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一種不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法

文檔序號(hào):40550650發(fā)布日期:2025-01-03 11:10閱讀:來(lái)源:國(guó)知局

技術(shù)特征:

1.一種不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法,其特征在于,包括以下步驟:

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法,其特征在于,所述進(jìn)行位點(diǎn)篩選,包括以下分步驟:

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法,其特征在于,所述a3中假設(shè)檢驗(yàn)方法為fisher精確檢驗(yàn),所述fisher精確檢驗(yàn)的計(jì)算公式為:

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法,其特征在于,所述s4中構(gòu)建參考字典,包括以下分步驟:

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法,其特征在于,所述s4中對(duì)差異位點(diǎn)集根據(jù)其重復(fù)單元提取參考字典中數(shù)據(jù)進(jìn)行皮爾遜相關(guān)性分析,包括以下分步驟:

6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法,其特征在于,所述皮爾遜相關(guān)性分析的計(jì)算公式為:

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法,其特征在于,基于所述皮爾遜相關(guān)性分析,當(dāng)皮爾遜相關(guān)系數(shù)ρx,y大于0.9的數(shù)目超過(guò)所述模板數(shù)量的設(shè)定比例,則當(dāng)前待檢測(cè)位點(diǎn)為穩(wěn)定位點(diǎn)。

8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法,其特征在于,所述s5中樣本不穩(wěn)定打分score的計(jì)算公式為:


技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開(kāi)了一種不依賴(lài)對(duì)照和參考基線的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)方法,涉及微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域,包括以下步驟:已知待檢測(cè)樣本癌癥類(lèi)型,根據(jù)其同種癌癥類(lèi)型的樣本進(jìn)行位點(diǎn)篩選,獲得適用于微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測(cè)的差異位點(diǎn)集;篩選在該種癌癥類(lèi)型樣本中始終穩(wěn)定且滿足一定檢測(cè)率要求的恒穩(wěn)定位點(diǎn)集;對(duì)待檢測(cè)樣本差異位點(diǎn)集和恒穩(wěn)定位點(diǎn)集進(jìn)行測(cè)序,提取各位點(diǎn)的重復(fù)次數(shù)分布;收集恒穩(wěn)定位點(diǎn)集的微衛(wèi)星頻率分布構(gòu)建參考字典,對(duì)差異位點(diǎn)集根據(jù)其重復(fù)單元提取參考字典中數(shù)據(jù)進(jìn)行皮爾遜相關(guān)性分析;獲得當(dāng)前樣本不穩(wěn)定打分實(shí)現(xiàn)樣本不穩(wěn)定性檢測(cè)。本發(fā)明解決了陰性樣本采集受限、未準(zhǔn)確進(jìn)行位點(diǎn)篩選而導(dǎo)致檢測(cè)成本較高,以及準(zhǔn)確率較低的問(wèn)題。

技術(shù)研發(fā)人員:葉凱,鄭高洋,賈鵬,趙煥煥
受保護(hù)的技術(shù)使用者:西安交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院
技術(shù)研發(fā)日:
技術(shù)公布日:2025/1/2
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