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一種苯致血液異常標(biāo)志物、評估模型及其構(gòu)建方法及應(yīng)用

文檔序號:40546104發(fā)布日期:2025-01-03 11:05閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種苯致血液異常評估模型的構(gòu)建方法,其特征在于,包括如下步驟:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種苯致血液異常評估模型的構(gòu)建方法,其特征在于,所述s1中的設(shè)置初篩條件包括:使用r軟件“l(fā)imma”包,以顯著性值p<0.05且∣logfoldchange∣≥0.5為初篩條件;在篩選出差異表達基因后,以“pheatmap”包繪制熱圖,以“ggplot2”包繪制火山圖。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的一種苯致血液異常評估模型的構(gòu)建方法,其特征在于,所述s2的步驟包括使用r軟件中“clusterprofiler”包對差異表達基因進行g(shù)o、kegg、gsea富集分析,以顯著性值p<0.05為標(biāo)準(zhǔn),并用氣泡圖來顯示富集分析結(jié)果。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的一種苯致血液異常評估模型的構(gòu)建方法,其特征在于,所述s3中的機器學(xué)習(xí)算法包括:lasso回歸算法、svm-rfe?支持向量機遞歸特征消除算法和隨機森林算法。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種苯致血液異常評估模型的構(gòu)建方法,其特征在于,所述s3的步驟包括:

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的一種苯致血液異常評估模型的構(gòu)建方法,其特征在于,所述s4中的多種學(xué)習(xí)模型包括:支持向量機模型、bp神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型、貝葉斯模型和c5.0決策樹;所述根據(jù)學(xué)習(xí)模型的測試結(jié)果選擇適合的學(xué)習(xí)模型的方式包括:通過計算各個學(xué)習(xí)模型的測試結(jié)果準(zhǔn)確率和繪制roc曲線,并進行對比,使用graphpad?prism?8.3軟件對比較結(jié)果進行繪制,以得到適合的學(xué)習(xí)模型;優(yōu)選的,經(jīng)訓(xùn)練過的c5.0決策樹作為苯致血液異常評估模型。

7.如權(quán)利要求1-6任一權(quán)利要求所述的構(gòu)建方法得到的苯致血液異常評估模型。

8.如權(quán)利要求1-6任一權(quán)利要求所述的構(gòu)建方法或權(quán)利要求7所述的苯致血液異常評估模型在苯暴露環(huán)境中血液異常的檢測模型中的應(yīng)用。

9.應(yīng)用如權(quán)利要求7所述的苯致血液異常評估模型篩選得到的一種苯致血液異常標(biāo)志物,其特征在于:包括nfkb1和ptx3。

10.檢測nfkb1和/或ptx3的引物在制備檢測苯致血液異常的試劑中的應(yīng)用。


技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,尤其是一種苯致血液異常標(biāo)志物、評估模型及其構(gòu)建方法及應(yīng)用,現(xiàn)提出如下方案,其包括S1:先對苯損傷表達譜數(shù)據(jù)集進行主成分分析,再設(shè)置初篩條件,篩選出苯損傷表達譜數(shù)據(jù)集之間的差異表達基因;S2:對差異表達基因進行GO、KEGG、GSEA富集分析,得到分析結(jié)果;S3:利用不同的機器學(xué)習(xí)算法從分析結(jié)果中篩選出特征基因并取交集,得到關(guān)鍵基因,再對關(guān)鍵基因進行驗證分析,得到苯損傷標(biāo)志基因;S4:利用苯損傷標(biāo)志基因訓(xùn)練、測試多種學(xué)習(xí)模型,根據(jù)學(xué)習(xí)模型的測試結(jié)果選擇適合的學(xué)習(xí)模型作為苯致血液異常評估模型。本發(fā)明可以為苯毒性早期干預(yù)提供理論依據(jù),并且可以為風(fēng)險評估提供更全面、靈敏的模型。

技術(shù)研發(fā)人員:王博深,朱寶立,蔣敏云,韓磊,張恒東,徐酩
受保護的技術(shù)使用者:江蘇省疾病預(yù)防控制中心(江蘇省預(yù)防醫(yī)學(xué)科學(xué)院)
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2025/1/2
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