技術(shù)特征:1.一種評估微生物系統(tǒng)彈性的方法,其特征在于:該方法包括以下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種評估微生物系統(tǒng)彈性的方法,其特征在于:所述s1中,多組學(xué)數(shù)據(jù)獲取的具體方法包括:
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種評估微生物系統(tǒng)彈性的方法,其特征在于:所述s2中,特定功能的微生物群篩選的具體方法包括:
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種評估微生物系統(tǒng)彈性的方法,其特征在于:所述s3中,評估抵抗力的具體方法包括:
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種評估微生物系統(tǒng)彈性的方法,其特征在于:所述s4中,評估功能冗余的具體方法包括:
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種評估微生物系統(tǒng)彈性的方法,其特征在于:所述s5中,評估彈性的具體方法包括:
技術(shù)總結(jié)本發(fā)明涉及一種評估微生物系統(tǒng)彈性的方法,屬于微生物學(xué)領(lǐng)域。該方法基于重建的彈性概念框架,將微生物群落的彈性定義為抵抗力和功能冗余的協(xié)同作用。通過宏基因組學(xué)和宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù),量化了抵抗力和功能冗余,并構(gòu)建了相應(yīng)的評估方法學(xué)。首先,通過多組學(xué)數(shù)據(jù)獲取和特定功能的微生物群篩選,獲得目標(biāo)功能相關(guān)的微生物群。然后,分別評估微生物群在代謝途徑中各過程的多樣性和凝聚力,以量化抵抗力;根據(jù)冗余物種的判別,計算功能冗余。最后,將抵抗力和功能冗余進(jìn)行線性擬合,并基于抵抗力、功能冗余與擬合線所圍面積計算彈性,并進(jìn)一步計算彈性維持。本發(fā)明能夠評估微生物系統(tǒng)在應(yīng)對外部擾動時維持功能的能力,為環(huán)境微生物研究和生態(tài)系統(tǒng)管理提供重要技術(shù)支撐。
技術(shù)研發(fā)人員:何欣霞,李哲,魯倫慧,盛星
受保護(hù)的技術(shù)使用者:中國科學(xué)院重慶綠色智能技術(shù)研究院
技術(shù)研發(fā)日:技術(shù)公布日:2024/12/23