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基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法

文檔序號(hào):40573987發(fā)布日期:2025-01-03 11:37閱讀:15來源:國(guó)知局
基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法

本發(fā)明涉及抑郁癥診斷,具體為基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法。


背景技術(shù):

1、抑郁癥,是一種以顯著而持久的心境低落為主要臨床特征的心境障礙。這種心境低落與其處境不相稱,表現(xiàn)為從悶悶不樂到悲痛欲絕,甚至悲觀厭世,嚴(yán)重時(shí)可出現(xiàn)幻覺、妄想等精神病性癥狀。抑郁癥異質(zhì)性高、發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,目前其診斷和治療主要基于臨床癥狀表象,存在主觀性和經(jīng)驗(yàn)性,亟需發(fā)展基于客觀生物標(biāo)記物的早期預(yù)警和精準(zhǔn)診療方法。

2、近紅外光譜是一種重要的光譜分析技術(shù),其波長(zhǎng)范圍介于可見光(vi?s)與中紅外光譜(mir)之間,通常定義為780nm至2500nm。這一光譜區(qū)域主要反映含氫鍵和有機(jī)分子振動(dòng)的倍頻和合頻振動(dòng),其光譜特征與有機(jī)分子的種類和含量高度相關(guān),因此特別適用于有機(jī)化合物和生物分子的分析。

3、通過獲取抑郁癥患者血樣近紅外光譜特征,結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)算法,建立近紅外光譜特征快速識(shí)別模型,有望實(shí)現(xiàn)抑郁癥患者近紅外光譜譜圖結(jié)果的快速識(shí)別。


技術(shù)實(shí)現(xiàn)思路

1、本發(fā)明提供的發(fā)明目的在于提供基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法。通過本發(fā)明基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,無(wú)需樣品前處理,僅通過微量血即可完成譜圖識(shí)別結(jié)果,操作簡(jiǎn)單、快捷。采集的干燥血近紅外光譜,與直接采集的液態(tài)血的近紅外光譜相比,沒有水峰的強(qiáng)干擾,顯示出更多更強(qiáng)的特征信號(hào)。篩選出的重要特征建模,大大降低了近紅外光譜特征維度,增加了計(jì)算速率和模型準(zhǔn)確度。

2、為了實(shí)現(xiàn)上述效果,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,包括以下步驟:

3、s1、采集并保存若干臨床抑郁癥病人和健康對(duì)照的少量血樣本;

4、s2、將步驟s1所得血樣本滴加到透明石英玻片上制得干燥血樣本,采集干燥血近紅外光譜形成光譜集;

5、s3、將步驟s2得到的近紅外光譜集按照一定的方法對(duì)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,并通過機(jī)器學(xué)習(xí)算法建立多個(gè)基礎(chǔ)模型;

6、s4、對(duì)步驟s3所建立的多個(gè)基礎(chǔ)模型分別進(jìn)行shap分析,篩選并合并重要特征后,通過步驟s3所使用的機(jī)器學(xué)習(xí)算法建立模型,并將這些模型與基礎(chǔ)模型對(duì)比,選出最優(yōu)模型作為最終的譜圖識(shí)別模型;

7、s5、采集待診斷臨床病人干燥血的近紅外光譜,并將其代入步驟s4建立的譜圖識(shí)別模型,以獲得譜圖快速識(shí)別結(jié)果。

8、進(jìn)一步的,包括以下步驟:根據(jù)s1中的操作步驟,所述少量血樣本體積為5-10微升,保存溫度為-80℃,常溫解凍后在24小時(shí)內(nèi)完成測(cè)試。

9、進(jìn)一步的,包括以下步驟:根據(jù)s2中的操作步驟,所述透明石英玻片需要進(jìn)行平整度和潔凈度檢查再使用。

10、進(jìn)一步的,包括以下步驟:根據(jù)s2中的操作步驟,所述近紅外光譜集是通過經(jīng)校準(zhǔn)和驗(yàn)證的近紅外光譜儀進(jìn)行光譜采集,以確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。

11、進(jìn)一步的,包括以下步驟:根據(jù)s2中的操作步驟,所述步驟s2采集近紅外光譜的具體方法為:

12、s201、將血樣滴加到透明石英玻片上經(jīng)30分鐘自然晾干后;

13、s202、再次滴加血到晾干的血之上經(jīng)30分鐘自然晾干;

14、s203、重疊滴加1-3次后,在透射模式下采集近紅外光譜。

15、進(jìn)一步的,包括以下步驟:根據(jù)s2中的操作步驟,所述近紅外光譜的采集范圍為4000-12000cm-1,分辨率范圍1-16cm-1,掃描次數(shù)范圍為2-64次。

16、進(jìn)一步的,包括以下步驟:根據(jù)s3中的操作步驟,所述近紅外光譜集對(duì)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理方法包括sg平滑(savitzky-golay,sg)、小波變換(wavelet?transform,wt)、移動(dòng)窗口平均(moving?window?average,mwa)、標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量變換(standard?normal?variatetransformation,snv)、多元散射校正(multiple?scattering?correction,msc)、歸一化(normalization,norm)、均值中心化(mean?centering,mc)、標(biāo)準(zhǔn)化(standardization,s)、一階求導(dǎo)、二階求導(dǎo)中的至少一種。

17、進(jìn)一步的,包括以下步驟:根據(jù)s3中的操作步驟,所述多種機(jī)器學(xué)習(xí)算法包括主成分-線性判別分析(principal?component?analysis-linear?dscriminant?analysis,pca-lda)、主成分-二次判別分析(principal?component?analysis-quadratic?discriminantanalysis,pca-qda)、偏最小二乘判別分析(partial?least?squares?discriminantanalysis,plsda)、k最近鄰(k-nearest?neighbor,knn)分類、邏輯回歸(logisticregression)模型、支持向量機(jī)(support?vector?machine,svm)、隨機(jī)森林(randomforests,rf)、極限梯度提升樹(extreme?gradient?boosting,xgboost)、多層感知機(jī)(multilayer?perceptron,mlp)中的一個(gè)或多個(gè)。

18、進(jìn)一步的,包括以下步驟:根據(jù)s4中的操作步驟,所述篩選重要特征的方法是將特征波長(zhǎng)根據(jù)shap絕對(duì)值均值大小排序后,取前總特征值數(shù)量的0.5%-60%。

19、進(jìn)一步的,包括以下步驟:根據(jù)s5中的操作步驟,所述譜圖識(shí)別模型的性能評(píng)價(jià)參數(shù)包括準(zhǔn)確率(accuracy)、受試者工作特征曲線下面積(area?under?curve,auc)、靈敏度(sensitivity)和特異性(specificity)。

20、本發(fā)明提供了基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,具備以下有益效果:

21、(1)本發(fā)明無(wú)需樣品前處理,僅通過微量血即可完成譜圖識(shí)別結(jié)果,操作簡(jiǎn)單、快捷。

22、(2)本發(fā)明采集的干燥血近紅外光譜,與直接采集的液態(tài)血的近紅外光譜相比,沒有水峰的強(qiáng)干擾,顯示出更多更強(qiáng)的特征信號(hào)。

23、(3)本發(fā)明使用篩選出的重要特征建模,大大降低了近紅外光譜特征維度,增加了計(jì)算速率和模型準(zhǔn)確度。



技術(shù)特征:

1.基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:根據(jù)s1中的操作步驟,所述少量血樣本體積為5-10微升,保存溫度為-80℃,常溫解凍后在24小時(shí)內(nèi)完成測(cè)試。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:根據(jù)s2中的操作步驟,所述透明石英玻片需要進(jìn)行平整度和潔凈度檢查再使用。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:根據(jù)s2中的操作步驟,所述近紅外光譜集是通過經(jīng)校準(zhǔn)和驗(yàn)證的近紅外光譜儀進(jìn)行光譜采集,以確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:根據(jù)s2中的操作步驟,所述采集近紅外光譜的具體方法為:

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:根據(jù)s2中的操作步驟,所述近紅外光譜的采集范圍為4000-12000cm-1,分辨率范圍1-16cm-1,掃描次數(shù)范圍為2-64次。

7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:根據(jù)s3中的操作步驟,所述近紅外光譜集對(duì)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理方法包括sg平滑、小波變換、移動(dòng)窗口平均、標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量變換、多元散射校正、歸一化、均值中心化、標(biāo)準(zhǔn)化、一階求導(dǎo)、二階求導(dǎo)中的至少一種。

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:根據(jù)s3中的操作步驟,所述多種機(jī)器學(xué)習(xí)算法包括主成分-線性判別分析、主成分-二次判別分析、偏最小二乘判別分析、k最近鄰分類、邏輯回歸模型、支持向量機(jī)、隨機(jī)森林、極限梯度提升樹、多層感知機(jī)中的一個(gè)或多個(gè)。

9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:根據(jù)s4中的操作步驟,所述篩選重要特征的方法是將特征波長(zhǎng)根據(jù)shap絕對(duì)值均值大小排序后,取前總特征值數(shù)量的0.5%-60%。

10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,其特征在于,包括以下步驟:根據(jù)s5中的操作步驟,所述譜圖識(shí)別模型的性能評(píng)價(jià)參數(shù)包括準(zhǔn)確率、受試者工作特征曲線下面積、靈敏度和特異性。


技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了基于干燥血近紅外光譜建立抑郁癥診斷模型的方法,屬于抑郁癥診斷技術(shù)領(lǐng)域,包括以下步驟:S1、采集并保存抑郁癥病人和健康對(duì)照的血樣本,S2、制備干燥血樣本并采集其近紅外光譜形成光譜集,S3、將近紅外光譜集數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,建立多個(gè)基礎(chǔ)模型,S4、篩選合并重要特征后,機(jī)器學(xué)習(xí)算法建立模型,選出最優(yōu)模型作為最終的譜圖識(shí)別模型,S5、采集待診斷病人干燥血的近紅外光譜,將其代入譜圖識(shí)別模型,快速識(shí)別結(jié)果。本發(fā)明無(wú)需樣品前處理,僅需微量血即可快速完成待診斷病人的近紅外光譜譜圖識(shí)別,采集的干燥血近紅外光譜與液態(tài)血的光譜相比,沒有水峰的強(qiáng)干擾,特征信號(hào)更多更強(qiáng),篩選出重要特征建模,增加了計(jì)算速率和模型準(zhǔn)確度。

技術(shù)研發(fā)人員:王剛,劉明霞,楊健,孫作厘,賀毅
受保護(hù)的技術(shù)使用者:首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京安定醫(yī)院
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2025/1/2
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