1.一種胎盤植入性疾病早期識別及嚴(yán)重程度預(yù)測的分類器訓(xùn)練系統(tǒng),其特征在于它包括:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng),其特征在于數(shù)據(jù)集劃分模塊中,將重型、輕型和未發(fā)生pas孕婦按照年齡、行nipt時孕周、胎兒性別及高危因素分布匹配,將主中心的樣本隨機(jī)劃分為訓(xùn)練數(shù)據(jù)集與內(nèi)部驗證數(shù)據(jù)集,各分中心的樣本作為獨(dú)立的外部驗證數(shù)據(jù)集;從訓(xùn)練數(shù)據(jù)集中依據(jù)行nipt時孕周與胎兒性別進(jìn)行1:1匹配獲得發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)集。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng),其特征在于影響因子提取模塊中,使用序列比對算法將nipt數(shù)據(jù)與人類參考基因組hg19比對,刪除pcr重復(fù)項,確定距轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)tss上下1000bp的區(qū)域作為啟動子區(qū)域ptss,并計算ptss區(qū)域的原始讀取覆蓋率。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的系統(tǒng),其特征在于影響因子提取模塊中,對ptss區(qū)域的原始讀取覆蓋率進(jìn)行類tpm標(biāo)準(zhǔn)化,npc通過下式獲?。?/p>
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng),其特征在于特征篩選模塊中,使用傾向性評分在訓(xùn)練數(shù)據(jù)集中分別對pas重組與未發(fā)生pas的高危孕婦、pas輕組與未發(fā)生pas的高危孕婦進(jìn)行1:1匹配,對匹配后的三組進(jìn)行分別的兩兩差異分析;
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng),其特征在于特征因子離散模塊中,為了增強(qiáng)分類器對不同測序平臺的普適性及臨床實用性,將三組中基因npc均值明顯高于或低于另兩組的一組作為該基因特異性組別;最佳截斷值定義為特異性組別與其他兩組之間的約登指數(shù)最大時的npc值;當(dāng)特征因子npc大于相應(yīng)的最佳截斷值時,設(shè)為1;否則,設(shè)為0。
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的系統(tǒng),其特征在于模型獲取模塊中:
8.一種早期識別高危孕婦胎盤植入性疾病發(fā)生風(fēng)險的分類器,其特征在于它通過權(quán)利要求1-7任一項所述的訓(xùn)練系統(tǒng)獲得。
9.檢測mapk10、mir3169、mir12133、zdhhc6、loc644634、loc728739、krt33a、c1galt1c1、mir1263、rbfox2、cep192、linc02330、lpcat3、or7e2p、or4n2基因表達(dá)的試劑在制備胎盤植入性疾病早期識別及嚴(yán)重程度診斷試劑盒中應(yīng)用。