本發(fā)明屬于數(shù)據(jù)檢測,尤其涉及一種結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法與系統(tǒng)。
背景技術(shù):
1、為了實現(xiàn)對結(jié)直腸癌的早期復(fù)發(fā)監(jiān)測處理,在發(fā)明專利申請cn202411153096.5《用于結(jié)直腸早期癌變檢測的生物標(biāo)志物及其應(yīng)用》通過分析結(jié)直腸癌腫瘤進(jìn)程中的進(jìn)展期腺瘤患者、早期結(jié)直腸癌患者以及健康對照人群血液中豐度水平顯著差異的蛋白,篩選出風(fēng)險預(yù)測的生物標(biāo)記物,進(jìn)而實現(xiàn)準(zhǔn)確、無創(chuàng)、高效地預(yù)測個體患結(jié)直腸早期癌變風(fēng)險,滿足臨床所需,但是卻存在以下技術(shù)問題:
2、在進(jìn)行結(jié)直腸癌的早期復(fù)發(fā)監(jiān)測時,往往會伴隨著基因的突變,因此在進(jìn)行個體患結(jié)直腸早期癌變風(fēng)險的確定時,若不能根據(jù)患者的基因檢測數(shù)據(jù)的變動情況,進(jìn)行差異化的復(fù)發(fā)監(jiān)測策略的確定,則無法保證及時有效的進(jìn)行復(fù)發(fā)風(fēng)險的輸出。
3、針對上述技術(shù)問題,本發(fā)明提供了一種結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法與系統(tǒng)。
技術(shù)實現(xiàn)思路
1、為實現(xiàn)本發(fā)明目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:
2、根據(jù)本發(fā)明的一個方面,提供了一種結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法。
3、一種結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,具體包括:
4、s1確定患者在不同的測序次數(shù)下的基因突變位點,獲取不同的基因突變位點對應(yīng)的測序次數(shù),并結(jié)合不同的基因突變位點與結(jié)直腸癌的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)確定所述患者存在疑似復(fù)發(fā)風(fēng)險時,進(jìn)入下一步驟;
5、s2獲取不同的測序次數(shù)下對應(yīng)的測序參數(shù),并結(jié)合不同的測序次數(shù)下的基因突變位點的分布數(shù)據(jù)以及對應(yīng)的測序次數(shù)進(jìn)行不同的測序次數(shù)的測序可信系數(shù)以及可信測序次數(shù)的確定;
6、s3基于不同的基因突變位點對應(yīng)的測序次數(shù)確定所述基因突變位點的匹配的可信測序次數(shù),并將其作為匹配測序次數(shù),以不同的基因突變位點對應(yīng)的匹配測序次數(shù)的測序可信系數(shù)、基因突變位點與結(jié)直腸癌的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)確定所述患者的復(fù)發(fā)風(fēng)險系數(shù)滿足要求時,進(jìn)入下一步驟;
7、s4獲取所述患者在不同的可信測序次數(shù)中的基因突變位點的分布數(shù)據(jù),并結(jié)合不同的測序次數(shù)的測序可信系數(shù)以及復(fù)發(fā)風(fēng)險系數(shù)進(jìn)行所述患者的監(jiān)測策略的輸出。
8、本發(fā)明的有益效果在于:
9、基于測序次數(shù)下對應(yīng)的測序參數(shù)、基因突變位點的分布數(shù)據(jù)以及對應(yīng)的測序次數(shù)進(jìn)行可信測序次數(shù)的確定,從而既考慮到不同的測序次數(shù)下對應(yīng)的測序處理深度等參數(shù)對不同的測序次數(shù)下的數(shù)據(jù)可信程度的影響,同時還實現(xiàn)了基因突變位點與其它的測序次數(shù)的匹配情況對不同的測序次數(shù)下的數(shù)據(jù)結(jié)果的可信程度的影響,實現(xiàn)了從多個角度進(jìn)行可信測序次數(shù)的篩選,也為進(jìn)一步進(jìn)行患者的監(jiān)測策略的差異化確定奠定了基礎(chǔ)。
10、以患者在不同的可信測序次數(shù)中的基因突變位點的分布數(shù)據(jù)、測序可信系數(shù)以及復(fù)發(fā)風(fēng)險系數(shù)進(jìn)行患者的監(jiān)測策略的輸出,既考慮到不同的可信次數(shù)下的基因突變位點的分布數(shù)量的差異導(dǎo)致的患者的基因突變情況的差異,同時還考慮到患者發(fā)生復(fù)發(fā)的風(fēng)險情況,實現(xiàn)了從復(fù)發(fā)風(fēng)險以及基因突變的異常程度進(jìn)行患者的監(jiān)測策略的輸出,既保證了患者的監(jiān)測處理的可靠性,同時也提升了患者的監(jiān)測處理的效率。
11、進(jìn)一步的技術(shù)方案在于,所述基因突變階段根據(jù)不同的測序次數(shù)下的基因突變數(shù)據(jù)的分析結(jié)果進(jìn)行確定。
12、進(jìn)一步的技術(shù)方案在于,所述基因突變位點與結(jié)直腸癌的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)包括所述基因突變位點的復(fù)發(fā)患者的數(shù)量以及數(shù)量占比。
13、進(jìn)一步的技術(shù)方案在于,確定所述患者存在疑似復(fù)發(fā)風(fēng)險,具體包括:
14、基于不同的基因突變位點與結(jié)直腸癌的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)確定包括所述基因突變位點的復(fù)雜患者的數(shù)量,并利用復(fù)發(fā)患者的數(shù)量進(jìn)行所述基因突破片段中的關(guān)聯(lián)片段的確定;
15、以不同的關(guān)聯(lián)片段對應(yīng)的測序次數(shù),確定包括關(guān)聯(lián)片段的測序總次數(shù),并利用包括關(guān)聯(lián)片段的測序總次數(shù)確定所述患者是否存在疑似復(fù)發(fā)風(fēng)險。
16、進(jìn)一步的技術(shù)方案在于,所述關(guān)聯(lián)片段為復(fù)發(fā)患者的數(shù)量大于預(yù)設(shè)復(fù)發(fā)患者數(shù)量的基因突變位點。
17、進(jìn)一步的技術(shù)方案在于,當(dāng)包括關(guān)聯(lián)片段的測序總次數(shù)大于預(yù)設(shè)次數(shù)閾值時,則確定所述患者存在疑似復(fù)發(fā)風(fēng)險。
18、進(jìn)一步的技術(shù)方案在于,利用所述監(jiān)測需求系數(shù)確定所述患者的監(jiān)測策略,具體包括:
19、以所述監(jiān)測需求系數(shù)確定所述患者的監(jiān)測需求系數(shù)對應(yīng)的匹配監(jiān)測策略,并利用所述患者的監(jiān)測需求系數(shù)對應(yīng)的匹配監(jiān)測策略確定所述患者的監(jiān)測策略。
20、進(jìn)一步的技術(shù)方案在于,所述監(jiān)測策略包括基因監(jiān)測的測序深度。
21、第二方面,本發(fā)明提供了一種計算機(jī)系統(tǒng),包括:通信連接的存儲器和處理器,以及存儲在所述存儲器上并能夠在所述處理器上運行的計算機(jī)程序,所述處理器運行所述計算機(jī)程序時執(zhí)行上述的一種結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法。
22、其他特征和優(yōu)點將在隨后的說明書中闡述,本發(fā)明的目的和其他優(yōu)點在說明書以及附圖中所特別指出的結(jié)構(gòu)來實現(xiàn)和獲得。
23、為使本發(fā)明的上述目的、特征和優(yōu)點能更明顯易懂,下文特舉較佳實施例,并配合所附附圖,作詳細(xì)說明如下。
1.一種結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,其特征在于,具體包括:
2.如權(quán)利要求1所述的結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,其特征在于,所述基因突變階段根據(jù)不同的測序次數(shù)下的基因突變數(shù)據(jù)的分析結(jié)果進(jìn)行確定。
3.如權(quán)利要求1所述的結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,其特征在于,所述基因突變位點與結(jié)直腸癌的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)包括所述基因突變位點的復(fù)發(fā)患者的數(shù)量以及數(shù)量占比。
4.如權(quán)利要求1所述的結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,其特征在于,確定所述患者存在疑似復(fù)發(fā)風(fēng)險,具體包括:
5.如權(quán)利要求4所述的結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,其特征在于,所述關(guān)聯(lián)片段為復(fù)發(fā)患者的數(shù)量大于預(yù)設(shè)復(fù)發(fā)患者數(shù)量的基因突變位點。
6.如權(quán)利要求1所述的結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,其特征在于,所述測序次數(shù)下對應(yīng)的測序參數(shù)包括所述測序次數(shù)對應(yīng)的測序深度。
7.如權(quán)利要求1所述的結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,其特征在于,所述患者的監(jiān)測策略的輸出的確定的方法為:
8.如權(quán)利要求1所述的結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,其特征在于,利用所述監(jiān)測需求系數(shù)確定所述患者的監(jiān)測策略,具體包括:
9.如權(quán)利要求1所述的結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法,其特征在于,所述監(jiān)測策略包括基因監(jiān)測的測序深度。
10.一種計算機(jī)系統(tǒng),包括:通信連接的存儲器和處理器,以及存儲在所述存儲器上并能夠在所述處理器上運行的計算機(jī)程序,其特征在于:所述處理器運行所述計算機(jī)程序時執(zhí)行權(quán)利要求1-9任一項所述的一種結(jié)直腸癌早期復(fù)發(fā)監(jiān)測方法。