本發(fā)明屬于實驗動物，涉及轉錄組注釋目標疾病原位移植模型的建立，具體涉及一種基于機器學習轉錄組注釋的大語言模型構建方法和系統(tǒng)。

背景技術：

1、手術切除腫瘤后術后預后迥異，臨床需要對患者術后的預后情況精準評估進行復發(fā)或死亡風險分層，以指導臨床制定個性化治療和隨訪方案，輔助臨床決策。術前準確的診斷、評估和預后預測是獲得精準治療決策的基礎。然而臨床實踐發(fā)現(xiàn)腫瘤完全切除后，即使相同分期，患者的預后也存在較大差導：因此臨床需要準確的預后評估方法。

2、目前體外共培養(yǎng)模型已經(jīng)在轉錄組注釋目標疾病的診斷與鑒別診斷、分級分期、預后預測和療效評估等發(fā)明領域都取得了優(yōu)異的發(fā)明成果并且形成了較為成熟的技術架構,融合影像組學和病理組學技術構建預測早期可手術切除轉錄組注釋目標疾病的病理分級和預測預后的模型不僅可以從多維度、實時、無創(chuàng)地反映腫瘤的異質性，并且可以為臨床醫(yī)生精準診療方案的制定提供重要依據(jù)。但現(xiàn)有技術中尚未發(fā)現(xiàn)針對轉錄組注釋目標疾病術后風險的全面預測方案，對轉錄組注釋目標疾病術后的恢復和其他類似患者的手術規(guī)劃提出挑戰(zhàn)。

3、因此本發(fā)明擬基于轉錄組注釋目標疾病患者，結合臨床指標構建原位移植動物模型，探索轉錄組注釋目標疾病術后預后精準預測的新生物學指標和標志物，篩選手術治療優(yōu)勢人群，輔助臨床決策。

技術實現(xiàn)思路

1、為實現(xiàn)上述目的，本技術提供如下技術方案：

2、根據(jù)本發(fā)明第一方面，本發(fā)明請求保護一種基于機器學習轉錄組注釋的大語言模型構建方法，包括：

3、采集轉錄組注釋目標疾病樣本的培養(yǎng)數(shù)據(jù)；其中，所述轉錄組注釋目標疾病樣本包括轉錄組注釋目標疾病樣本中每個轉錄組注釋目標疾病的轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)，所述轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)包括轉錄組注釋目標疾病的歸屬數(shù)據(jù)、活性數(shù)據(jù)及免疫抑制數(shù)據(jù)，所述活性數(shù)據(jù)包括所述轉錄組注釋目標疾病屬于已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本或所述轉錄組注釋目標疾病屬于未患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本，所述免疫抑制數(shù)據(jù)包括免疫抑制劑、免疫抑制劑作用時長及轉錄組注釋目標疾病失活周期；

4、采集第一已移植時間段內的m個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)；其中，每個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)包括原位移植動物創(chuàng)建時間和原位移植動物失活周期，所述原位移植動物創(chuàng)建時間為已移植原位移植動物的免疫抑制轉錄組注釋目標疾病被排異的發(fā)生時長，所述原位移植動物失活周期為所述免疫抑制轉錄組注釋目標疾病完成所述已移植原位移植動物返回到第一時間戳活性降低的發(fā)生時長；

5、根據(jù)所述轉錄組注釋目標疾病樣本的培養(yǎng)數(shù)據(jù)、所述m個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)以及第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)進行分析，將所述m個已移植原位移植動物分別選患并發(fā)癥免疫抑制轉錄組注釋目標疾病，并得到免疫深度培養(yǎng)模型數(shù)據(jù)；

6、其中，所述免疫深度培養(yǎng)模型數(shù)據(jù)用于評價所述第一已移植時間段內的轉錄組注釋目標疾病移植成功率；所述第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)包括最短手術執(zhí)行時間、免疫抑制劑上限及免疫抑制劑作用時長上限。

7、進一步的，所述m個已移植原位移植動物為按照所述原位移植動物創(chuàng)建時間進行先后順序排列的m個已移植原位移植動物；

8、其中，所述根據(jù)所述轉錄組注釋目標疾病樣本的培養(yǎng)數(shù)據(jù)、所述m個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)以及第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)進行分析，將所述m個已移植原位移植動物分別選患并發(fā)癥免疫抑制轉錄組注釋目標疾病，并得到免疫深度培養(yǎng)模型數(shù)據(jù)，包括：

9、按照所述原位移植動物創(chuàng)建時間的先后順序，從所述m個已移植原位移植動物中選取第p個已移植原位移植動物，并采集所述第p個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)；

10、采集所述轉錄組注釋目標疾病樣本的當前數(shù)據(jù)；

11、根據(jù)所述第p個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)、所述轉錄組注釋目標疾病樣本的當前數(shù)據(jù)以及所述第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)，采集所述第p個已移植原位移植動物的免疫抑制轉錄組注釋目標疾病。

12、進一步的，所述根據(jù)所述第p個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)、所述轉錄組注釋目標疾病樣本的當前數(shù)據(jù)以及所述第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)，采集所述第p個已移植原位移植動物的免疫抑制轉錄組注釋目標疾病，包括：

13、當i不等于1時，根據(jù)所述轉錄組注釋目標疾病樣本的當前數(shù)據(jù)，采集當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本中每個轉錄組注釋目標疾病的轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)；

14、根據(jù)所述當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本中每個轉錄組注釋目標疾病的轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)，采集所述第p個已移植原位移植動物的第一目標轉錄組注釋目標疾病集；其中，所述第一目標轉錄組注釋目標疾病集為第一目標轉錄組注釋目標疾病的集合；

15、當所述第一目標轉錄組注釋目標疾病集中所述第一目標轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量大于零時，在所述第一目標轉錄組注釋目標疾病集中選取一個第一目標轉錄組注釋目標疾病為所述第p個已移植原位移植動物的所述免疫抑制轉錄組注釋目標疾病。

16、進一步的，所述根據(jù)所述當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本中每個轉錄組注釋目標疾病的轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)，采集所述第p個已移植原位移植動物的第一目標轉錄組注釋目標疾病集，包括：

17、根據(jù)所述當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本中每個轉錄組注釋目標疾病的轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)，采集所述每個轉錄組注釋目標疾病的當前累計免疫抑制劑、當前累計免疫抑制劑作用時長及當前轉錄組注釋目標疾病失活周期；其中，所述當前累計免疫抑制劑為所述轉錄組注釋目標疾病截至最近一趟免疫抑制的累計免疫抑制劑；所述當前累計免疫抑制劑作用時長為所述轉錄組注釋目標疾病首趟免疫抑制的原位移植動物創(chuàng)建時間和最近一趟免疫抑制的原位移植動物失活周期之間的時間間隔；所述當前轉錄組注釋目標疾病失活周期取值于所述轉錄組注釋目標疾病最近一趟免疫抑制的原位移植動物失活周期；

18、根據(jù)所述每個轉錄組注釋目標疾病的所述當前累計免疫抑制劑、所述當前累計免疫抑制劑作用時長和所述當前轉錄組注釋目標疾病失活周期，所述第p個已移植原位移植動物的原位移植動物創(chuàng)建時間和原位移植動物失活周期，以及所述第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)中的所述最短手術執(zhí)行時間、所述免疫抑制劑上限和所述免疫抑制劑作用時長上限，確定所述第一目標轉錄組注釋目標疾病集。

19、進一步的，所述當所述第一目標轉錄組注釋目標疾病集中所述第一目標轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量大于零時，在所述第一目標轉錄組注釋目標疾病集中選取一個第一目標轉錄組注釋目標疾病為所述第p個已移植原位移植動物的所述免疫抑制轉錄組注釋目標疾病，包括：

20、根據(jù)所述第一目標轉錄組注釋目標疾病集中每個第一目標轉錄組注釋目標疾病的當前累計免疫抑制劑作用時長、當前累計免疫抑制劑及當前剩余免疫抑制劑，計算所述每個第一目標轉錄組注釋目標疾病的匹配關聯(lián)性得分；其中，所述當前剩余免疫抑制劑等于所述免疫抑制劑上限與所述當前累計免疫抑制劑之差；

21、將所述第一目標轉錄組注釋目標疾病集中所述匹配關聯(lián)性得分最高的第一目標轉錄組注釋目標疾病確定為所述第p個已移植原位移植動物的免疫抑制轉錄組注釋目標疾病。

22、進一步的，所述第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)包括轉錄組注釋目標疾病數(shù)上限；

23、所述根據(jù)所述第p個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)、所述轉錄組注釋目標疾病樣本的當前數(shù)據(jù)以及所述第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)，采集所述第p個已移植原位移植動物的免疫抑制轉錄組注釋目標疾病，還包括：

24、當所述第一目標轉錄組注釋目標疾病集中所述第一目標轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量不大于零時，根據(jù)所述轉錄組注釋目標疾病樣本的當前數(shù)據(jù)，采集當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量，并判斷所述當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量是否小于所述轉錄組注釋目標疾病數(shù)上限；

25、當所述當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量不小于所述轉錄組注釋目標疾病數(shù)上限時，根據(jù)所述當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本中每個轉錄組注釋目標疾病的轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)，采集所述第p個已移植原位移植動物的第二目標轉錄組注釋目標疾病集；其中，所述第二目標轉錄組注釋目標疾病集為第二目標轉錄組注釋目標疾病的集合；

26、當所述第二目標轉錄組注釋目標疾病集中所述第二目標轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量大于零時，在所述第二目標轉錄組注釋目標疾病集中選取一個所述第二目標轉錄組注釋目標疾病為所述第p個已移植原位移植動物的免疫抑制轉錄組注釋目標疾病。

27、進一步的，所述當所述當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量不小于所述轉錄組注釋目標疾病數(shù)上限時，根據(jù)所述當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本中每個轉錄組注釋目標疾病的轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)，采集所述第p個已移植原位移植動物的第二目標轉錄組注釋目標疾病集，包括：

28、根據(jù)所述當前已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本中每個轉錄組注釋目標疾病的轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)，采集所述每個轉錄組注釋目標疾病的當前轉錄組注釋目標疾病失活周期、當前累計免疫抑制劑及當前累計免疫抑制劑作用時長；

29、根據(jù)所述每個轉錄組注釋目標疾病的所述當前累計免疫抑制劑、所述當前累計免疫抑制劑作用時長和所述當前轉錄組注釋目標疾病失活周期，所述第p個已移植原位移植動物的原位移植動物創(chuàng)建時間和原位移植動物失活周期，以及所述第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)，確定所述第二目標轉錄組注釋目標疾病集。

30、進一步的，所述當所述第二目標轉錄組注釋目標疾病集中所述第二目標轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量大于零時，在所述第二目標轉錄組注釋目標疾病集中選取一個所述第二目標轉錄組注釋目標疾病為所述第p個已移植原位移植動物的免疫抑制轉錄組注釋目標疾病，包括：

31、當所述第二目標轉錄組注釋目標疾病集中所述第二目標轉錄組注釋目標疾病的數(shù)量大于零時，根據(jù)所述第二目標轉錄組注釋目標疾病中每個第二目標轉錄組注釋目標疾病的當前轉錄組注釋目標疾病失活周期，將所述當前轉錄組注釋目標疾病失活周期最早的所述第二目標轉錄組注釋目標疾病確定為所述第p個已移植原位移植動物的免疫抑制轉錄組注釋目標疾病。

32、根據(jù)本發(fā)明第二方面，本發(fā)明請求保護一種基于機器學習轉錄組注釋的大語言模型構建系統(tǒng)，包括：

33、第一采集模塊，用于采集轉錄組注釋目標疾病樣本的培養(yǎng)數(shù)據(jù)；其中，所述轉錄組注釋目標疾病樣本包括轉錄組注釋目標疾病樣本中每個轉錄組注釋目標疾病的轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)，所述轉錄組注釋目標疾病數(shù)據(jù)包括轉錄組注釋目標疾病的歸屬數(shù)據(jù)、活性數(shù)據(jù)及免疫抑制數(shù)據(jù)，所述活性數(shù)據(jù)包括所述轉錄組注釋目標疾病屬于已患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本或所述轉錄組注釋目標疾病屬于未患并發(fā)癥轉錄組注釋目標疾病樣本，所述免疫抑制數(shù)據(jù)包括免疫抑制劑、免疫抑制劑作用時長及轉錄組注釋目標疾病失活周期；

34、第二采集模塊，用于采集第一已移植時間段內的m個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)；其中，每個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)包括原位移植動物創(chuàng)建時間和原位移植動物失活周期，所述原位移植動物創(chuàng)建時間為已移植原位移植動物的免疫抑制轉錄組注釋目標疾病被排異的發(fā)生時長，所述原位移植動物失活周期為所述免疫抑制轉錄組注釋目標疾病完成所述已移植原位移植動物返回到所述第一時間戳活性降低的發(fā)生時長；

35、分析和結果得到模塊，用于根據(jù)所述轉錄組注釋目標疾病樣本的培養(yǎng)數(shù)據(jù)、所述m個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)以及第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)進行分析，將所述m個已移植原位移植動物分別選患并發(fā)癥免疫抑制轉錄組注釋目標疾??；并得到免疫深度培養(yǎng)模型數(shù)據(jù)；其中，所述免疫深度培養(yǎng)模型數(shù)據(jù)用于評價所述第一已移植時間段內的轉錄組注釋目標疾病移植成功率；所述第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)包括最短手術執(zhí)行時間、免疫抑制劑上限及免疫抑制劑作用時長上限。

36、本發(fā)明相比現(xiàn)有技術具備如下技術效果：本發(fā)明通過采集轉錄組注釋目標疾病樣本的培養(yǎng)數(shù)據(jù)；?采集第一已移植時間段內的m個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)；?根據(jù)所述轉錄組注釋目標疾病樣本的培養(yǎng)數(shù)據(jù)、所述m個已移植原位移植動物的原位移植動物數(shù)據(jù)以及第一轉錄組注釋目標疾病分化參數(shù)進行分析，將所述m個已移植原位移植動物分別選患并發(fā)癥免疫抑制轉錄組注釋目標疾病，并得到免疫深度培養(yǎng)模型數(shù)據(jù)；通過體外培養(yǎng)分離出來的轉錄組注釋目標疾病細胞之后，利用深度模型分析其細胞活性，在細胞活性滿足第一條件之后，選擇待移植動物的移植位置，以利用立體定向技術實現(xiàn)轉錄組注釋目標疾病細胞的原位移植動物模型構建。