一種與牙鲆耐熱性相關(guān)的snp位點及其應(yīng)用的制作方法
【專利摘要】發(fā)明的目的是提供一種與牙鲆耐熱性相關(guān)的SNP位點，所述的SNP位點是核酸序列為SEQ ID NO:1的HSP70基因的第47/48位，其堿基為AA或A/DEL；第65位，其堿基為T或C；第185位，其堿基為C或T；第260位，其堿基為C或T；第305位，其堿基為T或A；第600位，其堿基為T或C；第815位，其堿基為C或T；本發(fā)明的SNP位點用于牙鲆耐熱性個體/家系的篩選。本方法選用熱休克蛋白基因HSP70，通過分子標記的方法篩選耐熱家系，在分子水平上評估各家系的遺傳特性，能清晰的鑒別出其基因組的突變位點，并結(jié)合加熱實驗，分析突變位點和耐熱的相關(guān)性，對耐熱的分子機制做出合理的判斷，相對于傳統(tǒng)的選育方法目的性更強，成本較低，能明顯縮短選育時間。
【專利說明】一種與牙鲆耐熱性相關(guān)的SNP位點及其應(yīng)用

【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明屬于水產(chǎn)養(yǎng)殖中的魚類耐熱家系的篩選【技術(shù)領(lǐng)域】，具體涉及一種與牙鲆耐 熱性相關(guān)的SNP位點及其應(yīng)用。

【背景技術(shù)】
[0002] 牙鲆（Paralichthysolivaceus)俗稱牙片、偏口，為冷溫性底棲魚類，是我國重要 的海水經(jīng)濟魚類。牙鲆仔魚培育的最適溫度為17-20°C，成魚生長的適宜溫度為14-23°C， 最適溫度為21°C。牙鲆在低至1°C，高達33°C水溫條件下可短暫存活。和仔魚相比，成魚的 耐高溫能力會顯著下降，在23°C以上攝食量會減少，25°C以上停止生長，長期處于27°C會 引起大量死亡。溫度對魚類的生長率和代謝率具有重大影響，近年來，伴隨著全球變暖，海 水溫度逐步上升，嚴重影響牙鲆的生長速度和成活率，降低了養(yǎng)殖效益，增加了養(yǎng)殖成本。 同時，伴隨海水溫度的升高，牙鲆的養(yǎng)殖范圍也會縮小。因此，篩選出具有更好耐熱性的牙 鲆品系是牙鲆抗逆育種的迫切需求。傳統(tǒng)的選育方法存在選育時間過長、選育成本過高的 缺點，。因此，需要建立一種快速有效的牙鲆耐熱家系的篩選方法。
[0003] 關(guān)于魚類耐熱方面的研究中，大多集中在遺傳參數(shù)評估方面，比如Perry等 (2005)對虹鱒高溫耐受性的研究。伴隨分子生物學(xué)和測序技術(shù)的發(fā)展，單核苷酸多態(tài)性 (SNP)作為新一代分子標記已經(jīng)在育種領(lǐng)域得到認可，在魚類中研究人員篩選了一系列跟 性狀相關(guān)的SNPs，比如生長、抗病相關(guān)的SNP分子標記。在鲆鰈魚耐熱方面的研究中，主要 集中在耐熱相關(guān)微衛(wèi)星方面的篩選，很少有耐熱相關(guān)SNP篩選的報道。


【發(fā)明內(nèi)容】

[0004] 本發(fā)明的目的是提供一種與牙鲆耐熱性相關(guān)的SNP位點及其在牙鲆耐熱家系篩 選中的應(yīng)用，從而彌補現(xiàn)有技術(shù)的不足。
[0005] 本發(fā)明首先提供一種與牙鲆耐熱性相關(guān)的SNP位點，所述的SNP位點是核酸序列 為SEQIDN0:1的HSP70基因的第47/48位，其堿基為AA或A/DEL;第65位，其堿基為T 或C;第185位，其堿基為C或T;第260位，其堿基為C或T;第305位，其堿基為T或A;第 600位，其堿基為T或C;第815位，其堿基為C或T。
[0006] 上述的SNP位點用于牙鲆耐熱性個體/家系的篩選；
[0007] 本發(fā)明還提供一種篩選于牙鲆耐熱性個體/家系的方法，是用PCR擴增引物檢測 本發(fā)明所篩選到的SNP位點；
[0008] 用于檢測上述SNP位點的引物，其上下游序列分別為；

【權(quán)利要求】
1. 一種與牙鲆耐熱性相關(guān)的SNP位點，其特征在于，所述的SNP位點是序列為SEQ ID NO: 1的HSP70基因的第47/48位，其堿基為AA或A/DEL ;第65位，其堿基為T或C ;第185 位，其堿基為C或T ;第260位，其堿基為C或T ;第305位，其堿基為T或A ;第600位，其堿 基為T或C ;第815位，其堿基為C或T。
2. 權(quán)利要求1所述的SNP位點在牙鲆耐熱性個體/家系的篩選中的應(yīng)用。
3. -種篩選于牙鲆耐熱性個體/家系的方法，其特征在于，所述的方法是用PCR擴增引 物檢測權(quán)利要求1所述的SNP位點。
4. 如權(quán)利要求3所述的方法，其特征在于，所述的引物的序列為SEQ ID N0:2和SEQ ID N0:3。
【文檔編號】C12Q1/68GK104328116SQ201410623763
【公開日】2015年2月4日 申請日期:2014年11月6日 優(yōu)先權(quán)日:2014年11月6日
【發(fā)明者】張全啟, 劉金相, 于海洋, 王旭波, 劉旭東, 齊潔, 王志剛, 賀艷 申請人:中國海洋大學(xué)