本發(fā)明涉及醫(yī)藥領(lǐng)域,具體地,本發(fā)明公開了一種治療含tp53基因突變的腫瘤的藥物。
背景技術(shù):
1、細胞中遺傳和表觀遺傳改變的積累可導(dǎo)致細胞不受控制的生長和增殖,進而引發(fā)癌癥。tp53是人類癌癥中最常見的突變基因之一,發(fā)生在約50%的人類癌癥中,包括肺癌、乳腺癌、結(jié)腸癌、卵巢癌和胃癌等。tp53突變可發(fā)生在癌癥發(fā)展的任何階段,與預(yù)后不良和對治療的抵抗有關(guān)。
2、tp53是一種重要的腫瘤抑制基因,作為轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)細胞周期、dna修復(fù)和凋亡等相關(guān)基因的表達。其突變可導(dǎo)致相關(guān)蛋白質(zhì)功能喪失,進而導(dǎo)致無法誘導(dǎo)細胞凋亡或阻止細胞周期以響應(yīng)dna損傷,最終促進腫瘤生長和轉(zhuǎn)移。tp53突變也可導(dǎo)致蛋白質(zhì)獲得異常功能,從而促進腫瘤生長和轉(zhuǎn)移。
3、盡管tp53突變在癌癥發(fā)展和進展中很重要,但目前還沒有直接針對tp53突變的藥物。開發(fā)tp53直接靶向療法存在若干挑戰(zhàn),主要體現(xiàn)在以下幾方面:(1)tp53是一種具有多種功能的復(fù)合蛋白,因此很難開發(fā)出在不影響正常蛋白形式的情況下選擇性靶向突變蛋白形式的藥物;(2)tp53突變可能發(fā)生在癌癥發(fā)展的任何階段,因此很難開發(fā)出對所有癌癥階段都有效的藥物;(3)tp53突變可以是雜合或純合的,導(dǎo)致不同水平的蛋白質(zhì)表達和功能,這種異質(zhì)性可能使開發(fā)針對所有tp53突變腫瘤有效的藥物變得困難。
4、盡管tp53是一個很難成藥的靶點,但其基因突變使其失去正常功能外,還會激活級聯(lián)信號通路以促進腫瘤進展和補償功能的喪失,暗示在這些改變的途徑中可能隱藏著大量的“合成致死”伴侶。綜上所述,本領(lǐng)域仍然需要開發(fā)針對tp53靶點的腫瘤治療藥物。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、本發(fā)明人通過研究發(fā)現(xiàn),胸腺嘧啶dna糖基化酶(簡稱為tdg,下同)是一個很好的tp53基因突變“合成致死”伴侶,在tp53突變腫瘤治療中有很大的應(yīng)用前景。使用包括胸腺嘧啶dna糖基化酶(tdg)抑制劑,及其在藥學(xué)上可接受的輔助成分的藥物組合物,能夠有效地抑制人源tdg蛋白表達,對含tp53基因突變腫瘤有很好的治療效果。
2、本發(fā)明的第一方面,提供了一種tdg抑制劑的用途,用于制備治療tp53基因突變相關(guān)腫瘤的藥物組合物;
3、其中所述的藥物組合物包括:治療有效量的tdg抑制劑,以及其在藥學(xué)上可接受的載體輔助成分。
4、在另一優(yōu)選例中,所述的藥物組合物用于下調(diào)治療對象的tp53基因表達水平或表達量。
5、在另一優(yōu)選例中,所述的tp53基因突變腫瘤選自下組:肺癌、皮膚黑色素瘤、肝癌、乳腺癌、急性髓細胞樣白血病、結(jié)腸癌、結(jié)直腸癌、食管癌、胃癌、胰腺癌、膀胱癌。
6、在另一優(yōu)選例中,所述的tp53基因突變選自下組:錯義突變,基因缺失、移碼突變、剪接位點突變、截短突變。
7、在另一優(yōu)選例中,所述的tp53基因突變導(dǎo)致的蛋白序列改變包括但不限于下組:
8、p.146_149wvds>c、p.157_158insl、p.165_166insykq、p.173_174vr>g、p.239_240insn、p.247_248nr>kw、p.249_250insr、p.a119fs、p.a138p、p.a159d、p.a159p、p.a159v、p.a161d、p.a161t、p.a189a、p.a347p、p.a347v、p.a70a、p.a74s、p.a76fs、p.a88fs、p.c124*、p.c124r、p.c135f、p.c135fs、p.c135r、p.c135y、p.c141w、p.c141y、p.c176f、p.c176fs、p.c176s、p.c176w、p.c176y、p.c229fs、p.c238f、p.c238fs、p.c238g、p.c238r、p.c238s、p.c238y、p.c242f、p.c242fs、p.c242g、p.c242r、p.c242s、p.c242w、p.c242y、p.c275f、p.c275fs、p.c275g、p.c275y、p.c277f、p.d148g、p.d207y、p.d228fs、p.d259v、p.d259y、p.d281g、p.d281n、p.d281y、p.d48fs、p.d48n、p.d49h、p.e11q、p.e171*、p.e171del、
9、p.e180*、p.e180fs、p.e204*、p.e204fs、p.e224d、p.e224e、p.e224k、p.e258*、p.e258a、p.e258k、p.e271*、p.e271fs、p.e271k、p.e285k、p.e285v、p.e286k、p.e287*、p.e287d、p.e294*、p.e294fs、p.e298*、p.e326*、p.e326k、p.e336*、p.e336fs、p.e339*、p.e343*、p.e349*、p.e349fs、p.e51*、p.e56*、p.e62*、p.ee286del、p.f113c、p.f113l、p.f113s、p.f113v、p.f134fs、p.f341f、p.g105r、p.g108del、p.g108fs、p.g108v、p.g154v、p.g187c、p.g187r、p.g199*、p.g199g、p.g244a、p.g244c、p.g244d、p.g244s、p.g245c、p.g245d、p.g245r、p.g245s、p.g245v、p.g262d、p.g262s、p.g262v、p.g266*、p.g266e、p.g266r、p.g266v、p.g293fs、p.g334v、p.g356g、p.g360v、p.g389w、p.h178d、p.h179d、p.h179fs、p.h179q、p.h179r、p.h179y、p.h193fs、p.h193l、p.h193n、p.h193p、p.h193r、p.h193y、p.h214h、p.h214r、p.h233del、p.h296y、p.i162n、p.i195f、p.i195s、p.i195t、p.i232n、p.i232s、p.i251fs、p.i251l、p.i251n、p.i251t、p.i254d、p.i254s、p.i255del、p.i255n、p.i255s、p.i255t、p.k101*、p.k101fs、p.k120*、p.k120fs、p.k120n、p.k132e、p.k132m、p.k132n、p.k132q、p.k132r、p.k132t、p.k139fs、p.k164*、p.k164e、p.k164n、p.k291*、p.k291e、p.k291l、p.k292i、p.k319*、p.k320n、p.k382fs、p.l130f、p.l130r、p.l130v、p.l137q、p.l145r、p.l194f、p.l194r、p.l252fs、p.l252l、p.l264r、p.l265p、p.l323fs、p.l35fs、p.l93fs、p.lapp188del、p.m133k、p.m237i、p.m246i、p.m246r、p.m246t、p.m246v、p.n131k、p.n200fs、p.n235del、p.n239d、p.n239s、p.n268fs、p.n268i、p.n310fs、p.n345fs、p.n345s、p.p142fs、p.p142r、p.p151a、p.p151h、p.p151s、p.p152fs、p.p152l、p.p152p、p.p152s、p.p153fs、p.p177l、p.p177t、p.p190l、p.p191del、p.p191fs、p.p219fs、p.p223l、p.p250l、p.p278f、p.p278h、p.p278l、p.p278p、p.p278r、p.p278s、p.p278t、p.p27l、p.p295p、p.p301fs、p.p309s、p.p316p、p.p318fs、p.p322fs、p.p36fs、p.p36l、p.p47fs、p.p47p、p.p58fs、p.p98fs、p.p98l、p.p98s、p.ppqh190del、p.q100*、p.q104*、p.q136*、p.q136fs、p.q144*、p.q167*、p.q16l、p.q192*、p.q317*、p.q317fs、p.q331*、p.q331r、p.q38*、p.q52*、p.q52fs、p.q52p*、p.r110c、p.r110l、p.r110p、p.r156p、p.r158g、p.r158h、p.r158l、p.r158p、p.r174fs、p.r175fs、p.r175h、p.r175l、p.r181c、p.r181h、p.r181p、p.r196*、p.r196p、p.r209*、p.r209fs、p.r213*、p.r213g、p.r213l、p.r213q、p.r248g、p.r248l、p.r248q、p.r248w、p.r249fs、p.r249g、p.r249m、p.r249s、p.r249t、p.r263s、p.r267fs、p.r267l、p.r267p、p.r267q、p.r267w、p.r273c、p.r273h、p.r273l、p.r280fs、p.r280g、p.r280k、p.r280r、p.r280s、p.r280t、p.r282g、p.r282q、p.r282w、p.r283c、p.r283del、p.r283h、p.r283p、p.r290c、p.r290fs、p.r290h、p.r306*、p.r306fs、p.r335fs、p.r337c、p.r337l、p.r342*、p.r342fs、p.r379fs、p.s106r、p.s127c、p.s127f、p.s127p、p.s149fs、p.s166*、p.s183*、p.s185s、p.s215c、p.s215del、p.s215g、p.s215i、p.s215n、p.s215r、p.s240r、p.s241a、p.s241c、p.s241f、p.s241y、p.s261t、p.s313fs、p.s315fs、p.s33fs、p.s37fs、p.s90f、p.s90fs、p.s94*、p.s95f、p.s99fs、p.t118fs、p.t125m、p.t125p、p.t125t、p.t140fs、p.t155n、p.t155p、p.t211a、p.t211i、p.t256fs、p.t284fs、p.v122fs、p.v143a、p.v143m、p.v147d、p.v147g、p.v157f、p.v157fs、p.v173l、p.v173m、p.v197fs、p.v197l、p.v203l、p.v216l、p.v216m、p.v217g、p.v218del、p.v218l、p.v272e、p.v272fs、p.v272l、p.v272m、p.v274c、p.v274d、p.v274f、p.v31i、p.v73fs、p.w146*、p.w53*、p.w91*、p.w91fs、p.y103fs、p.y107*、p.y107fs、p.y126*、p.y126c、p.y163c、p.y163h、p.y205c、p.y205f、p.y205fs、p.y205h、p.y220c、p.y220d、p.y220fs、p.y234c、p.y234d、p.y234fs、p.y234n、p.y236*、p.y236c、p.y236n、p.y236s、p.y327fs。
10、*表示突變?yōu)榻K止密碼子。
11、在另一優(yōu)選例中,所述的tdg抑制劑為針對人源tdg的抑制劑(gene?id:6996)。
12、在另一優(yōu)選例中,所述的人源tdg?mrna序列ncbi登錄號為nm_003211.6。
13、在另一優(yōu)選例中,所述的人源tdg蛋白序列ncbi登錄號為np_003202.3。
14、在另一優(yōu)選例中,所述的tdg抑制劑選自下組:小分子抑制劑、多肽藥物、在crispr-cas9基因敲除技術(shù)中使用的針對人源tdg的sgrna組合物,在rna干擾技術(shù)中使用的針對人源tdg序列的sirna或其組合,在rna干擾技術(shù)中使用的針對人源tdg序列的shrna或其組合。
15、在另一優(yōu)選例中,所述的tdg抑制劑為us20160199381a1、us2022213070a1和wo2022047288a1中所述的小分子抑制劑。
16、在另一優(yōu)選例中,所述的tdg抑制劑為crispr-cas9基因敲除技術(shù)中使用的針對人源tdg序列的sgrna,且所述的sgrna選自下組(各個核苷酸序列為5’-3’):
17、
18、
19、在另一優(yōu)選例中,所述的tdg抑制劑為rna干擾技術(shù)中使用的針對人源tdg序列的sirna,且所述的sirna選自下組(各個核苷酸序列為5’-3’):
20、
21、
22、上述的核酸序列中,u核苷酸和t核苷酸是可互換的。
23、在另一優(yōu)選例中,所述的tdg抑制劑為rna干擾技術(shù)中使用的針對人源tdg序列的shrna,且所述的shrna選自下組(各個核苷酸序列為5’-3’):
24、
25、
26、
27、
28、在另一優(yōu)選例中,所述的藥物組合物中還包括第二治療活性成分,且所述的第二治療活性成分為免疫檢查點抑制劑。
29、在另一優(yōu)選例中,所述的免疫檢查點抑制劑為pd-1單抗。
30、在另一優(yōu)選例中,所述的免疫檢查點抑制劑為ctla-4單抗。
31、在本發(fā)明的第二方面,提供了一種藥物組合,所述的組合包括:
32、(1)第一治療活性成分,所述的第一治療活性成分為tdg抑制劑;
33、(2)第二治療活性成分,所述的第二治療活性成分為免疫檢查點抑制劑。
34、在本發(fā)明的第三方面,提供了一種crispr-cas9基因敲除技術(shù)中使用的針對人源tdg序列的sgrna,所述的sgrna選自下組(各個核苷酸序列為5’-3’):
35、
36、在本發(fā)明的第四方面,提供了一種針對人源tdg序列的sirna,所述的sirna具有選自下組的序列(各個核苷酸序列為5’-3’):
37、
38、
39、
40、上述的核酸序列中,u核苷酸和t核苷酸是可互換的。
41、在另一優(yōu)選例中,本發(fā)明提供了一種含有所述的sirna作為治療活性成分的納米脂質(zhì)體組合物。
42、在另一優(yōu)選例中,所述納米脂質(zhì)體組合物包括:載體、所述的sirna、藥用輔助劑,或其組合。
43、在另一優(yōu)選例中,所述載體包括:一種或多種陽離子脂質(zhì)化合物、助脂質(zhì)、結(jié)構(gòu)脂質(zhì)、聚合物綴合脂質(zhì),或其組合。
44、在另一優(yōu)選例中,所述陽離子脂質(zhì)化合物與助脂質(zhì)的摩爾比為0.5:1-15:1。
45、在另一優(yōu)選例中,所述陽離子脂質(zhì)化合物與結(jié)構(gòu)脂質(zhì)的摩爾比為0.5:1-5:1。
46、在另一優(yōu)選例中,所述陽離子脂質(zhì)化合物與聚合物綴合脂質(zhì)的摩爾比為10:1-250:1。
47、在另一優(yōu)選例中,所述納米脂質(zhì)體組合物為脂質(zhì)納米粒,且所述的脂質(zhì)納米粒的平均尺寸為30-200nm。
48、在另一優(yōu)選例中,所述脂質(zhì)納米粒的制劑的多分散指數(shù)≤0.3。
49、在另一優(yōu)選例中,所述藥用輔助劑包括:稀釋劑、穩(wěn)定劑、防腐劑或凍干保護劑,或其組合。
50、在本發(fā)明的第五方面,提供了一種針對人源tdg序列的shrna,所述的shrna具有選自下組的序列(各個核苷酸序列為5’-3’):
51、
52、
53、
54、
55、在本發(fā)明的第六方面,提供了一種用于構(gòu)建trp53敲除小鼠模型的sgrna序列,所述的序列(5’-3’)包括:
56、95mtrp53_sg-1:agtgaagccctccgagtgtc;
57、96mtrp53_sg-2:gaccctgtcaccgagacccc。
58、在本發(fā)明的第七方面,提供了一種用于構(gòu)建tdg敲除小鼠模型的sgrna序列,所述的序列包括:
59、97mtdg_sg-1:ttctagattggcattaaccc;
60、98mtdg_sg-2:ccgggaaggagggcgcatcc。
61、應(yīng)理解,在本發(fā)明范圍內(nèi)中,本發(fā)明的上述各技術(shù)特征和在下文(如實施例)中具體描述的各技術(shù)特征之間都可以互相組合,從而構(gòu)成新的或優(yōu)選的技術(shù)方案。限于篇幅,在此不再一一累述。