專利名稱:作為抗彎曲菌的抗微生物劑的肽的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及顯示出對彎曲菌(Campylobacter spp)的抗微生物特性的肽、包含所 述肽的組合物,以及所述肽用于抑制彎曲菌的生長或?qū)⑵錃⑺赖挠猛竞陀糜趶澢腥镜?診斷、預(yù)防和治療的用途。
背景技術(shù):
空腸彎曲菌(Campylobacter jejuni)是在人類中散發(fā)的食物源性疾病的主要原 因(Altekruse et al. 1999 ;Wren et al. 2001)。大部分確診的彎曲菌感染是由空腸彎曲 菌引起的(95% ),較少見的是由大腸彎曲菌(Campylobacter coli)引起的。對于多數(shù)人 來說,感染通常導(dǎo)致中等程度的腹瀉性疾病;但是在免疫系統(tǒng)較弱、發(fā)育不良或受到抑制的 人(例如,兒童、老人和患有慢性病的人)中,有可能出現(xiàn)嚴重的和長期的疾病。這類病例 常需要治療性干預(yù);但是,在過去十年中,空腸彎曲菌已對諸如四環(huán)素、萘啶酸和氟喹諾酮 類(fluorquinolones)的抗生素產(chǎn)生越來越強的抗性(Prats et al. 2000 ;Ge et al. 2003 ; Gupta et al. 2004),使得感染更難治療。在大約0. 的病例中,空腸彎曲菌感染導(dǎo)致諸如 格林-巴利綜合征(Guillain-Barre Syndrome (GBS))、密勒-費雪綜合征(Miller-Fisher Syndrome)或反應(yīng)性關(guān)節(jié)炎的慢性疾病。雞肉是人類的主要感染源(Wallaceet al. 1998 ;Altekruse et al. 1999),處理 以及食用生的和未熟的禽類產(chǎn)品是人感染彎曲菌病的主要危險因素。零售雞肉表面經(jīng)常污 染有嗜熱的彎曲菌,據(jù)報道污染水平在103-107CFU/禽體(Cason et al. 1997 ;Altekruse et al. 1999)。與之相比,從其他肉類中分離到彎曲菌的流行程度較低(例如,牛肉是0.5% ; 豬肉是 1. 5% ) (Zhao et al. 2001)。彎曲菌是家畜,諸如家禽的正常胃腸道微生物菌群的一部分,至4-7周齡時,家禽 群體的大約70-90%被彎曲菌定殖(Denis et al. 2001 ;Evans & Sayers 2000)。在屠宰場 進行的多項研究表明,在處理過程中,空腸彎曲菌的主要傳播途徑是由胃腸道到去皮的畜 體表面(Rivoal et al. 1999 ;Berrang et al. 2000 ;Musgrove et al. 1997)。由于空腸彎曲 菌與皮膚相互作用的性質(zhì),之后要從肉產(chǎn)品中除去它異常困難(Northcutt et al. 2004)。目前防止彎曲菌定殖的策略已證明無效。例如,彎曲菌廣泛存在于許多農(nóng)場動物、 寵物和鳥類中,使得幾乎不可能通過常規(guī)的生物安全措施來防止商業(yè)情境中的感染。提 議用于減少彎曲菌在雞中的定殖的幾種其他預(yù)防策略也未帶來多大的實際意義。例如, 用乙酸菌對小雞進行的益生菌處理和用有益微生物菌群進行的競爭排斥將定殖只降低了 2-27% (Morishita et al. 1997 ;Stern et al. 2005)。常規(guī)的試驗性疫苗也受到空腸彎曲 菌菌株的巨大血清型多樣性的限制。目前設(shè)計用于人類的藥物的抗生素通常活性譜寬泛, 并且就作用機制而言,均落在較少的幾個類型內(nèi)。因此,飼喂了這些抗生素的小雞可能成為 胃腸道抗生素抗性細菌的儲存宿主,這些抗生素抗性細菌經(jīng)零售店內(nèi)被污染的家禽傳播到 人類。仍需要替代的抗微生物化合物用于減少彎曲菌的定殖和生長,以及用于感染的診 斷。
發(fā)明概述本發(fā)明一個方面涉及與彎曲菌結(jié)合的分離的肽,其中所述肽選自a)能夠結(jié)合彎 曲菌的包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ IDN0 1)的肽或其片段;b)能夠結(jié)合彎曲 菌的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID NO 2)的肽或其片段;c)能夠結(jié)合彎曲菌 的包含氨基酸序列STALPL WSNYSYDSA(SEQ ID NO 3)的肽或其片段;d)能夠結(jié)合彎曲菌 的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽或其片段;e)能夠結(jié)合彎曲菌的 包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO 5)的肽或其片段;f)能夠結(jié)合彎曲菌的包 含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)的肽或其片段;g)能夠結(jié)合彎曲菌的包含 氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽或其片段;h)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨 基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽或其片段;i)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基 酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO 9)的肽或其片段;j)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸 序列FSPFRISELVYTLHP(SEQID NO 10)的肽或其片段;k)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO :11)的肽或其片段;1)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段;m)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列TGSGLYLHQMVYL YQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段;n)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其片段;o)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO :15)的肽或其片段;p)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或其片段;q)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的肽或其片段;r)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO :18)的肽或其片段;s)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或其片段;t)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)的肽或其片段;u)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或其片段;v)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列HRPVKTP ANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或其片段;w)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或其片段;x)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或其片段;y)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序 列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽或其片段;z)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列 RPSRWPWQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽或其片段;以及aa)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸 序列 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述肽特異結(jié)合彎曲菌。本發(fā)明另一方面涉及抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖姆椒?,所述方法包含將一種或 多種肽以足以抑制菌種的生長或?qū)⑵錃⑺赖牧颗c菌種接觸,其中所述一種或多種肽選自 a)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠩GVLGAALSAFSFDS(SEQ ID N0:1)的 肽或其片段;b)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠶AQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID N0:2)的肽或其片段;c)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?STALPLWSNYSYDSA(SEQID NO :3)的肽或其片段;d)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖?包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽或其片段;e)能夠抑制彎曲菌生 長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠯AIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO 5)的肽或其片段;f)能 夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠺CNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO :6)的肽
16或其片段;g)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠳FLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID N0:7)的肽或其片段;h)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?VPESIHKASLVCYRF(SEQ IDN0 8)的肽或其片段;i)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌?含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO :9)的肽或其片段;j)能夠抑制彎曲菌生長 或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠪SPFRISELVYTLHP(SEQID NO 10)的肽或其片段;k)能夠 抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠰PFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID N0:11)的肽 或其片段;1)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠫RFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段;m)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段;n)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖?包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其片段;o)能夠抑制彎曲菌生 長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠪MIDSPLASIGPTSM(SEQ IDN0:15)的肽或其片段;p)能 夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠪LSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽 或其片段;q)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠽LAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的肽或其片段;r)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18)的肽或其片段;s)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖?包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或其片段;t)能夠抑制彎曲菌生 長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠺PPYRAALATPVLLL(SEQ IDN0 20)的肽或其片段;u)能 夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠰SAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO :21)的肽 或其片段 ’v)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠬RPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或其片段;w)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?CFNDPLDIVPPMLLL(SEQID NO 23)的肽或其片段;x)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌?含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或其片段;y)能夠抑制彎曲菌生長或 將其殺死的包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽或其片段;z)能夠抑 制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠷PSRWPWQEPLPISI(SEQ IDN0 26)的肽或其片 段;以及aa)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠯VQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽與彎曲菌種結(jié)合從而抑制彎曲菌種的生 長。所述肽可以特異性結(jié)合彎曲菌從而抑制彎曲菌的生長。在一個實施方案中,所述一種或多種肽與彎曲菌種結(jié)合從而將其殺死。所述肽可 以特異性結(jié)合彎曲菌從而將其殺死。所述彎曲菌可以是彎曲菌的任何種。在一個實施方案中,所述彎曲菌是空腸彎曲 菌。另一個實施方案中,所述彎曲菌是大腸彎曲菌。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌?氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO :1)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一 種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠶AQPCPNQPDGSVYA(SEQ IDN0 2)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長 或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠸TALPLWSNYSYDSA(SEQ ID NO 3)的肽或其片段。在一 個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是
17能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠯AIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO 5)的肽 或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌?含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述 一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠳FLCPSPYPKVQPGL (SEQ ID N0:7)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生 長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠽PESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽或其片段。在一 個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?SRPIARFYTWSQNTT(SEQID NO 9)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是 能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠪SPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO: 10)的肽 或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌?含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID N0:11)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述 一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠫RFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO 12)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生 長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠺GSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段。在一 個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO :14)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是 能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠪MIDSPLASIGPTSM(SEQID NO 15)的肽 或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌?含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述 一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠽LAWFSPLTLESSRL (SEQ ID NO 17)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生 長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠽IDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18)的肽或其片段。在一 個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是 能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠺PPYRAALATPVLLL(SEQ IDN0 20)的肽 或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌?含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO :21)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一 種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠬RP VKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生 長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠧FNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或其片段。在一 個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄?AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO :24)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是 能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠯ALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽 或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌?含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述 一種或多種肽是能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠯VQIIPKDTLAPLPP(SEQ IDN0 27)的肽或其片段。 在一個實施方案中,所述方法包括抑制溶液中的彎曲菌的生長和將其殺死。溶液 可以是能夠被彎曲菌污染的任何溶液。在一個實施方案中,溶液是雞肉處理過程產(chǎn)生的溶液或者與雞肉加工相關(guān)的溶液,諸如飲用水、空調(diào)裝置中的水等等。在另一個實施方案中,所述方法包括抑制表面上的彎曲菌的生長和將其殺死。所 述表面可以是能夠被彎曲菌污染的任何表面。表面可以是農(nóng)業(yè)設(shè)備的表面或者家禽農(nóng)場使 用的設(shè)備(諸如用于運輸雞的板條箱、籠子、屠宰場使用的食物器皿和設(shè)備,例如用于宰殺 雞的設(shè)備)的表面,禽肉表面以及包裝的表面。例如,表面可以是一件與家禽或肉類產(chǎn)品發(fā) 生接觸的設(shè)備的表面。表面可以是動物的表面。在一個實施方案中,所述表面是動物肉例 如雞肉的表面。本發(fā)明另一方面涉及預(yù)防個體中彎曲菌感染的方法,包括將一種或多種肽以能夠 足以預(yù)防個體感染的量給予個體,其中所述一種或多種肽選自a)能夠預(yù)防彎曲菌感染的 包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID N0:1)的肽或其片段;b)能夠預(yù)防彎曲菌感染 的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID NO 2)的肽或其片段;c)能夠預(yù)防彎曲菌感 染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQ ID NO 3)的肽或其片段;d)能夠預(yù)防彎曲菌 感染的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽或其片段;e)能夠預(yù)防彎曲 菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO 5)的肽或其片段;f)能夠預(yù)防彎曲 菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)的肽或其片段;g)能夠預(yù)防彎 曲菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽或其片段;h)能夠預(yù)防 彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽或其片段;i)能夠預(yù) 防彎曲菌感染的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO 9)的肽或其片段;j)能夠 預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或其片段;k)能 夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11)的肽或其片段;1) 能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段; m)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片 段;n)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其 片段;o)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 15)的肽或 其片段;P)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽 或其片段;q)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的 肽或其片段;r)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18) 的肽或其片段;s)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或其片段;t)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)的肽或其片段;u)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或其片段;v)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列 HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或其片段;w)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序 列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或其片段;x)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸 序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或其片段;y)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基 酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽或其片段;z)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨 基酸序列RPSRWP WQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽或其片段;以及aa)能夠預(yù)防彎曲菌感染 的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或其片段。本發(fā)明另一方面涉及治療個體中彎曲菌感染的方法,包括將一種或多種肽以足以 治療個體感染的量給予個體,其中所述一種或多種肽選自a)能夠治療彎曲菌感染的包含
19氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1)的肽或其片段;b)能夠治療彎曲菌感染的包 含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID NO 2)的肽或其片段;c)能夠治療彎曲菌感染的 包含氨基酸序列STALPL WSNYSYDSA(SEQ ID NO 3)的肽或其片段;d)能夠治療彎曲菌感染 的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽或其片段;e)能夠治療彎曲菌感 染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO 5)的肽或其片段;f)能夠治療彎曲菌 感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)的肽或其片段;g)能夠治療彎曲 菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽或其片段;h)能夠治療彎 曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQID NO 8)的肽或其片段;i)能夠治療彎 曲菌感染的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO 9)的肽或其片段;j)能夠治療 彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或其片段;k)能夠 治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11)的肽或其片段;1)能 夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段;m) 能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列TGS GLYLHQMV YL YQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片 段;n)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其 片段;o)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 15)的肽或 其片段;P)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽 或其片段;q)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的 肽或其片段;r)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18) 的肽或其片段;s)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或其片段;t)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NQ 20)的肽或其片段;u)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或其片段;v)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列HRPVKTP ANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或其片段;w)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列 CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或其片段;x)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序 列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或其片段;y)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸 序列KAL YALHVPSMQ VFA(SEQ ID NO 25)的肽或其片段;z)能夠治療彎曲菌感染的包含氨 基酸序列RPSRWPWQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽或其片段;以及aa)能夠治療彎曲菌感染 的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ IDN0 27)的肽或其片段。
本發(fā)明另一方面涉及選自以下的一種或多種肽在制備治療個體彎曲菌感染的藥 物中的用途a)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1) 的肽或其片段;b)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID NO: 2)的肽或其片段;c)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQ ID NO 3)的肽或其片段;d)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID N0:4)的肽或其片段;e)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO 5)的肽或其片段;f)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)的肽或其片段;g)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽或其片段;h)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽或其片段;i)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO 9)的肽或其片段;j)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ IDNO 10)的肽或其片段;k)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11)的肽或其片段;1)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段;m)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序 列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段;η)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸 序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其片段;ο)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基 酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 15)的肽或其片段;ρ)能夠治療彎曲菌感染的包含氨 基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或其片段;q)能夠治療彎曲菌感染的包含 氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的肽或其片段;r)能夠治療彎曲菌感染的包 含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18)的肽或其片段;s)能夠治療彎曲菌感染的 包含氨基酸序列VRKTTSHPP S YALLH (SEQ ID NO 19)的肽或其片段;t)能夠治療彎曲菌感 染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)的肽或其片段;u)能夠治療彎曲菌 感染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或其片段;ν)能夠治療彎曲 菌感染的包含氨基酸序列HRP VKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或其片段;w)能夠治療 彎曲菌感染的包含氨基酸序列CFNDPLDI VPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或其片段;χ)能夠 治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或其片段;y)能 夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAL YALHVPSMQ VFA(SEQ ID NO 25)的肽或其片段; ζ)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO 26)的肽或其片 段;以及aa)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的 肽或其片段。本發(fā)明另一方面涉及診斷個體彎曲菌感染的方法,包括1)提供來自個體的樣品; 2)將樣品與一種或多種肽在允許所述一種或多種肽與彎曲菌結(jié)合的條件下接觸; 以及3)確定所述一種或多種肽是否結(jié)合了樣品中的彎曲菌,其中所述一種或多種肽選 自a)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1)的肽或其 片段;b)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID NO 2)的肽或 其片段;c)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQ ID NO 3)的肽 或其片段;d)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的 肽或其片段;e)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO 5)的 肽或其片段;f)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6) 的肽或其片段;g)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽或其片段;h)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽或其片段;i)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO 9)的肽或其片段;j)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或其片段;k)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11)的肽或其片段;1)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段;m)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序 列TGS GL YLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段;η)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基 酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID Ν0 14)的肽或其片段;ο)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 15)的肽或其片段;ρ)能夠診斷彎曲菌感染的包含 氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或其片段;q)能夠診斷彎曲菌感染的包 含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的肽或其片段;r)能夠診斷彎曲菌感染的 包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18)的肽或其片段;s)能夠診斷彎曲菌感染 的包含氨基酸序列VRKTTSHPP S YALLH (SEQ ID NO 19)的肽或其片段;t)能夠診斷彎曲菌 感染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)的肽或其片段;u)能夠診斷彎曲 菌感染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或其片段;ν)能夠診斷彎 曲菌感染的包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或其片段;w)能夠診斷 彎曲菌感染的包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或其片段;χ)能夠診 斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或其片段;y)能夠 診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽或其片段;ζ)能 夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO 26) 的肽或其片段;以 及aa)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或其 片段。在一個實施方案中,一種或多種肽與彎曲菌結(jié)合從而預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感 染。所述一種或多種肽可以特異性結(jié)合彎曲菌種從而預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染。彎曲菌可以是彎曲菌的任何種。在一個實施方案中,所述彎曲菌是空腸彎曲 菌。另一個實施方案中,所述彎曲菌選自大腸彎曲菌、海鷗彎曲菌(C. Iari)、上凸彎 曲菌(C. Upsaliensis)、簡明彎曲菌(C. concisus)、曲形彎曲菌(C. curvus)、胎兒彎 曲菌(C. fetus)、C. graciius、C. helveticus、豬腸彎曲菌(C hyoilei)、豚腸彎曲菌 (C. hyointestinalis)、C. lanienae、粘膜彎曲菌(C. mucosalis)、直腸彎曲菌(C. rectus)、 昭和彎曲菌(C. showae)和唾液彎曲菌(C. sputorum)。個體可以是人。個體可以是諸如雞、鴨、鵝或火雞的家禽。個體可以是馴養(yǎng)的動物, 例如貓或狗,或者是農(nóng)業(yè)動物,例如豬、?;蜓?。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包 含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一 種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID NO 2)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診 斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQ ID NO 3)的肽或其片段。在一 個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序 列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多 種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL (SEQ ID NO 5)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷 彎曲菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)的肽或其片段。在一個 實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列 NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是 能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQID NO 8)的肽 或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包 含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO 9)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診 斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO :11)的肽或其片段。在 一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸 序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或 多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷 彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其片段。在一 個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序 列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 15)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多 種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷 彎曲菌感染的包含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的肽或其片段。在一 個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序 列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQID NO 18)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種 肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎 曲菌感染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)的肽或其片段。在一個 實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列 LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ IDNO 22)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎 曲菌感染的包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或其片段。在一個 實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列 AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種 肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO: 25)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎 曲菌感染的包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO :26)的肽或其片段。在一個 實施方案中,所述一種或多種肽是能夠預(yù)防、治療或診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或其片段。 本發(fā)明另一方面涉及包含選自以下的氨基酸序列的分離的肽 EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO :1)、QAQPCPNQPDGSVYA(SEQID NO :2)、STALPLffSNYSYDSA(SEQ ID NO :3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)、KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ IDNO 5)、TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)、NFLCPSPYPKVQPGL (SEQ ID NO :7)、 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8),SRPIARFYTffSQNTT(SEQ ID NO 9),FSPFRISELVYTLHP(SEQ IDNO :10)、LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11)、GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO: 12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO : 1 3)、FLIDSPLAS IGPTSM(SEQ ID NO: 14)、FMIDSPLASIGPTSM(SEQ IDNO : 15)、FLSDPPAPPTSPGVV (SEQ ID N0:16)、 VLAffFSPLTLESSRL(SEQ ID NO : 1 7)、VIDLSGTRKSSSGTM(SEQID NO 18),VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO :19)、TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID N0:20)、 LSAPSPMFLPPVNPH (SEQI D NO : 2 1)、HRPVKTPANAPTTMM (SEQ ID NO:22)、 CFNDPLDIVPPMLLL (SEQ ID NO :23)、AHAPCSLFFPLSLRP (SEQI D NO:24)、 KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25), RPSRffPffQEPLP I SI(SEQ ID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQID NO :27)。本發(fā)明另一方面涉及15到100個氨基酸殘基的分離的肽,所述肽包含選自以下的氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS (SEQ ID NO 1)、QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO :2)、 STALPLffSNYSYDSA(SEQID NO 3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)、KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO :5)、TCNLSDYTLPRARVL(SEQ IDNO :6)、NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO :7)、 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8),SRPIARFYTffSQNTT(SEQ ID NO 9),FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO :10)、LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ IDNO : 11)、GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO: 12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO :13)、FLIDSPLASIGPTSM(SEQID N0:14)、 FMIDSPLASIGPTSM (SEQ ID NO : 1 5)、FLSDPPAPPTSPGVV (SEQ ID NO 16), VLAffFSPLTLESSRL (SEQ ID NO : 1 7)、VIDLSGTRKSSSGTM (SEQ ID NO 18), VRKTTSHPPSYALLH (SEQ ID NO : 19)、TPPYRAALATPVLLL (SEQ ID N0:20)、 LSAPSPMFLPPVNPH (SEQ ID NO :21)、HRPVKTPANAPTTMM (SEQI D N0:22)、 CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO : 23)、AHAPCSLFFPLSLRP (SEQ ID N0:24)、 KALYALHVPSMQVFA (SEQID NO 25) , RPSRffPffQEPLP I SI (SEQ ID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO :27)。本發(fā)明另一方面涉及包含選自以下的氨基酸序列的合成肽 EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO :1)、QAQPCPNQPDGSVYA(SEQID NO 2)、STALPLffSNYSYDSA(SEQ ID NO :3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO :4)、KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ IDNO 5)、TCNLSDYTLPRARVL (SEQ ID NO :6)、NFLCPSPYPKVQPGL (SEQ ID N0:7)、 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8),SRPIARFYTffSQNTT(SEQ ID NO 9),FSPFRISELVYTLHP(SEQ IDNO :10)、LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO : 11)、GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO: 12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO : 1 3)、FLIDSPLAS IGPTSM (SEQ ID NO: 14)、FMIDSPLASIGPTSM(SEQ IDNO : 15)、FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID N0:16)、 VLAffFSPLTLESSRL(SEQ ID NO : 1 7)、VIDLSGTRKSSSGTM(SEQID NO 18), VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO : 1 9)、TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID N0:20)、 LSAPSPMFLPPVNPH (SEQID NO :21)、HRPVKTP ANAPTTMM (SEQ ID N0:22)、 CFNDPLDIVPPMLLL (SEQ ID NO :23)、AHAPCSLFFPLSLRP (SEQ ID N0:24)、 KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25), RPSRffPffQEPLP I SI(SEQ ID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQID NO 27)。本發(fā)明另一方面涉及包含一種或多種肽的融合蛋白,其中所述一種或多 種肽選自EGVLGAALSAFSFDS (SEQ ID NO 1)、QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO :2)、 STALPLffSNYSYDSA(SEQID NO 3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)、KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO :5)、 TCNLSDYTLPRARVL(SEQ IDNO :6)、 NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO :7)、 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8),SRPIARFYTffSQNTT(SEQ ID NO 9),FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO :10)、LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ IDNO : 11)、GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO:12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO :13)、FLIDSPLASIGPTSM(SEQID NO 14), FMIDSPLASIGPTSM (SEQ ID NO : 1 5)、FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16), VLAffFSPLTLESSRL (SEQ ID NO : 1 7)、VIDLSGTRKSSSGTM (SEQ ID NO 18), VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19), TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID N0:20)、 LSAPSPMFLPPVNPH (SEQ ID NO :21)、HRPVKTPANAPTTMM (SEQID NO:22)、 CFNDPLDIVPPMLLL (SEQ ID NO : 2 3)、AHAPCSLFFPLSLRP (SEQ ID NO:24)、 KALYALHVPSMQVFA(SEQID NO 25) , RPSRffPffQEPLPISI (SEQ ID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO :27)。 在一個實施方案中,融合蛋白還包含噬菌體衣殼或其部分。本發(fā)明另一方面涉及包含一種或多種肽的fd-tet噬菌體,其中所述 一種或多種肽選自EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1), QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO 2), STALPLffSNYSYDSA (SEQID NO 3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO :4)、 KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO 5)、TCNLSDYTLPRARVL(SEQ IDNO 6)、NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO :7)、VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8) , SRPIARFYTffSQNTT (SEQ ID N0: 9)、FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)、LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ IDNO :11)、 GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO : 1 2)、TGSGLYLHQMVYLYQ (SEQ ID NO 13), FLIDSPLASIGPTSM (SEQID NO : 1 4)、FMIDSPLAS IGPTSM (SEQ ID NO 15), FLSDPPAPPTSPGVV (SEQ ID NO 16) , VLAffFSPLTLESSRL (SEQ ID NO 17), VIDLSGTRKSSSGTM (SEQ ID NO : 1 8)、VRKTTSHPPSYALLH (SEQ ID NO 19), TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO :20)、LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO :21)、HRPVKTP ANAPTTMM(SEQID NO :22)、CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO :23)、AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO :24)、KALYALHVPSMQVFA (SEQID NO :25)、RPSRWPWQEPLPISI (SEQ ID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO :27)。本發(fā)明另一方面涉及包含一種或多種肽的組合物,其中所述一種或多種肽 選自a)包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1)的肽;b)包含氨基酸序列 QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO 2)的肽;c)包含氨基酸序列 STALPL WSNYSYDSA (SEQ ID NO 3)的肽;d)包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR (SEQ ID NO 4)的肽;e)包含氨基酸序列 KAIAFQSSPGSPVLL (SEQ ID NO:5)的肽;f)包含氨基酸序列 TCNLSDYTLPRARVL (SEQ ID NO: 6)的肽;g)包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL (SEQ ID NO 7)的肽;h)包含氨基酸序列 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽;i)包含氨基酸序列 SRPIARFYTWSQNTT (SEQ ID N0: 9)的肽;j)包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP (SEQ ID NO 10)的肽;k)包含氨基酸序列 LPFNLAKPELYIFVQ (SEQ ID NO: 11)的肽;1)包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO: 12)的肽;m)包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ (SEQ ID NO 13)的肽;η)包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM (SEQ ID NO: 14)的肽;ο)包含氨基酸序列 FMIDSPLASIGPTSM (SEQ ID NO: 15)的肽;ρ)包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV (SEQ ID NO 16)的肽;q)包含氨基酸序列 VLAffFSPLTLESSRL (SEQ ID N0:17)的肽;r)包含氨基酸序列 VIDLSGTRKSSSGTM (SEQ ID NO: 18)的肽;s)包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH (SEQ ID NO 19)的肽;t)包含氨基酸序列 TPPYRAALATPVLLL (SEQ ID NO 20)的肽;u)包含氨基酸序列 LSAPSPMFLPPVNPH (SEQ ID NO 21)的肽;ν)包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽;w)包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽;χ)包含氨基酸序列 AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO
24)的肽;y)包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQID NO 25)的肽;ζ)包含氨基酸序列 RPSRffPffQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽;以及 aa)包含氨基酸序列 KVQIIPKDTLAPLPP (SEQ ID NO 27)的肽。本發(fā)明另一方面涉及包含一種或多種肽和藥物可接受的載體的藥物組合物, 其中所述一種或多種肽選自a)包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1)的 肽;b)包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO 2)的肽;c)包含氨基酸序列 STALPLffSNYSYDSA (SEQ ID NO:3)的肽;d)包含氨基酸序列 RTFGAKPPNIPFraR(SEQ ID NO:
4)的肽;e)包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO 5)的肽;f)包含氨基酸序列 TCNLSDYTLPRARVL (SEQ ID NO 6)的肽;g)包含氨基酸序列 NFLCPSPYPKVQPGL (SEQ ID NO:
7)的肽;h)包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQID NO 8)的肽;i)包含氨基酸序列 SRPIARFYTffSQNTT (SEQ ID NO 9)的肽;j)包含氨基酸序列 FSPFRISELVYTLHP (SEQ ID NO
10)的肽;k)包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQID NO 11)的肽;1)包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽;m)包含氨基酸序列 TGSGLYLHQMVYLYQ (SEQ ID NO:
13)的肽;η)包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQID NO 14)的肽;ο)包含氨基酸序列 FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO: 15)的肽;ρ)包含氨基酸序列 FLSDPPAPPTSPGVV (SEQ ID NO:
16)的肽;q)包含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQID NO 17)的肽;r)包含氨基酸序列 VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18)的肽;s)包含氨基酸序列 VRKTTSHPPSYALLH (SEQ ID N0:
19)的肽;t)包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQID NO 20)的肽;u)包含氨基酸序列 LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽;ν)包含氨基酸序列 HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽;w)包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽;χ)包含氨基酸序列 AHAPCSLFFPLSLRP (SEQ ID NO 24)的肽;y)包含氨基酸序列 KALYALHVPSMQVFA (SEQ ID NO
25)的肽;ζ)包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽;以及aa)包含氨基 酸序列 KVQIIPKDTLAPLPP (SEQ ID NO 27)的肽。本發(fā)明另一方面涉及分離的核酸分子,其編碼選自下述的肽a)包含氨基酸序列 egvlgaalsafsfds (seq id no 1)的肽;b)包含氨基酸序列 qaqpcpnqpdgsvya (seq id no: 2)的肽;c)包含氨基酸序列STALPLffSNYSYDSA (seq id no 3)的肽;d)包含氨基酸序列 Rtfgakppnipfi3RR (seq id no 4)的肽;e)包含氨基酸序列 kaiafqsspgspvll (seq id no:
5)的肽;f)包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)的肽;g)包含氨基酸序列 NFLCPSPYPKVQPGL (SEQ ID NO 7)的肽;h)包含氨基酸序列 VPESIHKASLVCYRF (SEQ ID NO:
8)的肽;i)包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQID NO 9)的肽;j)包含氨基酸序列 FSPFRISELVYTLHP (SEQ ID NO 10)的肽;k)包含氨基酸序列 LPFNLAKPELYIFVQ (SEQ ID N0:
11)的肽;1)包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQID NO 12)的肽;m)包含氨基酸序列 TGSGLYLHQMVYLYQ (SEQ ID NO 13)的肽;η)包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO:
14)的肽;ο)包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQID NO 15)的肽;ρ)包含氨基酸序列 FLSDPPAPPTSPGVV (SEQ ID N0:16)的肽;q)包含氨基酸序列 VLAWFSPLTLESSRL (SEQ ID NO:
17)的肽;r)包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQID NO 18)的肽;s)包含氨基酸序列 VRKTTSHPPSYALLH (SEQ ID NO 19)的肽;t)包含氨基酸序列 TPPYRAALATPVLLL (SEQ ID NO
20)的肽;u)包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQID NO 21)的肽;ν)包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽;w)包含氨基酸序列 CFNDPLDIVPPMLLL (SEQ ID NO
23)的肽;χ)包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽;y)包含氨基酸序列 KALYALHVPSMQVFA (SEQ ID NO 25)的肽;ζ)包含氨基酸序列 RPSRWPWQEPLPISI (SEQ ID NO: 26)的肽;以及aa)包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽。本發(fā)明另一方面涉及包含分離的核酸的重組載體,所述分離的核酸編碼選自下述的肽a)包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQID NO 1)的肽;b)包含氨基酸序列 QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO 2)的肽;c)包含氨基酸序列 STALPLWSNYSYDSA (SEQ ID NO: 3)的肽;d)包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽;e)包含氨基酸序列 KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO:5)的肽;f)包含氨基酸序列 TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO: 6)的肽;g)包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽;h)包含氨基酸序列 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽;i)包含氨基酸序列 SRPIARFYTWSQNTT (SEQ ID N0: 9)的肽;j)包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP (SEQ ID NO 10)的肽;k)包含氨基酸序列 LPFNLAKPELYIFVQ (SEQ ID NO 11)的肽;1)包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO 12)的肽;m)包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYL YQ (SEQ ID NO 13)的肽;η)包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO: 14)的肽;ο)包含氨基酸序列 FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO: 15)的肽;ρ)包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽;q)包含氨基酸序列 VLAffFSPLTLESSRL (SEQ ID N0:17)的肽;r)包含氨基酸序列 VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO: 18)的肽;s)包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽;t)包含氨基酸序列 TPPYRAALATPVLLL (SEQ ID NO 20)的肽;u)包含氨基酸序列 LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽;ν)包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽;w)包含氨基酸序列 CFNDPLDIVPPMLLL (SEQ ID NO 23)的肽;χ)包含氨基酸序列 AHAPCSLFFPLSLRP (SEQ ID NO
24)的肽;y)包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽;ζ)包含氨基酸序列 RPSRffPffQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽;以及 aa)包含氨基酸序列 KVQIIPKDTLAPLPP (SEQ ID NO 27)的肽。附圖簡述
圖1顯示了用于分離與空腸彎曲菌結(jié)合的噬菌體肽的篩選策略。A.將來自f88-4/15_聚體(mer)文庫的噬菌體肽直接針對空腸彎曲菌菌株ACM 3393進行選擇,得到“AP”和“AT”噬菌體肽集合。B.噬菌體展示文庫針對空腸彎曲菌菌株ACM 3393 (黑色框)進行一次差減,然后 針對空腸彎曲菌菌株ACM 3393進行三輪親和選擇。這樣得到“BP”和“BT”噬菌體肽。C.噬菌體展示文庫針對空腸彎曲菌菌株ACM 3393進行兩次差減,然后針對空腸 彎曲菌菌株C338(家禽菌株)進行三輪親和選擇。這樣得到“CP”和“CT”噬菌體肽。D.噬菌體展示文庫針對空腸彎曲菌菌株ACM 3393進行兩次差減,對空腸彎曲菌 菌株C338進行一次差減,然后對C338進行三輪親和選擇。這樣得到“DP”和“DT”噬菌體 肽。圖2顯示了與所選的噬菌體展示肽溫育時,空腸彎曲菌菌株C338的不同形態(tài)。A.與噬菌體肽CP3/1溫育的菌株C338的形態(tài)變?yōu)榫€形。B.與未經(jīng)選擇的噬菌體 文庫溫育的菌株C338,顯示正常的螺旋狀形態(tài);與BP3/5溫育的C338顯示為球菌樣形狀的 細菌。
圖3顯示了 AT3/5與相關(guān)蛋白的氨基酸比對。利用ClustalW將由AT3/5、家兔 (Oryctolagus cuniculus)水閘蛋白 Kclaudin 1)(兔;登錄號 ABK59974)、智人水閘蛋 白1(登錄號AAP97236)和中國恒河猴(Macaca mulatta)水閘蛋白1(恒河猴;登錄號 XP_001093143)推導(dǎo)的氨基酸序列進行比對。GeneDoc用作加陰影編輯器。用于表示每欄 的保守性程度的陰影水平對于100%保守是黑色,對于75%的氨基酸保守為灰色。注意,此 處顯示了氨基酸比對的前120個氨基酸。圖4顯示了 BT3/3與空腸彎曲菌鞭毛鉤長度調(diào)控蛋白(flagellahook length control protein)的氨基酸比對。利用ClustalW將由BT3/3、空腸彎曲菌亞種doyleii flgE基因(登錄號EAU02210)、空腸彎曲菌分離株5226 (登錄號AAP34261)、空腸彎曲菌空 腸亞種81-176 (登錄號CAA12127)和空腸彎曲菌菌株NCTC11168推導(dǎo)的氨基酸序列進行了 比對,GeneDoc用作加陰影編輯器。發(fā)明詳述
l.Ji本發(fā)明涉及分離的肽,所述肽結(jié)合彎曲菌并且通常抑制彎曲菌的生長或?qū)⑵錃?死。所述肽選自a)包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1)的肽;b)包含氨基 酸序列 QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO 2)的肽;c)包含氨基酸序列 STALPLWSNYSYDSA(SEQ ID NO 3)的肽;d)包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽;e)包含氨基酸 序列 KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO 5)的肽;f)包含氨基酸序列 TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)的肽;g)包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽;h)包含氨基酸序列 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽;i)包含氨基酸序列 SRPIARFYTWSQNTT (SEQ ID N0: 9)的肽;j)包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP (SEQ ID NO: 10)的肽;k)包含氨基酸序列 LPFNLAKPELYIFVQ (SEQ ID NO 11)的肽;1)包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID N0: 12)的肽;m)包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO: 13)的肽;η)包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽;ο)包含氨基酸序列 FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO: 15)的肽;ρ)包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO: 16)的肽;q)包含氨基酸序列 VLAffFSPLTLESSRL (SEQ ID N0:17)的肽;r)包含氨基酸序列 VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO: 18)的肽;s)包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽;t)包含氨基酸序列 TPPYRAALATPVLLL (SEQ ID NO 20)的肽;u)包含氨基酸序列 LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽;ν)包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽;w)包含氨基酸序列 CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽;χ)包含氨基酸序列 AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽;y)包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽;ζ)包含氨基酸序列 RPSRffPffQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽;以及 aa)包含氨基酸序列 KVQIIPKDTLAPLPP (SEQ ID NO 27)的肽。正如本文所述,與空腸彎曲菌結(jié)合的肽分離自噬菌體展示文庫,所述文庫由展示 與150-300拷貝主要衣殼蛋白pVIII融合的隨機15聚體肽的絲狀fd-tet噬菌體構(gòu)成 (Scott & Smith, 1990),并且含有2xl09肽變體/mL的復(fù)雜度[由George Smith博士提供 (密蘇里哥倫比亞大學(xué),USA)]。本發(fā)明的肽可以通過重組方法產(chǎn)生,或者化學(xué)合成。產(chǎn)生重組肽的方法是本領(lǐng)域 已知的,在例如Zwick et al. 1998中有描述。肽的化學(xué)合成方法是本領(lǐng)域已知的并有描述,例如,可以通過如Stewart et al,1984等描述的固相合成法來制備。如本文所述,本發(fā)明的肽結(jié)合空腸彎曲菌菌株ACM3393。發(fā)明人設(shè)想本發(fā)明的肽會 結(jié)合彎曲菌。所述肽可能表現(xiàn)出對彎曲菌的優(yōu)先結(jié)合。所述肽可能特異性結(jié)合彎曲菌。 本發(fā)明還涉及能夠結(jié)合彎曲菌的上述肽的片段。用于產(chǎn)生本文描述的肽的方法也 可以用于產(chǎn)生與彎曲菌結(jié)合的肽片段。能夠結(jié)合彎曲菌的上述肽的功能變體也在本發(fā)明的范圍內(nèi)。產(chǎn)生肽的功能變體的 方法是本領(lǐng)域已知的。包含上述肽的15到約100個氨基酸殘基的分離的肽也包括在本發(fā) 明內(nèi)。所述肽的實例包括長度為15到75個氨基酸殘基的肽,長度為15到50個氨基酸殘 基的肽,長度為15到25個氨基酸殘基的肽。可以如文中所述,將肽及其片段針對彎曲菌菌株進行測試,測試它們結(jié)合彎曲菌 的能力和/或它們抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖哪芰Α?.抑制彎曲菌牛長或?qū)⑵錃⑺赖姆椒òl(fā)明人發(fā)現(xiàn)結(jié)合空腸彎曲菌的肽可以適用于抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺?。因此?本發(fā)明還涉及利用一種或多種肽抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖姆椒?,所述一種或多種肽 選自下述a)包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1)的肽;b)包含氨基酸序列 QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO 2)的肽;c)包含氨基酸序列 STALPLWSNYSYDSA (SEQ ID NO: 3)的肽;d)包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽;e)包含氨基酸序列 KAIAFQSSPGSPVLL (SEQ ID NO:5)的肽;f)包含氨基酸序列 TCNLSDYTLPRARVL (SEQ ID NO: 6)的肽;g)包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽;h)包含氨基酸序列 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽;i)包含氨基酸序列 SRPIARFYTWSQNTT (SEQ ID NO: 9)的肽;j)包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP (SEQ ID NO: 10)的肽;k)包含氨基酸序列 LPFNLAKPELYIFVQ (SEQ ID NO 11)的肽;1)包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO: 12)的肽;m)包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO: 13)的肽;η)包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽;ο)包含氨基酸序列 FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO: 15)的肽;ρ)包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO: 16)的肽;q)包含氨基酸序列 VLAffFSPLTLESSRL (SEQ ID NO 17)的肽;r)包含氨基酸序列 VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO: 18)的肽;s)包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽;t)包含氨基酸序列 TPPYRAALATPVLLL (SEQ ID NO 20)的肽;u)包含氨基酸序列 LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽;ν)包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽;w)包含氨基酸序列 CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽;χ)包含氨基酸序列 AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽;y)包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽;ζ)包含氨基酸序列 RPSRffPffQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽;以及 aa)包含氨基酸序列 KVQIIPKDTLAPLPP (SEQ ID NO 27)的肽或者它們能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖钠?。在一個實施方案中,所述抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖姆椒ò▽澢c選 自以下的一種或多種肽進行接觸a)包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10) 的肽;b)包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO :12)的肽;c)包含氨基酸序列 TGSGLYLHQMVYLYQ (SEQ ID NO 13)的肽;d)包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO: 14)的肽;或e)包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽,或者它們能夠抑 制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖钠巍?br>
在另一個實施方案中,所述抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖姆椒ò▽澢c一 種或多種肽接觸,所述一種或多種肽選自a)包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽;b)包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽;或c)包含氨基酸序 列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽。
所述抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖姆椒òㄊ箯澢鷥H與上述肽中的一種接觸, 或者與一種以上的上述肽的組合接觸。在一個實施方案中,一種或多種肽與彎曲菌結(jié)合從而抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃?死。所述一種或多種肽可以優(yōu)先結(jié)合彎曲菌從而抑制其生長。所述一種或多種肽可以特異 性結(jié)合彎曲菌從而抑制其生長。所述一種或多種肽可以是殺菌性的。所述一種或多種肽可以是阻止細菌繁殖的。 可以通過阻止彎曲菌的生長來抑制彎曲菌的生長??梢酝ㄟ^減緩或降低彎曲菌生長速率來 抑制彎曲菌的生長。通過將彎曲菌與一種或多種肽接觸來抑制彎曲菌的生長??梢圆扇∪魏文軌蛞种?彎曲菌生長的方式使彎曲菌與肽接觸。在一個實施方案中,通過將彎曲菌的培養(yǎng)物與一種 或多種肽溫育使彎曲菌與所述肽接觸。通過將彎曲菌與一種或多種肽接觸來殺死彎曲菌??梢圆扇∪魏文軌驓⑺缽澢?的方式使彎曲菌與肽接觸。在一個實施方案中,通過將彎曲菌的培養(yǎng)物與一種或多種肽溫 育使彎曲菌與所述肽接觸。在一個實施方案中,抑制彎曲菌生長的方法可以包括抑制溶液中彎曲菌的生長或 將其殺死。在另一個實施方案中,抑制生長的方法可以包括抑制表面上的彎曲菌的生長或 將其殺死。彎曲菌的種類可以是彎曲菌的任何種,所述種在存在所述肽的情況下,其生長速 率比沒有所述肽的情況下的速率降低或者會被所述肽殺死。本文中描述了確定肽抑制彎曲 菌生長或?qū)⑵錃⑺赖哪芰Φ姆椒?,這些方法是本領(lǐng)域技術(shù)人員能力可及的。彎曲菌包括空腸彎曲菌、大腸彎曲菌、海鷗彎曲菌、上凸彎曲菌、簡明彎曲菌、胎兒 彎曲菌、C. graciius、C. helveticus、豬腸彎曲菌(Chyoilei)、豚腸彎曲菌、C. IanienaeJi^ 膜彎曲菌、直腸彎曲菌、昭和彎曲菌和唾液彎曲菌。3.治療或預(yù)防彎曲菌感染的方法如上所述,發(fā)明人發(fā)現(xiàn)本文描述的肽能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺?。發(fā)明 人還發(fā)現(xiàn)文中描述的某些肽顯示出與來自下述動物的水閘蛋白1以及Hendrixson & DiRita. 2003中描述的空腸彎曲菌鞭毛鉤長度調(diào)控蛋白(flgE)[登錄號YP_001001371、 EAQ71955、ΝΡ_281265、ΑΑΡ34261)的相似性智人(登錄號AAD22962),兔(家兔;登錄號 ΝΡ_001082785),恒河猴(中國恒河猴;登錄號ΧΡ_001093143))。發(fā)明人還發(fā)現(xiàn)當某些文中 描述的肽與空腸彎曲菌接觸時,對空腸彎曲菌的形態(tài)有影響。不希望被理論所束縛,發(fā)明人 設(shè)想這些肽可以抑制彎曲菌在胃腸細胞的中的定殖和入侵。因此發(fā)明人設(shè)想文中描述的肽 可以用于彎曲菌感染的治療或預(yù)防。因此,發(fā)明還涉及治療或預(yù)防個體中彎曲菌感染的方法,所述方法包括將一種或 多種肽給予個體,所述一種或多種肽選自a)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序 列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ IDNO 1)的肽或其片段;b)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID NO 2)的肽或其片段;c)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感 染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQ IDNO 3)的肽或其片段;d)能夠治療或預(yù)防 彎曲菌感染的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的肽或其片段;e)能夠治 療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO :5)的肽或其片段; f)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6)的肽或 其片段;g)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽或其片段;h)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO :8)的肽或其片段;i)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列 SRPIARFYTffSQNTT(SEQ ID NO :9)的肽或其片段;j)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨 基酸序列FSPFRISELVYTLHP (SEQ ID NO=IO)的肽或其片段;k)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染 的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11)的肽或其片段;Y)能夠治療或預(yù)防彎 曲菌感染的包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段;m)能夠治療 或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段;η) 能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其 片段;ο)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 15) 的肽或其片段;P)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO :16)的肽或其片段;q)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列 VLAffFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的肽或其片段;r)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨 基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18)的肽或其片段;s)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染 的包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或其片段;t)能夠治療或預(yù)防彎 曲菌感染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)的肽或其片段;u)能夠治療 或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或其片段;ν) 能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或其 片段;w)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23) 的肽或其片段;χ)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或其片段;y)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列 KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽或其片段;ζ)能夠治療或預(yù)防彎曲菌感染的包含氨 基酸序列RPSRWPWQEPLPISI (SEQ ID NO 26)的肽或其片段;以及aa)能夠治療或預(yù)防彎曲 菌感染的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ IDNO 27)的肽或其片段。在一個實施方案中,所述治療或預(yù)防個體中彎曲菌感染的方法包括將選自下 述的一種或多種肽給予個體a)包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID N0:10)的 肽;b)包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO 12的肽;c)包含氨基酸序列 TGSGLYLHQMVYLYQ (SEQ ID NO 13)的肽;d)包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或者e)包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽。在另一個實施方案中,所述治療或預(yù)防個體中彎曲菌感染的方法包括將選自下 述的一種或多種肽給予個體a)包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID N0:12)的 肽;b)包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ (SEQ ID NO 13)的肽或者c)包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽。術(shù)語“個體”用于本文是指患有需要治療的疾病或疾病狀態(tài)的任何動物。個體可以是人、或者可以是馴養(yǎng)的動物或者陪伴動物。雖然本發(fā)明的肽尤其考慮適用于治療家畜 種類,諸如包括雞、鴨、鵝和火雞的家禽,這些肽也考慮適用于治療人和諸如狗和貓的陪伴 動物以及諸如馬、牛和羊的其他馴養(yǎng)動物,或者諸如非人靈長類、貓科、犬科、牛科和蹄類的 動物園動物。通常,本文中使用的術(shù)語“治療(treating、treatment) ”意味著影響個體、組織或細胞從而獲得期望的藥理和/或生理效果。“治療”用于本文涵蓋對脊椎動物感染的任何治 療,包括抑制感染,即遏制其發(fā)展;或者緩解或改善感染的影響,即導(dǎo)致感染的影響的衰 退。本文中使用的“預(yù)防”意味著防止易于被感染,但還沒有被診斷為已患感染的個體發(fā)生 感染。本發(fā)明的方法可以包括以足以預(yù)防或治療彎曲菌感染的量給予一種或多種肽。術(shù)語“足以...的量”用于本文意味著本發(fā)明所述的一種或多種肽有效地產(chǎn)生期 望的反應(yīng)的量,所述期望的反應(yīng)例如通過給予發(fā)明所述的肽來預(yù)防或治療易于感染的個體 中的感染。當然,具體的“足以...的量”會隨諸如所治療的特定感染、個體的身體狀況和臨 床病史、接受治療的個體的類型、治療持續(xù)時間、同時進行的療法(如果有的話)的性質(zhì)、采 用具體配方以及肽或其片段或變體的結(jié)構(gòu)等因素而變化。4.組合物本發(fā)明的肽可以以組合物的形式與彎曲菌接觸。本發(fā)明的肽還可以通過包含本發(fā) 明的一種或多種肽以及藥物可接受載體的藥物組合物的形式給予個體。本文中使用的“藥物可接受的載體”是藥物可接受的溶劑、懸浮劑、賦形劑或者用 于將肽送遞給個體的介質(zhì)。載體可以是液體或固體,根據(jù)計劃的給藥方式來選擇。藥物可接受的載體包括例如Remington' s Pharmaceutical Sciences (雷明頓氏 藥學(xué)),20th ed. Williams & Wilkins (2000)和 The BritishNational Formulary (大不列 真頁國立處方一覽表)43rd ed. (BritishMedical Association and Royal Pharmaceutical Society of Great Britain, 2002 ;http: //bnf. rhn. net)中描述的碳酸鎂、二氧化鈦、乳 糖、甘露醇和其他糖、云母、奶蛋白、明膠、淀粉、維生素、纖維素及其衍生物、動物和蔬菜油、 聚乙二醇、以及諸如無菌水、醇、甘油和多羥基醇的溶劑、包括鹽、防腐劑、緩沖液等的無毒 賦形劑。根據(jù)本領(lǐng)域常規(guī)技術(shù)調(diào)節(jié)藥物組合物的PH和各種成分的精確濃度。參見Goodman 禾口Gilman 的 The Pharmacological Basis for Therapeutics (藥理學(xué)治療基礎(chǔ))(7th ed., 1985)。用于特定個體的本發(fā)明的肽或組合物的具體劑量水平取決于多種因素,包括所采 用的具體肽的活性、年齡、體重、一般健康狀況、性別、飲食、給藥時間、給藥途徑、排泄速度、 藥物組合和特定感染的嚴重程度。體外使用時,可以將肽加入或溶解于合適的生物學(xué)可接受的緩沖液中,加入細胞 或組織。生物學(xué)可接受的緩沖液包括TPS、鹽水和PBS。本發(fā)明的肽可以用作人或家禽或其他動物的彎曲菌感染的疫苗成分,或者用于開 發(fā)這類疫苗。正如本領(lǐng)域技術(shù)人員理解的,有幾種可用于送遞疫苗的途徑。在一個實施方 案中,本發(fā)明的肽用于鑒定可以在亞單位疫苗中使用的細菌受體。在該實施方案中,與一種 或多種肽結(jié)合的受體的鑒定是通過將彎曲菌與一種或多種所述肽接觸,允許發(fā)生結(jié)合并鑒定所述受體。本發(fā)明的肽可以固定于諸如濾膜、珠子、柱子、試紙條或凝膠的固體支持物上, 或者可以是融合蛋白的一部分或者是噬菌體衣殼的一部分。將這樣鑒定到的受體以本領(lǐng)域 技術(shù)人員已知的方式分離和/或合成,然后用作亞單位疫苗的抗原成分。疫苗的制備以及 合適的介質(zhì)和諸如佐劑的組分是本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的。在另一個實施方案中,本發(fā)明的 肽可以作為諸如基于肽的疫苗的疫苗組分,所述疫苗可以利用本發(fā)明所述的一種或多種噬 菌體展示的肽。同樣地,減毒細菌菌株可以展示肽,這方面Wyszynska et al.,2004描述了 經(jīng)口給予雞攜帶彎曲菌抗原的無毒力沙門氏菌疫苗菌株。可以考慮任何方便將多肽送遞給個體的方法。在一個實施方案中,在植物中的載 體中表達本發(fā)明的一種或多種肽(Fang et al. 2006提供了一個實例)。將表達治療性肽的 轉(zhuǎn)基因植物(例如谷物等)喂給家禽。另一個實施方案中,Lazarev et al. 2004描述了送 遞介質(zhì)。在該實施方案中,制備了重組質(zhì)粒載體并以氣霧劑給予雞。盡管出于清楚和便于理解的目的,對發(fā)明進行了詳細描述,對本領(lǐng)域技術(shù)人員顯 而易見的是可以對本文描述的實施方案和方法進行各種完善和改動,而不背離本說明書公 開的發(fā)明構(gòu)思的范圍。 5.診斷方法正如上文所述,本發(fā)明人發(fā)現(xiàn)本文描述的肽能夠診斷彎曲菌感染。因此,本發(fā)明涉 及診斷個體中彎曲菌感染的方法,所述方法包括1)提供來自個體的樣品;2)在允許所述一種或多種肽與彎曲菌結(jié)合的條件下,將樣品與一種或多種肽接 觸;和3)確定所述一種或多種肽是否結(jié)合了樣品中的彎曲菌,其中所述一種或多種肽選 自a)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1)的肽或其 片段;b)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID NO 2)的肽或 其片段;c)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQ ID NO 3)的肽 或其片段;d)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)的 肽或其片段;e)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO 5)的 肽或其片段;f)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO 6) 的肽或其片段;g)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7)的肽或其片段;h)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO 8)的肽或其片段;i)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO 9)的肽或其片段;j)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或其片段;k)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11)的肽或其片段;1)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段;m)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序 列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段;η)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸 序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其片段;ο)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基 酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 15)的肽或其片段;ρ)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨 基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SFQ ID NO 16)的肽或其片段;q)能夠診斷彎曲菌感染的包含 氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的肽或其片段;r)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18)的肽或其片段;s)能夠診斷彎曲菌感染的 包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或其片段;t)能夠診斷彎曲菌感染 的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)的肽或其片段;u)能夠診斷彎曲菌感 染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或其片段;ν)能夠診斷彎曲菌 感染的包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或其片段;w)能夠診斷彎曲 菌感染的包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或其片段;χ)能夠診斷彎 曲菌感染的包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或其片段;y)能夠診斷 彎曲菌感染的包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽或其片段;ζ)能夠 診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO 26)的肽或其片段;以及 aa)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或其片 段。在一個實施方案中,所述方法采用了包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ IDNO 11)的月太。在一個實施方案中,通過檢測肽與彎曲菌屬的細菌的結(jié)合,所述肽可以用于診斷。 更具體地說,“檢測”結(jié)合伴侶的方法可以包括將推定含有彎曲菌屬細菌的樣品與已被可檢 測地標記的肽接觸。在一個實施方案中,與彎曲菌結(jié)合的肽可以是固定在陣列上的多個捕 獲試劑之一。例如,可以將肽可檢測地標記上生物素,然后與樣品接觸,從而允許彎曲菌屬 的任何細菌與標記的肽結(jié)合??梢酝ㄟ^加入鏈霉親和素或者抗生物素蛋白,然后通過偶聯(lián) 了可檢測標記的鏈霉親和素或抗生物素蛋白特異抗體探測,從而確定特定位置(諸如與作 為陣列中的捕獲試劑之一的特定肽對應(yīng)的位置)上目標細菌的存在。也可以采用其他類型 的肽的可檢測標記,包括但不限于熒光Cy3和Cy5標記、金顆粒和放射性標記。作為生物素的替代物,也可以通過化學(xué)發(fā)光、增強的化學(xué)發(fā)光或者放射性標記來 標記肽??蛇x擇地,可以用例如辣根過氧化物酶或者另一種允許對肽復(fù)合物進行比色檢測 的可檢測的酶或標記將二抗標記。標記和檢測蛋白質(zhì)的其他方法是本領(lǐng)域技術(shù)人員已知 的。在一個實施方案中,可以將本發(fā)明的肽整合到噬菌體展示文庫中。噬菌體展示 文庫可以用于蛋白質(zhì)相互作用的高通量篩選,從而檢測彎曲菌表面上所述肽受體的存 在。將肽導(dǎo)入噬菌體展示文庫的方法是本領(lǐng)域技術(shù)人員完全理解的,并在例如Smith & Petrenko (1997)中有描述。簡而言之,所述方法涉及將靶DNA片段連接到編碼噬菌體衣殼 的基因中,例如連接到絲狀噬菌體的PlII或PVIII中。絲狀噬菌體株M13、fd和fl常用作 載體。導(dǎo)入的DNA片段作為衣殼蛋白的一部分被表達在噬菌體顆粒的表面。如果幾個DNA 片段被整合到基因中,則其成為這些DNA片段的文庫。然后將噬菌體基因和插入的DNA轉(zhuǎn) 化到諸如雄性大腸桿菌的細菌細胞,尤其是TGl大腸桿菌細胞中。直至用輔助噬菌體感染 細菌,噬菌體顆粒才會在細菌細胞成熟時釋放,而這時噬菌體顆粒就會將相關(guān)的蛋白片段 展示為它們的外殼的一部分。還可以基于下述進行分析只有含有彎曲菌的樣品可以作為 合適的噬菌體宿主,因此只有樣品中存在彎曲菌屬的細菌時,擴增才會發(fā)生。例如Biotec Laboratories (Ipswich,UK)擁有噬菌體擴增技術(shù)(PhageAmplification Technology),該 技術(shù)有潛力應(yīng)用于多種不同細菌,利用噬菌體擴增的存在與否來診斷感染。在該系統(tǒng)中,噬 菌體感染所關(guān)注的細菌,強力的殺病毒劑將所有沒有感染細菌的噬菌體破壞掉。噬菌體繼續(xù)在活細菌細胞中復(fù)制,通過細胞裂解被釋放從而重新感染非病原性的感受細胞。感受細 胞菌苔上的清澈區(qū)域(噬菌斑)指示這類測試的陽性結(jié)果。
實施例 現(xiàn)在僅通過參考以下非限制性實施例和附圖來詳細描述本發(fā)明。空腸彎曲菌的牛長空腸彎曲菌的家禽分離株由Pat Blackall博士(QDPI,Australia)提供,空腸 彎曲菌ACM 3393 (NCTC11351)從澳大利亞微生物保藏中心(Australian Collection of Microorganisms) (Queensland,Australia)購買??漳c彎曲菌生長于預(yù)先購買的彎曲菌瓊 脂板(OxoicbAustralia)或血瓊脂板[40g/L血瓊脂基礎(chǔ)#2 (Oxoid),5% (ν/ν)去除了血纖 維蛋白的馬血(Oxoid),以及彎曲菌生長添加劑(0. 25g/L丙酮酸鈉、0. 25g/Li3-亞硫酸氫 鈉和0. 25g/L硫酸亞鐵;Oxoid]。由CampyGen Sachets (Oxoid)在2. 5L厭氧性生物廣口瓶 中提供微需氧環(huán)境,或者可選擇地由GasPakE2Campy Pouches (BD Biosciences)提供。培 養(yǎng)物在37°C生長1-2天。為了在液體培養(yǎng)基中生長,將空腸彎曲菌重新懸浮于補充了彎曲菌生長添加劑 (0. 25g/L丙酮酸鈉、0. 25g/Li3 -亞硫酸氫鈉和0. 25g/L硫酸亞鐵;Oxoid)的2號營養(yǎng)肉 湯中(Nutrient Broth No. 2)(由 10g/LLab-Lemco 粉,10g/L 蛋白胨和 5g/L 氯化鈉組成; Oxoid)中。由 GasPakE2Campy Pouches (BD Biosciences)提供微需氧環(huán)境,培養(yǎng)物在 37°C, 180rpm 生長 1-2 天。親和選擇f88_4/15聚體肽噬菌體展示文庫(G. P. Smith博士提供,密蘇里哥倫比亞大學(xué), USA)用于針對與空腸彎曲菌外表面結(jié)合的噬菌體肽的親和選擇。所述文庫由展示融合 在150-300拷貝的主要衣殼蛋白pVIII (Scott & Smith,1990)上的隨機15聚體肽的絲狀 fd-tet噬菌體構(gòu)成,并含有2xl09肽變體/mL的復(fù)雜度(complexity)。圖1顯示了分離與空腸彎曲菌結(jié)合的噬菌體克隆的選擇方案。在選擇方案A(圖 1)中,直接針對空腸彎曲菌菌株ACM 3393選擇噬菌體展示文庫,得到集合A噬菌體。簡 言之將IOki轉(zhuǎn)導(dǎo)單位(TU ;Smith& Scott, 1993)的f88_4/15聚體噬菌體文庫與重懸在 終體積為3mL的PBSg (磷酸緩沖鹽pH 7. 0,含有0. 1 %明膠)中的IO9CFU的空腸彎曲菌 (菌株ACM 3393)溫育。將該空腸彎曲菌-噬菌體溶液于室溫下通過在軌道式振蕩器上 攪動來保持懸浮在培養(yǎng)皿中。20分鐘后,利用lmLPBSg(pH 7. 0)或TBST(TBS pH 7. 5,含 有0.5% Tween 20)作為平行實驗(圖1中洗滌的PBSg或者洗滌的TBST),通過一系列 洗滌和離心(3,000rpm,2分鐘)步驟將與空腸彎曲菌結(jié)合的噬菌體與溶液中非結(jié)合的噬 菌體分開。通過在室溫下加入洗脫緩沖液(含有甘氨酸的0. INHCl, pH 2. 2 ;lg/L牛血清 白蛋白)10分鐘,將仍與空腸彎曲菌結(jié)合的噬菌體從沉淀的空腸彎曲菌上洗脫下來,并立 即用IM Tris-CKpH 9.0)中和。噬菌體通過感染“饑餓”的大腸桿菌K91BlueKan細胞 (Yu &Smith,1996)得以擴增,經(jīng)聚乙二醇(PEG)沉淀純化兩次,重懸于TBS緩沖液(50mM Tris-Cl pH 7. 5,150mM NaCl) (Smith & Scott,1993)中。在大腸桿菌 K91BluKan 細胞中, 測定經(jīng)過擴增的噬菌體的滴度,然后如上所述將所述噬菌體重新應(yīng)用于新鮮制備的空腸彎 曲菌細胞中。繼續(xù)針對空腸彎曲菌進行親和選擇,共進行三次親和選擇和兩次擴增步驟。
在選擇方案B(圖1)中,針對空腸彎曲菌菌株ACM 3393進行消減或扣除步驟 (depletion or negative st印),然后針對空腸彎曲菌菌株ACM 3393進行三輪親和選擇。 這樣得到集合B噬菌體(BT和BP噬菌體;圖1)。在選擇方案C (圖1)中,針對空腸彎曲菌 菌株ACM 3393進行兩次消減/扣除步驟,然后對空腸彎曲菌菌株C338進行三輪親和選擇。 這樣得到集合C噬菌體(CT和CP噬菌體;圖1)。在選擇方案D (圖1)中,進行三次消減/ 扣除步驟(兩次針對空腸彎曲菌菌株ACM3393,一次針對C338菌株),然后針對空腸彎曲菌 菌株C338進行三次親和選擇。每個選擇方案中最后一輪(3’洗脫下來的噬菌體用于感染大腸桿菌K91BlueKan 細胞。這些細胞鋪在含有40mg/L四環(huán)素的LB(LuriaBroth)平板上以便選擇含有噬菌體的 細菌。隨機選擇各含有單個噬菌體群的細菌菌落,并將其繁殖以進行測序并在抗微生物分 析中進行檢測。從每種選擇策略中隨機挑出單個的噬菌體克隆。DNA測序和肽分析
由單個噬菌體克隆分離單鏈DNA并使用在DNA分析設(shè)備(Macquarie University, NSW, Australia)中的ABI Prism 377自動測序儀從pVIII基因的3'端測序。利用瑞士生 物信息研究所蛋白分析專家系統(tǒng)(Swiss Institute of Bioinformatics Expert Protein AnalysisSystem) (ExPASy :htttp://www, expasy. ch)中蛋白組學(xué)服務(wù)器上的〃翻譯〃程 序?qū)NA序列概念地翻譯為氨基酸。用BLAST程序(NCBI :http://www. ncbi. nlm. gov/ blast)獲得翻譯成的肽序列與已知蛋白質(zhì)的同源性。對彎曲菌菌種牛長的抑制檢測了代表性的親和選擇的噬菌體肽體外抑制空腸彎曲菌菌株生長的能力。每 個噬菌體克隆經(jīng)大腸桿菌感染擴增,通過PEG沉淀純化兩次并重新懸浮在TBS緩沖液 (pH 7.5)中。利用在分光光度計上的紫外(UV)吸收測量值計算噬菌體濃度為病毒顆粒/ μ L(Smith & Scott,1993)。利用一種形式的微量稀釋易感性檢測來確定每種噬菌體展示 肽的抗微生物活性。簡言之將各空腸彎曲菌菌株重新懸浮于營養(yǎng)肉湯中至OD595為0. 2, 然后在含有彎曲菌生長添加劑的營養(yǎng)肉湯中稀釋到104-105CFU/mL。微量滴定板的每個孔 接種150 μ L l-5xl05CFU/mL的細菌和45 μ L在TBS (pH 7. 5)中的單獨的噬菌體展示的肽。 對照包括不含噬菌體展示肽的TBS和含有未經(jīng)過選擇的噬菌體文庫的TBS。微需氧環(huán)境由 GasPak E2Campy Pouches (BD Biosciences)提供。在 37°C無震蕩培養(yǎng) 24-48 小時后,在平 板讀數(shù)儀(Victor2,Perkin Elmer)中測量細菌培養(yǎng)物在OD595Iim處的光密度。將接種物稀釋并鋪在血瓊脂板上,通過菌落計數(shù)來確定96孔板中的活細菌數(shù)。在 血瓊脂板上進行的菌落計數(shù)還可以用于確定所述分析中使用的最初細菌接種物。用革蘭氏 染色試劑盒檢查空腸彎曲菌與噬菌體肽溫育之后的形態(tài)??傊?,發(fā)現(xiàn)10個噬菌體克隆體外抑制空腸彎曲菌的生長,如表2所顯示。從這 10個克隆中分離單鏈DNA,并對基因pVIII上的肽編碼區(qū)域進行測序(如表2所示)。有 兩個克隆含有相同的序列,如CP3/3 (表2中的FLIDSPLASIGPTSM)和CP3/4 (表2中的 FMIDSPLASIGPTSM)所表示的。其余的6個克隆編碼獨特的肽序列(表2)。如表2所示,利用微量稀釋易感性檢測,某些噬菌體克隆能夠在體外抑制空腸彎 曲菌的生長。例如,BT3/4在體外抑制細菌濃度為lxl04CFU/mL的空腸彎曲菌的生長。當最初 的細菌接種物為2. 8xl04CFU/mL時,CP3/1抑制97%的空腸彎曲菌的生長,最初細菌接種物為2. 8xl04CFU/mL時,抑制89%的空腸彎曲菌的生長。當最初的細菌接種物為2. SxlO4CFU/mL時,CP3/2抑制92%的空腸彎曲菌的生長,最初細菌接種物為1. 6xl05CFU/mL時,CP3/2 抑制87 %的空腸彎曲菌的生長。此外,如圖2所示,這些噬菌體肽能夠影響空腸彎曲菌的形 態(tài)。利用BLAST (國立生物技術(shù)信息中心(National Centre ofBiotechnology Information))進行的序列分析表明,某些肽表現(xiàn)出與數(shù)據(jù)庫中的已知蛋白質(zhì)的相似性。例 如,表1中的AT3/5表現(xiàn)出與水閘蛋白Kclaudin 1)的相似性。水閘蛋白1是膜整合蛋白, 它是許多動物物種類的胃腸道中的緊密連接蛋白的一部分(圖3)。在胃腸感染的小鼠模型 中,發(fā)現(xiàn)幽門螺桿菌(Helicobacter pylori)干擾水閘蛋白1的表達。表1中的BT3/3顯 示出與來自空腸彎曲菌的鞭毛鉤長度調(diào)控蛋白(flgE)的相似性(圖4)。該蛋白是空腸彎 曲菌運動和體內(nèi)毒力所必需的。這些結(jié)果總起來表明,一些噬菌體肽可以通過破壞彎曲菌 移居和侵入胃腸細胞的能力來發(fā)揮作用。應(yīng)當理解,文中對現(xiàn)有技術(shù)出版物的引用不表示承認這些出版物構(gòu)成了在澳大利 亞或任何其他國家的公知常識的一部分。在隨后的權(quán)利要求書和本發(fā)明的以上描述中,除了由于語言表達或必要的暗 示,上下文另有需要外,詞語“包含(comprise)”或者諸如“包含(comprises) ”或“包含 (comprising),,的變體用于包括的含義,即用于限定所述特征的存在,但并不排除在本發(fā)明 的各種實施方案中存在或添加其他特征。參考文獻文中引用的參考文獻列舉如下,并通過引用并入本文。Altekruse, S. F. ;Stern, N. J. ;Fields, P. L, and Swerdlow, D. L. (1999). Campylobacter jejuni__an emerging foodborne pathogen. EmergInfect Dis. 28 ;5 (1) 28-35.Berrang, Μ. Ε. ;Buhr, R. J. , and Cason, J. A. (2000) Campylobacterrecovery from external and internal organs of commercial broiler carcassprior to scalding. Poult Sci. 79(2) :286_90.Bishop-Hurley S. L et al. 2005Antimicrobial Agents &Chemotherapy 49(7) 2972-2978).Cason, J. A. ;Bailey, J. S. ;Stern, N. J. ;ffhittemore, A. D. , and Cox, N. A. (1997) ο Relationship between aerobic bacteria,salmonellae andCampylobacter on broiler carcasses. Poult Sci. 76(7) 1037-41.Denis, M. ;Refregier-Petton, J. ;Laisney, Μ. J. ;Ermel, G. , and Salvat, G. (2001) 0 Campylobacter contamination in French chicken productionfrom farm to consumers. Use of a PCR assay for detection andidentification of Campylobacter jejuni and Camp. coli. J Appl Microbiol. 91 (2) :255_67.Dill,D. ;Stanker,L. H. ;Young,C. R. 1999. Detection of salmonellain poultry using a silicon chip-based biosensor. J. Biochem. Biophys. Methods 41 :61-67.Evans, S. J. and Sayers, A. R. (2000)A longitudinal study ofCampylobacter infection of broiler flocks in Great Britain. Prev Vet Med. 46(3) :209_23.
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權(quán)利要求
與彎曲菌結(jié)合的分離的肽,其中所述肽選自a)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQID NO1)的肽或其片段;b)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ ID NO2)的肽或其片段;c)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQ ID NO3)的肽或其片段;d)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQID NO4)的肽或其片段;e)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO5)的肽或其片段;f)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQID NO6)的肽或其片段;g)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQID NO7)的肽或其片段;h)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQID NO8)的肽或其片段;i)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQID NO9)的肽或其片段;j)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQID NO10)的肽或其片段;k)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQID NO11)的肽或其片段;l)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQID NO12)的肽或其片段;m)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO13)的肽或其片段;n)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQID NO14)的肽或其片段;o)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQID NO15)的肽或其片段;p)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQID NO16)的肽或其片段;q)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQID NO17)的肽或其片段;r)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQID NO18)的肽或其片段;s)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQID NO19)的肽或其片段;t)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQID NO20)的肽或其片段;u)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQID NO21)的肽或其片段;v)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO22)的肽或其片段;w)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQID NO23)的肽或其片段;x)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQID NO24)的肽或其片段;y)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO25)的肽或其片段;z)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI(SEQID NO26)的肽或其片段;以及aa)能夠結(jié)合彎曲菌的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQID NO27)的肽或其片段。
2.如權(quán)利要求1所述的分離的肽,其中所述肽特異結(jié)合彎曲菌。
3.抑制彎曲菌菌種生長或?qū)⑵錃⑺赖姆椒?,所述方法包括將一種或多種肽以足以抑制 所述菌種生長或?qū)⑵錃⑺赖牧颗c所述菌種接觸,其中所述一種或多種肽選自a)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠩GVLGAALSAFSFDS(SEQID NO1)的肽或其片段;b)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠶AQPCPNQPDGSVYA(SEQID NO:2)的肽或其片段;c)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠸TALPLWSNYSYDSA(SEQID NO:3)的肽或其片段;d)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠷TFGAKPPNIPFPRR(SEQID NO:4)的肽或其片段;e)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠯AIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO:5)的肽或其片段;f)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠺CNLSDYTLPRARVL(SEQID NO:6)的肽或其片段;g)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠳FLCPSPYPKVQPGL(SEQID NO:7)的肽或其片段;h)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠽PESIHKASLVCYRF(SEQID NO:8)的肽或其片段;i)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠸RPIARFYTWSQNTT(SEQID NO:9)的肽或其片段;j)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠪SPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO:10)的肽或其片段;k)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠰PFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO:11)的肽或其片段;1)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠫RFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO:12)的肽或其片段;m)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠺GSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO:13)的肽或其片段;n)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠪LIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO:314)的肽或其片段;o)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠪MIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO:15)的肽或其片段;P)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠪LSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO:16)的肽或其片段;q)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠽LAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO:17)的肽或其片段;r)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠽IDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO:18)的肽或其片段;s)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠽RKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO:19)的肽或其片段;t)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠺PPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO:20)的肽或其片段;u)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠰SAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO:21)的肽或其片段;v)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠬RPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO:22)的肽或其片段;w)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠧FNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO:23)的肽或其片段;x)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠥HAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO:24)的肽或其片段;y)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠯ALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO:25)的肽或其片段;z)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠷PSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO:26)的肽或其片段;以及aa)能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被嵝蛄蠯VQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO:27)的肽或其片段。
4.如權(quán)利要求3所述的方法,其包括將能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被?序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
5.如權(quán)利要求3所述的方法,其包括將能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被?序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
6.如權(quán)利要求3所述的方法,其包括將能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被?序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
7.如權(quán)利要求3所述的方法,其包括將能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被?序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
8.如權(quán)利要求3所述的方法,其包括將能夠抑制彎曲菌生長或?qū)⑵錃⑺赖陌被?序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
9.如權(quán)利要求3至8中任一項所述的方法,其中所述一種或多種肽與所述彎曲菌菌種 結(jié)合從而抑制所述彎曲菌菌種生長或?qū)⑵錃⑺馈?br>
10.如權(quán)利要求9所述的方法,其中所述一種或多種肽特異結(jié)合所述彎曲菌菌種從而 抑制所述彎曲菌菌種生長或?qū)⑵錃⑺馈?br>
11.如權(quán)利要求3至10中任一項所述的方法,其中所述彎曲菌是空腸彎曲菌。
12.如權(quán)利要求3至10中任一項所述的方法,其中所述彎曲菌是大腸彎曲菌。
13.如權(quán)利要求3至12中任一項所述的方法,其中所述方法包括抑制溶液中的彎曲菌 的生長或?qū)⑵錃⑺馈?br>
14.如權(quán)利要求3至12中任一項所述的方法,其中所述方法包括抑制表面上的彎曲菌 的生長或?qū)⑵錃⑺馈?br>
15.預(yù)防個體彎曲菌感染的方法,其包括將一種或多種肽以足以預(yù)防所述個體感染的 量給予所述個體,其中所述一種或多種肽選自a)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQID NO 1)的肽或其 片段;b)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQID NO 2)的肽或其 片段;c)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQID NO 3)的肽或其 片段;d)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQID NO 4)的肽或其 片段;e)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO 5)的肽或其 片段;f)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQID NO 6)的肽或其 片段;g)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQID NO 7)的肽或其 片段;h)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQID NO 8)的肽或其 片段;i)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQID NO 9)的肽或其 片段;j)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或 其片段;k)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID N0:11)的肽或 其片段;1)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或 其片段;m)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或 其片段;n)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或 其片段;o)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 15)的肽或其片段;P)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或 其片段;q)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的肽或 其片段;r)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18)的肽或 其片段;s)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或 其片段;t)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)的肽或 其片段;u)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或 其片段;v)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或 其片段;w)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或 其片段;x)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或 其片段;y)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽或 其片段;z)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO 26)的肽或 其片段;以及aa)能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或 其片段。
16.如權(quán)利要求15所述的方法,其包括將能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段與所述彎曲菌接觸。
17.如權(quán)利要求15所述的方法,其包括將能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列 TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO: 13)的肽或其片段與所述彎曲菌接觸。
18.如權(quán)利要求15所述的方法,其包括將能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其片段與所述彎曲菌接觸。
19.如權(quán)利要求15所述的方法,其包括將能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列 FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或其片段與所述彎曲菌接觸。
20.如權(quán)利要求15所述的方法,其包括將能夠預(yù)防彎曲菌感染的包含氨基酸序列 FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或其片段與所述彎曲菌接觸。
21.治療個體彎曲菌感染的方法,包括將一種或多種肽以足以治療所述個體感染的量 給予所述個體,其中所述一種或多種肽選自a)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID N0:1)的肽或其 片段;b)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQ 片段;c)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQ 片段;d)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ 片段;e)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ 片段;f)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQ 片段;g)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ 片段;h)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQ 片段;i)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQ 片段;j)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ 其片段;k)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ 其片段;1)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ 其片段;m)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ 其片段;n)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ 其片段;o)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQ 其片段;P)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ 其片段;q)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ 其片段;r)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ 其片段;s)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ 其片段;t)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ 其片段;u)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQID NO 2)的肽或其 ID NO 3)的肽或其 ID NO 4)的肽或其 ID NO ;5)的肽或其 ID NO 6)的肽或其 ID NO 7)的肽或其 ID NO 8)的肽或其 ID NO 9)的肽或其 ID NO: 10)的肽或 ID NO 11)的肽或 ID NO: 12)的肽或 ID NO 13)的肽或 ID NO 14)的肽或 ID NO: 15)的肽或 ID NO 16)的肽或 ID NO: 17)的肽或 ID NO 18)的肽或 ID NO: 19)的肽或 ID NO 20)的肽或 ID NO 21)的肽或其片段;v)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或 其片段;w)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或 其片段;x)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或 其片段;y)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽或 其片段;z)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO 26)的肽或 其片段;以及aa)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或 其片段。
22.如權(quán)利要求21所述的方法,其包括將能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
23.如權(quán)利要求21所述的方法,其包括將能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列 TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
24.如權(quán)利要求21所述的方法,其包括將能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
25.如權(quán)利要求21所述的方法,其包括將能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列 FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
26.如權(quán)利要求21所述的方法,其包括將能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列 FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或其片段與彎曲菌接觸。
27.診斷個體彎曲菌感染的方法,包括1)提供來自所述個體的樣品;2)將樣品與一種或多種肽在允許所述一種或多種肽與彎曲菌結(jié)合的條件下接觸;和3)確定所述一種或多種肽是否結(jié)合了樣品中的彎曲菌,其中所述一種或多種肽選自a)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQID N0:1)的肽或其 片段;b)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQID NO 2)的肽或其 片段;c)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQID NO 3)的肽或其 片段;d)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQID NO 4)的肽或其 片段;e)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO 5)的肽或其 片段;f)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQID NO 6)的肽或其 片段;g)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQID NO 7)的肽或其 片段;h)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQID NO 8)的肽或其 片段;i)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQID NO 9)的肽或其 片段;j)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQID NO 10) 其片段;k)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQID NO 11 其片段;1)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQID NO 12 其片段;m)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQID NO 13 其片段;n)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQID NO 14 其片段;o)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM(SEQID NO 15 其片段;P)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQID NO 16 其片段;q)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQID NO 17 其片段;r)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQID NO 18 其片段;s)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQID NO 19 其片段;t)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQID NO 20 其片段;u)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQID NO 21 其片段;v)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQID NO 22 其片段;w)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQID NO 23 其片段;x)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQID NO 24 其片段;y)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQID NO 25 其片段;z)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI(SEQID NO 26其片段;以及aa)能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或 其片段。
28.如權(quán)利要求27所述的方法,其包括將能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列 FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 15)的肽或其片段與所述樣品接觸。
29.如權(quán)利要求28所述的方法,其包括用能夠診斷彎曲菌感染的包含氨基酸序列 FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或其片段與所述樣品接觸。
30.如權(quán)利要求15至29中任一項所述的方法,其中所述彎曲菌是空腸彎曲菌。
31.如權(quán)利要求15至29中任一項所述的方法,其中所述彎曲菌是大腸彎曲菌。
32.如權(quán)利要求15至31中任一項所述的方法,其中所述個體選自人、家禽、馴養(yǎng)動物或 農(nóng)業(yè)動物。
33.如權(quán)利要求32所述的方法,其中所述家禽包含雞、鴨、鵝或火雞。
34.如權(quán)利要求32所述的方法,其中所述馴養(yǎng)動物包含貓或狗。
35.如權(quán)利要求32所述的方法,其中所述農(nóng)業(yè)動物包含豬、牛或羊。
36.包含選自以下的氨基酸序列的分離的肽EGVLGAALSAFSFDS(SEQID NO :1)、QAQPCPNQPDGSVYA(SEQID NO 2) , STALPLffSNYSYDSA(SEQ ID N0:3)、 RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)、KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ IDNO 5)、TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO :6)、NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO :7)、VPESIHKASLVCYRF (SEQ ID NO :8)、 SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO :9)、FSPFRISELVYTLHP(SEQ IDNO :10)、LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11) , GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO : 12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO :13)、FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO :14)、FMIDSPLASIGPTSM(SEQ IDNO 15)、FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16) , VLAWFSPLTLESSRL (SEQ ID NO: 17)、VIDLSGTRKSSSGTM(SEQID NO : 18)、VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19), TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO : 20)、LSAPSPMFLPPVNPH (SEQID N0:21)、 HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO : 22)、CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID N0:23)、 AHAPCSLFFPLSLRP (SEQID NO : 24)、KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID N0:25)、 RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO 26)和 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQID NO :27)。
37.15到100個氨基酸殘基的分離的肽,所述肽包含選自以下的氨基酸 序列EGVLGAALSAFSFDS (SEQ ID NO 1)、QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID N0:2)、 STALPLWSNYSYDSA(SEQID NO 3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)、KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO :5)、TCNLSDYTLPRARVL (SEQ IDNO :6)、NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO :7)、 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO :8)、SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO :9)、FSPFRISELVYTLHP(SEQID NO 10), LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ IDNO : 11)、GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID N0:12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQIDNO 13)、FLIDSPLASIGPTSM(SEQIDNO14)、FMIDSPLASIGPTSM(SEQIDNO15)、FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ IDNO 16)、VLAWFSPLTLESSRL(SEQIDNO 17)、VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ IDNO 18)、VRKTTSHPPSYALLH(SEQIDNO ;19)、TPPYRAALATPVLLL(SEQ IDNO 20)、LSAPSPMFLPPVNPH (SEQIDNO21)丨、HRPVKTPANAPTTMM (SEQIDNO 22),CFNDPLDIVPPMLLL(SEQIDNO :23)、AHAPCSLFFPLSLRP (SEQ IDNO 24)、KALYALHVPSMQVFA (SEQID NO 25)、RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO :27)。
38.包含選自以下的氨基酸序列的合成肽EGVLGAALSAFSFDS(SEQID NO I)、QAQPCPNQPDGSVYA(SEQID NO 2), STALPLffSNYSYDSA (SEQ ID N0:3)、 RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ IDNO 4)、KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO 5)、TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO :6)、NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO :7)、VPESIHKASLVCYRF (SEQ ID NO :8)、 SRPIARFYTWSQNTT(SEQ IDNO :9)、FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO :10)、LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11) , GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO :12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO :13)、FLIDSPLASIGPTSM(SEQID NO : 14)、FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO: 15)、FLSDPPAPPTSPGVV (SEQ ID NO : 16)、VLAWFSPLTLESSRL (SEQID NO 17), VIDLSGTRKSSSGTM (SEQ ID NO : 1 8)、VRKTTSHPPSYALLH (SEQ ID NO 19), TPPYRAALATPVLLL(SEQID NO : 20)、LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID N0:21)、 HRPVKTPANAPTTMM (SEQ ID NO :22)、CFNDPLDIVPPMLLL(SEQID N0:23)、 AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO :24)、KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID N0:25)、 RPSRWPWQEPLPISI(SEQID NO 26)和 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO :27)。
39.包含一種或多種肽的組合物,其中所述一種或多種肽包含選自以下的氨 基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQ ID NO 1)、QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO :2)、 STALPLWSNYSYDSA(SEQID NO 3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)、KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO :5)、 TCNLSDYTLPRARVL(SEQ IDNO :6)、 NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO :7)、 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO :8)、SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO :9)、FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO :10)、LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ IDNO : 11)、GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO: 12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO : 13)、FLIDSPLASIGPTSM (SEQID N0:14)、 FMIDSPLASIGPTSM (SEQ ID NO : 1 5)、FLSDPPAPPTSPGVV (SEQ ID NO 16), VLAWFSPLTLESSRL (SEQID NO : 1 7)、VIDLSGTRKSSSGTM (SEQ ID NO 18), VRKTTSHPPSYALLH (SEQ ID NO : 1 9)、TPPYRAALATPVLLL (SEQID N0:20)、 LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO :21)、HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO:22)、 CFNDPLDIVPPMLLL (SEQ ID NO : 23)、AHAPCSLFFPLSLRP (SEQ ID NO:24)、 KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25), RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO :27)。
40.包含一種或多種肽和藥物可接受的載體的藥物組合物,其中所述一 種或多種肽包含選自以下的氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS (SEQ ID NO :1)、 QAQPCPNQPDGSVYA(SEQID NO :2)、STALPLWSNYSYDSA(SEQ ID NO :3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO :4)、KAIAFQSSPGSPVLL (SEQ IDNO :5)、TCNLSDYTLPRARVL(SEQ ID NO :6)、 NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO 7).VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO :8)、SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO :9)、FSPFRISELVYTLHP (SEQ IDNO : 10)、LPFNLAKPELYIFVQ (SEQ ID NO:II)、GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO : 12)、TGSGLYLHQMVYLYQ (SEQ ID N0:13)、 FLIDSPLASIGPTSM (SEQ ID NO : 1 4)、FMIDSPLASIGPTSM(SEQ IDNO 15), FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO :16)、VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17), VIDLSGTRKSSSGTM (SEQID NO 18) , VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19),TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)、LSAPSPMFLPPVNPH (SEQID NO :21)、HRPVKTP ANAPTTMM(SEQ ID NO :22)、CFNDPLDIVPPMLLL (SEQ ID NO :23)、AHAPC SLFFPLSLRP (SEQID NO 24) , KALYALHVPSMQVFA (SEQ ID NO :25)、RPSRWPWQEPLPISI (SEQ ID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQID NO 27)。
41.包含一種或多種肽的融合蛋白,其中所述一種或多種肽包含選自以下的 氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS (SEQ ID NO 1)、QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO: 2) , STALPLWSNYSYDSA (SEQID NO :3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO :4)、KAIAFQS SPGSPVLL(SEQ ID NO 5)、TCNLSDYTLPRARVL(SEQ IDNO 6)、NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO :7)、VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO :8)、SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO :9)、 FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO : 10)、LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ IDNO : 11)、GRFLIRVTS SPLGPD (SEQ ID NO : 12)、TGSGLYLHQMVYLYQ (SEQ ID NO : 13)、FLIDSPLASIGPTSM (SEQID NO :14)、FMIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO : 15)、FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO: 16)、VLAWFSPLTLESSRL (SEQID NO : 17)、VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID N0:18)、 VRKTTSHPPSYALLH (SEQ ID NO : 1 9)、TPPYRAALATPVLLL(SEQID N0:20)、 LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO : 2 1)、HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID N0:22)、 CFNDPLDIVPPMLLL (SEQID NO : 2 3)、AHAPCSLFFPLSLRP (SEQ ID N0:24)、 KALYALHVPSMQVFA (SEQ ID NO 25) , RPSRWPWQEPLPISI(SEQID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO :27)。
42.如權(quán)利要求41所述的融合蛋白,其中所述蛋白還包含噬菌體衣殼或其部分。
43.包含一種或多種肽的fd-tet噬菌體,其中所述一種或多種肽包含選自以下 的氨基酸序列:EGVLGAALSAFSFDS (SEQ ID NO :1)、QAQPCPNQPDGSVYA (SEQ ID NO 2)、 STALPLWSNYSYDSA(SEQID NO 3)、RTFGAKPPNIPFPRR(SEQ ID NO 4)、KAIAFQSSPGSPVLL(SEQ ID NO :5)、TCNLSDYTLPRARVL (SEQ IDNO :6)、NFLCPSPYPKVQPGL(SEQ ID NO :7)、 VPESIHKASLVCYRF(SEQ ID NO :8)、SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO :9)、FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO : 10)、LPFNLAKPELYIFVQ (SEQ IDNO : 11)、GRFLIRVTSSPLGPD (SEQ ID NO: 12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO :13)、FLIDSPLASIGPTSM(SEQID N0:14)、 FMIDSPLASIGPTSM (SEQ ID NO : 1 5)、FLSDPPAPPTSPGVV (SEQ ID NO 16), VLAWFSPLTLESSRL(SEQID NO : 1 7)、VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18), VRKTTSHPPSYALLH (SEQ ID NO : 1 9)、TPPYRAALATPVLLL(SEQID N0:20)、 LSAPSPMFLPPVNPH (SEQ ID NO : 2 1 )、HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID N0:22)、 CFNDPLDIVPPMLLL (SEQID NO : 23)、AHAPCSLFFPLSLRP (SEQ ID N0:24)、 KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25) , RPSRWPWQEPLPISI(SEQID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO :27)。
44.分離的核酸分子,其編碼選自下述的肽EGVLGAALSAFSFDS(SEQID NO :1)、QAQPCPNQPDGSVYA (SEQID NO 2)、STALPLWSNYSYDSA (SEQ ID N0:3)、 RTFGAKPPNIPFPRR (SEQ ID NO 4)、KAIAFQSSPGSPVLL (SEQ IDNO 5)、TCNLSDYTLPRARVL (SEQ ID NO :6)、NFLCPSPYPKVQPGL (SEQ ID NO :7)、VPESIHKASLVCYRF (SEQ ID NO :8)、 SRPIARFYTWSQNTT(SEQ ID NO :9)、FSPFRISELVYTLHP(SEQ IDNO 10).LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11) , GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO : 12)、TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ IDNO :13)、FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)、FMIDSPLASIGPTSM(SEQ IDNO 15)、FLSDPP APPTSPGVV (SEQ ID NO :16)、VLAWFSPLTLESSRL (SEQ ID NO: 17)、VIDLSGTRKSSSGTM(SEQID NO : 18)、VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19), TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO :20)、LSAPSPMFLPPVNPH (SEQID NO :21)、HRPVKTP ANAPTTMM(SEQ ID NO :22)、CFNDPLDIVPPMLLL (SEQ ID NO :23)、AHAPCSLFFPLSLRP (SEQID NO 24)、KALYALHVPSMQVFA (SEQ ID NO 25)、RPSRWPWQEPLPISI (SEQ ID NO 26)禾口 KVQIIPKDTLAPLPP(SEQID NO :27)。
45. 一種或多種肽在制備用于治療個體彎曲菌感染的藥物中的用途,其中所述一種或 多種肽選自a)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列EGVLGAALSAFSFDS(SEQID N0:1)的肽或其 片段;b)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列QAQPCPNQPDGSVYA(SEQID NO 2)的肽或其 片段;c)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列STALPLWSNYSYDSA(SEQID NO 3)的肽或其 片段;d)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列RTFGAKPPNIPFPRR(SEQID NO 4)的肽或其 片段;e)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列KAIAFQSSPGSPVLL(SEQID NO 5)的肽或其 片段;f)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列TCNLSDYTLPRARVL(SEQID NO 6)的肽或其 片段;g)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列NFLCPSPYPKVQPGL(SEQID NO 7)的肽或其 片段;h)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VPESIHKASLVCYRF(SEQID NO 8)的肽或其 片段;i)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列SRPIARFYTWSQNTT(SEQID NO 9)的肽或其 片段;j)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)的肽或 其片段;k)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列LPFNLAKPELYIFVQ(SEQ ID NO 11)的肽或 其片段;1)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)的肽或 其片段;m)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO 13)的肽或 其片段;n)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)的肽或 其片段;o)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FMIDSPLASIGPTSM (SEQ ID NO 15)的肽或 其片段;P)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)的肽或 其片段;q)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VLAWFSPLTLESSRL(SEQ ID NO 17)的肽或 其片段;r)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VIDLSGTRKSSSGTM(SEQ ID NO 18)的肽或 其片段;s)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列VRKTTSHPPSYALLH(SEQ ID NO 19)的肽或 其片段;t)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列TPPYRAALATPVLLL(SEQ ID NO 20)的肽或 其片段;u)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列LSAPSPMFLPPVNPH(SEQ ID NO 21)的肽或 其片段;v)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列HRPVKTPANAPTTMM(SEQ ID NO 22)的肽或 其片段;w)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列CFNDPLDIVPPMLLL(SEQ ID NO 23)的肽或 其片段;x)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列AHAPCSLFFPLSLRP(SEQ ID NO 24)的肽或 其片段;y)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列KALYALHVPSMQVFA(SEQ ID NO 25)的肽或 其片段;z)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列RPSRWPWQEPLPISI(SEQ ID NO 26)的肽或 其片段;以及aa)能夠治療彎曲菌感染的包含氨基酸序列KVQIIPKDTLAPLPP(SEQ ID NO 27)的肽或 其片段。
46.如權(quán)利要求45所述的用途,其中所述肽包含能夠治療彎曲菌感染的氨基酸序列 GRFLIRVTSSPLGPD(SEQ ID NO 12)或其片段。
47.如權(quán)利要求45所述的用途,其中所述肽包含能夠治療彎曲菌感染的氨基酸序列 TGSGLYLHQMVYLYQ(SEQ ID NO: 13)或其片段。
48.如權(quán)利要求45所述的用途,其中所述肽包含能夠治療彎曲菌感染的氨基酸序列 FLIDSPLASIGPTSM(SEQ ID NO 14)或其片段。
49.如權(quán)利要求45所述的用途,其中所述肽包含能夠治療彎曲菌感染的氨基酸序列 FSPFRISELVYTLHP(SEQ ID NO 10)或其片段。
50.如權(quán)利要求45所述的用途,其中所述肽包含能夠治療彎曲菌感染的氨基酸序列 FLSDPPAPPTSPGVV(SEQ ID NO 16)或其片段。
全文摘要
本發(fā)明涉及顯示出對彎曲菌(Campylobacter spp)的抗微生物特性的肽、包含所述肽的組合物,以及所述肽用于抑制彎曲菌的生長或?qū)⑵錃⑺赖挠猛竞陀糜趶澢腥镜脑\斷、預(yù)防和治療的用途。
文檔編號C07K7/28GK101861329SQ200880020282
公開日2010年10月13日 申請日期2008年6月18日 優(yōu)先權(quán)日2007年6月22日
發(fā)明者克里斯托弗·西蒙·麥克斯維尼, 莎倫·莉莉安·畢曉普-赫爾利 申請人:澳大利亞家禽Crc有限公司