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治療、診斷或檢測與liv-1過量表達相關的癌癥的方法

文檔序號:3561155閱讀:2117來源:國知局

專利名稱::治療、診斷或檢測與liv-1過量表達相關的癌癥的方法
技術領域
:本發(fā)明總體上涉及腫瘤學領域。更具體地,本發(fā)明涉及治療癌癥的方法,治療癌癥的組合物以及用于診斷和/或檢測癌癥的方法和組合物。
背景技術
:癌癥是美國第二的主要死亡原因。雖然"癌癥"常被用于描述許多不同類型的癌癥,即乳腺癌、前列腺癌、肺癌、結腸癌、胰腺癌,每一種類型的腫瘤在表型水平和遺傳水平都是不同的。當一個或多個基因的表達由于突變而變得失調(diào)且細胞生長不再受到控制時,就會發(fā)生癌癥的失調(diào)生長特征。通常將基因分為兩類癌基因和肺瘤抑制基因。癌基因是其正常功能是只在特定條件下促進細胞生長的基因。當癌基因獲得了突變并然后喪失這一控制時,它會在所有條件下都促進生長。然而,已經(jīng)發(fā)現(xiàn),對于癌癥要真正成功來說,癌癥還必須需要在胂瘤抑制基因中的突變。腫瘤抑制基因的正常功能是阻止細胞生長。肺瘤抑制基因的例子包括p53、p16、p21和APC,所有這些在正常作用時均阻止細胞免于不受控制地分裂和生長。當肺瘤抑制基因突變或喪失時,細胞生長的剎車也喪失了,使得細胞現(xiàn)在可以不受限制的生長。鋅是細胞生長所需要的,并且也是超過300種酶的輔因子。鋅參與蛋白、核酸、碳水化合物和脂代謝。鋅在基因轉錄、生長、發(fā)育和分化的控制中也起著重要作用(Vallee和Falchuk(1993)Physiol.Rev.73,79-118)。在哺乳動物中,鋅缺乏是有害的,會引起發(fā)育障礙和嚴重的代謝疾病(Truong-Tran等,(2001)Biometals14,315-330)。過量的鋅也會對細胞有毒(Koh等,(1996)Science272,1013-1016)。鋅不能被動地擴散穿過細胞膜。因此,需要特定的鋅轉運蛋白來將鋅轉運入細胞。因為鋅對細胞生長非常重要,因此鋅轉運蛋白在維持細胞凋亡和細胞生長之間的細胞平衡中起著重要的作用。細胞平衡的失常能夠導致癌癥(Taylor等,Biochem.J.(2003)375,51-59)。真核生物具有許多不同的鋅轉運蛋白。迄今為止,研究得最多的鋅轉運蛋白屬于ZIP或CDF(陽離子擴散家族)轉運蛋白家族。ZIP轉運蛋白定位于質(zhì)膜上并作為鋅流入轉運蛋白,或定位于細胞內(nèi)膜上并允許它們從這些結構中動員儲存。ZIP家族由至少86個成員組成并且可分為4個獨立的亞家族ZIP亞家族I(有1個已知的人類成員)、ZIP亞家族II(有3個已知的人類成員)、gufa亞家族(有2個已知的人類成員)、以及LIV-1亞家族(有9個已知的人類成員)(Gaither和Eide(2001),Biometals14,251-270)。LIV-1也被稱為Zip6,是鋅轉運蛋白,其作為這樣的基因得到鑒定,即它的表達受到某些乳腺癌細胞的雌激素治療的刺激(Manning等,(1988),Mol.Cell.Endocrinol.59,205-212)。已顯示出LIV隱1屬于ZIP(Zrt-、Irt-樣蛋白)鋅轉運蛋白的4皮命名為LZT(ZIP鋅轉運蛋白LIV-1亞家族)的亞家族(Taylor和Nicholson(2003)Biochim.Biophys.ActaBiomembr.1611,16-30)。這些轉運蛋白含有與在代謝中具有已知功能的存在于基質(zhì)金屬蛋白酶的基序類似的潛在金屬蛋白酶基序(Itoh和Nagase,(2002),EssaysBiochem.38,21-36)。LIV-1mRNA的表達顯示出與乳腺癌至局部淋巴結的擴散相關。LIV-1結構顯示出它是富含組氨酸的并且至少具有結合和/或轉運Zn2+離子的可能性(Taylor,(2000),ZUBMBLife49:249-253)。脊推動物的原腸胚形成是身體建立中的關鍵步驟。上皮-間充質(zhì)細胞轉變(EMT)發(fā)生在原腸胚形成過程中。EMT是胚胎發(fā)育、器官和組織再生以及肺瘤轉移的中心事件之一。轉錄的信號轉導物和激活子(STATs)介導了在各種生物過程中應答細胞因子和生長因子的包括細胞增殖、分化和存活的生物學作用。STATs在原腸胚形成、器官發(fā)生、傷口愈合和癌演進過程中的EMT中也是重要的。已顯示STAT3在斑馬魚原腸胚形成過程中被激活并且其活性對于原腸胚形成活動非常重要。然而,在EMT中STAT作用的分子機制還沒有被完全闡述明白。LIV1是STAT3在EMT中的下游靶標,并且其在鋅指蛋白Snail(EMT的主調(diào)節(jié)劑)的核定位中也很重要。然而,迄今為止LIV-1在癌癥中的作用還沒有被完全闡述明白。需要鑒定調(diào)控LIV-1的組合物和方法。本發(fā)明涉及這些以及其它重要需求。發(fā)明概述在一些方面,本發(fā)明提供了包含LIV-1調(diào)節(jié)劑和一種或多種可藥用載體的組合物。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是分離的雙鏈RNA(dsRNA)。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是包含SEQIDNO:l序列的至少IO個連續(xù)核苷酸的分離的寡核苷酸。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是結合LIV-1結構域中的表位的抗體,所述LIV-1結構域選自LIV-1的N-端細胞外結構域、在跨膜結構域(TM)2和3之間的LIV-1細胞外結構域、在TM4和5之間的LIV-1細胞外結構域、在TM6和7之間的LIV-1細胞外結構域、以及LIV-1的C-端細胞外結構域。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是dsRNA、siRNA、shRNA或反義寡核苷酸。在一些方面,本發(fā)明提供了在有需要的患者中治療癌癥或癌癥癥狀的方法,包括給患者施與治療有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑。在一些方面,本發(fā)明提供了在患者中調(diào)節(jié)LIV-1相關生物學活性的方法,包括給患者施與調(diào)節(jié)LIV-1相關生物學活性有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑。在一些方面,本發(fā)明提供了鑒定對LIV-1治療敏感的患者的方法,包括檢測在患者樣本中存在或不存在LIV-1的差異表達,如果患者是LIV-1治療的候選者則給患者施與治療有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑;如果患者不是LIV-1治療的候選者則給患者施與常規(guī)的癌癥治療。在一些方面,本發(fā)明提供了抑制表達LIV-1的癌細胞生長的方法,包括將抑制細胞生長有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑與細胞接觸。在一些方面,本發(fā)明提供了在表達LIV-1的細胞群中抑制癌細胞表型的方法,包括給細胞群施與抑制癌細胞表型有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑。在一些方面,本發(fā)明提供了在樣本中檢測一種或多種表達LIV-1的癌細胞的方法,包括將樣本與包含和顯像劑連接的LIV-1調(diào)節(jié)劑的組合物接觸并檢測顯像劑在樣本中的定位。在一些方面,本發(fā)明提供了抑制兩個或多個細胞(其中至少一個細胞表達LIV-1)相互作用的方法,包括給包含細胞的樣本施與有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑。在一些方面,本發(fā)明提供了在CHO或骨髓瘤細胞中表達抗LIV-1抗體的方法。在一些實施方案中,抗LIV-1抗體抑制一種或多種LIV-1相關生物學活性。在一些實施方案中,該方法包括在CHO或骨髓瘤細胞中表達編碼抗LIV-1抗體的核酸。在一些方面,本發(fā)明提供了鑒定癌抑制劑的方法,包括將表達LIV-1的細胞與候選化合物和LIV-1配體接觸,并檢測LIV-1相關鋅轉運活性是否被抑制。在一些實施方案中,LIV-1相關鋅轉運活性的抑制是癌抑制劑的指標。在一些方面,本發(fā)明提供了鑒定癌抑制劑的方法,包括將表達LIV-1的細胞與候選化合物和LIV-1配體接觸,并檢測LIV-1下游標志物是否被抑制。在一些實施方案中,下游標志物的抑制是癌抑制劑的指標。在一些方面,本發(fā)明提供了確定患者對LIV-1調(diào)節(jié)劑敏感性的方法,包括在所述患者的癌樣本中檢測LIV-1差異表達的證據(jù)。在一些實施方案中,LIV-1差異表達的證據(jù)是患者對LIV-1調(diào)節(jié)劑敏感性的指標。在一些方面,本發(fā)明提供了從包含LIV-1蛋白的樣本中純化LIV-1蛋白的方法,包括提供包含結合至固體支持物的LIV-1抗體的親和基質(zhì),將樣本與親和基質(zhì)接觸以形成親和基質(zhì)-LIV-l蛋白復合體;從樣本剩^^物中分離親和基質(zhì)-LIV-l蛋白復合體;以及從親和基質(zhì)釋放LIV-1蛋白。在一些方面,本發(fā)明提供了將細胞毒劑或診斷劑遞送至一個或多個表達LIV-1的細胞的方法,該方法包括提供與LIV-1抗體或其片段綴合的細胞毒劑或診斷劑,并且將細胞暴露于抗體-劑或片段-劑綴合物。在一些方面,本發(fā)明提供了確定癌癥患者預后的方法,包括確定患者樣本中LIV-1-S對LIV-1的比值。在一些實施方案中,應用LIV-1-S對LIV-1的比值來確定癌癥患者的預后。在一些方面,本發(fā)明提供了確定癌癥患者預后的方法,包括在患者樣本中檢測結合至細胞質(zhì)膜的LIV-1的存在或不存在。在一些實施方案中,患者樣本中結合至細胞質(zhì)膜的LIV-1的不存在是患者良好預后的指標。在一些方面,本發(fā)明提供了包含鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑和一種或多種可藥用載體的組合物。在一些實施方案中,鋅轉運蛋白是分離的雙鏈RNA(dsRNA)。在一些實施方案中,鋅轉運蛋白是包含選自SEQIDNO:383-385的序列的至少IO個連續(xù)核苷酸的分離的寡核苷酸。在一些實施方案中,鋅轉運蛋白是結合鋅轉運蛋白結構域中的表位的抗體,所述鋅轉運蛋白結構域選自N-端細胞外結構域、在跨膜結構域(TM)2和3之間的細胞外結構域、在TM4和5之間的細胞外結構域、在TM6和7之間的細胞外結構域、以及C-端細胞外結構域。在一些實施方案中,鋅轉運蛋白是SLC39A10、SLC39A11或SLC39A13。在一些方面,本發(fā)明提供了在有需要的患者中治療癌癥或癌癥癥狀的方法,包括給患者施與治療有效量的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑。在一些方面,本發(fā)明提供了在患者中調(diào)節(jié)鋅轉運蛋白相關生物學活性的方法,包括給患者施與調(diào)節(jié)鋅轉運蛋白相關生物學活性有效量的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑。在一些方面,本發(fā)明提供了抑制表達鋅轉運蛋白的癌細胞生長的方法,包括將抑制細胞生長有效量的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑與細胞接觸。在一些方面,本發(fā)明提供了在樣本中檢測一種或多種表達鋅轉運蛋白的癌細胞的方法,包括將樣本與包含和顯像劑連接的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑的組合物接觸并檢測顯像劑在樣本中的定位。在一些方面,本發(fā)明提供了抑制兩個或多個細胞(其中至少一個細胞表達鋅轉運蛋白)相互作用的方法,包括給包含細胞的樣本施與有效量的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑。在一些方面,本發(fā)明提供了鑒定癌抑制劑的方法,癌癥的特征在于與對照相比鋅轉運蛋白的過量表達。在一些實施方案中,該方法包括將表達鋅轉運蛋白的細胞與候選化合物和鋅轉運蛋白配體接觸,并檢測鋅轉運活性是否被抑制。在一些實施方案中,鋅轉運活性的抑制是癌抑制劑的指標。在一些方面,本發(fā)明提供了鑒定癌抑制劑的方法,癌癥的特征在于與對照相比鋅轉運蛋白的過量表達。在一些實施方案中,該方法包括將表達鋅轉運蛋白的細胞與候選化合物和鋅轉運蛋白配體接觸,并檢測鋅轉運蛋白的下游標志物是否被抑制。在一些實施方案中,下游標志物的抑制是癌抑制劑的指標。在一些方面,本發(fā)明提供了確定患者對鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑敏感性的方法,包括在患者的癌樣本中檢測鋅轉運蛋白差異表達的證據(jù)。在一些實施方案中,鋅轉運蛋白差異表達的證據(jù)是患者對鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑敏感性的指標。在一些方面,本發(fā)明提供了從包含一種或多種鋅轉運蛋白的樣本中純化鋅轉運蛋白的方法,包括提供包含結合至固體支持物的鋅轉運蛋白抗體的親和基質(zhì),將樣本與親和基質(zhì)接觸以形成親和基質(zhì)-鋅轉運蛋白復合體;從樣本剩余物中分離親和基質(zhì)-鋅轉運蛋白復合體;以及從親和基質(zhì)釋放鋅轉運蛋白。在一些方面,本發(fā)明提供了將細胞毒劑或診斷劑遞送至一個或多個表達鋅轉運蛋白的細胞的方法,該方法包括提供綴合至鋅轉運蛋白抗體或其片段的細胞毒劑或診斷劑,并且將細胞暴露于抗體-劑或片段-劑綴合物。本發(fā)明的這些和其它方面將在以下的發(fā)明詳述中闡述。附圖簡述圖1描述幾個癌樣本中LIV-1蛋白的表達。左圖描述ER陽性、ER陰性和轉移性乳腺癌。在右圖中的癌組織中可看到質(zhì)膜染色。右下圖描述在非透化細胞上的共焦覆蓋圖。圖2描述通過LIV-1特異的siRNAs敲低(knockdown)LIV-1蛋白。圖3描述在癌細胞中通過LIV-1特異的siRNAs抑制癌細胞生長、增殖和存活。圖4描述在癌細胞中通過LIV-1特異的siRNAs敲低LIV-1誘導的胱天蛋白酶活化。圖5描述了在正常細胞中LIV-1特異的siRNAs對增殖、胱天蛋白酶活性和LIV-1mRNA水平的影響。圖6描述了在癌細胞中通過LIV-1特異的siRNAs降低癌細胞中細胞周期蛋白Dl水平。圖7描述了通過LIV-1特異的抗體降低細胞質(zhì)鋅水平。圖8描述了正常和癌細胞中的LIV-1表達。圖9描述了在MCF7細胞中LIV-1敲低的影響,包括對細胞增殖、軟瓊脂生長、蛋白質(zhì)表達和存活的影響。圖10描述了通過LIV-1特異的siRNAs降低細胞質(zhì)鋅水平。圖ll描述了在用LIV-1特異性抗體處理后細胞周期蛋白Dl水平的降低。圖12描述了應用LIV-1分析的癌性和正常組織的孩史陣列分析(affyU133plus2芯片)圖示。沿水平軸上布置正常和癌性組織類型。癌性組織用"c"標記,例如,、_乳腺—管"表示乳腺癌組織樣本,且正常組織類似地用"n"表示。如果知道的話,還對組織類型進一步標記有關組織的類型和亞型。例如,"c—乳腺—管"是來自位于乳腺管中的乳腺癌的癌性組織。如果在外科切除期間不清楚或不知道亞型,則標簽記為"ns"表示"非確切的"。在垂直軸上的每一個點表示來自單個患者的組織樣本,以及每一點在垂直軸上的高度(基于1og2)代表探針組(probeset)的相對表達水平。實心圓代表表達水平在線性檢測范圍內(nèi)的樣本??招膱A代表在其中基因在探針組的檢測極限以下的樣本中基因表達的上限。空的方塊代表在其中探針組被飽和的樣本中基因表達的下限。(簡而言之,在進行分析之前,通過在大量、不同的樣本組中分析組成探針組的探針的表現(xiàn)校正探針組。這一校正確定每一探針的相對敏感性、以及強度范圍,在所述強度范圍內(nèi)探針組的反應在探針之間是線性的。在這一范圍以下的強度#:稱為"未檢測到"而在所述范圍以上的強度被稱為"飽和"。由于樣本之間雜交和標記效率的不同,每一芯片均在應用校正后被規(guī)一化。這使得按照基因表達水平的范圍上限和下限在樣本與樣本之間有些不同。)圖13描述了用SLC39A10分析的癌性和正常組織的微陣列分析(affyU133plus2芯片)圖示。信息如以上圖12所提供。圖14描述了用SLC39A11分析的癌性和正常組織的孩吏陣列分析(affyU133plus2芯片)圖示。信息如以上圖12所提供。圖15描述了用SLC39A13分析的癌性和正常組織的孩i陣列分析(affyU133plus2芯片)圖示。信息如以上圖12所提供。發(fā)明詳述本發(fā)明提供了用于癌癥治療、診斷和成像,具體而言用于LIV-1相關癌癥的治療、i貪斷和成《象的方法和組合物。本發(fā)明的發(fā)明人尤其發(fā)現(xiàn)LIV-1在數(shù)種癌癥,包括乳腺癌中過量表達,并且在正常組織中具有受限的表達。抑制LIV-1則抑制了癌細胞的增殖,但不抑制LIV-l-陽性的"正常"細胞。此外,已發(fā)現(xiàn)LIV-1的抑制調(diào)節(jié)細胞質(zhì)鋅水平以及下游標志物的水平,所述下游標志物例如包括細胞周期蛋白D1和MT1-MMP。在本申請中提供了本發(fā)明的這些和其它方面。定義在這一文件中使用了許多定義。多數(shù)詞語具有對本領域技術人員來說是這些詞語本身的意思。在下面或在這一文件中其它地方特別定義的詞語具有在本發(fā)明的上下文中作為整體所提供的以及如本領域技術人員通常理解的意思。除非特別標明,本發(fā)明的實施將應用本領域內(nèi)常見的化學、生物化學、分子生物學、免疫學和藥學方法。在文獻中充分地解釋了此類技術。例如,參見Remington'sPharmaceuticalSciences,第18版(Easton,Pennsylvania:MackPublishingCompany,1990);MethodsInEnzymology(S.Colowick和N.Kaplan,編輯,AcademicPress,Inc.);以及HandbookofExperimentalImmunology,I-IV巻(D.M.Weir和CC.Blackwell,編輯,1986,BlackwellScientificPublications)以及Sambrook等,MolecularCloning:ALaboratoryManual(第二版,1989)。本文所使用的單數(shù)形式"一個"、"一種"和"該"包括復數(shù)關系,除非文中另外清楚地標明。因此,例如論及"一種抗體,,時包括兩種或以上此類抗體的混合物。本文所使用的術語"約"是指值的+/-20%、+/-10%、或+/-5%。本文所使用的術語"鋅轉運蛋白"或"鋅運載蛋白"是指顯示出鋅轉運蛋白結構特征的生物分子。在一些實施方案中,鋅轉運蛋白包括LIV-l、SLC39A13、SLC39A11和SLC39A10。本文所使用的術語"LIV-r也被稱為Zip6,是指屬于被稱為LZT的ZIP鋅轉運蛋白的亞家族的鋅轉運蛋白。在GeneCard中,LIV-1也被稱為SLC39A6(溶質(zhì)載體蛋白家族39(鋅轉運蛋白),成員6)。LIV-1的核苷酸序列如SEQIDNO:l所示,且LIV-1的氨基酸序列如SEQIDNO:2。盡管為了簡潔的目的,本發(fā)明主要根據(jù)LIV-1作為例證,但應該理解涉及LIV-1的定義和實施方案也可用于本文公開的其它鋅轉運蛋白。本文所使用的術語"LIV-1-8"是指與LIV-1相比至少缺乏氨基端部分的LIV-1變體。LIV-1-8的多肽序列如SEQIDNO:365所示。本文所使用的術語"多肽"和"蛋白"可以互換使用,是指任何長度的氨基酸聚合體形式,其可以包括編碼的或非編碼的氨基酸、化學或生物化學修飾或衍生的氨基酸、以及具有經(jīng)修飾的肽骨架的多肽。該術語包括融合蛋白,包括但不限于與異源氨基#列融合的融合蛋白、與同源或異源的具有或沒有N端曱硫氨酸殘基的前導序列融合;免疫學標記的蛋白等。術語"個體"、"受試者"、"宿主"和"患者,,可互換使用,是指對于其來說診斷、治療或療法是所期望的任何受試者,尤其是人類。其它受試者可以包括牛、狗、貓、豚鼠、兔子、大鼠、小鼠、馬等。在一些優(yōu)選的實施方案中,受試者是人類。本文所使用的術語"癌癥"是指原發(fā)或轉移癌。術語"癌細胞,,是指被轉化的細胞。這些細胞可以從患有癌癥的患者中分離,或者是在體外經(jīng)轉化變?yōu)榘┬缘募毎?。癌細胞可以從許多種類的樣本中取得,所述樣本包括任何組織或細胞培養(yǎng)系。在一些實施方案中,癌細胞是過度增生細胞、腫瘤細胞或贅生物。在一些實施方案中,癌細胞從乳腺癌、皮膚癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宮癌、子宮頸癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多發(fā)性骨髓瘤和黑素瘤中分離。在一些實施方案中,癌細胞從公眾可獲得的已建立的細胞系中取得。在一些實施方案中,癌細胞從業(yè)已存在的患者樣本或從包含癌細胞的文庫中分離。在一些實施方案中,分離癌細胞并然后將其移植至不同的宿主中,例如異種移植。在一些實施方案中,在SCED小鼠模型中移植并應用癌細胞。在一些實施方案中,癌是乳腺癌。本文所使用的術語"經(jīng)轉化的"是其后代能穩(wěn)定遺傳的在細胞特性上的任何轉變。在一些實施方案中,"經(jīng)轉化的"是指正常細胞至癌性細胞的轉變,例如,能夠引起腫瘤的改變。在一些實施方案中,經(jīng)轉化的細胞是永生化的。轉化可以通過許多因素引起,包括在缺乏受體磷酸化的情況下的受體過量表達、病毒感染、在癌基因和/或腫瘤抑制基因上的突變、和/或任何改變細胞生長和/或永生化特性的其它技術。"癌性表型"通常是指作為癌性細胞特性的任意的多種生物學現(xiàn)象,其中的現(xiàn)象在不同類型的癌癥中可以不同。癌性表型通常通過在例如細胞生長或增殖(例如,不受控制的生長或增殖)、細胞周期調(diào)控、細胞遷移、細胞-細胞相互作用或轉移等中的反常來鑒定。本文所使用的術語"轉移"是指已傳播至遠離癌的起源,例如遠離原發(fā)癌的位置處的癌癥。轉移的位置包括但不限于骨、淋巴結、肺、肝和腦。本文所使用的術語"血管發(fā)生"是指患者中血管的發(fā)生。本文所使用的術語"臨床端點(clinicalendpoint)"是指癌癥的可測量事件指標。臨床端點包括但不限于第一次轉移的時間、隨后轉移的時間、轉移瘤的大小和/或數(shù)目、腫瘤的大小和/或數(shù)目、腫瘤的位置、腫瘤的侵襲、生活質(zhì)量、疼痛等。本領域技術人員具有確定和測量臨床端點的能力。測量臨床端點的方法對于本領域技術人員來說是已知的。本文所使用的術語"樣本"是指來自患者的生物學材料。通過本發(fā)明測定的樣本不限于任何特殊的類型。作為非限制性實例,樣本包括單個細胞、多個細胞、組織、腫瘤、生物學液體、生物分子、或任何前述的上清液或提取物。樣本的例子包括為活組織檢查取出的組織、在切除術期間取出的組織、血液、尿、淋巴組織、淋巴液、腦脊髓液、粘液和糞便樣本。所使用的樣本會依據(jù)分析方式、檢測方法和待檢測腫瘤、組織、細胞或提取物的性質(zhì)而不同。制備樣本的方法在本領域是熟知的,并且可以很容易的修改以獲得適合于所應用的方法的樣本。本文所使用的術語"生物分子"包括但不限于多肽、核酸和糖類。本文所用的術語"調(diào)節(jié)"是指在細胞內(nèi)部、外部或表面的基因、蛋白或任何分子的質(zhì)或量上的改變。改變可以是分子表達或水平上的升高或降低。術語"調(diào)節(jié)"也包括改變生物學功能/活性的質(zhì)或量,所述生物學功能/活性包括但不限于細胞增殖、生長、粘附、細胞存活、凋亡、細胞內(nèi)信號傳導、細胞-細胞間信號傳導等。本文所使用的術語"調(diào)節(jié)劑,,是指調(diào)節(jié)一種或多種與癌癥相關的生理學或生物化學事件的組分。在一些實施方案中,調(diào)節(jié)劑抑制一種或多種與癌癥相關的生物學活性。在一些實施方案中,調(diào)節(jié)劑是小分子、抗體、模擬物、誘斜(decoy)或寡核苷酸。在一些實施方案中,調(diào)節(jié)劑通過阻斷配體結合或通過竟爭配體結合位點起作用。在一些實施方案中,調(diào)節(jié)劑獨立于配體結合之外起作用。在一些實施方案中,調(diào)節(jié)劑不竟爭配體結合位點。在一些實施方案中,調(diào)節(jié)劑阻斷參與癌癥的基因產(chǎn)物的表達。在一些實施方案中,調(diào)節(jié)劑阻斷兩個或更多個參與癌癥的生物分子的物理相互作用。在一些實施方案中,本發(fā)明的調(diào)節(jié)劑抑制一種或多種LIV-1生物學活性,所述LIV-1生物學活性選自癌細胞生長、腫瘤形成、癌細胞增殖、癌細胞存活、癌細胞轉移、細胞遷移、血管生成、LIV-1信號傳導、LIV-1介導的細胞-細胞粘附、細胞-細胞相互作用、LIV-1介導的細胞-細胞膜相互作用、LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)相互作用、整聯(lián)蛋白介導的活性、LIV-1表面表達、LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)降解、EGFR磷酸化和Snail核定位。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑抑制LIV-1表達。"基因產(chǎn)物"是指由基因表達或產(chǎn)生的生物聚合物產(chǎn)物?;虍a(chǎn)物例如可以是未剪接的RNA、mRNA、剪接變體mRNA、多肽、翻譯后修飾的多肽、剪接變體多肽等。這一術語還包括應用RNA基因產(chǎn)物作為模板產(chǎn)生的生物聚合物產(chǎn)物(即,RNA的cDNA)?;虍a(chǎn)物可以酶學地、重組地、化學地或在對于其來說該基因是天然存在的細胞中制得。在一些實施方案中,如果基因產(chǎn)物是蛋白質(zhì)的,其表現(xiàn)出生物學活性。在一些實施方案中,如果基因產(chǎn)物是核酸,其可以翻譯為表現(xiàn)出生物學活性的蛋白質(zhì)基因產(chǎn)物。本文所使用的"LIV-1活性的調(diào)節(jié)"是指LIV-1活性的升高或降低,其例如可以是物質(zhì)與LIV-1多核苷酸或多肽的相互作用、LIV-1轉錄和/或翻譯的抑制(例如,通過反義或siRNA與LIV-1基因或LIV-1轉錄子相互作用、通過促進LIV-1表達的轉錄因子的調(diào)控)等的結果。例如,生物活性的調(diào)節(jié)是指生物學活性的升高或生物學活性的降低。本發(fā)明對導致LIV-1活性降低的LIV-1活性調(diào)節(jié)特別感興趣??梢酝ㄟ^以下方法評估LIV-1活性,所述方法包括但不限于:測試鋅轉運活性、評估LIV-1多肽水平、或通過評估LIV-1轉錄水平。LIV-1活性的比較也可以通過測量LIV-1下游標志物的水平、測量對LIV-1信號傳導的抑制、測量對LIV-1介導的細胞粘附的抑制、測量對LIV-1介導的癌細胞凋亡的活化、測量癌細胞生長抑制、測量腫瘤形成的抑制、測量細胞周期蛋白產(chǎn)生的抑制、測量對產(chǎn)生纖連蛋白的抑制和測量對鋅轉運的抑制來完成。本文所使用的術語"抑制"是指活性或量的減少、降低、失活或下調(diào)。例如,在本發(fā)明的上下文中,Liv-l調(diào)節(jié)劑可以抑制癌細胞生長、腫瘤形成、癌細胞增殖、癌細胞存活、癌細胞轉移、細胞遷移、血管生成、LIV-1信號傳導、LIV-l介導的細胞-細胞粘附、細胞-細胞相互作用、LIV-1介導的細胞-細胞膜相互作用、LIV-l介導的細胞-細胞外基質(zhì)相互作用、整聯(lián)蛋白介導的活性、LIV-1表面表達、LIV-l介導的細胞-細胞外基質(zhì)降解、Snail核定位、以及LIV-1表達中的一種或多種。LIV-1調(diào)節(jié)劑也可以抑制細胞周期蛋白Dl、纖連蛋白、RhoB、MT1-MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR、EGFR磷酸化、在SNAIL途徑中的一個或多個基因。LIV-1調(diào)節(jié)劑也可以抑制鋅轉運并且在一些實施方案中能降低細胞質(zhì)鋅水平。與對照相比,抑制可以是至少25%、至少50%、至少是60%、至少70%、至少75%、至少是80%、至少卯%、至少95%、至少是97%、至少98%、至少是99%、或100%。本文所使用的術語"在癌細胞中差異表達,,和"在癌細胞中差異表達的多核普酸,,在本文中可以互相使用,是指代表或對應于基因的多核苷酸,當與非癌性的相同細胞類型的細胞相比較時,所述基因在癌性細胞中差異表達,例如,發(fā)現(xiàn)mRNA在至少約25%、至少約50%至約75%、至少約90%、至少約1.5倍、至少約2倍、至少約5倍、至少約10倍、至少約50倍或更多不同(例如,更高或更低)的水平上。例如如果使用原位雜交或其它在組織上的細胞類型之間允許一定程度的區(qū)別的分析方法,可以在組織中進行比較。比較也可以或備選地在從它們的組織來源中分離的細胞之間進行,或在一個原位細胞和第二個從它的組織來源中分離的細胞之間進行。在一些實施方案中,與正常細胞相比較,基因在癌細胞中上調(diào)。如果癌癥的至少一個癥狀得到減輕、終止、變慢或防止,則"抑制"了LIV-1相關癌癥。在本文中,如果癌癥的復發(fā)或轉移得到減輕、變慢、延緩或防止,則也"抑制"了LIV-1相關癌癥。本文所使用的詞組"抑制LIV-1介導的細胞粘附,,是指在LIV-1抑制劑存在的情況下,細胞-細胞之間粘附的抑制或消失,其中至少一個細胞差異表達LIV-1。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時LIV-1介導的細胞粘附,通過LIV-1抑制劑能夠使LIV-1介導的細胞粘附降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。LIV-1介導的細胞粘附的比較可以通過測量完成,例如,通過標記感興趣的細胞、將它們與黏附至基質(zhì)的未標記細胞群孵育、以及洗滌以從非勦附細胞群中分離黏附細胞。在這一方法中,通過測量保留在基質(zhì)上的標記的量確定細胞粘附。分析系統(tǒng)的實例包括但不限于用熒光探針標記并在熒光板讀數(shù)器上或通過流式細胞術測量焚光,所述熒光探針諸如鉀熒光素AM,CFMDA(二乙酸5-氯甲基焚光素)、5(6)-CFDA-SE二乙酸5-(和-6)-羧基熒光素,琥珀酰亞胺酯l。在本文中所使用的詞組"增加癌細胞凋亡,,是指在存在LIV-1抑制劑的情況下增加差異表達LIV-1的癌細胞的凋亡。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時的癌細胞凋亡,通過LIV-1抑制劑可以使癌細胞凋亡增加至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%、直至100%。癌細胞凋亡的比較例如可以通過測量DNA片段化、胱天蛋白酶活性、線粒體膜電位的喪失、活性氧類(ROS)增加的產(chǎn)生、細胞內(nèi)酸化、染色質(zhì)凝聚、細胞表面的磷脂酰絲氨酸水平以及增加的細胞膜通透性來完成。DNA片段化例如可以用TUNEL測試法(末端脫氧核苷酸轉移酶dUTP缺口末端標記)來測量。該測試法的商業(yè)版本可廣泛地獲得,例如,APO-BrdUTMTUNEL測試試劑盒(Invitrogen)、APO-DIRECTTM試劑盒(BDBiosciencesPharmingen)和ApoAlertTMDNA片段化測試試劑盒(Clontech,TakaraBioCompany)。胱天蛋白酶活性可以通過對特定胱天蛋白酶特異的熒光、生色和發(fā)光底物來監(jiān)測。至少對于胱天蛋白酶l、2、3、6、7、8和9可獲得商業(yè)化測試試劑盒。(例fe口,參見Invitrogen、Chemicon、CalBiochem、BioSourceInternational、Biovision)。線粒體膜電位的喪失可以用在健康活性的線粒體中差異聚集的熒光染料來測量。一個非限制性實例是Invitrogen的MitoTrackerRed系統(tǒng)?;钚匝躅?ROS)的產(chǎn)生可以用熒光染料來測量,所述染料例如包括H2DCFDA(Invitrogen)。細胞內(nèi)酸化可以用熒光或生色染料來測量。染色質(zhì)凝聚可以用熒光染料來測量,所述熒光染料例如包括Hoechst33342。磷脂酰絲氨酸(PS)可以在細胞表面測量。例如,膜聯(lián)蛋白V具有對PS的高親和性。許多商業(yè)可獲得的測試法適合于監(jiān)測經(jīng)標記的膜聯(lián)蛋白v與細胞表面的結合。細胞膜通透性可以用染料來測量,所述染料諸如可以進入凋亡細胞但不能進入壞死細胞的熒光染料YO-PRO-l(Invitrogen)。本文所使用的詞組"抑制癌細胞生長,,是指在存在LIV-1抑制劑的情況下癌細胞生長的抑制或消失,其中細胞差異表達LIV-1。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時的癌細胞生長,通過LIV-1抑制劑可以使癌細胞生長降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%、直至100%。癌細月包生長的比較例如可以應用MTT測試法(例如,Vybrant⑧MTT細胞增殖測試試劑盒(Invitrogen))、BrdU摻入(例如,Absolute-SSBIP測試法(Invitrogen))、測量細胞內(nèi)ATP水平(例如應用ATPLiteTM-M,l,OOO測試試劑盒(PerkinElmer)或ATP細月包活力測試試劑盒(BioVision))、DiOc18測試法(膜可滲透染料(Invitrogen))、葡萄糖-6-磷酸脫氫酶活性測試法(例如,Vibrant細胞毒測試法(Invitrogen))或測量細胞LDH活性來完成。本文所使用的詞組"抑制腫瘤形成"是指在存在LIV-1抑制劑的情況下腫瘤形成的抑制或消失,其中腫瘤包含差異表達LIV-1的細胞。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時的腫瘤形成,通過LIV-1抑制劑可以使腫瘤形成減少至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%、直至100%。腫瘤形成的比較例如可以應用基于細胞的測試法(例如在軟瓊脂上的集落形成)、通常依賴于將感興趣的細胞注射至動物(例如,無胸腺小鼠或大鼠、受輻射的小鼠或大鼠;接種至免疫特惠位點(immunologicallyprivilegedsites),諸如腦、頰嚢或目艮;同系動物接種)并在規(guī)定的時間段后監(jiān)測腫塊大小的體內(nèi)腫瘤形成模型來完成。本文所使用的詞組"抑制細胞周期蛋白Dl"是指LIV-1介導的細胞周期蛋白產(chǎn)生的抑制或消失。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時的LIV-1介導的細胞周期蛋白產(chǎn)生,通過抑制劑可以使LIV-1介導的細胞周期蛋白產(chǎn)生降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少卯%、至少95%、直至100%。細胞周期蛋白產(chǎn)生的比較可以通過以下方法來完成例如通過RT-PCR或RNA印跡法測量細胞周期蛋白mRNA水平;通過免疫印跡、免疫沉淀或ELISA測量細胞周期蛋白多肽水平;或應用功能測試法,包括例如應用耙向CDK、p21WAFl、p27KEP-l的抗體的免疫共沉淀測試法以測量與細胞周期蛋白調(diào)節(jié)劑(諸如細胞周期蛋白依賴性激酶(CDK,s))復合的細胞周期蛋白水平;以及測量通過CDK,s的細胞周期蛋白的磷酸化,可以通過放射性標記和免疫沉淀分析或基于FRET的方法,例如CDK2/細胞周期蛋白A測試試劑盒(MolecularDevices)來測試。本文所使用的詞組"抑制EGFR磷酸化"是指LIV-1介導的EGFR磷酸化的抑制或消失。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時的LIV-l介導的EGFR磷酸化,通過抑制劑可以使LIV-1介導的EGFR磷酸化降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。EGFR磷酸化的比較可以通過本領域技術人員已知的磷酸化測試法來確定。本文所使用的詞組"抑制腫瘤細胞存活"是指對表達LIV-1的癌細胞存活的抑制。在一些實施方案中,該術語是指實現(xiàn)表達LIV-1的癌細胞的凋亡。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時的癌細胞存活和/或在正常細胞中,通過抑制劑可以使表達LIV-1的癌細胞存活降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。本文所使用的詞組"抑制整聯(lián)蛋白介導的活性"是指對與整聯(lián)蛋白相關的活性的抑制或消失。整聯(lián)蛋白介導的活性包括但不限于細胞粘附、趨化性、增殖、存活和小管形成。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時LIV-1介導的整聯(lián)蛋白活性,通過抑制劑可以使LIV-1介導的整聯(lián)蛋白活性降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。本文所使用的詞組"抑制纖連蛋白"是指對LIV-1介導的產(chǎn)生纖連蛋白的抑制或消失。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時LIV-1介導的纖連蛋白產(chǎn)生,通過抑制劑可以使LIV-1介導的纖連蛋白產(chǎn)生降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。纖連蛋白產(chǎn)生的比較可以通過以下方法完成例如通過RT-PCR或RNA印跡法測量纖連蛋白mRNA水平;通過免疫印跡、免疫沉淀或ELISA(例如,纖連蛋白ELISA試劑盒(AMERICANDIAGNOSTICA));應用功能測試法以測量與纖連蛋白包被的底物的細胞粘附。例如,參見InnoCyteTMECM細胞粘附測試法,纖連蛋白(Calbiochem)和QCMTM-FN[定量細胞遷移測試法-纖連蛋白(CHEMICON)I。本文所使用的詞組"抑制鋅轉運"是指對LIV-1介導的鋅轉運的抑制或消失。在這一上下文中,相對于不存在LIV-1抑制劑時LIV-1介導的鋅轉運,通過抑制劑可以使LIV-1介導的鋅轉運降低至少25%、至少50%、至少75%、至少85%、至少90%、至少95%、直至100%。在一些實施方案中,LIV-1抑制劑降低胞質(zhì)鋅水平。鋅轉運的比較和鋅水平的確定可以應用本領域技術人員已知的方法來完成,例如包括測量到細胞或嚢泡內(nèi)的65Zn攝入(參見,Kambe等,(2002)J.Biol.Chem.,277:19049-l卯55);或測量細胞通透的熒光鋅指示劑Newport綠二乙酸鹽(MolecularProbes)的攝入。體液和細胞條件介質(zhì)中的鋅庫例如可以按照Zalewski等闡述的討論來測量(BioTechniques,2006,第40巻,第4期第509-520頁)。本文所使用的詞組"抑制UV-1信號傳導"是指降低LIV-1對包括LIV-1的細胞信號級聯(lián)下游成員的影響。包括LIV-1的細胞信號級聯(lián)尤其包括SNAIL途徑。在一些實施方案中,對LIV-1信號傳導的抑制上調(diào)SNAIL途徑中的一個或多個上皮標記物。在一些實施方案中,對LIV-1信號傳導的抑制下調(diào)SNAIL途徑中的一個或多個間充質(zhì)標記物。在一些實施方案中,上皮標記物和/或間充質(zhì)標記物參與運動性和細胞存活。在一些實施方案中,對LIV-1信號傳導的調(diào)節(jié)調(diào)節(jié)了Stat3相關信號級聯(lián)。在一些實施方案中,Stat3相關信號級聯(lián)的元件與SNAIL相關信號級聯(lián)的元件不同。對LIV-1信號傳導的抑制可以通過測量細另包信號傳導途徑下游成員的多肽或多核苷酸水平來確定。本領域技術人員具備測量LIV-1多肽和/或多核苷酸水平能力。本領域技術人員也能夠測量LIV-1下游標志物的水平。本文所使用的詞組"抑制細胞-細胞相互作用"是指減少或消除兩個或多個表達LIV-1的細胞之間的相互作用。在一些實施方案中,細胞之間的相互作用導致細胞信號。細胞-細胞相互作用可以通過本領域技術人員已知的多種方法檢測,所述方法包括但不限于觀察共培養(yǎng)的、例如用不同焚光膜染料(包括PKH26和PKH67(Sigma))標記的預標記細胞之間的膜交換。本文所使用的"LIV-1下游標志物"是指與其在正?;蚪】到M織中的表達水平相比較,在癌組織或癌細胞中表現(xiàn)出改變的表達水平的基因或活性,或是在存在LIV-1調(diào)節(jié)劑的情況下改變的特性(例如,胞質(zhì)鋅水平)。在一些實施方案中,當LIV-1受到本發(fā)明的LIV-1調(diào)節(jié)劑擾動時,下游標志物表現(xiàn)出改變的表達水平。LIV-1下游標志物包括但不限于細胞周期蛋白Dl、纖連蛋白、RhoB、MT1-MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR、SNAIL途徑中的一個或多個基因、E-鈣粘著蛋白、VE-鈣粘著蛋白、Muc-l、水閘蛋白(claudin)、封閉蛋白(occludin)、橋粒斑蛋白、胱天蛋白酶、p21、p53、BID(bcl-相互作用死亡激動劑)、DFF40(DNA片段化因子)以及細胞角蛋白。如上面所討論的那樣,在一些實施方案中,LIV-1下游標志物是Stat3途徑的基因。本文所使用的術語"上調(diào),,是指活性或量的增加、激活或刺激。例如,在本發(fā)明的上下文中,Liv-l調(diào)節(jié)劑可以增加E-鈣粘著蛋白、VE-鈣粘著蛋白、Muc-l、水閘蛋白、封閉蛋白、橋粒斑蛋白、胱天蛋白酶、p21、p53、BID(bd-相互作用死亡激動劑)、DFF40(DNA片段化因子)以及細胞角蛋白之中的一種或多種。與對照相比,上調(diào)可以是至少25%、至少50%、至少75%、至少100%、至少150%、至少200%、至少250%、至少400%、或至少500%。本文所使用的術語"N-端"是指蛋白質(zhì)的最前的IO個氨基酸。本文所使用的術語"C-端"是指蛋白質(zhì)的最后的IO個氨基酸。本文所使用的術語"結構域,,是指有對生物分子已知或猜想的功能有貢獻的生物分子的結構部分。結構域可以與其區(qū)域或部分共延伸(co-extensive),以及除了特定區(qū)域的全部或部分外也可以還包含與特定區(qū)域不同的生物分子的部分。本文所使用的術語"細胞外結構域"是指分子在細胞外部或外邊的部分。在本發(fā)明的上下文中,N-端細胞外結構域是指存在于緊接在第一個跨膜結構域之前的分子N-端的細胞外結構域。在兩個跨膜(TM)結構域之間,例如在TM2和3之間的細胞外結構域的上下文中,細胞外結構域是指在LIV-1第二和第三跨膜結構域之間的在細胞膜外的LIV-1的部分。本文所使用的術語"配體結合結構域"是指至少保留了一種相應LIV-1天然序列定性結合活性的受體的任何部分或區(qū)域。術語"區(qū)域,,是指生物分子一級結構的物理連續(xù)部分。在蛋白質(zhì)的情況下,區(qū)域是通過蛋白質(zhì)氨基酸序列的連續(xù)部分來定義的,在一些實施方案中,"區(qū)域"與生物分子的功能相關。本文所使用的術語"片段"是指生物分子一級結構的物理連續(xù)部分。在蛋白質(zhì)的情況下,部分是通過蛋白質(zhì)氨基*列的連續(xù)部分來定義的,并且指至少3-5個氨基酸、至少8-10個氨基酸、至少11-15個氨基酸、至少17-24個氨基酸、至少25-30個氨基酸、至少30-45個氨基酸。在寡核苷酸的情況下,部分是通過寡核苷酸的核酸序列的連續(xù)部分來定義的,并且指至少9-15個核苷酸、至少18-30個核苷酸、至少33-45個核苷酸、至少48-72個核苷酸、至少75-90個核苷酸、至少90-130個核苷酸。在一些實施方案沖,生物分子的部分具有生物學活性。在本發(fā)明的上下文中,LIV-1多肽片段不包含如SEQIDNO:2所示的全長LIV-1多肽序列。本文所使用的詞組"LIV-l相關細胞/腫瘤/樣本"等是指其特征是相對于非癌性和/或非轉移細胞、樣本、腫瘤或其它病變而言,LIV-1差異表達的細胞、樣本、腫瘤或其它病變。在一些實施方案中,UV-1相關細胞、樣本、腫瘤或其它病變的特征是相對于非轉移細胞、樣本、腫瘤或其它病變而言LIV-1表達的升高證據(jù)。本文所使用的術語"抗體"是指對靶標蛋白或其片段特異的單克隆和多克隆抗體、單鏈抗體、嵌合抗體、雙功能/雙特異性抗體、人源化抗體、人類抗體、以及互補決定區(qū)移植抗體。術語"抗體"還包括體內(nèi)治療的抗體基因轉移。本發(fā)明也提供了包括Fab、Fab,、F(ab,)2、scFv和Fv的抗體片段。本文所使用的術語"表位"是指多肽的抗原決定簇。在一些實施方案中,表位可以包含3個或更多氨基酸,所述氨基酸位于對表位唯一的空間構象中的。在一些實施方案中,表位是線性的或構象的表位。表位通常由至少4個、至少6個、至少8個、至少10個、以及至少12個此類氨基酸組成,或更通常由至少8-10個此類氨基酸組成。確定氨基酸空間構象的方法在本領域是已知的,例如包括X射線晶體學和2維核磁共振。本文所使用的術語"寡核苷酸"是指一系列連接的核苷酸殘基。寡核苷酸包括但不限于反義和siRNA寡核苷酸。寡核苷酸包含DNA序列的部分,并且具有至少約IO個核苷酸以及多達約500個核苷酸。在一些實施方案中,寡核苷酸包含約10至約50個核苷酸、約15至約30個核苷酸、以及約20至約25個核苷酸。寡核苷酸可以化學合成并且能夠被用作探針。在一些實施方案中,寡核苷酸是單鏈的。在一些實施方案中,寡核苷酸至少包含是雙鏈的一部分。在一些實施方案中,寡核苷酸是反義寡核苷酸(ASO)。在一些實施方案中,寡核苷酸是RNAi寡核苷酸、siRNAs或shRNAs。本文所使用的術語"反義寡核苷酸,,具有與LIV-1多核苷酸序列互補的核苷酸序列的未經(jīng)修飾或經(jīng)修飾的核酸,所述LIV-1多核苷酸序列包括與LIV-1轉錄或翻譯相關的多核苷酸序列(例如,LIV-1多核苷酸的啟動子),其中反義多核苷酸能夠雜交至LIV-1多核苷M列。特別感興趣的是能夠在體外或體內(nèi)抑制編碼LIV-1多肽的多核苷酸轉錄和/或翻譯的反義多核苷酸。本文所使用的術語"siRNA寡核苷酸,,、"RNAi寡核苷酸,,、"短干擾RNA"、或"siRNA"可互換使用,是指通過轉錄后基因沉默、也被稱為RNA干擾(RNAi)而起作用的寡核苷酸。該術語是指能夠RNA干擾"RNAi,,的雙鏈核酸分子(參見Kreutze等,WO00/44895;Zernicka-Goetz等WO01/36646;Fire,WO99/32619;Mello和Fire,WO01/29058)。SiRNA分子通常是RNA分子但進一步包含化學修飾的核苷酸和非核苷酸。SiRNA基因靶向實驗通過將siRNA瞬時轉染至細胞(通過如脂質(zhì)體介導轉染、電穿孔或微注射等此類經(jīng)典方法實現(xiàn))進行。SiRNA分子是21至23個核苷酸的RNA,具有特征性的類似于長雙鏈RNA(dsRNAs)的RNaseIII加工產(chǎn)物的2至3個核苷酸3,突出端,其通常啟始RNAi。有效利用siRNA途徑來介導基因沉默部分地取決于siRNA細胞內(nèi)遞送的有效方法。siRNA分子在細胞內(nèi)傾向于是短命的,不容易遞送至難以轉染的細胞類型,并且通過化學合成生產(chǎn)相對昂貴(Jacks等,(2005)Biotechniques39:215-224;Bernards等,(2006)NatureMethods3:701-706)。有效細胞內(nèi)遞送siRNA的一種方法是應用短發(fā)夾RNA,或"shRNAs"。shRNAs是單鏈RNA分子,其包括由非互補區(qū)域連接的兩條互補序列。在體內(nèi),互補序列退火以產(chǎn)生在一個末端具有非配對環(huán)的雙鏈螺旋。得到的棒棒糖狀形狀的結構稱為莖環(huán)并且可以被RNAi機制識別并在細胞內(nèi)加工為具有類似siRNA特性的短雙螺旋RNA。shRNA可以通過從已插入到合適載體的DNA模板轉錄而在細胞內(nèi)合成。有用的shRNA—般是50-70個核苷酸長、具有通過5-10個核苷酸環(huán)分隔的兩條19-29個核苷酸的互補序列。shRNA構建體一般通過以下三種方法之一產(chǎn)生互補寡核苷酸退火;基于啟動子的聚合酶鏈式反應(PCR);或引物延伸。許多載體系統(tǒng)應用RNAPolIII啟動子,PolIII介導的轉錄是有利的,因為其在定義明確的起始位點開始、產(chǎn)生不含poly(A)的轉錄本,并且PolIII啟動子在所有細胞類型中都是有效的(Brummelkamp等,(2002)Science296:550-553;Mclntyre,G.和Fanning,G.(2006)BMCBiotechnology6:1-8)。編碼shRNA的載體系統(tǒng)提供了基因沉默試劑的可再生細胞內(nèi)來源,這可以在將載體穩(wěn)定整合至宿主基因組后介導持續(xù)的基因沉默。此外,能很容易地將shRNA盒插入逆轉錄病毒、慢病毒或腺病毒載體以方便將shRNA遞送至寬范圍的細胞類型中,所述細胞類型包括非分裂的原代培養(yǎng)物??烧{(diào)節(jié)的shRNA載體形式對遺傳篩選是特別有用的。本文所使用的術語"誘斜"(decoy)是指至少包含能夠結合鋅或鋅載體的一部分LIV-1多肽的多肽。在一些實施方案中,誘斜能夠結合與鋅復合的鋅載體。在一些實施方案中,誘何結合未與鋅復合的鋅載體。本文所使用的術語"治療有效量"是指產(chǎn)生藥用效果的藥物量,所述藥用效果是指當將治療有效量的藥物施與個體后,觀察到的個體中一種或多種臨床端點、癌細胞生長和/或存活、或癌細胞轉移的減少或逆轉。治療有效量一般通過與當用不包含活性成分的組合物施與類似處境個體時觀察到的效果相比較的效果來確定。對于受試者精確的治療有效量將取決于受試者的大小和健康、疾病的性質(zhì)和程度、以及選擇施與的治療或治療組合。然而,對于給定情況的有效量可通過常規(guī)實驗確定并且在臨床醫(yī)生的判斷范圍內(nèi)。本文所使用的術語"聯(lián)合"或"聯(lián)用"是指本發(fā)明的LIV-1調(diào)節(jié)劑和其它治療方案一起施與。本文所使用的術語"敏感的"是指對于其來說LIV-1治療是可接受的治療方法的患者,即很可能有陽性反應的患者。對LIV-1治療敏感的癌癥患者相對于對LIV-1治療不敏感的那些患者表達高水平的LIV-1。對LIV-1治療來說不是好候選者的癌癥患者包括具有這樣腫瘤樣本的癌癥患者,所述腫瘤樣本在它們的腫瘤細胞中或肺瘤細胞上缺乏或具有較低水平的LIV-1。本文所使用的術語"檢測"是指確立、發(fā)現(xiàn)或確認活性(例如,基因表達)或生物分子(例如,多肽)的證據(jù)。本文所使用的詞組"同源核苷酸序列"或"同源氨基酸序列"或其變體是指特征在于在核苷酸水平或氨基酸水平至少特定百分數(shù)同源的序列,并且與"序列同一性"可互相使用。同源核苷^列包括編碼蛋白同種型的那些序列。此類同種型可以例如作為RNA選擇性剪接的結果在相同機體的不同組織中表達。或者,同種型可以由不同的基因編碼。同源核苷酸序列包括編碼除人類之外其它物種的蛋白的核酸序列,所述物種包括但不限于哺乳動物。同源核苷酸序列還包括但不限于本文中闡明的核苷酸序列的天然存在的等位變體和突變體。同源氨基酸序列包括含有保守氨基酸替換以及其多肽具有相同結合和/或活性的那些氨基酸序列。同源或同一性百分比例如可以通過Gap程序(Wisconsin序列分析軟件包,用于UNIX的第8版,GeneticsComputerGroup,UniversityResearchPark,MadispnWI)、應用缺省設置來確定,所述程序應用了Smith和Waterman的算法(Adv.Appl.Math"1981,2,482-489)。在一些實施方案中,揮:針和靶標之間的同源性在約50%至約60%之間。在一些實施方案中,核酸具有與SEQIDNO:l或其部分約60%、約70%、約80%、約85%、約卯%、約92%、約94%、約95%、約97%、約98%、約99%以及約100%同源的核普酸。本發(fā)明還提供了SEQIDNO:l的完全互補序列的部分,或它的同源物。同源性也可以是在多肽水平上的。在一些實施方案中,多肽與SEQIDNO:2或其部分約60%、約70%、約80%、約85%、約90%、約92%、約94%、約95%、約97%、約98%、約99%以及約100%的同源。本文所使用的術語"探針"是指可變長度的核酸序列。在一些實施方案中,探針包含至少約10個以及多至約6,000個核苷酸。在一些實施方案中,探針包含至少12、至少14、至少16、至少18、至少20、至少25、至少50或至少75個連續(xù)的核苷酸。探針用于檢測同一的、類似的或互補的核酸序列。較長的探針通常從天然或重組來源得到、對靶序列高度特異、以及比寡聚物慢得多地與靶標雜交。探針可以是單鏈或雙鏈,并經(jīng)過設計從而在PCR、基于膜的雜交、原位雜交(ISH)、熒光原位雜交(FISH)或類似ELISA的技術中具有特異性。本文所^使用的術語"混合"是指將一種或多種化合物、細胞、分子等在同一區(qū)域中結合在一起的過程。這例如可以在試管、培養(yǎng)皿或其它允許一種或多種化合物、細胞或分子混合的容器中進行。本文所使用的術語"分離的"是指處于與多核苷酸、多肽或抗體天然存在的環(huán)境不同的環(huán)境當中的多核苷酸、多肽、抗體或宿主細胞。分離細胞的方法對本領域技術人員是已知的。分離的多核苷酸、多肽、抗體通常是基本上純的。本文所使用的術語"基本上純的"是指從其天然環(huán)境中分離并至少60%、至少75%、至少卯%沒有其它與之天然聯(lián)系的成分攙雜的化合物(例如,多核苷酸或多肽或抗體)。本文所使用的術語"結合"意思是兩個或多個生物分子或化合物之間的物理或化學相互作用。結合包括離子鍵、非離子鍵、氬鍵、范德華力(VanderWaals)、疏水相互作用等。結合可以是直接的或間接的,間接是通過或由于另一個生物分子或化合物的作用。直接結合是指不通過或由于另一用。本文所使用的術語"接觸"是指直接或間接地將一個分子帶到一起與笫二個分子物理上接近。分子可以在任意數(shù)量的緩沖液、鹽、溶液等之中。"接觸,,例如包括將多核苷酸置于含有核酸分子的燒杯、微量滴定板、細胞培養(yǎng)瓶或孩吏陣列等中。接觸例如還包括將抗體置于含有多肽的燒杯、微量滴定板、細胞培養(yǎng)瓶或微陣列等中。接觸可以發(fā)生在體內(nèi)(invivo)、間接體內(nèi)(exvivo)或體夕卜(invitro)。本文所使用的詞組"嚴格的雜交條件"或"嚴格條件"是指這樣的條件,在所述條件下,探針、引物或寡核苷酸能夠與它的靶標序列雜交,但是與最小數(shù)量的其它序列雜交。嚴格條件是序列依賴性的,并且在不同的環(huán)境下會不同。更長的序列會在更高的溫度與它們適當?shù)幕パa鏈特異雜交。通常,在規(guī)定的離子強度和pH下對于特定序列的嚴格條件選擇比熱熔解點(Tm)低約5°C。Tm是這樣的溫度(在定義的離子強度、pH和核酸濃度下),在該溫度中在平衡狀態(tài)下50%與靶標序列互補的探針與靶標序列雜交。由于靶標序列通常過量存在,在Tm,在平衡狀態(tài)下50%的探針與它們的互補序列雜交。一般地,嚴格條件是這些條件其中鹽濃度小于約l.OM鈉離子、一般地約0.01至1.0M鈉離子(或其它鹽);pH7.0至8J;以及對于短探針、引物或寡核苷酸(例如10至50個核苷酸)而言溫度至少約30°C、及對于更長的探針、引物或寡核普酸而言溫度至少約60。C。嚴格條件也可以通過添加去穩(wěn)定劑,諸如甲酰胺而實現(xiàn)。本文所使用的術語"中等嚴格條件"是指這樣的條件,在這種條件下探針、引物或寡核苷酸能夠與它的靶標序列雜交,但是與有限數(shù)量的其它序列雜交。中等條件是序列依賴性的,并且在不同的環(huán)境下會不同。中等條件是本領域技術人員已知的并尤其描述于Manitatis等(MolecularCloning:ALaboratoryManual,ColdSpringHarborLaboratory;第二版(1989年12月))。本文所描述的核酸組合物例如可被用于產(chǎn)生多肽、作為用于檢測生物樣本(例如人類細胞提取物)中mRNA或從此類樣本中產(chǎn)生的cDNA的探針、產(chǎn)生寡核苷酸的另外的拷貝、產(chǎn)生核酶或寡核苷酸(單鏈或雙鏈)、以及作為單鏈DNA探針或作為形成三鏈的寡核苷酸。本文描述的探針例如可以用于確定樣本中本文所提供的寡核苷酸的存在或不存在。多肽可以用于產(chǎn)生對與癌癥相關的多肽特異的抗體,其抗體又可用于如本文中更詳細討論的診斷方法、預后方法等。多肽也可以用于作為治療干預的靶標,如本文更詳細討論的那樣。本發(fā)明的抗體例如也可以用于純化、檢測和靶向本發(fā)明的多肽,包括體外和體內(nèi)診斷和治療方法。例如,抗體在用于定性和定量測量生物樣本中本發(fā)明多肽水平的免疫分析中是有用的。例如參見Harlow等,Antibodies:ALaboratoryManual,(ColdSpringHarborLaboratoryPress,第二版1988)。這些和其它用途將在以下更詳細地描述。本文所使用的術語"顯像劑"是指能用本領域技術人員已知的方法檢測的連接至本發(fā)明的抗體、小分子或探針上的組合物。本文所使用的術語"基因表達的證據(jù)"是指基因表達了的任何可檢測的指標。術語"可藥用載體,,是指用于施用治療劑,諸如抗體或多肽、基因和其它治療劑的載體。該術語是指其本身不會誘導產(chǎn)生對接受組合物的個體有害的抗體且可以施與而沒有過度毒性的任何藥學載體。合適的載體可以是大的、代謝緩慢的大分子,諸如蛋白、多糖、聚乳酸、聚乙醇酸、聚合氨基酸、氨基酸共聚物、脂聚集體、失活的病毒顆粒。此類栽體是本領域普通技術人員公知的。治療組合物中可藥用栽體包括液體,諸如水、鹽水、甘油或乙醇。輔助物質(zhì),諸如潤濕劑或乳化劑、pH緩沖物質(zhì)等也可以存在于此類載體中。可以通過本發(fā)明的方法和組合物治療的癌癥的特定例子包括但不限于LIV-1相關癌癥。本文所使用的術語"LIV-1相關癌癥"是指特征是其細胞相對于非癌性細胞差異表達LIV-1的癌癥。本發(fā)明也可以應用于其中LIV-1在癌細胞生長、腫瘤形成、癌細胞增殖、癌細胞轉移、細胞遷移、血管生成、LIV-1信號傳導、LIV-l介導的細胞-細胞粘附、細胞-細胞相互作用、LIV-1介導的細胞-細胞膜相互作用、LIV-l介導的細胞-細胞外基質(zhì)相互作用、整聯(lián)蛋白介導的活性、LIV-1表面表達、LIV-l介導的細胞-細胞外基質(zhì)降解、Snail核定位以及LIV-1表達中起著作用的任何的腫瘤細胞類型。在一些實施方案中,癌癥是乳腺癌、皮膚癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宮癌、子宮頸癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多發(fā)性骨髓瘤和黑素瘤。在一些實施方案中,癌癥是ER陽性乳腺癌。在一些實施方案中,癌癥是ER陰性乳腺癌。在一些實施方案中,此類癌癥展現(xiàn)出與對照相比至少約25%、至少約50%、至少約75%、至少約100%、至少約150%、至少約200%或至少約300%的LTV-I差異表達。本發(fā)明提供了用于治療、抑制和管理與LIV-1過量表W目關的疾病和病癥以及治療、抑制和管理此類疾病和病癥的癥狀的方法和組合物。本發(fā)明的一些實施方案涉及包含治療、抑制和管理癌癥的組合物的方法和組合物,所述癌癥包括但不限于癌轉移、癌細胞增殖、癌細胞生長和癌細胞侵襲。本發(fā)明還提供了包括與本發(fā)明LIV-1調(diào)節(jié)劑聯(lián)合的其它活性組分的方法。在一些實施方案中,該方法還包括給患者施與一種或多種常規(guī)癌治療。在一些實施方案中,本發(fā)明的方法還包括用化學治療、放射治療或外科手術中的一種或多種治療患者。本法還提供了用于治療、抑制和管理癌癥或其它超增殖的細胞病癥或疾病的方法和組合物,所述癌癥或其它超增殖的細胞病癥或疾病已變得部分或完全地耐受當前的或標準癌癥治療,諸如外科手術、化學治療、方文射治療、激素治療和生物學治療。本發(fā)明也提供了應用本發(fā)明的LIV-1調(diào)節(jié)劑、特別是LIV-1抗體以診斷癌癥和/或預測癌癥進程的診斷和/或成像方法。在一些實施方案中,本發(fā)明的方法提供成像和定位腫瘤和/或轉移灶的方法以及診斷和預后的方法。在一些實施方案中,本發(fā)明的方法提供了評價LIV-1相關治療適當性的方法。LIV-1調(diào)節(jié)劑本發(fā)明提供了LIV-1調(diào)節(jié)劑,尤其用于癌癥治療、診斷、檢測或成像。LIV-1調(diào)節(jié)劑也可用于制備治療癌癥的藥物。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是寡核苷酸、小分子、模擬物、誘辨或抗體。在一些實施方案中,與對照相比,LIV-1調(diào)節(jié)劑使LIV-1生物活性凈皮抑制了25%、50%、60%、70%、75%、80%、90%、95%、97%、98%、99%或100%。在一些實施方案中,與對照相比,LIV-1調(diào)節(jié)劑4吏LIV-1表達被抑制了至少25%、50%、60%、70%、75%、80%、90%、95%、97%、98%、99%或100%??贵w在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是單克隆抗體、多克隆抗體、嵌合抗體、人類抗體、人源化抗體、單鏈抗體、或Fab片段??贵w例如可以用酶、同位素或熒光團標記。在一些實施方案中,抗體具有對除LIV-1之外的多肽小于約lxl05Ka的結合親和力。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是以至少1x108Ka的親和力結合至LIV-1的單克隆抗體。本發(fā)明也提供了抗體,所述抗體竟爭性地抑制抗體與本發(fā)明的表位的結合,如通過例如應用免疫分析的用于確定竟爭性抑制的任何本領域已知方法確定的那樣。在一些實施方案中,抗體對至表位的結合而言,竟爭性抑制至少95%、至少卯%、至少85%、至少80%、至少75%、至少70%、至少60%或至少50%。在一些實施方案中,抗體是人源化抗體。人源化抗體可以通過各種方法得到,所述方法例如包括(l)將非人類互補決定區(qū)(CDRs)移植至人類構架和恒定區(qū)(本領域稱為"人源化"的方法),或者備選地(2)移植整個非人類可變區(qū),但是通過表面殘基替換用人類樣表面"遮掩,,它們(本領域稱為"鑲飾(veneering)"的方法)。在本發(fā)明中,人源化抗體將包括"人源化"和"鑲飾,,抗體。類似地,人類抗體可以通過將人類免疫球蛋白基因座引入其中內(nèi)源免疫球蛋白基因已部分或全部失活的轉基因動物例如小鼠中而得以制備。攻擊后,觀察到了人類抗體的產(chǎn)生,其在包括基因重排、組裝和抗體庫等的所有方面都非常類似于在人類中所觀察到的。這一方法例如描述于美國專利號5,545,807、5,545,806、5,569,825、5,625,126、5,633,425、5,661,016,以及以下科學出版物中Marks等,Bio/Technology10,779-783(1992);Lonberg等,Nature368856-859(1994);Morrison,Nature,368,812-13(1994);Fishwild等,NatureBiotechnology14,845-51(1996);Neuberger,NatureBiotechnology14,826(1996);Lonberg和Huszar,Intern.Rev.Immunol.1365-93(1995);Jones等,Nature321:522-525(1986);Morrison等,Proc.Natl.Acad.Sci,U.S.A.,81:6851-6855(1984);Morrison和Oi,Adv.Immunol"44:65-92(1988);Verhoeyer等,Science,239:1534-1536(1988);Padlan,Molec.Immun.28:489-498(1991);Padlan,Molec.Immunol.31(3):169-217(1994);以及Kettleborough,CA.等,ProteinEng.4(7):773-83(1991),其中的每一個都在此引入作為參考。本發(fā)明的抗體可以通過不同的機制工作。在一些實施方案中,抗體觸發(fā)抗體依賴性細胞毒性(ADCC),細胞溶解作用攻擊抗體靶向的細胞。在一些實施方案中,抗體具有多重治療功能,例如包括抗原結合、誘導凋亡以及補體依賴的細胞毒性(CDC)。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體可以作為本發(fā)明多肽的激動劑或拮抗劑。例如,在一些實施方案中,本發(fā)明提供了抗體,所述抗體部分或完全地破壞受體/配體與本發(fā)明多肽的相互作用。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體結合本文公開的表位,或其部分。在一些實施方案中,提供了抗體,與不存在抗體的情況下相比,所述抗體調(diào)節(jié)配體活性或受體活性至少95%、至少90%、至少85%、至少80%、至少75%、至少70%、至少60%或至少50%。在一些實施方案中,LIV-1抗體抑制Snail途徑和/或抑制細胞周期蛋白Dl、纖連蛋白、RhoB、MT1-MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR和EGFR磷酸化中的一個或多個。在一些實施方案中,LIV-1抗體抑制整聯(lián)蛋白介導的活性。在一些實施方案中,LIV-1抗體抑制Snail核定位。在一些實施方案中,LIV-1抗體上調(diào)E-鈣粘著蛋白、VE-鈣粘著蛋白、Muc-l、水閘蛋白、封閉蛋白、橋粒斑蛋白、胱天蛋白酶、p21、p53、BID(bcl-相互作用死亡激動劑)、DFF40(DNA片段化因子)以及細胞角蛋白中的一個或多個。在一些實施方案中,LIV-1抗體下調(diào)Snail途徑中的一個或多個間充質(zhì)標記物。在一些實施方案中,本發(fā)明提供了中和抗體。在一些實施方案中,中和抗體作為受體拮抗劑,即抑制配體介導的受體活化的生物活性的全部或其子集。在一些實施方案中,可以將抗體描述為生物學活性的激動劑、拮抗劑或反向激動劑,所述生物學活性包含本文所公開發(fā)明多肽的特定生物學活性。本發(fā)明的抗體可以單獨使用或與其它組合物聯(lián)合使用??贵w可以進一步在N-或C-端重組融合至異源多肽或化學綴合(包括共價或非共價綴合)至多肽或其它組合物上。例如,本發(fā)明的抗體可以重組融合或綴合至在檢測分析中用于作為標簽的分子或諸如異源多肽、藥物、方丈射性核素或毒素的效應分子上。例如,參見PCT公開WO92/08495、WO91/14438、WO89/12624;美國專利號5,314,995;以及EP396,387。除了嵌合抗體和人源化抗體之外,完全的人類抗體也可以從具有人類免疫球蛋白基因的轉基因小鼠(例如,參見美國專利號6,075,181、6,091,001和6,114,598,其全部在此引入作為參考)、或從人類免疫球蛋白基因的噬菌體展示文庫中(例如,參見McCafferty等,Nature,348:552-554(19卯).Clackson等,Nature,352:624-628(1991),以及Marks等,J.Mol.Biol"222:581-597(1991))得到??梢詰肒ohler等(1975,Nature256:495-496)的方法或其修改方法制備單克隆抗體。一般地,用含有抗原的溶液免疫小鼠。免疫可以通過在鹽水、優(yōu)選在佐劑諸如弗氏完全佐劑中混合或乳化含有抗原的溶液,以及腸胃外注射混合物或乳劑而完成??捎帽绢I域已知的任何免疫方法獲得本發(fā)明的單克隆抗體。在動物免疫之后,分離脾臟(以及任選地,數(shù)個大淋巴結)并將其解離為單個細胞??梢酝ㄟ^將細胞懸浮液應用至包被有感興趣抗原的板或孔中來篩選脾臟細胞。表達對抗原特異的膜結合免疫球蛋白的B細胞結合至板上并不會被漂洗走。然后誘導所得到的B細胞或所有離解的脾臟細胞與骨髓瘤細胞融合以形成雜交瘤,并在選擇培養(yǎng)基中培養(yǎng)。通過系列或有限稀釋平板接種所得到的細胞,并且分析特異性結合感興趣抗原(并且不結合非相關抗原)的抗體的產(chǎn)生。然后在體外(例如在組織培養(yǎng)瓶或中空纖維反應器中)或體內(nèi)(如小鼠中的腹水)培養(yǎng)所選擇的分泌單克隆抗體(mAb)的雜交瘤。作為對應用雜交瘤用于表達的備選,可以在細胞系,諸如CHO或骨髓瘤細胞系中產(chǎn)生抗體,如在美國專利號5,545,403、5,545,405和5,998,144公開的那樣,其中上述每一個專利均在此引入作為參考。簡而言之,分別用能夠表達輕鏈和重鏈的載體轉染細胞系。通過轉染在分開的載體上的兩個蛋白,可以產(chǎn)生嵌合抗體。Immunol.147:8;Banchereau等(1991)Clin.Immunol.Spectrum3:8;以及Banchereau等(1991)Science251:70,其全部在此引入作為參考。也可以通過應用本領域已知的技術,包括噬菌體展示文庫[Hoogenboom和Winter,J.Mol.Biol"227:381(1991);Marks等,J.Mol.Biol.,222:581(1991)來制備人類抗體。也可以利用Cole等和Boerner等的方法制備人類單克隆抗體[Cole等,MonoclonalAntibodiesandCancerTherapy,AlanR.Liss,第77頁(1985)以及Boerner等,J.Immunol"147(1):8695(1991)。人源化抗體可以通過各種方法得到,所述方法例如包括(l)將非人類互補決定區(qū)(CDRs)移植至人類構架和恒定區(qū)(本領域稱為"人源化,,的方法),或者備選地(2)移植整個非人類可變結構域,但是通過表面殘基替換用人類樣表面"遮掩"它們(本領域稱為"鑲飾"的方法)。在本發(fā)明中,人源化抗體將包括"人源化,,和"鑲飾,,抗體。類似地,人類抗體可以通過將人類免疫球蛋白基因座引入其中內(nèi)源免疫球蛋白基因已部分或全部失活的轉基因動物如小鼠中而制備。攻擊后,觀察到了人類抗體的產(chǎn)生,其在包括基因重排、組裝和抗體譜的所有方面都非常類似于在人類中所觀察到的。這一方法例如描述于美國專利號5,545,807、5,545,806、5,569,825、5,625,126、5,633,425、5,661,016,以及以下科學出版物中Marks等,Bio/Technology10,779-783(1992);Lonberg等,Nature,368856-859(1994);Morrison,Nature,368,812-13(1994);Fishwild等,NatureBiotechnology14,845-51(1996);Neuberger,NatureBiotechnology14,826(1996);Lonberg和Huszar,Intern.Rev.Immunol.1365-93(1995);Jones等,Nature321:522-525(1986);Morrison等,Pro"Natl.Acad.Sci,U.S.A.,81:6851-6855(1984);Morrison和Oi,Adv.Immunol.,44:65-92(1988);Verhoeyer等,Science,239:1534-1536(1988);Padlan,Molec.Immun.28:489-498(1991);Padlan,Molec.Immunol.31(3):169畫217(1994);以及Kettleborough,CA.等,ProteinEng.4(7):773-83(1991),其中的每一個都在此引入作為參考。詞組"互補決定區(qū)"是指一起定義天然免疫球蛋白結合位點的天然Fv區(qū)域的結合親和力和特異性的氨基酸序列。例如參見,Chothia等,J.Mol.Biol.196:卯1-917(1987);Kabat等,U.S.Dept.ofHealthandHumanServicesNEHPublicationNo.91-3242(1991)。詞組"恒定區(qū),,是指賦予效應子功能的抗體分子的部分。在本發(fā)明中,用人類恒定區(qū)替換了小鼠恒定區(qū)。對象人源化抗體的恒定區(qū)衍生自人類免疫球蛋白。重鏈恒定區(qū)可以選自任意的以下5種同種型a、s、£、y、fi。人源化抗體的一種方法包括將非人類重鏈和輕鏈序列與人類重鏈和輕鏈序列進行比對,基于該比對選擇并用人類構架替換非人類構架,分子建模以預測人源化序列的構象并與親本抗體的構象相比較。這一方法之后,反復回復突變妨礙CDRs結構的CDR區(qū)殘基,直到人源化序列模型的預測構象密切接近親本非人類抗體的非人類CDRs的構象??梢赃M一步衍生此類人源化抗體以促進攝入和例如通過Ashwell受體的清除。例如參見美國專利號5,530,101和5,585,089,其在此引入作為參考?;騽游飦砩a(chǎn)。例如,WO98/24893公開了具有人類Ig基因座的轉基因動物,其中該動物由于內(nèi)源重鏈和輕鏈基因座的失活而不產(chǎn)生有功能的內(nèi)源免疫球蛋白。WO91/10741也公開了能夠對免疫原產(chǎn)生免疫反應的轉基因非靈長類哺乳動物宿主,其中抗體具有靈長類的恒定和/或可變區(qū),且其中編碼內(nèi)源免疫球蛋白的基因座被替換或失活了。WO96/30498公開了用Cre/Lox系統(tǒng)修飾哺乳動物中免疫球蛋白基因座的應用,諸如替換恒定或可變區(qū)的全部或部分以形成經(jīng)修飾的抗體分子。WO94/02602公開了具有失活的內(nèi)源Ig基因座和有功能的人類Ig基因座的非人類哺乳動物宿主。美國專利號5,939,598公開了制備轉基因小鼠的方法,其中小鼠缺乏內(nèi)源重鏈并且表達包含一個或多個異種恒定區(qū)的異源免疫球蛋白基因座。本發(fā)明的抗體也可以應用如在美國專利5,766,886中所討論的人類基因工程技術得以制備,其在此引入作為參考。應用以上描述的轉基因動物,可以產(chǎn)生對所選擇的抗原分子的免疫反應,以及可以從動物中分離產(chǎn)生抗體的細胞并且用于產(chǎn)生分泌人類單克隆抗體的雜交瘤。免疫方案、佐劑等是本領域已知的,并且例如用于如WO96/33735描述的轉基因小鼠的免疫??蓪慰寺】贵w進行抑制或中和相應蛋白生物學活性或生理學作用的能力測試。本發(fā)明的抗體可以通過如Fang等((2005),Nat.Biotechnol.23,584-590)所討論的體內(nèi)治療性抗體基因轉移而施與給受試者。例如可以產(chǎn)生重組載體以遞送多順反子表達盒,所述表達盒包含介導位于MAb重鏈和輕鏈編碼序列之間多肽的不依賴酶的共翻譯自切割的肽。表達產(chǎn)生化學計量量的兩個MAb鏈。介導不依賴酶的共翻譯自切割的肽的優(yōu)選示例是衍生自口蹄疫的2A肽??贵w片段適合用于本發(fā)明的方法,只要它們保留了全長抗體的期望親和力。因此,抗LIV-1抗體片段將保留結合至LIV-1的能力。此類片段的特征在于與相應的全長抗LIV-1抗體類似的特性,即片段特異性地結合在人類細胞表面上表達的人類LIV-1抗原。在一些實施方案中,抗體結合LIV-1細胞外結構域上的一個或多個表位。在一些實施方案中,抗體調(diào)節(jié)一個或多個LIV-1相關的生物學活性。在一些實施方案中,抗體抑制癌細胞生長、胂瘤形成和癌細胞增殖中的一個或多個。在一些實施方案中,抗體是結合至選自以下的結構域中的一個或多個LIV-1表位的單克隆抗體LIV-1的N端細胞外結構域、跨膜結構域(TM)2和3之間的LIV-1細胞外結構域、TM4和5之間的LIV-1細胞外結構域、TM6和7之間的LIV-1細胞外結構域以及LIV-1的C端細胞外結構域。在一些實施方案中,單克隆抗體結合至TM2和3之間的LIV-1細胞外結構域中的LIV-1表位。在一些實施方案中,單克隆抗體結合至SEQIDNO:388的一個或多個表位。在一些實施方案中,抗體單克隆抗體結合至LIV-1N端細胞外結構域中的LIV-1表位。在一些實施方案中,單克隆抗體結合至SEQIDNO:387的一個或多個表位。根據(jù)本發(fā)明的合適的抗體能夠識別線性或構象型的表位,或其組合。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體結合至選自SEQIDNO:3-6的LIV-1抗原區(qū)域的表位。在一些實施方案中,抗體對具有選自SEQIDNO:3-360的序列的表位是特異的。在一些實施方案中,抗體對具有選自SEQIDNO:361-364或387-391的序列的表位是特異的。應當理解,這些肽可以不需要精確的繪制表位,而是也可以含有非免疫原性的LIV-1序列。預測其它本發(fā)明抗體可以與其結合的潛在表位的方法對于本領域技術人員來說是公知的,包括但不限于Kyte-Doolittle分析(Kyte,J.和Dolittle,R.F"J.Mol.Biol.(1982)157:105-132)、Hopp和Woods分析(Hopp,T.P.和Woods,K,R"Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1981)78:3824-3828;Hopp,TJ.和Woods,K.R.,Mol.Immunol.(1983)20:483-489;Hopp,TJ,,丄Immunol.Methods(1986)88:1-18.)、Jameson-Wolf分析(Jameson,B.A.和Wolf,H.,Comput.Appl.Biosci.(1988)4:181-186.)和Emini分析(Emini,E.A.,Schlief,W.A.,Colonno,RJ.和Wimmer,E.,Virology(1985)140:13-20.)。如果抗體滿足以下條件則被定義為"特異性結合,,l)它們表現(xiàn)出閣水平的結合活性,和/或2)它們不與已知相關多肽分子顯著地交叉反應??贵w的結合親和力可以通過本領域普通技術人員很容易地確定,例如,通過Scatchard分析(Scatchard,Ann.NYAcad.Sci.51:660-672,1949)。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體結合至它們的靶標表位或模擬誘斜,對靶標癌相關多肽比對其它ZIP(Zrt-、Irt-樣蛋白)鋅轉運蛋白的已知成員高至少1.5倍、2倍、5倍、10倍、100倍、103倍、104倍、105倍、106倍或更高。在一些實施方案中,抗體以10^M或更少、10々M或更少、10力M或更少的高親和力,或以亞納摩級親和力(0.9、0.8、0.7、0,6、0.5、0.4、0.3、0.2、0.1nM或甚至更低)結合。在一些實施方案中,抗體對LIV-1的結合親和力至少是lx106Ka。在一些實施方案中,抗體對LIV-1的結合親和力是至少5xl()6Ka、至少lxl(TKa、至少2xl()7Ka、至少lxl()8Ka,或更高。本發(fā)明的抗體也可以根據(jù)它們對本發(fā)明多肽的結合親和力來描述或說明。在一些實施方案中,結合親和力包括Kd小于5xl(^M、1(T2M、5xl03M、103M、5xl04M、1(T4M、5xlOsM、10sM、5xl06M、106M、5x107M、107M、5x108M、108M、5xl(T9M、109M、5x1010M、1010M、5xlO11M、1011M、5x1012M、1012M、5x1013M、1013M、5xl(T"M、1(T14M、5xl(T15M、或l(T15M或更低的那些。在一些實施方案中,例如,如果應用標準蛋白質(zhì)印跡分析(AusubeI等)本發(fā)明的抗體結合LIV-1多肽而不是已知相關多肽,則本發(fā)明的抗體不結合至已知的相關多肽分子。已知相關多肽的例子包括但不限于ZIP(Zrt-,Irt-樣蛋白)鋅轉運蛋白家族的其它成員等,包括但不限于SEQIDNO:365、SEQIDNO:366和SEQIDNO:386。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體結合至LIV-1或鋅轉運蛋白多肽的直向同源物(orthologs)、同源物、旁系同源物(paralogs)或變體、或其組合和亞組合。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體結合至LIV-1或鋅轉運蛋白多肽的直向同源物。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體結合至LIV-1或鋅轉運蛋白多肽的同源物。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體結合至LIV-1或鋅轉運蛋白多肽的旁系同源物。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體結合至LIV-1或鋅轉運蛋白多肽的變體。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體不結合至LIV-1或鋅轉運蛋白多肽的直向同源物、同源物、旁系同源物或變體、或其癥且合和亞組合。在一些實施方案中,可以針對已知相關多肽篩選抗體以分離特異結合至LIV-1多肽的抗體群。例如,在合適的緩沖條件下使對人類LIV-1多肽特異的抗體流過包含附著在不可溶基質(zhì)的ZIP(Zrt-,Irt-樣蛋白)鋅轉運蛋白(除LIV-1之外)的柱。此類篩選允許分離不與密切相關多肽交叉反應的多克隆和單克隆抗體(Antibodies:ALaboratoryManual,Harlow和Lane(編輯),ColdSpringHarborLaboratoryPress,1988、CurrentProtocolsinImmunology,Cooligan等(編輯),NationalInstitutesofHealth,JohnWiley和Sons,Inc.,1995)。特定抗體的篩選和分離在本領域是^^知的(參見,F(xiàn)undamentalImmunology,Paul(編輯),RavenPress,1993、Getzoff等,Adv.inImmunol.43:1-98,1988、MonoclonalAntibodies:PrinciplesandPractice,Goding,J.W.(編輯),AcademicPressLtd"1996、Benjamin等,Ann.Rev.Immunol.2:67-101,1984)。此類分析的代表性例子包括并行免疫電泳、放射免疫分析(RIA)、放射免疫沉淀、酶聯(lián)免疫吸附分析(ELISA)、點印跡或蛋白質(zhì)印跡分析、抑制或竟爭分析以及三明治分析法。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體不特異性的結合至SEQIDNO:365、SEQIDNO:366或SEQIDNO:386。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體不特異性地結合至由SEQIDNO:386的125-138位殘基、SEQIDNO:386的252-265位殘基或SEQIDNO:386的418-431位殘基組成的表位。在一些實施方案中,抗體不與ZnTl或Zipl交叉反應。本發(fā)明也提供是SMIPs或對靶標蛋白特異的結合結構域免疫球蛋白融合蛋白的抗體。這些構建物是包含融合至免疫球蛋白實施抗體效應子功能所必需結構域的抗原結合結構域的單鏈多肽。例如參見W003/041600、美國專利公開20030133939和美國專利公開20030118592。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體是中和抗體。在一些實施方案中,抗體是靶向抗體,在一些實施方案中,抗體在結合粑標后被內(nèi)在化。在一些實施方案中,抗體在結合靶標后不被內(nèi)在化而是保留在表面??梢葬槍Y合至所討論的腫瘤細胞抗原后迅速內(nèi)在化的能力或針對在結合后留在細胞表面的能力篩選本發(fā)明的抗體。在一些實施方案中,例如在一些類型的免疫綴合物構建物中,如果需要內(nèi)在化以釋放毒素部分的話,抗體被內(nèi)在化的能力是所期望的。或者,如果將抗體用于提高ADCC或CDC,更期望抗體保留在細胞表面??梢詰煤Y選方法區(qū)分這些類型的表現(xiàn)。例如,可以利用擁有腫瘤細胞抗原的細胞,其中將細胞與人類IgGl(對照抗體)或本發(fā)明抗體之一以大約1jig/mL的濃度在冰上(具有0.1%疊氮化鈉以阻止內(nèi)在化)或在37。C(沒有疊氮化鈉)孵育3小時。然后用冷的染色緩沖液(PBS+1。/。BSA+0.1。/。疊氮化鈉)洗滌細胞,并用山羊抗人IgG-FITC在水上染色30分鐘。通過FACSCalibur記錄幾何平均熒光強度(MFI)。如果在與本發(fā)明抗體水上于存在疊氮化鈉的情況下孵育的細胞和在"。C不存在疊氮化鈉的情況下觀察的細胞之間沒有觀察到MFI的差別,則認為該抗體是保持結合在細胞表面而不被內(nèi)在化的抗體。然而如果發(fā)現(xiàn)當細胞在37。C不存在疊氮化鈉的情況下孵育時,在表面的可染色的抗體減少了,則認為該抗體是能夠內(nèi)在化的抗體??贵w綴合物在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體是綴合的。在一些實施方案中,綴合的抗體可以用于癌癥治療、癌癥診斷或癌性細胞成像。對用于診斷應用,一般用可檢測部分標記抗體。可利用很多標簽,這些標簽通??梢苑譃橐韵骂愋?a)放射性核素,諸如以下所討論的那些。例如,可以用放射性同位素應用例如描述于CurrentProtocolsinImmunology,巻1和2,Coligen等編輯.Wiley-Interscience,NewYork,N.Y.,Pubs.(1991)的技術標記抗體,并可以用閃鑠計數(shù)法測量方文射性。(b)熒光標簽,諸如可以利用稀土元素螯合物(銪螯合物),或熒光素及其衍生物、羅丹明及其衍生物、丹酰、麗絲胺、藻紅素、德克薩斯紅。可以應用例如以上CurrentProtocolsinImmunology中公開的技術將熒光標簽綴合至抗體??梢杂脽晒庥嫸糠俟狻?c)可以利用各種酶-底物標簽,以及美國專利號4,275,149提供了這些中一些的綜述。酶通常催化可應用各種技術測量的顯色底物的化學改變。例如,酶可以催化可用分光光度計測量的底物的顏色變化。或者,酶可以改變底物的熒光或化學發(fā)光。上面討論了定量熒光改變的技術?;瘜W發(fā)光底物通過化學反應變得電子活躍的,并可能然后發(fā)射可測量(例如應用化學發(fā)光儀)的光或給與能量給熒光受體。酶標簽的示例包括螢光素酶(例如,螢火蟲螢光素酶和細菌螢光素酶,美國專利號4,737,456)、螢光素、2,3-二氫二氮雜萘二酮(2,3-dihydrophthalazinediones)、蘋果酸脫氫酶、脲酶、過氧化物酶諸如辣根過氧物酶(HRPO)、堿性磷酸酶、p-半乳糖苷酶、葡糖淀粉酶、溶菌酶、糖氧化酶(例如,葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶、以及葡萄糖-6-磷酸脫氫酶)、雜環(huán)氧化酶(諸如尿酸酶和黃嘌呤氧化酶)、乳過氧化物酶、微過氧化物酶等。將酶綴合至抗體的技術描述于O,Sullivan等,MethodsforthePreparationofEnzyme-AntibodyConjugatesforuseinEnzymeImmunoassay,MethodsinEnzym.(編輯J.Langone&H.VanVunakis),Academicpress,NewYork,73:147-166(1981)??贵w也可以用于體內(nèi)診斷分析。在一些實施方案中,用放射性核素標記抗體,從而可以應用免疫閃爍成像定位腫瘤。為了方便,本發(fā)明的抗體可以在試劑盒中提供,即預定量試劑和進行診斷分析說明書的經(jīng)包裝的組合。當抗體用酶標記時,試劑盒可以包括酶所需的底物和輔助因子(例如,提供可檢測發(fā)色團或熒光團的底物前體)。此外,還可以包括其它添加劑,諸如穩(wěn)定劑、緩沖液(例如,封閉緩沖液或裂解緩沖液)等。各種試劑的相對量可能變化很大,以提供基本上最優(yōu)化分析敏感性的試劑在溶液中的濃度。具體地,試劑可以作為通常是凍干的干粉提供,所述試劑包括賦形劑,其在溶解后將提供具有合適濃度的試劑溶液。在一些實施方案中,將抗體綴合至一個或多個美登素分子(例如每一個抗體分子約1至約10個美登素分子)。例如,可將美登素轉換為May-SS-Me,后者可還原為May-SH3并與經(jīng)修飾的抗體反應(Chari等CancerResearch52:127-131(1992))以產(chǎn)生美登木素生物堿-抗體免疫綴合物。在一些實施方案中,綴合物可以是高效的美登素衍生物DMl(N2,-脫乙酰-N2,-(3-巰基-l-氧代丙基)-美登素)(例如,參見2002年12月12日公開的WO02/098883),其具有約10-11M的IC50(綜述,參見Payne(2003)CancerCell3:207-212),或DM4(N2,-脫乙酰-N2,(4-甲基-4-巰基-l-氧代戊基)-美登素)(例如參見2004年12月2日公開的WO2004/103272)。在一些實施方案中,抗體綴合物包含綴合至一個或多個加利車霉素分子的抗腫瘤細胞抗原抗體??股氐募永嚸顾丶易迥軌蛟趤喥つ柕臐舛认庐a(chǎn)生雙鏈DNA斷裂??梢允褂玫募永嚸顾亟Y構類似物包括但不限于yll、ot21、a31、N-乙酰-ylI、PSAG和6Il(Hinman等CancerResearch53:3336-3342(1993)和Lode等CancerResearch58:2925-2928(1998))。也參見美國專利號5,714,586、5,712,374、5,264,586和5,773,001,其每一個都明確地在此引入作為參考。在一些實施方案中,抗體綴合至前體藥物,所述前體藥物能夠通過在許多癌中過度生產(chǎn)的酶釋^t它的活性形式。例如,可以與阿霉素的前體藥物形式制得抗體綴合物,其中通過纖維蛋白溶酶從綴合物中釋放活性成分。已知在許多癌性組織中都過度產(chǎn)生纖維蛋白溶酶(參見Decy等,(2004)FASEBJournal18(3):565-567)。在一些實施方案中,將抗體綴合至酶活性毒素或其片段,在一些實施方案中,毒素包括但不限于白喉A鏈、白喉毒素的非結合活性片段、外毒素A鏈(來自銅綠假單胞菌(/^"flto附ow肪""MgZ"仍fl))、假單胞菌內(nèi)毒素、蓖麻毒素A鏈、相思豆毒素A鏈、蒴蓮根毒素A鏈、a-帚曲霉素、油桐蛋白、石竹素蛋白、美洲商陸(Phytolacaamericana)蛋白(PAPI、PAPII和PAP-S)、核糖核酸酶(Rnase)、脫氧核糖核酸酶(Dnase)、美洲商陸抗病毒蛋白、苦瓜抑制劑、麻風樹毒蛋白、巴豆毒蛋白、肥皂草(sapaonariaofficinalis)抑制劑、白樹毒素、促細胞分裂劑、局限曲菌素、酚霉素、新霉素和單端孢霉烯族化合物(tricothecenes)。例如參見1993年10月28日公開的WO93/21232。在一些實施方案中,毒素具有很低的內(nèi)在免疫原性以及減少癌性細胞變得耐受毒素的可能性的作用機理(例如,細胞毒性機理對細胞抑制才幾理)。在一些實施方案中,在本發(fā)明的抗體和免疫調(diào)節(jié)劑之間制得綴合物。例如,在一些實施方案中,可以應用免疫刺激性寡核苷酸。這些分子是可以引起抗原特異性抗體反應的有效免疫原(參見Datta等,(2003)AnnN.Y.Acad.Sci1002:105-111)。其它的免疫調(diào)節(jié)化合物可以包括干細胞生長因子,諸如"S1因子";淋巴毒素,諸如腫瘤壞死因子(TNF);造血因子,諸如白介素;集落刺激因子(CSF),諸如粒細胞集落刺激因子(G-CSF)或粒細胞巨噬細胞刺激因子(GM-CSF);干擾素(IFN),諸如干擾素a、卩、y;促紅細胞生成素以及促血小板生成素。在一些實施方案中,提供了放射綴合的抗體。在一些實施方案中,此類抗體可以應用32P、33P、47Sc、59Fe、64Cu、67Cu、75Se、77As、89Sr、90Y、"Mo、105Rh、109Pd、125I、131I、142Pr、143Pr、149Pm、153Sm、161Th、166Ho、169Er、177Lu、186Re、188Re、189Re、194Ir、198Au、199Au、211Pb、212Pb、213Bi、58Co、67Ga、80mBr、99mTc、103mRh、109Pt、161Ho、189mOs、192Ir、152Dy、211At、212Bi、223Ra、219Rn、215Po、211Bi、225Ac、221Fr、217At、213Bi、255Fm或其組合或亞組合而制得。在一些實施方案中,將硼、釓或鈾原子綴合至抗體。在一些實施方案中,硼原子是1GB、釓原子是157Gd以及鈾原子是235U。在一些實施方案中,放射性核素綴合物具有能量在20至10,000keV之間的放射性核素。放射性核素可以是具有小于1000keV能量的Auger發(fā)射體、具有20至5000keV之間能量的P發(fā)射體、或具有2000至10,000keV之間能量的a或"a"發(fā)射體。在一些實施方案中,提供了診斷的放射性綴合物,其包含是發(fā)射,、P-或發(fā)射正電子的同位素的方文射性核素。在一些實施方案中,放射性核素具案中,放射性核素選自18F、51Mn、52mMn、S2Fe、55Co、62Cn、64Cn、68Ga、72As、75Br、76Br、82mRb、83Sr、89Zr、94mTc、51Cr、57Co、58Co、59Fe、67Ga、7SSe、97Ru、99mTc、114mIn、123I、125I、131^和197!^。在一些實施方案中,本發(fā)明的抗體綴合至是光活化劑或造影劑的診斷劑。光活化化合物可以包含諸如發(fā)色團或染料的化合物。造影劑例如可以是順磁離子,其中離子包含選自以下的金屬鉻(III)、錳(II)、鐵(III)、鐵(n)、鈷(n)、鎳(n)、銅(n)、釹(in)、釤(in)、鐿(ni)、釔(ni)、釩(n)、鋱(ni)、鏑(ni)、鈥(ni)和鉺(ni)。造影劑也可以是用于x射線技術或計算機斷層掃描中的射線不透性化合物,諸如碘、銥、鋇、鎵和鉈化合物。射線不透性化合物可以選自鋇、3,5-雙[乙酰氨基-2,4,6-三碘苯甲酸鹽、乙碘油(ethiodizedoil)、檸檬酸鎵、碘卡酸、碘酸胺酸、碘達酸、膽影酸、碘沙酸、iogulamide、碘海醇、磺帕醇、碘番酸、-典普西酸、碟西法酸、碘絲酸、碘磺拉胺甲基葡胺、iosemetic酸、碘酞硫、硪替酸、碘拉酸、碘托西酸、碘克沙酸、羥泛影酸、碘泊酸鹽、甲基葡胺、甲泛葡胺、曱泛影鈉、丙磺酮以及氯化亞鉈。在一些實施方案中,診斷性免疫綴合物可以含有綴合至本發(fā)明抗體的超聲增強劑,諸如充滿氣體的脂質(zhì)體。診斷性免疫綴合物可以用于各種方法中,包括但不限于腫瘤或癌癥診斷和檢測的手術中、內(nèi)窺鏡檢查或血管內(nèi)方法。在一些實施方案中,應用各種雙功能蛋白偶聯(lián)劑制備綴合物,所述偶聯(lián)劑諸如N-琥珀酰亞胺-3-(2-吡咬基二硫酚)丙酸鹽(SPDP)、琥珀酰亞胺-4-(N-馬來酰亞胺基甲基)環(huán)己烷-l-羧酸鹽、亞氨基硫烷(IT)、亞氨酸酯的雙功能衍生物(諸如己二酰亞氨二甲酯HCL)、活性酯(諸如二琥珀酰亞胺基辛二酸酯)、醛(諸如戊二醛)、二-疊氮基化合物(諸如二(對疊氮基苯曱酰)己二胺)、二-重氮衍生物(諸如二-(對重氮基苯甲酰)乙二胺)、二異氰酸鹽(諸如甲苯2,6-二異氰酸鹽)以及雙活性氟化合物(諸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。例如,可以如Vitetta等Science238:1098(1987)描述的方法制備蓖麻毒素免疫毒素。碳-14-標記的l-異硫氰酸苯曱基-3-甲基二亞乙基三胺五乙酸(MX-DTPA)是用于將放射性核苷酸綴合至抗體的示范性螫合劑。參見WO94/11026。接頭可以是能促進細胞毒素藥物在細胞中釋放的"可切割接頭"。例如,可以應用酸不穩(wěn)定的接頭、肽酶敏感的接頭、二甲基接頭或含有二硫化物的接頭(Chari等CancerResearch52:127-131(1992))。此外試劑也可以通過碳水化合物部分連接至本發(fā)明的抗體。在一些實施方案中,包含本發(fā)明的抗體和細胞毒劑的融合蛋白例如可以通過重組技術或肽合成制備。在一些實施方案中,將此類包含與細胞毒劑綴合的抗腫瘤抗原抗體的免疫綴合物施與患者。在一些實施方案中,免疫綴合物和/或其結合的腫瘤細胞抗原蛋白被細胞內(nèi)在化,導致增加了免疫綴合物在殺傷其結合的癌細胞中的治療效力。在一些實施方案中,細胞毒劑耙向或干擾癌細胞中的核酸。此類細胞毒劑的例子包括美登木素生物堿、加利車霉素、核糖核酸酶和DNA核酸內(nèi)切酶。在一些實施方案中,抗體綴合至"受體"(例如鏈親和素)用于在腫瘤預耙向中的應用,其中將抗體-受體綴合物施與患者,隨后用清潔劑從循環(huán)中移除未結合的綴合物并然后施與綴合至細胞毒劑(例如放射性核苷酸)的"配體"(例如抗生物素蛋白)。在一些實施方案中,抗體綴合至在靶細胞溶酶體內(nèi)釋放的細胞毒素分子。例如,可以通過纈氨酸-瓜氨酸連接來綴合藥物一曱基奧瑞他汀(auristatin)E(MMAE),在抗體綴合物內(nèi)在化后,所述纈氨酸-瓜氨酸連接會凈皮水解蛋白的溶酶體酶—組織蛋白酶B切割(例如參見2003年4月3日公開的WO03/026577)。在一些實施方案中,可應用酸不穩(wěn)定的接頭將MMAE連接至抗體,所述酸不穩(wěn)定的接頭含有作為可切割部分的腙官能度(例如參見2002年11月11日公開的WO02/088172)??贵w依賴的酶介導的前體藥物治療(ADEPT)在一些實施方案中,通過綴合抗體至前體藥物活化酶可以將本發(fā)明的抗體用于ADEPT,所述前體藥物活化酶將前體藥物(例如,肽基化學治療劑,參見WO81/01145)轉換為活性抗癌藥物。例如參見\¥088/07378和美國專利號No.4,975,278。在一些實施方案中,用于ADEPT的免疫綴合物的酶組分包括任何能夠以將前體藥物轉換為它的更有效的細胞毒性形式的方式作用于前體藥物在ADEPT中有用的酶包括但不限于用于將含有磷酸酯的前體藥物轉換為游離藥物的堿性磷酸酶;用于將含有硫酸酯的前體藥物轉換為游離藥物的芳香基硫酸酯酶;用于將非毒性5-氟胞嘧啶轉換為抗癌藥物5-氟尿嘧啶的胞嘧啶脫氨酶;用于將含有肽的前體藥物轉換為游離藥物的蛋白酶,諸如靈桿菌(serratia)蛋白酶、嗜熱菌蛋白酶、枯草桿菌蛋白酶、羧肽酶和組織蛋白酶(諸如組織蛋白酶B和L);用于轉換含有D-氨基酸替代物的前體藥物的D-丙氨酰羧基肽酶;用于將糖基化前體藥物轉換為游離藥物的糖切割酶,諸如p-半乳糖苷酶和神經(jīng)氨酸酶;用于將與p-內(nèi)酰胺衍生的藥物轉換為游離藥物的p-內(nèi)酰胺酶;用于將在它們的胺氮上分別用苯氧基乙?;虮揭阴;鶊F衍生的藥物轉換為游離藥物的青霉素酰胺酶,諸如青霉素V酰胺酶或青霉素G酰胺酶。在一些實施方案中,可以用具有酶活性的抗體(在本領域也稱為"抗體酶(abzymes)")將本發(fā)明的前體藥物轉換為游離的活性藥物(例如參見,Massey,Nature328:457-458(1987))。可以如本文描述的那樣制備抗體-抗體酶綴合物用于將抗體酶遞送至腫瘤細胞群。在一些實施方案中,可以通過本領域公知的技術將ADEPT酶共價結合至抗體,諸如應用上面討論的異雙功能交聯(lián)劑。在一些實施方案中,可以應用本領域公知的重組DNA技術構建包含連接至本發(fā)明的酶的至少功能活性部分的本發(fā)明抗體的至少抗原結合區(qū)域的融合蛋白(例如參見Neuberger等,Nature,312:604-608(1984))。在一些實施方案中,對以細胞抑制方式而不是以細胞毒性方式作用的抗體的鑒定可以通過測量與未經(jīng)處理的對照培養(yǎng)物相比,經(jīng)處理的靶細胞培養(yǎng)物的生存力來完成??梢杂帽绢I域已知的方法檢測生存力,諸如CellTiter-Blue細胞生存力測試法或CellTiter-Glo發(fā)光細胞生存力測試法(Promega,目錄編號分別是G8080和G5750)。在一些實施方案中,如果處理引起與對照培養(yǎng)相比在細胞數(shù)目上的降低,而沒有任何如通過以上描述的方法測量的細胞死亡的證據(jù),則認為該抗體是潛在的細胞抑制劑。在一些實施方案中,可以應用本領域已知的測試法進行體外篩選測試以鑒定促進ADCC的抗體。一個示范性測試法是體外ADCC測試法。為制備鉻51標記的靶細胞,使腫瘤細胞系在組織培養(yǎng)板中生長并用滅菌的在PBS中的10mMEDTA收集。用細胞培養(yǎng)基洗滌分離的細胞兩次。用200nCi鉻51(NewEnglandNuclear/DuPont)在37。C標記細胞(5xl06)—個小時,偶爾進行混合。用細胞培養(yǎng)基洗滌經(jīng)標記的細胞三次,然后將細胞懸浮至1x1()5個細胞/mL的濃度。在通過與抗體在PBMC測試法中以100ng/mL和1.25ng/mL或在NK測試法中以20ng/mL和1ng/mL孵育的測試之前,細胞沒有經(jīng)調(diào)理作用或經(jīng)調(diào)理作用。通過從正常健康供體收集肝素支持的血液并用等容積的磷酸緩沖鹽水(PBS)稀釋制備外周血單核細胞。然后將血液鋪在LYMPHOCYTESEPARATIONMEDIUM(LSM:OrganonTeknika)上并按照生產(chǎn)商的教導離心。從LSM-血漿分界面收集單核細胞并用PBS洗滌3次。將效應細胞懸浮在細胞培養(yǎng)基中至終濃度1xl(f個細胞/mL。在通過LSM純化后,應用NK細胞分離試劑盒和磁柱(MiltenyiBiotech),按照生產(chǎn)商的教導,通過負選擇從PBMCs分離自然殺傷(NK)細胞。收集分離的NK細胞,洗滌并懸浮于細胞培養(yǎng)基中達到2x1(^個細胞/mL的濃度。通過流式細胞分析確定NK細胞的身份。通過用細胞培養(yǎng)基沿微滴定板的行兩倍系列稀釋效應(PBMC或NK)細胞(100nL終體積)而制備不同的效應子靼標比。效應細胞的濃度范圍對于PBMC是1.0x107/mL至2.0x104/mL,且對于NK是2.0x106/mL至3.9x103/mL。在效應細胞的滴定之后,將100nL1x1()5個細胞/mL的鉻51標記的耙細胞(受調(diào)理或未受調(diào)理)加至板的每一個孔。這樣得到對于PBMC的100:1的初始效應子靼標比以及對于NK細胞的20:1的初始效應子靶標比。所有的分析均以雙份進行,并且每一塊板都含有對于自發(fā)裂解(沒有效應細胞)和總裂解(靶細胞加上100jiL1%十二烷基硫酸鈉、IN氫氧化鈉)的對照。將板在37。C孵育18小時,之后應用上清收集系統(tǒng)(SkatronInstrument,Inc.)收集細胞培養(yǎng)上清液并在Minaxi自動-y5000系列y計數(shù)器(Packard)中計數(shù)1分鐘。然后應用公式%細胞毒性-(樣本cpm-自發(fā)裂解)/(總裂解-自發(fā)裂解)x100以細胞毒性百分數(shù)表達結果。為鑒定促進CDC的抗體,熟練的技術人員可以進行本領域已知的測試。一個示范性的測試法是體外CDC測試法。在體外,CDC活性可以通過將表達腫瘤抗原的細胞與人類(或其它來源)含有補體的血清在不存在或存在不同濃度測試抗體的情況下孵育而得以測量。然后通過應用ALAMARBLUE(Gazzano-Santoro等,J.Immunol.Methods202163-171(1997))定量活細胞來測量細胞毒性。以不含抗體和含有抗體,但使用熱滅活血清和/或應用不表達所討論的腫瘤細胞抗原的細胞來進行對照測試?;蛘?,可以用腫瘤抗原或衍生自腫瘤抗原的肽包被紅細胞,以及然后可以通過觀察紅細胞裂解來測試CDC(例如參見Karjalainen和Mantyjarvi,ActaPatholMicrobiolScandC.1981年10月;89(5):315-9)。為選擇誘導細胞死亡的抗體,可以相對于對照評估如通過PI、臺盼藍或7AAD攝入指示的膜完整性的喪失。一個示范性測試法是應用表達腫瘤抗原的細胞的PI攝入測試法。按照這一測試法,在補充有10%熱失活FBS(Hyclone)和2mML-谷氨酰胺的Dulbecco改良Eagle培養(yǎng)基(D-MEM):Ham'sF-12(50:50)中培養(yǎng)表達肺瘤細胞抗原的細胞。(因此,該測試法在不存在補體和免疫效應細胞的情況下進行)。以每培一3xl06的密度在100x20mm培養(yǎng)皿中接種腫瘤細胞并允許貼附過夜。然后移除培養(yǎng)基,并替換以單獨的新鮮培養(yǎng)基或含有iopg/mL合適單克隆抗體的培養(yǎng)基。將細胞孵育3天時間。在每個處理之后,用PBS洗滌單細胞層并通過胰蛋白酶消化分離。然后將細胞在4"C以1200轉/分鐘離心5分鐘,將沉淀重懸浮于3ml冰冷的Ca2+結合緩沖液(10mMHepes,pH7.4,140mMNaCl,2.5mMCaCh)中,并分裝至用于移除細胞團塊的蓋有35mm濾過器的12x75管(每管lml,每一處理組3管)中。管然后接受PI(10pg/mL)??梢詰肍ACSCANtm流式細胞計和FACSCONVERTtm.CellQuest軟件(BectonDickinson)分析樣本。那些誘導統(tǒng)計學顯著水平的細胞死亡(如通過PI攝入所確定的那樣)的抗體可以選擇作為誘導細胞死亡的抗體。也可以應用"F-膜聯(lián)蛋白作為PET成像劑在體內(nèi)針對細胞凋亡活性篩選抗體。在這一方法中,用"F放射性標記膜聯(lián)蛋白V并且在測試動物服用所研究的抗體后將其給予測試動物。在細胞凋亡過程中發(fā)生的最早事件之一是磷脂酰絲氨酸從細胞膜的內(nèi)側外翻至可被膜聯(lián)蛋白接近的細胞外表面。然后將動物進行PET成像(參見Yagle等,JNuclMed.2005年4月;46(4):658-66)。也可以將動物處死并分離單個的器官或腫瘤并按照標準方案針對細胞凋亡標記進行分析。盡管在一些技術方案中,癌癥的特征是基因表達產(chǎn)物的過量表達,本申請還提供了用于治療這樣的癌癥的方法,所述癌癥不認為是過量表達腫瘤抗原的癌癥。為確定癌中腫瘤抗原的表達,可以利用各種診斷/預后測試法。在一些實施方案中,可以通過IHC分析基因表達產(chǎn)物的過量表達??梢詫⑹灠竦膩碜阅[瘤活組織檢查的組織切片進行IHC測試,并如下給予胂瘤抗原蛋白染色強度標準得分0:沒有觀察到染色或在少于10%的腫瘤細胞中觀察到膜染色;得分1+:在超過10%的腫瘤細胞中檢測到微弱的/幾乎不能察覺的膜染色。這些細胞僅僅在它們膜的一部分被染色。得分2+:在超過10%的腫瘤細胞中觀察到弱至中等的完全的膜染色。得分3+:在超過10。/。的腫瘤細胞中觀察到中等至強的完全的膜染色??蓪⒕哂?或1+的腫瘤抗原過量表達評估得分的那些腫瘤描述為不過量表達腫瘤抗原,而將具有2+或3+得分的那些腫瘤描述為過量表達腫瘤抗原。備選地,或另外地,可在福爾馬林固定、石蠟包埋的的腫瘤組織上進行諸如informtm(由Ventana,Ariz銷售)或PATHVISIONtm(Vysis,Ill.)的FISH測試法,以確定腫瘤中腫瘤抗原過量表達的程度(如果有的話)。此外,可通過共價綴合至聚合物來化學修飾抗體以例如增加它們的循環(huán)半壽期。每一個抗體分子可連接至一個或多個(即1、2、3、4、5或更多)聚合物分子。優(yōu)選地將聚合物分子通過連接分子連接至抗體。一般而言,聚合物可以是合成的或天然存在的聚合物,例如任選取代的直鏈或支鏈聚烯烴、聚亞烯烴或聚氧基亞烷基聚合物或支鏈或無支鏈的多糖,例如同-或異多糖。在一些實施方案中,聚合物是聚氧乙烯多元醇或聚乙二醇(PEG)。PEG在室溫下可溶于水并且具有通式R(0-CH2-CH2)nO-R,其中R可以是氫或保護基團,諸如烷基或烷醇基團。在一些實施方案中,保護基團具有1至8個碳。在一些實施方案中,保護基團是甲基。符號ii是1至1,000之間或2至500之間的正整數(shù)。在一些實施方案中,PEG具有1000至40,000之間、2000至20,000之間、或3,000至12,000之間的平均分子量。在一些實施方案中,PEG具有至少一個羥基基團。在一些實施方案中,羥基是末端羥基基團。在一些實施方案中,正是這一羥基基團被活化以與抑制劑上的游離氨基基團反應。然而,應當理解,反應基團的種類和量可以是不同的以得到本發(fā)明共價綴合的PEG/抗體。聚合物以及將它們連接至多肽的方法顯示于美國專利號4,766,106、4,179,337、4,495,285和4,609,546,其每一個均在此全文引入作為參考。寡核苷酸在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是寡核苷酸。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是包含選自SEQIDNO:367-382的序列的寡核苷酸。在一些實施方案中,寡核苷酸H義或RNAi寡核苷酸,包括siRNAs和shRNAs。在一些實施方案中,寡核苷酸與LIV-1基因或基因產(chǎn)物的區(qū)域、結構域、部分或片段互補。在一些實施方案中,寡核苷酸包含約5至約100個核苷酸、約10至約50個核苷酸、約12至約35、以及約18至25個核苷酸。在一些實施方案中,寡核苷酸與LIV-1基因或基因產(chǎn)物的區(qū)域、部分、結構域或片段至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同源。在一些實施方案中,寡核苷酸與LIV-1基因或基因產(chǎn)物的至少15、20、25、30、35、40、50或100個連續(xù)核苷酸存在相當高的序列同源性。在一些實施方案中,寡核苷酸與全長的LIV-1基因或基因產(chǎn)物存在相當高的序列同源性。在一些實施方案中,寡核苷酸在中等或嚴格雜交條件下結合至具有SEQIDNO:1核苷酸序列的核酸分子。在一些實施方案中,LIV-l調(diào)節(jié)劑是雙鏈RNA(dsRNA)分子并通過RNAi(RNA干擾)工作。在一些實施方案中,dsRNA的一條鏈與LIV-l基因的區(qū)域、部分、結構域或片段至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至少卯%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%同源。在一些實施方案中,與LIV-l基因的至少15、20、25、30、35、40、50、100、200、300、400、500或1000個連續(xù)核苷酸存在相當高的序列同源性。在一些實施方案中,與全長的LIV-l基因存在相當高的序列同源性。在一些實施方案中,本發(fā)明的寡核苷酸用于聚合酶鏈式反應(PCR)。這一序列可基于基因組序列或cDNA序列(或由此設計)并用于擴增、確定或檢測在特定細胞或組織中同一的、類似的或互補的DNA或RNA的存在。小分子在一些實施方案中,LIV-l調(diào)節(jié)劑是小分子。本文所使用的術語"小分子"是指具有小于約IO千道爾頓分子量的有機或無機非聚合物化合物。小分子的示例包括肽、寡核苷酸、有機化合物、無機化合物等。在一些實施方案中,小分子具有小于約9、約8、約7、約6、約5、約4、約3、約2或約1千道爾頓的分子量。模擬物在一些實施方案中,LIV-l調(diào)節(jié)劑是模擬物。本文所使用的術語"模擬物,,是指模擬肽活性的化合物。模擬物是非肽但可以包含通過非肽鍵連接的氨基酸。1997年6月10日發(fā)布的美國專利號5,637,677及其母申請(其全部在此引物作為參考)包含產(chǎn)生模擬物的詳細教導。簡而言之,用不是肽的分子復制與LIV-1三維結構特異性相互作用的肽的三維結構。在一些實施方案中,LIV-1模擬物是LIV-1的模擬物或LIV-l配體的模擬物。誘斜在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是包含至少一部分LIV-1多肽的誘斜。在一些實施方案中,誘辨與天然LIV-1多肽竟爭鋅或鋅載體-鋅復合體。在一些實施方案中,標記誘斜以利于定量、定性和/或可視化。在其它的實施方案中,誘斜還包含利于誘斜或誘斜-鋅或誘飾-鋅栽體復合體分離或分開的部分。在一些實施方案中,誘斜通過捕獲鋅和/或鋅載體(與鋅復合或未復合)并阻止其與傳導信號的LIV-1多肽相互作用發(fā)揮功能。在一些實施方案中,誘飾至少包含融合至抗體或抗體片段的LIV-1多肽的部分。治療/預防癌癥的方法
技術領域
:本發(fā)明提供了在受試者中治療和/或預防癌癥或癌癥癥狀的方法,其包括給受試者施與治療有效量的一種或多種本發(fā)明的LIV-1調(diào)節(jié)劑。在一些實施方案中,癌癥是與LIV-1過量表W目關的癌癥。在一些實施方案中,癌癥是乳腺癌、皮膚癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宮癌、子宮頸癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多發(fā)性骨髓瘤或黑素瘤。在一些實施方案中,癌位于非激素調(diào)節(jié)的組織。在一些實施方案中,乳腺癌是ER-陽性乳腺癌、ER-陰性乳腺癌、或轉移性乳腺癌。在一些實施方案中,乳腺癌是管腺癌、小葉腺癌或轉移性腺癌。在一些實施方案中,受試者已被診斷為患有癌癥或是對癌癥易感的。癌癥的癥狀是本領域技術人員公知的并且包括但不限于胸部腫塊、乳頭變化、胸部嚢腫、胸部疼痛、死亡、重量減輕、虛弱、極度疲勞、進食困難、食欲不振、久咳、惡化的氣喘、咳出血、尿血、4更血、惡心、嘔吐、肝轉移、肺轉移、骨轉移、腹痛下墮、氣脹、腹膜腔中有液體、陰道流血、便秘、腹脹、結腸穿孔、急性腹膜炎(感染、發(fā)燒、疼痛)、疼痛、吐血、重汗、發(fā)燒、高血壓、貧血、腹瀉、黃疸、眩暈、寒戰(zhàn)、肌肉痙攣、結腸轉移、肺轉移、膀胱轉移、肝轉移、骨轉移、腎轉移、以及胰腺轉移、吞咽困難等。所述調(diào)節(jié)化合物的治療有效量可以按照藥劑師公知的程序憑經(jīng)驗確定,并且將尤其取決于患者的年齡、疾病的嚴重度以及取決于所期望的最終藥物制劑。本發(fā)明調(diào)節(jié)劑的施與例如可以以下列方式進^f亍通過吸入或松劑或施與至粘膜組織(諸如通過灌洗至陰道、直腸、尿道、口腔或舌下組織)、經(jīng)口地、局部地、鼻內(nèi)地、腹膜內(nèi)地、非腸胃地、靜脈內(nèi)地、淋巴管內(nèi)地、瘤內(nèi)地、肌內(nèi)地、間質(zhì)地、動脈內(nèi)地、皮下地、經(jīng)眼地(intraoccularly)、滑膜內(nèi)地、經(jīng)上皮的和經(jīng)皮地施用。在一些實施方案中,抑制劑通過灌洗、口頭或動脈內(nèi)施與。其它合適的引入方法也可以包括可再填裝(rechargeable)或可生物降解的裝置以及緩慢或持續(xù)釋放的聚合物裝置。如上面所討論的那樣,本發(fā)明的治療組合物可以作為與其它已知抗癌劑或其它已知抗骨病治療方案的聯(lián)合治療的一部分施與。本發(fā)明還提供了在患者中調(diào)節(jié)LIV-1相關生物學活性的方法。該方法包括給患者施與調(diào)節(jié)一種或多種LIV-1生物活性有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑。在上文或下文中給出了用于測量LIV-1生物活性的合適的測試法。本發(fā)明也提供了在有需要的患者中抑制癌細胞生長的方法,包括給患者施與治療有效量的一種或多種LIV-1調(diào)節(jié)劑。用于測量LIV-1相關細胞生長的合適的測試法是本領域普通技術人員已知的并且在上文和下文中給出。本發(fā)明還提供了在有需要的患者中抑制癌癥的方法。方法包括確定患者是否是本文所述的LIV-1治療的候選者,以及如果患者是LIV-1治療的候選者則施與治療有效量的一種或多種LIV-1調(diào)節(jié)劑給患者。如果患者不是LIV-1治療的候選者,則用常規(guī)癌癥療法來治療患者。本發(fā)明還提供了在診斷或懷疑患有癌癥的患者中抑制癌癥的方法。方法包括施與治療有效量的一種或多種LIV-1調(diào)節(jié)劑給患者。本發(fā)明也提供了在患者中抑制兩個或多個細胞相互作用的方法,包括施與治療有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑給所述患者。用于測量LIV-1相關細胞相本發(fā)明也提供了在患者中調(diào)節(jié)一種或多種癌癥癥狀的方法,包括給所述患者施與治療有效量的本文所描述的LIV-1組合物。本發(fā)明還提供了在有需要的患者中抑制細胞生長的方法,包括給患者施與治療有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑。在上文和下文中給出了適合用于測量LIV-1相關的貼壁不依賴細胞生長的測試法。本發(fā)明也提供了在有需要的患者中抑制癌細胞遷移的方法,包括給患者施與治療有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑。用于測量LIV-1相關的細胞遷移的合適的測試法是本領域技術人員已知的。本發(fā)明還提供了在有需要的患者中抑制癌細胞粘附的方法,包括給患者施與治療有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑。用于測量LIV-1相關的細胞粘附的測試法是本領域技術人員已知的。本發(fā)明也提供了用于預防性治療患者的方法,所述患者是對形成癌、癌轉移易感的患者或已患有轉移病變并因此對再發(fā)或復發(fā)易感的患者。該方法在例如具有癌癥家族史或轉移腫瘤家族史,或顯示出癌轉移的遺傳傾向性的高危個體中是特別有用的。在一些實施方案中,腫瘤是LIV-1相關肺瘤。此外,該方法能用于預防患者LIV-1相關腫瘤的復發(fā),所述患者患有已通過外科切除術移除或用常規(guī)的癌癥治療方法治療的LIV-1相關肺瘤。本發(fā)明也提供了抑制癌進程和/或引起癌消退的方法,所述方法包括給患者施與治療有效量的LIV-1調(diào)節(jié)劑。在一些實施方案中,用本發(fā)明的LIV-1調(diào)節(jié)劑與化學療法和/或^L射療法聯(lián)合治療需要抗癌治療的患者。例如,在施與LIV-1調(diào)節(jié)劑后,也可以用治療有效量的抗癌放射治療患者。在一些實施方案中,提供了與LIV-1調(diào)節(jié)劑聯(lián)合的化學療法治療。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑與化學療法和放射療法聯(lián)合施與。治療方法包括施與單劑量或多劑量的一種或多種LIV-1調(diào)節(jié)劑給患者。在一些實施方案中,以無菌、無熱原且包含與可藥用載體或稀釋劑聯(lián)合的LIV-1調(diào)節(jié)劑的可注射藥物組合物施與LIV-1調(diào)節(jié)劑。在一些實施方案中,本發(fā)明的治療方案與常規(guī)的癌癥治療方案一起使用,所述常規(guī)的癌癥治療方案包括但不限于外科手術、放射治療、激素消融和/或化學治療。本發(fā)明LIV-1調(diào)節(jié)劑的施與可發(fā)生在常規(guī)的癌癥治療之前、同時或之后。在一些實施方案中,給患者施與兩種或多種不同的LIV-1調(diào)節(jié)劑。在一些實施方案中,施與患者的LIV-1調(diào)節(jié)劑的量能有效地抑制癌細胞生長、腫瘤形成、癌細胞增殖、癌細胞轉移、細胞遷移、血管生成、LIV-1信號傳導、抑制LIV-1介導的細胞-細胞粘附、LIV-1介導的細胞-細胞膜相互作用、LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)相互作用、整聯(lián)蛋白介導的活性、LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)降解以及LIV-l表達中的一種或多種。在一些實施方案中,施與患者的LIV-1調(diào)節(jié)劑的量能有效地通過細胞凋亡增加癌細力包死亡。聯(lián)合治療在一些實施方案中,發(fā)明提供了包含兩種或多種LIV-1調(diào)節(jié)劑的組合物以提供更改良的抗癌效力。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是單克隆抗體??蓪瑑煞N或多種LIV-1抗體的組合物施與患有或傾向于患有癌癥的人或哺乳動物。也可將一種或多種抗體與另外一種治療劑,諸如細胞毒劑或癌化療劑施與。兩種或多種治療劑的同時施與不需要在相同的時間或通過相同的途徑施與所述藥劑,只要在藥劑發(fā)揮它們治療作用期間的時間段有重疊即可??紤]在不同天或周施與的同時或順次施與。在一些實施方案中,本發(fā)明提供的方法考慮了施與不同抗體的聯(lián)合或"混合物(cocktails)"。此類抗體混合物具有某些優(yōu)點,因為它們含有利用不同效應物機理的抗體或使細胞毒性抗體與依賴免疫效應物功能的抗體直接聯(lián)合。此類聯(lián)合的抗體可能表現(xiàn)出協(xié)同的治療效果。細胞毒劑是指抑制或阻止細胞功能和/或引起細胞毀滅的物質(zhì)。該術語意圖包括放射性同位素(例如,1311、1251、卯Y和讓Re)、化學治療劑和毒素,所述毒素諸如細菌、真菌、植物或動物來源的酶活性毒素、或合成毒素、或其片段。非細胞毒劑是指不會抑制或阻止細胞功能和/或不《1起細胞毀滅的物質(zhì)。非細胞毒劑可以包括能被活化為細胞毒劑的試劑。非細胞毒劑可以包括珠子、脂質(zhì)體、基質(zhì)或顆粒(例如參見,美國專利公開2003/0028071和2003/0032995,其在此引入作為參考)。此類試劑可以與本發(fā)明的抗體綴合、偶聯(lián)、連接或聯(lián)合。在一些實施方案中,將常規(guī)癌癥藥物與本發(fā)明的組合物一起施與。常規(guī)癌癥藥物包括a)癌癥化療劑;b)其它的藥劑;c)前體藥物。癌癥化療劑包括但不限于烷化劑,諸如卡波鉑和順氯氨柏;氮芥烷化劑;亞硝基脲烷化劑,諸如亞硝脲氮芥(BCNU);代謝拮抗劑,諸如氨甲蝶呤;亞葉酸;嘌呤類似物代謝拮抗劑,巰基嘌呤;嘧啶類似物代謝拮抗劑,諸如氟尿嘧啶(5-FU)和吉西他濱(Gemzar);激素抗腫瘤藥,諸如戈舍瑞林、利普安和他莫昔芬;天然抗腫瘤藥,諸如阿地白介素、白介素-2、紫杉辟、依托泊苷(VP-16)、干擾素(x、紫杉醇(Taxo隨)和維甲酸(ATRA);抗生素天然抗腫瘤藥,諸如博萊霉素、放線菌素、柔紅霉素、阿霉素、道諾霉素和包括絲裂霉素C的絲裂霉素;以及長春花生物堿天然抗腫瘤藥,諸如長春花堿、長春新堿、去乙酰長春酰胺;羥基脲;醋葡內(nèi)酯、阿霉素、異環(huán)磷酰胺、依諾他濱、環(huán)硫雄醇、阿柔比星、環(huán)胞苷、嘧啶亞硝脲、鹽酸甲基下肼、卡巴醌、卡波鉑、卡莫氟、色霉素A3、抗癌多糖、抗癌血小板因子、環(huán)磷酰胺(Cytoxin⑧)、裂裥菌素、阿糖胞苷(胞嘧啶阿拉伯糖苷)、氮烯唑胺、硫肌苷、硫替派、替加氟、多拉司他汀、多拉司他汀類似物諸如奧瑞他汀(auristatin)、CPT-ll(依立替康)、米托蒽醌、長春瑞濱、替尼泊苷、胺-蝶呤、洋紅霉素、esperamicins(例如參見,美國專利號4,675,187)、新制癌菌素、OK-432、博萊霉素、氟牽失龍、溴苷、白消安、二磷酸已烯雌酚四鈉、培洛霉素、貝他定(Ubenimex⑧)、干擾素-P、美雄烷、二溴甘露醇、米爾法蘭、層粘連蛋白肽、蘑菇多糖、云芝提取物、替加氟/尿嘧啶、雌氮芥(雌激素/氮芥)??梢杂米靼┌Y患者治療的其它的藥劑包括EPO、G-CSF、更昔洛偉;抗體、利普安;哌嘧啶;齊多夫定(AZT);白介素1至18,包括突變體和類似物;干擾素或細胞因子,諸如干擾素a、P和y;激素,諸如黃體生成素釋放激素(LHRH)和類似物,以及促性腺激素釋放激素(GnRH);生長因子,諸如轉化生長因子-p(TGF-p)、成纖維細胞生長因子(FGF)、神經(jīng)生長因子(NGF)、生長激素釋^:因子(GHRF)、表皮生長因子(EGF)、成纖維細胞生長因子類似因子(FGFHF)、肝細胞生長因子(HGF)和胰島素生長因子(IGF);腫瘤壞死因子-a和卩(TNF-a和卩);侵襲抑制因子-2(IIF-2);骨形態(tài)發(fā)生蛋白1-7(BMP1-7);促生長素抑制素;胸腺素-a-l;y-球蛋白;超氧化物歧化酶(SOD);補體因子;抗血管生成因子;抗原物質(zhì);以及前體藥物。前體藥物是指藥學活性物質(zhì)的前體或衍生物形式,與母體藥物相比,其對腫瘤細胞的細胞毒性更小或沒有細胞毒性,并且其能被酶激活或轉換為活性或更具活性的母體形式。例如,參見Wiknan,"ProdrugsinCancerChemotherapy"BiochemicalSocietyTransactions,14,第375-382頁,615thMeetingBelfast(1986)和Stella等,"Prodrugs:AChemicalApproachtoTargetedDrugDelivery,"DirectedDrugDelivery,Borchardt等,(編輯),第247-267頁,HumanaPress(1985)。前體藥物包括但不限于含磷酸酯的前體藥物、含硫代磷酸酯的前體藥物、含^<酸酯的前體藥物、含肽的前體藥物、D-氨基酸修飾的前體藥物、糖基化前體藥物、含b-內(nèi)酰胺的前體藥物、含任選取代的苯氧基乙酰胺的前體藥物或含任選取代的苯乙酰胺的前體藥物、5-氟胞嘧啶和其它能夠轉換為更有效的細胞毒游離藥物的5-氟尿普前體藥物??裳苌鸀楸疚膽玫那绑w藥物形式的細胞毒藥物的示例包括但不限于上面描述的那些化學治療劑。臨床方面在一些實施方案中,本發(fā)明的方法和組合物尤其對乳腺癌、皮膚癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宮癌、子宮頸癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多發(fā)性骨髓瘤和黑素瘤有用。在一些實施方案中,癌癥是管腺癌、小葉腺癌或轉移性腺癌。藥物組合物本發(fā)明也提供了包含一種或多種本文描述的LIV-1調(diào)節(jié)劑和可藥用載體的藥物組合物。在一些實施方案中,將藥物組合物制備為可注射的液體溶液或懸浮液;也可以制備適合于在注射之前溶解或懸浮于液體載體中的固體形式。脂質(zhì)體也包括在可藥用栽體的定義之內(nèi)。藥物組合物中也可存在藥學可接受的鹽,例如無機酸鹽,諸如鹽酸鹽、氫溴酸鹽、磷酸鹽、硫酸鹽等;以及有機酸的鹽,諸如乙酸鹽、丙酸鹽、丙二酸鹽、苯曱酸鹽等。對藥學可接受賦形劑的完全的討論可在Remington:TheScienceandPracticeofPharmacy(1995)AlfonsoGennaro,Lippincott,Williams和Wilkins中得到。檢測LIV-1的方法
技術領域
:本發(fā)明也提供了檢測LIV-1的方法。在一些實施方案中,LIV-1存在于患者或患者樣本中。在一些實施方案中,方法包括將包含一種或多種LIV-1調(diào)節(jié)劑的組合物施與患者并檢測顯像劑在患者中的定位。在一些實施方案中,患者樣本包含癌細胞。在一些實施方案中,將LIV-1調(diào)節(jié)劑連接至顯像劑或進行可檢測地標記。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是綴合至顯像劑的LIV-1抗體,并將其施與患者以檢測一種或多種腫瘤或確定患者對LIV-1治療的敏感性。經(jīng)標記的抗體結合至細胞上高密度的受體并且因此聚集在腫瘤細胞上。應用標準成像技術可以檢測腫瘤的位置。本發(fā)明也提供了成像/檢測表達或過量表達LIV-1的細胞或腫瘤的方法,包括將包含LIV-1調(diào)節(jié)劑的組合物與樣本接觸,并檢測樣本中LIV-I調(diào)節(jié)劑的存在。在一些實施方案中,樣本是患者樣本。在一些實施方案中,患者樣本包含癌細胞。在一些實施方案中,將LIV-1調(diào)節(jié)劑連接至顯像劑或進行可檢測地標記。本發(fā)明也提供了定量化患者、細胞或樣本中存在的LIV-1量的方法。該方法包括將一種或多種抗體、探針、或小分子施與患者或樣本,并檢測樣本中存在的LIV-1量。在一些實施方案中,將抗體、探針、或小分子連接至顯像劑或進行可檢測地標記。此類信息表明,例如,腫瘤是否與LIV-1相關以及因此是否需要應用或避免特定治療。在一些實施方案中,應用本領域公知的標準技術,獲得被認為包含腫瘤細胞的樣本并與經(jīng)標記的抗體、探針、寡核苷酸和小分子接觸。在移除任何未結合的經(jīng)標記的抗體、探針、寡核苷酸和小分子后,確定結合至細胞的經(jīng)標記的抗體、肽、寡核苷酸或模擬物的量、或確定因為未結合而被移除的抗體、肽、寡核苷酸或模擬物的量。該信息直接涉及LIV-1的存在量。成像可以應用本領域技術人員公知的方法完成。成卩象例如可以通過放射性閃爍顯^象、核磁共振成像(MRI)或計算機斷層掃描(CT掃描)等完成。最常用的用于顯像劑的放射性標記包括放射性碘和銦。通過CT掃描成像可以利用重金屬諸如鐵螯合物。MRI掃描可以利用釓或錳的螯合物。此夕卜,正電子放射層掃描術(PET)可能應用氧、氮、鐵、碳或鎵的正電子發(fā)射器。成像也可以應用鋅敏感染料以監(jiān)測體內(nèi)Liv-l活性來完成。此類方法是本領域技術人員已知的。A.Takeda等,CancerResearch61,5065-5069,,2001年7月1日;和C.Frederickson,SciSTKE.2003年5月13日;2003(182)討論了此類方法的實例,其每一個均在此全文引入作為參考。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑是LIV-1抗體。在一些實施方案中,將調(diào)節(jié)劑連接至顯像劑或進行可檢測地標記。在一些實施方案中,顯像劑是"F、43K、S2Fe、57Co、67Cu、67Ga、77Br、87MSr、86Y、90Y、99MTc、mIn、氣氣mCs、129Cs、131l、叼、、、203pb或206說。檢測的方法是本領域普通技術人員公知的。例如,檢測多核苷酸的方法包括但不限于PCR、RNA印跡法、DNA印跡法、RNA保護和DNA雜交(包括原位雜交)。檢測多肽的方法包括但不限于蛋白質(zhì)印跡、ELISA、酶活性測試法、狹線印跡法、肽質(zhì)量指紋法、電泳、免疫化學和免疫組織化學。檢測方法的其它示例包括但不限于放射免疫測試法(RIA)、化學發(fā)光免疫測試法、熒光免疫測試法、時間分辨熒光免疫測試法(TR-FIA)、雙色熒光顯微鏡法、或免疫色譜法(ICA),全部都是本領域技術人員公知的。在一些本發(fā)明優(yōu)選的實施方案中,應用PCR方法檢測多核苷酸的表達以及應用ELISA^支術檢測多肽產(chǎn)物。將細胞毒劑或診斷劑遞送至細胞的方法
技術領域
:本發(fā)明也提供了將細胞毒劑或診斷劑遞送至一個或多個表達LIV-1的細胞中的方法。在一些實施方案中,方法包括將綴合至細胞毒劑或診斷劑的本發(fā)明的LIV-1調(diào)節(jié)劑與細胞接觸。確定癌癥患者預后的方法本發(fā)明也提供了確定患有LIV-1相關癌癥的患者預后的方法。該方法包括確定患者樣本中LIV-1-S對LIV-1的比值。盡管不希望被理論所束繂,發(fā)明人已發(fā)現(xiàn)相對于LIV-1的更高水平的LIV-1-S與侵襲性更小的癌癥和/或更容易治療的癌癥相關。因此,在一些實施方案中,相對于LIV-1的高水平LIV-1-S是具有延長生存和/或用本發(fā)明的LIV-1調(diào)節(jié)劑和/或常規(guī)癌癥藥物成功治療的良好預后的患者的指標。在一些實施方案中,良好的預后通過至少2:1、至少3:1、至少4:1或至少5:1的LIV-1-8:LIV-1比值來指示。在一些實施方案中,通過測量mRNA或蛋白水平確定LIV-l-S:LIV-1的比值。在一些實施方案中,確定患有LIV-1相關癌癥患者的預后的方法包括檢測患者樣本中結合至細胞質(zhì)膜的LIV-1。在一些實施方案中,在患者樣本中結合至細胞質(zhì)膜的LIV-1的檢出不是延長生存和/用本發(fā)明的LIV-1調(diào)節(jié)劑和/或常規(guī)癌癥藥物成功治療的良好預后的指標。在一些實施方案中,LIV-1由具有SEQIDNO:l序列的核酸編碼。在一些實施方案中,LIV-1具有SEQIDNO:2的序列。在一些實施方案中,LIV-1-3具有SEQIDNO:365的序列。確定對LIV-1治療敏感性的方法
技術領域
:本發(fā)明也提供了確定患者對LIV-1治療敏感性的方法。該方法包括檢測患者或患者樣本中LIV-1差異表達證據(jù)的存在或不存在。在患者或樣本中LIV-1差異表達證據(jù)的存在是對LIV-1治療敏感的患者的指標。在一些實施方案中,在患者或患者樣本中LIV-1差異表達證據(jù)的不存在表明患者不是LIV-1治療的候選者。在一些實施方案中,治療方法包括首先鑒定對LIV-1治療敏感的患者,包括給有需要的患者施與包含連接至顯影劑的LIV-1調(diào)節(jié)劑的組合物,并檢測患者中基因或基因產(chǎn)物證據(jù)的存在或不存在。在一些實施方案中,治療方法還包括如果患者是LIV-1治療的候選者則施與一種或多種LIV-1調(diào)節(jié)劑給患者,以及如果患者不是LIV-1治療的候選者則用常規(guī)癌癥療法治療患者。在一些治療方法中,當患者被確認為患有癌癥或對癌癥易感,則給患者單獨施與或與其它抗癌藥物聯(lián)合施與一種或多種LIV-1調(diào)節(jié)劑。評估癌癥i^艮的方法
技術領域
:本發(fā)明還提供了在患者中評估癌癥進展的方法,包括將第一時間點的生物樣本中LIV-1表達產(chǎn)物的水平與第二時間點的相同表達產(chǎn)物水平相比較。第二時間點相對于第一時間點的表達產(chǎn)物水平的改變是癌癥進展的指標。篩選方法
技術領域
:本發(fā)明也提供了篩選抗癌劑的方法。該方法包括將表達LIV-1的細胞與候選化合物接觸,并確定LIV-1相關生物活性是否受到調(diào)節(jié)。在一些實施方案中,癌細胞生長、整聯(lián)蛋白介導的活性、腫瘤形成、癌細胞增殖、癌細胞轉移、細胞遷移、血管生成、LIV-1信號傳導、LIV-l介導的細胞-細胞粘附、LIV-l介導的細胞-細胞膜相互作用、LIV-l介導的細胞-細胞外基質(zhì)相互作用、LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)降解以及LIV-l表達中一種或多種的抑制是抗癌劑的指標。本發(fā)明還提供了鑒定癌抑制劑的方法。該方法包括將表達LIV-1的細胞與候選化合物和LIV-1配體接觸,并確定LIV-1相關生物活性是否受到調(diào)節(jié)。在一些實施方案中,癌細胞生長、整聯(lián)蛋白介導的活性、腫瘤形成、癌細胞增殖、癌細胞轉移、細胞遷移、血管生成、LIV-1信號傳導、LIV-1介導的細胞-細胞粘附、LIV-l介導的細胞-細胞膜相互作用、LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)相互作用、LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)降解以及LIV-1表達中一種或多種的抑制是癌抑制劑的指標。在一些實施方案中,施與患者的LIV-1調(diào)節(jié)劑的量對增加癌細胞凋亡有效。在一些實施方案中,本發(fā)明提供了篩選抗癌劑、尤其是抗轉移癌藥劑的方法,例如通過針對調(diào)節(jié)下游標志物的活性或水平的能力篩選假定的調(diào)節(jié)劑。在一些實施方案中,將降低細胞周期蛋白Dl水平、減少MT1-MMP水平或減少細胞質(zhì)鋅水平的候選試劑確定為抗癌劑。純化LIV-1的方法在一些實施方案中,本發(fā)明提供了從包含LIV-1的樣本中純化LIV-1蛋白的方法。該方法包括提供包含結合至固體支持物上的本發(fā)明LIV-1抗體的親和基質(zhì),將樣本與親和基質(zhì)接觸以形成親和基質(zhì)-LIV-l蛋白復合體,從樣本的剩余物中分離親和基質(zhì)-LIV-l蛋白復合體,并從親和基質(zhì)上釋放LIV-1蛋白。試劑盒在一些實施方案中,本發(fā)明提供了用于成像和/或檢測與LIV-1過量表達相關的基因或基因產(chǎn)物的試劑盒。本發(fā)明的試劑盒包含可檢測的抗體、小分子、寡核苷酸、誘何、模擬物或探針以及完成本發(fā)明方法的說明書。任選地,試劑盒也可以含有以下的一個或多個以下組分對照(陽性和/或陰性)、對照的容器、陽性和/或陰性結果代表實例的照片或描繪。本文描述的每一個專利、專利申請、登錄號和出版物均在此全文引入作為參考。除了本文描述之外的本發(fā)明的各種修改鑒于前面的描述對于本領域技術人員是顯而易見的。意圖使此類修改也落入附錄實施方案的范圍內(nèi)。本發(fā)明將在以下實施例中進一步說明,所述實施例的目的是舉例說明而不是試圖限制本發(fā)明的范圍。實施例實施例1:免疫沉淀法制備含有50mMTris-HClpH7.5、150mMNaCl、l%TritonX-100和每10ml總體積1個蛋白酶抑制劑片劑(RocheDiagnosticCorp.,Indianapolis,IN)的免疫沉淀(IP)緩沖液。合并用IP緩沖液以l:100稀釋的才幾構內(nèi)部(in-house)產(chǎn)生的抗LIV-1兔多克隆抗體(Ab),并添加至有螺旋蓋的管中的細胞裂解產(chǎn)物中,允許其在搖動平臺上在4°C混合1-2小時。為進行免疫沉淀,將40jil抗兔IgG綴合珠或120jil鏈親和素珠添加至每一管并繼續(xù)在搖動平臺上在4。C孵育過夜。隨后,將管以7000xg在4。C離心2分鐘,并移除上清液。用冷的洗滌緩沖液洗滌珠子沉淀4次,然后往每一管加入30fil含有還原劑的2XSDSTris/甘氨酸樣本緩沖液。然后將樣本緩沖液中的珠子在95°C煮兩次,每次5分鐘,以從珠子中釋放免疫沉淀物。然后將煮過的珠子溶液在室溫下以14,000xg離心5分鐘,將上清液移出并轉移至新管中。立即通過在SDS-PAGE凝膠上電泳分析免疫沉淀物或將其儲存在-20。C。應用標準方法進行蛋白質(zhì)印跡分析。將經(jīng)電泳的免疫沉淀物從聚丙烯酰胺凝膠中轉移至膜上,并然后于室溫在溫和搖動中應用第二LIV-1抗體(l:IOOO)探測膜1小時。用含有0.05%吐溫20的PBS(PBST)洗滌數(shù)次后,加入綴合至辣根過氧物酶(HRP)的合適的物種特異性二抗,并于室溫在搖動平臺上孵育30分鐘。數(shù)次洗滌后,然后用ECL檢測系統(tǒng)(AmershamBiosciencesUK)顯現(xiàn)膜上的反應條帶。實施例2:FACS分析將非透化的細胞用于分析。制備含有(冷)PBS、1。/。牛血清白蛋白(BSA)、2。/。胎牛血清(FBS)和0.1。/。疊氮化鈉的FACS緩沖液。通過用離解緩沖液(InvitrogenCorp.,Carlsbad,CA)使貼壁細胞不貼壁而收集細胞。為中和離解緩沖液,加入等體積的生長培養(yǎng)基。然后將細胞分裝至5ml聚苯乙烯圓底管中。對每一個染色,將一百萬個細胞在4。C以1000轉/分鐘離心5分鐘,并然后往細胞沉淀中加入第一抗體(100jiLFACS緩沖液中達6jig),通過渦旋混合并在水上孵育30分鐘至1小時。然后通過在4。C以1000轉/分鐘離心5分鐘沉淀后,用3mlFACS緩沖液洗滌細胞兩次。在笫二次洗滌和離心后,往細胞沉淀中加入第二抗體(50jiLFACS緩沖液中l(wèi)jig),通過渦旋混合并在水上在黑暗中孵育30分鐘。通過在4。C以1000轉/分鐘離心5分鐘沉淀細胞后,用3mlFACS緩沖液洗滌細胞兩次。在第二次洗滌和離心后,將細胞以500ng懸浮于50jiL含有碘化丙錠(PI)的FACS緩沖液中。(將PI制備為1jig/nL的儲存液并以1:100使用)。在一小時內(nèi)實施FACS/流式細胞術分析。實施例3:LIV-1寡核苷酸抑制軟瓊脂生長用對LIV-1的寡核苷酸(SEQIDNO:369和370)處理MDA231、MCF-7、ZR75-1和T47D1細胞。將細胞平板接種于0.35%軟瓊脂中并在培養(yǎng)7天后用AlamarBlue定量生長。通過在軟瓊脂中的集落形成測量LIV-1基因表達對T47D1細胞的貼壁不依賴性細胞生長的影響。通過首先用聚HEMA包被非組織培養(yǎng)處理的平板以阻止細胞貼附至平板來進行軟瓊脂分析。用胰蛋白酶收集非轉染的細胞并用培養(yǎng)基洗滌兩次。用血細胞計數(shù)器計數(shù)細胞并在培養(yǎng)基中重懸細胞至每ml1(^個細胞。將50jil等分試樣置于聚HEMA包被的96孔板中,并轉染。對于每一個轉染混合物,將載體分子(優(yōu)選脂-擬肽綴合物(lipitoid)或擬膽固醇(cholesteroid))制備為在水中的0.5nM工作濃度,超聲處理以產(chǎn)生均勻的溶液并通過0.45nmPVDF膜過濾。然后將反義或對照寡核苷酸在無菌Millipore水中制備成100jiM的工作濃度。將寡核苷酸在微離心管中的OptiMEMTM(Gibco/BRL)中進一步稀釋至2jiM,或每mlOptiMEMTM約20ng寡核苷酸。在另一個樣t離心管中,將脂-擬肽綴合物或擬膽固醇稀釋至與稀釋寡核苷酸所用的相同體積的OptiMEMTM中,一般地以每照反義寡核苷酸約1.5-2nmol月旨-擬肽綴合物的量進行。將經(jīng)稀釋的反義寡核苷酸立即添加至經(jīng)稀釋的脂-擬肽綴合物,并通過上下移液混合。將寡核苷酸添加至細胞至約300nM的終濃度。在37。C轉染約30分鐘后,通過上下移液將3。/。GTG瓊脂糖加至細胞中,達到0.35%瓊脂糖的終濃度。在細胞層瓊脂凝固后,將100jil培養(yǎng)基滴在每一個孔的上面。在約7天中形成集落。為了讀出生長,往每一孔中加入20ftlAlamarBlue并將平板振動約15分鐘。在孵育6-24小時后,進行熒光讀數(shù)(S30nm激發(fā)/590nm發(fā)射)。應用LIV-1調(diào)節(jié)劑對癌細胞系集落形成的抑制表明LIV-1在轉移表型的產(chǎn)生和/或維持中是重要的。實施例4:基因表達的調(diào)節(jié)應用寡核苷酸分析了由癌性細胞中多核苷酸所示的差異表達基因的表達,以確定LIV-1在腫瘤發(fā)生,例如在促進轉移表型中的作用和功能。產(chǎn)生LIV-1寡核苷酸并測試它們抑制LIV-1表達的能力。一旦合成并定量后,則在一組細胞系中針對轉錄敲低的效率篩選寡核苷酸。通過應用GeneAmp定量分析mRNA水平來確定敲除效率。通過轉染至T47D1、T47D-T1、MCF7、ZR-75-l、MDA231、184B5或HMEC細胞中測試每一個寡核苷酸抑制基因表達的能力。對于每一個轉染混合物,將載體分子(諸如脂類,脂類衍生物、脂類樣分子、膽固醇、膽固醇衍生物或膽固醇樣分子)在水中制備為0.5mM的工作濃度,超聲處理以產(chǎn)生均勻溶液并通過0.45nmPVDF膜過濾。然后將反義和siRNA寡核苷酸在無菌Millipore水中制備成約100fiM的工作濃度。將寡核苷酸在微離心管中在OptiMEMTM(Gibco/BRL)中進一步稀釋至2jiM,或每mlOptiMEMTM約20jig寡核普酸。在另一個微離心管中,將栽體分子稀釋至與稀釋寡核苷酸所用的相同體積的OptiMEMTM中,一般以每jig反義寡核苷酸約1.5-2nmol載體進行。將經(jīng)稀釋的反義寡核苷酸立即添加至經(jīng)稀釋的載體中,并通過上下移液混合。將siRNAs添加至細胞至約67nM的終濃度。應用ABIGeneAmp7000TM實時PCR儀在細胞系中定量經(jīng)轉染細胞中與感興趣的靶標基因相對應的靶標mRNA的水平。將靶標mRNA值對內(nèi)對照進行標準化。對于每一20nl反應,將提取的RNA(通??偣?.2-1jig)置于滅菌的0.5或1.5ml微離心管中,添加水達到12.5jil的總體積。往每一管添加7.5jil緩沖液/酶混合物,所述緩沖液/酶混合物通過(以所列順序)混合2.5plH20、2.0fill0x反應緩沖液、10nl寡聚dT(20pmo1)、1.0jildNTP混合物(每一種10mM)、0.5filRNAsin(20u)(Ambion,Inc.,Hialeah,F(xiàn)L)和0.5filMMLV逆轉錄酶(50u)(Ambion,Inc.)而制備。通過上下移液混合內(nèi)容物,將反應混合物在42。C孵育1小時。在擴增之前離心每一管的內(nèi)容物。應用ABIsybrmastermix加上0.175pmol每一種寡核苷酸制備擴增混合物。SYBRGreen(MolecularProbes,Eugene,OR)是當其結合至雙鏈DNA時發(fā)熒光的染料。由于在擴增過程中會產(chǎn)生雙鏈PCR產(chǎn)物,來自SYBRGreen的熒光增加。往每20fil擴增混合物的等分試樣中加入2jil模板RT,并按照標準方案進行擴增。以相應基因的表達相對于沒有轉染的細胞、只轉染了載體的細胞(假轉染)或用反向對照寡核苷酸轉染的細胞降低的百分比來表達結果。盡管LIV-1寡核苷酸在所有測試細胞系中均抑制Liv-l表達,LIV-1寡核苷酸只在致瘤系中具有功能后果。在非致癌系中沒有觀察到LIV-1寡核苷酸的功能后果,表明癌細胞和"正常,,細胞對Livl活性具有不同的依賴性。實施例5:表達對增殖的影響在數(shù)個細胞系中應用siRNA方法評估了基因表達對細胞增殖抑制的影響,所述細胞系包括T47D1、T47D-T1、MCF7、ZR-75-l、184B5、MDA231和HMEC細月包。將細胞以數(shù)天后會達到約80-95%融合的密度接種在96-孔皿上。將寡核苷酸(反義或siRNA)在OptiMEMTM中稀釋至2pM。然后將寡核苦酸-OptiMElVFM加入到遞送載體,對所述載體進行選擇使得對于在測試中待使用的特定細胞類型是最優(yōu)化的。然后將寡核苷^/遞送載體混合物進一步稀釋至在細胞上的有血清的培養(yǎng)液中。反義寡核苷酸的終濃度是約300nM以及siRNA寡核苷酸的終濃度是67-100nM。如上面描述的那樣制備寡核苷酸。將細胞在37°C轉染約4小時至過夜,然后用新鮮培養(yǎng)基更換轉染混合物。如上面描述的那樣進行轉染。LIV-1寡核苷酸抑制癌細胞增殖但不抑制HMEC(原代乳腺上皮細胞)或184B5(非致瘤性乳腺上皮細胞系)細胞的增殖,表明LIV-1在癌細胞癌性表型的產(chǎn)生和/或維持中起著重要作用。實施例6:生存測試為評估革巴信息的缺失對細胞死亡的影響,轉染T47D-T1、MCF7、Zr-75-l和MDA-MB231細胞用于細胞毒性測試。通過測量由于膜損傷釋放至培養(yǎng)基中的LDH酶量來監(jiān)測細胞毒性。應用來自RocheMolecularBiochemicals的細胞毒性檢測試劑盒來檢測LDH活性。數(shù)據(jù)以釋放至培養(yǎng)基中的LDH對在相同時間點和處理中在孔中存在的總LDH的比值(rLDH/tLDH)提供。測試包括了應用針對BCL2(已知的抗凋亡基因)的反義和反向對照寡核苦酸的陽性對照;與用對照寡核苷酸的處理相比(由于轉染的背景細胞毒性),BCL2信號的喪失導致了細胞死亡的增加。實施例7:胱天蛋白酶/M30方法對來自用siRNA處理的細胞的裂解產(chǎn)物應用蛋白質(zhì)印跡分析評估胱天蛋白酶原(procaspase)和M30。在處理后的不同時間點,裂解細胞(貼壁或分離的細胞,將后者離心下來)并應用針對胱天蛋白酶原和M30的抗體進行蛋白質(zhì)印跡分析。胱天蛋白酶原的消失與胱天蛋白酶活化相對應。M30表位的出現(xiàn)是細胞角蛋白18的胱天蛋白酶切割的反映。所使用的抗體是Axxora/AlexisM30(CytoDeath:CAT#ALX-804-5卯)和胱天蛋白酶原Ab(R&DSystems,貨號MAB707)。實施例8:細胞周期蛋白Dl方法用siRNA轉染細胞以敲低Livl或用Uv-l特異的抗體處理細胞。對于轉染的細胞,在轉染48小時后收集細胞裂解產(chǎn)物。對于Ab處理,在處理6小時后收集細胞裂解產(chǎn)物。應用抗細胞周期蛋白DlAb:周期蛋白DlAbeamCat#-ab24249對裂解產(chǎn)物進行蛋白質(zhì)印跡分析。所使用的siRNAs是SEQIDNO:369和370。測試的LIV-1抗體是針對N端和TM2-3ECD的機構內(nèi)部產(chǎn)生的抗體。針對TM2-3ECD的抗體似乎顯示出最大的效力。實施例9:鋅水平在實施例G之前24、48或72小時用siRNA處理細胞或在實施例10之前30分鐘用抗體處理細胞。所使用的siRNAs是SEQIDNO:369和370。測試的LIV-1抗體是針對N端和TM2-3ECD的機構內(nèi)部產(chǎn)生的抗體。針對TM2-3ECD的抗體似乎顯示出最大的效力。實施例10:鋅轉運測試法應用通透細胞的鋅選擇性熒光指示劑NewportGreen測試鋅轉運。在通過細胞內(nèi)酯酶切割后,NewportGreen結合至游離的鋅離子并作為細胞內(nèi)游離鋅含量的熒光指示劑。如下制備在Krebs畫Ringer-HEPESBuffer(KRH)緩沖液(120mMNaCl、25mMHEPES、pH7.5、4.8mMKC1、1.2mMKH2P04、1.2mMMgS04、1.3mMCaCh)中的10jiMNewportGreenPDX染料(滲透酯形式,Cat#N24191,Invitrogen-MolecularProbesTM)和0.02%PluronicF-127(在DMSO中20%PluronicF-127;Cat#P3000,Invitrogen-MolecularProbesTM)的工作溶液。將NewportGreen以50fig等分試樣于干燥下儲存于-20。C、避光并在使用之前融化。通過將50ngNewportGreen在16.8jil無水二甲亞砜(DMSO)(Cat#276855-100mL,Sigma-Aldrich)中重構制得NewportGreen染料的2.5mM儲存溶液。通過將等體積(16.8^L)的分散劑PluronicF-127添加至2.5mM儲存溶液并然后將全部體積的染料稀釋至8.366mLKRH緩沖液中制備NewportGreen染料的10工作溶液。將貼壁細胞用沒有Ca"和Mg"的磷酸鹽緩沖鹽水(PBS)洗滌一次,并用沒有酶的、基于Hanks的離解緩沖液(Invitrogen,Cat#13150-016)收集。將PBS和解離緩沖液在使用前平衡至37。C。然后通過添加等體積的生長培養(yǎng)基中和細胞懸浮液的pH。通過在1000轉/分鐘離心5分鐘收集細胞,將得到的細胞沉淀以1xi(^個細胞/mL的濃度重懸于PBS。為了進行分析,將1.5x106個細胞分裝至5ml聚苯乙烯圓底FACS管(BectonDickinson,Cat#352054)中。通過離心再次沉淀細胞并移除PBS。將細胞通過渦旋重懸浮于0.5mL10jiMNewportGreen染料溶液中;蓋上FACS管并在30°C水浴中孵育45分鐘。將lmL沒有染料的KRH緩沖液加入到細胞懸浮液中,并通過在1000轉/分鐘離心5分鐘沉淀細胞。吸出上清液,在lmL沒有染料的KRH緩沖液中再次洗滌細胞,將細胞沉淀重懸浮于0.5mL沒有染料的KRH緩沖液中并在30。C水浴中孵育30分鐘。將lmL沒有染料的KRH緩沖液加入到細胞懸浮液中,并通過在1000轉/分鐘離心5分鐘沉淀細胞。吸出上清液,在lmL沒有染料的KRH緩沖液中再次洗滌細胞,將細胞沉淀通過渦旋重懸浮于2.0mL沒有染料的KRH緩沖液中。通過FACS(FACSCalibur)(BDBiosciences)監(jiān)測細胞內(nèi)熒光。實時收集細胞,并根據(jù)時間繪制NewportGreen染料焚光(FITC設置)圖(收集設置在10分鐘收集200萬個細胞)。在建立了1.5至2分鐘收集范圍內(nèi)的熒光基線后,將100mM氯化鋅(Cat#Z0152-100G,Sigma-Aldrich,溶解于29mMHC1)添加至細胞達到1-100fiM的終濃度。立即將細胞管送回FACS機器,通過熒光的瞬時增加顯示鋅攝入。將FACS數(shù)據(jù)輸出至Flowjo軟件(TreeStarInc,Ashland,Oregon)并應用動力學平臺(KineticsPlatform)分析。用移動平均平滑選擇來展示數(shù)據(jù)的中位數(shù),以及在布圖編輯器(LayoutEditor)中產(chǎn)生圖示覆蓋圖。實施例11:LIV-l表位可以通過本領域已知的多種方法中的任何一種鑒定用于抗體識別和制備的LIV-l線性表位。一些示例方法包括探測衍生自抗原氨基酸序列的肽的抗體結合能力。可以通過應用BIACORE或ELISA方法評估結合。其它技術包括將在平面固體支持物("芯片,,)上的肽文庫暴露給抗體,并通過在固相篩選中所應用的多種方法中的任何一種檢測結合。此外,可以應用噬菌體展示來篩選肽文庫,經(jīng)過數(shù)輪生物篩選后選擇表位。以下表1提供了已鑒定為適合于被抗LIV1抗體識別的線性表位的LIV畫l(SEQIDNO:2)區(qū)域。<table>tableseeoriginaldocumentpage79</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage80</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage81</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage82</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage83</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage84</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage85</column></row><table>IgG取血前對照(Chiron,Emeryville,CA)。將Ventana普遍第二試劑(VentanaMedicalSystems,Inc.,Tucson,Az)和隨后的VentanaDABMap試劑盒(VentanaMedicalSystemsInc.)用于檢測。使用Ventana蘇木精和上藍試劑(VentanaMedicalSystems,Inc)用于復染,并在分級醇中使切片脫水,在二曱苯中清潔并應用合成的固封介質(zhì)蓋上蓋玻片。實施例13:癌對正常組織;Spotfire分析也將微陣列數(shù)據(jù)用于確定多種癌性腫瘤類型和多種來自正常樣本的組織中LIV畫1、SLC39A10、SLC39A11和SLC39A13的表達。應用DecisionSite軟件(Spotfire,Somerville,MA)和才/L構內(nèi)部開發(fā)的PipelinePilot(SciTegic,SanDiego,CA,機構內(nèi)部的開發(fā)人JosefRinggenberg)方案產(chǎn)生顯示于圖12-15的圖解描述。結果顯示每一種目的腫瘤細胞抗原在許多癌類型中表達升高,而在很多正常組織類型中有較低水平的表達。實施例14:序列LIV-1核苦齡列;SEQIDNO:1:OGAACCAAACCTGCGCGCGTGGCCGGGCCGTGGGACAACGAGGCCGCG(3AGAC(3AAGGCGCAATGGCGAGGAAGTCCCAGACCACTGAGAAAATTAGTCCGAATTGGGAATCTOGCATTAATGTTGACTTGGCAATTTCCACACGGCAATCTCACCATAATCATGCTGCTTCTOGTAAAAATAAGCGAAAAGCTCTTTGCCCAGACCATGACTCAGATAGTTCAGTAGAGACTCCAAGACCTGGAAAACTCTTCCCCAAAGATGTAAGCAGCTCCACTCCACCCAGTGTCACATCAAAGAGCCGGGTGAGCCGGCTGGCTGGTAGGAAAACAAATGAiiTCTGTGAC3TGAGCCCCGAAAAGGCTTTATGTATTCCAGAAACACAAATGAAAATCCTCAGGAGTGTTTCAATGCATCAAAGCTACTOACATCTCATGGCATGGGCATCCAGGTAGCGATTTCCATCATCAGTTTCCTGTCTCTGCTGGGGGTTATCTTAGTGCCTCTCATGAATCGGGTGTTTTTCAAATTTCTCCTGAGTTTCCTTGTGGCACTGGCCGTTGGGACTTTGAGTGGTGATGCTTTTTTACACCTTCTTCCACATTCTCATGCAAGTCACCACCATAGTCATAGCCATGAAGAACCAC3CAATGGAAATC3AAAAGAGGACCACTTTTCAGCCTGTATTTCATGiTTCTTGTTGAACATOTCCTCACATTGATCAAACAATTTAAAGATAAGiV^GAAAAAGAATCAGAAGAAACCTGAAAMGATGATGATGTOGAGATTAAGAAGCACTTGTCCAAGTATGAATCTCAACTTTCAACAAATGAGGAGAAAC3TAC3ATACAC3AT(3ATCGAACTGAA(3GCTATTTAC:GAGCAGACTCACAAGAGCCCTCCCACTTTG'cTcTcccGc工加加cA一cG一Ml86attatgctoaaaatgtttctatgtggatatttgcacttactgctggcttattcatcstatgttgctct'ggttgatatggtacctgaaa士gctgcac^atgatgctagtgaccatggatgtagccgct6ggggtatttctttttacAgAatgCTGGGAT(3CTTTTGGGTTTTdGAATTATGTTACTTATTTCCATATTTGAACATAAAATCGi(3TTTCGTATAAATTTCTAGTTAAGGTTTJ^AATGCTAGAGTAGCTTAAAAAOTTOTCATAOTTTCAGTAC3GT'CATivGGGAGATGAGTTi:GTCAGTTAAAGGTACGTTTTAATATTTAAGTTATTCTATCTTGGAGATAAAATCTC3TATOTGCAATTCACCGGTATttttcaagaactaacacagttattcctatactggattttaggtctctgaagaactgctggtoLIV-1氨基,列;SEQIDNO:2:rkliiqnig工e)kikr工h:iiffldhd朋sdhehhsdherhsdhehhsdhehhsdhd朋shhnhaasgiknkrkmjcpdhdsdssgkdprnsqgkgahrpehasgrrnvkdsvsasevtstvyntvsegthfijetietprpgkxifpkdvssstppsvtsksrvsriiagrktnesvseprkgfmysrntnenpqecfnaskliitshgmg;iovpiinat邁.pnyiicpal工nqldahliliphshashhhshsheepa^iemkrgpiifshlssqnieesayfbstwkgltalgglyfmflvehvltiiikqfkdkkkknqkkpendddveikkqi^kyesqlstnee^vdtddrtegylradsqepshfdsqqpavleeeeVmiahahpqBVYNEyVPRGCKNKCHSHFHDTIjC3QSDr)Ij工HHliHDYHH工IiHHHHHQNHHraSHSORYS肪EIiKDAGVATIiAWMV;i:FR工OT在本發(fā)明的一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑包含或涉及LIV-1多肽的抗原性區(qū)域。LIV-1的抗原性區(qū)域包括"f旦不限于以下的SEQIDNO:3、SEQIDNO:4和SEQIDNO:5:hhdhd朋sd耶HHSDHERHSDHEHHSDHEHHSDHNHAASC3KNKRKAIiCPDHDSDS(SEQIDNO:3)kgah^pehasgrrnvkdsvsase(SEQIDNO:4)HliLPH^HASHHHSHSHEEPA(SEQli)NO:5)在本發(fā)明的一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑包含和/或特異性地結合至SEQIDNO:2的一個或多個序列。在一些實施方案中,LIV-1調(diào)節(jié)劑特異性地結合至一個或多個具有選自以下SEQIDNO:361-SEQIDNOJ64或SEQIDNO:387畫SEQIDNO:391序列的LIV-1表位hshsheepamemkrgplfsh;SEQIDNO:361cfnaskllshgm;SEQ|IDNO:362gmgiqvplnatefnyl;SEQIDNO:363svsasevtstvyntvsegt;SEQIDNO:364LHEIjKAAAFPQTTEJEaSPNWESGINVDLAISTRQYHIjQQLFYRYGENNSIiSVBGFRKIiLQKriGIDKIKRIHIHHDiDDHHSDHEHHSDHBRHSDHEHHSDHBHHSDHNHAASGKNKRKAIiCPDHDSDSSGKDPRNSQGKGAHRPEHASGRR'NVKDSVSASEVTSTVYNTVSEIOTHFIjETIETPRPGKLFPKDViSSSTPPSVTSKSRVSRIiAGRKTNESVSEPRKGFggfi;SEQIDNO:387;N端HLLPHSHASHHHSHSHEEPAMEMKRGPLFSHLS'SQNIEESAYFDST;SEQIDNO:388;TM2/3teglss;SEQEDNO:389;TM4/5hyaewVsm;SEQIDNO:390;TM6/7vfrinf;SEQIDNO:391;C端在一些實施方案中,本發(fā)明的LIV-l調(diào)節(jié)劑具有下面的序列CHIR296-4SI;AAAGGCTGGCMteACCGTTAA(SEQIDNO:367)CHIR296-3SI;gacagtgttagtgctagtgaa(SEQID加:368)CHIR296-2SIctagttaaggtttaaatgcta(SEQEDNO:369)CHIR296-1SI;aaggcttatcaagtggtttaa(SBQIDNQ:370)CHIR296-7RC;gcaaccctgaaactcaccactacga(SEQIDNO:371')'CHIR296-5RC;taccgacccgtagotccaa加cg(SEQIDNO:372)CH1R296-2RC;tgtggtactggtgctggtaotga:gt(SEQIDNO:373)CHIR296醫(yī)9CHIR29.6-8CHIR296-6CHIR296-5CHIR296-4CHIR296;3CHIR296-2CHIR296-1TGGTGAATGAGATCGTCTGACTGGC(SEQIDNO:374)AGGGCTCTTGTGAGTCTGCTCGTAA(SEQIDNO:375)AGCATCACCACTCAAAGTCCCAACG(SEQIDNO:376)GCCAGTGCCACAAGGAAACTCAGG(SEQIDNO':377')G。.GGAACCTGGATGCCCATGCCAT(SEQEDNO:378)ACTGGCATGTTCTGGTCGGTC3AGC(SEQIDNO:379)ATGCTCATGGTCTGAGTGACGCTCA(SEQEDNO:380)TGAGTGATGGTCGTGGTCATG'GTGT(SEQIDNO:381)GAGAGGGCAAAGOTCAGGATCAAGA(SEQIDNO:382).SLC39A10;SEQIDNO.383;NP—065075.1MKVHMHTKFCIjICliljTFiraHCNHCHEEHDHGPEALHRQHRGMTEIjEPSKFSKQAAENEKKyYIEKLFERYGEMGRIiSFFGLEKLLTNLGLGBRKVVEINHEDLGHDHVSHIjDILAVQEGKHFHSHNHQHSHNHLNSENQTVTSVSTKRNHKCDPEKETVEVSVKSDDKHMHDHNHRLRHHHRLHHHLDHNNTHHFHNDSI^PSERGEPSNEPSTETlSrKTQEQSDVKLPKGKRKKKGRKSNENSEVITPGFPPNHDQGEQYEHNRVHKPDRVHN-GHSHVHLPER^GB[DPGRGHQD:LEiPDNEGEL!RHTRKREAPHVKNNAIISIiRKDLNEDDHHHEcijNVTQIjIiKYYGHGANSPISTDIiFTYIiCPALlLYQ'IDSilljCIEHFDKLLVEDINKDKNIiVPEDE^NI(3asawiCGI工SITV工SIiLSLLGVILVPIIN。GCFkFLliTFLVALAVGTMSGDALmLLPHSQGGHD.HSHQHAHGHGHSHGHESNKFLEEYDAVLKGLVALGG'工yllfiiehc工rmfkhykqqrgkqkwf'mkqnteestigrklSdhklnwtpdsdw:lq:lkp.lagtDDSWSEDRLNETgLiTDljEGQQESPPKNYLCIEE'EKIIDHSHSDGIjHTIHEHDLHAAAHNHHGENKTVLRKHNHQWHHjKHSHHSHGPCHSGSDIjKETdlANIAWMVIMGDGIHNFSDGLAIGAAFSAGLiTGGISTSIAVFCHEiLPHElLGDFAVLIjKAGMTVKQAIVYNIjIiSAMMAYIGMLIGTAVGQYANNITLW工FAVTAGMFLYVALVDMLPEMJLHGDGDNEEHGFCF^GQF工LQNLGLIiFGFAIMLVIALYEDKIVFDIQFSLC39A11;SEQIDNO:384;NP—631916MijQGHSSVFQALIjGTFFTWGMtAAGAAIjVFVFSSGQRRIIirJGSIjGFAAGVMIjAASYWSIjLAPAVEMATSSGGTOAFAFFPVAVGFTLGAAFVYLADIiLMPHLGAAJEXJPQTALALiNPGSTIiMKKKSDPEGPALIiFPESEIiSIRIDKSENGEAYQRKKAAATGLPEC3PAVPVPSRGNIAQPGC3SSWRR工AIiL工LAIT3:HNVPEGriAVC3VGFGA工EKTASATFESARNtiA工G工GIQNFPEGLAVSIiP:LRGAG^ST^RAFWYGQIiSGMVEPriAGVFGAFAVVLAEPIIiPYAJAFAAC3AMVYVVMSLC39A13;SEQIDNO:385;NP—689477.2MPGCPCPGCGMAGPRLIjFIiTAIALEIjIjGRAGGSQPALRSRGTATACRIjDNKESESWGALIjSGERLDTWICSIiIjGSLMVGLSGVFPIiLVIPliEMGTMIjRSEAGAWRrjKQIiljSFAIiGGIjIjGNVFIjHLLPEAWAYTCSASPGGEGQSIuQQQQQLGILWVIAGiriTFLAIjEKMFLiPSKEEGTSQAPNKDPTAAAAALNGGHCLAQPA^EPGLdAVVRSIKVSGYLNLLkNTIDNFTHGLAVAASFLVSKKIGLIiTTMAIIiLHEIPHEVGDFAILljRAGFDRWSAAKliQLSTALGGiLIjGAGFAICTQSPKGVEETAAWVLPFTSGGFLYIALVNVLPDIjIjEEEDPWIlSiLQQKLIjIjCAGIVVMVLFSIjFVDSEQIDNO:386GFIA工S工ISFLSIiliGVLVPLMNRVFFKFLLSliVALAVGTIiSGDAFljIjLPHSpASHHHSHSHEPAMEMKRGPIiFSHLSQNIEESAYFDJ^TWKLTALGGljYFMFLVEHI/rijICKQFKDKKKKNQKPENDDDVE工KKQ:LSY'ESQIjSTNEE.KVDT]i)RTEGYIjRADSQEPSHDSQQPAVIjEEEEVMIHAHPQEVYNEYVPRGKNKCHSriFHDTLGQSDIilHHHHDYHHITUHHHHQNHHPHSHSQRYSEEIjKDAGVATIjAWMVMGDGIiHNFSDGLAIGAFTEGLSSGLSTSVAFCIIEIIiPHELiGDFAVIiKAGMTVKQAVliYNALAMLAYLGMATGIF工GYAENVSMW工FALTAGFMYVALVDMVPEMLHDASDHGCSRWGYFFLNAGMLLGFGIMLiL工PLNIKSCSYKFLVKVLIV畫l-S;SEQIDNO:365MGIQVPLNAT^FNYLCPAIINQ工DARSCL工HTSEKKAE工PPKTYSLQ工AWVGGFIAIS11SFLSliLGVILiVPLMNKVFFKFIjIjSFljVALAVGTLiSGDAFLiHLiIjPHSHASHHHSHSHEEPAMEMKRGPIiFSHLSSQNIEESAYFDSTWKGIiTALGGIiYFMFLVEHVLTIjIKQFKDKKKKNQKKPENliDDVEIKKQLSKYESQLSTNEEKVDTDDIlTEGYLiRADSQEPSHFDSQQPAVLEEEEVMIAHAHPQEVYNEYVPRGCKNKCHSHFHDTIiGQSDDLIHHHHPYHHILHHHHHQNHHPHSHSQRYSREELiKDAGVATLAWMVIMGDGLiHNFSDGLAIGAAPTEGLiSSGrjSiSVAVFCHEIjPHEIiGDFAVLrjKAGMTVKQAVLYNALSAMIAYLGIviATGIF工GHYAENVSMWIFALTAGIiFMYVALVDMVSFSEQIDNO:366MARKLSVILIl/TFALSVTNPLHEIiKAAAFPQTTEKISPNWESGINVDLAISTRQYHLQQLFYR;YGENNSLSVEGFRKLLQNIG工DKIKRIHIHHDHDHHSDHEHHS.DHERkSDHEHHSDHEHHSDHDHHSHHNHAASC3KNKRKALCPIHDSDSSGKDPRNSQGKGAHRPEHASGRRNVKDSV—SEVTSTVYNTVSEGTHFliETIETPRPGKLFPKDVSSST^PSVTSKSRVSRLAGRKTNE.SVSEPRKGFMYSRNTNENPQECFNASKLLTSHGMGIQVPiiNATEFNYLC'PAIINQIDARSCIjIHTSEKKAEIP'PKTYSLiQIAWGGFIAISIISFLSliL'GVTIiVPIMNRVFFKFLLSFliVALAVGTLSGDAFIiHLLPHSHASHHHSHSHEEPAMEMKRGPLFSHLS.SQNIEESAYP.DSTWKGLTALGGLYFMFLiVEHV:LTL工KQFKDKKKKNQKKPENDDDVEIkKQ!LSKYESQ趙'STNEEKVi)TDDRTECJ!fLRADSQEPSHFDSQQAV^LEEEEVMi:fiH^HFQ'EVYNEYVPRGCKNKCHSHEHDTLGQSDDIi工HHHHDYHHi:L油HHHQNHHPHSHSQRYSREEliKDAGVATIiAWMVIMGDGIiHN-FSDGLiAIGAAFTEGIjSSGIjSTSVAVFCHELiPHELGDFAVLLKADMTVKQAVLYWAIiSAMLAYLGMATGIFIGHYAENVSMWIFALTAGLPMYVALVDMVPEMLHNDASDHGCSRWGYFFLQNAGMLLGFGIMKLISI'FEHKIVPlil]S^盡管已參照其特定的實施方案對本發(fā)明進行了描述,但本領域技術人員應當理解可以進行各種改變以及可以以等同方式進行替代,而不背離本發(fā)明真實精神和范圍的情況。此外,可以進行許多修改以使特定情況、材料、物質(zhì)組合物、處理、處理步驟適應本發(fā)明的目的、精神和范圍。所有的此類修改都在本發(fā)明的范圍內(nèi)。權利要求1、包含LIV-1調(diào)節(jié)劑和一種或多種可藥用載體的組合物,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑選自分離的雙鏈RNA(dsRNA);包含SEQIDNO1序列的至少10個連續(xù)核苷酸的分離的寡核苷酸;和結合LIV-1結構域中的表位的抗體,所述LIV-1結構域選自LIV-1的N-端細胞外結構域、在跨膜結構域(TM)2和3之間的LIV-1細胞外結構域、在TM4和5之間的LIV-1細胞外結構域、在TM6和7之間的LIV-1細胞外結構域、和LIV-1的C-端細胞外結構域。2、權利要求l的組合物,其中寡核苷酸是dsRNA、siRNA、shRNA或反義寡核苷酸。3、權利要求l的組合物,其具有選自以下的一種或多種活性增加癌細胞凋亡、抑制癌細胞生長、抑制腫瘤形成、抑制癌細胞存活、抑制癌細胞增殖、抑制癌細胞轉移、抑制細胞遷移、抑制血管生成、抑制LIV-1信號傳導、抑制LIV-1介導的細胞-細胞粘附、抑制LIV-1介導的細胞-細胞膜相互作用、抑制LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)相互作用、抑制LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)降解、和抑制LIV-1表達。4、權利要求l的組合物,其中組合物是無菌可注射的。5、權利要求1的組合物,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑抑制癌細胞生長、癌細胞存活、腫瘤形成和癌細胞增殖中的一種或多種。6、權利要求1的組合物,其中所述的LIV-1調(diào)節(jié)劑抑制細胞周期蛋白D1、纖連蛋白、RhoB、MT1畫MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR和EGFR磷酸化中的一種或多種。7、權利要求1的組合物,其中所述的LIV-1調(diào)節(jié)劑調(diào)節(jié)整聯(lián)蛋白介導的活性。8、權利要求1的組合物,其中所述的LIV-1調(diào)節(jié)劑抑制SNAIL途徑中的一個或多個基因。9、權利要求1的組合物,其中所述的LIV-1調(diào)節(jié)劑抑制Snail核定位。10、權利要求1的組合物,其中所述的LIV-1調(diào)節(jié)劑上調(diào)E-鈣粘著蛋白、VE-鈣粘著蛋白、Muc-l中的一種或多種。11、權利要求l的組合物,其中所述的LIV-1調(diào)節(jié)劑上調(diào)水閘蛋白、封閉蛋白、橋粒斑蛋白、胱天蛋白酶、p21、p53、BID(bcl-相互作用死亡激動劑)、DFF40(DNA片段化因子)和細胞角蛋白中的一種或多種。12、權利要求l的組合物,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑抑制鋅轉運。13、權利要求1的組合物,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑降低細胞質(zhì)鋅水平。14、權利要求1的組合物,其中UV-1調(diào)節(jié)劑是以至少1x108Ka的親和力結合至LIV-1多肽的單克隆抗體。15、權利要求14的組合物,其中LIV-1多肽具有SEQIDNO:2的序列。16、權利要求14的組合物,其中單克隆抗體調(diào)節(jié)一種或多種LIV-1相關生物學活性。17、權利要求14的組合物,其中單克隆抗體抑制癌細胞生長、癌細胞存活、肺瘤形成和癌細胞增殖中的一種或多種。18、權利要求l的組合物,其中單克隆抗體是單克隆抗體、多克隆抗體、嵌合抗體、人類抗體、人源化抗體、單鏈抗體、雙特異性抗體、多特異性抗體或Fab片段。19、權利要求14的組合物,其中單克隆抗體結合至LIV-1的一個或多個表位,所述的表位具有選自SEQIDNO:3-364和388-391的序列。20、權利要求14的組合物,其中單克隆抗體結合至在TM2和3之間的LIV-1細胞外結構域中的LIV-1表位。21、權利要求19的組合物,其中單克隆抗體結合至SEQIDNO:388的一個或多個表位。22、權利要求14的組合物,其中單克隆抗體結合至LIV-1N端細胞外結構域中的LIV-1表位。23、權利要求22的組合物,其中單克隆抗體結合至SEQIDNO:387的一個或多個表位,24、權利要求1的組合物,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑是具有選自SEQIDNO:367-382的序列的寡核苷酸。25、產(chǎn)生權利要求14的抗體的經(jīng)分離的細胞。26、產(chǎn)生權利要求14的抗體的雜交瘤細胞。27、產(chǎn)生權利要求14的抗體的非人類轉基因動物。28、分離的帶有表位的多肽,其包含SEQIDNO:2的一個或多個表位,所迷表位選自SEQIDNO:6-364和387-391。29、權利要求28的分離的帶有表位的多肽,其進一步的限制條件是多肽不包含SEQIDNO:2的全部氨基酸序列。30、編碼權利要求28的分離的帶有表位的多肽的多核苷酸。31、權利要求28的帶有表位的多肽,其中每一個所述表位由選自SEQIDNO:6-364和387-391的表位的約6至約20個連續(xù)氨基酸組成。32、權利要求28的帶有表位的多肽,其包含SEQIDNO:2的至少兩個表位,并且其中每一個所述表位由選自SEQIDNO:6-364和387-391的表位的約6至20個連續(xù)氨基酸組成。33、權利要求28的帶有表位的多肽,其中至少一個所述表位由SEQIDNO:2的至少21個連續(xù)氨基酸組成。34、分離的UV-1抗體,其是通過用權利要求28的帶有表位的多肽免疫受試者獲得的。35、在有需要的患者中治療癌癥或癌癥癥狀的方法,所述方法包括給患者施與治療有效量的權利要求1的LIV-1調(diào)節(jié)劑。36、權利要求35的方法,其中在測量細胞生長的體外測試法中,LIV-1調(diào)節(jié)劑抑制表達LIV-1的癌細胞的生長至少25%。37、權利要求35的方法,其中在測量細胞凋亡的體外測試法中,LIV-1調(diào)節(jié)劑在小于約lmM的濃度能有效地在至少25%所接觸的細胞中誘導細胞凋亡。38、權利要求35的方法,其中與對照相比較,LIV-1調(diào)節(jié)劑使細胞質(zhì)鋅水平減少至少25%。39、權利要求35的方法,其中所述的LIV-1調(diào)節(jié)劑抑制細胞周期蛋白Dl、纖連蛋白、RhoB、MT1-MMP、FGF、CDK4、VEGF、EGFR和EGFR磷酸化中的一種或多種。40、權利要求35的方法,其中與對照相比較,LIV-1調(diào)節(jié)劑抑制LIV-1表達至少25%。41、權利要求35的方法,其中LIV-l調(diào)節(jié)劑是siRNA、shRNA或反義寡核苷酸。42、權利要求41的方法,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑是具有選自SEQIDNO:367-382的序列的寡核苷酸。43、權利要求35的方法,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑是單克隆抗體。44、權利要求43的方法,其中單克隆抗體結合一個或多個表位,所述的表位具有選自SEQIDNO:3-364和388-391的序列。45、權利要求43的方法,其中單克隆抗體結合至在跨膜結構域(TM)2和3之間的LIV-1細胞外結構域中的LIV-1表位。46、權利要求43的方法,其中單克隆抗體結合至SEQIDNO:388的一個或多個表位。47、權利要求43的方法,其中單克隆抗體結合至LIV-1N端細胞外結構域中的LIV-1表位。48、權利要求43的方法,其中單克隆抗體結合至SEQIDNO:387的一個或多個表位。49、權利要求35的方法,其中癌癥是乳腺癌、皮膚癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宮癌、子宮頸癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多發(fā)性骨髓瘤或黑素瘤。50、權利要求35的方法,其中癌癥位于非激素調(diào)節(jié)的組織。51、權利要求49的方法,其中乳腺癌是雌激素受體陽性乳腺癌、雌激素受體陰性乳腺癌和轉移性乳腺癌。52、權利要求49的方法,其中乳腺癌選自管腺癌、小葉腺癌和轉移性腺癌。53、權利要求35的方法,其中癌癥是鱗狀細胞癌。54、權利要求35的方法,其還包括給患者施與常規(guī)的癌癥治療。55、權利要求35的方法,其還包括用化學治療、放射治療或外科手術中的一種或多種治療患者。56、權利要求35的方法,其中癌癥癥狀選自胸部腫塊、乳頭變化、胸部嚢腫、胸部疼痛、死亡、重量減輕、虛弱、極度疲勞、進食困難、食欲不振、久咳、惡化的氣喘、咳出血、尿血、便血、惡心、嘔吐、肝轉移、肺轉移、骨轉移、腹痛下墮、氣脹、腹膜腔中有液體、陰道流血、便秘、腹脹、結腸穿孔、急性腹膜炎、疼痛、吐血、重汗、發(fā)燒、高血壓、貧血、腹瀉、黃疸、眩暈、寒戰(zhàn)、肌肉痙攣、結腸轉移、肺轉移、膀胱轉移、肝轉移、骨轉移、腎轉移、和胰腺轉移、吞咽困難等。57、在患者中調(diào)節(jié)LIV-1相關生物學活性的方法,所述方法包括給患者施與調(diào)節(jié)LIV-1相關生物學活性有效量的權利要求1的LIV-1調(diào)節(jié)劑。58、權利要求57的方法,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑是選擇性結合至LIV-1的單克隆抗體。59、權利要求57的方法,其中患者患有或易誘發(fā)乳腺癌、皮膚癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宮癌、子宮頸癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多發(fā)性骨髓瘤和黑素瘤中的一種或多種。60、權利要求35的方法,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑是抗體,并且通過體內(nèi)治療性抗體基因轉移施與受試者。61、鑒定對LIV-1治療敏感的患者的方法,包括(a)檢測患者樣本中LIV-1差異表達的存在或不存在,其中在所述樣本中存在LIV-1差異表達表明患者是LIV-1治療的候選者;且在所述樣本中不存在LIV-1差異表達表明患者不是LIV-1治療的候選者;(b)如果患者是LIV-1治療的候選者,則給患者施與治療有效量的權利要求1的組合物;和(c)如果患者不是LIV-1治療的候選者,則給患者施與常規(guī)的癌癥治療。62、權利要求61的方法,其中與對照相比較,在患者中LIV-1的表達升高了至少50%。63、權利要求61的方法,其中通過測量LIV-1RNA檢測LIV-1差異表達。64、權利要求61的方法,其中通過測量LIV-1表達產(chǎn)物檢測LIV-1差異表達。65、權利要求61的方法,其還包括給患者施與常規(guī)的癌癥治療。66、抑制表達LIV-1的癌細胞生長的方法,所述方法包括將抑制癌細胞生長有效量的權利要求1的LIV-1調(diào)節(jié)劑與細胞接觸。67、權利要求66的方法,其中與對照相比較,LIV-1調(diào)節(jié)劑使細胞質(zhì)鋅水平降低至少25%。68、權利要求66的方法,其中與對照相比較,LIV-1調(diào)節(jié)劑使細胞周期蛋白Dl水平降低至少25%。69、在表達LIV-1的細胞群中抑制癌細胞表型的方法,所述方法包括給所述細胞群施與抑制癌細胞表型有效量的權利要求1的LIV-1調(diào)節(jié)劑。70、權利要求69的方法,其中癌細胞選自乳腺癌、皮膚癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宮癌、子宮頸癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多發(fā)性骨髓瘤和黑素瘤。71、在樣本中檢測一種或多種表達LIV-1的癌細胞的方法,所述方法包括將樣本與包含連接至顯像劑的權利要求1的LIV-1調(diào)節(jié)劑的組合物接觸并檢測顯像劑在樣本中的定位。72、權利要求71的方法,其中組合物包含綴合至顯像劑的LIV-1抗體。73、權利要求72的方法,其中顯像劑是"F、43K、S2Fe、57Co、67Cu、67Ga、77Br、87MSr、86Y、90Y、"MTc、mIn、123I、125I、127Cs、129Cs、mI、132I、197Hg、2Q3pb或贏Bi。74、抑制兩個或多個細胞相互作用的方法,其中至少一個所述細胞表達LIV-l,所述方法包括給包含所述細胞的樣本施與有效量的權利要求1的LIV-1調(diào)節(jié)劑。75、權利要求74的方法,其中相互作用是在體內(nèi)的。76、權利要求74的方法,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑是與對照相比較使細胞質(zhì)鋅水平降低至少25%的單克隆抗體。77、權利要求74的方法,其中LIV-1調(diào)節(jié)劑是與對照相比較使細胞周期蛋白Dl水平降低至少25%的單克隆抗體。78、在CHO或骨髓瘤細胞中表達抗LIV-1抗體的方法,其中抗LIV-1抗體抑制一種或多種LIV-1相關生物學活性,所述方法包括在所述CHO或骨髓瘤細胞中表達編碼抗LIV-1抗體的核酸。79、鑒定癌抑制劑的方法,所述癌的特征在于與對照相比LIV-1的過量表達,所述方法包括將表達LIV-1的細胞與候選化合物和LIV-1配體接觸,并確定LIV-1相關鋅轉運活性是否受到抑制,其中LIV-1相關鋅轉運活性的抑制是癌抑制劑的指標。80、鑒定癌抑制劑的方法,所述癌的特征在于與對照相比LIV-1的過量表達,所述方法包括將表達LIV-1的細胞與候選化合物和LIV-1配體接觸,并確定LIV-1下游標志物是否受到抑制,其中下游標志物的抑制是癌抑制劑的指標。81、權利要求80的方法,其中下游標志物是細胞周期蛋白Dl或細胞質(zhì)鋅水平。82、確定患者對LIV-1調(diào)節(jié)劑敏感性的方法,所述方法包括在所述患者的癌樣本中檢測LIV-1差異表達的證據(jù),其中LIV-1差異表達的證據(jù)是患者對所述LIV-1調(diào)節(jié)劑敏感性的指標。83、權利要求82的方法,其中所述的LIV-1差異表達的證據(jù)是LIV-1在所述患者癌樣本中的上調(diào)。84、從包含LIV-1蛋白的樣本中純化LIV-1蛋白的方法,包括a)提供親和基質(zhì),所述親和基質(zhì)包含結合至固體支持物的權利要求1的抗體;b)將樣本與親和基質(zhì)接觸以形成親和基質(zhì)-LIV-l蛋白復合體;c)從樣本剩余物中分離親和基質(zhì)-LIV-l蛋白復合體;以及d)從親和基質(zhì)釋放UV-1蛋白。85、將細胞毒劑或診斷劑遞送至一個或多個表達LIV-1的細胞的方法,所述方法包才舌a)提供綴合至權利要求1的抗體或其片段的細胞毒劑或診斷劑;以及b)將細胞暴露于抗體-劑或片段-劑綴合物。86、確定癌癥患者預后的方法,包括確定所述患者的樣本中LIV-1-S對LIV-1的比值,其中應用LIV-1-S對LIV-1的比值來確定癌癥患者的預后。87、確定癌癥患者預后的方法,包括在所述患者的樣本中確定結合至細胞質(zhì)膜的LIV-1的存在或不存在,其中所述患者的樣本中不存在結合至細胞質(zhì)膜的LIV-1指示患者良好的預后。88、權利要求86或87的方法,其中LIV-1由具有SEQIDNO:l的序列的核酸編碼。89、權利要求86或87的方法,其中LIV-l具有SEQIDNO:2的序列。90、權利要求86的方法,其中LIV-l-5具有SEQIDNO:365的序列。91、權利要求86的方法,其中至少2:1的LIV-1-S:LIV-1比值是具有良好預后的患者的指標。92、包^#轉運蛋白調(diào)節(jié)劑和一種或多種可藥用載體的組合物,其中鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑選自分離的雙鏈RNA(dsRNA);包含選自序列SEQIDNO:383-385的至少10個連續(xù)核苷酸的分離的寡核苷酸;結合鋅轉運蛋白結構域中的表位的抗體,所述鋅轉運蛋白結構域選自N-端細胞外結構域、在跨膜結構域(TM)2和3之間的細胞外結構域、在TM4和5之間的細胞外結構域、在TM6和7之間的細胞外結構域、以及C-端細胞外結構域。93、權利要求92的組合物,其中鋅轉運蛋白是SLC39A10、SLC39A11或SLC39A13。94、權利要求92的組合物,其中所述鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑調(diào)節(jié)整聯(lián)蛋白介導的活性、抑制鋅轉運或降低細胞質(zhì)鋅水平。95、權利要求92的組合物,其中寡核苷酸是siRNA或反義寡核苷酸。96、權利要求92的組合物,其中鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑是以至少1x108Ka的親和力結合至鋅轉運蛋白的單克隆抗體。97、權利要求97的組合物,其中單克隆抗體結合至鋅轉運蛋白N端細胞外結構域中的一個或多個表位。98、權利要求97的組合物,其中單克隆抗體結合至在跨膜結構域(TM)2和3之間的鋅轉運蛋白細胞外結構域中的一個或多個表位。99、權利要求97的組合物,其中單克隆抗體抑制癌細胞生長、癌細胞存活、腫瘤形成和癌細胞增殖中的一種或多種。100、在有需要的患者中治療癌癥或癌癥癥狀的方法,所述方法包括給患者施與治療有效量的權利要求92的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑。101、權利要求100的方法,其中鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑具有選自以下的一種或多種活性增加癌細胞凋亡、抑制癌細胞生長、抑制癌細胞存活、抑制腫瘤形成、抑制癌細胞增殖、抑制癌細胞轉移、抑制細胞遷移、抑制血管生成、抑制LIV-1信號傳導、抑制LIV-1介導的細胞-細胞粘附、抑制LIV-1介導的細胞-細胞膜相互作用、抑制LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)相互作用、抑制LIV-1介導的細胞-細胞外基質(zhì)降解、和抑制LIV-1表達。102、權利要求100的方法,其中在測定細胞生長的體外測試法中,鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑抑制表達鋅轉運蛋白的癌細胞的癌細胞生長至少30%。103、權利要求100的方法,其中在測定細胞凋亡的體外測試法中,鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑在小于約lmM的濃度能有效地在至少20%的接觸的細胞中誘導細胞凋亡。104、權利要求100的方法,其中鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑抑制鋅轉運。105、權利要求100的方法,其中鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑調(diào)節(jié)細胞質(zhì)鋅水平。106、權利要求100的方法,其中所述的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑調(diào)節(jié)整聯(lián)蛋白介導的活性。107、權利要求101的方法,其中與對照相比較,鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑至少25%抑制鋅轉運蛋白表達。108、權利要求100的方法,其中鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑是單克隆抗體。109、權利要求108的方法,其中抗體具有對除鋅轉運蛋白之外的多肽的小于約1xl05Ka的結合親和力。110、權利要求109的方法,其中單克隆抗體誘導細胞凋亡。111、權利要求109的方法,其中單克隆抗體抑制肺瘤形成。112、在患者中調(diào)節(jié)鋅轉運蛋白相關生物學活性的方法,所述方法包括給患者施與調(diào)節(jié)鋅轉運蛋白相關生物學活性有效量的權利要求92的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑。113、權利要求112的方法,其中鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑是選擇性結合至鋅轉運蛋白的單克隆抗體。114、權利要求100或112的方法,其中患者患有或易誘發(fā)乳腺癌、皮膚癌、食管癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、子宮癌、子宮頸癌、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、多發(fā)性骨髓瘤和黑素瘤中的一種或多種。115、抑制表達鋅轉運蛋白的癌細胞生長的方法,所述方法包括將細胞與抑制癌細胞生長有效量的權利要求92的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑接觸。116、權利要求115的方法,其中鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑是選擇性地結合鋅轉運蛋白并與對照相比較調(diào)節(jié)細胞質(zhì)鋅水平至少30%的單克隆抗體。117、在樣本中檢測一種或多種表達鋅轉運蛋白的癌細胞的方法,所述方法包括將樣本與包含連接至顯像劑的權利要求92的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑的組合物接觸并檢測顯像劑在樣本中的定位。118、權利要求117的方法,其中組合物包含綴合至顯像劑的鋅轉運蛋白抗體。119、權利要求118的方法,其中顯像劑是"F、43K、52Fe、S7Co、67Cu、67Ga、77Br、87MSr、86Y、90Y、"MTc、mIn、123I、125I、127Cs、129Cs、131I、132I、197Hg、203pb或206Bi。120、抑制兩個或多個細胞相互作用的方法,其中至少一個所述細胞表達鋅轉運蛋白,所述方法包括給包含所述細胞的樣本施與有效量的權利要求92的鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑。121、權利要求120的方法,其中相互作用是在體內(nèi)的。122、鑒定癌抑制劑的方法,所述癌的特征在于與對照相比鋅轉運蛋白的過量表達,所述方法包括將表達鋅轉運蛋白的細胞與候選化合物和鋅轉運蛋白配體接觸,并確定鋅轉運活性是否受到抑制,其中鋅轉運活性的抑制是癌抑制劑的指標。123、鑒定癌抑制劑的方法,所述癌的特征在于與對照相比鋅轉運蛋白的過量表達,所述方法包括將表達鋅轉運蛋白的細胞與候選化合物和鋅轉運蛋白配體接觸,并確定鋅轉運蛋白下游標志物是否受到抑制,其中下游標志物的抑制是癌抑制劑的指標。124、確定患者對鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑敏感性的方法,所述方法包括在所述患者的癌樣本中檢測鋅轉運蛋白差異表達的證據(jù),其中鋅轉運蛋白差異表達的證據(jù)是患者對所述鋅轉運蛋白調(diào)節(jié)劑敏感性的指標。125、權利要求124的方法,其中所述的鋅轉運蛋白差異表達的證據(jù)是鋅轉運蛋白在所述患者癌樣本中的上調(diào)。126、從包含一種或多種鋅轉運蛋白的樣本中純化鋅轉運蛋白的方法,所述方法包括a)提供親和基質(zhì),所述親和基質(zhì)包含結合至固體支持物的權利要求92的抗體;b)將樣本與親和基質(zhì)接觸以形成親和基質(zhì)-鋅轉運蛋白復合體;c)從樣本剩余物中分離親和基質(zhì)-鋅轉運蛋白復合體;以及d)從親和基質(zhì)釋放鋅轉運蛋白。127、將細胞毒劑或診斷劑遞送至一個或多個表達鋅轉運蛋白的細胞的方法,所述方法包括a)提供綴合至權利要求92的抗體或其片段的細胞毒劑或診斷劑;以及b)將細胞暴露于抗體-劑或片段-劑綴合物。全文摘要本發(fā)明尤其提供了治療癌癥的方法、治療癌癥的組合物以及用于診斷和/或檢測癌癥的方法和組合物。具體而言,本發(fā)明提供了用于治療、診斷和檢測與LIV-1過量表達相關的癌癥的方法和組合物。文檔編號C07K14/47GK101622273SQ200780021878公開日2010年1月6日申請日期2007年4月12日優(yōu)先權日2006年4月13日發(fā)明者D·齊默爾曼,G·于,M·J·揚塔波爾,R·多,V·尚申請人:諾瓦提斯疫苗和診斷公司
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