專利名稱：一種新型人蛋白分泌相關(guān)因子的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明屬于生物醫(yī)學(xué)專業(yè)領(lǐng)域，涉及一種新型人蛋白分泌相關(guān)因子(ADPribosylation factor GTPase-activating protein 1，簡稱為ARFGAP1)的cDNA序列和氨基酸序列，以及該基因的染色體定位和功能線索。
內(nèi)分泌功能紊亂和男性生殖系統(tǒng)功能紊亂是臨床常見癥狀。此二者在很多程度上與特定蛋白質(zhì)從細(xì)胞內(nèi)向外分泌的途徑有關(guān)。所以，如果能夠找到一種能夠有效地影響或者調(diào)節(jié)此過程(分泌功能紊亂)的因子，則有可能是一個(gè)有效的解決問題的途徑。
本發(fā)明的目的是提供一種新型人蛋白分泌相關(guān)因子。該發(fā)明有可能為臨床上治療內(nèi)分泌功能紊亂和男性生殖功能缺陷提供新的治療途徑。
肝臟所分泌的細(xì)胞因子的種類繁多，尤其在胚胎時(shí)期的肝臟中更是如此。4-6月孕齡的人胎肝是造血、免疫、肝臟系統(tǒng)干祖細(xì)胞的主要來源，表達(dá)基因在各類組織中最為豐富，表明其中存在大量具有醫(yī)學(xué)價(jià)值的活性成分。因此，本發(fā)明以4-6月孕齡的人胎肝為研究材料，按照分子生物學(xué)的常規(guī)技術(shù)，通過富集未知低豐度的mRNA，利用耐高溫反轉(zhuǎn)錄酶獲得全長cDNA并構(gòu)建文庫，對該文庫進(jìn)行大規(guī)模、長序列測定，最終對表達(dá)序列片段(EST)及新基因進(jìn)行功能預(yù)測與驗(yàn)證，從中發(fā)現(xiàn)具有重要功能的人類新基因。該發(fā)明有可能為臨床上治療內(nèi)分泌功能紊亂、男性生殖功能缺陷以及肺功能下降等提供新的治療途徑。
本發(fā)明所提供的新型人蛋白分泌相關(guān)因子具有如下cDNA序列1 ttttcgtcgactcttaccggttggctgggccagctgcgccgcggctcacagctgacgATGGGGGACCCCAGC7273 AAGCAGGACATCTTGACCATCTTCAAGCGCCTCCGCTCGGTGCCCACTAACAAGGTGTGTTTTGATTGTGGT 144145 GCCAAAAATCCCAGCTGGGCAAGCATAACCTATGGAGTGTTCCTTTGCATTGATTGCTCAGGGTCCCACCGG 216217 TCACTTGGTGTTCACTTGAGTTTTATTCGATCTACAGAGTTGGATTCCAACTGGTCATGGTTTCAGTTGCGA 288289 TGCATGCAAGTCGGAGGAAACGCTAGTGCATCTTCCTTTTTTCATCAACATGGGTGTTCCACCAATGACACC 360361 AATGCCAAGTACAACAGTCGTGCTGCTCAGCTCTATAGGGAGAAAATCAAATCGCTCGCCTCTCAAGCAACA 432433 CGGAAGCATGGCACTGATCTGTGGCTTGATAGTTGTGTGGTTCCACCTTTGTCCCCTCCACCAAAGGAGGAA 504505 GATTTTTTTGCCTCTCACGTTTCTCCTGAGGTGAGTGACACAGCGTGGGCATCAGCAATAGCAGAACCATCT 576577 TCTTTAACATCAAGGCCTGTGGAAACCACTTTGGAAAATAATGAAGGTGGACAAGAGCAAGGACCAAGTGTG 648649 GAAGGTCTTAATGTACCAACAAAGGCTACTTTAGAGGTATCCTCTATCATAAAAAAGAAACCAAATCAAGCT 720721 AAAAAAGGCCTTGGGGCCAAAAAAGGAAGTTTGGGAGCTCAGAAACTGGCAAACACATGCTTTAATGAAATT 792793 GAAAAACAAGCTCAAGCTGCGGATAAAATGAAGGAGCAGGAAGACCTGGCCAAGGTGGTATCTAAAGAAGAA 864865 TCAATTGTTTCATCATTACGATTAGCCTATAAGGATCTTGAAATTCAAATGAAGAAAGACGAAAAGATGAAC 936937 ATTAGTGGCAAAAAAAATGTTGACTCAGACAGACTCGGCATGGGATTTGGAAATTGCAGAAGTGTTATTTCA 10081009 CATTCAGTGACTTCAGATATGCAGACCATAGAGCAGGAATCACCCATTATGGCAAAACCAAGAAAAAAGTAT 10801081 AATGATGACAGTGACGATTCATATTTTACTTCCAGCTCAAGTTACTTTGACGAGCCAGTGGAGTTAAGGAGC 11521153 AGTTCTTTCTCTAGCTGGGATGACAGTTCAGATTCCTATTGGAAAAAAGAGACCAGCAAAGATACTGAAACA 12241225 GTTCTGAAAACCACAGGCTATTCAGACAGACCTACTGCTCGCCGCAAGCCAGATTATGAGCCAGTTGAAAAT 12961297 ACAGATGAGGCCCAGAAGAAGTTTGGCAATGTCAAGGCCATTTCATCAGATATGTATTTTGGAAGACAATCC 13681369 CAGGCTGATTATGAGACCAGGGCCCGCCTAGAGAGGCTGTCGGCAAGTTCCTCCATAAGCTCGGCTGATCTG 14401441 TTCGAGGAGCCGAGGAAGCAGCCAGCAGGGAACTACAGCCTGTCCAGTGTGCTGCCCAACGCCCCCGACATG 15121513 GCGCAGTTCAAGCAGGGAGTGAGATCGGTTGCTGGAAAACTCTCCGTCTTTGCTAATGGAGTCGTGACTTCA 15841585 ATTCAGGATCGCTACGGTTCTTAAtactgaagtcatgatgtgtatttcctggagaaattcctctttaaatga 16561657 acaagtaaccacatctcaggcggcagtgaagtccagatagttttgcagattgttttgctactttttcatatg 17281729 gtatatgtttctgatttttaatatttcttttgagaaattctgagttctgatgtaggagctttcctgtgattt 18001801 ctgtttcacgttccttcctgtcacaccctcctttggcgtctctgtgtatatccttgctttattttcttggaa 18721873 cctttgatttcaacactgagggcctggagacctcggctcctcctgctcctgaaccaggaggcttcatgtggg 19441945 ggaggaggagaggtctccatgtgacacatgggctcagggctgccagaatcagcggatgctggatgggcctgc 20162017 agaaacaacactcaccacacacacttccttcaaaagaccaaaagtgactggtgtctcgtgtgacagattgct 20882089 tcatttatgtttctacatagtaaggtgactgccaaataatatttgaagtcatctgtctctttgtaaattatt 21602161 ttatatgacctataaatttaaaaatgtttttcagtgagtgcttttaacaaacttaagcttctgccctgccaa 22322233 gggaattaatgttatcttgtgaaaggtgttgctgtttgaattgatgagaaatggaagatgagaactccctaa 23042305 gagttctcataataaatcatctcatcacaaatcaatacggtatacagagttaaagtggaatgaggtaagaag 23762377 atacagctacagaaaatagttgcgtgtatgggagaacagtcattgtaattgggtagttttgttaataaatat 24482449 ttttaaatcttgcttttcagaaattaccgaatgtgtataaacaaataaagaaaaataatttagctgtgtttt 25202521 agacagcattagaatatattgttcagcacagtaaaatatatttgaaatttgataagccaaaaatgtggtttt 25922593 gaatgaatattttgtgaatctttcttaaaagctcaaatttgtagacttctaaatagaataaacacttgcagc 26642665 aga(102) 2768據(jù)此，本發(fā)明所提供的新型人蛋白分泌相關(guān)因子具有如下氨基酸序列1 MGDPSKQDILTIFKRLRSVPTNKVCFDCGAKNPSWASITYGVF4344 LCIDCSGSHRSLGVHLSFIRSTELDSNWSWFQLRCMQVGGNAS8687 ASSFFHQHGCSTNDTNAKYNSRAAQLYREKIKSLASQATRKHG 129130 TDLWLDSCVVPPLSPPPKEEDFFASHVSPEVSDTAWASAIAEP 172173 SSLTSRPVETTLENNEGGQEQGPSVEGLNVPTKATLEVSSIIK 215216 KKPNQAKKGLGAKKGSLGAQKLANTCFNEIEKQAQAADKMKEQ 258259 EDLAKVVSKEESIVSSLRLAYKDLEIQMKKDEKMNISGKKNVD 301302 SDRLGMGFGNCRSVISHSVTSDMQTIEQESPIMAKPRKKYNDD 344345 SDDSYFTSSSSYFDEPVELRSSSFSSWDDSSDSYWKKETSKDT 387388 ETVLKTTGYSDRPTARRKPDYEPVENTDEAQKKFGNVKAISSD 430431 MYFGRQSQADYETRARLERLSASSSISSADLFEEPRKQPAGNY 473474 SLSSVLPNAPDMAQFKQGVRSVAGKLSVFANGVVTSIQDRYGS 516據(jù)此，本發(fā)明所提供的新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的基因定位于人染色體22q13.2～13.3。該染色體定位來自于RH技術(shù)的結(jié)果，具體而言，基于該基因3＇-非編碼區(qū)(2059-2419)設(shè)計(jì)引物，獲得一組向量數(shù)據(jù)＂00000 00100 00101 0010001011 00000 10001 00000 00110 11000 00001 11110 00000 01110 0011010000 01011 11000 000＂，聯(lián)網(wǎng)向Whitehead Institute/MIT Center for GenomeResearch的Radiation Hybrid Mapper Server＂http:∥www-genome.wi.mit.edu/cgi-bin/contig/rhmapper.pl＂提交后獲得上述精確的基因定位。
本發(fā)明所提供的新型人蛋白分泌相關(guān)因子的基因組序列全長60千核苷酸對，含有16個(gè)外顯子，15個(gè)內(nèi)含子。按照GB4map數(shù)據(jù)格式，該基因組序列位于定位標(biāo)志D22S272(39.5cM)和定位標(biāo)志D22S274(45.5cM)之間，遺傳距離6cM，物理距離17cR3000，按照G3map數(shù)據(jù)格式，位于定位標(biāo)志D22S272(39.5cM)和定位標(biāo)志D22S274(45.5cM)之間，遺傳距離6cM，物理距離391cR10000。
本發(fā)明所提供的新型人蛋白分泌相關(guān)因子的氨基酸序列中含有ARFGAP家族的特征結(jié)構(gòu)。該因子的氨基端第6～126位含有典型的ARFGAP結(jié)構(gòu)域，該結(jié)構(gòu)域?qū)ζ渌哂械腁RFGAP催化活性起決定作用，催化的核心部位是一個(gè)鋅指結(jié)構(gòu)(CX2CX16CX2C)。ARFGAP1的羧基端含有一個(gè)重復(fù)序列“SISSX3FG”，該特點(diǎn)同時(shí)存在于ARFGAP家族其它成員中，此特征序列可能和ARF GAP向特定細(xì)胞內(nèi)膜結(jié)構(gòu)的定向作用有關(guān)。本發(fā)明所提供的新型人蛋白分泌相關(guān)因子所具有的可與ARF發(fā)生反應(yīng)的疏水性殘基也具有一定的保守性，從而將該基因歸類于ARFGAP家族中，屬于其中的一個(gè)新成員。
本發(fā)明所提供的新型人蛋白分泌相關(guān)因子具有以下生物學(xué)特性分子量為56.928千道爾頓，等電點(diǎn)為7.12。該因子在人內(nèi)分泌組織(至少包括胰腺、腎上腺、垂體、唾液腺、前列腺、甲狀腺、乳腺)和睪丸中高表達(dá)，在成人肺中的表達(dá)量是胎肺中的一倍，可能具有通過活化內(nèi)分泌組織(至少包括胰腺、腎上腺、垂體、唾液腺、前列腺、甲狀腺、乳腺)和睪丸內(nèi)ARF蛋白以促進(jìn)細(xì)胞內(nèi)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)及其向細(xì)胞外的分泌，從而調(diào)節(jié)人體內(nèi)分泌系統(tǒng)、睪丸的功能，同時(shí)該基因可能與成人肺中Ⅱ型細(xì)胞合成并分泌肺表面活性物質(zhì)從而保證成人肺的正常功能有關(guān)。
以下為結(jié)合附圖進(jìn)一步說明本發(fā)明

圖1新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的cDNA序列圖2新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列圖3新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的基因結(jié)構(gòu)圖4新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的外顯子和內(nèi)含子的剪接形式圖5新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的cDNA序列與GenBank核酸數(shù)據(jù)庫全序列相似性比較結(jié)果圖6新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的cDNA序列與GenBank EST庫同源性比較結(jié)果圖7新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列與GenBank蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫全序列相似性比較結(jié)果圖8新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列的多重序列對齊分析圖9新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列的模體(Motif)分析圖10新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列的結(jié)構(gòu)、功能域分析圖11新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列的組織表達(dá)譜分析圖12新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列的轉(zhuǎn)錄本分析圖1為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的cDNA序列，其中的大寫字母表示其開放閱讀框架(Open reading frame,ORF)。
圖2為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列，表示該基因的編碼產(chǎn)物共有516個(gè)氨基酸。
圖3為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的基因結(jié)構(gòu)，表示具有16個(gè)外顯子，15個(gè)內(nèi)含子。
圖4為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的外顯子和內(nèi)含子的剪接形式。
圖5為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的cDNA序列與GenBank核酸數(shù)據(jù)庫全序列相似性比較結(jié)果，說明該基因的cDNA序列與來源于染色體22q13.2-13.33的一段DNA序列高度相似，從而提示了該基因的染色體定位。
圖6為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的cDNA序列與GenBank EST庫同源性比較結(jié)果，說明該基因的cDNA在GenBank的EST數(shù)據(jù)庫中具有較多的EST序列。
圖7為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列與GenBank蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫全序列相似性比較結(jié)果，說明該基因的蛋白質(zhì)全長序列中包括了兩個(gè)氨基酸序列(注冊號CAB51394和CAB51393)。后者是Sanger測序中心根據(jù)基因組序列(注冊號AL049757)用計(jì)算機(jī)分析得到的核酸編碼產(chǎn)物。顯然，本專利申請中所涉及的ARFGAP1基因的編碼產(chǎn)物是真正的編碼產(chǎn)物。
圖8為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列的多重序列對齊分析，說明將ARFGAP1基因歸類于ARFGAP家族中的證據(jù)。
圖9為使用Omiga軟件(2.0版)對新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1氨基酸序列進(jìn)行分析的結(jié)果，發(fā)現(xiàn)該氨基酸序列中共有42個(gè)已知的結(jié)構(gòu)模體(Motif)。
圖10為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列的結(jié)構(gòu)、功能域分析，說明將ARFGAP1基因歸類于ARFGAP家族中的證據(jù)。
圖11為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列的組織表達(dá)譜分析，說明ARFGAP1基因在內(nèi)分泌組織個(gè)睪丸組織中高表達(dá)。A1全腦；A2杏仁核；A3尾狀核；A4小腦；A5大腦皮質(zhì)；A6額葉；A7海馬；A8延髓；BI枕葉；B2殼核；B3黑質(zhì)；B4顳葉；B5丘腦；B6丘腦下核；B7脊髓；C1心；C2主動脈；C3骨骼?。籆4結(jié)腸；C5膀胱；C6子宮；C7前列腺；C8胃；D1睪丸；D2卵巢；D3胰腺；D4垂體；D5腎上腺；D6甲狀腺；D7唾液腺；D8乳腺；E1腎；E2肝；E3小腸；E4脾；E5胸腺；E6外周淋巴細(xì)胞；E7淋巴結(jié)；E8骨髓；F1闌尾；F2肺；F3氣管；F4胎盤；G1胎腦；G2胎心；G3胎腎；G4胎肝；G5胎脾；G6胚胎胸腺；G7胎肺.
圖12為新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAP1的氨基酸序列的轉(zhuǎn)錄本分析，說明ARFGAP1基因只有一個(gè)轉(zhuǎn)錄本。A.胎腦，胎肺，胎肝和胎腎、B成淋巴細(xì)胞白血病細(xì)胞系MOLT-4，慢性骨髓性白血病細(xì)胞系K-562,Hela細(xì)胞系S3，結(jié)腸-直腸腺癌細(xì)胞系SW480，肺癌細(xì)胞系A(chǔ)549，原髓細(xì)胞性白血病細(xì)胞系HL-60，黑色素瘤細(xì)胞系G-361。
權(quán)利要求
1.本發(fā)明所提供的新型人蛋白分泌相關(guān)因子具有如下cDNA序列1 ttttcgtcgactcttaccggttggctgggccagctgcgccgcggctcacagctgacgATGGGGGACCCCAGC7273 AAGCAGGACATCTTGACCATCTTCAAGCGCCTCCGCTCGGTGCCCACTAACAAGGTGTGTTTTGATTGTGGT 144145 GCCAAAAATCCCAGCTGGGCAAGCATAACCTATGGAGTGTTCCTTTGCATTGATTGCTCAGGGTCCCACCGG 216217 TCACTTGGTGTTCACTTGAGTTTTATTCGATCTACAGAGTTGGATTCCAACTGGTCATGGTTTCAGTTGCGA 288289 TGCATGCAAGTCGGAGGAAACGCTAGTGCATCTTCCTTTTTTCATCAACATGGGTGTTCCACCAATGACACC 360361 AATGCCAAGTACAACAGTCGTGCTGCTCAGCTCTATAGGGAGAAAATCAAATCGCTCGCCTCTCAAGCAACA 432433 CGGAAGCATGGCACTGATCTGTGGCTTGATAGTTGTGTGGTTCCACCTTTGTCCCCTCCACCAAAGGAGGAA 504505 GATTTTTTTGCCTCTCACGTTTCTCCTGAGGTGAGTGACACAGCGTGGGCATCAGCAATAGCAGAACCATCT 576577 TCTTTAACATCAAGGCCTGTGGAAACCACTTTGGAAAATAATGAAGGTGGACAAGAGCAAGGACCAAGTGTG 648649 GAAGGTCTTAATGTACCAACAAAGGCTACTTTAGAGGTATCCTCTATCATAAAAAAGAAACCAAATCAAGCT 720721 AAAAAAGGCCTTGGGGCCAAAAAAGGAAGTTTGGGAGCTCAGAAACTGGCAAACACATGCTTTAATGAAATT 792793 GAAAAACAAGCTCAAGCTGCGGATAAAATGAAGGAGCAGGAAGACCTGGCCAAGGTGGTATCTAAAGAAGAA 864865 TCAATTGTTTCATCATTACGATTAGCCTATAAGGATCTTGAAATTCAAATGAAGAAAGACGAAAAGATGAAC 936937 ATTAGTGGCAAAAAAAATGTTGACTCAGACAGACTCGGCATGGGATTTGGAAATTGCAGAAGTGTTATTTCA 10081009 CATTCAGTGACTTCAGATATGCAGACCATAGAGCAGGAATCACCCATTATGGCAAAACCAAGAAAAAAGTAT 10801081 AATGATGACAGTGACGATTCATATTTTACTTCCAGCTCAAGTTACTTTGACGAGCCAGTGGAGTTAAGGAGC 11521153 AGTTCTTTCTCTAGCTGGGATGACAGTTCAGATTCCTATTGGAAAAAAGAGACCAGCAAAGATACTGAAACA 12241225 GTTCTGAAAACCACAGGCTATTCAGACAGACCTACTGCTCGCCGCAAGCCAGATTATGAGCCAGTTGAAAAT 12961297 ACAGATGAGGCCCAGAAGAAGTTTGGCAATGTCAAGGCCATTTCATCAGATATGTATTTTGGAAGACAATCC 13681369 CAGGCTGATTATGAGACCAGGGCCCGCCTAGAGAGGCTGTCGGCAAGTTCCTCCATAAGCTCGGCTGATCTG 14401441 TTCGAGGAGCCGAGGAAGCAGCCAGCAGGGAACTACAGCCTGTCCAGTGTGCTGCCCAACGCCCCCGACATG 15121513 GCGCAGTTCAAGCAGGGAGTGAGATCGGTTGCTGGAAAACTCTCCGTCTTTGCTAATGGAGTCGTGACTTCA 15841585 ATTCAGGATCGCTACGGTTCTTAAtactgaagtcatgatgtgtatttcctggagaaattcctctttaaatga 16561657 acaagtaaccacatctcaggcggcagtgaagtccagatagttttgcagattgttttgctactttttcatatg 17281729 gtatatgtttctgatttttaatatttcttttgagaaattctgagttctgatgtaggagctttcctgtgattt 18001801 ctgtttcacgttccttcctgtcacaccctcctttggcgtctctgtgtatatccttgctttattttcttggaa 18721873 cctttgatttcaacactgagggcctggagacctcggctcctcctgctcctgaaccaggaggcttcatgtggg 19441945 ggaggaggagaggtctccatgtgacacatgggctcagggctgccagaatcagcggatgctggatgggcctgc 20162017 agaaacaacactcaccacacacacttccttcaaaagaccaaaagtgactggtgtctcgtgtgacagattgct 20882089 tcatttatgtttctacatagtaaggtgactgccaaataatatttgaagtcatctgtctctttgtaaattatt 21602161 ttatatgacctataaatttaaaaatgtttttcagtgagtgcttttaacaaacttaagcttctgccctgccaa 22322233 gggaattaatgttatcttgtgaaaggtgttgctgtttgaattgatgagaaatggaagatgagaactccctaa 23042305 gagttctcataataaatcatctcatcacaaatcaatacggtatacagagttaaagtggaatgaggtaagaag 23762377 atacagctacagaaaatagttgcgtgtatgggagaacagtcattgtaattgggtagttttgttaataaatat 24482449 ttttaaatcttgcttttcagaaattaccgaatgtgtataaacaaataaagaaaaataatttagctgtgtttt 25202521 agacagcattagaatatattgttcagcacagtaaaatatatttgaaatttgataagccaaaaatgtggtttt 25922593 gaatgaatattttgtgaatctttcttaaaagctcaaatttgtagacttctaaatagaataaacacttgcagc 26642665 aga(102)2768
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的新型人蛋白分泌相關(guān)因子具有如下氨基酸序列1 MGDPSKQDILTIFKRLRSVPTNKVCFDCGAKNPSWASITYGVF4344 LCIDCSGSHRSLGVHLSFIRSTELDSNWSWFQLRCMQVGGNAS8687 ASSFFHQHGCSTNDTNAKYNSRAAQLYREKIKSLASQATRKHG 129130 TDLWLDSCVVPPLSPPPKEEDFFASHVSPEVSDTAWASAIAEP 172173 SSLTSRPVETTLENNEGGQEQGPSVEGLNVPTKATLEVSSIIK 215216 KKPNQAKKGLGAKKGSLGAQKLANTCFNEIEKQAQAADKMKEQ 258289 EDLAKVVSKEESIVSSLRLAYKDLEIQMKKDEKMNISGKKNVD 301302 SDRLGMGFGNCRSVISHSVTSDMQTIEQESPIMAKPRKKYNDD 344345 SDDSYFTSSSSYFDEPVELRSSSFSSWDDSSDSYWKKETSKDT 387388 ETVLKTTGYSDRPTARRKPDYEPVENTDEAQKKFGNVKAISSD 430431 MYFGRQSQADYETRARLERLSASSSISSADLFEEPRKQPAGNY 473474 SLSSVLPNAPDMAQFKQGVRSVAGKLSVFANGVVTSIQDRYGS 516
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAPI的基因定位于人染色體22q13.2～13.3。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的新型人蛋白分泌相關(guān)因子的基因組序列全長60千核苷酸對。按照GB4map數(shù)據(jù)格式，該基因組序列位于定位標(biāo)志D22S272(39.5cM)和定位標(biāo)志D22S274(45.5cM)之間，遺傳距離6cM，物理距離17cR3000，按照G3map數(shù)據(jù)格式，位于定位標(biāo)志D22S272(39.5cM)和定位標(biāo)志D22S274(45.5cM)之間，遺傳距離6cM，物理距離391cR10000。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的新型人蛋白分泌相關(guān)因子的基因組序列其特征可以是具有異常的基因組序列。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的新型人蛋白分泌相關(guān)因子具有16個(gè)外顯子，15個(gè)內(nèi)含子，其組織結(jié)構(gòu)如下
7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的新型人蛋白分泌相關(guān)因子具有16個(gè)外顯子，15個(gè)內(nèi)含子，而且16個(gè)外顯子和15個(gè)內(nèi)含子的剪接形式如下本發(fā)明所提供的新型人蛋白分泌相關(guān)因子基因的外顯子和內(nèi)含子剪接形式*
*大寫字母表示外顯子，小寫字母表示內(nèi)含子
8.根據(jù)權(quán)利要求1所述的新型人蛋白分泌相關(guān)因子具有以下生物學(xué)特性新型人蛋白分泌相關(guān)因子蛋白質(zhì)的分子量為56.928千道爾頓，等電點(diǎn)為7.12。新型人蛋白分泌相關(guān)因子ARFGAPI在人內(nèi)分泌組織，至少包括胰腺、腎上腺、垂體、唾液腺、前列腺、甲狀腺、乳腺和睪丸中高表達(dá)，在成人肺中的表達(dá)量是胎肺中的一倍，可能具有通過活化內(nèi)分泌組織至少包括胰腺、腎上腺、垂體、唾液腺、前列腺、甲狀腺、乳腺和睪丸內(nèi)ARF蛋白以促進(jìn)細(xì)胞內(nèi)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)及其向細(xì)胞外的分泌，從而調(diào)節(jié)人體內(nèi)分泌系統(tǒng)、睪丸的功能，同時(shí)該基因可能與成人肺中Ⅱ型細(xì)胞合成并分泌肺表面活性物質(zhì)從而保證成人肺的正常功能有關(guān)。
全文摘要
本發(fā)明提供了一種新型人蛋白分泌相關(guān)因子的cDNA序列及其所編碼的氨基酸序列及其可能的功能。其cDNA序列全長為2768個(gè)堿基。其氨基酸序列全長為516個(gè)氨基酸。該基因定位于人染色體22q13.2～13.3,基因組序列全長60千核苷酸對,外顯子16個(gè),內(nèi)含子15個(gè)。新型人蛋白分泌相關(guān)因子在人內(nèi)分泌組織和睪丸中高表達(dá),在成人肺中的表達(dá)量是胎肺中的一倍,可能具有通過活化ARF蛋白以促進(jìn)細(xì)胞內(nèi)蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)及其向細(xì)胞外的分泌,從而調(diào)節(jié)人體內(nèi)分泌系統(tǒng)、睪丸和成人肺的功能。
文檔編號C07K14/435GK1307001SQ00100738
公開日2001年8月8日 申請日期2000年2月2日 優(yōu)先權(quán)日2000年2月2日
發(fā)明者賀福初, 張成崗, 魚詠濤, 邢桂春, 魏漢東, 劉曉勤, 張紹文, 歐陽曙光, 羅凌, 劉孟珉, 吳祖澤 申請人:中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院放射醫(yī)學(xué)研究所