專利名稱:抑制人Akt2基因表達的siRNA序列及其融合表達載體的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,具體是一段能抑制人Akt2基因表達的 s iRNA序列及其融合表達載體。
背景技術(shù):
RM干擾(RNAi )是多數(shù)真核細胞本身固有的一種自我保護現(xiàn)象,既 能對抗如病毒基因或人工轉(zhuǎn)基因所表達的mRNA等外源基因的侵害,又能 降解自身異?;虍a(chǎn)生的mRNA。以基因轉(zhuǎn)錄后沉默的方式或誘導(dǎo)DNA曱 基化的方式對含有其同源序列的基因表達進行干涉。
近年來,人們利用這一現(xiàn)象針對要研究的基因表達進行阻斷,從而 產(chǎn)生相應(yīng)的功能缺失表型,形成RNAi技術(shù)。新近的RNAi技術(shù),是利用 DNA表達載體直接在體內(nèi)表達短發(fā)夾狀RNA(shRNA),特異性封閉相應(yīng)的 靶基因mRNA,抑制mRNA的翻譯。與早期的RNA干擾技術(shù)相比,該方法的
特異性和干擾效率均有較大提高,已廣泛應(yīng)用于多種研究領(lǐng)域。
蛋白激酶B(Akt)是一種絲氨酸蘇氨酸蛋白激酶,包含Aktl、Akt2、Akt3 三種亞型,其中Akt2在多種肺瘤中均有表達。Akt最早發(fā)現(xiàn)于引起鼠白血 病的逆轉(zhuǎn)錄病毒癌基因v-Akt編碼的融合蛋白中,至今在哺乳動物體內(nèi)還 沒有發(fā)現(xiàn)Akt基因的突變體。研究證明,Akt是胰島素樣生長因子l受體(IGF 一1R)、表皮生長因子受體HER^/neu、血管內(nèi)皮生長因子受體(VEGF—R)、 血小板源性生長因子受體(PDGF—R)等受體酪氨酸激酶或G.蛋白偶聯(lián)受體 等參與的細胞外信號通路上游的重要會聚點,同時Akt也是磷酯酰肌醇3 激酶(PI3K)信號傳導(dǎo)通路的中心環(huán)節(jié)。其功能除了涉及細胞周期調(diào)控,凋 亡啟動等細胞生存調(diào)節(jié)外,還參與血管生成、端粒酶活性和細胞侵襲,f生等 諸多重要的生理及病理過程。目前的研究發(fā)現(xiàn),Akt是腫瘤發(fā)生的重要信 號分子,其亞型Akt2是由481個氨基酸組成的蛋白質(zhì),當(dāng)其第308位的絲氨 酸和473位的蘇氨酸磷酸化時,激酶活性增高,發(fā)揮促進細胞增殖和抑制 細^^凋亡的作用。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明是為了進一步研究Akt2在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用提供一個有 效的工具,也為腫瘤的基因治療提供了一個新的技術(shù)手段,而提供一段抑 制人Ak 12基因表達的s i RN A序列及其融合表達載體。
本發(fā)明通過基因敲除技術(shù),即siRNA的方法抑制Akt2的表達。利用 RNAi技術(shù)特異地抑制癌基因、癌相關(guān)基因或突變基因的過度表達,使這 些基因保持在沉默或休眠狀態(tài),從而使腫瘤細胞增殖速度減慢,凋亡加快,顯示了 RNAi技術(shù)用于腫瘤基因治療的可行性和有效性。RNAi過程中, 由雙鏈RNA分子加工而成的19-23個核芬酸的RNAs就稱為siRNA,是誘 導(dǎo)基因沉默的第一步,它與-RNAi特異性酶結(jié)合,形成沉默復(fù)合物,特異 降解與s iRNA同源的靶mRNA。
抑制人Akt2基因表達的siRNA序列,該序列與Akt2 mRNA互補;具 有抑制人Akt2基因表達的功能,其作用位點Akt2 mRNA ( NM—001626 CDS: 263-1708) 1570-1588,
其核酸序列如下5 ,-TTCATCATCGAAGTACCTT- 3 ,。
一種抑制人Akt2基因表達的siRNA序列的融合表達載體,其融合表 達載體由合成的抑制人Akt2基因表達的siRNA序列模板與 pRNAT-U6. 1/Hygro載體相連接而成,將其轉(zhuǎn)染人乳腺癌細胞后能夠特異 降解與siRNA同源的Akt2的mRNA,抑制人Akt2基因表達;
其中合成抑制人Aia2基因表達的siRNA序列模板為兩端帶有酶切 位點,3'端為HindIII, 5'端為BamH I ,合成抑制人Akt2基因表達的siRNA 序列模板的核酸序列如下
5,-GGATCCCAATTCATCATCGAAGTACCTTTTCAAGAGAAAGGTACTTCGATGATGAA TTTTTTTTCCAAAAGCTT-3,。
本發(fā)明通過脂質(zhì)體將融合載體轉(zhuǎn)入MDA-MB-231人乳腺癌細胞系中, 以contro卜siRNA作為對照,通過潮霉素壓力篩選得到穩(wěn)定細胞抹,用 RT-PCR、 Western Blot方法檢測細胞的Akt2表達水平。結(jié)果表明表達 Akt2-siRNA作用的細胞其Akt2的合成明顯降低,與對照組相比具有顯著 差異(P〈0. 05)。
本發(fā)明設(shè)計的靶向Akt2的siRNA的序列及融合表達載體能夠在人乳 腺癌細胞中表達特定的siRNA,并能夠有效地抑制Akt2的基因表達,為 進一步研究Akt2基因在腫瘤中的生物學(xué)功能提供了可行的手段。
這樣設(shè)計的本發(fā)明能夠為進一步研究Akt2在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用 提供了一個有效的工具,也為腫瘤的基因治療提供了一個新的技術(shù)手段。
附圖是Akt2的mRNA和蛋白表達量。
具體實施例方式
下面結(jié)合附圖及實施例對本發(fā)明進行詳細的說明。 一。實驗材料來源
人乳&,癌MDA-231細月包由美國國家癌癥研究所Dr. Joost J. Oppenheim贈送;pRNAT-U6. 1/Hygro質(zhì)粒購自GenScript公司; Hygromysin來自Invitrogen。鼠抗人Akt2單克隆抗體購自Santa Cruz公司。
二.實施方法
1. Akt2-siRNA的設(shè)計與合成
依據(jù)Ambion公司在網(wǎng)上提供的設(shè)計軟件 (www。 ambion. com/techl ib/misc/ siRNA finder, html )合成以下 Akt2特異的si隨:
5,-GGATCCCAATTCATCATCGAAGTACCTTTTCAAGAGAAAGGTACTTCGATGATGA ATTTTTTTTCCAAAAGCTT-3,
siRNA作用位點
Akt2 mRNA ( NM—001626 CDS: 263-1708)的1570-1588位點,siRNA 由GenScript公司合成。
2. Akt2-siRNA融合表達載體構(gòu)建
表達載體pRNAT-U6. 1/Hygro其結(jié)構(gòu)為線性,兩端分別為BamHI和 HindIII酶切位點的粘性末端。將合成的Akt2-siRNA模板退火,連入 pRNAT-U6. 1/Hygro質(zhì)粒載體中,轉(zhuǎn)染感受態(tài)大腸桿菌DH5 ot ,鋪平板過 夜培養(yǎng)。挑取轉(zhuǎn)化菌擴增培養(yǎng)提取質(zhì)粒,酶切測序驗證插入序列。
陰性對照Control-siRNA載體由試劑盒提供,含有一段與人類已知 基因均不同源的siRNA。
3. 表達載體轉(zhuǎn)染及穩(wěn)定細胞抹篩選
應(yīng)用EndoFree Plasmid Maxi試劑盒提取純化質(zhì)粒,用800 u 1低滲 液將20iag重組質(zhì)粒與lxl(T細胞混合,采用1 OOOv電壓電轉(zhuǎn)lOOix s, 靜置5min,傳入96孔板,5。/。C02溫箱孵育24h。添加0. 8mg/ml Hygromycin B壓力篩選至非轉(zhuǎn)染對照組細胞完全死亡,約20 d,將表達GFP的單克 隆挑出擴大培養(yǎng)。
結(jié)果表明得到4個穩(wěn)定克隆,其編號分別為44、 98、 97、 102。
4. 檢測細胞中Akt2的表達水平 ①.實驗方法
將對照細胞和Akt2-siRNA轉(zhuǎn)染的細胞(44、 98、 97、 102),用Trizol 試劑提取細胞的總RNA,電泳;險測質(zhì)量,紫外分光定量。以相同量RNA作 為起始才莫板,逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)合成cDNA。 用QuantiTect SYBR Green PCR試 劑盒在定量PCR儀GeneAmp 5700上進行實時定量PCR,反應(yīng)體系為95°C 預(yù)變性15min, 94。C變性15s, 5(TC退火30s, 72。C延伸30s,循環(huán)40次。 用SDS Software及瓊脂糖凝膠電泳分析結(jié)果。
用免疫印跡的方法檢測細胞中蛋白的表達水平是生物實驗中一個傳 統(tǒng)的方法。將對照細月包和Akt2-siRNA轉(zhuǎn)染的細月包(44、 98、 97、 102)預(yù)留足夠數(shù)量至離心管中,離心后裂解細胞,煮樣,超聲,再離心。制
得樣品后,使用BCA試劑盒進行蛋白濃度的測定。根據(jù)樣品的濃度,取 相同的蛋白總量進行SDS-PAGE電泳。電泳結(jié)束后,將膠上蛋白電轉(zhuǎn)到PVDF 膜上,室溫牛奶封閉2小時。簡單洗滌后, 一抗(鼠抗人Akt2單克隆抗 體)室溫孵育2小時。然后用抗鼠的二抗室溫孵育1小時。最后用化學(xué) 發(fā)光試劑盒檢測。根據(jù)曝光后條帶的寬窄和深淺判斷蛋白的表達量。每 個克隆至少通過3次免疫印跡進行;險測。
②.實^r結(jié)果見圖1,與對照細^^目比,克隆44、 98、 97、 102中 的Akt2的mRNA和蛋白表達量均有明顯降低。
從以上工作的結(jié)果中得出本發(fā)明設(shè)計的靶向Akt2的siRNA的序列 及融合表達載體能夠在人乳腺癌細胞中表達特定的siRNA,并能夠有效地 抑制Akt2的基因表達,為進一步研究Akt2基因在紳瘤中的生物學(xué)功能 提供了可行的手段。SEQUENCE LISTING
<110>天津醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院
<120>抑制人Akt2基因表達的siRNA序列及其融合表達載體 <130> 人 <160> 1
<170> Patentln version 3,1 <210> 1 <211> 74 <212> DNA
<213> 人 <220>
<221> siRNA <222> (1)..(74) <223> <400> 1
ggatcccaat tc3tcatcg3 3gt3cctttt c33g3g333g gt3cttcg3t g3tg33tttt 60 ttttccaaaa gctt 7權(quán)利要求
1. 抑制人Akt2基因表達的siRNA序列,其特征在于該序列與Akt2mRNA互補;具有抑制人Akt2基因表達的功能,其作用位點Akt2 mRNA(NM_001626 CDS263-1708)1570-1588,其核酸序列如下5’-TTCATCATCGAAGTACCTT-3’。
2. —種抑制人Akt2基因表達的siRNA序列的融合表達載體,其特征 在于該融合表達載體由合成的抑制人Akt2基因表達的siRNA序列模板 與pRNAT-U6. 1/Hygro載體相連接而成,將其轉(zhuǎn)染人乳腺癌細胞后能夠特 異降解與siRNA同源的Akt2的mRNA,抑制人Akt2基因表達;其中合成抑制人Akt2基因表達的siRNA序列模板為兩端帶有酶切 位點,3'端為HindIII, 5,端為BamH I ,合成抑制人Akt2基因表達的siRNA 序列模板的核酸序列如下5 ,-GGATCCCAATTCATCATCGAAGTACCTTTTCAAGAGAAAGGTACTTCGATGATGAA TTTTTTTTCCAAAAGCTT-3'。
全文摘要
本發(fā)明公開了一段抑制人Akt2基因表達的siRNA序列及其融合表達載體,屬于生物技術(shù)領(lǐng)域。該序列與Akt2 mRNA互補;具有抑制人Akt2基因表達的功能,其核酸序列為5’-TTCATCATCGAAGTACCTT-3’;其融合表達載體由合成的抑制人Akt2基因表達的siRNA序列模板與pRNAT-U6.1/Hygro載體相連接而成,將其轉(zhuǎn)染人乳腺癌細胞后能夠特異降解與siRNA同源的Akt2的mRNA,抑制人Akt2基因表達;在人乳腺癌細胞中能夠沉默Akt2的表達,可以有效地抑制人乳腺癌細胞Akt2蛋白合成,為進一步研究Akt2基因在腫瘤中的生物學(xué)功能提供了可行的手段。
文檔編號A61P35/00GK101434629SQ20071015020
公開日2009年5月20日 申請日期2007年11月16日 優(yōu)先權(quán)日2007年11月16日
發(fā)明者寧 張, 王靜娜 申請人:天津醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院