本申請要求2014年5月1日提交的美國臨時(shí)申請第61/987,354號的權(quán)益,其內(nèi)容通過引用以其整體據(jù)此并入。
背景
在本領(lǐng)域中對于癌癥和腫瘤病(neoplastic disease)的有效治療存在需求。
發(fā)明簡述
本文提供了被取代的雜環(huán)衍生化合物和包含所述化合物的藥物組合物。主題化合物和組合物對于抑制賴氨酸特異性脫甲基酶-1(LSD-1)是有用的。此外,主題化合物和組合物對于治療癌癥例如急性髓細(xì)胞樣白血病(AML)、急性淋巴細(xì)胞白血病(ALL)、小細(xì)胞肺癌(SCLC)、非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)、成神經(jīng)細(xì)胞瘤、小圓藍(lán)細(xì)胞瘤(small round blue cell tumor)、成膠質(zhì)細(xì)胞瘤、前列腺癌、乳腺癌、膀胱癌、肺癌和/或黑色素瘤及類似癌癥是有用的。本文描述的被取代的雜環(huán)衍生化合物是基于中心雜環(huán)體系例如嘧啶酮或類似物。所述嘧啶酮環(huán)體系還被4-氰基苯基和另外的基團(tuán)例如芳基、雜芳基或雜環(huán)基取代。
一個(gè)實(shí)施方案提供具有式(I)的結(jié)構(gòu)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,
其中,
W是N、C-H、或C-F;
X是氫、鹵素、-CN、任選地被取代的烷基、任選地被取代的炔基、任選地被取代的碳環(huán)基炔基、任選地被取代的芳基、或任選地被取代的雜芳基;
Y是氫、任選地被取代的烷基、任選地被取代的環(huán)烷基、或任選地被取代的環(huán)烷基烷基;
Z是選自以下的任選地被取代的基團(tuán):烷基、碳環(huán)基、C附接的雜環(huán)基、N附接的雜環(huán)基、雜環(huán)基烷基、雜環(huán)基烯基、-O-雜環(huán)基、-N(R)-雜環(huán)基、-O-雜環(huán)基烷基、-N(R)-雜環(huán)基烷基、-N(R)(C1-C4亞烷基)-NR2、-O(C1-C4亞烷基)-NR2,并且R是氫或C1-C4烷基。
一個(gè)實(shí)施方案提供具有式(Ia)的結(jié)構(gòu)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,
其中,
W是N、C-H、或C-F;
X是氫、鹵素、-CN、任選地被取代的炔基、任選地被取代的碳環(huán)基炔基、任選地被取代的芳基、或任選地被取代的雜芳基;
Y是氫、任選地被取代的烷基、任選地被取代的環(huán)烷基、或任選地被取代的環(huán)烷基烷基;并且
Z是選自以下的任選地被取代的基團(tuán):N附接的雜環(huán)基、-O-雜環(huán)基烷基、-N(H)-雜環(huán)基、-N(Me)-雜環(huán)基、-N(H)-雜環(huán)基烷基、或-N(Me)-雜環(huán)基烷基。
一個(gè)實(shí)施方案提供具有式(Ib)的結(jié)構(gòu)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,
其中,
W是N、C-H、或C-F;
X是氫、鹵素、任選地被取代的炔基、任選地被取代的碳環(huán)基炔基、任選地被取代的芳基、或任選地被取代的雜芳基;
Y是氫、任選地被取代的烷基、或任選地被取代的環(huán)烷基;并且
Z是選自以下的任選地被取代的基團(tuán):N-雜環(huán)基、-O-雜環(huán)基烷基、-N(H)-雜環(huán)基烷基、或-N(Me)-雜環(huán)基烷基。
一個(gè)實(shí)施方案提供包含式(I)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽和藥學(xué)上可接受的賦形劑的藥物組合物。一個(gè)實(shí)施方案提供包含式(Ia)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽和藥學(xué)上可接受的賦形劑的藥物組合物。一個(gè)實(shí)施方案提供包含式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽和藥學(xué)上可接受的賦形劑的藥物組合物。
一個(gè)實(shí)施方案提供調(diào)節(jié)細(xì)胞中的基因轉(zhuǎn)錄的方法,所述方法包括通過使賴氨酸特異性脫甲基酶1酶暴露于式(I)的化合物來抑制賴氨酸特異性脫甲基酶1的活性。一個(gè)實(shí)施方案提供調(diào)節(jié)細(xì)胞中的基因轉(zhuǎn)錄的方法,所述方法包括通過使賴氨酸特異性脫甲基酶1酶暴露于式(Ia)的化合物來抑制賴氨酸特異性脫甲基酶1的活性。一個(gè)實(shí)施方案提供調(diào)節(jié)細(xì)胞中的基因轉(zhuǎn)錄的方法,所述方法包括通過使賴氨酸特異性脫甲基酶1酶暴露于式(Ib)的化合物來抑制賴氨酸特異性脫甲基酶1的活性。
一個(gè)實(shí)施方案提供治療需要其的患者中的癌癥的方法,所述方法包括向患者施用式(I)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽。一個(gè)實(shí)施方案提供治療需要其的患者中的癌癥的方法,所述方法包括向患者施用式(Ia)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽。一個(gè)實(shí)施方案提供治療需要其的患者中的癌癥的方法,所述方法包括向患者施用式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽。
通過引用并入
為了本文確定的特定的目的,本說明書中提及的所有出版物、專利、以及專利申請通過引用并入本文。
發(fā)明詳述
如本文和所附權(quán)利要求中所使用的,除非上下文另外清楚地指明,否則單數(shù)形式“一(a)”、“一(an)”和“該(the)”包括復(fù)數(shù)指示物。因此,例如提到“劑”包括多個(gè)此類劑,并且提到“細(xì)胞”包括提到一個(gè)或更多個(gè)細(xì)胞(或提到多個(gè)細(xì)胞)以及對于本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的其等效物,等等。當(dāng)范圍在本文中被用于物理性質(zhì)例如分子量、或化學(xué)性質(zhì)例如化學(xué)式時(shí),意圖包括范圍的所有組合和子組合以及其中的特定的實(shí)施方案。當(dāng)提到數(shù)字或數(shù)值范圍時(shí),術(shù)語“約”意指所提到的數(shù)字或數(shù)值范圍是在實(shí)驗(yàn)變量內(nèi)(或在統(tǒng)計(jì)學(xué)實(shí)驗(yàn)誤差內(nèi))的近似值,并且因此在某些情況下,數(shù)字或數(shù)值范圍將在所陳述的數(shù)字或數(shù)值范圍的1%和15%之間變化。術(shù)語“包括(comprising)”(以及有關(guān)的術(shù)語例如“包括(comprise)”或“包括(comprises)”或“具有(having)”或“包含(including)”)不意圖排除,在其他某些實(shí)施方案中,例如本文描述的任何物質(zhì)組合物、組合物、方法、或工藝或類似物的實(shí)施方案“由所描述的特征組成”或“基本上由所描述的特征組成”。
定義
如在說明書和所附權(quán)利要求中所使用的,除非相反地指定,否則以下術(shù)語具有下文指示的含義。
“氨基”指的是-NH2基團(tuán)。
“氰基”指的是-CN基團(tuán)。
“硝基”指的是-NO2基團(tuán)。
“氧雜”指的是-O-基團(tuán)。
“氧代”指的是=O基團(tuán)。
“硫代”指的是=S基團(tuán)。
“亞氨基”指的是=N-H基團(tuán)。
“肟基”指的是=N-OH基團(tuán)。
“肼基”指的是=N-NH2基團(tuán)。
“烷基”指的是僅由碳原子和氫原子組成的、不包含不飽和的、具有從一個(gè)至十五個(gè)碳原子的直鏈的或支鏈的烴鏈基團(tuán)(例如C1-C15烷基)。在某些實(shí)施方案中,烷基包含一個(gè)至十三個(gè)碳原子(例如C1-C13烷基)。在某些實(shí)施方案中,烷基包含一個(gè)至八個(gè)碳原子(例如C1-C8烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基包含一個(gè)至五個(gè)碳原子(例如C1-C5烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基包含一個(gè)至四個(gè)碳原子(例如C1-C4烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基包含一個(gè)至三個(gè)碳原子(例如C1-C3烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基包含一個(gè)至兩個(gè)碳原子(例如C1-C2烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基包含一個(gè)碳原子(例如C1烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基包含五個(gè)至十五個(gè)碳原子(例如C5-C15烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基包含五個(gè)至八個(gè)碳原子(例如C5-C8烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基包含兩個(gè)至五個(gè)碳原子(例如C2-C5烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基包含三個(gè)至五個(gè)碳原子(例如C3-C5烷基)。在其他實(shí)施方案中,烷基選自甲基、乙基、1-丙基(正丙基)、1-甲基乙基(異丙基)、1-丁基(正丁基)、1-甲基丙基(仲丁基)、2-甲基丙基(異丁基)、1,1-二甲基乙基(叔丁基)、1-戊基(正戊基)。烷基通過單鍵被附接至分子的其余部分。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則烷基任選地被以下取代基中的一個(gè)或更多個(gè)取代:鹵素、氰基、硝基、氧代、硫代、亞氨基、肟基、三甲基甲硅烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t是1或2)、-S(O)tORa(其中t是1或2)、-S(O)tRa(其中t是1或2)以及-S(O)tN(Ra)2(其中t是1或2),其中每個(gè)Ra獨(dú)立地是氫、烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、碳環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、或雜芳基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)。
“烷氧基”指的是通過式-O-烷基的氧原子結(jié)合的基團(tuán),其中烷基是如上文所定義的烷基鏈。
“烯基”指的是僅由碳原子和氫原子組成的、包含至少一個(gè)碳-碳雙鍵的、并且具有從兩個(gè)至十二個(gè)碳原子的直鏈的或支鏈的烴鏈基團(tuán)。在某些實(shí)施方案中,烯基包含兩個(gè)至八個(gè)碳原子。在其他實(shí)施方案中,烯基包含兩個(gè)至四個(gè)碳原子。烯基通過單鍵被附接至分子的其余部分,例如乙烯基(ethenyl)(即,乙烯基(vinyl))、丙-1-烯基(即,丙烯基(allyl))、丁-1-烯基、戊-1-烯基、戊-1,4-二烯基及類似基團(tuán)。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則烯基任選地被以下取代基中的一個(gè)或更多個(gè)取代:鹵素、氰基、硝基、氧代、硫代、亞氨基、肟基、三甲基甲硅烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t是1或2)、-S(O)tORa(其中t是1或2)、-S(O)tRa(其中t是1或2)以及-S(O)tN(Ra)2(其中t是1或2),其中每個(gè)Ra獨(dú)立地是氫、烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、碳環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、或雜芳基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)。
“炔基”指的是僅由碳原子和氫原子組成的、包含至少一個(gè)碳-碳三鍵的、具有從兩個(gè)至十二個(gè)碳原子的直鏈的或支鏈的烴鏈基團(tuán)。在某些實(shí)施方案中,炔基包含兩個(gè)至八個(gè)碳原子。在其他實(shí)施方案中,炔基包含兩個(gè)至六個(gè)碳原子。在其他實(shí)施方案中,炔基包含兩個(gè)至四個(gè)碳原子。炔基通過單鍵被附接至分子的其余部分,例如乙炔基、丙炔基、丁炔基、戊炔基、己炔基及類似基團(tuán)。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則炔基任選地被以下取代基中的一個(gè)或更多個(gè)取代:鹵素、氰基、硝基、氧代、硫代、亞氨基、肟基、三甲基甲硅烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t是1或2)、-S(O)tORa(其中t是1或2)、-S(O)tRa(其中t是1或2)以及-S(O)tN(Ra)2(其中t是1或2),其中每個(gè)Ra獨(dú)立地是氫、烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、碳環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、或雜芳基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)。
“亞烷基”或“亞烷基鏈”指的是僅由碳和氫組成的、不包含不飽和并且具有從一個(gè)至十二個(gè)碳原子的將分子的其余部分連接至基團(tuán)的、直鏈的或支鏈的二價(jià)烴鏈,例如亞甲基、亞乙基、亞丙基、亞正丁基及類似基團(tuán)。亞烷基鏈通過單鍵被附接至分子的其余部分并且通過單鍵被附接至基團(tuán)。亞烷基鏈附接至分子的其余部分并且附接至基團(tuán)的點(diǎn)是通過亞烷基鏈中的一個(gè)碳或通過鏈內(nèi)的任何兩個(gè)碳。在某些實(shí)施方案中,亞烷基包含一個(gè)至八個(gè)碳原子(例如C1-C8亞烷基)。在其他實(shí)施方案中,亞烷基包含一個(gè)至五個(gè)碳原子(例如C1-C5亞烷基)。在其他實(shí)施方案中,亞烷基包含一個(gè)至四個(gè)碳原子(例如C1-C4亞烷基)。在其他實(shí)施方案中,亞烷基包含一個(gè)至三個(gè)碳原子(例如C1-C3亞烷基)。在其他實(shí)施方案中,亞烷基包含一個(gè)至兩個(gè)碳原子(例如C1-C2亞烷基)。在其他實(shí)施方案中,亞烷基包含一個(gè)碳原子(例如C1亞烷基)。在其他實(shí)施方案中,亞烷基包含五個(gè)至八個(gè)碳原子(例如C5-C8亞烷基)。在其他實(shí)施方案中,亞烷基包含兩個(gè)至五個(gè)碳原子(例如C2-C5亞烷基)。在其他實(shí)施方案中,亞烷基包含三個(gè)至五個(gè)碳原子(例如C3-C5亞烷基)。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則亞烷基鏈任選地被以下取代基中的一個(gè)或更多個(gè)取代:鹵素、氰基、硝基、氧代、硫代、亞氨基、肟基、三甲基甲硅烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t是1或2)、-S(O)tORa(其中t是1或2)、-S(O)tRa(其中t是1或2)以及-S(O)tN(Ra)2(其中t是1或2),其中每個(gè)Ra獨(dú)立地是氫、烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、碳環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、或雜芳基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)。
“亞炔基”或“亞炔基鏈”指的是僅由碳和氫組成的、包含至少一個(gè)碳-碳三鍵的、并且具有從兩個(gè)至十二個(gè)碳原子的將分子的其余部分連接至基團(tuán)的直鏈的或支鏈的二價(jià)烴鏈。亞炔基鏈通過單鍵被附接至分子的其余部分并且通過單鍵被附接至基團(tuán)。在某些實(shí)施方案中,亞炔基包含兩個(gè)至八個(gè)碳原子(例如C2-C8亞炔基)。在其他實(shí)施方案中,亞炔基包含兩個(gè)至五個(gè)碳原子(例如C2-C5亞炔基)。在其他實(shí)施方案中,亞炔基包含兩個(gè)至四個(gè)碳原子(例如C2-C4亞炔基)。在其他實(shí)施方案中,亞炔基包含兩個(gè)至三個(gè)碳原子(例如C2-C3亞炔基)。在其他實(shí)施方案中,亞炔基包含兩個(gè)碳原子(例如C2亞炔基)。在其他實(shí)施方案中,亞炔基包含五個(gè)至八個(gè)碳原子(例如C5-C8亞炔基)。在其他實(shí)施方案中,亞炔基包含三個(gè)至五個(gè)碳原子(例如C3-C5亞炔基)。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則亞炔基鏈任選地被以下取代基中的一個(gè)或更多個(gè)取代:鹵素、氰基、硝基、氧代、硫代、亞氨基、肟基、三甲基甲硅烷基、-ORa、-SRa、-OC(O)-Ra、-N(Ra)2、-C(O)Ra、-C(O)ORa、-C(O)N(Ra)2、-N(Ra)C(O)ORa、-OC(O)-N(Ra)2、-N(Ra)C(O)Ra、-N(Ra)S(O)tRa(其中t是1或2)、-S(O)tORa(其中t是1或2)、-S(O)tRa(其中t是1或2)以及-S(O)tN(Ra)2(其中t是1或2),其中每個(gè)Ra獨(dú)立地是氫、烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、氟烷基、碳環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、碳環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、或雜芳基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)。
“芳基”指的是通過從環(huán)碳原子移除氫原子而衍生自芳香族單環(huán)或芳香族多環(huán)烴環(huán)體系的基團(tuán)。芳香族單環(huán)或芳香族多環(huán)烴環(huán)體系僅包含氫和從五個(gè)至十八個(gè)碳原子的碳,其中環(huán)體系中的環(huán)的至少一個(gè)是完全不飽和的,即其包含根據(jù)休克爾理論(Hückel theory)的環(huán)狀的、離域化的(4n+2)π-電子體系。芳基從其中衍生的環(huán)體系包括但不限于基團(tuán)例如苯、芴、二氫化茚、茚、1,2,3,4-四氫化萘以及萘。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則術(shù)語“芳基”或前綴“芳(ar-)”(例如在“芳烷基”中)意指包括任選地被一個(gè)或更多個(gè)取代基取代的芳基,該一個(gè)或更多個(gè)取代基獨(dú)立地選自:烷基、烯基、炔基、鹵素、氟烷基、氰基、硝基、任選地被取代的芳基、任選地被取代的芳烷基、任選地被取代的芳烯基、任選地被取代的芳炔基、任選地被取代的碳環(huán)基、任選地被取代的碳環(huán)基烷基、任選地被取代的雜環(huán)基、任選地被取代的雜環(huán)基烷基、任選地被取代的雜芳基、任選地被取代的雜芳基烷基、-Rb-ORa、-Rb-OC(O)-Ra、-Rb-OC(O)-ORa、-Rb-OC(O)-N(Ra)2、-Rb-N(Ra)2、-Rb-C(O)Ra、-Rb-C(O)ORa、-Rb-C(O)N(Ra)2、-Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2、-Rb-N(Ra)C(O)ORa、-Rb-N(Ra)C(O)Ra、-Rb-N(Ra)S(O)tRa(其中t是1或2)、-Rb-S(O)tRa(其中t是1或2)、-Rb-S(O)tORa(其中t是1或2)以及-Rb-S(O)tN(Ra)2(其中t是1或2),其中每個(gè)Ra獨(dú)立地是氫、烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、氟烷基、環(huán)烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、環(huán)烷基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、或雜芳基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代),每個(gè)Rb獨(dú)立地是直鍵(direct bond)或直鏈的或支鏈的亞烷基鏈或亞烯基鏈,并且Rc是直鏈的或支鏈的亞烷基鏈或亞烯基鏈,并且除非另外指示,否則其中上文取代基中的每個(gè)是未被取代的。
“芳烷基”指的是式-Rc-芳基的基團(tuán),其中Rc是如上文定義的亞烷基鏈,例如亞甲基、亞乙基及類似基團(tuán)。芳烷基的亞烷基鏈部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于亞烷基鏈所描述的。芳烷基的芳基部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于芳基所描述的。
“芳烯基”指的是式-Rd-芳基的基團(tuán),其中Rd是如上文所定義的亞烯基鏈。芳烯基的芳基部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于芳基所描述的。芳烯基的亞烯基鏈部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于亞烯基所描述的。
“芳炔基”指的是式-Re-芳基的基團(tuán),其中Re是如上文所定義的亞炔基鏈。芳炔基的芳基部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于芳基所描述的。芳炔基的亞炔基鏈部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于亞炔基鏈所描述的。
“芳烷氧基”指的是通過式-O-Rc-芳基的氧原子結(jié)合的基團(tuán),其中Rc是如上文定義的亞烷基鏈,例如亞甲基、亞乙基及類似基團(tuán)。芳烷基的亞烷基鏈部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于亞烷基鏈所描述的。芳烷基的芳基部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于芳基所描述的。
“碳環(huán)基”指的是僅由碳原子和氫原子組成的、包括稠合的或橋接的環(huán)體系的、具有從三個(gè)至十五個(gè)碳原子的穩(wěn)定的非芳香族單環(huán)或多環(huán)烴基。在某些實(shí)施方案中,碳環(huán)基包含三個(gè)至十個(gè)碳原子。在其他實(shí)施方案中,碳環(huán)基包含五個(gè)至七個(gè)碳原子。碳環(huán)基通過單鍵被附接至分子的其余部分。碳環(huán)基是飽和的(即僅包含單個(gè)C-C單鍵)或不飽和的(即包含一個(gè)或更多個(gè)雙鍵或三鍵)。完全飽和的碳環(huán)基還被稱為“環(huán)烷基”。單環(huán)環(huán)烷基的實(shí)例包括例如環(huán)丙基、環(huán)丁基、環(huán)戊基、環(huán)己基、環(huán)庚基、以及環(huán)辛基。不飽和的碳環(huán)基還被稱為“環(huán)烯基”。單環(huán)環(huán)烯基的實(shí)例包括例如環(huán)戊烯基、環(huán)己烯基、環(huán)庚烯基、以及環(huán)辛烯基。多環(huán)碳環(huán)基包括例如金剛烷基、降冰片基(即雙環(huán)[2.2.1]庚基)、降冰片烯基、十氫萘基、7,7-二甲基雙環(huán)[2.2.1]庚基及類似基團(tuán)。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則術(shù)語“碳環(huán)基”意指包括任選地被一個(gè)或更多個(gè)取代基取代的碳環(huán)基,該一個(gè)或更多個(gè)取代基獨(dú)立地選自:烷基、烯基、炔基、鹵素、氟烷基、氧代、硫代、氰基、硝基、任選地被取代的芳基、任選地被取代的芳烷基、任選地被取代的芳烯基、任選地被取代的芳炔基、任選地被取代的碳環(huán)基、任選地被取代的碳環(huán)基烷基、任選地被取代的雜環(huán)基、任選地被取代的雜環(huán)基烷基、任選地被取代的雜芳基、任選地被取代的雜芳基烷基、-Rb-ORa、-Rb-OC(O)-Ra、-Rb-OC(O)-ORa、-Rb-OC(O)-N(Ra)2、-Rb-N(Ra)2、-Rb-C(O)Ra、-Rb-C(O)ORa、-Rb-C(O)N(Ra)2、-Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2、-Rb-N(Ra)C(O)ORa、-Rb-N(Ra)C(O)Ra、-Rb-N(Ra)S(O)tRa(其中t是1或2)、-Rb-S(O)tRa(其中t是1或2)、-Rb-S(O)tORa(其中t是1或2)以及-Rb-S(O)tN(Ra)2(其中t是1或2),其中每個(gè)Ra獨(dú)立地是氫、烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、氟烷基、環(huán)烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、環(huán)烷基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、或雜芳基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代),每個(gè)Rb獨(dú)立地是直鍵或直鏈的或支鏈的亞烷基鏈或亞烯基鏈,并且Rc是直鏈的或支鏈的亞烷基鏈或亞烯基鏈,并且除非另外指示,否則其中上文取代基中的每個(gè)是未被取代的。
“碳環(huán)基烷基”指的是式-Rc-碳環(huán)基的基團(tuán),其中Rc是如上文所定義的亞烷基鏈。亞烷基鏈和碳環(huán)基是任選地被取代的,如上文所定義的。
“碳環(huán)基炔基”指的是式-Rc-碳環(huán)基的基團(tuán),其中Rc是如上文所定義的亞炔基鏈。亞炔基鏈和碳環(huán)基是任選地被取代的,如上文所定義的。
“碳環(huán)基烷氧基”指的是通過式-O-Rc-碳環(huán)基的氧原子結(jié)合的基團(tuán),其中Rc是如上文所定義的亞烷基鏈。亞烷基鏈和碳環(huán)基是任選地被取代的,如上文所定義的。
如本文所使用的,“羧酸生物電子等排體”指的是呈現(xiàn)與羧酸部分類似的物理性質(zhì)、生物性質(zhì)和/或化學(xué)性質(zhì)的官能團(tuán)或部分。羧酸生物電子等排體的實(shí)例包括但不限于,
及類似基團(tuán)。
“鹵素(halo)”或“鹵素(halogen)”指的是溴取代基、氯取代基、氟取代基或碘取代基。
“氟烷基”指的是被如上文所定義的一個(gè)或更多個(gè)氟基團(tuán)取代的如上文所定義的烷基,例如三氟甲基、二氟甲基、氟甲基、2,2,2-三氟乙基、1-氟甲基-2-氟乙基及類似基團(tuán)。在某些實(shí)施方案中,氟烷基的烷基部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于烷基所定義的。
“雜環(huán)基”指的是包含兩個(gè)至十二個(gè)碳原子和選自氮、氧和硫的從一個(gè)至六個(gè)雜原子的穩(wěn)定的3元至18元非芳香族環(huán)基。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則雜環(huán)基是單環(huán)環(huán)體系、雙環(huán)環(huán)體系、三環(huán)環(huán)體系或四環(huán)環(huán)體系,所述環(huán)體系任選地包括稠合的或橋接的環(huán)體系。雜環(huán)基中的雜原子任選地被氧化。如果存在,一個(gè)或更多個(gè)氮原子任選地被季銨化。雜環(huán)基是部分地或完全地飽和的。雜環(huán)基通過環(huán)的任何原子被附接至分子的其余部分。此類雜環(huán)基的實(shí)例包括但不限于二氧戊環(huán)基、噻吩基[1,3]二噻烷基、十氫異喹啉基、咪唑啉基、咪唑烷基、異噻唑烷基、異噁唑烷基、嗎啉基、八氫吲哚基、八氫異吲哚基、2-氧代哌嗪基、2-氧代哌啶基、2-氧代吡咯烷基、噁唑烷基、哌啶基、哌嗪基、4-哌啶酮基、吡咯烷基、吡唑烷基、奎寧環(huán)基、噻唑烷基、四氫呋喃基、三噻烷基、四氫吡喃基、硫代嗎啉基(thiomorpholinyl)、硫嗎啉基(thiamorpholinyl)、1-氧代硫代嗎啉基、以及1,1-二氧代硫代嗎啉基。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則術(shù)語“雜環(huán)基”意指包括任選地被一個(gè)或更多個(gè)取代基取代的如上文所定義的雜環(huán)基,該一個(gè)或更多個(gè)取代基選自:烷基、烯基、炔基、鹵素、氟烷基、氧代、硫代、氰基、硝基、任選地被取代的芳基、任選地被取代的芳烷基、任選地被取代的芳烯基、任選地被取代的芳炔基、任選地被取代的碳環(huán)基、任選地被取代的碳環(huán)基烷基、任選地被取代的雜環(huán)基、任選地被取代的雜環(huán)基烷基、任選地被取代的雜芳基、任選地被取代的雜芳基烷基、-Rb-ORa、-Rb-OC(O)-Ra、-Rb-OC(O)-ORa、-Rb-OC(O)-N(Ra)2、-Rb-N(Ra)2、-Rb-C(O)Ra、-Rb-C(O)ORa、-Rb-C(O)N(Ra)2、-Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2、-Rb-N(Ra)C(O)ORa、-Rb-N(Ra)C(O)Ra、-Rb-N(Ra)S(O)tRa(其中t是1或2)、-Rb-S(O)tRa(其中t是1或2)、-Rb-S(O)tORa(其中t是1或2)以及-Rb-S(O)tN(Ra)2(其中t是1或2),其中每個(gè)Ra獨(dú)立地是氫、烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、氟烷基、環(huán)烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、環(huán)烷基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、或雜芳基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代),每個(gè)Rb獨(dú)立地是直鍵或直鏈的或支鏈的亞烷基鏈或亞烯基鏈,并且Rc是直鏈的或支鏈的亞烷基鏈或亞烯基鏈,并且除非另外指示,否則上文取代基中的每個(gè)是未被取代的。
“N-雜環(huán)基”或“N附接的雜環(huán)基”指的是包含至少一個(gè)氮并且其中將雜環(huán)基附接至分子的其余部分的點(diǎn)是通過雜環(huán)基中的氮原子的如上文定義的雜環(huán)基。N-雜環(huán)基是任選地被取代的,如上文關(guān)于雜環(huán)基所描述的。此類N-雜環(huán)基的實(shí)例包括但不限于1-嗎啉基、1-哌啶基、1-哌嗪基、1-吡咯烷基、吡唑烷基、咪唑啉基、以及咪唑烷基。
“C-雜環(huán)基”或“C附接的雜環(huán)基”指的是包含至少一個(gè)雜原子并且其中將雜環(huán)基附接至分子的其余部分的點(diǎn)是通過雜環(huán)基中的碳原子的如上文定義的雜環(huán)基。C-雜環(huán)基是任選地被取代的,如上文關(guān)于雜環(huán)基所描述的。此類C-雜環(huán)基的實(shí)例包括但不限于2-嗎啉基、2-哌啶基或3-哌啶基或4-哌啶基、2-哌嗪基、2-吡咯烷基或3-吡咯烷基及類似基團(tuán)。
“雜環(huán)基烷基”指的是式-Rc-雜環(huán)基的基團(tuán),其中Rc是如上文所定義的亞烷基鏈。如果雜環(huán)基是含氮雜環(huán)基,則雜環(huán)基在氮原子處任選地被附接至烷基。雜環(huán)基烷基的亞烷基鏈?zhǔn)侨芜x地被取代的,如上文關(guān)于亞烷基鏈所定義的。雜環(huán)基烷基的雜環(huán)基部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于雜環(huán)基所定義的。
“雜環(huán)基烷氧基”指的是通過式-O-Rc-雜環(huán)基的氧原子結(jié)合的基團(tuán),其中Rc是如上文所定義的亞烷基鏈。如果雜環(huán)基是含氮雜環(huán)基,則雜環(huán)基在氮原子處任選地被附接至烷基。雜環(huán)基烷氧基的亞烷基鏈?zhǔn)侨芜x地被取代的,如上文關(guān)于亞烷基鏈所定義的。雜環(huán)基烷氧基的雜環(huán)基部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于雜環(huán)基所定義的。
“雜芳基”指的是從包含兩個(gè)至十七個(gè)碳原子和選自氮、氧和硫的從一個(gè)至六個(gè)雜原子的3元至18元芳香族環(huán)基衍生的基團(tuán)。如本文所使用的,雜芳基是單環(huán)環(huán)體系、雙環(huán)環(huán)體系、三環(huán)環(huán)體系或四環(huán)環(huán)體系,其中環(huán)體系中的環(huán)的至少一個(gè)是完全不飽和的,即其包含根據(jù)休克爾理論的環(huán)狀的、離域化的(4n+2)π-電子體系。雜芳基包括稠合的或橋接的環(huán)體系。雜芳基中的雜原子任選地被氧化。如果存在,一個(gè)或更多個(gè)氮原子任選地被季銨化。雜芳基通過環(huán)的任何原子被附接至分子的其余部分。雜芳基的實(shí)例包括但不限于吖庚因基、吖啶基、苯并咪唑基、苯并吲哚基、1,3-苯并二氧雜環(huán)戊烯基、苯并呋喃基、苯并噁唑基(benzooxazolyl)、苯并[d]噻唑基、苯并噻二唑基、苯并[b][1,4]二噁庚基(benzo[b][1,4]dioxepinyl)、苯并[b][1,4]噁嗪基、1,4-苯并二氧六環(huán)基、苯并萘并呋喃基、苯并噁唑基、苯并二氧雜環(huán)戊烯基、苯并二噁英基(benzodioxinyl)、苯并吡喃基、苯并吡喃酮基、苯并呋喃基、苯并呋喃酮基、苯并噻吩基(benzothienyl)(苯并噻吩基(benzothiophenyl))、苯并噻吩并[3,2-d]嘧啶基、苯并三唑基、苯并[4,6]咪唑并[1,2-a]吡啶基、咔唑基、噌啉基、環(huán)戊二烯并[d]嘧啶基、6,7-二氫-5H-環(huán)戊二烯并[4,5]噻吩并[2,3-d]嘧啶基、5,6-二氫苯并[h]喹唑啉基、5,6-二氫苯并[h]噌啉基、6,7-二氫-5H-苯并[6,7]環(huán)庚三烯并[1,2-c]噠嗪基、二苯并呋喃基、二苯并噻吩基、呋喃基、呋喃酮基、呋喃并[3,2-c]吡啶基、5,6,7,8,9,10-六氫環(huán)辛間四烯并[d]嘧啶基、5,6,7,8,9,10-六氫環(huán)辛間四烯并[d]噠嗪基、5,6,7,8,9,10-六氫環(huán)辛間四烯并[d]吡啶基、異噻唑基、咪唑基、吲唑基、吲哚基、吲唑基、異吲哚基、吲哚啉基、異吲哚啉基、異喹啉基、吲嗪基、異噁唑基、5,8-亞甲基-5,6,7,8-四氫喹唑啉基、萘啶基、1,6-萘啶酮基、噁二唑基、2-氧代吖庚因基、噁唑基、環(huán)氧乙烷基、5,6,6a,7,8,9,10,10a-八氫苯并[h]喹唑啉基、1-苯基-1H-吡咯基、酚嗪基、吩噻嗪基、吩噁嗪基、酞嗪基、蝶啶基、嘌呤基、吡咯基、吡唑基、吡唑并[3,4-d]嘧啶基、吡啶基、吡啶并[3,2-d]嘧啶基、吡啶并[3,4-d]嘧啶基、吡嗪基、嘧啶基、噠嗪基、吡咯基、喹唑啉基、喹喔啉基、喹啉基、異喹啉基、四氫喹啉基、5,6,7,8-四氫喹唑啉基、5,6,7,8-四氫苯并[4,5]噻吩并[2,3-d]嘧啶基、6,7,8,9-四氫-5H-環(huán)庚三烯并[4,5]噻吩并[2,3-d]嘧啶基、5,6,7,8-四氫吡啶并[4,5-c]噠嗪基、噻唑基、噻二唑基、三唑基、四唑基、三嗪基、噻吩并[2,3-d]嘧啶基、噻吩并[3,2-d]嘧啶基、噻吩并[2,3-c]吡啶基、以及噻吩基(thiophenyl)(即噻吩基(thienyl))。除非在本說明書中另外特定地陳述,否則術(shù)語“雜芳基”意指包括任選地被一個(gè)或更多個(gè)取代基取代的如上文所定義的雜芳基,該一個(gè)或更多個(gè)取代基選自:烷基、烯基、炔基、鹵素、氟烷基、鹵代烯基、鹵代炔基、氧代、硫代、氰基、硝基、任選地被取代的芳基、任選地被取代的芳烷基、任選地被取代的芳烯基、任選地被取代的芳炔基、任選地被取代的碳環(huán)基、任選地被取代的碳環(huán)基烷基、任選地被取代的雜環(huán)基、任選地被取代的雜環(huán)基烷基、任選地被取代的雜芳基、任選地被取代的雜芳基烷基、-Rb-ORa、-Rb-OC(O)-Ra、-Rb-OC(O)-ORa、-Rb-OC(O)-N(Ra)2、-Rb-N(Ra)2、-Rb-C(O)Ra、-Rb-C(O)ORa、-Rb-C(O)N(Ra)2、-Rb-O-Rc-C(O)N(Ra)2、-Rb-N(Ra)C(O)ORa、-Rb-N(Ra)C(O)Ra、-Rb-N(Ra)S(O)tRa(其中t是1或2)、-Rb-S(O)tRa(其中t是1或2)、-Rb-S(O)tORa(其中t是1或2)以及-Rb-S(O)tN(Ra)2(其中t是1或2),其中每個(gè)Ra獨(dú)立地是氫、烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、氟烷基、環(huán)烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、環(huán)烷基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、芳烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜環(huán)基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、雜芳基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代)、或雜芳基烷基(任選地被鹵素、羥基、甲氧基、或三氟甲基取代),每個(gè)Rb獨(dú)立地是直鍵或直鏈的或支鏈的亞烷基鏈或亞烯基鏈,并且Rc是直鏈的或支鏈的亞烷基鏈或亞烯基鏈,并且除非另外指示,否則其中上文取代基中的每個(gè)是未被取代的。
“N-雜芳基”指的是包含至少一個(gè)氮并且其中將雜芳基附接至分子的其余部分的點(diǎn)是通過雜芳基中的氮原子的如上文定義的雜芳基。N-雜芳基是任選地被取代的,如上文關(guān)于雜芳基所描述的。
“C-雜芳基”指的是如上文定義的并且其中將雜芳基附接至分子的其余部分的點(diǎn)是通過雜芳基中的碳原子的雜芳基。C-雜芳基是任選地被取代的,如上文關(guān)于雜芳基所描述的。
“雜芳基烷基”指的是式-Rc-雜芳基的基團(tuán),其中Rc是如上文所定義的亞烷基鏈。如果雜芳基是含氮雜芳基,則雜芳基在氮原子處任選地被附接至烷基。雜芳基烷基的亞烷基鏈?zhǔn)侨芜x地被取代的,如上文關(guān)于亞烷基鏈所定義的。雜芳基烷基的雜芳基部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于雜芳基所定義的。
“雜芳基烷氧基”指的是通過式-O-Rc-雜芳基的氧原子結(jié)合的基團(tuán),其中Rc是如上文所定義的亞烷基鏈。如果雜芳基是含氮雜芳基,則雜芳基在氮原子處任選地被附接至烷基。雜芳基烷氧基的亞烷基鏈?zhǔn)侨芜x地被取代的,如上文關(guān)于亞烷基鏈所定義的。雜芳基烷氧基的雜芳基部分是任選地被取代的,如上文關(guān)于雜芳基所定義的。
在某些實(shí)施方案中,本文公開的化合物包含一個(gè)或更多個(gè)不對稱中心并且因此產(chǎn)生對映異構(gòu)體、非對映異構(gòu)體、以及在絕對立體化學(xué)方面被定義為(R)-或(S)-的其他立體異構(gòu)形式。除非另外陳述,否則意圖本文公開的化合物的所有立體異構(gòu)形式被本公開內(nèi)容預(yù)期。當(dāng)本文描述的化合物包含烯烴雙鍵時(shí),并且除非另外指定,否則意圖本公開內(nèi)容包括E幾何異構(gòu)體和Z幾何異構(gòu)體(例如順式或反式)兩者。同樣地,所有可能的異構(gòu)體以及其外消旋形式和光學(xué)純的形式,以及所有互變異構(gòu)形式也意圖被包括。術(shù)語“幾何異構(gòu)體”指的是烯烴雙鍵的E幾何異構(gòu)體或Z幾何異構(gòu)體(例如順式或反式)。術(shù)語“位置異構(gòu)體”指的是圍繞中心環(huán)的結(jié)構(gòu)異構(gòu)體,例如圍繞苯環(huán)的鄰位異構(gòu)體、間位異構(gòu)體、以及對位異構(gòu)體。
“互變異構(gòu)體”指的是其中質(zhì)子從分子的一個(gè)原子位移至相同分子的另一個(gè)原子是可能的分子。在某些實(shí)施方案中,本文提供的化合物作為互變異構(gòu)體存在。在其中互變異構(gòu)化是可能的情形下,互變異構(gòu)體的化學(xué)平衡將存在。互變異構(gòu)體的精確比率取決于若干因素,包括物理狀態(tài)、溫度、溶劑、以及pH。互變異構(gòu)平衡的某些實(shí)例包括:
“藥學(xué)上可接受的鹽”包括酸加成鹽和堿加成鹽兩者。本文描述的被取代的雜環(huán)衍生化合物中的任一個(gè)的藥學(xué)上可接受的鹽意圖涵蓋任何和所有藥學(xué)上合適的鹽形式。本文描述的化合物的優(yōu)選的藥學(xué)上可接受的鹽是藥學(xué)上可接受的酸加成鹽和藥學(xué)上可接受的堿加成鹽。
“藥學(xué)上可接受的酸加成鹽”指的是保持游離堿的生物效力和性質(zhì)、生物學(xué)上或另外不是不合意的、并且與無機(jī)酸形成的那些鹽,所述無機(jī)酸為例如鹽酸、氫溴酸、硫酸、硝酸、磷酸、氫碘酸、氫氟酸、亞磷酸及類似無機(jī)酸。還包括與有機(jī)酸形成的鹽,所述有機(jī)酸為例如脂肪族一元羧酸和脂肪族二元羧酸、被苯基取代的鏈烷酸、羥基鏈烷酸、鏈烷二酸、芳香族酸、脂肪族酸以及芳香族磺酸等等并且包括例如乙酸、三氟乙酸、丙酸、乙醇酸、丙酮酸、草酸、馬來酸、丙二酸、琥珀酸、富馬酸、酒石酸、檸檬酸、苯甲酸、肉桂酸、扁桃酸、甲烷磺酸、乙烷磺酸、對甲苯磺酸、水楊酸及類似有機(jī)酸。示例性鹽因此包括硫酸鹽、焦硫酸鹽、硫酸氫鹽、亞硫酸鹽、亞硫酸氫鹽、硝酸鹽、磷酸鹽、一氫磷酸鹽、二氫磷酸鹽、偏磷酸鹽、焦磷酸鹽、氯化物、溴化物、碘化物、乙酸鹽、三氟乙酸鹽、丙酸鹽、辛酸鹽、異丁酸鹽、草酸鹽、丙二酸鹽、琥珀酸鹽、辛二酸鹽、癸二酸鹽、富馬酸鹽、馬來酸鹽、扁桃酸鹽、苯甲酸鹽、氯苯甲酸鹽、甲基苯甲酸鹽、二硝基苯甲酸鹽、鄰苯二甲酸鹽、苯磺酸鹽、甲苯磺酸鹽、苯基乙酸鹽、檸檬酸鹽、乳酸鹽、蘋果酸鹽、酒石酸鹽、甲烷磺酸鹽及類似鹽。還預(yù)期氨基酸的鹽,例如精氨酸鹽、葡萄糖酸鹽、以及半乳糖醛酸鹽(參見例如,Berge S.M.等人,"Pharmaceutical Salts,"Journal of Pharmaceutical Science,66:1-19(1997))。在某些實(shí)施方案中,堿性化合物的酸加成鹽通過根據(jù)技術(shù)人員熟悉的方法和技術(shù),使游離堿形式與充足量的期望的酸接觸以產(chǎn)生鹽來制備。
“藥學(xué)上可接受的堿加成鹽”指的是保持游離酸的生物效力和性質(zhì)的、生物學(xué)上或另外不是不合意的那些鹽。這些鹽從將無機(jī)堿或有機(jī)堿添加至游離酸來制備。在某些實(shí)施方案中,藥學(xué)上可接受的堿加成鹽用金屬或胺例如堿金屬和堿土金屬或有機(jī)胺形成。從無機(jī)堿衍生的鹽包括但不限于鈉鹽、鉀鹽、鋰鹽、銨鹽、鈣鹽、鎂鹽、鐵鹽、鋅鹽、銅鹽、錳鹽、鋁鹽及類似鹽。從有機(jī)堿衍生的鹽包括但不限于伯胺、仲胺、和叔胺、被取代的胺(包括天然存在的被取代的胺)、環(huán)胺以及堿性離子交換樹脂例如異丙胺、三甲胺、二乙胺、三乙胺、三丙胺、乙醇胺、二乙醇胺、2-二甲基氨基乙醇、2-二乙基氨基乙醇、二環(huán)己基胺、賴氨酸、精氨酸、組氨酸、咖啡因、普魯卡因、N,N-二芐基乙二胺、氯普魯卡因、海巴胺(hydrabamine)、膽堿、甜菜堿、乙二胺、乙二苯胺、N-甲基葡糖胺、葡糖胺、甲基葡糖胺、可可堿、嘌呤、哌嗪、哌啶、N-乙基哌啶、多胺樹脂及類似物的鹽。參見上述的Berge等人。
如本文所使用的,可互換地使用“治療(treatment)”或“治療(treating)”或“減輕(palliating)”或“改善(ameliorating)”。這些術(shù)語指的是用于獲得有益的或期望的結(jié)果(包括但不限于治療益處和/或預(yù)防益處)的方法?!爸委熞嫣帯币庵副恢委煹目赡艿奈蓙y的根除或改善。還有,治療益處以根除或改善與可能的紊亂有關(guān)聯(lián)的生理學(xué)癥狀中的一種或更多種來實(shí)現(xiàn),使得在患者中觀察到改進(jìn),盡管患者仍被可能的紊亂所折磨。對于預(yù)防益處,在某些實(shí)施方案中,組合物被施用至處于發(fā)作特定疾病的風(fēng)險(xiǎn)的患者,或施用至報(bào)告疾病的生理學(xué)癥狀中的一種或更多種的患者,即使未曾做出該疾病的診斷。
“前藥(Prodrug)”意指指示在某些實(shí)施方案中在生理學(xué)條件下或通過溶劑分解轉(zhuǎn)化成本文描述的生物活性化合物的化合物。因此,術(shù)語“前藥”指的是藥學(xué)上可接受的生物活性化合物的前體。前藥當(dāng)被施用至受試者時(shí)典型地是無活性的,但在體內(nèi)轉(zhuǎn)化成活性化合物,例如通過水解。前藥化合物常常提供溶解度、組織相容性或在哺乳動(dòng)物器官內(nèi)延遲釋放的優(yōu)點(diǎn)(參見例如,Bundgard,H.,Design of Prodrugs(1985),第7-9頁,第21-24頁(Elsevier,Amsterdam))。
在Higuchi,T.,等人,"Pro-drugs as Novel Delivery Systems,"A.C.S.Symposium Series,第14卷中和在Bioreversible Carriers in Drug Design,Edward B.Roche編輯,American Pharmaceutical Association and Pergamon Press,1987中提供前藥的討論。
術(shù)語“前藥”還意指包括當(dāng)此類前藥被施用至哺乳動(dòng)物受試者時(shí)在體內(nèi)釋放活性化合物的任何共價(jià)地結(jié)合的載體。如本文所描述的活性化合物的前藥,通過以使得改性(以常規(guī)的操作或在體內(nèi))被裂解成母體活性化合物的方式使活性化合物中存在的官能團(tuán)改性來制備。前藥包括當(dāng)活性化合物的前藥被施用至哺乳動(dòng)物受試者時(shí),其中羥基、氨基或巰基與裂解以分別形成游離的羥基、游離的氨基或游離的巰基的任何基團(tuán)結(jié)合的化合物。前藥的實(shí)例包括但不限于活性化合物中的醇官能團(tuán)或氨官能團(tuán)的乙酸酯衍生物、甲酸酯衍生物和苯甲酸酯衍生物及類似物。
被取代的雜環(huán)衍生化合物
本文描述被取代的雜環(huán)衍生化合物,其為賴氨酸特異性脫甲基酶-1抑制劑。這些化合物和包含這些化合物的組合物對于癌癥和腫瘤病的治療是有用的。
一個(gè)實(shí)施方案提供具有式(I)的結(jié)構(gòu)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,
其中,
W是N、C-H、或C-F;
X是氫、鹵素、-CN、任選地被取代的烷基、任選地被取代的炔基、任選地被取代的碳環(huán)基炔基、任選地被取代的芳基、或任選地被取代的雜芳基;
Y是氫、任選地被取代的烷基、任選地被取代的環(huán)烷基、或任選地被取代的環(huán)烷基烷基;
Z是選自以下的任選地被取代的基團(tuán):烷基、碳環(huán)基、C附接的雜環(huán)基、N附接的雜環(huán)基、雜環(huán)基烷基、雜環(huán)基烯基、-O-雜環(huán)基、-N(R)-雜環(huán)基、-O-雜環(huán)基烷基、-N(R)-雜環(huán)基烷基、-N(R)(C1-C4亞烷基)-NR2、-O(C1-C4亞烷基)-NR2,并且R是氫或C1-C4烷基。
一個(gè)實(shí)施方案提供具有式(Ia)的結(jié)構(gòu)的式(I)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,
其中,
W是N、C-H、或C-F;
X是氫、鹵素、-CN、任選地被取代的炔基、任選地被取代的碳環(huán)基炔基、任選地被取代的芳基、或任選地被取代的雜芳基;
Y是氫、任選地被取代的烷基、任選地被取代的環(huán)烷基、或任選地被取代的環(huán)烷基烷基;并且
Z是選自以下的任選地被取代的基團(tuán):N附接的雜環(huán)基、-O-雜環(huán)基烷基、-N(H)-雜環(huán)基、-N(Me)-雜環(huán)基、-N(H)-雜環(huán)基烷基、或-N(Me)-雜環(huán)基烷基。
一個(gè)實(shí)施方案提供具有式(Ib)的結(jié)構(gòu)的式(I)或式(Ia)的化合物,或其藥學(xué)上可接受的鹽,
其中,
W是N、C-H、或C-F;
X是氫、鹵素、任選地被取代的炔基、任選地被取代的碳環(huán)基炔基、任選地被取代的芳基、或任選地被取代的雜芳基;
Y是氫、任選地被取代的烷基、或任選地被取代的環(huán)烷基;并且
Z是選自以下的任選地被取代的基團(tuán):N-雜環(huán)基、-O-雜環(huán)基烷基、-N(H)-雜環(huán)基烷基、或-N(Me)-雜環(huán)基烷基。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中W是C-H。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中W是C-F。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中W是N。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中X是氫。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中X是鹵素。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中X是任選地被取代的炔基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中X是任選地被取代的碳環(huán)基炔基。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中X是任選地被取代的芳基或任選地被取代的雜芳基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中X是任選地被取代的芳基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中X是任選地被取代的苯基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中X是任選地被取代的雜芳基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中X選自任選地被取代的吡啶基、任選地被取代的吡唑基、或任選地被取代的吲唑基。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Y是氫。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Y是任選地被取代的環(huán)烷基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Y是任選地被取代的烷基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Y是任選地被取代的C1-C3烷基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Y是任選地被取代的C1烷基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Y是甲基。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-O-雜環(huán)基烷基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-N(H)-雜環(huán)基烷基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-N(Me)-雜環(huán)基烷基。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-O-雜環(huán)基烷基并且該雜環(huán)基烷基具有式-Rc-雜環(huán)基并且Rc是任選地被取代的C1-C3亞烷基鏈。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-O-雜環(huán)基烷基并且該雜環(huán)基烷基具有式-Rc-雜環(huán)基并且Rc是任選地被取代的C1亞烷基鏈。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-O-雜環(huán)基烷基,并且該雜環(huán)基烷基具有式-Rc-雜環(huán)基并且該雜環(huán)基是任選地被取代的含氮的4元、5元、6元、或7元雜環(huán)基。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-N(H)-雜環(huán)基烷基并且該雜環(huán)基烷基具有式-Rc-雜環(huán)基并且Rc是任選地被取代的C1-C3亞烷基鏈。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-N(H)-雜環(huán)基烷基并且該雜環(huán)基烷基具有式-Rc-雜環(huán)基并且Rc是任選地被取代的C1亞烷基鏈。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-N(H)-雜環(huán)基烷基,并且該雜環(huán)基烷基具有式-Rc-雜環(huán)基并且該雜環(huán)基是任選地被取代的含氮的4元、5元、6元、或7元雜環(huán)基。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-N(Me)-雜環(huán)基烷基并且該雜環(huán)基烷基具有式-Rc-雜環(huán)基并且Rc是任選地被取代的C1-C3亞烷基鏈。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-N(Me)-雜環(huán)基烷基并且該雜環(huán)基烷基具有式-Rc-雜環(huán)基并且Rc是任選地被取代的C1亞烷基鏈。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的-N(Me)-雜環(huán)基烷基并且該雜環(huán)基烷基具有式-Rc-雜環(huán)基并且該雜環(huán)基是任選地被取代的含氮的4元、5元、6元、或7元雜環(huán)基。
另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的N-雜環(huán)基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是4元、5元、6元、或7元N-雜環(huán)基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是6元N-雜環(huán)基。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的哌啶。另一個(gè)實(shí)施方案提供式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽,其中Z是任選地被取代的4-氨基哌啶。
在某些實(shí)施方案中,式(I)、式(Ia)或式(Ib)中描述的被取代的雜環(huán)衍生化合物具有表1中提供的結(jié)構(gòu)。
表1
在某些實(shí)施方案中,本文描述的被取代的雜環(huán)衍生化合物具有表2中提供的結(jié)構(gòu)。
表2
被取代的雜環(huán)衍生化合物的制備
在本文描述的反應(yīng)中使用的化合物根據(jù)對本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的有機(jī)合成技術(shù)、從可商購的化學(xué)品和/或從在化學(xué)文獻(xiàn)中描述的化合物開始來制備?!翱缮藤彽幕瘜W(xué)品”從包括以下的標(biāo)準(zhǔn)商業(yè)來源獲得:Acros Organics(Pittsburgh,PA)、Aldrich Chemical(Milwaukee,WI,including Sigma Chemical and Fluka)、Apin Chemicals Ltd.(Milton Park,UK)、Avocado Research(Lancashire,U.K.)、BDH Inc.(Toronto,Canada)、Bionet(Cornwall,U.K.)、Chemservice Inc.(West Chester,PA)、Crescent Chemical Co.(Hauppauge,NY)、Eastman Organic Chemicals、Eastman Kodak Company(Rochester,NY)、Fisher Scientific Co.(Pittsburgh,PA)、Fisons Chemicals(Leicestershire,UK)、Frontier Scientific(Logan,UT)、ICN Biomedicals,Inc.(Costa Mesa,CA)、Key Organics(Cornwall,U.K.)、Lancaster Synthesis(Windham,NH)、Maybridge Chemical Co.Ltd.(Cornwall,U.K.)、Parish Chemical Co.(Orem,UT)、Pfaltz&Bauer,Inc.(Waterbury,CN)、Polyorganix(Houston,TX)、Pierce Chemical Co.(Rockford,IL)、Riedel de Haen AG(Hanover,Germany)、Spectrum Quality Product,Inc.(New Brunswick,NJ)、TCI America(Portland,OR)、Trans World Chemicals,Inc.(Rockville,MD)、以及Wako Chemicals USA,Inc.(Richmond,VA)。
詳細(xì)描述本文描述的在化合物的制備中有用的反應(yīng)物的合成、或提供描述該制備的文章的參考文獻(xiàn)的合適的參考書籍和論文包括例如,"Synthetic Organic Chemistry",John Wiley&Sons,Inc.,New York;S.R.Sandler等人,"Organic Functional Group Preparations,"第2版,Academic Press,New York,1983;H.O.House,"Modern Synthetic Reactions",第2版,W.A.Benjamin,Inc.Menlo Park,Calif.1972;T.L.Gilchrist,"Heterocyclic Chemistry",第2版,John Wiley&Sons,New York,1992;J.March,"Advanced Organic Chemistry:Reactions,Mechanisms and Structure",第4版,Wiley-Interscience,New York,1992。詳細(xì)描述在本文描述的化合物的制備中有用的反應(yīng)物的合成、或提供描述該制備的文章的參考文獻(xiàn)的另外的合適的參考書籍和論文包括例如,F(xiàn)uhrhop,J.和Penzlin G."Organic Synthesis:Concepts,Methods,Starting Materials",Second,Revised and Enlarged Edition(1994)John Wiley&Sons ISBN:3-527-29074-5;Hoffman,R.V."Organic Chemistry,An Intermediate Text"(1996)Oxford University Press,ISBN 0-19-509618-5;Larock,R.C."Comprehensive Organic Transformations:A Guide to Functional Group Preparations"第2版(1999)Wiley-VCH,ISBN:0-471-19031-4;March,J."Advanced Organic Chemistry:Reactions,Mechanisms,and Structure"第4版(1992)John Wiley&Sons,ISBN:0-471-60180-2;Otera,J.(主編)"Modern Carbonyl Chemistry"(2000)Wiley-VCH,ISBN:3-527-29871-1;Patai,S."Patai's 1992Guide to the Chemistry of Functional Groups"(1992)Interscience ISBN:0-471-93022-9;Solomons,T.W.G."Organic Chemistry"第7版(2000)John Wiley&Sons,ISBN:0-471-19095-0;Stowell,J.C.,"Intermediate Organic Chemistry"第2版(1993)Wiley-Interscience,ISBN:0-471-57456-2;"Industrial Organic Chemicals:Starting Materials and Intermediates:An Ullmann's Encyclopedia"(1999)John Wiley&Sons,ISBN:3-527-29645-X,在8卷中;"Organic Reactions"(1942-2000)John Wiley&Sons,在超過55卷中;以及"Chemistry of Functional Groups"John Wiley&Sons,在73卷中。
具體的和類似的反應(yīng)物通過由美國化學(xué)學(xué)會(huì)的化學(xué)文摘社(Chemical Abstract Service of the American Chemical Society)準(zhǔn)備的已知化學(xué)品的索引(在大部分公共圖書館和大學(xué)圖書館中是可得的),以及通過在線數(shù)據(jù)庫(為了更多細(xì)節(jié),聯(lián)系華盛頓哥倫比亞特區(qū)的美國化學(xué)學(xué)會(huì))來任選地確定。已知的但不是目錄中可商購的化學(xué)品通過定制化學(xué)合成公司任選地來制備,其中許多標(biāo)準(zhǔn)化學(xué)品供應(yīng)公司(例如上文列出的公司)提供定制合成服務(wù)。用于本文描述的被取代的雜環(huán)衍生化合物的藥物鹽的制備和選擇的參考文獻(xiàn)是P.H.Stahl&C.G.Wermuth"Handbook of Pharmaceutical Salts",Verlag Helvetica Chimica Acta,Zurich,2002。
被取代的雜環(huán)衍生化合物通過下文方案1中描述的一般合成路線來制備。
方案1
參考方案1,使化合物A選擇性地水解以給出化合物B?;衔顲從化合物B與多種烷基鹵化物R1-X的N-烷基化獲得。三氯化合物C的選擇性取代用多種胺HN(R2)(R2’)在堿性條件下進(jìn)行以形成化合物D?;衔顴由化合物D在鈀介導(dǎo)的交叉偶聯(lián)條件下用硼酸例如R3-B(OH)2或硼酸酯來制備?;衔颋由化合物E在鈀介導(dǎo)的交叉偶聯(lián)條件下用硼酸例如R3-B(OH)2或硼酸酯來制備。
被取代的雜環(huán)衍生化合物的藥物組合物
在某些實(shí)施方案中,如本文描述的被取代的雜環(huán)衍生化合物作為純的化學(xué)品被施用。在其他實(shí)施方案中,本文描述的被取代的雜環(huán)衍生化合物與基于如例如在Remington:The Science and Practice of Pharmacy(Gennaro,第21版Mack Pub.Co.,Easton,PA(2005))中描述的選擇的施用途徑和標(biāo)準(zhǔn)藥物實(shí)踐選定的藥學(xué)上合適的或可接受的載體(在本文還被稱為藥學(xué)上合適的(或可接受的)賦形劑、生理學(xué)上合適的(或可接受的)賦形劑、或生理學(xué)上合適的(或可接受的)載體)組合。
本文提供包含至少一種被取代的雜環(huán)衍生化合物、或其立體異構(gòu)體、藥學(xué)上可接受的鹽、水合物、溶劑化物、或N-氧化物連同一種或更多種藥學(xué)上可接受的載體的藥物組合物。如果載體與組合物的其他成分是相容的并且對于組合物的接受者(即受試者)不是有害的,那么該載體(或賦形劑)是可接受的或合適的。
一個(gè)實(shí)施方案提供包含式(I)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽和藥學(xué)上可接受的賦形劑的藥物組合物。一個(gè)實(shí)施方案提供包含式(Ia)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽和藥學(xué)上可接受的賦形劑的藥物組合物。一個(gè)實(shí)施方案提供包含式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽和藥學(xué)上可接受的賦形劑的藥物組合物。
在某些實(shí)施方案中,如由式(I)描述的被取代的雜環(huán)衍生化合物大體上是純的,即其包含小于約5%、或小于約1%、或小于約0.1%的其他有機(jī)小分子,例如未反應(yīng)的中間體或例如在合成方法的步驟的一個(gè)或更多個(gè)步驟中產(chǎn)生的合成副產(chǎn)物。
合適的口服劑型包括例如片劑、丸劑、袋劑、或硬明膠或軟明膠的膠囊劑、甲基纖維素或容易溶解在消化道中的另一種合適的材料。在某些實(shí)施方案中,使用合適的無毒固體載體,其包括例如藥物級別的甘露醇、乳糖、淀粉、硬脂酸鎂、糖精鈉、滑石、纖維素、葡萄糖、蔗糖、碳酸鎂及類似物。(參見例如,Remington:The Science and Practice of Pharmacy(Gennaro,第21版Mack Pub.Co.,Easton,PA(2005))。
包含如本文描述的至少一種被取代的雜環(huán)衍生化合物的組合物的劑量有區(qū)別,取決于患者的(例如人類)狀況,即疾病的階段、一般健康狀態(tài)、年齡及其他因素。
藥物組合物以適合于待被治療(或預(yù)防)的疾病的方式被施用。施用的合適的劑量和合適的持續(xù)時(shí)間以及施用頻率將通過諸如患者的狀況、患者的疾病的類型和嚴(yán)重程度、活性成分的特定的形式、以及施用方法的因素來確定。通常,合適的劑量和治療方案以足以提供治療益處和/或預(yù)防益處(例如改進(jìn)的臨床結(jié)果,例如更頻繁的完全的或部分的緩解、或更長的無疾病和/或總體存活率、或癥狀嚴(yán)重程度的減輕)的量提供組合物。最優(yōu)的劑量通常使用實(shí)驗(yàn)?zāi)P秃?或臨床試驗(yàn)來確定。最優(yōu)的劑量取決于患者的身體質(zhì)量、重量、或血容量。
口服劑量典型地在從約1.0mg至約1000mg的范圍內(nèi),每天一次至四次或更多次。
被取代的雜環(huán)衍生化合物的用途
表觀遺傳學(xué)是由基礎(chǔ)DNA序列(underlying DNA sequence)之外的機(jī)制引起的基因表達(dá)的可遺傳的變化的研究。在表觀遺傳調(diào)控中起作用的分子機(jī)制包括DNA甲基化和染色質(zhì)/組蛋白修飾。
真核有機(jī)體的基因組在細(xì)胞的核中是高度組織化的。需要極大的壓縮以將人類基因組的30億個(gè)核苷酸包裝到細(xì)胞的核中。染色質(zhì)是構(gòu)成染色體的DNA和蛋白質(zhì)的復(fù)合物。組蛋白是染色質(zhì)的主要蛋白質(zhì)組分,充當(dāng)DNA在其周圍纏繞的線軸。染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化受組蛋白的共價(jià)修飾和非組蛋白結(jié)合蛋白影響。在多個(gè)位點(diǎn)處修飾組蛋白的若干類酶是已知的。
存在組成兩組的總計(jì)六類組蛋白(HI、H2A、H2B、H3、H4、以及H5):核心組蛋白(core histone)(H2A、H2B、H3、以及H4)和連接組蛋白(linker histone)(HI和H5)。染色質(zhì)的基本單元是核小體,其由在核心組蛋白八聚體周圍纏繞的約147個(gè)堿基對DNA組成,所述核心組蛋白八聚體由兩個(gè)拷貝組成,每個(gè)具有核心組蛋白H2A、H2B、H3、以及H4。
然后,基本核小體單元通過核小體的聚集和折疊進(jìn)一步地組織(organized)和凝聚(condensed)以形成高度凝聚的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。一系列不同狀態(tài)的凝聚是可能的,并且染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的緊密度(tightness)在細(xì)胞周期期間變化,在細(xì)胞分裂的過程期間是最緊實(shí)的。
染色質(zhì)結(jié)構(gòu)在調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄方面起重要作用,基因轉(zhuǎn)錄不能從高度凝聚的染色質(zhì)有效地發(fā)生。染色質(zhì)結(jié)構(gòu)受一系列組蛋白尤其組蛋白H3和H4的后翻譯修飾控制,并且在延伸超過核心核小體結(jié)構(gòu)的組蛋白尾部內(nèi)最常見。這些修飾是乙酰化、甲基化、磷酸化、核糖基化、類小泛素化(sumoylation)、泛素化、瓜氨酸化、脫亞氨化、以及生物素化。組蛋白H2A和H3核心還可以被修飾。組蛋白修飾對于多樣化生物過程例如基因調(diào)節(jié)、DNA修復(fù)、以及染色體濃縮(chromosome condensation)是不可或缺的。
組蛋白甲基化是最重要的染色質(zhì)標(biāo)記物中的一種;這些染色質(zhì)標(biāo)記物在轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、DNA損傷響應(yīng)、異染色質(zhì)形成和維護(hù)、以及X染色體滅活中起重要作用。最近的發(fā)現(xiàn)還揭示,組蛋白甲基化通過影響剪接調(diào)節(jié)物的募集影響前mRNA(pre-mRNA)的剪接結(jié)果。組蛋白甲基化包括賴氨酸的一甲基化、二甲基化、以及三甲基化,和精氨酸的一甲基化、對稱二甲基化、以及不對稱二甲基化。這些修飾可以為活化標(biāo)記物或阻遏標(biāo)記物,取決于甲基化的位點(diǎn)和程度。
組蛋白脫甲基酶
如本文所提到的“脫甲基酶”或“蛋白脫甲基酶”指的是從多肽中除去至少一個(gè)甲基的酶。脫甲基酶包括JmjC域,并且可以是甲基-賴氨酸脫甲基酶或甲基-精氨酸脫甲基酶。一些脫甲基酶作用于組蛋白,例如充當(dāng)組蛋白H3脫甲基酶或組蛋白H4脫甲基酶。例如,H3脫甲基酶可以使H3K4、H3K9、H3K27、H3K36和/或H3K79中的一個(gè)或更多個(gè)脫甲基化??蛇x擇地,H4脫甲基酶可以使組蛋白H4K20脫甲基化??梢允挂患谆孜?、二甲基化底物和/或三甲基化底物脫甲基化的脫甲基酶是已知的。另外,組蛋白脫甲基酶可以作用于甲基化核心組蛋白底物、單核小體底物、二核小體底物和/或寡核小體底物、肽底物和/或染色質(zhì)(例如在基于細(xì)胞的測定中)。
發(fā)現(xiàn)的第一個(gè)賴氨酸脫甲基酶是賴氨酸特異性脫甲基酶1(LSD1/KDM1),其使用黃素作為輔因子使一甲基化的和二甲基化的H3K4或H3K9兩者脫甲基化。包含Jumonji C(JmjC)域的第二類組蛋白脫甲基酶被預(yù)測,并且當(dāng)使用甲醛釋放測定法發(fā)現(xiàn)H3K36脫甲基酶時(shí)被確證,該H3K36脫甲基酶被命名為包含JmjC域的組蛋白脫甲基酶1(JHDM1/KDM2A)。
更多包含JmjC域的蛋白質(zhì)相繼地被確定并且其在系統(tǒng)發(fā)生學(xué)上可以聚集成七個(gè)子家族:JHDM1、JHDM2、JHDM3、JMJD2、JARID、PHF2/PHF8、UTX/UTY、以及僅JmjC域。
LSD-1
賴氨酸特異性脫甲基酶1(LSD1)是使一甲基化的和二甲基化的組蛋白H3在K4處特異地脫甲基化并且還使二甲基化的H3在K9處脫甲基化的組蛋白賴氨酸脫甲基酶。雖然LSD1的主要靶似乎是一甲基化的和二甲基化的組蛋白賴氨酸,特異地H3K4和H3K9,但是在文獻(xiàn)中存在證據(jù),LSD 1可以使非組蛋白蛋白如p53、E2F1、Dnmtl以及STAT3上的甲基化的賴氨酸脫甲基化。
LSD1具有與多胺氧化酶和單胺氧化酶的相當(dāng)程度的結(jié)構(gòu)類似性和氨基酸同一性/同源性,所有酶(即MAO-A、MAO-B和LSDl)是催化氮-氫鍵和/或氮-碳鍵的氧化的黃素依賴性胺氧化酶。LSD1還包括N末端SWRIM域。存在通過可變剪接產(chǎn)生的LSD1的兩種轉(zhuǎn)錄變體。
在某些實(shí)施方案中,通過使生物樣品與如本文公開的被取代的雜環(huán)化合物接觸,本文公開的化合物能夠抑制生物樣品中的LSD 1活性。在某些實(shí)施方案中,如本文公開的被取代的雜環(huán)化合物能夠調(diào)節(jié)生物樣品中的組蛋白4賴氨酸3甲基化的水平。在某些實(shí)施方案中,如本文公開的被取代的雜環(huán)化合物能夠調(diào)節(jié)生物樣品中的組蛋白-3賴氨酸-9甲基化水平。
本文公開的被取代的雜環(huán)化合物缺少明顯的MAO-A或MAO-B抑制活性。在某些實(shí)施方案中,相比于MAO-A抑制活性和/或MAO-B抑制活性,如本文公開的被取代的雜環(huán)化合物在更大的程度上抑制LSD 1抑制活性。
一個(gè)實(shí)施方案提供調(diào)節(jié)細(xì)胞中的基因轉(zhuǎn)錄的方法,所述方法包括通過使賴氨酸特異性脫甲基酶1酶暴露于式(I)的化合物來抑制賴氨酸特異性脫甲基酶1的活性。一個(gè)實(shí)施方案提供調(diào)節(jié)細(xì)胞中的基因轉(zhuǎn)錄的方法,所述方法包括通過使賴氨酸特異性脫甲基酶1酶暴露于式(Ia)的化合物來抑制賴氨酸特異性脫甲基酶1的活性。一個(gè)實(shí)施方案提供調(diào)節(jié)細(xì)胞中的基因轉(zhuǎn)錄的方法,所述方法包括通過使賴氨酸特異性脫甲基酶1酶暴露于式(Ib)的化合物來抑制賴氨酸特異性脫甲基酶1的活性。
治療方法
本文公開通?;蛳鄬τ谝粋€(gè)或更多個(gè)特異性靶基因調(diào)節(jié)細(xì)胞中或受試者中脫甲基化的方法。調(diào)節(jié)脫甲基化以控制多種細(xì)胞功能,包括不限于:分化;增殖;凋亡;腫瘤發(fā)生、白血病發(fā)生或其他致瘤轉(zhuǎn)化事件;脫發(fā);或性別區(qū)分。
一個(gè)實(shí)施方案提供治療需要其的患者中的癌癥的方法,所述方法包括向患者施用式(I)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽。一個(gè)實(shí)施方案提供治療需要其的患者中的癌癥的方法,所述方法包括向患者施用式(Ia)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽。一個(gè)實(shí)施方案提供治療需要其的患者中的癌癥的方法,所述方法包括向患者施用式(Ib)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽。
在另外的實(shí)施方案中的是用于治療受試者中的癌癥的方法,其中癌癥選自前列腺癌、乳腺癌、膀胱癌、肺癌或黑色素瘤。在另外的實(shí)施方案中的是用于治療受試者中的癌癥的方法,其中癌癥選自急性髓細(xì)胞樣白血病(AML)、急性淋巴細(xì)胞白血病(ALL)、小細(xì)胞肺癌(SCLC)、非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)、成神經(jīng)細(xì)胞瘤、小圓藍(lán)細(xì)胞瘤、或成膠質(zhì)細(xì)胞瘤。
鑒于本公開內(nèi)容,其他實(shí)施方案和用途對本領(lǐng)域技術(shù)人員將是明顯的。以下實(shí)施例僅作為各個(gè)實(shí)施方案的說明而提供,并且將不被解釋為以任何方式限制本發(fā)明。
實(shí)施例
I.化學(xué)合成
除非另外注明,否則使用如從商業(yè)供應(yīng)商接收的試劑和溶劑。使用無水溶劑和烘箱干燥的玻璃器皿,用于對水分和/或氧氣敏感的合成轉(zhuǎn)化。不優(yōu)化收率。反應(yīng)時(shí)間是近似的并且不被優(yōu)化。除非另外注明,否則在硅膠上進(jìn)行柱色譜法和薄層色譜法(TLC)。以ppm(δ)給出光譜并且以赫茲報(bào)告偶合常數(shù),J。對于質(zhì)子光譜,使用溶劑峰作為參考峰。
制備1A:2,5,6-三氯嘧啶-4-醇
向2,4,5,6-四氯嘧啶(5g,22.9mmol)在THF(50mL)中的溶液逐滴地添加1N NaOH(31mL,31.2mmol),并且將混合物在RT下攪拌過夜。將溶液用1N HCl酸化并且用DCM(3x)萃取。將有機(jī)物合并,干燥,并且在真空中濃縮。將固體在Et2O中在RT下成漿料持續(xù)30min,過濾,用Et2O洗滌,并且干燥以給出3.0g(66%)的標(biāo)題化合物。對于C4HCl3N2O的[M+H]計(jì)算為201;實(shí)測為201。
制備1B:2,5,6-三氯-3-甲基-3-氫嘧啶-4-酮
向2,5,6-三氯嘧啶-4-醇(1g,5.0mmol)和K2CO3(759mg,5.5mmol)在THF(50mL)中的混合物在0℃下逐滴地添加碘甲烷(714mg,5.0mmol),并且將反應(yīng)在RT下攪拌過夜。將反應(yīng)混合物用乙酸乙酯(EA)稀釋。將有機(jī)相用鹽水洗滌,干燥并且在真空中濃縮。將殘余物通過硅膠色譜法(10:1,PE:EA)純化以給出760mg(71%)的標(biāo)題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ3.74(s,3H)。對于C5H3Cl3N2O的[M+H]計(jì)算為213;實(shí)測為213。
制備1C:N-[1-(5,6-二氯-3-甲基-4-氧代(3-氫嘧啶-2-基))(4-哌啶基)](叔丁氧基)甲酰胺
將2,5,6-三氯-3-甲基-3-氫嘧啶-4-酮(426mg,2.0mmol)、DIEA(536mg,4.0mmol)和哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(400mg,2mmol)在DMF(10mL)中的溶液在120℃下加熱持續(xù)1h。將溶劑在真空中除去并且將殘余物通過硅膠色譜法(1:1,PE:EA)純化以給出550mg(73%)的標(biāo)題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ1.45(s,9H),1.50-1.58(m,2H),2.06-2.10(m,2H),2.98-3.05(m,2H),3.48(s,3H),3.53-3.56(m,2H),3.70(s,1H),4.52(s,1H)。對于C15H22Cl2N4O3的[M+H]計(jì)算為213;實(shí)測為213。
制備1D:1-(5-氯-4-(4-氰基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯
將N-[1-(5,6-二氯-3-甲基-4-氧代(3-氫嘧啶-2-基))(4-哌啶基)](叔丁氧基)甲酰胺(500mg,1.3mmol)、4-氰基苯基硼酸(195mg,1.3mmol)、[1,1′-雙(二叔丁基膦基)二茂鐵]二氯化鈀(II)(81mg,0.13mmol)和K2CO3(359mg,2.6mmol)在DMF(10mL)中的混合物用氮?dú)鉀_洗并且在85℃下攪拌持續(xù)2h。添加水,并且將混合物用EA(3x)萃取。將有機(jī)物合并,用水洗滌,用鹽水洗滌,干燥并且在真空中濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:1,EA:PE)純化以給出250mg(40%)的標(biāo)題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ1.45(s,9H),1.54-1.61(m,2H),2.05-2.10(m,2H),2.99-3.05(m,2H),3.48-3.56(s,5H),3.70(s,1H),4.56(s,1H),7.73(d,J=8.0Hz,2H),7.93(d,J=8.0Hz,2H)。對于C22H26ClN5O3的[M+H]計(jì)算為444;實(shí)測為444。
制備1E:1-(4-(4-氰基苯基)-1-甲基-6-氧代-5-對甲苯基-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯
將1-(5-氯-4-(4-氰基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.45mmol)、對甲苯基硼酸(123mg,0.90mmol)、[1,1′-雙(二叔丁基膦基)二茂鐵]二氯化鈀(II)(28mg,0.045mol)和K2CO3(124mg,0.90mmol)在DMF(10mL)中的混合物用氮?dú)鉀_洗并且在85℃下攪拌持續(xù)2h。添加水,并且將混合物用EA(3x)萃取。將有機(jī)物合并,用水洗滌,用鹽水洗滌,干燥并且在真空中濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:1,EA:PE)純化以給出50mg(22%)的標(biāo)題化合物。對于C29H33N5O3的[M+H]計(jì)算為500;實(shí)測為500。
實(shí)施例1:4-(2-(4-氨基哌啶-1-基)-1-甲基-6-氧代-5-對甲苯基-1,6-二氫嘧啶-4-基)苯甲腈HCl鹽
向1-(4-(4-氰基苯基)-1-甲基-6-氧代-5-對甲苯基-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.1mmol)在EA(10mL)中的溶液添加在EA(5mL)中的4N HCl溶液并且將混合物在RT下攪拌持續(xù)2h。將溶劑在真空中濃縮,并且將殘余物通過制備型HPLC純化以給出作為鹽酸鹽的20mg(46%)的標(biāo)題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ1.74-1.79(m,2H),2.00-2.04(m,2H),2.21(s,3H),2.96-3.03(m,2H),3.29-3.03(m,1H),3.48(s,3H),3.71-3.74(m,2H),6.89(d,J=8.0Hz,2H),6.99(d,J=8.0Hz,2H),7.38(d,J=8.0Hz,2H),7.44(d,J=8.4Hz,2H)。對于C24H25N5O的[M+H]計(jì)算為400;實(shí)測為400。
實(shí)施例2:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以5%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.74-1.78(m,2H),2.00-2.03(m,2H),2.98-3.02(m,2H),3.26-3.00(m,1H),3.48(s,3H),3.69(s,3H),3.70-3.73(m,2H),6.72(d,J=8.8Hz,2H),6.93(d,J=8.4Hz,2H),7.39(d,J=8.0Hz,2H),7.46(d,J=8.0Hz,2H)。對于C24H25N5O2的[M+H]計(jì)算為416;實(shí)測為416。
實(shí)施例3:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(6-甲氧基吡啶-3-基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以11%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.87-1.95(m,2H),2.14-2.17(m,2H),3.15-3.24(m,2H),3.43-3.48(m,1H),3.62(s,3H),3.93-3.98(m,2H),4.23(s,3H),7.46(d,J=9.2Hz,1H),7.63(d,J=8.0Hz,2H),7.71(d,J=8.4Hz,2H),8.12(dd,J=8.8,1.6Hz,1H),8.28(d,J=2.0Hz,1H)。對于C23H24N6O2的[M+H]計(jì)算為417;實(shí)測為417。
實(shí)施例4:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-1-甲基-5-(6-甲基吡啶-3-基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以4%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.79-1.80(m,2H),2.03-2.05(m,2H),2.66(s,3H),3.04-3.09(m,2H),3.30-3.34(m,1H),3.50(s,3H),3.83-3.88(m,2H),7.48(d,J=8.4Hz,2H),7.58(d,J=8.4Hz,2H),7.64(d,J=8.4Hz,1H),8.00(dd,J=8.4,2.0Hz,1H),8.54(d,J=8.0Hz,1H)。對于C23H24N6O的[M+H]計(jì)算為401;實(shí)測為401。
實(shí)施例5:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以7%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ1.89-1.95(m,2H),2.15-2.18(m,2H),3.14-3.18(m,2H),3.44-3.46(m,1H),3.60(s,3H),3.88-3.90(m,5H),6.79(d,J=8.4Hz,1H),6.96-7.02(m,2H),7.54(d,J=8.0Hz,2H),7.64(d,J=8.0Hz,2H)。對于C24H24FN5O2的[M+H]計(jì)算為434;實(shí)測為434。
實(shí)施例6:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以5%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.83-1.89(m,2H),2.10-2.13(m,2H),3.05-3.11(m,2H),3.35-3.38(m,1H),3.55(s,3H),3.76(s,3H),3.77-3.82(m,2H),6.84(d,J=8.8Hz,2H),7.04(d,J=8.8Hz,2H),7.21(d,J=8.0Hz,1H),7.35(d,J=8.0Hz,1H),7.53-7.56(m,1H)。對于C24H24FN5O2的[M+H]計(jì)算為434;實(shí)測為434。
制備7A:1-(5-氯-4-(3-氟-4-氰基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯
將N-[1-(5,6-二氯-3-甲基-4-氧代(3-氫嘧啶-2-基))(4-哌啶基)](叔丁氧基)甲酰胺(150g,0.40mol)、3-氟-4-氰基苯基硼酸(65.8g,0.40mol)、Pd(Ph3P)4(9.3g,8mmol)和0.4N Na2CO3(2L,0.80mol)在ACN(4L)中的混合物用氮?dú)鉀_洗并且在85℃下攪拌持續(xù)2h。添加水,并且將混合物用EA(3x)萃取。將有機(jī)物合并,用水洗滌,用鹽水洗滌,干燥并且在真空中濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:1,EA:PE)純化以給出95g(57%)的標(biāo)題化合物。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ1.45(s,9H),1.54-1.61(m,2H),2.05-2.13(m,2H),2.99-3.08(m,2H),3.53-3.58(s,5H),3.70(s,1H),4.54(d,J=6.0Hz,1H),7.68-7.80(m,3H)。
制備7B:N-[1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(3-氟-4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-氧代嘧啶-2-基]哌啶-4-基]氨基甲酸叔丁酯
將(叔丁氧基)-N-{1-[5-氯-6-(4-氰基-3-氟苯基)-3-甲基-4-氧代(3-氫嘧啶-2-基)](4-哌啶基)}甲酰胺(1g,2.169mmol)、3-氟-4-甲氧基苯硼酸(740mg,4.338mmol)、Pd(dppf)Cl2(480mg,0.651mmol)和Na2CO3(690mg,6.51mmol)在二氧六環(huán):H2O(3:1,15mL)中的混合物用氮?dú)鉀_洗,加蓋并且在145℃下在微波中攪拌持續(xù)2h。將反應(yīng)混合物濃縮并且將殘余物通過FC(1:1,EA:PE)純化以給出800mg(71%)的標(biāo)題化合物。對于C29H31FN2O4的[M+H]計(jì)算為552;實(shí)測為552。1H NMR(400MHz,CDCl3):δppm 1.46(s,9H),1.60(d,J=10.11Hz,2H),2.11(d,J=11.62Hz,2H),3.06(t,J=12.00Hz,2H),3.54(s,3H),3.60(d,J=13.64Hz,2H),3.72(br.s.,1H),3.88(s,3H),4.52(br.s.,1H),6.79-6.89(m,2H),6.97(d,J=12.38Hz,1H),7.13(d,J=8.34Hz,1H),7.31(d,J=9.85Hz,1H),7.42(br.s.,1H)。
實(shí)施例7:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(3-氟-4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
向N-[1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(3-氟-4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-氧代嘧啶-2-基]哌啶-4-基]氨基甲酸叔丁酯(5.2g,9.44mmol)在EA(20mL)中的溶液添加在EA(30mL)中的1N HCl。將混合物在RT下攪拌持續(xù)2h。將溶劑在真空中濃縮以給出作為HCl鹽的標(biāo)題產(chǎn)物(4.05g,88%)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.77-1.79(m,2H),2.02-2.04(m,2H),2.99-3.04(m,2H),3.26-3.00(m,1H),3.38(s,3H),3.73(s,3H),3.73-3.75(m,2H),6.67-6.68(m,1H),6.84-6.95(m,2H),7.12-7.14(m,1H),7.24-7.36(m,1H),7.46-7.50(m,1H)。對于C24H23F2N5O2的[M+H]計(jì)算為452;實(shí)測為452。
實(shí)施例8:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(6-甲氧基吡啶-3-基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以6%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.79-1.83(m,2H),2.02-2.06(m,2H),3.04-3.11(m,2H),3.21-3.22(m,1H),3.49(s,3H),3.81-3.85(m,2H),4.12(s,3H),7.22-7.24(m,1H),7.38(d,J=9.2Hz,1H),7.49(d,J=9.2Hz,1H),7.57-7.61(m,1H),8.04-8.07(m,1H),8.21(s,1H)。對于C23H23FN6O2的[M+H]計(jì)算為435;實(shí)測為435。
實(shí)施例9:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(6-甲氧基吡啶-3-基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以8%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.92-1.96(m,2H),2.16-2.19(m,2H),2.80(s,3H),3.19-3.25(m,2H),3.45-3.49(m,1H),3.62(s,3H),3.96-3.99(m,2H),7.34(d,J=8.0Hz,1H),7.60(d,J=7.2Hz,1H),7.71(t,J=7.6Hz,1H),7.80(d,J=8.4Hz,1H),8.18(d,J=8.4Hz,1H),8.71(s,1H)。對于C23H23FN6O的[M+H]計(jì)算為419;實(shí)測為419。
實(shí)施例10:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(6-乙基吡啶-3-基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以7%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.30(t,J=4.0Hz,3H),1.83-1.88(m,2H),2.06-2.09(m,2H),2.96-2.99(m,2H),3.09-3.16(m,2H),3.26-3.31(m,1H),3.51(s,3H),3.86-3.89(m,2H),7.35(d,J=8.0Hz,2H),7.61(d,J=8.0Hz,2H),7.71(d,J=8.4Hz,1H),8.08(d,J=8.4Hz,1H),8.57(s,1H)。對于C24H26N6O的[M+H]計(jì)算為415;實(shí)測為415。
實(shí)施例11:2-氟-4-[5-(4-甲氧基苯基)-1-甲基-2-(4-甲基氨基哌啶-1-基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以7%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.80-1.90(m,2H),2.19-2.23(m,2H),2.75(s,3H),3.06-3.12(m,2H),3.32-3.36(m,1H),3.56(s,3H),3.76(s,3H),3.84-3.87(m,2H),6.84(d,J=8.4Hz,2H),7.04(d,J=8.4Hz,2H),7.22(d,J=8.0Hz,1H),7.36(d,J=10.8Hz,1H),8.54-7.58(m,1H)。對于C25H26FN5O2的[M+H]計(jì)算為448;實(shí)測為448。
實(shí)施例12:2-氟-4-[5-(3-氟-4-甲氧基苯基)-1-甲基-2-(4-甲基氨基哌啶-1-基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以7%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.78-1.88(m,2H),2.17-2.20(m,2H),2.73(s,3H),3.05-3.11(m,2H),3.30-3.35(m,1H),3.54(s,3H),3.82(s,3H),3.83-3.86(m,2H),6.76(d,J=8.4Hz,1H),6.93-6.99(m,2H),7.20(d,J=8.4Hz,1H),7.38(d,J=10.4Hz,1H),8.55-7.589(m,1H)。對于C25H25F2N5O2的[M+H]計(jì)算為466;實(shí)測為466。
制備13A:2,6-二氯-3-乙基-3H-嘧啶-4-酮
將2,6-二氯嘧啶-4-醇(1.0g,6.1mmol)和K2CO3(1.1g,7.9mmol)在DMF(10mL)中的溶液在RT下攪拌持續(xù)15min。將反應(yīng)混合物冷卻至0℃,并且逐滴地添加碘乙烷(1.1mL,6.7mmol)。在RT下攪拌過夜之后,將反應(yīng)混合物用EA稀釋,用鹽水洗滌,干燥(Na2SO4)并且在真空中濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法(20:1,EA:PE)純化以給出330mg(28%)的標(biāo)題化合物。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ1.37(t,J=7.6Hz,3H),4.76(q,J=6.8Hz,2H),6.67(s,1H)。對于C6H6Cl2N2O的[M+H]計(jì)算為193,195,197;實(shí)測為193,195,197。
制備13B:[1-(4-氯-1-乙基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基)-哌啶-4-基]氨基甲酸叔丁酯
將2,6-二氯-3-乙基-3H-嘧啶-4-酮(320mg,1.64mmol)、DIEA(423mg,3.28mmol)和(叔丁氧基)-N-(4-哌啶基)甲酰胺(328mg,1.64mmol)在DMF(10mL)中的溶液加熱至120℃持續(xù)1h。將溶劑在真空中濃縮并且將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:5,EA:PE)純化以給出作為黃色固體的210mg(36%)的標(biāo)題化合物。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ1.25-1.32(m 2H),1.35(t,J=7.2Hz,3H),1.96-2.02(m,2H),2.98-3.06(m,2H),3.70(br,1H),4.30(q,J=5.2Hz,2H),4.44(br,1H),4.57-4.61(m,2H),5.95(s,1H)。對于C16H25ClN4O3的[M+H]計(jì)算為357,359;實(shí)測為357,359。
制備13C:{1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-乙基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
將在CH3CN(10mL)中的[1-(4-氯-1-乙基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基)-哌啶-4-基]氨基甲酸叔丁酯(210mg,0.59mmol)、3-氟-4-氰基苯基硼酸(126mg,0.77mmol)、Pd(PPh)4(14mg,0.012mmol)和0.4M Na2CO3(4.5mL,1.77mmol)的混合物在90℃下在N2氣氛下攪拌過夜。將有機(jī)物在真空中濃縮,并且水相用DCM(2x)萃取。將合并的有機(jī)物用鹽水洗滌,干燥(Na2SO4)并且濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:2,EA:PE)純化以給出作為黃色固體的185mg(64%)的標(biāo)題化合物。對于C23H28FN5O3的[M+H]計(jì)算為442;實(shí)測為442。
實(shí)施例13:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-1-乙基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
向{1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-乙基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(180mg,0.41mmol)在EA(5mL)中的混合物添加HCl在EA(3mL)中的4M溶液。將反應(yīng)混合物攪拌持續(xù)30min。將溶劑在真空中蒸發(fā)以給出作為黃色固體(HCl鹽)的150mg的標(biāo)題化合物(97%)。1HNMR(400MHz,CD3OD):δ1.28(t,J=7.2Hz,1H),1.48-1.52(m,2H),1.99-2.02(m,2H),2.94-3.01(m,2H),3.33-3.38(m,1H),6.81(q,J=6.8Hz,2H),4.85-4.88(m,2H),6.95(s,1H),7.73(t,J=8.0Hz,1H),7.90-7.95(m,2H)。對于C18H20FN5O的[M+H]計(jì)算為342;實(shí)測為342。
制備14A:{1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-環(huán)戊基乙炔基-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
將1-(5-氯-4-(3-氟-4-氰基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基)哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.43mmol)、乙炔基環(huán)戊烷(82mg,0.87mmol)、Pd(MeCN)2Cl2(4.5mg,0.017mmol)、X-Phos(10mg,0.022mmol)和K2CO3(120mg,0.87mmol)在ACN(15mL)中的混合物在95℃下在密封管中攪拌過夜。將反應(yīng)混合物冷卻至RT并且將溶劑在真空中濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:2,PE:EA)純化以給出100mg(45%)的標(biāo)題化合物。對于C29H34FN5O3的[M+H]計(jì)算為519;實(shí)測為519。
實(shí)施例14:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-環(huán)戊基乙炔基-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
根據(jù)用于制備實(shí)施例1的一般程序,標(biāo)題化合物以70%總收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CDCl3):δ1.50-1.74(m,8H),1.94-1.99(m,4H),2.88-3.01(m,4H),3.51(s,3H),3.60(d,J=13.2Hz,2H),7.63-7.67(m,1H),8.07-8.11(m,2H)。對于C24H26FN5O的[M+H]計(jì)算為419;實(shí)測為419。
制備15A:(2,4,5-三氯-6-氧代-6H-嘧啶-1-基)-乙酸甲酯
向2,5,6-三氯-3H-嘧啶-4-酮(20.0g,0.1mol)在DMF(150mL)中的溶液在0℃下分批地添加NaH(60%在礦物油中,6.0g,0.12mol)并且將混合物攪拌持續(xù)30min。然后添加溴乙酸甲酯(18.3g,0.12mol),并且將反應(yīng)混合物在RT下攪拌過夜。將溶液用水(800mL)稀釋并且用EA(200mL,3x)萃取。將合并的有機(jī)物用水(800mL,3x)洗滌,用鹽水(500mL)洗滌,干燥(Na2SO4)并且濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:50,EA:PE)純化以給出6.0g的標(biāo)題產(chǎn)物(22%)。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ3.80(s,3H),5.04(s,2H)。對于C7H5Cl3N2O3的[M+H]計(jì)算為271;實(shí)測為271。
制備15B:[2-(4-叔丁氧羰基氨基-哌啶-1-基)-4,5-二氯-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酸甲酯
向(2,4,5-三氯-6-氧代-6H-嘧啶-1-基)乙酸甲酯(6.0g,22.4mmol)和哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(4.9g,24.4mmol)在DMF(50mL)中的溶液在RT下逐滴地添加DIPEA(5.7g,44.3mmol),并且將混合物攪拌過夜。將反應(yīng)混合物用水(500mL)稀釋,并且將固體通過過濾收集。然后將固體溶解在DCM(100mL)中,用水(100mL,3x)洗滌,用鹽水(100mL)洗滌,干燥(Na2SO4)并且濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:2至1:1,DCM:PE)純化以給出6.3g的標(biāo)題產(chǎn)物(64%)。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ1.22-1.34(m,2H),1.45(s,9H),1.97-2.03(m,2H),2.96-3.09(m,2H),3.68-3.69(m,1H),3.75(s,3H),4.42-4.44(m,3H),4.84(s,2H)。對于C17H24Cl2N4O5的[M+H]計(jì)算為435;實(shí)測為435。
制備15C:[2-(4-叔丁氧羰基氨基-哌啶-1-基)-5-氯-4-(4-氰基-3-氟苯基)-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酸甲酯
將[2-(4-叔丁氧羰基氨基-哌啶-1-基)-4,5-二氯-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酸甲酯(5.76g,13.2mmol)、4-氰基-3-氟苯硼酸(2.24g,16.1mmol)、Pd(PPh3)4(306mmol,0.26mmol)和Na2CO3(2.8g,26.5mmol)在DMF:H2O(50mL:10mL)中的混合物在65℃下在氮?dú)鈿夥障聰嚢柽^夜。將反應(yīng)混合物濃縮,并且將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:20至1:0,EA:PE)純化以給出2.4g的標(biāo)題產(chǎn)物(43%)。1HNMR(400MHz,CDCl3):δ1.27-1.37(m,2H),1.45(s,9H),1.99-2.02(m,2H),2.99-3.06(m,2H),3.68-3.76(m,1H),3.78(s,3H),4.42-4.52(m,3H),4.90(s,2H),7.63-7.66(m,1H),7.67-7.71(m,2H)。對于C24H27ClFN5O5的[M+H]計(jì)算為520;實(shí)測為520。
制備15D:[2-(4-叔丁氧羰基氨基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酸甲酯
將[2-(4-叔丁氧羰基氨基-哌啶-1-基)-5-氯-4-(4-氰基-3-氟苯基)-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酸甲酯(2.2g,4.2mmol)、對甲氧基硼酸(1.9g,12.7mmol)、Pd-118(274mg,0.42mmol)和K2CO3(1.2g,8.4mmol)在DMF(50mL)中的溶液在145℃下在氮?dú)鈿夥障聰嚢璩掷m(xù)6h。將反應(yīng)混合物用水稀釋并且用EA(3x)萃取。將合并的有機(jī)物用水洗滌,用鹽水洗滌,干燥(Na2SO4)并且濃縮。將殘余物通過制備型HPLC純化以給出600mg的標(biāo)題產(chǎn)物(24%)。對于C31H34FN5O6的[M+H]計(jì)算為592;實(shí)測為592。
制備15E:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-1-環(huán)丙基甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
向[2-(4-叔丁氧羰基氨基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酸甲酯(600mg,1.02mmol)在MeOH(10mL)中的溶液添加2N NaOH溶液(5mL)。反應(yīng)完成之后,將溶液用1N HCl酸化并且用EA(3x)萃取。將合并的有機(jī)物用鹽水洗滌,干燥(Na2SO4)并且濃縮。將殘余物通過制備型HPLC純化以給出作為黃色固體的240mg的標(biāo)題產(chǎn)物(41%)。對于C30H32FN5O6的[M+H]計(jì)算為578;實(shí)測為578。
實(shí)施例15:[2-(4-氨基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酸
向[2-(4-叔丁氧羰基氨基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酸(100mg,0.15mmol)在EA(10mL)中的溶液添加在EA中的5N HCl溶液(5mL)。將反應(yīng)混合物在RT下攪拌持續(xù)2h,并且將溶劑在真空中濃縮。將殘余物通過制備型HPLC純化以給出作為HCl鹽的25mg的標(biāo)題產(chǎn)物(32%)。1HNMR(400MHz,CD3OD):δ1.53-1.56(m,2H),2.00-2.03(m,2H),3.00-3.07(m,2H),3.35-3.39(m,1H),3.67(s,3H),4.70(s,2H),4.76-4.77(m,2H),6.74(d,J=8.4Hz,2H),6.96(d,J=8.8Hz,2H),7.17(d,J=8.4Hz,1H),7.26(d,J=10.0Hz,1H),7.50(dd,J=7.2,8.0Hz,1H)。對于C25H24FN5O4的[M+H]計(jì)算為478;實(shí)測為478。
制備16A:{1-[1-氨基甲?;谆?4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
向[2-(4-叔丁氧羰基氨基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酸(120mg,0.2mmol)在DMF(5mL)中的溶液添加NH4Cl(17mg,0.3mmol)、HATU(95mg,0.25mmol)和DIEA(25mg,0.4mmol))。反應(yīng)完成之后,將溶液用H2O稀釋并且用DCM萃取(3x)。將合并的有機(jī)物干燥(Na2SO4)并且濃縮。將殘余物通過制備型HPLC純化以給出作為黃色固體的50mg的標(biāo)題產(chǎn)物(43%)。對于C30H33FN6O5的[M+H]計(jì)算為577;實(shí)測為577。
實(shí)施例16:2-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-6H-嘧啶-1-基]乙酰胺
根據(jù)用于制備實(shí)施例15的程序,標(biāo)題化合物以96%收率被制備為鹽酸鹽。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.49-1.53(m,2H),1.98-2.01(m,2H),2.97-3.04(m,2H),3.33-3.36(m,1H),3.68(s,3H),4.69(s,2H),4.75-4.78(m,2H),6.75(d,J=8.4Hz,2H),6.99(d,J=8.8Hz,2H),7.16(dd,J=1.2,8.0Hz,1H),7.25(dd,J=0.8,10.4Hz,1H),7.49(dd,J=7.2,8.0Hz,1H)。對于C25H25FN6O3的[M+H]計(jì)算為477;實(shí)測為477。
制備17A:2,6-二氯-3-(3-甲氧基丙基)-3H-嘧啶-4-酮
向2,6-二氯-3H-嘧啶-4-酮(600mg,3.65mmol)在DMF(10mL)中的溶液添加K2CO3(1.0g,7.3mmol)并且將混合物在RT下攪拌持續(xù)10min。然后在0℃下逐滴地添加1-溴-3-甲氧基丙烷(101mg,7.3mmol),并且將混合物在RT下攪拌過夜。將DMF在真空中濃縮,并且將殘余物通過二氧化硅色譜法純化以給出400mg的標(biāo)題化合物(47%)。對于C8H10Cl2N2O2的[M+H]計(jì)算為237;實(shí)測為237。
制備17B:{1-[4-氯-1-(3-甲氧基丙基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
將2,6-二氯-3-(3-甲氧基丙基)-3H-嘧啶-4-酮(400mg,1.68mmol)、哌啶-4-基氨基甲酸叔丁酯(405mg,2mmol)和DIEA(260mg,2.0mmol)在DMF(20mL)中的溶液在85℃下攪拌持續(xù)2h。將溶劑濃縮,并且將殘余物通過二氧化硅色譜法純化以給出500mg的標(biāo)題化合物(75%)。對于C18H29ClN4O4的[M+H]計(jì)算為400;實(shí)測為400。
制備17C:{1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-(3-甲氧基丙基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
將{1-[4-氯-1-(3-羥基丙基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.5mmol)、4-氰基-3-氟苯基硼酸(107mg,0.65mmol)、Pd(PPh3)4(12mg,0.01mmol)和在ACN中的0.4M Na2CO3溶液(4mL)的混合物在85℃下攪拌過夜。將反應(yīng)混合物用水稀釋并且用EA(3x)萃取。將反應(yīng)混合物在RT下攪拌持續(xù)2h并且將溶劑在真空中濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法純化以給出240mg的標(biāo)題產(chǎn)物(99%)。對于C25H32FN5O4的[M+H]計(jì)算為485;實(shí)測為485。
實(shí)施例17:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-1-(3-羥基丙基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
向{1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-(3-甲氧基丙基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.41mmol)在DCM中的溶液在-78℃下添加1M BBr3(4mL)。將混合物在RT下攪拌持續(xù)2h并且在0℃下用MeOH猝滅。將溶液用含水飽和的NaHCO3洗滌。將有機(jī)層干燥并且濃縮。將殘余物通過制備型HPLC純化以給出作為鹽酸鹽的35mg的標(biāo)題產(chǎn)物(23%)。1H NMR(400MHz,CD3OD):1.65-1.69(m,2H),1.97-2.19(m,4H),3.13-3.22(m,2H),3.48-3.55(m,1H),3.73(t,J=8.0Hz,2H),4.55(t,J=8.0Hz,2H),4.94-4.95(m,2H),6.71(s,1H),7.88-8.05(m,3H)。對于C19H22FN5O2的[M+H]計(jì)算為371;實(shí)測為371。
制備18A:{1-[5-苯并呋喃-5-基-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
將{1-[5-氯-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.45mmol)、苯并呋喃-5-硼酸(120mg,0.68mmol)、Pd(PPh3)4(26mg,0.05mmol)和2M Na2CO3(0.9mL)在1,4-二氧六環(huán)(200mL)中的混合物在N2氣氛下回流過夜。將反應(yīng)混合物用水稀釋并且用EA(3x)萃取。將合并的有機(jī)物用鹽水洗滌,干燥(Na2SO4)并且濃縮。將殘余物通過二氧化硅色譜法純化以給出100mg的標(biāo)題產(chǎn)物(42%)。對于C30H30FN5O4的[M+H]計(jì)算為543;實(shí)測為543。
實(shí)施例18:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-苯并呋喃-5-基-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
向制備18A(60mg,0.11mmol)在EA(20mL)中的溶液添加在EA(10mL)中的4M HCl溶液。將混合物在RT下攪拌持續(xù)2h。將溶劑在真空中濃縮以給出作為鹽酸鹽的43mg的標(biāo)題產(chǎn)物(53%)。1H NMR(400MHz,CD3OD):1.85-1.92(m,2H),2.13-2.18(m,2H),3.10(t,J=4.0Hz,2H),3.31-3.33(m,1H),3.61(s,3H),3.87(d,J=13.2Hz,2H),6.65-7.21(m,3H),7.38-7.76(m,4H),7.76(s,1H)。對于C25H22FN5O2的[M+H]計(jì)算為443;實(shí)測為443。
制備19A:{1-[5-氰基-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
將{1-[5-氯-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(460mg,1mmol)、Zn(CN)2(175mg,1.5mmol)和Pd(PPh3)4(116mg,0.0.1mmol)在DMF(5mL)中的混合物在150℃下在N2氣氛下攪拌持續(xù)4h。將反應(yīng)混合物冷卻至RT并且過濾。將濾液在真空中濃縮,并且將殘余物通過制備型HPLC純化以給出作為黃色固體的150mg的標(biāo)題產(chǎn)物(33%)。對于C23H25FN6O3的[M+H]計(jì)算為453;實(shí)測為453。
實(shí)施例19:2-(4-氨基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-5-甲腈
向{1-[5-氰基-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(150mg,0.33mmol)在EA(5mL)中的溶液添加在EA(5mL)中的5N HCl溶液。將反應(yīng)混合物在RT下攪拌持續(xù)2h,并且將溶劑在真空中濃縮以給出作為HCl鹽的120mg的標(biāo)題產(chǎn)物(94%)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.67-1.72(m,2H),2.02-2.06(m,2H),3.13-3.16(m,2H),3.34-3.38(m,1H),3.42(s,3H),3.98-4.02(m,2H),7.82-7.90(m,3H)。對于C18H17FN6O的[M+H]計(jì)算為353;實(shí)測為353。
實(shí)施例20:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-氯-1-甲基-6-氧代嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
向{1-[5-氯-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(150mg,0.33mmol)在EA(5mL)中的溶液添加在EA(5mL)中的5N HCl溶液。將反應(yīng)混合物在RT下攪拌持續(xù)2h,并且將溶劑在真空中濃縮以給出作為HCl鹽的120mg的標(biāo)題產(chǎn)物(94%)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.67-1.72(m,2H),2.02-2.06(m,2H),3.13-3.16(m,2H),3.34-3.38(m,1H),3.42(s,3H),3.98-4.02(m,2H),7.82-7.90(m,3H)。對于C18H17FN6O的[M+H]計(jì)算為353;實(shí)測為353。1H NMR(400MHz,甲醇-d4):δppm 1.73-1.91(m,2H),2.18(d,J=12.13Hz,2H),3.06(t,J=12.76Hz,2H),3.33-3.40(m,1H),3.57(s,3H),3.83(d,J=13.14Hz,2H),7.75-7.93(m,3H)。
制備120A:[1-(5-氯-4-氰基-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基)-哌啶-4-基]氨基甲酸叔丁酯
將N-[1-(5,6-二氯-3-甲基-4-氧代(3-氫嘧啶-2-基))(4-哌啶基)](叔丁氧基)甲酰胺(2.4g,6.38mmol)、Zn(CN)2(388mg,3.32mmol)和Pd(PPh3)4(740mg,0.05mmol)在DMF(20mL)中的混合物在130℃下在N2氣氛下攪拌持續(xù)5h。將反應(yīng)混合物冷卻至RT并且過濾。將濾液在真空中濃縮,并且將殘余物通過制備型HPLC純化以給出200mg的標(biāo)題產(chǎn)物(9%)。對于C16H22ClN5O3的[M+H]計(jì)算為368;實(shí)測為368。
制備120B:{1-[4-氰基-5-(3-氟-4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
將[1-(5-氯-4-氰基-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基)-哌啶-4-基]氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.54mmol)、3-氟-4-甲氧基苯硼酸(278mg,1.63mmol)、Pd(dppf)2Cl2(119mg,0.16mmol)、以及Na2CO3(173mg,1.63mmol)在二氧六環(huán)(5mL)和H2O(1mL)中的混合物用N2脫氣并且在145℃下在微波中攪拌持續(xù)2h。將反應(yīng)混合物冷卻至RT并且過濾。將濾液在真空中濃縮,并且將殘余物通過制備型HPLC純化以給出110mg的期望的產(chǎn)物(45%)。對于C23H28FN5O4的[M+H]計(jì)算為458;實(shí)測為458。
實(shí)施例120:2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(3-氟-4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-甲腈
向{1-[4-氰基-5-(3-氟-4-甲氧基苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(100mg,0.23mmol)在EA(5mL)中的混合物添加在EA(5mL)中的5N HCl溶液,在RT下攪拌持續(xù)2h。將溶劑在真空中濃縮以給出作為HCl鹽的85mg的標(biāo)題產(chǎn)物(93%)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.71-1.75(m,2H),1.89-2.03(m,2H),2.96-3.02(m,2H),3.27-3.31(m,1H),3.42(s,3H),3.69-3.73(m,2H),3.83(s,3H),7.06(t,J=8.0Hz,1H),7.17-2.01(m,2H)。對于C18H20FN5O2的[M+H]計(jì)算為358;實(shí)測為358。
制備121A:{1-[5-氰基-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
將{1-[5-氯-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(460mg,1mmol)、Zn(CN)2(175mg,1.5mmol)和Pd(PPh3)4(116mg,0.05mmol)在DMF(5mL)中的混合物在150℃下在N2氣氛下攪拌4h。將混合物冷卻至RT并且過濾。將濾液在真空中濃縮,并且將殘余物通過制備型HPLC純化以給出作為黃色固體的150mg的標(biāo)題產(chǎn)物(33%)。對于C23H25FN6O3的[M+H]計(jì)算為453;實(shí)測為453。
實(shí)施例121:2-(4-氨基哌啶-1-基)-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-5-甲腈
向{1-[5-氰基-4-(4-氰基-3-氟苯基)-1-甲基-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(150mg,0.33mmol)在EA(5mL)中的混合物添加在EA(5mL)中的5N HCl溶液,并且將混合物在RT下攪拌持續(xù)2h。將溶劑在真空中濃縮以給出作為HCl鹽的120mg標(biāo)題產(chǎn)物(94%)。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.67-1.72(m,2H),2.02-2.06(m,2H),3.13-3.16(m,2H),3.34-3.38(m,1H),3.42(s,3H),3.98-4.02(m,2H),7.82-7.90(m,3H)。對于C18H17FN6O的[M+H]計(jì)算為353;實(shí)測為353。
制備122A:4-氰基-3-氟苯甲酰氯
將4-氰基-3-氟苯甲酸(2.0g,12.12mmol)在SOCl2(20mL)中的混合物回流持續(xù)2h,并且將SOCl2在真空中除去以給出4-氰基-3-氟苯甲酰氯(2.2g,99%)。將粗品進(jìn)行下一步而不進(jìn)一步純化。
制備122B:3-(4-氰基-3-氟苯基)-2-(4-甲氧基苯基)-3-氧代-丙酸甲酯
向(4-甲氧基苯基)乙酸(2.18g,12.12mmol)在THF(20mL)中的溶液在-78℃下添加LiHMDS(18.2mL,18.18mmol)并且將混合物攪拌持續(xù)30min。在-78℃下逐滴地添加4-氰基-3-氟苯甲酰氯(2.2g,12mmol)在THF中的溶液;并且允許反應(yīng)混合物加溫至RT并且攪拌過夜。添加含水NH4Cl并且將水相用EA(3x)萃取。將合并的有機(jī)物在真空中濃縮并且將殘余物通過二氧化硅色譜法(1:5,EA:PE)純化以給出1.8g(45%)的標(biāo)題化合物。對于C18H14FNO4的[M+H]計(jì)算為328;實(shí)測為328。
制備122C:{1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯
使3-(4-氰基-3-氟苯基)-2-(4-甲氧基苯基)-3-氧代-丙酸甲酯(1.8g,5.5mmol)、(1-脒基-哌啶-4-基)-氨基甲酸叔丁酯(2.6g,9.2mmol)、DIEA(2.4g,18.3mmol)在甲苯(50mL)中的混合物回流過夜。將溶劑在真空中濃縮。將殘余物懸浮在MeOH中并且將固體過濾以給出100mg(4%)的標(biāo)題化合物。對于C28H30FN5O4的[M+H]計(jì)算為520;實(shí)測為520。
實(shí)施例122:4-[2-(4-氨基哌啶-1-基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-4-基]-2-氟苯甲腈
向{1-[4-(4-氰基-3-氟苯基)-5-(4-甲氧基苯基)-6-氧代-1,6-二氫嘧啶-2-基]-哌啶-4-基}氨基甲酸叔丁酯(50mg,0.096mmol)在EA(10mL)中的溶液添加在EA中的5M HCl溶液并且將混合物在RT下攪拌持續(xù)2h。將溶劑在真空中除去并且將殘余物通過制備型HPLC純化以給出作為鹽酸鹽的18mg(40%)的標(biāo)題化合物。1H NMR(400MHz,CD3OD):δ1.81-1.87(m,2H),2.22-2.25(m,2H),3.34-3.38(m,2H),3.56-3.60(m,1H),3.78(s,3H),4.61-4.64(m,2H),6.86(d,J=7.2Hz,2H),7.08(d,J=8.4Hz,2H),7.37-7.38(m,1H),7.51-7.53(m,1H),7.74(s,1H)。對于C23H22FN5O2的[M+H]計(jì)算為420;實(shí)測為420。
II.生物學(xué)評估
實(shí)施例1a:體外酶抑制測定-LSD-1
此測定確定測試化合物抑制LSD1脫甲基酶活性的能力。大腸桿菌(E.coli)表達(dá)的全長人類LSD1(登錄號O60341)購自Active Motif(貨號31334)。
LSD1活性的酶測定是基于時(shí)間分辨-熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)檢測?;衔飳SD1的抑制性質(zhì)在384孔板版式中在以下反應(yīng)條件下被確定:0.1-0.5nM LSD1,50nM H3K4me1-生物素標(biāo)記的肽(Anaspec貨號64355),在50mM HEPES的測定緩沖劑中的2μM FAD,pH7.3,10mM NaCl,0.005%Brij35,0.5mM TCEP,0.2mg/ml BSA。在LSD1抑制劑例如在LANCE檢測緩沖劑(PerkinElmer)中的1.8mM的反苯環(huán)丙胺鹽酸鹽(2-PCPA)的存在下,在將檢測試劑Phycolink鏈親和素-別藻藍(lán)素(Streptavidin-allophycocyanin)(Prozyme)和銪-抗未修飾的組蛋白H3賴氨酸4(H3K4)抗體(PerkinElmer)分別添加為12.5nM和0.25nM的濃度之后,反應(yīng)產(chǎn)物通過TR-FRET定量地確定。
測定反應(yīng)根據(jù)以下程序進(jìn)行:將150nM H3K4me1-生物素標(biāo)記的肽與2μL的11點(diǎn)連續(xù)稀釋的測試化合物在3%DMSO中的2μL的混合物添加至板的每個(gè)孔,隨后添加2μL的0.3nM LSD1和6μM的FAD以引發(fā)反應(yīng)。然后將反應(yīng)混合物在室溫下溫育持續(xù)一小時(shí),并且通過添加在包含25nM Phycolink鏈親和素-別藻藍(lán)素和0.5nM銪-抗未修飾的H3K4抗體的LANCE檢測緩沖劑中的6μL的1.8mM 2-PCPA終止。如果在板中使用0.5LSD1酶,則酶促反應(yīng)在15分鐘內(nèi)終止。在室溫下1小時(shí)溫育之后,通過TR-FRET模型中的EnVision多標(biāo)記讀數(shù)器(EnVision Multilabel Reader)來讀取板。對于每個(gè)孔,計(jì)算比率(665/615)并且擬合以確定抑制常數(shù)(IC50)。
定量本文公開的化合物抑制LSD1活性的能力并且確定各自的IC50值。表3提供本文公開的各個(gè)被取代的雜環(huán)化合物的IC50值。
表3
注解:生物化學(xué)測定IC50數(shù)據(jù)被指定在以下范圍內(nèi):
A:≤0.10μM
B:>0.10μM至≤1.0μM
C:>1.0μM至≤10μM
D:>10μM
實(shí)施例2:體外酶抑制測定—MAO選擇性
獲得人類重組單胺氧化酶蛋白MAO-A和MAO-B。MAO催化伯胺、仲胺和叔胺的氧化脫氨。為了監(jiān)測MAO酶活性和/或其被感興趣的抑制劑的抑制率,進(jìn)行基于熒光的(抑制劑)篩選測定。選擇非熒光化合物3-(2-氨基苯基)-3-氧代丙胺(犬尿胺二氫溴酸鹽,Sigma Aldrich)作為底物。犬尿胺對于兩種MAO活性均是非特異性底物。當(dāng)犬尿胺通過MAO活性經(jīng)歷氧化脫氨時(shí),犬尿胺被轉(zhuǎn)化成4-羥基喹啉(4-HQ),產(chǎn)生熒光產(chǎn)物。
單胺氧化活性通過測量犬尿胺至4-羥基喹啉的轉(zhuǎn)化來評估。在具有透明底部的96孔黑色板(Corning)中以100μl的最終體積進(jìn)行測定。測定緩沖劑是100mM HEPES,pH 7.5。在同一實(shí)驗(yàn)中,一式三份地進(jìn)行每個(gè)實(shí)驗(yàn)。
簡言之,將固定量的MAO(對于MAO-A為0.25μg,并且對于MAO-B為0.5μg)在冰上在反應(yīng)緩沖劑中在各個(gè)濃度的如本文公開的化合物(例如從0μΜ至50μΜ,取決于抑制劑強(qiáng)度)的不存在和/或存在下溫育持續(xù)15分鐘。使用反苯環(huán)丙胺(Biomol International)作為用于抑制的對照。
在使酶與測試化合物相互作用之后,將60μΜ至90μΜ的犬尿胺添加至分別用于MAO-B測定和MAO-A測定的每個(gè)反應(yīng),并且將反應(yīng)留在37℃下在暗處持續(xù)1小時(shí)。通過添加50μl的2N NaOH,使底物的氧化脫氨停止。使用微板讀數(shù)器(Infinite 200,Tecan),通過熒光(在320nm處激發(fā),在360nm處發(fā)射)監(jiān)測犬尿胺至4-羥基喹啉的轉(zhuǎn)化。使用任意單位以測量測試化合物不存在和/或存在下產(chǎn)生的熒光水平。
通過在測試化合物不存在下測量由犬尿胺脫氨形成的4-羥基喹啉的量獲得最大氧化脫氨活性并且針對背景熒光校正。每個(gè)抑制劑的Ki(IC50)在Vmax/2下確定。在上文描述的測定中測試化學(xué)合成實(shí)施例1-94、化學(xué)合成實(shí)施例101-106、化學(xué)合成實(shí)施例108-117、以及化學(xué)合成實(shí)施例120-122并且發(fā)現(xiàn)具有大于2μΜ的IC50。
實(shí)施例3:LSD1CD11b細(xì)胞測定
為了分析細(xì)胞中LSD1抑制劑效力,進(jìn)行CD11b流式細(xì)胞術(shù)測定。LSD1抑制誘導(dǎo)THP-1(AML)細(xì)胞內(nèi)的CD11b表達(dá),這通過流式細(xì)胞術(shù)來測量。將THP-1細(xì)胞以100,000個(gè)細(xì)胞/孔接種在具有每孔500μL的最終體積的24孔板中的包含10%胎牛血清的RPMI 1640培養(yǎng)基中。將LSD1測試化合物在DMSO中連續(xù)地稀釋。將稀釋液相應(yīng)地添加至每個(gè)孔至0.2%DMSO的最終濃度。將細(xì)胞在37攝氏度下在5%CO2中溫育持續(xù)4天。將每個(gè)孔的250μL轉(zhuǎn)移至96孔圓底板中的孔。將板以1200rpm在4攝氏度下在Beckman Coulter Alegra 6KR離心機(jī)中離心持續(xù)5分鐘。將培養(yǎng)基除去,留下細(xì)胞在孔的底部。將細(xì)胞在100μL冷HBSS(Hank’s Balanced Salt Solution)加2%BSA(Bovine Serum Albumin)溶液中洗滌并且以1200rpm在4攝氏度下離心持續(xù)5分鐘。將洗滌液除去。將細(xì)胞重新懸浮在包含APC軛合的小鼠抗CD11b抗體(BD Pharmingen貨號555751)的1:15稀釋液的100μL HBSS加2%BSA中并且在冰上溫育持續(xù)25分鐘。將細(xì)胞離心并且在100μL HBSS加2%BSA中洗滌兩次。在最終旋轉(zhuǎn)之后,將細(xì)胞重新懸浮在包含1ug/mL DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚)的100μL HBSS加2%BSA中。然后,細(xì)胞在BD FACSAria儀器中通過流式細(xì)胞術(shù)分析。分析細(xì)胞的CD11b表達(dá)。對于每個(gè)抑制劑濃度,使用表達(dá)CD11b的細(xì)胞的百分?jǐn)?shù)以確定分析的每個(gè)化合物的IC50曲線。
表4提供本文公開的各個(gè)被取代的雜環(huán)化合物的細(xì)胞IC50值。
表4
注解:細(xì)胞測定IC50數(shù)據(jù)被指定在以下范圍內(nèi):
A:≤0.10μM
B:>0.10μM至≤1.0μM
C:>1.0μM至≤10μM
D:>10μM
實(shí)施例4:Kasumi-1AML細(xì)胞系增殖測定(Cell-MTS測定)
比色細(xì)胞測定以評估LSD-1小分子抑制劑影響確定的AML癌細(xì)胞系Kasumi-1的增殖的能力。
測定背景
已經(jīng)示出LSD-1蛋白質(zhì)在包括SCLC和AML的多種癌癥類型的生物學(xué)中起關(guān)鍵作用。為了證明LSD-1的小分子抑制作為可能的抗癌療法,
實(shí)施測量AML的確定的癌細(xì)胞系中的增殖抑制的程度的測定。
測定原理
此Cell-MTS測定是在測試化合物的存在和不存在下對新產(chǎn)生的NADH的量定量的基于7天板的比色測定法。這些NADH水平被用作用于定量癌細(xì)胞增殖的代表。
測定方法
具有已證實(shí)的p53突變的確定的癌細(xì)胞系Kasumi-1購自American Type Culture Collection(ATCC)并且根據(jù)ATCC公布的方案常規(guī)地傳代。對于常規(guī)的測定,將這些細(xì)胞以每96孔20,000個(gè)細(xì)胞的密度接種。在平鋪之后24小時(shí),細(xì)胞接收其中最終濃度在從100μM至2.0nM的范圍內(nèi)的11點(diǎn)稀釋的測試化合物。將細(xì)胞在化合物的存在下在37℃、5%CO2下溫育持續(xù)168小時(shí)。在此化合物溫育時(shí)間段結(jié)束時(shí),除去80μl的培養(yǎng)基并且添加20μL的CellTiterAQueous非放射性細(xì)胞增殖測定溶液(Promega)。溫育細(xì)胞,直到OD490>0.6。IC50值使用IDBS XL擬合軟件包來計(jì)算并且包括背景減除的OD490值并且與DMSO對照歸一化。
表5提供本文公開的各個(gè)被取代的雜環(huán)化合物的Kasumi-1細(xì)胞IC50值。
表5
實(shí)施例5:體內(nèi)異種移植研究—MCF-7異種移植
將包含0.72mg 17-β雌二醇的時(shí)間釋放小球(Time release pellets)皮下地移植到nu/nu小鼠中。MCF-7細(xì)胞在包含10%FBS的RPMI中在5%CO2,37℃下生長。將細(xì)胞旋轉(zhuǎn)下來并且以1X107個(gè)細(xì)胞/mL重新懸浮在50%RPMI(無血清)和50%基質(zhì)膠(Matrigel)中。將MCF-7細(xì)胞在小球移植2-3天后皮下注射(100μL/動(dòng)物)到右側(cè)并且每兩周地監(jiān)測腫瘤體積(長度x寬度2/2)。當(dāng)腫瘤達(dá)到~200mm3的平均體積時(shí),將動(dòng)物隨機(jī)化并且開始治療。將動(dòng)物用媒介物或化合物每天治療持續(xù)4周。在整個(gè)研究中,每兩周地監(jiān)測腫瘤體積和體重。在治療時(shí)間段結(jié)束時(shí),采取血漿樣品和腫瘤樣品分別用于藥效學(xué)和藥代動(dòng)力學(xué)分析。
實(shí)施例6:體內(nèi)異種移植研究—LNCaP異種移植
將具有穩(wěn)定敲除的LSDl(shLSDl細(xì)胞)的LNCaP細(xì)胞或?qū)φ占?xì)胞(例如shNTC細(xì)胞)通過皮下注射(例如在100μl的50%RPMI 1640/BD基質(zhì)膠中的3x106個(gè)細(xì)胞)接種在裸小鼠的背側(cè)。每周一次測量小鼠重量和腫瘤大小并且使用式(7i/6)(LxW)評估腫瘤體積,其中L=腫瘤的長度并且W=腫瘤的寬度。進(jìn)行兩個(gè)樣品t檢驗(yàn)以確定兩組之間的平均腫瘤體積的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。
將未修飾的LNCaP細(xì)胞通過皮下注射到裸小鼠的背側(cè)(例如在100μl的50%RPMI 1640/BD基質(zhì)膠中的3x106個(gè)細(xì)胞)中接種。三周之后,將小鼠用水(對照)、巴吉林(0.53mg或1.59mg;1mM或3mM最終濃度,假定70%生物利用度)、或XB154(4μg或20μg;1μΜ或5μΜ最終濃度,假定70%生物利用度)每天一次腹腔內(nèi)地注射或用測試化合物治療(每周5mg/kg或每周10mg/kg)。治療繼續(xù)持續(xù)三周,在此期間如上文測量小鼠重量和腫瘤體積。
將shLSDl LNCaP細(xì)胞或?qū)φ占?xì)胞如上文注射在裸小鼠內(nèi)。三周之后,小鼠用2.6μg絲裂霉素C(預(yù)計(jì)1μΜ的最終濃度,假定40%生物利用度)、奧拉帕尼(例如約0.5mg/kg至25mg/kg)或媒介物每天一次腹腔內(nèi)地治療持續(xù)三周。在其他實(shí)施例中,將未修飾的LNCaP細(xì)胞如上文注射在裸小鼠內(nèi)。
三周之后,如上文用測試化合物或媒介物加MMC或奧拉帕尼治療小鼠。治療繼續(xù)持續(xù)三周,在此期間如上文測量小鼠重量和腫瘤體積。
用shLSDl細(xì)胞注射的小鼠中相比于對照的腫瘤體積減小指示LSD1抑制減小體內(nèi)腫瘤生長。
類似地,用LNCaP細(xì)胞注射和用本文公開的化合物治療的小鼠中相比于對照的腫瘤體積減小指示LSD1抑制減小體內(nèi)腫瘤生長。最后,用LNCaP細(xì)胞注射的和用本文公開的化合物加奧拉帕尼治療的小鼠相比于單獨(dú)用本文公開的化合物治療的小鼠的腫瘤體積減小指示LSD1的抑制加PARP的抑制減小體內(nèi)腫瘤生長。
檢查收獲的異種移植物組織中LSD1抑制的證據(jù)。這用蛋白印跡來評估以檢查2MK4組蛋白標(biāo)記物和2MK9組蛋白標(biāo)記物的整體水平,F(xiàn)A/BRCA基因的表達(dá),F(xiàn)ANCD2泛素化、以及在shRNA細(xì)胞情況下LSD1蛋白水平。這些參數(shù)中的一個(gè)或更多個(gè)的降低指示LSD1的有效抑制。另外,用H2AX灶的染色評估了對DNA損傷修復(fù)的作用。
III.藥物劑型的制備
實(shí)施例1:口服片劑
片劑通過將按重量計(jì)48%的式(I)的化合物或其藥學(xué)上可接受的鹽、按重量計(jì)45%的微晶纖維素、按重量計(jì)5%的低取代的羥基丙基纖維素、以及按重量計(jì)2%的硬脂酸鎂混合來制備。片劑通過直接壓片來制備。壓制的片劑的總重量被保持在250-500mg。