專(zhuān)利名稱(chēng)：一段淋球菌dna序列(2)特異性的確定及其應(yīng)用的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)DNA序列(2)特異性的確定及其應(yīng)用，屬于生物醫(yī)學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。
本發(fā)明的技術(shù)方案為本發(fā)明利用現(xiàn)有的方法確定了長(zhǎng)度為204bp的一段淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)特異DNA序列(2)及其PCR引物，用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，其序列如下gcaccctaga cctgttggaa accaagacca aaggtttgac actggaaaat tgcccagtcg 60agaacagcaa agcaacgcgg gtatgcgtag cgaccgagaa gcgaatgctg gacgcgttag 120cggaattaga gagcaatcac gcagcaatcg agcagcgaat gatgaaagcc ttaacgcact 180tgggcgaaag gttggcagag crag204引物序列為1. 5’-ctagctctgccaacctttcg-3’2. 5’- gcaccctagacctgttggaa-3’上述淋球菌特異DNA序列(2)用于診斷淋球菌的基因芯片的探針序列，并通過(guò)上述的引物序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增，標(biāo)記后進(jìn)行雜交檢測(cè)或直接用于PCR診斷。
用本發(fā)明建立的臨床檢測(cè)技術(shù)所使用的方法具有快速、準(zhǔn)確、操作簡(jiǎn)便、成本低等優(yōu)點(diǎn)。
圖2、圖2續(xù)是測(cè)序圖。其中圖2是測(cè)定的序列、圖2續(xù)是原始測(cè)序圖譜。
圖3是用Blast軟件對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測(cè)序結(jié)果與預(yù)計(jì)序列的比較分析。
圖4、圖4續(xù)是基因數(shù)據(jù)庫(kù)中Blast搜索結(jié)果。
圖5是基因芯片雜交結(jié)果。
本發(fā)明可用于PCR方法或基因芯片方法進(jìn)行淋球菌的臨床檢測(cè)。用本發(fā)明提供的序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增，根據(jù)PCR方法獲得產(chǎn)物是否出現(xiàn)和大小判斷是否為淋球菌感染。也可用本序列為探針，作為基因芯片中的一個(gè)檢測(cè)位點(diǎn)，然后用本發(fā)明中的PCR引物序列擴(kuò)增臨床標(biāo)本，并標(biāo)記后進(jìn)行雜交檢測(cè)。
說(shuō)明書(shū)序列表<110>昆明寰基生物芯片開(kāi)發(fā)有限公司<120>一段淋球菌DNA序列(2)特異性的確定及其應(yīng)用<140><141><160>1<210>1<211>204<212>DNA<213>淋球菌(Neisseria gonorrhoeae)<220><221>gene<222>(1)…(204)<400>1gcaccctaga cctgttggaa accaagacca aaggtttgac actggaaaat tgcccagtcg 60agaacagcaa agcaacgcgg gtatgcgtag cgaccgagaa gcgaatgctg gacgcgttag 120cggaattaga gagcaatcac gcagcaatcg agcagcgaat gatgaaagcc ttaacgcact 180tgggcgaaag gttggcagag ctag20權(quán)利要求
1.一段淋球菌DNA序列(2)特異性的確定，其特征在于該序列的長(zhǎng)度為204bp，，其序列及PCR引物如下gcaccctaga cctgttggaa accaagacca aaggtttgac actggaaaat tgcccagtcg 60agaacagcaa agcaacgcgg gtatgcgtag cgaccgagaa gcgaatgctg gacgcgttag 120cggaattaga gagcaatcac gcagcaatcg agcagcgaat gatgaaagcc ttaacgcact 180tgggcgaaag gttggcagag ctag204引物序列為1. 5’-ctagctctgccaacctttcg-3’2. 5’-gcaccctagacctgttggaa-3’
2.一段淋球菌DNA序列(2)特異性的應(yīng)用，其特征在于該序列用于診斷淋球菌的基因芯片的探針序列，并通過(guò)上述的引物序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增，標(biāo)記后進(jìn)行雜交檢測(cè)或直接用于PCR診斷。
全文摘要
本發(fā)明涉及一段淋球菌DNA序列(2)特異性的確定及其應(yīng)用，屬于生物醫(yī)學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明通過(guò)基因數(shù)據(jù)庫(kù)資料的搜尋和分析，確定了一段淋球菌DNA序列(2)的特異性及PCR擴(kuò)增引物，該序列長(zhǎng)度為204bp。通過(guò)對(duì)人類(lèi)生殖道淋球菌感染標(biāo)本的PCR擴(kuò)增，克隆，獲得該序列，測(cè)序證明與預(yù)計(jì)序列一致。再經(jīng)生物信息學(xué)方法分析，基因芯片雜交分析，結(jié)果證實(shí)了該序列對(duì)于淋球菌的特異性。本發(fā)明作為基因芯片診斷的探針及PCR擴(kuò)增檢測(cè)序列，用于淋球菌的診斷。用本發(fā)明建立的臨床檢測(cè)技術(shù)所使用的方法具有快速、準(zhǔn)確、操作簡(jiǎn)便、成本低等優(yōu)點(diǎn)。
文檔編號(hào)C07H21/04GK1465714SQ0213337
公開(kāi)日2004年1月7日 申請(qǐng)日期2002年6月26日 優(yōu)先權(quán)日2002年6月26日
發(fā)明者譚德勇, 朱寶生 申請(qǐng)人:昆明寰基生物芯片開(kāi)發(fā)有限公司