè)管家基因(在梨的葉中表達(dá)穩(wěn)定的基因)作為對(duì)照,其片段長(zhǎng)度與S基因特異片段長(zhǎng)度一致,在芯片陣列中點(diǎn)樣各重復(fù)4次,空白點(diǎn)樣重復(fù)4次。
【權(quán)利要求】
1.一種砂梨基因檢測(cè)芯片,包括砂梨S基因CDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列,其特征在于,砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列排列于帶正電荷硅烷化材料膜層上,至少有4個(gè)陣列,一個(gè)陣列包含所有已知的S基因的cDNA特異檢測(cè)探針,一個(gè)陣列可檢測(cè)一個(gè)品種;所述的帶正電荷硅烷化材料膜層被覆于基片上,基片的表面為玻片片基表面,片基表面被氨基修飾,帶正電荷,與cDNA上帶負(fù)電荷的磷酸基以離子鍵結(jié)合,將砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列牢固地固定于基片上,組合形成砂梨S基因cDNA檢測(cè)芯片。
2.如權(quán)利要求1所述的砂梨基因檢測(cè)芯片,其特征在于,所述的砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列是粘貼在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
3.如權(quán)利要求1所述的砂梨基因檢測(cè)芯片,其特征在于,所述的砂梨S基因cDNA檢測(cè)探針點(diǎn)陣陣列是對(duì)稱排列在帶正電荷硅烷化材料膜層上的。
【文檔編號(hào)】C12M1/34GK204097484SQ201320647212
【公開日】2015年1月14日 申請(qǐng)日期:2013年10月21日 優(yōu)先權(quán)日:2013年10月21日
【發(fā)明者】江南, 譚曉風(fēng) 申請(qǐng)人:湖南工業(yè)大學(xué)