一種與家兔重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其檢測(cè)方法和應(yīng)用的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種與家兔重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其檢測(cè)方法和應(yīng)用。通過對(duì)家兔UCP2基因編碼區(qū)SNPs位點(diǎn)的檢測(cè)和分析篩選，以c.72G>A位點(diǎn)為候選SNP，分析了該位點(diǎn)與家兔生長性狀、屠體性狀和肉質(zhì)性狀三大重要經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)性，為家兔重要經(jīng)濟(jì)性狀的分子標(biāo)記輔助選擇提供了一個(gè)新的分子標(biāo)記，有利于家兔早期選種、縮短世代間隔和提高育種效率，同時(shí)，針對(duì)難以測(cè)定的屠體性狀和肉質(zhì)性狀，有利于提高選種的準(zhǔn)確性和效率。
【專利說明】一種與家兔重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其檢測(cè)方法和應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及分子標(biāo)記輔助選擇技術(shù)，尤其涉及的是一種與家兔重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其檢測(cè)方法和應(yīng)用。
【背景技術(shù)】
[0002]分子標(biāo)記輔助選擇(marker assisted selection, MAS)是在分子遺傳學(xué)、數(shù)量遺傳學(xué)和生物技術(shù)的基礎(chǔ)上，發(fā)展起來的一種對(duì)家養(yǎng)動(dòng)物進(jìn)行科學(xué)選種的方法。MAS的核心技術(shù)是尋找到與育種目標(biāo)性狀顯著關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記，而單核苷酸多態(tài)性(single nucleotidepolymorphism, SNP)是人類和動(dòng)物基因組中廣泛分布的一類遺傳標(biāo)記，是繼限制性片段長度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)和微衛(wèi)星多態(tài)性(microsatellite polymorphism)之后最具潛力的第三代分子遺傳標(biāo)記。因此,SNP已成為目前應(yīng)用于MAS最廣泛的一類分子標(biāo)記。
[0003]MAS的一般步驟包括:候選基因的選擇；SNP位點(diǎn)的檢測(cè)；與性狀的關(guān)聯(lián)分析；關(guān)聯(lián)分析的驗(yàn)證試驗(yàn)；在尋找到與性狀顯著關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記后，結(jié)合表型和系譜信息，進(jìn)行選種。在尋找到有效分子標(biāo)記后，開發(fā)快速簡便的檢測(cè)該分子標(biāo)記的技術(shù)方法是MAS應(yīng)用的關(guān)鍵。
[0004]目前在家畜育種中最常用的選種方法是表型選擇。表型選擇是指對(duì)動(dòng)物自身及與之有血緣關(guān)系的個(gè)體的表型性狀進(jìn)行測(cè)定，結(jié)合系譜信息和性狀的遺傳參數(shù)，利用數(shù)量遺傳學(xué)的方法，同時(shí)對(duì)環(huán) 境效應(yīng)進(jìn)行校正后，估計(jì)出后備個(gè)體的育種值，以育種值的高低決定是否留種。
[0005](I)傳統(tǒng)表型選擇利用的是所測(cè)得的表型性狀的數(shù)據(jù)，動(dòng)物生產(chǎn)性能的表型性狀是由遺傳因素和環(huán)境因素的共同作用形成的，決定選種準(zhǔn)確性就在于對(duì)遺傳因素部分的準(zhǔn)確估計(jì)。而現(xiàn)有的數(shù)量遺傳學(xué)方法對(duì)環(huán)境因素百分之百校正的難度較大。
[0006](2)傳統(tǒng)選種方法受到年齡的限制，如家兔的出欄體重，只能等到出欄時(shí)才能進(jìn)行測(cè)定和選種，不能進(jìn)行早期選擇，世代間隔較長，選種效率不高。
[0007](3)對(duì)難于測(cè)定和度量的性狀，如屠體性狀和肉質(zhì)性狀，傳統(tǒng)方法通常采用間接測(cè)定和遺傳相關(guān)來獲得，信息準(zhǔn)確性不高，選擇的準(zhǔn)確性和效率低下。
[0008]縮略語和關(guān)鍵術(shù)語定義
[0009]MAS:marker assisted selection,分子標(biāo)記輔助選擇；
[0010]UCP2:uncoupling protein2,解偶聯(lián)蛋白 2 ；
[0011]SNP:single nucleotide polymorphism,單核苷酸多態(tài)性；
[0012]RFLP !restriction ragment length polymorphism,限制性片段長度多態(tài)性。

【發(fā)明內(nèi)容】

[0013]本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)的不足提供一種與家兔重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記及其檢測(cè)方法和應(yīng)用。
[0014]本發(fā)明的技術(shù)方案如下:
[0015]一種與家兔重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記，該分子標(biāo)記為UCP2基因c.72G>A位點(diǎn)。
[0016]所述的分子標(biāo)記的檢測(cè)方法，包括以下步驟:
[0017](I)、引物設(shè)計(jì):根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫家兔UCP2基因的參考序列，采用PrimerPremier5.0軟件設(shè)計(jì)引物；
【權(quán)利要求】
1.一種與家兔重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記，該分子標(biāo)記為UCP2基因c.72G>A位點(diǎn)。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記的檢測(cè)方法，其特征在于，包括以下步驟: (1)、引物設(shè)計(jì):根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫家兔UCP2基因的參考序列，采用PrimerPremier5.0軟件設(shè)計(jì)引物；
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的分子標(biāo)記的應(yīng)用，其特征在于，應(yīng)用于家兔分子標(biāo)記輔助選擇育種。
【文檔編號(hào)】C12Q1/68GK103937791SQ201410201690
【公開日】2014年7月23日 申請(qǐng)日期:2014年5月13日 優(yōu)先權(quán)日:2014年5月13日
【發(fā)明者】劉文超, 賴松家, 陳仕毅, 賈先波, 王杰 申請(qǐng)人:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)