技術(shù)特征:1.一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)模型輔助分析5'?utr對mrna翻譯效率影響的方法,其特征在于,包括如下步驟:
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)模型輔助分析5'?utr對mrna翻譯效率影響的方法,其特征在于,步驟s1中,構(gòu)建5'?utr質(zhì)粒文庫包括:
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)模型輔助分析5'?utr對mrna翻譯效率影響的方法,其特征在于,步驟s2中,luciferase-opt熒光素酶的發(fā)光強(qiáng)度的測定包括:
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)模型輔助分析5'?utr對mrna翻譯效率影響的方法,其特征在于,步驟s4中,模型構(gòu)建的具體步驟包括:
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)模型輔助分析5'?utr對mrna翻譯效率影響的方法,其特征在于,最小二乘回歸樹構(gòu)建公式包括:
技術(shù)總結(jié)本發(fā)明公開了一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)模型輔助分析5'UTR對mRNA翻譯效率影響的方法,涉及合成生物學(xué)及計(jì)算生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,方法包括:S1、構(gòu)建5'UTR質(zhì)粒文庫;S2、將5'UTR質(zhì)粒轉(zhuǎn)錄為單獨(dú)的帶有l(wèi)uciferase?opt熒光素酶的mRNA,以luciferase?opt熒光素酶的發(fā)光強(qiáng)度作為mRNA的翻譯強(qiáng)度;S3、對mRNA進(jìn)行蛋白質(zhì)表達(dá)強(qiáng)度相關(guān)的特征進(jìn)行分析;S4、以步驟S3中分析的特征為基礎(chǔ)構(gòu)建隨機(jī)森林算法模型來預(yù)測5'UTR對mRNA翻譯效率的影響。本發(fā)明一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)模型輔助分析5'UTR對mRNA翻譯效率影響的方法,為后續(xù)mRNA疫苗的開發(fā)中mRNA的序列優(yōu)化提供一個(gè)可行的技術(shù)路線參考,使得mRNA疫苗能夠高效地在機(jī)體中表達(dá)出目的蛋白。
技術(shù)研發(fā)人員:朱海峰,王林豐,劉蘇稼,曾驥,林佳奇
受保護(hù)的技術(shù)使用者:深圳近鄰生物科技有限公司
技術(shù)研發(fā)日:技術(shù)公布日:2025/1/9