專利名稱：：新siRNA結(jié)構(gòu)的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
：本發(fā)明涉及新化合物、包含該化合物的藥物組合物以及使用其抑制某些哺乳動(dòng)物基因包括TP53BP2、LRDD,CYBA,CASP2、N0X3、HRK、RACl、RHOA和DUOXl的方法。所述化合物和組合物因此在治療其中基因表達(dá)具有不良后果的疾病或病癥和/或與該疾病或病癥相關(guān)的癥狀的受試者時(shí)是有用的。在具體實(shí)施方案中，本發(fā)明提供包含該化合物的組合物及其使用方法。本發(fā)明還提供在制備化學(xué)修飾的siRNA寡核苷酸中有用的新結(jié)構(gòu)基序、包含它的組合物及其使用方法。
背景技術(shù)：
：siRNA和RNA干擾RNA干擾(RNAi)是涉及雙鏈(ds)RNA-依賴的基因特異性轉(zhuǎn)錄后沉默的現(xiàn)象。由于存在響應(yīng)于長鏈dsRNA分子激活的主動(dòng)的、非特異性抗病毒防御機(jī)制，研究該現(xiàn)象和實(shí)驗(yàn)性操作哺乳動(dòng)物細(xì)胞的最初嘗試均以失敗告終(Gil等人ApOptOSiS，2000.5107-114)。隨后發(fā)現(xiàn)21個(gè)核苷酸RNA的合成雙鏈體可在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中介導(dǎo)基因特異性RNAi，而不刺激通用抗病毒防御機(jī)制。(參見Elbashir等人Nature2001，411:494_498和Caplen等人PNASUSA2001，98:9742-9747)。因此，小干擾RNA(siRNA)已成為嘗試?yán)斫饣蚬δ艿挠辛ぞ摺NA干擾(RNAi)在哺乳動(dòng)物中是由小干擾RNA(siRNA)(Fire等人Nature1998，391806)或微小RNA(miRNA)(Ambros,Nature2004，431(7006):350_355；Bartel,Cell2004，116(2)281-97)介導(dǎo)的。在植物中相應(yīng)的過程通常稱為特異性轉(zhuǎn)錄后基因沉默(PTGS)或RNA沉默，并在真菌中也可稱為壓抑(quelling)。siRNA是下調(diào)或沉默(阻止)其內(nèi)源性(細(xì)胞內(nèi))對應(yīng)物(counterpart)的基因/mRNA表達(dá)的雙鏈RNA或修飾的RNA分子。RNA干擾的機(jī)制在下文詳述。若干研究顯示siRNA療法在哺乳動(dòng)物和人類二者中都是有效的。Bitko等人表明當(dāng)鼻內(nèi)施用時(shí)，針對呼吸道合胞病毒(RSV)核殼體N基因的特異性siRNA分子有效治療小鼠(Nat.Med.2005，11(1):50_55)。討論siRNA療法的近期綜述是可獲得的(Barik等人J.Mol.Med2005，83:764-773;Dallas和Vlassov，Med.Sci.Monitor2006，12(4)RA67-74；Chakraborty,CurrentDrugTargets2007,8(3):469_82;Dykxhoorn等人GeneTherapy2006.13:541_552)。Mucke(IDrugs200710(1):37_41)發(fā)表了目前療法用于治療眼部疾病例如年齡相關(guān)性黃斑變性(AMD)和青光眼的綜述，包括針對各種靶的siRNA。SiRNA結(jié)構(gòu)與已知基因?qū)?yīng)的siRNA的選擇和合成已經(jīng)被廣泛報(bào)道；(參見例如Ui-Tei等人JBiomedBiotech.2006；200665052；Chalk等人BBRC.2004，319(1):264_74；Sioud和Leirdal，Met.MolBiol.；2004，252:457_69;Levenkova等人Bioinform.2004，20(3)430-2；Ui-Tei等人NAR.2004，32(3)936-48)。修飾的siRNA的利用和制備的實(shí)例，參考例如，Braasch等人Biochem.2003，42(26):7967-75，Chiu等人RNA,2003,9(9)1034-48；PCT公布W02004/015107(atugenAG)和WO02/44321(Tuschl等人)。美國專利號5，898，031和6，107，094，教導(dǎo)了化學(xué)合成低聚物。美國專利公布號2005/0080246和2005/0042647分別涉及具有交替基序的低聚化合物和具有化學(xué)修飾的核苷間鍵合的dsRNA化合物。其他修飾已經(jīng)公開。結(jié)果表明5'_磷酸部分的并入增強(qiáng)siRNA在果蠅胚胎中的活性(Boutla等人Curr.Biol.2001，111776-1780)和是人類HeLa細(xì)胞中siRNA功能所必需的(Schwarz等人Mol.Cell，2002，10:537-48)。Amarzguioui等人(NAR，2003，31(2)589-95)顯示siRNA活性取決于2'-0-甲基修飾的位置。Holen等人(NAR.2003,31(9)2401-07)報(bào)道了具有少數(shù)2'-0-甲基修飾核苷的siRNA與野生型相比產(chǎn)生高活性，但隨著2'-0-甲基修飾的核苷數(shù)量的增加其活性降低。Chiu和Rana(RNA.2003,91034-48)教導(dǎo)了相對于未修飾的siRNA，在有義鏈或反義鏈(完全修飾鏈)中并入2'-0-甲基修飾核苷的siRNA活性嚴(yán)重降低。據(jù)報(bào)道在反義鏈5'-末端放置2'-0甲基將嚴(yán)重限制其活性，而在反義鏈3'-末端和有義鏈的兩個(gè)末端的放置則是耐受的(Czauderna等人NAR.2003，31(11):2705-16;W02004/015107)。本發(fā)明提供的分子的優(yōu)勢在于其無毒性和可用于制備用于治療各種疾病的藥物組合物。促凋亡基因促凋亡基因通常定義為在凋亡性細(xì)胞死亡中起作用的基因。本發(fā)明中有用的促凋亡基因的非限制性列表如下腫瘤蛋白P53結(jié)合蛋白2(TP53BP2)；含有富含亮氨酸重復(fù)序歹Il禾口(leucine—richrepeatsanddeathdomaincontaining,LRDD)；ifflIfife^b-245，α多肽(CYBA，p22phoX)；激活轉(zhuǎn)錄因子3(ATF3)；半胱天冬酶2，凋亡相關(guān)半胱氨酸肽酶(CASP2)；NADPH氧化酶3(N0X3)；harakiri,BCL2相互作用蛋白(HRK，BID3)；補(bǔ)體成分1，q子成分結(jié)合蛋白(ClQBP)；BCL2/腺病毒ElB19kDa相互作用蛋白3(BNIP3)；絲裂原活化蛋白激酶8(MAPK8，JNK1)；絲裂原活化蛋白激酶14(MAPK14，p38)；ras相關(guān)C3肉毒桿菌毒素底物1(Rho家族小GTP結(jié)合蛋白RAC1)；糖原合酶激酶3β(GSK3B)；嘌呤能受體Ρ2Χ，配體門控離子通道7(P2RX7)；瞬時(shí)受體電位陽離子通道，亞家族M，成員2(TRPM2)；聚(ADP-核糖)糖原水解酶(poly(ADP-ribose)glycohydrolase，PARG)；CD38分子(CD38)；STEAP家族成員4(STEAP4)；骨形態(tài)發(fā)生蛋白2(BMP2)；間隙連接蛋白，al，43kDa(連接蛋白43，GJA1)；TYRO蛋白酪氨酸激酶結(jié)合蛋白(TYROBP)；結(jié)締組織生長因子(CTGF)；分泌磷蛋白1(骨橋蛋白，SPP1)；ras同源物基因家族，成員A(RHOA)和雙氧化酶1(DU0X1)。轉(zhuǎn)讓給本發(fā)明受讓人的PCT專利申請?zhí)朠CT/IL2007/001278(PCT公布號WO2008/050329)和美國序列號11/978,089涉及上述基因的抑制劑，并通過引用以其整體并入。聽力損失化學(xué)誘導(dǎo)的耳毒性各種治療藥物對聽細(xì)胞和螺旋神經(jīng)節(jié)神經(jīng)元的耳毒性效應(yīng)經(jīng)常是限制它們治療有用性的因素。常用的耳毒性藥物包括廣泛使用的化療藥物順鉬及其類似物、氨基糖苷類抗生素如慶大霉素、奎寧及其類似物、水楊酸及其類似物和環(huán)利尿劑(loop-diuretics)。例如，已知抗細(xì)菌氨基糖苷類如慶大霉素、鏈霉素、卡那霉素、妥布拉霉素等有嚴(yán)重的毒性副作用，特別是耳毒性和腎毒性，這降低了它們作為治療劑的價(jià)值(參見Goodman和Gilman的ThePharmacologicalBasisofTherapeutics(治療劑的藥理學(xué)基礎(chǔ))，第6版，A.GoodmanGilman等人編輯；MacmiIlanPublishingCo.，Inc.，1980.NewYork，第1169-71頁)。因此，耳毒性是公認(rèn)的抗生素施用的劑量限制性副作用。研究表明，每天接受1克超過1周后，4-15%患者發(fā)展可測量的聽力損失，如果繼續(xù)治療，則逐漸惡化并可能導(dǎo)致永久性耳聾。耳毒性也是順鉬的嚴(yán)重的劑量限制性副作用，順鉬是已證明對各種人類癌癥包括睪丸癌、卵巢癌、膀胱癌、頭頸癌有效的鉬配合物。已顯示順鉬(Platinol)損害聽覺系統(tǒng)和前庭系統(tǒng)。水楊酸類，例如阿斯匹林，由于其抗炎、鎮(zhèn)痛、解熱和抗血栓效應(yīng)而成為最常用的治療藥物。不幸的是，它們也有耳毒性的副作用，并可導(dǎo)致耳鳴(“耳中鳴響”)和暫時(shí)性聽力損失。此外，如果長期高劑量使用該藥物，可出現(xiàn)慢性的和不可逆轉(zhuǎn)的聽力損傷。不限于理論，順鉬藥物和其他潛在的耳毒性藥物通過內(nèi)耳組織中細(xì)胞凋亡誘導(dǎo)耳毒性效應(yīng)，尤其是內(nèi)耳毛細(xì)胞(Zhang等人Neuroscience2003,120(1)191-205；Wang^人2003，J.Neuroscience,23(24)=8596-8607)。長期高劑量使用耳毒性藥物會(huì)導(dǎo)致持久性和不可逆轉(zhuǎn)的聽力損傷。哺乳動(dòng)物的聽毛細(xì)胞的只在胚胎發(fā)育時(shí)產(chǎn)生并如果在出生后損失則不可再生。因此，毛細(xì)胞的損失將導(dǎo)致完全的和不可逆轉(zhuǎn)的耳聾。不幸的是，目前沒有有效治療耳蝸使耳聾好轉(zhuǎn)的療法。因此，防止聽毛細(xì)胞死亡的有效治療會(huì)有很大的治療價(jià)值。轉(zhuǎn)讓給本發(fā)明申請人的美國序列號11/655，610涉及治療受試者聽力損傷的方法，所述方法包括給受試者施用包含有效量P53多核苷酸抑制劑和任選地促凋亡基因抑制劑的組合物。老年性耳聾另一種類型的聽力損失是老年性耳聾，它是老年人逐漸發(fā)生的聽力損失。約30-35%年齡介于65-75歲之間的成年人和40-50%年齡在75歲和以上的人經(jīng)歷聽力損失。因此，存在對預(yù)防、降低或治療牽涉內(nèi)耳組織特別是內(nèi)耳毛細(xì)胞的內(nèi)耳疾患和聽力損傷的發(fā)病率和/或嚴(yán)重程度的措施的需要。聲損傷聲損傷是長期暴露于高噪音所導(dǎo)致的聽力損失類型。不希望限于理論，暴露于高噪音導(dǎo)致耳蝸上的毛細(xì)胞敏感性降低。對于更加嚴(yán)重的暴露，損傷可從相鄰支持細(xì)胞的損失發(fā)展到柯替器(organofCorti)的完全破壞。感覺細(xì)胞死亡可導(dǎo)致漸進(jìn)性沃勒變性(ffalleriandegeneration)和初級聽神經(jīng)纖維的損失。因此，存在對預(yù)防、降低或治療化學(xué)毒性導(dǎo)致的疾病或疾患包括內(nèi)耳疾患及聽力損傷、腎損害(腎毒性)和神經(jīng)損傷(神經(jīng)毒性)的發(fā)病率和/或嚴(yán)重程度的措施的需要。急性腎功能衰竭急性腎功能衰竭(ARF)是特征為在數(shù)天內(nèi)發(fā)生腎功能的快速惡化的臨床綜合征。ARF的主要特征是腎小球?yàn)V過率(GFR)突然下降，導(dǎo)致含氮廢物(尿素、肌酐)滯留。在世界范圍內(nèi)，每年每1百萬人中約170-200人發(fā)生嚴(yán)重的ARF?，F(xiàn)今，還沒有對確定的ARF的特異療法。已發(fā)現(xiàn)一些藥物在動(dòng)物模型中改善毒性和缺血性實(shí)驗(yàn)性ARF，如降低的血清肌酐水平，減少的組織學(xué)損害和更快恢復(fù)腎功能所表現(xiàn)的。這些藥物包括抗氧化劑、鈣通道阻滯劑、利尿劑、血管活性物質(zhì)、生長因子、抗炎劑等。然而，當(dāng)這些藥物進(jìn)行臨床試驗(yàn)時(shí)則表現(xiàn)出沒有益處，并且未批準(zhǔn)其對治療ARF有用。大多數(shù)住院的ARF患者中，ARF是由急性腎小管壞死(ATN)引起的，性腎小管壞死由缺血和/或腎毒性損害引起。腎灌注不足是由低血容量休克、心源性休克和感染性休克，由施用血管收縮藥物或腎損傷造成的。腎毒素包括外源性毒素如造影劑和氨基糖苷類以及內(nèi)源性毒素如肌紅蛋白。最近的研究表明，腎組織細(xì)胞凋亡在大多數(shù)人類ARF病例中是突出的。凋亡性細(xì)胞死亡的主要位點(diǎn)是遠(yuǎn)端腎單位。在缺血性損傷的初始階段，肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架的完整性喪失導(dǎo)致上皮扁平，和刷狀緣喪失，焦點(diǎn)細(xì)胞接觸喪失，以及隨后細(xì)胞從深層基底脫離。已經(jīng)建議，凋亡性腎小管細(xì)胞死亡可能比壞死性細(xì)胞死亡更多地預(yù)測功能變化(Komarov等人I"9，Science.285(5434)1733-7；Supavekin等人2OO3,KidneyInt.63(5):1714-24)。綜上所述，目前還沒有預(yù)防和/或治療急性腎功能衰竭的理想治療模式，而且顯然需要為此研發(fā)新化合物。腎移棺移棺物功能延遲移植物功能延遲(Delayedgraftfunction,DGF)是腎移植中手術(shù)后早期最常見的并發(fā)癥，并且導(dǎo)致不理想的移植結(jié)果(Moreso等人^phrol.Dial.Transplant.1999.14(4):930_35)。雖然移植物功能延遲的發(fā)生率和定義在移植中心之間不同，但結(jié)果是不變的并包括延長的住院、其他侵入性程序以及對患者和醫(yī)療保健系統(tǒng)的額外成本。急性移植排斥反應(yīng)急性移植排斥反應(yīng)可分為三類，取決于移植物破壞(graftdestruction)的發(fā)作。超急性排斥是應(yīng)用于極早期移植物破壞通常在最初的48小時(shí)內(nèi)的術(shù)語。急性排斥反應(yīng)在移植后幾天到幾個(gè)月或甚至幾年發(fā)作，并可涉及體液和/或細(xì)胞的機(jī)制。慢性排斥反應(yīng)與慢性同種異體免疫反應(yīng)有關(guān)。青光眼青光眼是世界上引起失明的主要原因之一。它影響了全世界大約6680萬人。每年至少有12，000美國人因這種疾病所致盲(Kahn和Milton，AmJEpidemiol.1980，111(6)769-76)。青光眼的特征是視神經(jīng)頭部的軸突變性，主要是由于升高的眼壓(IOP)。原發(fā)性開角型青光眼(POAG)是青光眼最常見的形式之一，由于小梁網(wǎng)(TM)中房水外流的阻力增力口，造成IOP升高和最終的視神經(jīng)損傷。Mucke(IDrugs2007,10(1):37_41)綜述了目前的療法，包括用于治療眼部疾病例如年齡相關(guān)性黃斑變性(AMD)和青光眼的針對各種靶的SiRNA0急性呼吸窘迫綜合征急性呼吸窘迫綜合征(ARDS)，也稱為呼吸窘迫綜合征(RDS)或成人呼吸窘迫綜合征(相對于嬰兒呼吸窘迫綜合征，IRDS)是對各種形式肺損傷的嚴(yán)重反應(yīng)。其為造成增加通透性的肺水腫的最嚴(yán)重的疾患。ARDS是各種直接和間接損害引起的嚴(yán)重肺部疾病。其特征是肺實(shí)質(zhì)炎癥，該肺實(shí)質(zhì)炎癥導(dǎo)致氣體交換受損與伴隨的炎癥介質(zhì)的全身釋放，所述炎癥介質(zhì)引起炎癥、缺氧，并經(jīng)常導(dǎo)致多器官功能衰竭。這種情況會(huì)危及生命而且往往致命的，通常需要機(jī)械通氣并進(jìn)入加護(hù)病房。急性呼吸窘迫綜合征不太嚴(yán)重的形式稱為急性肺損傷(ALI)。器官移棺后缺血再灌灃損傷缺血再灌注損傷(IRI)是器官同種異體移植物接受者死亡的主要原因之一。重大IRI發(fā)生在從死亡捐贈(zèng)者的每個(gè)器官移植病例和在從活體捐贈(zèng)者的一些器官移植病例。它導(dǎo)致急性排斥反應(yīng)增加和長期同種異體移植功能損害。肺移植是終末期肺部疾病病人的唯一最終治療(definitivetherapy)，在所有固體同種異體移植接受者中存活率差。急件肺移棺排斥反應(yīng)急性同種異體移植排斥反應(yīng)仍然是肺移植中嚴(yán)重的問題，盡管免疫抑制藥物有所進(jìn)展。缺血再灌注(I/R)損傷和缺氧損傷可造成排斥反應(yīng)和最終早期發(fā)病和死亡。脊髓損傷脊髓損傷，是導(dǎo)致感覺和/或運(yùn)動(dòng)喪失的脊髓障礙，也稱為脊髓病。兩種最常見的類型是創(chuàng)傷引起的脊髓損傷和疾病引起的脊髓損傷。創(chuàng)傷常常是由車禍、跌倒、槍擊、潛水事故等引起的?？捎绊懠顾璧募膊“顾杌屹|(zhì)炎、脊柱裂、腫瘤、弗里德賴希共濟(jì)失調(diào)(Friedreich，sataxia)。壓瘡壓瘡(Pressuresore)，通常稱為褥瘡或壓迫性潰瘍，為損壞的皮膚和組織部位。隨著長期受壓，可發(fā)展組織缺血，造成間質(zhì)組織中代謝廢物的積累，造成缺氧和細(xì)胞死亡。這種壓力引起的缺血還導(dǎo)致過度組織缺氧，進(jìn)一步促使細(xì)菌繁殖和組織破壞。年齡相關(guān)性黃斑變性超過65歲的美國人中最佳矯正視力下降的最常見的原因是稱為年齡相關(guān)性黃斑變性(AMD)的視網(wǎng)膜疾患。受AMD影響的眼部區(qū)域是黃斑區(qū)，為視網(wǎng)膜中心的一個(gè)小區(qū)域，主要是感光細(xì)胞組成。隨著AMD的進(jìn)展，該病的特征是尖銳的中央視力的喪失。所謂的“干性”AMD占AMD患者的約85-90%并涉及由于細(xì)胞的整體萎縮所致的眼色素分布改變、光感受器損失和視網(wǎng)膜功能減弱?！皾裥浴盇MD涉及異常脈絡(luò)膜血管增殖導(dǎo)致視網(wǎng)膜下空間形成凝塊或傷痕。因此，“濕性”AMD的發(fā)作是由于神經(jīng)視網(wǎng)膜下方異常脈絡(luò)膜新生血管網(wǎng)絡(luò)的形成(脈絡(luò)膜新生血管形成，CNV)。新形成的血管過度泄漏，導(dǎo)致視網(wǎng)膜下積液和血液積聚導(dǎo)致視敏度損失。最終，隨著包括脈絡(luò)膜和視網(wǎng)膜的大盤狀疤痕的形成，有關(guān)區(qū)域功能性視網(wǎng)膜完全喪失。干性AMD患者可以維持質(zhì)量下降的視力，而濕性AMD常常導(dǎo)致失明(Hamdi禾口Kenney,FrontiersinBioscience,e305_314,May2003)。糖尿病性視網(wǎng)膜病糖尿病性視網(wǎng)膜病變(DR)被認(rèn)為是表現(xiàn)過度的毛細(xì)血管通透性、血管閉合和新血管增殖的視網(wǎng)膜血管病。DR以兩個(gè)階段發(fā)生非增殖階段和增殖階段。在非增殖階段該疾病的特征是視網(wǎng)膜毛細(xì)血管周細(xì)胞喪失、基底膜增厚和微動(dòng)脈瘤的發(fā)展、圓點(diǎn)狀和污點(diǎn)狀出血和硬性滲出物。在增殖階段該疾病的特征是大量新生血管發(fā)生、血管侵入到玻璃體、出血和纖維化隨后的視網(wǎng)膜牽引，視網(wǎng)膜牽引導(dǎo)致視力嚴(yán)重?fù)p傷。轉(zhuǎn)讓給本發(fā)明的受讓人的美國專利號6740738和相關(guān)專利和申請涉及抑制RTP801基因和蛋白質(zhì)用于治療視網(wǎng)膜病變以及其他病變的方法?？谇徽衬ぱ卓谇火つぱ?，也稱為口腔炎，是化學(xué)治療和放射線療法常見和衰弱副作用，其表現(xiàn)為紅斑和口腔和咽喉潰瘍性病變部位疼痛。口腔粘膜炎患者日?；顒?dòng)如吃飯、喝水、吞咽和說話都可能困難或難以做到。姑息性療法包括施用止痛藥和局部清洗。干眼綜合征干眼綜合征是由于潤滑眼睛的淚膜減少所致的常見問題。大多數(shù)干眼病患者會(huì)有不適感，和沒有視力損失；盡管在嚴(yán)重的情況下，角膜可能受到損傷或感染。潤濕滴液(人工眼淚)可用于治療干眼綜合征，潤滑膏可用于更嚴(yán)重的情況。缺血件眼病缺血性視神經(jīng)病變(ION)包括各種視神經(jīng)缺血產(chǎn)生的疾病。根據(jù)定義，ION定義為眼前病變?nèi)绻嬖诩毙砸暽窠?jīng)盤水腫，表明最接近眼球的一部分視神經(jīng)梗死。缺血性視神經(jīng)病變也可是眼后，位于眼球的背后幾厘米。缺血性視神經(jīng)病變通常只發(fā)生在60歲以上的人。多數(shù)病例是非動(dòng)脈炎性和可歸因于視神經(jīng)灌注動(dòng)脈粥樣硬化、糖尿病或高血壓的影響。顳動(dòng)脈炎導(dǎo)致約有5%的病例(動(dòng)脈性ION)。癥狀和體征是突然、部分或完全喪失視力，伴隨著視盤腫脹，而且往往出血。視野缺損可能表現(xiàn)為喪失一半的橫向劃分視野或有中央或中心外(環(huán)繞生理盲點(diǎn))盲點(diǎn)。視力下降緊接著視盤蒼白。更有效治療上述疾病和病癥的療法，將有很大的治療價(jià)值。發(fā)明概述本發(fā)明提供新TP53BP2、LRDD、CYBA、CASP2、N0X3、HRK、RAC1、RH0A和DUOXlsiRNA,以及新的化學(xué)和/或結(jié)構(gòu)修飾的siRNA化合物，以抑制一般基因表達(dá)和特別是哺乳動(dòng)物基因TP53BP2、LRDD、CYBA、ATF3、CASP2、N0X3、HRK、CIQBP、BNIP3、MAPK8、MAPK14、RAC1、GSK3B、P2RX7、TRPM2、PARG、CD38、STEAP4、BMP2、CX43、TYROBP,CTGF,SPPl、RHOA和DUOXl的表達(dá)。(關(guān)于基因的詳情參見以下表A)。進(jìn)一步提供具有有利性質(zhì)并可應(yīng)用于任何靶序列的siRNA，特別是在此公開的siRNA寡核苷酸，的新雙鏈寡核苷酸結(jié)構(gòu)。本發(fā)明所公開的化學(xué)修飾的siRNA基序在制備用于RNA干擾(RNAi)的穩(wěn)定和活性化合物中是有用的。本發(fā)明還提供包括一種或多種所述寡核苷酸的藥物組合物。本發(fā)明進(jìn)一步涉及在需要其的受試者中治療或預(yù)防疾病或病癥的發(fā)病率或嚴(yán)重程度的方法，其中所述疾病或病癥和/或與之相關(guān)的癥狀與靶基因的表達(dá)相關(guān)。在一些實(shí)施方案中所述疾病或病癥選自由聽力損失，急性腎功能衰竭(ARF)，青光眼，急性呼吸窘迫綜合征(ARDS)及其他急性肺和呼吸損傷，肺移植后缺血再灌注損傷，眼缺血病癥，器官移植包括肺、肝臟、心臟、胰腺和腎臟移植，腎毒性和神經(jīng)毒性，脊髓損傷，壓瘡，年齡相關(guān)性黃斑變性(AMD)，干眼綜合征，口腔粘膜炎，缺血性眼神經(jīng)病變(ION)和慢性阻塞性肺病(COPD)組成的組。該方法涉及給需要所述治療的哺乳動(dòng)物施用預(yù)防或治療有效量的一種或多種所述化合物，其抑制或降低至少一種所述基因的表達(dá)或活性。因此，本發(fā)明一方面提供新寡核苷酸序列用于抑制選自LRDD、CYBA、CASP2、N0X3、HRK、RAC1、RH0A和DUOXl的基因，所述基因的mRNA多核苷酸序列分別如SEQIDNOS:1_2、3-5、6、10-11、12、13、24-26、46和47-48所示。表D(D1-D34)提供本發(fā)明的19、21和23-mer有義寡核苷酸和相應(yīng)的反義寡核苷酸。本發(fā)明的另一方面提供用于抑制一般基因表達(dá)或選自TP53BP2、LRDD、CYBA、ATF3、CASP2、N0X3、HRK、CIQBP、BNIP3、MAPK8、MAPK14、RAC1、GSK3B、P2RX7、TRPM2、PARG,CD38、STEAP4、ΒΜΡ2、CX43、TYROBP,CTGF,SPPl、RHOA或DUOXl的基因的基因表達(dá)的化學(xué)和/或結(jié)構(gòu)修飾的核酸化合物。在不同實(shí)施方案中修飾的化合物包含存在于表Β(Β1-Β74)和C(C1-C3)的如SEQIDNOS:97_68654所示的寡核苷酸序列(在美國序列號11/978，089和PCT專利申請?zhí)朠CT/IL2007/001278中公開，在此通過引用整體并入)。在某些實(shí)施方案中，化學(xué)和/或結(jié)構(gòu)修飾的SiRNA化合物包含存在于表D(D1_D34；SEQIDNOS:68，655-87，088)的寡核苷酸序列。本發(fā)明一方面提供化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(A)(A)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'V-(N')y5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中χ和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中Z和Z'中的每一個(gè)可存在或不存在，但是如果存在，則是共價(jià)連接到其所存在的鏈的3'末端的1-5個(gè)連續(xù)核苷酸；其中(N)X的序列包括存在于表D(D1_D34)中的一個(gè)或多個(gè)反義序列。在某些實(shí)施方案中，(N)x和(N')y完全互補(bǔ)。在其他實(shí)施方案中(N)x和(N')y基本上互補(bǔ)。在某些實(shí)施方案中(N)x與靶序列完全互補(bǔ)，在其他實(shí)施方案中(N)x與靶序列基本上互補(bǔ)。根據(jù)某些優(yōu)選實(shí)施方案本發(fā)明提供siRNA化合物，該siRNA化合物包含一個(gè)或多個(gè)修飾的核苷酸，其中修飾的核苷酸在糖基部分、堿基部分或核苷酸間鍵合部分具有修飾。本發(fā)明一方面提供化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(IX)(IX)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'V-(N')γ-z"5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)為可以是未修飾的或修飾的核糖核苷酸或非常規(guī)部分；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'可存在或不存在，但是如果存在，則獨(dú)立地是共價(jià)連接到其所存在的鏈的3'末端的1-5個(gè)連續(xù)核苷酸；其中ζ“可存在或不存在，但是如果存在，則是共價(jià)連接到(N')y的5'末端的加帽部分；其中χ=18至Ij27；其中y=18至Ij27；其中(N)X包含修飾的和未修飾的核糖核苷酸，每個(gè)修飾的核糖核苷酸在其糖基上具有2'-0-甲基，其中在(N)x的3'末端的N是修飾的核糖核苷酸，(N)x包含從3'末端開始的至少5個(gè)交替的修飾的核糖核苷酸和共計(jì)至少9個(gè)修飾的核糖核苷酸，并且每個(gè)剩余的N是未修飾的核糖核苷酸；其中在(N')y中存在至少一個(gè)非常規(guī)部分，該非常規(guī)部分可能是脫堿基核糖部分、脫堿基脫氧核糖部分、修飾的或未修飾的脫氧核糖核苷酸、鏡像核苷酸，和通過2'-5'核苷酸間磷酸鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸；和其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N')y的序列與靶基因編碼的mRNA的序列基本上相同。在一些實(shí)施方案中χ=y=19。在其他實(shí)施方案中χ=y=23。在一些實(shí)施方案中至少一個(gè)非常規(guī)部分存在于(N')y中的位置15、16、17或18。在一些實(shí)施方案中所述非常規(guī)部分選自鏡像核苷酸、脫堿基核糖部分和脫堿基脫氧核糖部分。在一些優(yōu)選實(shí)施方案中所述非常規(guī)部分是鏡像核苷酸，優(yōu)選L-DNA部分。在一些實(shí)施方案中L-DNA部分位于位置17，位置18或位置17和18。在其他實(shí)施方案中所述非常規(guī)部分是脫堿基部分。在不同實(shí)施方案中(N')y包含至少5個(gè)脫堿基核糖部分或脫堿基脫氧核糖部分。在又其他實(shí)施方案中(N')y包含至少5個(gè)脫堿基核糖部分或脫堿基脫氧核糖部分，并且至少1個(gè)&是LNA。在結(jié)構(gòu)(IX)的一些實(shí)施方案中，(N)x包含9個(gè)交替的修飾的核糖核苷酸。在結(jié)構(gòu)(IX)的其他實(shí)施方案中(N)x包含9個(gè)交替的修飾的核糖核苷酸，還包含位于位置2的2'0修飾的核苷酸。在一些實(shí)施方案中(N)x包含位于奇數(shù)位置1、3、5、7、9、11、13、15、17、19的2'0Me修飾的核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中(N)x還包含位于位置2和18中一個(gè)或兩個(gè)位置的2'0Me修飾的核糖核苷酸。在又其他實(shí)施方案中(N)x包含位于位置2、4、6、8、11、13、15、17、19的2'0Me修飾的核糖核苷酸。在不同實(shí)施方案中ζ"存在，并且選自脫堿基核糖部分、脫氧核糖部分、反向脫堿基核糖部分、脫氧核糖部分、C6-氨基-Pi、鏡像核苷酸。本發(fā)明另一方面提供化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(X)(X)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'V-(N')γ-ζ"5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)為可以是未修飾的或修飾的核糖核苷酸或非常規(guī)部分；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'可存在或不存在，但是如果存在，則獨(dú)立地是共價(jià)連接到其所存在的鏈的3'末端的1-5個(gè)連續(xù)核苷酸；其中ζ“可存在或不存在，但是如果存在，則是共價(jià)連接到(N')y的5'末端的加帽部分；其中X=18至Ij27;其中y=18至Ij27;其中(Nx包括修飾的或未修飾的核糖核苷酸，和任選地至少一個(gè)非常規(guī)部分；其中在(N')y中存在至少一個(gè)非常規(guī)部分，該非常規(guī)部分可以是脫堿基核糖部分、脫堿基脫氧核糖部分、修飾的或未修飾的脫氧核糖核苷酸、鏡像核苷酸，和非堿基配對的核苷酸類似物或通過2'-5'核苷酸間磷酸鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸；和其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N')y的序列與靶基因編碼的mRNA的序列基本上相同。在一些實(shí)施方案中χ=y=19。在其他實(shí)施方案中χ=y=23。在一些優(yōu)選實(shí)施方案中(N)x包含修飾的和未修飾的核糖核苷酸，和至少一個(gè)非常規(guī)部分。在不同實(shí)施方案中(N)x包含與所述mRNA互補(bǔ)的少于15個(gè)連續(xù)核苷酸。在一些實(shí)施方案中，位于(N)x的3'末端的N是修飾的核糖核苷酸，并且(N)X包括至少8個(gè)修飾的核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中所述至少8個(gè)修飾的核糖核苷酸中的至少5個(gè)交替開始于3'端。在一些實(shí)施方案中(N)x包含位于位置5、6、7、8、9、10、11、12、13、14或15之一的脫堿基部分。在一些實(shí)施方案中，(N')y中的所述至少一個(gè)非常規(guī)部分位于位置15、16、17或18。在一些優(yōu)選實(shí)施方案中所述非常規(guī)部分選自鏡像核苷酸，優(yōu)選L-DNA部分。在一些實(shí)施方案中L-DNA部分位于位置17，位置18或位置17和18。在其他實(shí)施方案中，(N')y中的所述至少一個(gè)非常規(guī)部分是脫堿基核糖部分或脫堿基脫氧核糖部分。在某些實(shí)施方案中，(N)χ和(N')y之間有少于15個(gè)堿基對。在結(jié)構(gòu)(X)的不同實(shí)施方案中ζ"存在，并且選自脫堿基核糖部分、脫氧核糖部分、反向脫堿基核糖部分、脫氧核糖部分、C6-氨基-Pi、鏡像核苷酸。在另一方面本發(fā)明提供化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(XI)(XI)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'Z'-(N')y-z〃5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)為可以是未修飾的或修飾的核糖核苷酸或非常規(guī)部分；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'可存在或不存在，但是如果存在，則獨(dú)立地是共價(jià)連接到其所存在的鏈的3'末端的1-5個(gè)連續(xù)核苷酸；其中ζ“可存在或不存在，但是如果存在，則是共價(jià)連接到(N')y的5'末端的加帽部分；其中χ=18至Ij27;其中y=18到27;其中(N)X包含修飾的或者未修飾的核糖核苷酸和非常規(guī)部分的組合，任何修飾的核糖核苷酸在其糖基上具有2'-0-甲基；其中(N')y包含修飾的或者未修飾的核糖核苷酸和任選地非常規(guī)部分，任何修飾的核糖核苷酸在其糖基上具有2'OMe；其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N’)y的序列與靶基因編碼的mRNA的序列基本上相同；其中存在與所述mRNA互補(bǔ)的少于15個(gè)連續(xù)核苷酸。在一些實(shí)施方案中χ=y=19。在其他實(shí)施方案中χ=y=23。在一些優(yōu)選實(shí)施方案中所述至少一個(gè)優(yōu)選的非常規(guī)部分存在于(N)x中，并且是脫堿基核糖部分或脫堿基脫氧核糖部分。在其他實(shí)施方案中，所述至少一個(gè)非常規(guī)部分存在于(N)χ,并且是非堿基配對的核苷酸類似物。在不同實(shí)施方案中(N)x包含與所述mRNA互補(bǔ)的少于15個(gè)連續(xù)核苷酸。在不同實(shí)施方案中(N')y包含未修飾的核糖核苷酸。在一些實(shí)施方案中(N)x包含至少5個(gè)脫堿基核糖部分或脫堿基脫氧核糖部分或其組合。在某些實(shí)施方案中(N)x和/或(N')y包含不與(N')y和/或(N)x中相應(yīng)的修飾的或未修飾的核糖核苷酸堿基配對的修飾的核糖核苷酸。結(jié)構(gòu)(IX)，(X)和(XI)基序用于針對哺乳動(dòng)物或非哺乳動(dòng)物基因的任何寡核苷酸對(有義和反義鏈)。在一些實(shí)施方案中哺乳動(dòng)物基因是人類基因。在不同實(shí)施方案中人類基因的mRNA如SEQIDNOS1-41,46-48之一所示。在一些實(shí)施方案中結(jié)構(gòu)(IX)、(X)和(XI)基序與表B(B1-B74)，C(C1_C3C4)和表D(D1-D34)(SEQIDNOS=97-87,178)所示的寡核苷酸對組合使用。在不同實(shí)施方案中本發(fā)明提供有結(jié)構(gòu)(IV)所列的SiRNA(IV)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'V-(N')y5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸，未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'不存在；其中χ=y=19；其中在(N')y中位置15、16、17、18和19的至少一個(gè)位置的核苷酸包含選自以下的核苷酸脫堿基假核苷酸、鏡像核苷酸、脫氧核糖核苷酸和通過2'-5'核苷酸間鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸；其中(N)X包含交替的修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸，每個(gè)修飾的核糖核苷酸經(jīng)修飾使得在其糖基上具有2'-0-甲基，并且位于(N)x的中間位置的核糖核苷酸是修飾的或未修飾的，優(yōu)選地未修飾的；和其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N')y的序列與靶基因的mRNA基本上相同。在結(jié)構(gòu)(IV)的一些實(shí)施方案中，位于(N')y的位置17和18中一個(gè)或兩個(gè)位置的核苷酸包含選自以下的核苷酸脫堿基假核苷酸、鏡像核苷酸和通過2'-5'核苷酸間鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在一些實(shí)施方案中鏡像核苷酸選自L-DNA和L-RNA。在不同實(shí)施方案中鏡像核苷酸是L-DNA。在不同實(shí)施方案中(N')y包含位于位置15的修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自鏡像核苷酸和脫氧核糖核苷酸。在某些實(shí)施方案中(N')y還包含位于位置2的修飾的核苷酸或者假核苷酸，其中假核苷酸可能是脫堿基假核苷酸類似物，并且修飾的核苷酸任選地是鏡像核苷酸。在不同實(shí)施方案中反義鏈(N)x包含位于奇數(shù)位置(從5'到3'；位置1、3、5、7、9、11、13、15、17、19)的2'O-Me修飾的核糖核苷酸。在一些實(shí)施方案中(N)χ還包含位于位置2和18中一個(gè)或兩個(gè)位置的2'O-Me修飾的核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中(N)χ包含在位置2、4、6、8、11、13、15、17、19的2'0Me修飾的核糖核苷酸?？紤]了結(jié)構(gòu)(IV)、(IX)和⑴的其他實(shí)施方案，其中χ=y=21或其中x=y=23；在這些實(shí)施方案中，對上文論述過的(N')y修飾不是在位置17和18而是在21-mer寡核苷酸的位置19和20以及23-mer寡核苷酸的位置21和22；類似地，在位置15、16、17、18或者19的修飾為在21-mer寡核苷酸的位置17、18、19、20或21和23-mer寡核苷酸的位置19、20、21、22、或23。反義鏈上的2'OMe修飾做出類似的調(diào)整。在一些實(shí)施方案中(N)x包含在奇數(shù)位置(5'到3'，21-mer寡核苷酸的位置1、3、5、7、9、12、14、16、18、20[位置11的核苷酸未修飾]和23-mer寡核苷酸的位置1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23[位置12的核苷酸未修飾])的2'OMe修飾的核糖核苷酸。在其他實(shí)施中(N)x包含在21-mer寡核苷酸的位置2、4、6、8、10、12、14、16、18、20[位置11的核苷酸未修飾]和23-mer寡核苷酸的位置2、4、6、8、10、13、15、17、19、21、23[位置12的核苷酸未修飾]的2'OMe修飾的核糖核苷酸。在一些實(shí)施方案中(N')y還包含5'末端加帽核苷酸。在不同實(shí)施方案中末端加帽部分選自脫堿基假核苷酸類似物、反向脫堿基假核苷酸類似物、L-DNA核苷酸和C6-亞胺磷酸酯。結(jié)構(gòu)(IV)基序用于針對哺乳動(dòng)物或非哺乳動(dòng)物基因的任何寡核苷酸對(有義和反義鏈)。在一些實(shí)施方案中哺乳動(dòng)物基因是人類基因。在不同實(shí)施方案中人類基因的mRNA如SEQIDNOS1-41,46-48之一所示。在一些實(shí)施方案中結(jié)構(gòu)(IV)基序與表B(B1-B74)、C(C1_3C4)和表D(D1_D34)(SEQIDNOS=97-87,178)所示的寡核苷酸對組合使用。在其他實(shí)施方案中本發(fā)明提供化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)V5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'V-(N')y5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)選自假核苷酸和核苷酸；其中每個(gè)核苷酸選自未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'不存在；其中χ=18至Ij27;其中y=18至Ij27;其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N')y的序列與靶基因的mRNA基本上相同；其中至少一個(gè)N選自脫堿基假核苷酸、非配對的核苷酸類似物和(N)X的位置中與靶基因mRNA錯(cuò)配的核苷酸，而使(N)χ包含與靶基因mRNA互補(bǔ)的少于15個(gè)連續(xù)核苷酸。在其他實(shí)施方案中本發(fā)明提供雙鏈化合物，該雙鏈化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(VI)(VI)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'V-(N')y5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'不存在；其中χ和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N')y的序列與靶基因的mRNA基本上相同；其中(N)x、(N')y或(N)x和(N')y包含非堿基配對的修飾的核苷酸，而使(N)X和(N')y在雙鏈化合物中形成小于15個(gè)堿基對。在其他實(shí)施方案中本發(fā)明提供化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(VII)(VII)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'V-(N')y5'(有義鏈)其中每個(gè)N是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中每個(gè)N'是選自六元糖核苷酸、七元糖核苷酸、嗎啉代部分、肽核酸及其組合的核苷酸類似物；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'不存在；其中χ和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N')y的序列與靶基因的mRNA基本上相同。在其他實(shí)施方案中本發(fā)明提供化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(VIII)(VIII)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'V-(N')y5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'不存在；其中χ和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中(N)X或(N')y內(nèi)部位置的一個(gè)N或N'，或位于(N)X或(N')y的末端位置的一個(gè)或多個(gè)N或N'包含脫堿基部分或2'修飾的核苷酸；其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N')y的序列與靶基因的mRNA基本上相同。在結(jié)構(gòu)(V)-(VIII)的一些實(shí)施方案中，(N)x包含交替的修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸；每個(gè)修飾的核糖核苷酸經(jīng)修飾使得其糖基上具有2'-0-甲基。在一些實(shí)施方案中位于(N)x中間位置的N是未修飾的。在結(jié)構(gòu)(IV)的一些實(shí)施方案中，(N')y的位置17和18中的一個(gè)或兩個(gè)位置的核苷酸包含選自以下的核苷酸脫堿基假核苷酸、鏡像核苷酸和通過2'-5'核苷酸間鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在一些實(shí)施方案中鏡像核苷酸選自L-DNA和L-RNA。在不同實(shí)施方案中鏡像核苷酸是L-DNA。在不同實(shí)施方案中(N')y包含位于位置15的修飾的核苷酸，其中修飾的核苷酸選自鏡像核苷酸和脫氧核糖核苷酸。在某些實(shí)施方案中(N')y還包含位于位置2的修飾的核苷酸，其中修飾的核苷酸選自鏡像核苷酸和脫堿基假核苷酸類似物。在不同實(shí)施方案中反義鏈(N)x包括位于奇數(shù)位置(5'到3'；位置1、3，5、7、9、11、13、15、17、19)的2'O-Me修飾的核糖核苷酸。在一些實(shí)施方案中(N)x還包含位于位置2和18中的一個(gè)或兩個(gè)位置的2'O-Me修飾的核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中(N)χ包括位于位置2、4、6、8、11、13、15、17、19的2'0Me修飾的核糖核苷酸?？紤]了結(jié)構(gòu)(IV)的其他實(shí)施方案，其中X=y=21或其中χ=y=23；在這些實(shí)施方案中，對上文論述過的(N')y修飾不是在位置17和18而是在21-mer寡核苷酸的位置19和20以及23-mer寡核苷酸的位置21和22；類似地位置15、16、17、18或19的修飾為21-mer寡核苷酸的位置17、18、19、20或21和23-mer寡核苷酸的位置19、20、21、22或23。反義鏈上的2'0Me修飾做類似調(diào)整。在一些實(shí)施方案中(N)x包含在奇數(shù)位置(5'到3'；21-mer寡核苷酸的位置1、3、5、7、9、12、14、16、18、20[位置11的核苷酸未修飾]和23-mer寡核苷酸的位置1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23[位置12的核苷酸未修飾]的2'0Me修飾的核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中(N)x包含在21-mer寡核苷酸的位置2、4、6、8、10、12、14、16、18、20[位置11的核苷酸未修飾]和23-mer寡核苷酸的位置2、4、6、8、10、13、15、17、19、21、23[位置12的核苷酸未修飾]的2'0Me修飾的核糖核苷酸。在一些實(shí)施方案中(N')y還包含5'末端加帽核苷酸。在不同實(shí)施方案中末端加帽部分選自脫堿基假核苷酸類似物、反向脫堿基假核苷酸類似物、L-DNA核苷酸和C6-亞胺磷酸酯。結(jié)構(gòu)(IV)基序用于針對哺乳動(dòng)物或非哺乳動(dòng)物基因的任何寡核苷酸對(有義和反義鏈)。在一些實(shí)施方案中哺乳動(dòng)物基因是人類基因。在不同實(shí)施方案中人類基因的mRNA如SEQIDNOS1-41,46-48之一所示。在一些實(shí)施方案中結(jié)構(gòu)(IV)基序與表B(B1-B74)、C(C1-C4)和表D(D1_D34)中所示的寡核苷酸對組合使用。本發(fā)明的第二方面提供基于本文公開的結(jié)構(gòu)(C)-(H)以及相關(guān)結(jié)構(gòu)(I)-(XI)的化學(xué)和/或結(jié)構(gòu)修飾的siRNA化合物。在不同實(shí)施方案中siRNA化合物基于表B(B1-B74)、表C(C1-C4)和/或表D(D1-D34)所示的有義寡核苷酸和相應(yīng)的反義寡核苷酸中的一個(gè)。本發(fā)明的另一方面提供藥物組合物，其包含有效抑制人類基因表達(dá)的量的本發(fā)明的修飾的或未修飾的化合物和藥學(xué)上可接受的載體，其中該化合物包含存在于表D(D1-D34)的反義序列，(Ν)χ0本發(fā)明又一方面提供藥物組合物，其包含有效抑制人類基因表達(dá)的量一種或多種本發(fā)明的修飾的化合物和藥學(xué)上可接受的載體，其中該化合物包含表ΒΦ1-Β74)或表C(C1-C4)和/或表D(D1-D34)所示的反義序列，(N)x。本發(fā)明另一個(gè)方面涉及給需要治療的受試者治療與基因表達(dá)相關(guān)的疾病或病癥和/或與該疾病或病癥相關(guān)的癥狀的方法，其中所述基因的miRNA多核苷酸序列如SEQIDNOS1-41,46-48中的任一個(gè)所示，所述方法包括給受試者施用治療有效劑量的量的根據(jù)本發(fā)明的siRNA從而治療受試者。更具體地，本發(fā)明提供用于治療患有急性腎功能衰竭(ARF)，聽力損失，青光眼，急性呼吸窘迫綜合征(ARDS)及其他急性肺和呼吸損傷，器官移植包括肺、腎、骨髓、心臟、胰腺、角膜或肝臟移植損傷(例如缺血再灌注損傷)和包括移植物功能延遲(DGF)腎毒性，脊髓損傷，壓瘡，干眼綜合征，口腔粘膜炎，缺血性視神經(jīng)病變(ION)和慢性阻塞性肺病(COPD)的受試者的方法和組合物。本發(fā)明的方法包含給受試者施用抑制基因表達(dá)的一種或多種SiRNA化合物，其中所述基因的mRNA多核苷酸序列如SEQIDNOS:1_41，46-48中的任一個(gè)所示。在此公開的新結(jié)構(gòu)，當(dāng)整合到任何靶基因的反義和相應(yīng)有義核酸序列時(shí)提供siRNA化合物，所述siRNA化合物用于降低靶基因表達(dá)。靶基因是哺乳動(dòng)物或者非哺乳動(dòng)物基因。在特定實(shí)施方案中，靶基因是具有選自SEQIDNOS:1-41，或46-48中的任一個(gè)的mRNA的哺乳動(dòng)物基因。轉(zhuǎn)讓給本發(fā)明的受讓人的PCT公布號W02008/050329中公開了如表B和C所示的有義和相應(yīng)反義核苷酸序列，該公布在此通過引用整體并入。本發(fā)明排除序列和修飾均已知的siRNA化合物。附圖簡述圖IA和IB呈現(xiàn)了19-mersiRNA結(jié)構(gòu)和用本發(fā)明的2‘_0_甲基化化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖2顯示了在有義鏈和反義(AS)鏈上都具有交替甲基化模式的23-mersiRNA化合物的實(shí)例；圖3A和3B呈現(xiàn)了包含2‘-0甲基化單體的23_merCASP2siRNA結(jié)構(gòu)和用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖4A和4B呈現(xiàn)了包含2'-0甲基化單體的23_merCASP2siRNA結(jié)構(gòu)和用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖5A和5B呈現(xiàn)了包含2‘-0甲基化單體的23_merCASP2siRNA結(jié)構(gòu)和用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖6A和6B呈現(xiàn)了包含2'5‘橋接核苷酸的19_merQM5(靶向p53)siRNA結(jié)構(gòu)和用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖7A和7B呈現(xiàn)了包含2'5‘橋接核苷酸的19_merCASP2siRNA結(jié)構(gòu)和用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖8A和8B分別呈現(xiàn)了包含2’5'橋接核苷酸的19_merREDD2和QM5siRNA結(jié)構(gòu)。圖9A和9B呈現(xiàn)了包含2'5'橋接核苷酸(星號)和2'-0甲氧基核糖核苷酸(粗體，下劃線)的組合的19-merQM5siRNA結(jié)構(gòu)，和圖9C-9E顯示了這些化合物的活性。圖IOA和IOB呈現(xiàn)了包含2'5'橋接核苷酸(星號)和2'_0甲氧基核糖核苷酸(粗體，下劃線)的組合的19-merQM5siRNA結(jié)構(gòu)和用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。圖IOC和IOD顯示了血清穩(wěn)定性結(jié)果；圖IlA和IlB呈現(xiàn)了包含2'5‘橋接核苷酸(星號)和2‘_0甲氧基核糖核苷酸(粗體，下劃線)的組合的23-merCASP2siRNA結(jié)構(gòu)，及用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖12A和12B呈現(xiàn)了包含2’5'橋接核苷酸(星號)的23-merCASP2siRNA結(jié)構(gòu)和用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖13A顯示了包含L-DNA核苷酸的QM5siRNA結(jié)構(gòu)；和圖13B顯示了用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖13C顯示了血清穩(wěn)定性，和圖13D顯示了包含L-DNA核苷酸的siRNA與包含交替2'甲氧基模式的siRNA相比的IC50值；圖14A顯示了包含LNA核苷酸的QM5siRNA結(jié)構(gòu)；而圖14B顯示了用這些化合物得到的實(shí)驗(yàn)結(jié)果；圖15顯示了串聯(lián)siRNA化合物的實(shí)例及其血清穩(wěn)定性結(jié)果；圖16顯示了星形(star)siRNA化合物的實(shí)例及其血清穩(wěn)定性結(jié)果；圖17A-17C顯示了包含修飾組合的siRNA化合物的實(shí)例；圖18描述了RNA/DNA嵌合寡核苷酸；圖19A-19D顯示了包含單獨(dú)的或與附加修飾組合的L-DNA基序的寡核苷酸的實(shí)例；圖20描述了在制備根據(jù)本發(fā)明的雙鏈體化合物中有用的另外的寡核苷酸結(jié)構(gòu)；圖21舉例說明了用于本文詳述的各種結(jié)構(gòu)的非堿基配對的核苷酸單體的實(shí)例；圖22提供了本發(fā)明中用作5'加帽結(jié)構(gòu)的C6-氨基-磷酸(C6-氨基-Pi)部分的化學(xué)結(jié)構(gòu)的圖像；圖23提供了用于RNAi的包含根據(jù)本發(fā)明序列和結(jié)構(gòu)基序的化合物表。發(fā)明詳述本發(fā)明總體上涉及下調(diào)各種基因的表達(dá)的化合物，特別地涉及新的小干擾RNA(siRNA)以及這些新siRNA在治療遭受各種醫(yī)學(xué)病癥的受試者中的應(yīng)用。因此，本發(fā)明一方面提供用于抑制選自LRDD、CYBA,CASP2、N0X3、HRK、RACKRHOA和DUOXl的基因的新寡核苷酸序列，所述基因的mRNA多核苷酸序列分別如SEQIDNO:1_2、3-5、6、10-11、12、13、24-26、46和47-48所示。寡核苷酸序列呈現(xiàn)于表D(D1-D34)，其中有義鏈與互補(bǔ)的反義鏈配對。還提供了在針對任何靶基因的siRNA的制備中有用的新結(jié)構(gòu)基序。表B(B1-B74)、C(C1-C4)和D(D1_D34)提供了本發(fā)明使用的優(yōu)選siRNA的列表。對于每個(gè)基因有19-mer，21-mer和23-mer序列的獨(dú)立表，所述序列基于它們在專有性算法中作為靶向人類基因表達(dá)的最佳序列的得分按優(yōu)先次序列出。在此詳細(xì)討論了抑制本發(fā)明基因的分子和組合物，并且所述分子和/或組合物的任一個(gè)可有益地用于遭受所述病癥的任一種的受試者的治療。本發(fā)明的siRNA化合物具有可例如增強(qiáng)活性，增加穩(wěn)定性，和/或最小化毒性的結(jié)構(gòu)和修飾；本發(fā)明的新修飾siRNAs有益地應(yīng)用于在預(yù)防或削弱靶基因表達(dá)中有用的雙鏈RNA,特別地是此處論述的靶基因。在下面的表A中呈現(xiàn)了某些靶基因和優(yōu)選的適應(yīng)癥的詳情。表A本發(fā)明的靶基因<table>tableseeoriginaldocumentpage21</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage22</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage23</column></row><table>ARDS急性呼吸窘迫綜合征；AMD年齡相關(guān)性黃斑變性；C0PD慢性阻塞性肺??；ARF急性腎功能衰竭；SCI脊髓損傷；ION缺血性眼神經(jīng)病變.表A提供如SEQIDNO:1_48所示mRNA的多核苷酸序列的gi(Genelnfoidentifier，基因信息標(biāo)識符)和登錄號。相應(yīng)多肽如SEQIDN0:49_96所示。下面詳述前面表A所列的基因(1)腫瘤蛋白p53結(jié)合蛋白，2(TP53BP2)基因別名:BBP；53BP2；ASPP2；p53BP2；PPP1R13A,AI746547,X98550。該基因編碼p53相互作用蛋白的ASPP(p53凋亡刺激蛋白)家族成員。相應(yīng)的蛋白含有參與蛋白_蛋白相互作用的4個(gè)錨蛋白重復(fù)序列和1個(gè)SH3結(jié)構(gòu)域。該蛋白定位于細(xì)胞質(zhì)核周區(qū)域，并且通過與其他調(diào)節(jié)分子包括P53家庭成員相互作用來調(diào)節(jié)凋亡和細(xì)胞生長。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)編碼不同同種型的該基因的多個(gè)轉(zhuǎn)錄變體。人TP53BP2miRNA轉(zhuǎn)錄變體1和2的多核苷酸序列分別是SEQIDN0S:1和2，并且其相應(yīng)的多肽序列分別如SEQIDN0S49-50所示。(2)含有富含亮氨酸重復(fù)序列和死亡結(jié)構(gòu)域(LRDD)基因別名PIDD；MGC16925；DKFZp434D229,120001lD09Rik，AU042446該基因編碼的蛋白含有富含亮氨酸重復(fù)序列和死亡結(jié)構(gòu)域(阿丄eucine-richrepeatandadeathdomain，LRDD)。已證明該蛋白與其他死亡結(jié)構(gòu)域蛋白相互作用，如經(jīng)由死亡結(jié)構(gòu)域與Fas(TNFRSF6)締合的(Fas(TNFRSF6)-associatedviadeathdomain，F(xiàn)ADD)和含有激活MAP-激酶的死亡結(jié)構(gòu)域蛋白(MAP-kinaseactivatingdeathdomain-containingprotein,MADD)，并因此在細(xì)胞死亡相關(guān)信號過程中可作為接頭蛋白起作用。已發(fā)現(xiàn)該基因的小鼠對應(yīng)物的表達(dá)能被腫瘤抑制蛋白P53正向調(diào)節(jié)，并誘導(dǎo)響應(yīng)于DNA損傷的細(xì)胞凋亡，提示該基因作為p53-依賴的細(xì)胞凋亡效應(yīng)物的作用。已報(bào)道了編碼不同同種型的3個(gè)可變剪接轉(zhuǎn)錄變體。人LRDD轉(zhuǎn)錄變體2、1和3的多核苷酸序列分別如SEQIDN0S:3-5所示，其相應(yīng)的多肽序列分別如SEQIDN0S:51_53所示。國際專利公布W001/18037公開了LRDD多核苷酸和多肽序列。國際專利公布TO03/087368教導(dǎo)抑制基因的組合物和方法。(3)細(xì)胞色素b-245，a多肽(CYBA)基因別名細(xì)胞色素b輕鏈；細(xì)胞色素b(558)a-亞基；細(xì)胞色素b，a多肽；黃細(xì)胞色素(flavocytochrome)b-558a多肽；p22_phox。細(xì)胞色素b包含輕鏈(a)和重鏈(0)。該基因編碼輕鏈，a亞基，其已被認(rèn)為是吞噬細(xì)胞殺微生物氧化酶體系的主要組成成分。該基因的突變與常染色體隱性遺傳性慢性肉芽腫病(CGD)有關(guān)，該疾病以激活的吞噬細(xì)胞不能產(chǎn)生超氧化物為特征，這對這些細(xì)胞的殺微生物活性是重要的。人類CYBAmRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO:6所示，并且其相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO54所示。國際專利公布W02005/103297講授了p22phox活性的調(diào)節(jié)。(4)激活轉(zhuǎn)錄因子3(ATF3)基因別名ATF3deltaZip2；ATF3deltaZip2c；ATF3deltaZip3,LRG-21，LRF-IATF3是轉(zhuǎn)錄因子的哺乳動(dòng)物激活轉(zhuǎn)錄因子/cAMP響應(yīng)元件-結(jié)合(CREB)蛋白家族的成員。已發(fā)現(xiàn)該基因的多個(gè)轉(zhuǎn)錄變體，這些變體編碼兩種不同同種型。較長的同種型具有ATF結(jié)合元件，其抑制而不是激活啟動(dòng)子后的轉(zhuǎn)錄。較短的同種型(deltaZip2)沒有亮氨酸拉鏈蛋白_二聚化基序，不能結(jié)合到DNA，推測其通過使抑制性輔因子遠(yuǎn)離啟動(dòng)子來激活轉(zhuǎn)錄?？勺兗艚涌赡茉诎谢蛘{(diào)節(jié)中有生理學(xué)上的重要作用。人類ATF3轉(zhuǎn)錄變體3、1和2的多核苷酸序列分別如SEQIDN0S7-9所示，并且相應(yīng)的多肽序列分別如SEQIDN0S55-57所示。美國專利公布號2003/0125277教導(dǎo)了ATF3的反義。國際專利公布號W02005/103297涉及治療神經(jīng)元疾病的方法。(5)半胱天冬酶2，凋亡相關(guān)半胱氨酸肽酶(神經(jīng)前體細(xì)胞表達(dá)的，發(fā)育下調(diào)2(CASP2)基因別名CASP-2，ICH-1L,ICH-1L/1S，ICH1,NEDD2；ICH-1蛋白酶；NEDD2凋亡調(diào)節(jié)基因；半胱天冬酶2，凋亡相關(guān)半胱氨酸蛋白酶。該基因編碼為半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶(半胱天冬酶)家族成員的蛋白。半胱天冬酶的順序激活在細(xì)胞凋亡的執(zhí)行階段起關(guān)鍵作用。半胱天冬酶作為非活性酶原存在，其經(jīng)過在保守的天冬氨酸殘基上的蛋白酶解加工產(chǎn)生大小二個(gè)亞基，所述二個(gè)亞基通過二聚化形成具有活性的酶。該蛋白的蛋白水解由多種凋亡刺激物誘導(dǎo)。該基因的可變剪接產(chǎn)生編碼不同同種型的多個(gè)轉(zhuǎn)錄變體。人類CASP2轉(zhuǎn)錄變體1和3的多核苷酸序列分別如SEQIDN0S:10-11所示，并且相應(yīng)的多肽序列分別如SEQIDN0S58-59所示。美國專利號6，083，735涉及Casp2的可變剪接產(chǎn)物。美國專利號5，929，042和7，223，856公開了用于神經(jīng)退行性疾患治療的特異性Casp2反義化合物。國際專利公布W002/024720教導(dǎo)了Casp2反義。國際專利公布W002/034201公開了糖尿病性視網(wǎng)膜病的治療方法；W003/05821涉及凋亡相關(guān)基因的抑制；W02004/009797教導(dǎo)了Casp2反義鏈；和W02004/103389涉及防止細(xì)胞死亡的方法。(6)NADPH氧化酶3(N0X3)基因別名GP91-3，MGC124289,het,nmf250；NADPH氧化酶催化亞基-樣3，NADPH氧化酶1；head-tiltNADPH氧化酶，如N0X3，是在許多細(xì)胞類型中被發(fā)現(xiàn)的質(zhì)膜相關(guān)酶。這些酶利用NADPH作為電子供體通過氧的1-電子還原催化超氧化物的產(chǎn)生。人類NOX3mRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO12所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO:60所示。國際專利公布號W02005/119251涉及治療聽力損失的方法。(7)harakiri，BCL2相互作用蛋白(僅包含BH3結(jié)構(gòu)域)(HRK)基因別名DP5，Bid3；BCL2_相互作用蛋白質(zhì)；凋亡激活因子Hrk；BH3相互作用(與BCL2家族)結(jié)構(gòu)域，凋亡激動(dòng)劑。作為凋亡激活因子，Hrk通過與死亡阻遏蛋白Bcl_2和Bcl_X(L)相互作用調(diào)節(jié)凋亡。除了與BIK的BCL2同源性結(jié)構(gòu)域_3(BH3)相類似的8-氨基酸區(qū)域之外，HRK蛋白質(zhì)與其他BCL2家族成員沒有明顯同源性。HRK經(jīng)BH3結(jié)構(gòu)域與BCL2和BCLXL相互作用，而不與促進(jìn)死亡的BCL2-相關(guān)蛋白BAX、BAK或BCLXS相互作用。HRK與先前報(bào)道的BCL2和BCLXL以相類似的模式定位于胞內(nèi)細(xì)胞器的膜上。人HRKmRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO13所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO61所示。(8)補(bǔ)體成分1，q子成分結(jié)合蛋白(C1QBP)基因別名GC1QBP，HABP1,SF2p32,gClQ-R,gClqR,p32,RP23-83I13.1，AA407365，AA986492，Dllffsul82e,MGC91723，Clq球狀結(jié)構(gòu)域結(jié)合蛋白；透明質(zhì)烷結(jié)合蛋白1；剪接因子SF2-相關(guān)蛋白。人補(bǔ)體子成分Clq與Clr和Cls締合以產(chǎn)生血清補(bǔ)體系統(tǒng)的第一成分。已知該基因編碼的蛋白結(jié)合到Clq分子的球狀頭部，并抑制C1激活。該蛋白還被鑒別為前-mRNA剪接因子SF2的p32亞單位和透明質(zhì)酸-結(jié)合蛋白。人C1QBPmRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO14所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO62所示。(9)BCL2/腺病毒E1B19kD相互作用蛋白3(BNIP3)基因別名NIP3，MGC93043，BCL2/腺病毒E1B19kD_相互作用蛋白3；線粒體產(chǎn)物的BCL2/腺病毒ElB19kDa-相互作用蛋白3核基因。該基因是BCL2/腺病毒E1B19kd_相互作用蛋白(BNIP)家族的成員。它與E1B19kDa蛋白以及BCL2的ElB19kDa_樣序列相互作用，ElB19kDa蛋白負(fù)責(zé)保護(hù)病毒-誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡，BCL2的ElB19kDa-樣序列也是凋亡保護(hù)者。所述基因包含BH3結(jié)構(gòu)域和跨膜結(jié)構(gòu)域，其與促凋亡功能有關(guān)。已知該基因編碼的二聚線粒體蛋白即使在BCL2存在時(shí)也誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。人BNIP3mRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO15所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO63所示。美國專利號5，858，678涉及BNIP3多核苷酸和多肽序列。國際專利公布號TO2004/009780公開了防止缺血誘導(dǎo)的細(xì)胞損傷的方法。(10)絲裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)基因別名JNKJNK1；PRKM8；SAPK1JNK1A2JNK21B1/2JNK1a蛋白激酶；c_JunN-末端激酶1；絲裂原活化蛋白蛋白激酶8轉(zhuǎn)錄變體2；蛋白激酶JNK1；應(yīng)激-激活蛋白激酶JNK1。該基因編碼的蛋白是MAP激酶家族成員。MAP激酶充當(dāng)多種生物化學(xué)信號的集合點(diǎn)，且參與各式各樣的細(xì)胞過程，如增殖、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)和發(fā)育。該激酶由各種細(xì)胞刺激物激活，并靶向特定轉(zhuǎn)錄因子，因此響應(yīng)于細(xì)胞刺激物介導(dǎo)極早期基因表達(dá)。已發(fā)現(xiàn)腫瘤壞死因子-a(TNF-a)對該激酶的激活是腫瘤壞死因子-a誘導(dǎo)的凋亡所需要的。該激酶還參與紫外輻射誘導(dǎo)的凋亡，其被認(rèn)為與細(xì)胞色素c-介導(dǎo)的細(xì)胞死亡路徑有關(guān)。對該基因的小鼠對應(yīng)物的研究提示其在T細(xì)胞增殖、凋亡和分化中的作用。已報(bào)道了4個(gè)編碼不同同種型的可變剪接轉(zhuǎn)錄變體。MAPK8的轉(zhuǎn)錄變體2、1、3和4的多核苷酸序列分別如SEQIDN0S16-19所示，并且相應(yīng)的多肽序列分別如SEQIDNO:64_67所示。國際專利公布TO99/09214和美國專利號5，877，309公開了JNK家族成員的反義。(11)絲裂原激活蛋白激酶14(MAPK14)基因別名CSBP1；CSBP2；CSPB1；EXIP；Mxi2；PRKM14；PRKM15；RK；SAPK2A；p38；P38ALPHA；MGC102436；p38MAPK；CSBP；Exip；Hog；MGC105413；p38Hog；Csaids結(jié)合蛋白；MAP激酶Mxi2；MAX—相互作用蛋白2；細(xì)胞因子抑制性抗炎藥結(jié)合蛋白；p38MAP激酶；p38有絲分裂原激活蛋白激酶；p38aExip；應(yīng)激-激活蛋白激酶2A；tRNA合成酶輔因子p38。該基因編碼的蛋白是MAP激酶家族的成員，其充當(dāng)多種生物化學(xué)信號的集成點(diǎn)，并參與各式各樣的細(xì)胞代謝過程，如增殖、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)和發(fā)育。該激酶由各種環(huán)境應(yīng)激和促炎細(xì)胞因子激活。該激活需要經(jīng)MAP激酶激酶(MKK)對其磷酸化，或經(jīng)其與MAP3K7IP1/TAB1蛋白相互作用引發(fā)其自身磷酸化。該激酶的底物包括轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子ATF2、MEF2C、和MAX,細(xì)胞周期調(diào)節(jié)因子CDC25B，和腫瘤抑制因子p53，這提示其在應(yīng)激相關(guān)轉(zhuǎn)錄和細(xì)胞周期調(diào)節(jié)以及基因毒性應(yīng)激響應(yīng)中的作用。已報(bào)道了該基因編碼不同同種型的4個(gè)可變剪接轉(zhuǎn)錄變體。人MAPK1轉(zhuǎn)錄變體2、4、1和3的多核苷酸序列分別如SEQIDN0S:20_23所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDN0:68-71所示。國際專利公布W02000/59919和W02005/016947和美國專利號6，140，124和6，448，079教導(dǎo)了p38的反義抑制。(12)Ras-相關(guān)C3肉毒桿菌毒素底物1(rho家族，小GTP結(jié)合蛋白Racl；RAC1)基因別名MGC111543，MIG5,TC-25，p21_Racl，遷移-誘導(dǎo)基因5；遷移-誘導(dǎo)蛋白5；ras-相關(guān)C3肉毒桿菌毒素底物1；rho家族，小GTP結(jié)合蛋白Racl，ras-相關(guān)C3肉26毒桿菌毒素底物1(rho家族小GTP結(jié)合蛋白Racl)該基因編碼的蛋白是GTP酶，其屬于小GTP-結(jié)合蛋白的RAS超家族。該超家族的成員調(diào)節(jié)多樣化的細(xì)胞事件，包括控制細(xì)胞生長、重構(gòu)細(xì)胞骨架和激活蛋白激酶。已描述過該基因的若干可變剪接轉(zhuǎn)錄變體，但是這些變體中的一些的全長性質(zhì)還尚未確定。人RAC1轉(zhuǎn)錄變異體lc、lb和1的多核苷酸序列分別如SEQIDN0S:24-26所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO72-74所示。美國專利號6，180，597涉及增加內(nèi)皮細(xì)胞氧化氮合酶水平的rhoGTP酶抑制劑。國際專利公布W001/15739教導(dǎo)了Rho家庭成員的反義調(diào)節(jié)。國際專利公布TO2004/042052教導(dǎo)了抑制TNF-a分泌的方法。(13)糖原合酶激酶30(GSK3B)基因別名7330414F15Rik，8430431H08Rik,C86142,GSK-3，GSK-33，GSK3糖原合酶激酶-3(GSK3)是脯氨酸指導(dǎo)的絲氨酸-蘇氨酸激酶，該酶最初確定為磷酸化和滅活糖原合酶。有兩種同種型，a(GSK3A；MIM606784)和0，顯示出高度氨基酸同源性(Stambolic和Woodgett，BiochemJ.1994303(Pt3):701_4)。GSK3B參與能量代謝、神經(jīng)細(xì)胞發(fā)育、和身體格局形成(Plyte等人，BiocbimBiophysActa.1992.1114(2-3)147-62)。人GSK3BmRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO:27所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO75所示。美國專利號6，323，029涉及GSK3B的反義抑制。(14)嘌呤能受體P2X，配體門控離子通道，7(P2RX7)基因別名MGC20089，P2X7,AI467586；腺苷三磷酸受體；P2X嘌呤受體7；P2X7受體；P2Z受體；嘌呤能受體P2X7。該基因的產(chǎn)物屬于ATP的嘌呤受體家族。該受體具有配體門控離子通道功能，并通過形成能滲透大分子的膜孔引起巨噬細(xì)胞的ATP-依賴性溶解。細(xì)胞質(zhì)中ATP對該核受體的激活可能是可借以將細(xì)胞活動(dòng)與基因表達(dá)改變相偶聯(lián)的機(jī)制。已經(jīng)鑒定可編碼不同的同種型的多種可變剪接變體，盡管一些符合無義介導(dǎo)的降解(NMD)標(biāo)準(zhǔn)。人P2RX7mRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO:28所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO:76所示。(15)瞬時(shí)受體電位陽離子通道，亞族M，成員2(TRPM2)基因另ij名:EREG1,KNP3,LTRPC2,MGC133383,NUDT9H,NUDT9L1,TRPC7,9830168K16Rik，C79133，Trp7，Trrp7；雌激素響應(yīng)元件相關(guān)基因1；長瞬時(shí)受體電位通道2；瞬時(shí)受體電位通道7，瞬時(shí)受體電位陽離子通道，亞族M，成員2(Trpm2)；瞬時(shí)受體電位通道7；瞬時(shí)受體蛋白7。該基因編碼的蛋白是鈣滲透性陽離子通道，其由游離的胞內(nèi)ADP-核糖調(diào)節(jié)。該基因的編碼蛋白通過氧化應(yīng)激激活，并賦予對細(xì)胞死亡的易感性。人TRPM2的多核苷酸序列如SEQIDNO:29所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDN0:77所示。(已發(fā)現(xiàn)該基因的編碼不同同種型S和L的兩種轉(zhuǎn)錄變體。S變體(SEQIDNO30)由于其含有序列錯(cuò)誤并且不存在，所以被NCBI刪除)。(16)聚(ADP-核糖)糖原水解酶(PARG)基因別名PARG99；多聚(ADP-核糖)糖原水解酶PARG是多聚(ADP-核糖)分解代謝的主要酶，是染色體蛋白的可逆共價(jià)-改性劑。發(fā)現(xiàn)該蛋白存在于許多組織中，并且可經(jīng)蛋白水解生成更小的活性產(chǎn)物。人PARGmRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO31所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO79所示。(17)CD38分子(CD38)基因別名T10，Cd38-rsl；ADP-核糖基環(huán)化酶/環(huán)化ADP核糖水解酶；CD38抗原；CD38抗原(p45)；環(huán)化ADP-核糖水解酶。⑶38是廣泛表達(dá)于細(xì)胞和組織，特別是白細(xì)胞中的新多功能胞外酶。⑶38還在細(xì)胞粘著、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和鈣信號中起作用。人CD38mRNA的多核苷酸序列如SEQIDN0:32所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO80所示。(18)STEAP家族成員4(STEAP4)基因別名:DKFZp666D049,FLJ23153,STAMP2,TIARP,TNFAIP9,1110021017Rik,AI481214，dudulin4；六跨膜前列腺蛋白2；腫瘤壞死因子，a-誘導(dǎo)蛋白9;腫瘤壞死-a-誘導(dǎo)的脂肪-相關(guān)蛋白，TNFa-誘導(dǎo)的脂肪相關(guān)蛋白；腫瘤壞死因子，誘導(dǎo)蛋白9。在脂肪組織中由TNF-a和IL_6誘導(dǎo)的膜蛋白。IL_6和腫瘤壞死因子-a在脊髓損傷模型中顯示未調(diào)節(jié)(Ahn等人，BBRC2006348(2):560_70)，并被認(rèn)為促進(jìn)凋亡事件。人STEAP4mRNA的多核苷酸序列如SEQIDN033所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO81所示。(19)骨形態(tài)發(fā)生蛋白2(BMP2)基因別名BMP2A，AI467020,BC069214CR618407,M22489該基因編碼的蛋白屬于轉(zhuǎn)化生長因子(TGFB)超家族。編碼蛋白作為二硫化物_連接的同型二聚體起作用，并誘導(dǎo)骨和軟骨形成。人BMP2mRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO34所示，并且對應(yīng)多肽序列如SEQIDN082所示。共同轉(zhuǎn)讓給本發(fā)明受讓人的國際專利公布號W02005/041857涉及用以治療局部缺血和神經(jīng)系統(tǒng)疾病的BMP抑制。(20)間隙連接蛋白，al，43kDa(連接蛋白43，GJA1)基因別名CX43，DFNB38,GJAL,ODD,0DDD,0D0D,SDTY3,MGC93610,AU042049,AW546267，Cnx43，CX43al，Gja-l，Npml，間隙連接蛋白，a-樣；眼齒指發(fā)育不良(并指III型)，間隙連接蛋白al43kD;間隙連接蛋白，al，43kD，a1連接蛋白。間隙連接蛋白，a1是蛋白質(zhì)連接蛋白基因家族的成員和心臟缺隙連接點(diǎn)的成分，并被認(rèn)為在心臟同步收縮和胚胎發(fā)育中有關(guān)鍵作用。若干調(diào)節(jié)心肌細(xì)胞-細(xì)胞偶聯(lián)的蛋白激酶靶向連接蛋白43。相關(guān)的無內(nèi)含子(intron-less)的連接蛋白43假基因，GJA1P，已被繪制于5號染色體。人GJAlmRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO:35所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO83所示。美國專利7，098，190教導(dǎo)了特別用于治療創(chuàng)傷和脊髓損傷的反義化合物。(21)TYR0蛋白酪氨酸激酶結(jié)合蛋白(TYR0BP)基因別名DAP12，KARAP,PL0SL,Ly83；DNAX-激活蛋白12；殺傷激活受體相關(guān)蛋白。該基因編碼跨膜信號多肽，該多肽在細(xì)胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域中包含免疫受體基于酪氨酸的激活基序(ITAM)。該蛋白可與膜糖蛋白的殺傷_細(xì)胞抑制受體(KIR)家族相關(guān)聯(lián)，并可作為激活信號轉(zhuǎn)導(dǎo)元件。該蛋白可結(jié)合鏈(TCR)相關(guān)蛋白激酶70kDa(ZAP-70)和脾酪氨酸激酶(SYK)，并在信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、骨成型、腦髓鞘形成和炎癥中起作用。該基因內(nèi)的突變已經(jīng)與多囊脂肪膜性骨發(fā)育不良并發(fā)硬化性腦白質(zhì)病(PL0SL)，也稱為Nasu-Hakola病相關(guān)聯(lián)。其推定受體，表達(dá)于骨髓細(xì)胞的觸發(fā)受體2(TREM2)，也引起PL0SL。已鑒定該基因的編碼不同同種型的兩種可變轉(zhuǎn)錄變體。其它可變剪接轉(zhuǎn)錄變體已被描述，但其全長性質(zhì)還沒有被確定。人TYR0BP轉(zhuǎn)錄變體1和2的多核苷酸序列分別如SEQIDNO:36_37所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDN0:84-85所示。(22)結(jié)締組織生長因子(CTGF)基因別名CCN2，HCS24，IGFBP8,MGC102839,N0V2,CTGRP,Fispl2,HCS24,fisp-12,肥大軟骨細(xì)胞_特異蛋白24，胰島素-樣增長因素-結(jié)合蛋白8，F(xiàn)ISP-12蛋白；成纖維細(xì)胞可誘導(dǎo)的分泌蛋白；成纖維細(xì)胞可誘導(dǎo)的分泌蛋白質(zhì)；肥大軟骨細(xì)胞-特異基因產(chǎn)物24。由血管肉皮細(xì)胞分泌的主要結(jié)締組織有絲分裂引誘劑(mitoattractant)。促進(jìn)軟骨細(xì)胞的增殖和分化。人CTGFmRNA的多核苷酸序列如SEQIDN0:38所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO86所示。(23)分泌磷蛋白1(SPP1)基因別名AA960535，AI790405，Apl-1，BNSP,BSPI，Bsp，ETA-1，Eta,OP,Opn,Opnl，Ric，Spp-1，minopontin,0SP；44kDa骨磷蛋白；44kDa骨磷蛋白；骨唾液蛋白I；骨橋蛋白，早期T淋巴細(xì)胞激活1。SSP1是分泌性蛋白，其作為細(xì)胞因子參與增強(qiáng)干擾素和白細(xì)胞介素-12的產(chǎn)生，并降低白細(xì)胞介素-10的產(chǎn)生，導(dǎo)致I型免疫的途經(jīng)中非常重要。人SPP1轉(zhuǎn)錄變體1、2和3的多核苷酸序列分別如SEQIDN0S:39_41所示，并且對應(yīng)多肽序列如SEQID:87_89所示。美國專利號6，458，590和美國專利公布號2004/0142865和2006/0252684涉及骨橋蛋白的抑制。(24)漿膜蛋白4受體(RTN4R)基因別名NGR，N0G0R，NgRl，Nogo-66受體，UNQ330/PR0526；Nogo受體，菜膜蛋白4受體前體。該基因編碼漿膜蛋白4、少突神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞髓磷脂糖蛋白和髓磷脂-相關(guān)糖蛋白的受體。該受體介導(dǎo)軸突生長抑制，并可在調(diào)節(jié)成人中樞神經(jīng)系統(tǒng)中的軸突再生和可塑性中起作用。人RTN4RmRNA的多核苷酸序列如SEQIDNO:42所示，并且相應(yīng)的多肽序列如SEQIDNO90所示。(25)膜聯(lián)蛋白A2(ANXA2)基因別名ANX2，ANX2L4,CAL1H,LIP2,LPC2,LPC2D,P36,PAP-IV，膜聯(lián)蛋白II，依鈣結(jié)合蛋白I重鏈多肽；嗜鉻粒結(jié)合蛋白8；脂皮質(zhì)蛋白II；胎盤抗凝蛋白IV。該基因編碼膜聯(lián)蛋白家族成員。此鈣_依賴性磷脂_結(jié)合蛋白家族的成員在調(diào)節(jié)細(xì)胞生長和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中起作用。該蛋白用作自泌因子，其增強(qiáng)破骨細(xì)胞形成和骨吸收。該基因有分別位于染色體4、9和10的3個(gè)假基因。已發(fā)現(xiàn)該基因編碼不同同種型的多個(gè)可變剪接轉(zhuǎn)錄變體。人ANXA2轉(zhuǎn)錄變體1、3和2的多核苷酸序列如SEQIDN0S43-45所示，且對應(yīng)多肽序列如SEQIDN0S91-93所示。29(26)ras同源基因家族，成員A(RHOA)基因別名ARH12，ARHA，RH012,RH0H12，雨虎屬(Aplysia)ras-相關(guān)同系物12；致癌基因RH0H12；小GTP結(jié)合蛋白RhoA。RHOA是已知在應(yīng)激纖維形成中調(diào)節(jié)肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架的小GTP酶蛋白。其作用于效應(yīng)物蛋白Rho激酶(ROCK)，Rho激酶最終抑制軸突再生。體外研究中用Rho-A拮抗劑C3轉(zhuǎn)移酶增強(qiáng)在髓磷脂基質(zhì)的軸突生長，而體內(nèi)試驗(yàn)并沒有效果。人RHOAmRNA的多核苷酸序列如SEQIDN046所示，且對應(yīng)多肽序列如SEQIDNO94所示。(27)雙氧化酶1(DU0X1)基因別名LN0X1，MGC138840，MGC138841，N0XEF1,TH0X1,NADPH甲狀腺氧化酶1；黃素蛋白NADPH氧化酶；煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶。該基因編碼的蛋白是糖蛋白，并且是NADPH氧化酶家族的成員。甲狀腺激素的合成是由位于甲狀腺卵泡細(xì)胞頂膜的蛋白質(zhì)復(fù)合物催化的。該復(fù)合物包含碘轉(zhuǎn)運(yùn)體、甲狀腺過氧化物酶，和含有該編碼蛋白和DU0X2的過氧化物生成系統(tǒng)。該蛋白具有過氧化物酶同源結(jié)構(gòu)域和gp91phox結(jié)構(gòu)域。已描述了該基因編碼相同蛋白的兩種可變剪接轉(zhuǎn)錄變體。人DU0X1轉(zhuǎn)錄變體1和2的多核苷酸序列分別如SEQIDN0S:47_48所示，且對應(yīng)多肽序列如SEQIDN0S95-96所示?！按俚蛲龆嚯摹敝溉魏紊鲜鏊谢虬ㄞD(zhuǎn)錄變體、同種型、直系同源物或旁系同源物和類似形式編碼的多肽。根據(jù)本發(fā)明的一方面提供包含未修飾的和修飾的核苷酸的抑制性寡核苷酸化合物。該化合物包含選自由糖修飾、堿基修飾和核苷酸間鍵合修飾組成的組的至少一種修飾的核苷酸，并可含有DNA，和修飾的核苷酸，如LNA(鎖核酸)包括ENA(亞乙基-橋接核酸)、PNA(肽核酸)、阿拉伯糖苷、PACE(磷乙酸及其衍生物)、鏡像核苷酸或具有六元糖類似物(例如己糖或嗎啉)的核苷酸。在一個(gè)實(shí)施方案中該化合物包含至少一個(gè)核糖核苷酸的糖基上的2'修飾。在某些實(shí)施方案中該化合物包含2'0烴基(alkyl)或2'-氟或2'0_烯丙基或任何其它2'糖修飾。任選地在交替位置。優(yōu)選的2'修飾是2'0-甲基(2'甲氧基，2'OMe)。其它穩(wěn)定修飾也是可能的(例如，加到寡聚體3'或5'末端的修飾的核苷酸)。在一些實(shí)施方案中，寡核苷酸的主鏈?zhǔn)切揎椀模姿狨?D-核糖實(shí)體，但還可包含硫代磷酸酯-D-核糖實(shí)體、磷酸二酯L-核糖實(shí)體、三酯、硫酯、2'-5'橋接主鏈(也可稱為5'-2')、PACE修飾的核苷酸間鍵合或任何其它類型的修飾。其它修飾包括寡核苷酸5'和/或3'末端的加成。這樣的末端修飾可以是脂質(zhì)、肽、糖或其它分子。本發(fā)明還涉及下調(diào)各種基因表達(dá)的化合物，特別涉及新的小干擾RNA(siRNA)，以及這些新siRNA在各種疾病和醫(yī)學(xué)病癥治療中的用途。需治療的特別疾病和病癥是急性腎功能衰竭(ARF)，聽力損失，青光眼，急性呼吸窘迫綜合征(ARDS)及其他急性肺和呼吸損傷，器官移植包括肺、腎、骨髓、心臟、胰腺、角膜或肝臟移植中的損傷(例如缺血再灌注損傷)，眼缺血病癥，器官移植腎毒性，脊髓損傷，壓瘡，眼干綜合征，口腔粘膜炎，I0N和慢性阻塞性肺病(C0PD)。本發(fā)明所用的優(yōu)選siRNA列表提供于表B(B1-B74)、表C(C1-C4)和表D(D1-D34)30中。對于每個(gè)基因有一個(gè)單獨(dú)的19-mer，21-mer和23-mer序列的列表，以其在專有算法中的得分為基準(zhǔn)，按靶向人基因表達(dá)的最佳序列優(yōu)先次序列出。21-或23-mersiRNA序列也通過此處公開的19-mer序列在5‘和/或3‘延伸得到。該延伸優(yōu)選與相應(yīng)mRNA序列互補(bǔ)。某些23-mer寡聚體通過如下方法設(shè)計(jì)該方法的優(yōu)先化次序是相應(yīng)19-mer的次序。結(jié)構(gòu)基序根據(jù)本發(fā)明siRNA化合物是根據(jù)在結(jié)構(gòu)(A)-(H)中所列的修飾之一化學(xué)和/或結(jié)構(gòu)修飾的或是串聯(lián)siRNA或RNAstar。本發(fā)明一個(gè)方面提供有如結(jié)構(gòu)(A)所列的化合物(A)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'V-(N')y5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)x和N)y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中x和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中Z和Z'中的每一個(gè)可存在或不存在，但是如果存在，則是共價(jià)連接到其所存在的鏈的3'末端的1-5個(gè)連續(xù)核苷酸；和其中(N)x的序列如表D(D1_D34)中的任一個(gè)所示；并以(N)x和(N')y中的每一個(gè)不包含超過50%的未修飾的脫氧核糖核苷酸或修飾的脫氧核糖核苷酸為條件。本發(fā)明優(yōu)選的反義序列是針對TP53BP2、LRDD、CYBA、CASP2、N0X3、HRK、RAC1、RH0A和DU0X1的新siRNA化合物，所述基因的mRNA多核苷酸序列分別如SEQIDNO:1_2、3_5、6、10-11、12、13、24-26、46和47-48所示。在某些實(shí)施方案中，本發(fā)明提供了具有結(jié)構(gòu)B的化合物(在表D的兩條鏈上具有交替的2'-0-甲基修飾的結(jié)構(gòu))(B)5'(N)x3'反義鏈3'(N')y5'有義鏈其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)N或N'是通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的未修飾的核糖核苷酸或修飾的核糖核苷酸的寡聚體；其中x和y中的每一個(gè)=19，21或23并且(N)x和(N')y完全互補(bǔ)；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)上的交替核糖核苷酸被修飾以導(dǎo)致核糖核苷酸的糖殘基上2'-0-甲基修飾；其中(N')y的序列與(N)x的序列互補(bǔ)；和其中(N)x的序列存在于表D中的任一表格。在一些實(shí)施方案中(N)x和(N')y中的每一個(gè)在3'和5'末端各自磷酸化或非磷酸化。在本發(fā)明的某些實(shí)施方案中，該化合物在反義鏈和有義鏈兩條鏈上都有交替核苷酸修飾；在某些實(shí)施方案中其中x和y中的每一個(gè)=19或23，(N)x的5'和3'末端的每個(gè)N是修飾的；和31(N')y的5'和3'末端的每個(gè)N'是未修飾的。在某些實(shí)施方案中其中x和y中的每一個(gè)=21，(N)x的5'和3'末端的每個(gè)N是未修飾的；和(N')y的5'和3'末端的每個(gè)N'是修飾的。在特定實(shí)施方案中，當(dāng)x和y=19時(shí)，siRNA被修飾以使2'_0_甲基(2'-OMe)基團(tuán)存在于反義鏈(N)x的第1、3、5、7、9、11、13、15、17和19核苷酸，并據(jù)此同樣修飾，例如，2'-0Me基團(tuán)，存在于有義鏈(N')y的第2、4、6、8、10、12、14、16和18核苷酸。在不同實(shí)施方案中這些特定siRNA化合物的兩個(gè)末端都是平端。siRNA的新結(jié)構(gòu)C_H以下結(jié)構(gòu)基序可用于設(shè)計(jì)siRNA化合物。在一些實(shí)施方案中，本發(fā)明提供具有結(jié)構(gòu)(C)的化合物(C)5'(N)x-Z3'反義鏈3'V-(N')y5'有義鏈其中N和N'中的每一個(gè)是獨(dú)立地選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)核苷酸通過共價(jià)鍵與下一個(gè)核苷酸連接的寡聚體并且x和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中在(N)x中核苷酸是未修飾的或(N)x包含交替的修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸；每個(gè)修飾的核糖核苷酸被修飾以在其糖上有2'-0-甲基并且位于(N)x的中間位置的核糖核苷酸是修飾的或未修飾的優(yōu)選未修飾的；其中(N')y包含未修飾的核糖核苷酸，還包含一個(gè)位于末端或末端倒數(shù)第二位的修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自由以下組成的組鏡像核苷酸，雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基(alkoxy)鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；其中如果(N')y中有多于1個(gè)修飾的核苷酸，修飾的核苷酸可以是連續(xù)的；其中Z和Z'中的每一個(gè)可存在或不存在，但如果存在，則是共價(jià)連接到其所連接的任一寡聚體的3'末端的1-5個(gè)脫氧核糖核苷酸；其中(N')y的序列包含基本上與(N)x互補(bǔ)的序列；并且其中(N)x的序列包含與從基因轉(zhuǎn)錄的mRNA上約18至約40個(gè)連續(xù)核糖核苷酸基本上互補(bǔ)的反義序列。在某些實(shí)施方案中(N)x的序列存在于表A-D中的任一表格。在特定實(shí)施方案中，x=y=19和(N)x中每個(gè)修飾的核糖核苷酸是修飾的因此在其糖基上有2'-0-甲基并且位于(N)x中間的核糖核苷酸是未修飾的。因此，在其中x=19的化合物中，(N)x包含在位置1、3、5、7、9、11、13、15、17和19的2'-0-甲基糖修飾的核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置5的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、8、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置6的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、11、13、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置15的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其32他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置14的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置1、2、3、7、9、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置5的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置1、2、3、5、7、9、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置6的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置1、2、3、5、7、9、11、13、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置15的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置1、2、3、5、7、9、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置14的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、7、9、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置5的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置1、2、4、6、7、9、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置5的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、11、13、14、16、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置15的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置1、2、3、5、7、9、11、13、14、16、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置15的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸例如在位置15。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置7的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置8的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置9的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置10的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置11的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、11、13、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置12的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在其他實(shí)施方案中，(N)x包含在位置2、4、6、8、11、15、17和19的2'0Me修飾的核糖核苷酸，并且還可包含例如在位置13的至少一個(gè)脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在又其他實(shí)施方案中(N)x包含相對于靶基因的至少一個(gè)核苷酸錯(cuò)配。在某些優(yōu)選實(shí)施方案中，(N)x包含在位置5、6或14的單核苷酸錯(cuò)配。在結(jié)構(gòu)(C)的一個(gè)實(shí)施方案中，(N')y的5'和3'末端的任一末端或兩個(gè)末端的至少兩個(gè)核苷酸通過2'-5'磷酸二酯鍵連接。在某些優(yōu)選實(shí)施方案中x=y=19或x=y=23；(N)x中核苷酸交替為修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸，每個(gè)修飾的核糖核苷酸被修飾以在其糖上有2'-0-甲基并且位于(N)x的中間位置的核糖核苷酸是未修飾的；并且(N')y的3'末端的三個(gè)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接(在此如結(jié)構(gòu)I所示)。在其他優(yōu)選實(shí)施方案中，x33=y=19或χ=y=23；(N)χ中核苷酸交替為修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸，每個(gè)修飾的核糖核苷酸被修飾以在其糖上有2'-O-甲基并且位于(N)x的中間位置的核糖核苷酸是未修飾的；并且(N')y的5'末端的四個(gè)連續(xù)核苷酸通過三個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接，在另一實(shí)施方案中，位于(N)y中間位置的另外的核苷酸可在其糖基上用2'-O-甲基修飾。在另一優(yōu)選實(shí)施方案中，(N)x中核苷酸交替為2'-O-甲基修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸，并(N')y的5'末端的四個(gè)連續(xù)核苷酸通過三個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接并且5'末端核苷酸或5'末端的2或3個(gè)連續(xù)核苷酸包含3'-O-甲基修飾。在結(jié)構(gòu)C的某些優(yōu)選實(shí)施方案中，x=y=19并且在(N')y中至少一個(gè)位置包含脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸，優(yōu)選地五個(gè)位置包含脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸。在不同實(shí)施方案中，下列位置包含脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸位置1和16-19，位置15-19，位置1-2和17-19，位置1-3和18-19，位置1-4和19以及位置1-5。(N')y還可包含至少一個(gè)LNA核苷酸。在結(jié)構(gòu)C的某些優(yōu)選實(shí)施方案中，χ=y=19并且在(N')y中至少一個(gè)位置的核苷酸包含鏡像核苷酸、脫氧核糖核苷酸和通過2'-5'核苷酸間鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸；在結(jié)構(gòu)C的某些優(yōu)選實(shí)施方案中，χ=y=19并且(N')y包含鏡像核苷酸。在不同實(shí)施方案中，所述鏡像核苷酸為L-DNA核苷酸。在某些實(shí)施方案中，所述L-DNA是L-脫氧核糖胞苷。在一些實(shí)施方案中(N')y包含在位置18的L-DNA。在其他實(shí)施方案中(N')y包含在位置17和18的L-DNA。在某些實(shí)施方案中(N')y包含在位置2和在位置17和18中的一個(gè)或兩個(gè)位置的L-DNA取代。在某些實(shí)施方案中(N')y還包含5'末端加帽核苷酸例如5'-0-甲基DNA或脫堿基的或反向脫堿基的假核苷酸作為突出端。在又其他實(shí)施方案中(N')y包含相對于靶基因的至少一個(gè)核苷酸錯(cuò)配，在某些優(yōu)選的實(shí)施方案中，(N')y包含在位置6、14或15的單核苷酸錯(cuò)配。在又其他實(shí)施方案中(N')y包含在位置15的DNA和在位置17和18中的一個(gè)或兩個(gè)位置的L-DNA。在該結(jié)構(gòu)中，位置2還可包含L-DNA或脫堿基的假核苷酸。考慮了結(jié)構(gòu)C的其他實(shí)施方案，其中χ=y=21或其中χ=y=23；在這些實(shí)施方案中上述討論的(N')y的修飾不是位于位置15、16、17、18，而是位于21-mer的位置17、18、19、20或23-mer的位置19、20、21、22；類似地，位于位置17和18中的一個(gè)或兩個(gè)位置的修飾位于21-mer的位置19或20中的一個(gè)或兩個(gè)位置和23-mer的位置21或22中的一個(gè)或兩個(gè)位置。19-mer的所有修飾可類似地進(jìn)行調(diào)整以用于21-mer和23-mer。根據(jù)結(jié)構(gòu)(C)的不同實(shí)施方案，(N')y中位于3'末端的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸通過2'-5'核苷酸間鍵合連接。在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，(N')y的3'末端的四個(gè)連續(xù)核苷酸通過三個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接，其中形成2'-5'磷酸二酯鍵的2'-5'核苷酸中的一個(gè)或多個(gè)還包含3'-0-甲基糖修飾。優(yōu)選地(N')y的3'末端的核苷酸包含2'-0-甲基糖修飾。在結(jié)構(gòu)C的某些優(yōu)選實(shí)施方案中，χ=y=19并且(N')y中在位置15、16、17、18和19的兩個(gè)或多個(gè)連續(xù)核苷酸包含通過2'-5'核苷酸間鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在不同實(shí)施方案中形成2'-5'核苷酸間鍵的核苷酸包含3'脫氧核糖核苷酸或3'甲氧基核苷酸。在一些實(shí)施方案中位于(N')y位置17和18的核苷酸通過2'核苷酸間鍵連接。在其他實(shí)施方案中(N')y中位于位置16、17、18、16-17、17-18或16-18的核苷酸通過2'-5'核苷酸間鍵連接。在某些實(shí)施方案中(N')y包含位于位置2的L-DNA和位于位置16、17、18、16-17、17-18或16-18的2'核苷酸間鍵。在某些實(shí)施方案中(N')y包含位于位置16、17、18、16-17、17-18或16-18的2'-5'核苷酸間鍵和5'末端加帽核苷酸。根據(jù)結(jié)構(gòu)(C)的不同實(shí)施方案，(N')y中位于任一末端的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸或位于5'和3'末端的每個(gè)末端的2_8個(gè)修飾的核苷酸獨(dú)立地為鏡像核苷酸。在一些實(shí)施方案中所述鏡像核苷酸是L-核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中所述鏡像核苷酸是L-脫氧核糖核苷酸。鏡像核苷酸還可在糖基部分或堿基部分或核苷酸間鍵合上修飾。在結(jié)構(gòu)(C)的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，(N')y的3'末端核苷酸或位于(N')y的3'末端的2或3個(gè)連續(xù)核苷酸是L-脫氧核糖核苷酸。在結(jié)構(gòu)(C)的其他優(yōu)選實(shí)施方案中，(N')y中位于任一末端的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸或5'和3'末端的每個(gè)末端的2_8個(gè)修飾的核苷酸獨(dú)立地是2'-糖基修飾的核苷酸，在一些實(shí)施方案中所述2'_糖基修飾包含氨基酸、氟、烴氧基或烴基(alkyl)部分的存在。在某些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含甲氧基部分(2‘-0Me)。在一系列優(yōu)選實(shí)施方案中，(N')y的5'末端的3、4或5個(gè)連續(xù)核苷酸包含2'_0Me修飾。在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，(N')y的3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸包含2‘_0_甲基修飾。在結(jié)構(gòu)(C)的一些實(shí)施方案中，(N')y中位于任一末端的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸或位于5'和3'末端的每個(gè)末端的2_8個(gè)修飾的核苷酸獨(dú)立地為雙環(huán)核苷酸。在不同實(shí)施方案中所述雙環(huán)核苷酸是鎖核酸(LNA)。2'-0，4'-C-亞乙基橋接核酸(ENA)是LNA種類(參見如下)。在不同實(shí)施方案中，(N')y包含在5'末端或在3'和5'末端的兩端的修飾的核苷酸。在結(jié)構(gòu)(C)的一些實(shí)施方案中，位于(N')y的5'和3'末端的任一末端或兩個(gè)末端的至少兩個(gè)核苷酸通過P-乙氧基主鏈修飾連接。在某些優(yōu)選實(shí)施方案中X=y=19或χ=y=23;(N)x中核苷酸交替為修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸，每個(gè)修飾的核糖核苷酸被修飾以在其糖基有2'-0-甲基并且位于(N)x的中間位置的核糖核苷酸是未修飾的；并且位于(N')y的3'末端或5'末端的四個(gè)連續(xù)核苷酸通過三個(gè)P-乙氧基主鏈修飾連接。在另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，(N')y中位于3'末端或5'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過兩個(gè)P-烴氧基主鏈修飾連接。在結(jié)構(gòu)(C)一些實(shí)施方案中，(N')y中5'和3'末端的每個(gè)末端的2、3、4、5、6、7或8連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地是鏡像核苷酸、通過2'-5'磷酸二酯鍵連接的核苷酸、2'糖修飾的核苷酸或雙環(huán)核苷酸。在一個(gè)實(shí)施方案中，(N')y的5'和3'末端的修飾相同。在一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，(N')y的5'末端的四個(gè)連續(xù)核苷酸通過三個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接和(N')y的3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接。在另一個(gè)實(shí)施方案中，(N')y的5'末端的修飾與(N')y的3'末端的修飾不同。在一個(gè)特定實(shí)施方案中，(N')y的5'末端的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸和(N')y的3'末端的修飾的核苷酸通過2'-5'磷酸二酯鍵連接。在另一個(gè)特定實(shí)施方案中，(N')y的5'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸是LNA核苷酸和(N')y的3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過2‘-5'磷酸二酯鍵連接。(N)x中的核苷酸交替為修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸，每個(gè)修飾的核糖核苷酸被修飾以在其糖基上有2'-O-甲基并且位于(N)x的中間的核糖核苷酸是未修飾的，或(N)x中的核糖核苷酸是未修飾的。在結(jié)構(gòu)(C)的另一個(gè)實(shí)施方案中，本發(fā)明提供化合物，其中x=y=19或x=y=23；(N)x的核苷酸交替為修飾的核糖核苷酸和未修飾的核糖核苷酸，每個(gè)修飾的核糖核苷酸被修飾以在其糖基上有2'-0-甲基并且位于(N)x的中間的核糖核苷酸未被修飾；(N')y的3'末端的三個(gè)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接并且(N')y的5'末端的三個(gè)核苷酸是LNA例如ΕΝΑ。在結(jié)構(gòu)(C)的另一個(gè)實(shí)施方案中，(N')y的5'末端的五個(gè)連續(xù)核苷酸包含2'-0-甲基糖修飾并且(N')y的3'末端的兩個(gè)連續(xù)核苷酸是L-DNA。在又一個(gè)實(shí)施方案中，本發(fā)明提供化合物，其中χ=y=19或χ=y=23;(N)x由未修飾的核糖核苷酸組成；(N')y的3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接并且(N')y的5'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸是LNA例如ΕΝΑ。根據(jù)結(jié)構(gòu)(C)的其他實(shí)施方案，(N')y的5'或3'末端的核苷酸，或任一末端的2、3、4、5或6個(gè)連續(xù)核苷酸或5'和3'末端的每個(gè)末端的1_4個(gè)修飾的核苷酸獨(dú)立地為膦酰基羧酸酯核苷酸或亞膦?；人狨ズ塑账?PACE核苷酸)。在一些實(shí)施方案中PACE核苷酸是脫氧核糖核苷酸。在一些優(yōu)選實(shí)施方案中，(N')y的5'和3'末端的每個(gè)末端的1或2個(gè)連續(xù)核苷酸是PACE核苷酸。美國專利號6，693，187和7，067，641中公開的PACE核苷酸和類似物的實(shí)施例，所述兩個(gè)專利通過弓I用并入。在另外的實(shí)施方案中，本發(fā)明提供具有結(jié)構(gòu)(D)的化合物(D)5'(N)x-Z3'反義鏈3'Z，-(N，)y5'有義鏈其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸或修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)X和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)核苷酸通過共價(jià)鍵與下一個(gè)核苷酸連接的寡聚體并且X和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中在(N)X包含未修飾的核糖核苷酸，還包含一個(gè)位于3'末端或末端倒數(shù)第二位的修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自由以下組成的組雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；其中(N')y包含未修飾的核糖核苷酸，還包含一個(gè)位于5'末端或末端倒數(shù)第二位的修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自由以下組成的組雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；其中在(N)x和(N')y中的每一個(gè)中修飾的和未修飾的核苷酸不是交替的；其中Z和Z'中的每一個(gè)可存在或不存在，但如果存在，則是共價(jià)連接到其所連接的任一寡聚體的3'末端的1-5個(gè)脫氧核糖核苷酸；其中(N')y的序列與(N)x的序列基本上互補(bǔ)；并且其中(N)X的序列包含與從基因轉(zhuǎn)錄的mRNA上約18至約40個(gè)連續(xù)核糖核苷酸具有基本同一性的反義序列。在某些實(shí)施方案中(N)x的序列和互補(bǔ)的(N')y的序列存在于表A-D中的任一表格。在結(jié)構(gòu)⑶的一個(gè)實(shí)施方案中，χ=7=19或乂=7=23;(N)χ包含未修飾的核糖核苷酸，其中3'末端的兩個(gè)連續(xù)核苷酸通過一個(gè)2'-5'核苷酸間鍵合連接；并且(N')y包含未修飾的核糖核苷酸，其中5'末端的兩個(gè)連續(xù)核苷酸通過一個(gè)2'-5'核苷酸間鍵合連接。在一些實(shí)施方案，χ=y=19或χ=y=23；(N)χ包含未修飾的核糖核苷酸，其中3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接在一起；并且(N')y包含未修飾的核糖核苷酸，其中5'末端的四個(gè)連續(xù)核苷酸通過三個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接在一起(在此如結(jié)構(gòu)II所示)。根據(jù)結(jié)構(gòu)(D)的不同實(shí)施方案，起始于(N)x的3'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸和起始于(N')y的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸通過2'-5'核苷酸間鍵合連接。根據(jù)結(jié)構(gòu)(D)的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案，(N')y的5'末端的四個(gè)連續(xù)核苷酸通過三個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接和(N')x的3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接。(N')y的5'末端的三個(gè)核苷酸和(N')x的3'末端的兩個(gè)核苷酸也可以包含3'-0-甲基修飾。根據(jù)結(jié)構(gòu)(D)的不同實(shí)施方案，起始于(N)x的3'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸和起始于(N')y的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地為鏡像核苷酸。在一些實(shí)施方案中所述鏡像核苷酸是L-核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中所述鏡像核苷酸是L-脫氧核糖核苷酸。在結(jié)構(gòu)(D)的其他實(shí)施方案中，起始于(N)x的3'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸和起始于(N')y的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地為2'_糖基修飾的核苷酸。在一些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含氨基、氟、烴氧基或烴基部分的存在。在某些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含甲氧基部分(2‘-0Me)。在結(jié)構(gòu)(D)的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，位于(N')y的5'末端的五個(gè)連續(xù)核苷酸包含2'-0-甲基修飾和位于(N')x的3'末端的五個(gè)連續(xù)核苷酸包含2'-0-甲基修飾。在結(jié)構(gòu)(D)的另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，位于(N')y的5'末端的十個(gè)連續(xù)核苷酸包含2'-0-甲基修飾和位于(N')x的3'末端的五個(gè)連續(xù)核苷酸包含2'-0-甲基修飾，在結(jié)構(gòu)(D)的另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，位于(N')y的5'末端的十三個(gè)連續(xù)核苷酸包含2'-0-甲基修飾和位于(N')x的3'末端的五個(gè)連續(xù)核苷酸包含2'-0-甲基修飾。在結(jié)構(gòu)(D)的一些實(shí)施方案中，(N')y中起始于(N)x的3'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸和起始于(N')y的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地為雙環(huán)核苷酸。在不同實(shí)施方案中所述雙環(huán)核苷酸是鎖核酸(LNA)例如2’-0，4，-C-亞乙基橋接核酸(ENA)。在結(jié)構(gòu)(D)的不同實(shí)施方案中，(N')y包含選自以下的修飾的核苷酸雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P"烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；在結(jié)構(gòu)(D)的不同實(shí)施方案中，(N)X包含選自以下的修飾的核苷酸雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；在其中相同鏈的3'和5'末端的每個(gè)末端包含修飾的核苷酸的實(shí)施方案中，5'和3'末端的修飾是相同的。在另一個(gè)實(shí)施方案中，5'末端的修飾與相同鏈3'末端的修飾不同，在一個(gè)特定實(shí)施方案中，5'末端的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸，且相同鏈3'末端的修飾的核苷酸通過2'-5'磷酸二酯鍵連接。在結(jié)構(gòu)⑶一個(gè)特定實(shí)施方案中，(N')y的5'末端的五個(gè)連續(xù)核苷酸包含2'-0-甲基修飾和(N')y的3'末端的兩個(gè)連續(xù)核苷酸是L-DNA。此外，該化合物還包含(N')x的3'末端五個(gè)連續(xù)的2'-0-甲基修飾的核苷酸。在結(jié)構(gòu)(D)的不同實(shí)施方案中，(N)x中的修飾的核苷酸與(N')y中的修飾的核苷酸不同。例如，(N)x中的修飾的核苷酸是2'-糖基修飾的核苷酸和(N')y中的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸。在另一個(gè)實(shí)例中，(N)x的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸和(N')y的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸。在另一個(gè)實(shí)例中，(N)x的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸和(N')y的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸。在另外的實(shí)施方案中，本發(fā)明提供具有結(jié)構(gòu)(E)的化合物(E)5'(N)x-Z3'反義鏈3'V-(N')y5'有義鏈其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)X和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)核苷酸通過共價(jià)鍵與下一個(gè)核苷酸連接的寡聚體并且X和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中(N)X包含未修飾的核糖核苷酸，還包含一個(gè)位于5'末端或末端倒數(shù)第二位的修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自由以下組成的組雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；其中(N')y包含未修飾的核糖核苷酸，還包含一個(gè)位于3'末端或末端倒數(shù)第二位的修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自由以下組成的組雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；其中在(N)x和(N')y中的每一個(gè)中修飾的和未修飾的核苷酸不是交替的；其中Z和Z'中的每一個(gè)可存在或不存在，但如果存在，則是共價(jià)連接到其所連接的任一寡聚體的3'末端的1-5個(gè)脫氧核糖核苷酸；其中(N')y的序列與(N)X的序列基本上互補(bǔ)；并且其中(N)X的序列包含與從基因轉(zhuǎn)錄的mRNA上約18至約40個(gè)連續(xù)核糖核苷酸具有基本同一性的反義序列。在某些實(shí)施方案中(N)x和互補(bǔ)(N')y的序列存在于表A-D中的任一表格。在某些優(yōu)選實(shí)施方案中(N)X的5'末端的最末端的核苷酸是未修飾的。根據(jù)結(jié)構(gòu)(E)的不同實(shí)施方案，起始于(N)X的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位，優(yōu)選地起始于5'末端倒數(shù)第二位，的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸和起始于(N')y的3'的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸通過2'-5'核苷酸間鍵合連接。根據(jù)結(jié)構(gòu)(E)的不同實(shí)施方案，起始于(N)x的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位，優(yōu)選地起始于5'末端倒數(shù)第二位，的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14連續(xù)核糖核苷酸和起始于(N')y的3'的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地為鏡像核苷酸。在一些實(shí)施方案中所述鏡像核苷酸是L-核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中所述鏡像核苷酸是L-脫氧核糖核苷酸。在結(jié)構(gòu)(E)的其他實(shí)施方案中，起始于(N)X的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位，優(yōu)選起始于5'末端倒數(shù)第二位，的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸和起始于(N')y的3'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地為2'_糖基修飾的核苷酸。在一些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含氨基、氟、烴氧基或烴基部分的存在。在某些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含甲氧基部分(2‘-OMe)。在結(jié)構(gòu)(E)的一些實(shí)施方案中，(N')y中起始于(N)x的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位，優(yōu)選地起始于5‘末端倒數(shù)第二位，的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸和起始于(N')y的3'的末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地為雙環(huán)核苷酸。在不同實(shí)施方案中所述雙環(huán)核苷酸是鎖核酸(LNA)例如2’_0，4’-C-亞乙基橋接核酸(ENA)。在結(jié)構(gòu)(E)的不同實(shí)施方案中，(N')y包含位于3'末端或3'和5'末端的每個(gè)末端的修飾的核苷酸，所述修飾的核苷酸選自雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸或通過P-烴氧基主鏈修飾與相鄰核苷酸連接的核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在結(jié)構(gòu)(E)的不同實(shí)施方案中，(N')y包含位于5'末端或3'和5'末端的每個(gè)末端的修飾的核苷酸，所述修飾的核苷酸選自雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；在其中相同鏈的3'和5'兩個(gè)末端都包含修飾的核苷酸的一個(gè)實(shí)施方案中，5'和3'末端的修飾相同。在另一個(gè)實(shí)施方案中，5'末端的修飾與相同鏈3'末端的修飾不同。在一個(gè)特定實(shí)施方案中，5'末端的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸并且相同鏈3'末端的修飾的核苷酸通過2'-5'磷酸二酯鍵連接。在結(jié)構(gòu)(E)的不同實(shí)施方案中，(N)X的修飾的核苷酸與(N')y的修飾的核苷酸不同。例如，(N)x的修飾的核苷酸是2'-糖基修飾的核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸。在另一個(gè)實(shí)例中，(N)x的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸，在另一個(gè)實(shí)例中，(N)X的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸。在另外的實(shí)施方案中，本發(fā)明提供具有結(jié)構(gòu)式(F)的化合物(F)5'(N)x-Z3'反義鏈3'V-(N')y5'有義鏈其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸和修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)X和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)核苷酸通過共價(jià)鍵與下一個(gè)核苷酸連接的寡聚體并且χ和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中(N)X和(N')y中的每一個(gè)包含未修飾的核糖核苷酸，其中(N)X和(N')y中的每一個(gè)獨(dú)立地包含位于3'末端或末端倒數(shù)第二位的修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自由雙環(huán)核苷酸、2'-糖基修飾的核苷酸、鏡像核苷酸、或通過P-烴氧基主鏈修飾與相鄰核苷酸連接的核苷酸、或通過2'-5'磷酸二酯鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸組成的組；其中在(N)X和(N')y中的每一個(gè)中修飾的和未修飾的核苷酸不是交替的；其中Z和Z'中的每一個(gè)可存在或不存在，但如果存在，則是共價(jià)連接到其所連接的任一寡聚體的3'末端的1-5個(gè)脫氧核糖核苷酸；其中(N')y的序列與(N)X的序列基本上互補(bǔ)；并且其中(N)X的序列包含與從基因轉(zhuǎn)錄的mRNA上約18至約40個(gè)連續(xù)核糖核苷酸具有基本同一性的反義序列。在某些實(shí)施方案中(N)x和互補(bǔ)(N')y的序列存在于表A_D中的任一表格。在結(jié)構(gòu)(F)的一些實(shí)施方案中，χ=y=19或χ=y=23;(N')y包含未修飾的核糖核苷酸，其中3'末端的兩個(gè)連續(xù)核苷酸包含兩個(gè)連續(xù)的鏡像脫氧核糖核苷酸；和(N)χ包含未修飾的核糖核苷酸，其中3'末端的一個(gè)核苷酸包含鏡像脫氧核糖核苷酸(如結(jié)構(gòu)III所示)根據(jù)結(jié)構(gòu)(F)的不同實(shí)施方案，獨(dú)立地起始于(N)x和(N')y的3'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸通過2'-5'核苷酸間鍵合連接。根據(jù)結(jié)構(gòu)(F)的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案，(N')y的3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接和(N')x的3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接。根據(jù)結(jié)構(gòu)(F)的不同實(shí)施方案，獨(dú)立地起始于(N)x和(N')y的3'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸獨(dú)立地為鏡像核苷酸。在一些實(shí)施方案中所述鏡像核苷酸是L-核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中所述鏡像核苷酸是L-脫氧核糖核苷酸。在結(jié)構(gòu)(F)的其他實(shí)施方案中，獨(dú)立地起始于(N)x和(N')y的3'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地是2'-糖基修飾的核苷酸。在一些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含氨基、氟、烴氧基或烴基部分的存在。在某些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含甲氧基部分(2‘-OMe)。在結(jié)構(gòu)(F)的一些實(shí)施方案中，獨(dú)立地起始于(N)x和(N')y的3'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地是雙環(huán)核苷酸。在不同實(shí)施方案中所述雙環(huán)核苷酸是鎖核酸(LNA)例如2’-0，4’-C-亞乙基橋接核酸(ENA)。在結(jié)構(gòu)(F)的不同實(shí)施方案中，(N')y包含位于3'末端或3'和5'兩個(gè)末端的修飾的核苷酸，所述修飾的核苷酸選自雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在結(jié)構(gòu)(F)的不同實(shí)施方案中，(N)x包含位于5'末端或3'和5'末端的每個(gè)末端的修飾的核苷酸，所述修飾的核苷酸選自雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在其中相同鏈的3'和5'末端的每個(gè)末端包含修飾的核苷酸的一個(gè)實(shí)施方案中，5'和3'末端的修飾相同。在另一個(gè)實(shí)施方案中，5'末端的修飾與相同鏈3'末端的修飾不同。在一個(gè)特定實(shí)施方案中，5'末端的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸并且相同鏈3'末端的修飾的核苷酸通過2'-5'磷酸二酯鍵連接。在結(jié)構(gòu)(F)的不同實(shí)施方案中，(N)x的修飾的核苷酸與(N')y的修飾的核苷酸不同。例如，(N)x的修飾的核苷酸是2'-糖基修飾的核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸。在另一個(gè)實(shí)例中，(N)x的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸。在另一個(gè)實(shí)例中，(N)X的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸。在另外的實(shí)施方案中，本發(fā)明提供具有結(jié)構(gòu)(G)的化合物(G)5'(N)x-Z3'反義鏈3'V-(N')y5'有義鏈其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸或修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)X和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)核苷酸通過共價(jià)鍵與下一個(gè)核苷酸連接的寡聚體并且X和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中(N)X和(N')y中的每一個(gè)包含未修飾的核糖核苷酸，其中(N)X和(N')y中的每一個(gè)獨(dú)立地包含一個(gè)位于5'末端或末端倒數(shù)第二位的修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自由雙環(huán)核苷酸、2'-糖基修飾的核苷酸、鏡像核苷酸、或通過P-烴氧基主鏈修飾與相鄰核苷酸連接的核苷酸、或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸組成的組；其中(N)X的修飾的核苷酸優(yōu)選地位于末端倒數(shù)第二位；其中在(N)x和(N')y中的每一個(gè)中修飾的和未修飾的核苷酸不是交替的；其中Z和Z'中的每一個(gè)可存在或不存在，但如果存在，則是共價(jià)連接到其所連接的任一寡聚體的3'末端的1-5個(gè)脫氧核糖核苷酸；其中(N')y的序列與(N)X的序列基本上互補(bǔ)；并且其中(N)X的序列包含與從基因轉(zhuǎn)錄的mRNA上約18至約40個(gè)連續(xù)核糖核苷酸具有基本同一性的反義序列。在某些實(shí)施方案中(N)x和互補(bǔ)(N')y的序列存在于表A-D中的任一表格。在結(jié)構(gòu)(G)的一些實(shí)施方案中，x=y=19或x=y=23。根據(jù)結(jié)構(gòu)(G)的不同實(shí)施方案，獨(dú)立地起始于(N)x和(N')y的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸通過2'-5'核苷酸間鍵合連接。對于(N)x修飾的核苷酸優(yōu)選地起始于5'末端的末端倒數(shù)第二位。根據(jù)結(jié)構(gòu)(G)的不同實(shí)施方案，獨(dú)立地起始于(N)x和(N')y的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸獨(dú)立地是鏡像核苷酸。在一些實(shí)施方案中，所述鏡像核苷酸是L-核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中，所述鏡像核苷酸是L-脫氧核糖核苷酸。對于(N)X，所述修飾的核苷酸優(yōu)選地起始于5'末端的末端倒數(shù)第二位。在結(jié)構(gòu)(G)的其他實(shí)施方案中，獨(dú)立地起始于(N)x和(N')y的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地是2'-糖基修飾的核苷酸。在一些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含氨基、氟、烴氧基或烴基部分的存在。在某些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含甲氧基部分(2‘-OMe)。在一些優(yōu)選實(shí)施方案中連續(xù)的修飾的核苷酸優(yōu)選起始于(N)x的5'末端的末端倒數(shù)第二位。在結(jié)構(gòu)(G)的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，位于(N')y的5'末端的五個(gè)連續(xù)核糖核苷酸包含2'-0-甲基修飾和位于(N')x的5'末端倒數(shù)第二位的一個(gè)核糖核苷酸包含2'-0-甲基修飾。在結(jié)構(gòu)(G)的另一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，位于(N')y的5'末端的五個(gè)連續(xù)核糖核苷酸包含2'-0-甲基修飾和位于(N')x的5'末端的兩個(gè)連續(xù)核糖核苷酸包含2'-0-甲基修飾。在結(jié)構(gòu)(G)的一些實(shí)施方案中，獨(dú)立地起始于(N)x和(N')y的5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸是雙環(huán)核苷酸。在不同實(shí)施方案中所述雙環(huán)核苷酸是鎖核酸(LNA)例如2’-0，4’-C-亞乙基橋接核酸(ΕΝΑ)。在一些優(yōu)選的實(shí)施方案中連續(xù)的修飾的核苷酸優(yōu)選地起始于(N)x的5'末端的末端倒數(shù)第二位。在結(jié)構(gòu)(G)的不同實(shí)施方案中，(N')y包含位于5'末端或3'和5'末端的每個(gè)末端的修飾的核苷酸，所述修飾的核苷酸選自雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在結(jié)構(gòu)(G)的不同實(shí)施方案中，(N)x包含位于5'末端或3'和5'末端的每個(gè)末端的修飾的核苷酸，所述修飾的核苷酸選自雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在其中相同鏈的3'和5'末端的每個(gè)末端包含修飾的核苷酸的一個(gè)實(shí)施方案中，5'和3'末端的修飾相同。在另一個(gè)實(shí)施方案中，5'末端的修飾與相同鏈3'末端的修飾不同。在一個(gè)特定實(shí)施方案中，5'末端的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸并且相同鏈3'末端的修飾的核苷酸通過2'-5'磷酸二酯鍵連接。在結(jié)構(gòu)(G)的不同實(shí)施方案中，(N)x的修飾的核苷酸和(N')y的修飾的核苷酸不同。例如，(N)x的修飾的核苷酸是2'-糖基修飾的核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸。在另一個(gè)實(shí)例中，(N)x的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸。在另一實(shí)例中，(N)x的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸。在另外的實(shí)施方案中，本發(fā)明提供具有結(jié)構(gòu)(H)的化合物(H)5'(N)x-Z3'反義鏈3'V-(N')y5'有義鏈其中N和N'中的每一個(gè)是選自以下的核苷酸未修飾的核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸、未修飾的脫氧核糖核苷酸或修飾的脫氧核糖核苷酸；其中(N)X和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)核苷酸通過共價(jià)鍵與下一個(gè)核苷酸連接的寡聚體并且X和y中的每一個(gè)是介于18和40之間的整數(shù)；其中在(N)X包含未修飾的核糖核苷酸，還包含一個(gè)位于3'末端或末端倒數(shù)第二位的或5'末端或末端倒數(shù)第二位的修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自由以下組成的組雙環(huán)核苷酸，2‘-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；其中(N')y包含未修飾的核糖核苷酸，還包含位于內(nèi)部位置的一個(gè)修飾的核苷酸，其中所述修飾的核苷酸選自由以下的組成的組雙環(huán)核苷酸，2'-糖基修飾的核苷酸，鏡像核苷酸，阿卓糖醇核苷酸，或通過選自2'-5'磷酸二酯鍵、P-烴氧基鍵合或PACE鍵合的核苷酸間鍵合與相鄰核苷酸連接的核苷酸；其中在(N)x和(N')y中的每一個(gè)中修飾的和未修飾的核苷酸不是交替的；其中Z和Z'中的每一個(gè)可存在或不存在，但如果存在，則是共價(jià)連接到其所連接的任一寡聚體的3'末端的1-5個(gè)脫氧核糖核苷酸；其中(N')y的序列與(N)X的序列基本上互補(bǔ)；并且其中(N)X的序列包含與從基因轉(zhuǎn)錄的mRNA上約18至約40個(gè)連續(xù)核糖核苷酸具有基本同一性的反義序列。在某些實(shí)施方案中(N)x和互補(bǔ)(N')y的序列存在于表A-D中的任一表格。在結(jié)構(gòu)(H)的一個(gè)實(shí)施方案中，獨(dú)立地起始于(N)X的3'末端或5'末端或兩個(gè)末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸獨(dú)立地是2'-糖基修飾的核苷酸、雙環(huán)核苷酸、鏡像核苷酸、阿卓糖醇核苷酸或通過2'-5'磷酸二酯鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸，并且(N')y中2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)的內(nèi)部核糖核苷酸獨(dú)立地為2'-糖基修飾的核苷酸、雙環(huán)核苷酸、鏡像核苷酸、阿卓糖醇核苷酸或通過2'-5'磷酸二酯鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在一些實(shí)施方案中所述2'-糖基修飾包含氨基、氟、烴氧基或烴基部分的存在。在某些實(shí)施方案中，所述2'-糖基修飾包含甲氧基部分(2‘-OMe)。在結(jié)構(gòu)(H)的另一個(gè)實(shí)施方案中，獨(dú)立地起始于(N')y的3'末端或5'末端的最末端或末端倒數(shù)第二位的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核糖核苷酸或(N')y的5'和3'末端的每個(gè)末端的2-8個(gè)連續(xù)核苷酸獨(dú)立地是2'-糖基修飾的核苷酸、雙環(huán)核苷酸、鏡像核苷酸、阿卓糖醇核苷酸或通過2'-5'磷酸二酯鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸，并且(N)X的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)的內(nèi)部核糖核苷酸獨(dú)立地為2'-糖基修飾的核苷酸、雙環(huán)核苷酸、鏡像核苷酸、阿卓糖醇核苷酸或通過2'-5'磷酸二酯鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸。在其中相同鏈的3'和5'末端的每個(gè)末端包含修飾的核苷酸的一個(gè)實(shí)施方案中，5'和3'末端的修飾相同。在另一個(gè)實(shí)施方案中，5'末端的修飾與相同鏈3'末端的修飾不同。在一個(gè)特定實(shí)施方案中，5'末端的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸并且相同鏈3'末端的修飾的核苷酸通過2'-5'磷酸二酯鍵連接。在結(jié)構(gòu)(H)的不同實(shí)施方案中，(N)X的修飾的核苷酸與(N')y的修飾的核苷酸不同。例如，(N)x的修飾的核苷酸是2'-糖基修飾的核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸。在另一個(gè)實(shí)例中，(N)x的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸。在另一個(gè)實(shí)例中，(N)X的修飾的核苷酸是通過2'-5'核苷酸間鍵合連接的核苷酸并且(N')y的修飾的核苷酸是鏡像核苷酸。在結(jié)構(gòu)(H)的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案中，x=y=19;(N')y的9-11核苷酸位置9-11的三個(gè)連續(xù)核糖核苷酸包含2'-0-甲基修飾并且(N')x的3'末端的五個(gè)連續(xù)核糖核苷酸包含2'-0-甲基修飾。對于所有上述結(jié)構(gòu)(A)-(H)，在不同實(shí)施方案中x=y并且x和y中的每一個(gè)是19、20、21、22或23。在某些實(shí)施方案中，χ=y=19。在又其他實(shí)施方案中χ=y=23。在另外的實(shí)施方案中該化合物包含位于交替位置的修飾的核糖核苷酸，其中(N)x的5'和3'末端的每個(gè)N是糖殘基修飾的并且中間的核糖核苷酸是未修飾的，例如，19-mer鏈的位置10、21-mer的位置ll、23-mer鏈的位置12的核糖核苷酸。在其中x=y=21或x=y=23的一些實(shí)施方案中，19-mer的修飾位置進(jìn)行調(diào)整以用于21mer和23mer，條件是反義鏈的中間核苷酸優(yōu)選是未修飾的。在一些實(shí)施方案中，(N)x和(N')y都沒有在3'和5'末端磷酸化。在其他實(shí)施方案中(N)x和(N')y的任一個(gè)或兩個(gè)都在3'末端磷酸化。在又一個(gè)實(shí)施方案中，(N)x和(N')y的任一個(gè)或兩個(gè)都使用不可裂解的磷酸基團(tuán)在3'末端磷酸化。在又一個(gè)實(shí)施方案中，(N)x和(N')y的任一個(gè)或兩個(gè)都使用可裂解的磷酸基團(tuán)或不可裂解的磷酸基團(tuán)在末端的2'末端位置磷酸化。這些特殊的siRNA化合物也是平端和末端非磷酸化的；然而，對比實(shí)驗(yàn)表明，在一個(gè)或兩個(gè)3'末端磷酸化的siRNA化合物與非磷酸化的化合物的活性具有相似的體內(nèi)活性。在所有上述結(jié)構(gòu)的某些實(shí)施方案中，該化合物是平端的，例如其中Z和Z'二者都不存在。在可選擇的實(shí)施方案中，該化合物包含至少1個(gè)3'突出端，其中Z或Z'中的至少1個(gè)存在。Z和Z'獨(dú)立地包含一個(gè)或多個(gè)共價(jià)連接的修飾的或未修飾的核苷酸，例如反向抓或(^、(11\11^、鏡像核苷酸和類似核苷酸。在一些實(shí)施方案中Z和Z'中的每一個(gè)獨(dú)立地選自dT和dTdT。其中存在Z和/或Z'的SiRNA與其中不存在Z和Z'的siRNA有相似的活性和穩(wěn)定性。在所有上述結(jié)構(gòu)的某些實(shí)施方案中，該化合物包含一個(gè)或多個(gè)膦酰基羧酸酯和/或亞膦?；人狨ズ塑账?PACE核苷酸)。在一些實(shí)施方案中PACE核苷酸是脫氧核糖核苷酸和膦?；人狨ズ塑账崾庆Ⅴ；姿狨ズ塑账帷Ｃ绹鴮＠?，693，187和7，067，641公開了PACE核苷酸和類似物的實(shí)例，二者在此通過引用并入。在所有上述結(jié)構(gòu)的某些實(shí)施方案中，該化合物包含一個(gè)或多個(gè)鎖核酸(LNA)也稱為橋接核酸或雙環(huán)核酸。優(yōu)選地鎖核酸是2‘-0，4-C-亞乙基核苷(ENA)或T-0，4-C-亞甲基核苷。WO98/39352,WO00/47599和WO99/14226公開了LNA和ENA核苷酸的其他實(shí)施例，其全部在此通過引用并入。在所有上述結(jié)構(gòu)的某些實(shí)施方案中，該化合物包含一個(gè)或多個(gè)阿卓糖醇單體(核苷酸)，也稱為1，5酐-2-脫氧-D-阿卓糖醇-己糖醇(參見例如Allart等入，1998.Nucleosides&Nucleotides171523-1526；Herdewijn^K,1999.Nucleosides&Nucleotides18:1371_1376;Fisher等人，2007，NAR35(4)1064-1074；其全部在此通過引用并入)。本發(fā)明明確地排除N和/或N'中的每一個(gè)是脫氧核糖核苷酸(D-A、D-C、D-G、D-T)的化合物。在某些實(shí)施方案中(N)x和(N')y可獨(dú)立地包含1、2、3、4、5、6、7、8、9或更多個(gè)脫氧核糖核苷酸。在某些實(shí)施方案中本發(fā)明提供化合物，其中每個(gè)N是未修飾的核糖核苷酸并且(N')y的3'末端核苷酸或3'末端的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸是脫氧核糖核苷酸。在又其他的實(shí)施方案中，每個(gè)N是未修飾的核苷酸并且(N')y的5'末端核苷酸或5'末端的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸是脫氧核糖核苷酸。在進(jìn)一步的實(shí)施方案中，(N)x的5'末端核苷酸或5'末端的2、3、4、5、6、7、8或9個(gè)連續(xù)核苷酸和3'末端的1、2、3、4、5或6個(gè)連續(xù)核苷酸是脫氧核糖核苷酸并且每個(gè)N'是未修飾的核糖核苷酸。在又進(jìn)一步的實(shí)施方案中，(N)x包含未修飾的核糖核苷酸和獨(dú)立地位于5'和3'末端的每個(gè)末端的1或2、3或4個(gè)連續(xù)的脫氧核糖核苷酸和內(nèi)部位置的1或2、3、4、5或6個(gè)連續(xù)的脫氧核糖核苷酸，并且每個(gè)N'是未修飾的核糖核苷酸。在某些實(shí)施方案中，(N')y的3'末端核苷酸或3'末端的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸或(N)x的5'末端核苷酸或5'末端的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個(gè)連續(xù)核苷酸是脫氧核糖核苷酸。本發(fā)明的化合物排除其中N和/或N'中的每一個(gè)是脫氧核糖核苷酸的化合物。在一些實(shí)施方案中5'末端核苷酸N或2或3個(gè)連續(xù)的N和1、2、或3個(gè)N'是脫氧核糖核苷酸。美國專利公布2005/0004064和Ui-Tei，2008(NAR36(7):2136_2151)公開了活性DNA/RNAsiRNA嵌合體的某些實(shí)例，其在此通過引用整體并入。除非另有說明，在本文討論的結(jié)構(gòu)的優(yōu)選實(shí)施方案中每個(gè)連續(xù)的N或N'之間的共價(jià)鍵是磷酸二酯鍵。由本發(fā)明提供的另外一種新分子是寡核苷酸，所述寡核苷酸包括連續(xù)的核苷酸，其中該核苷酸的第一區(qū)段編碼第一個(gè)抑制RNA分子，該核苷酸的第二區(qū)段編碼第二個(gè)抑制RNA分子，并且該核苷酸的第三區(qū)段編碼第三個(gè)抑制RNA分子。所述第一區(qū)段、第二區(qū)段和第三區(qū)段中的每一個(gè)可包含雙鏈RNA的一條鏈并且所述第一區(qū)段、第二區(qū)段和第三區(qū)段可通過連接體連接起來。此外，寡核苷酸可包含通過一個(gè)或多個(gè)連接體連接起來的三個(gè)雙鏈區(qū)段。因此，本發(fā)明提供的一種分子是寡核苷酸，所述寡核苷酸包含編碼三個(gè)抑制RNA分子的連續(xù)的核苷酸；所述寡核苷酸可具有三鏈結(jié)構(gòu)，因此三個(gè)雙鏈臂通過一個(gè)或多個(gè)連接體連接起來，例如在上文出現(xiàn)的任何一個(gè)連接體。該分子形成“星”狀結(jié)構(gòu)，并且也可在本文稱為RNAstar。所述三鏈寡核苷酸可能是具有以下整體結(jié)構(gòu)的寡核糖核苷酸5'Oligol(有義)連接體A01igo2(有義)3'3'Oligol(反義)連接體BOligo3(有義)5'3'Oligo3(反義)連接體COligo2(反義)5'或5'Oligol(有義)連接體A01igo2(反義)3'3'Oligol(反義)連接體B01igo3(有義)5'3'01igo3(反義)連接體C01igo2(有義)5'或5'Oligol(有義)連接體AOligo3(反義)3'3'Oligol(反義)連接體B01igo2(有義)5'3'Oligo3(有義)連接體COligo2(反義)3'其中存在連接體A、連接體B或連接體C中的一個(gè)或多個(gè)；兩個(gè)或多個(gè)寡核苷酸和連接體A-C中的一個(gè)或多個(gè)的任何組合是可能的，只要保持鏈的極性和分子的整體結(jié)構(gòu)。此外，如果存在連接體A-C中的兩個(gè)或多個(gè)，其可相同或不同。因此，形成三臂結(jié)構(gòu)，其中每個(gè)臂包含有義鏈和基本上互補(bǔ)的反義鏈(即Oligol反義堿基配對Oligol有義等)。三臂結(jié)構(gòu)可以是三鏈，其使每個(gè)臂具有堿基配對。此外，上述三鏈結(jié)構(gòu)可在一個(gè)或多個(gè)鏈中具有缺口而不是連接體。這種帶有缺口的分子是技術(shù)上四鏈的而非三鏈；插入額外的缺口或切口將導(dǎo)致分子具有額外的鏈。由本發(fā)明的發(fā)明人獲得的初步結(jié)果顯示所述有缺口的分子比類似的但是無缺口的分子在抑制某些靶基因中更具活性。這也可能是有切口的分子的情況。共價(jià)鍵是指連接一個(gè)核苷酸單體到相鄰核苷酸單體的核苷酸間鍵合。共價(jià)鍵包括，例如，磷酸二酯鍵、硫代磷酸酯鍵、P-烴氧基鍵、P-羧基鍵和類似鍵。RNA和DNA正常的核苷酸間鍵合是3'到5'磷酸二酯鍵合。在某些優(yōu)選實(shí)施方案中共價(jià)鍵是磷酸二酯鍵。共價(jià)鍵涵蓋不含磷的核苷酸間鍵合，如尤其是在WO2004/041924中公開的那些。除非另有說明，在本發(fā)明討論的結(jié)構(gòu)的優(yōu)選實(shí)施方案中，每個(gè)連的續(xù)N或N'之間的共價(jià)鍵是磷酸二酯鍵。對于上述所有結(jié)構(gòu)，在一些實(shí)施方案中(N)x的寡核苷酸序列與(N')y的寡核苷酸序列完全互補(bǔ)。在其他實(shí)施方案中(N)x與(N')y基本上互補(bǔ)。在某些實(shí)施方案中(N)χ與靶序列完全互補(bǔ)。在其他實(shí)施方案中(N)x與靶序列基本上互補(bǔ)。定義為了方便起見，在此描述了說明書、實(shí)施例和權(quán)利要求中使用一些術(shù)語。應(yīng)當(dāng)注意的是，除非內(nèi)容明確規(guī)定相反，否則在此作為單數(shù)形式使用的“一個(gè)”、“一種”和“該”包括復(fù)數(shù)形式。本發(fā)明的觀點(diǎn)或?qū)嵤┓桨敢择R庫什群組或其他替代群組的方式來描述，本領(lǐng)域技術(shù)人員將理解，本發(fā)明還可因此以該群組的任何個(gè)體成員或成員子群來描述?！按俚蛲龆嚯摹敝溉魏紊鲜鏊谢虬艚幼凅w、同種型、直系同源物、或旁系同源物和類似形式編碼的多肽?！耙种苿笔悄芙档突虮磉_(dá)或該基因產(chǎn)物活性到足以達(dá)到所需生物學(xué)或者生理效應(yīng)程度的化合物。在此所使用的術(shù)語“抑制劑”指一個(gè)或多個(gè)寡核苷酸抑制劑，包括siRNA,shRNA,miRNA和核酶。抑制也可被稱為下調(diào)，或?qū)τ赗NAi稱為沉默。在此所使用的術(shù)語“抑制”指降低基因表達(dá)或該基因產(chǎn)物活性到足以達(dá)到期望的生物學(xué)或者生理效應(yīng)。抑制可以是完全或部分抑制。在此所使用的術(shù)語“多核苷酸”和“核酸”可互換使用，并指包含脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)的核苷酸序列。該術(shù)語也應(yīng)理解為等同地包含由核苷酸類似物制成的RNA或DNA類似物。貫穿本申請列出mRNA序列以描述相應(yīng)基因的靶標(biāo)。術(shù)語“mRNA多核苷酸序列”和mRNA可互換使用?！肮押塑账帷被颉肮丫垠w”指從約2到約50個(gè)核苷酸的脫氧核糖核苷酸或核糖核苷酸序列。每個(gè)DNA或RNA核苷酸可以獨(dú)立地為天然的或合成的，和/或修飾的或未修飾的。修飾包括糖部分、堿基部分和/或寡核苷酸中核苷酸間鍵合的變化。本發(fā)明的化合物包括含有脫氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、修飾的脫氧核糖核苷酸、修飾的核糖核苷酸及其組合的分子。在此所使用的術(shù)語“非配對的核苷酸類似物”是指包含非堿基配對的部分的核苷酸類似物，該非堿基配對的部分包括但不限于6脫氨基腺苷(水粉蕈素)、4-Me_吲哚、3-硝基吡咯、5-硝基吲哚、Ds、Pa、N3-Me核糖U、N3_Me核糖Τ、N3_MedC、N3-Me_dT、Nl-Me-dG,Nl-Me-dA,N3-乙基-dC、N3_MedC。在一些實(shí)施方案中非堿基配對的核苷酸類似物是核糖核苷酸。在其他實(shí)施方案中非堿基配對核苷酸類似物是脫氧核糖核苷酸。本發(fā)明提供抑制體內(nèi)靶基因表達(dá)的方法和組合物。通常，該方法包括施用寡核糖核苷酸，特別是小干擾RNA(例如siRNA)或是可以在細(xì)胞中產(chǎn)生siRNA的核酸材料，以靶向SEQIDNOS:1-41、46-48中的任一個(gè)所示的mRNA，其以通過RNA干擾機(jī)制足以下調(diào)靶基因表達(dá)的量施用。特別地，該方法用于抑制基因表達(dá)以治療患有與該基因表達(dá)相關(guān)的疾病的受試者。根據(jù)本發(fā)明，靶基因的siRNA分子或抑制劑用作藥物治療以各種病變?！昂塑账帷笔侵赴撗鹾颂呛塑账岷秃颂呛塑账?，其可以是天然的或合成的，和修飾的或未修飾的。修飾包括糖部分、堿基部分和/或核苷酸間鍵合的變化和置換。核苷酸/寡核苷酸的所有類似物或修飾可在本發(fā)明中使用，條件是所述類似物或修飾不顯著不利地影響核苷酸/寡核苷酸的功能?？山邮艿男揎棸ㄌ遣糠值男揎?、堿基部分的修飾、核苷酸間鍵合的修飾和其組合。本發(fā)明中有時(shí)被稱為“脫堿基核苷酸”或“脫堿基核苷酸類似物”的化合物更恰當(dāng)?shù)厥侵讣俸塑账峄蚍浅Ｒ?guī)部分。核苷酸是核酸的單體單元，由核糖或脫氧核糖、磷酸酯、和堿基(在DNA中是腺嘌呤、鳥嘌呤、胸腺嘧啶或胞嘧啶；在RNA中是腺嘌呤、鳥嘌呤、尿嘧啶或胞嘧啶)組成。修飾的核苷酸包括在糖基、磷酸酯和或堿基中的一個(gè)或多個(gè)上的修飾。脫堿基假核苷酸沒有堿基，因此不是嚴(yán)格的核苷酸。在此使用的術(shù)語“加帽部分”包括脫堿基核糖部分、脫堿基脫氧核糖部分、修飾脫堿基核糖和脫堿基脫氧核糖部分包括2'0烴基修飾，反向脫堿基核糖和脫堿基脫氧核糖部分及其修飾；C6-亞氨基-Pi；鏡像核苷酸，包括L-DNA和L-RNA；5'0Me核苷酸；和核苷酸類似物，包括4',5'-亞甲基核苷酸，l-(i3_D-赤呋喃糖基)核苷酸，4'-硫代核苷酸，碳環(huán)核苷酸，磷酸5‘-氨基烴基酯，磷酸1，3-二氨基-2-丙酯，磷酸3-氨基丙酯，磷酸6-氨基己酯，磷酸12-氨基十二烷基酯，磷酸羥丙酯，1,5-失水己糖醇核苷酸，α-核苷酸，蘇-戊呋喃糖基核苷酸，無環(huán)3',4'-開環(huán)核苷酸，3，4-二羥基丁基核苷酸，3，5-二羥基戊基核苷酸，5'-5'-反向脫堿基部分，1，4_丁二醇磷酸，5'-氨基；和橋接或非橋接的甲基膦酸酯和5'-巰基部分。某些優(yōu)選加帽部分是脫堿基核糖或脫堿基脫氧核糖部分，反向脫堿基核糖或者脫堿基脫氧核糖部分，C6-氨基-Pi，包括L-DNA和L-RNA的鏡像核苷酸。圖22所示為C6-氨基磷酸酯5'加帽部分及其與5'末端(N')的連接點(diǎn)的化學(xué)結(jié)構(gòu)。在此使用的術(shù)語“非常規(guī)部分”是指脫堿基核糖部分，脫堿基脫氧核糖部分，脫氧核糖核苷酸，修飾的脫氧核糖核苷酸，鏡像核苷酸，非堿基配對的核苷酸類似物和通過2'-5'核苷酸間磷酸鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸；包括LNA和亞乙基橋接核酸的橋接核酸。脫堿基脫氧核糖部分包括例如脫堿基脫氧核糖-3‘-磷酸酯、1，2-雙脫氧-D-呋喃核糖-3-磷酸酯、1，4-脫水-2-脫氧D-核糖醇-3-磷酸酯。反向脫堿基脫氧核糖部分包括反向脫氧核糖脫堿基、3'，5'反向脫氧脫堿基5'-磷酸酯。鏡像核苷酸包括例如L-DNA(L_脫氧核糖腺苷_3‘-磷酸酯(鏡像dA)、L_脫氧核糖胞苷_3‘-磷酸酯(鏡像dC)、L-脫氧核糖鳥苷_3‘-磷酸酯(鏡像dG)、L-脫氧核糖胸苷_3‘-磷酸酯(鏡像dT))和L-RNA(L-核糖腺苷-3‘-磷酸酯(鏡像rA)、L_核糖胞苷-3‘-磷酸酯(鏡像rC)；L-核糖鳥苷-3‘-磷酸酯(鏡像rG)、L_核糖尿嘧啶_3‘-磷酸酯(鏡像dU))。修飾的脫氧核糖核苷酸包括，例如5‘0MeDNA(5_甲基-脫氧核糖鳥苷_3‘-磷酸酯)其可用作5'末端位置(位置編號1)的核苷酸；PACE(脫氧核糖胸苷3'磷乙酸，脫氧核糖胞苷3'磷乙酸，脫氧核糖鳥苷3'磷乙酸，脫氧核糖胸苷3'磷乙酸。橋接核酸包括LNA(2'-0,4'_C_亞甲基橋接核酸腺苷3‘單磷酸酯，2'_0，4'-C-亞甲基橋接核酸5-甲基-胞苷3'單磷酸酯，2'-0,4'-C-亞甲基橋接核酸鳥苷3'單磷酸酯，5-甲基-尿苷(或胸苷)3'單磷酸酯)；和ENA(2‘-0,4'-C-亞乙基橋接核酸腺苷3'單磷酸'，2'-0,4'-C-亞乙基橋接核酸5-甲基-胞苷3'單磷酸酯，2'-0，4'-C-亞乙基橋接核酸鳥苷3'單磷酸酯，5-甲基-尿苷(或胸苷)3'單磷酸酯)。在本發(fā)明的一些實(shí)施方案中，優(yōu)選的非常規(guī)部分是脫堿基核糖部分、脫堿基脫氧核糖部分、脫氧核糖核苷酸、鏡像核苷酸，和通過2'-5'核苷酸間磷酸鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸。核苷酸選自天然生成或合成的修飾堿基。天然生成堿基包括腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶。核苷酸的修飾堿基包括次肌苷、黃嘌呤、次黃嘌呤、2-氨基腺嘌呤、6-甲基、2-丙基及其他烴基腺嘌呤、5-鹵代尿嘧啶、5-鹵代胞嘧啶、6-氮雜胞嘧啶和6-氮雜胸腺嘧啶、假尿嘧啶、4-硫脲嘧啶、8-鹵代腺嘌呤、8-氨基腺嘌呤、8-巰基腺嘌呤、8-硫烴基腺嘌呤、8-羥基腺嘌呤及其他8-取代腺嘌呤、8-鹵代鳥嘌呤、8-氨基鳥嘌呤、8-巰基鳥嘌呤、8-硫烴基鳥嘌呤、8-羥基鳥嘌呤及其他取代鳥嘌呤、其他氮雜和脫氮腺嘌呤、其他氮雜和脫氮鳥嘌呤、5-三氟甲基尿嘧啶和5-三氟胞嘧啶。本發(fā)明包括脫堿基假核苷酸，和包含交替的RNA和DNA核苷酸的分子。包含修飾的堿基的核苷酸單體，包括脫堿基假核苷酸單體，可取代寡核苷酸的一個(gè)或多個(gè)核糖核苷酸。脫堿基假核苷酸單體可包含于一個(gè)或多個(gè)末端位置或作為5'末端加帽。5'末端加帽也可選自反向脫堿基假核苷酸類似物、L-DNA核苷酸和C6-亞胺磷酸酯。此外，制備了多核苷酸的類似物，其中一個(gè)或多個(gè)核苷酸的結(jié)構(gòu)基本改變并較好地適于用作治療或試驗(yàn)的試劑。核苷酸類似物的實(shí)例是肽核酸(PNA)，其中在DNA(或RNA)的脫氧核糖(或核糖)磷酸酯主鏈包含與多肽中發(fā)現(xiàn)的主鏈相似的聚酰胺主鏈。已證明PNA類似物對酶促降解有抗性，并在體內(nèi)和體外具有延長的壽命。糖殘基上的可能修飾是多樣的，并包括2'-0烴基、鎖核酸(LNA)、乙二醇核酸(GNA)、蘇糖核酸(TNA)、阿拉伯糖苷、阿卓糖醇(ANA)及其他6-元糖包括嗎啉和環(huán)己炔基(cyclohexinyls)。LNA化合物公開于國際專利公布號WO00/47599,WO99/14226，和WO98/39352。包含LNA核苷酸的siRNA化合物的實(shí)例公開于Elmen等人(NAR2005.33(1):439_447)和國際專利公布號WO2004/083430。六元環(huán)核苷酸類似物公開于Allart等人(Nucleosides&Nucleotides,1998，17:1523_1526，和Perez-Perez等人1996，BioorgandMedicinalChemLetters61457-1460)。國際專利申請公布號WO2006/047842公開了包含6-元環(huán)核苷酸類似物的寡核苷酸，所述6-元環(huán)核苷酸類似物包括己六醇和阿卓糖醇核苷酸單體)。本發(fā)明的化合物利用一種或多種反向核苷酸，如反向胸苷或反向腺嘌呤(例如，參見Takei等人，2002.JBC277(26):23800_06)合成。本發(fā)明上下文中，“鏡像”核苷酸(也稱為鏡像異構(gòu)體)，是具有與天然生成或常用核苷酸相反的手性，即為天然生成或常用核苷酸的鏡像，的核苷酸類似物。鏡像核苷酸是核糖核苷酸(L-RNA)或脫氧核糖核苷酸(L-DNA)，并還可包含至少一個(gè)糖或者堿基修飾和/或主鏈修飾，比如磷硫?；蜢⑺狨ゲ糠帧Ｃ绹鴮＠?，602，858公開了包含至少一個(gè)L-核苷酸取代的核酸催化劑。主鏈修飾，如乙基(產(chǎn)生磷酸-乙基三酯)，丙基(產(chǎn)生磷酸-丙基三酯)，和丁基(產(chǎn)生磷酸-丁基三酯)也是可以的。其他主鏈修飾包括聚合物主鏈、環(huán)狀主鏈、非環(huán)狀主鏈、硫代磷酸-D-核糖主鏈、酰胺化物、磷乙酸衍生物。某些結(jié)構(gòu)包括具有一個(gè)或多個(gè)2'-5'核苷酸間鍵合(橋接或主鏈)的siRNA化合物。在一些實(shí)施方案中，(N)x和(N')y都沒有在3'和5'末端磷酸化。在其他實(shí)施方案中(N)x和(N')y中的任一個(gè)或兩個(gè)在3'末端磷酸化(3'Pi)。在又一實(shí)施方案中，(N)x和(N')y任一個(gè)或兩個(gè)都使用不可裂解的磷酸基團(tuán)在3'末端磷酸化。在又一實(shí)施方案中，(N)x或/和(N')y的任一個(gè)或兩個(gè)都使用可裂解的磷酸基團(tuán)或不可裂解的磷酸基團(tuán)在末端的2'末端位置磷酸化。此外，本發(fā)明的抑制性核酸分子可包含一個(gè)或多個(gè)缺口和/或一個(gè)或多個(gè)切口和/或一個(gè)或多個(gè)錯(cuò)配。不希望受限于理論，缺口、切口和錯(cuò)配有在使所述核酸/siRNA部分不穩(wěn)定優(yōu)點(diǎn)，因此其可由內(nèi)源細(xì)胞結(jié)構(gòu)，如DICER、DROSHA或RISC更容易地加工成其抑制性組分。本發(fā)明的上下文中，核酸中的缺口指一條鏈中一個(gè)或多個(gè)內(nèi)部核苷酸的缺失，而核酸中的切口指一條鏈中兩個(gè)相鄰核苷酸間核苷酸間鍵合的缺失。本發(fā)明的任何分子可包含一個(gè)或多個(gè)缺口和/或一個(gè)或多個(gè)切口。寡核苷酸表B(B1-B74)，表C(C1-C4)和表D(D1_D34)包含在制備siRNA化合物中有用的有義寡聚體的核酸序列和對應(yīng)反義寡聚體的核酸序列。這些化合物用作化學(xué)和/或結(jié)構(gòu)修飾的化合物。與已知基因相應(yīng)的siRNA的篩選和合成已有廣泛報(bào)道，參見例如Ui-Tei等人’JBiomedBiotechnol.200665052；Chalk等人’BBRC.2004,319(1)264-74；Sioud&Leirdal，Met.MolBiol.2004,252457-69；Levenkova等人，Bioinform.2004,20(3)430-2；Ui-Tei等人，NAR.2004,32(3):936_48。關(guān)于修飾的siRNA的用途和生產(chǎn)的實(shí)例參見如Braasch等人Biochem.2003,42(26)7967-75；Chiu等人，RNA.2003,9(9)1034-48；PCT公布號W02004/015107和W002/44321和美國專利號5，898031和6，107，094。本發(fā)明提供雙鏈寡核苷酸(例如siRNA)，該雙鏈寡核苷酸下調(diào)所需基因的表達(dá)。本發(fā)明的siRNA是雙鏈體寡核糖核苷酸，其中有義鏈源自于所需基因的mRNA序列，且反義鏈至少基本與有義鏈互補(bǔ)。通常，與靶mRNA序列的一些偏差是允許的而不妨害siRNA活性(參見如Czauderna等人NAR.2003,31(11)2705-2716)。本發(fā)明的siRNA在轉(zhuǎn)錄后水平上抑制基因表達(dá)，該過程伴隨或不伴隨mRNA的破壞。不限于理論，siRNA可使mRNA靶向特異切割和降解，和/或可抑制所靶向的信息的翻譯。在一些實(shí)施方案中，選自表D(D1_D34)的寡核苷酸對包含修飾的siRNA，該修飾的siRNA具有一個(gè)或多個(gè)在此公開的任何修飾。在不同實(shí)施方案中siRNA包含含有第一鏈和第二鏈的RNA雙鏈體，第一鏈包含與靶核酸的約18到約40個(gè)連續(xù)核苷酸至少部分互補(bǔ)的核糖核苷酸序列，所述靶核酸為從靶基因轉(zhuǎn)錄的mRNA，且第二鏈包含與第一鏈至少部分互補(bǔ)的核糖核苷酸序列，并且其中所述第一鏈和/或所述第二鏈包含修飾的核糖核苷酸的許多組，任選地具有在糖部分的2'-位置上的修飾，由此在每條鏈內(nèi)每個(gè)修飾的核糖核苷酸組的一側(cè)或兩側(cè)的側(cè)翼為一個(gè)側(cè)翼核苷酸組，任選地核糖核苷酸，形成側(cè)翼核糖核苷酸組的每個(gè)核糖核苷酸選自未修飾的核糖核苷酸或具有不同于所述修飾的核糖核苷酸組中的修飾的修飾的核糖核苷酸。在一些實(shí)施方案中修飾的核糖核苷酸組和/或側(cè)翼核苷酸組包含選自由從1到12的整數(shù)組成的組的數(shù)量的核糖核苷酸。因此該組包含一個(gè)核苷酸，二個(gè)核苷酸，三個(gè)核苷酸，四個(gè)核苷酸，五個(gè)核苷酸，六個(gè)核苷酸，七個(gè)核苷酸，八個(gè)核苷酸，九個(gè)核苷酸，十個(gè)核苷酸，十一個(gè)核苷酸或十二個(gè)核苷酸。修飾的核苷酸和側(cè)翼核苷酸的組可以在一條鏈或兩條鏈上的模式組織。在一些實(shí)施方案中反義和有義鏈包含交替的未修飾的和2'糖修飾的核糖核苷酸。在一些優(yōu)選的實(shí)施方案中，反義鏈的中間核糖核苷酸是未修飾的核苷酸。例如，在19-寡聚體反義鏈中，位置10的核糖核苷酸是未修飾的；在21-寡聚體反義鏈中，位置11的核糖核苷酸是未修飾的；和在23-寡聚體反義鏈中，位置12的核糖核苷酸是未修飾的。siRNA的修飾或修飾模式，如果有的話，必須設(shè)計(jì)成允許這樣。在偶數(shù)寡聚體，例如22mer，中間核苷酸可在位置11或12。在糖基2'部分的可能修飾包括氨基，氟，甲氧烴氧基，烴基，氨基，氟，氯，溴，CN，CF,咪唑，羧酸酯，硫酯(thioate)，C1到Cltl的低級烴基，取代的低級烴基，烴芳基(alkaryl)或者芳烴基，OCF3,0CN,0-，S-,或N-烴基；0-，S，或N-鏈烯基；SOCH3；SO2CH3；ONO2；NO2,N3；雜環(huán)烴基(heterozycloalkyl)；雜環(huán)芳基(heterozycloalkaryl)；氨基烴胺基；聚烴胺基或者取代的甲硅烷基，尤其如描述于歐洲專利EPO586520B1或者EPO618925B1中的。在本發(fā)明的化合物中一個(gè)或多個(gè)脫氧核糖核苷酸也是允許的。如在此所用，在描述用于在此公開的分子、RNAi或者RNAi的任何實(shí)施方案的設(shè)計(jì)的任何策略時(shí)，術(shù)語“末端修飾”意思是加到有義和/或反義鏈的末端5'或者3'核苷酸的化學(xué)實(shí)體。這種末端修飾的實(shí)例包括但不局限于3'或者5'磷酸酯、反向脫堿基、脫堿基、氨基、氟、氯、溴、CN、CF3、甲氧基、咪唑基、羧酸酯、硫代磷酸酯、C1到C22和低級烴基、脂質(zhì)、糖和聚氨基酸(即肽)、取代的低級烴基、烴芳基或者芳烴基、003、0^0-、5-、或N-烴基；0-、S-、或N-鏈烯基；SOCH3、SO2CH3、ONO2,NO2,N3、雜環(huán)烴基、雜環(huán)芳基、氨基烴胺基、聚烴胺基或者取代的甲硅烷基，尤其如描述于歐洲專利EP0586520B1或EP0618925B1中的。在一些實(shí)施方案中SiRNA是在一端或兩端為平端的，即Z和Z'不存在。更具體地說，siRNA可能在由第一鏈的5'末端和第二鏈的3'末端定義的末端，和/或由第一鏈的3'末端和第二鏈的5'末端定義的末端是平端的。在其他實(shí)施方案中兩條鏈中的至少一個(gè)在5'-末端可具有至少一個(gè)核苷酸的突出端；該突出端可由至少一個(gè)脫氧核糖核苷酸組成。所述鏈的至少一個(gè)也可任選地在3-末端具有至少一個(gè)核苷酸的突出端。該突出端可由從大約1到大約5個(gè)的核苷酸組成。RNA雙鏈體的長度從大約18到大約40個(gè)核糖核苷酸，優(yōu)選19、21或者23個(gè)核糖核苷酸。此外，每條鏈的長度可獨(dú)立地具有選自由大約15到大約40個(gè)堿基，優(yōu)選18到23個(gè)堿基，更優(yōu)選19、21或者23個(gè)核糖核苷酸組成的組。在某些實(shí)施方案中所述第一鏈和靶核酸間的互補(bǔ)性可以是完全的。在一些實(shí)施方案中，鏈?zhǔn)腔旧匣パa(bǔ)的，即，在所述第一鏈和靶mRNA之間或第一鏈和第二鏈之間有一個(gè)，兩個(gè)或多達(dá)五個(gè)錯(cuò)配。基本上互補(bǔ)指與另一序列的互補(bǔ)性大于大約70%，并小于100%。例如在由19個(gè)堿基對組成的雙鏈體區(qū)域，一個(gè)錯(cuò)配產(chǎn)生94.7%的互補(bǔ)性，兩個(gè)錯(cuò)配產(chǎn)生大約89.5%的互補(bǔ)性，三個(gè)錯(cuò)配產(chǎn)生大約84.2%的互補(bǔ)性，四個(gè)錯(cuò)配產(chǎn)生大約79%的互補(bǔ)性和五個(gè)錯(cuò)配產(chǎn)生大約74%的互補(bǔ)性，表現(xiàn)為雙鏈體區(qū)域基本上互補(bǔ)。因此，基本等同指與另一序列具有大于大約70%的同一性。第一鏈和第二鏈可以由環(huán)結(jié)構(gòu)連接，該環(huán)結(jié)構(gòu)可包括非核酸聚合體比如，尤其是聚乙二醇?？蛇x擇地，該環(huán)結(jié)構(gòu)可包括核酸，包括修飾的和非修飾的核糖核苷酸以及修飾的和非修飾的脫氧核糖核苷酸。此外，siRNA第一鏈的5'末端可連接到第二鏈的3'-末端，或者第一鏈的3'-末端可連接到第二鏈的5'-末端，所述連接經(jīng)由核酸連接體連接，該連接體典型地具有2-100個(gè)核酸堿基，優(yōu)選大約2到大約30個(gè)核酸堿基長度。在本發(fā)明化合物的優(yōu)選實(shí)施方案中，該化合物在其反義和有義鏈的至少一條上具有交替的核糖核苷酸修飾，對于19mer和23mer寡聚體，在反義鏈5'和3'末端的核糖核苷酸的糖基上是修飾的，并且在有義鏈5'和3'末端的核糖核苷酸的糖基上是未修飾的。對于21mer寡聚體，在有義鏈的5'和3'末端的核糖核苷酸上的糖基是修飾的，和在反義鏈5'和3'末端核糖核苷酸上的糖基是未修飾的，或者可具有在3'末端的任選的另外的修飾。如上所述，優(yōu)選反義鏈的中間核苷酸是未修飾的。根據(jù)本發(fā)明的一個(gè)優(yōu)選實(shí)施方案，寡核苷酸/siRNA的反義和有義鏈僅在3‘末端而不在5'-末端磷酸化。根據(jù)本發(fā)明的另一優(yōu)選實(shí)施方案，反義和有義鏈?zhǔn)欠橇姿峄摹８鶕?jù)本發(fā)明的又一優(yōu)選實(shí)施方案，有義鏈最5'端的核糖核苷酸是修飾的，以取消體內(nèi)5'-磷酸化的任何可能性。在此公開的任何SiRNA序列制備成具有在此公開的任何修飾或結(jié)構(gòu)。序列和結(jié)構(gòu)的組合是新穎的，并且在本文所公開的病癥的治療中有用的。藥物組合物雖然本發(fā)明的化合物可以以化學(xué)原料形式施用，但優(yōu)選將其作為藥物組合物施用。因此本發(fā)明提供包含一種或多種本發(fā)明的化合物和藥學(xué)上可接受的載體的藥物組合物。該組合物可包含兩種或多種不同寡核苷酸/siRNA的混合物。本發(fā)明進(jìn)一步提供藥物組合物，該藥物組合物包含有效抑制上文公開的一種或多種基因的量的與一種或多種本發(fā)明的化合物共價(jià)或非共價(jià)連接的至少一種化合物，和藥學(xué)上可接受的載體。該化合物可經(jīng)內(nèi)源細(xì)胞復(fù)合物胞內(nèi)處理產(chǎn)生一種或多種本發(fā)明的寡核糖核苷酸。本發(fā)明還提供藥物組合物，該藥物組合物包含藥學(xué)上可接受的載體和有效下調(diào)細(xì)胞中靶基因表達(dá)的量一種或多種本發(fā)明的化合物，該化合物包含與(N)X的序列基本互補(bǔ)的序列。在某些實(shí)施方案中，靶基因是病毒、細(xì)菌或哺乳動(dòng)物的基因。在不同實(shí)施方案中靶基因是哺乳動(dòng)物的基因，優(yōu)選人類基因。因此，本發(fā)明提供與對照相比抑制靶基因表達(dá)至少50%的方法，該方法包括將靶基因的mRNA轉(zhuǎn)錄物與一種或多種本發(fā)明的化合物接觸。在一些實(shí)施方案中與對照相比，活性siRNA化合物以至少50%、60%或70%的水平抑制基因表達(dá)。在某些優(yōu)選實(shí)施方案中與對照相比的抑制水平為至少75%、80%或90%。在一些實(shí)施方案中靶基因是在此公開的促凋亡基因。在一個(gè)實(shí)施方案中寡聚核糖核苷酸抑制一種或多種本發(fā)明的促凋亡基因，其中抑制選自由抑制基因功能、抑制多肽和抑制mRNA表達(dá)組成的組。在一個(gè)實(shí)施方案中化合物抑制靶基因編碼的多肽的表達(dá)，其中抑制選自由抑制功能(其可通過尤其是酶測定或與天然基因/多肽的已知相互作用物的結(jié)合測定來檢驗(yàn))，抑制蛋白(其可通過尤其是蛋白質(zhì)印跡、ELISA或免疫沉淀檢驗(yàn))和抑制mRNA表達(dá)(其可通過尤其是RNA印跡、定量RT-PCR、原位雜交或微陣列雜交檢驗(yàn))組成的組。在另外的實(shí)施方案中本發(fā)明提供治療患有伴有本發(fā)明的促凋亡基因水平上升的疾病的受試者的方法，該方法包括給受試者施用治療有效劑量的本發(fā)明的化合物從而治療受試者。更特別地，本發(fā)明提供寡聚核糖核苷酸，其中一條鏈包含從5'到3'具有如表B所示的序列的連續(xù)核苷酸或其同源物，其中多達(dá)兩個(gè)核糖核苷酸與互補(bǔ)鏈的核糖核苷酸不配對。此外，根據(jù)本發(fā)明的另外的核酸包含如表B(表B1-B74)所示的任一多核苷酸寡聚體的至少14個(gè)連續(xù)核苷酸，并且更優(yōu)選地包含如上所述第一鏈和第二鏈的雙鏈結(jié)構(gòu)的任何末端的14個(gè)連續(xù)核苷酸堿基對。腿本發(fā)明的SiRNA分子可通過直接應(yīng)用與載體或稀釋劑制備的裸分子而遞送于靶組織。術(shù)語“裸siRNA”是指無作為協(xié)助、促進(jìn)或便于其進(jìn)入細(xì)胞的任何運(yùn)載體(vehicle)的siRNA分子，所述運(yùn)載體包括病毒序列、病毒粒子、脂質(zhì)體制劑、脂質(zhì)體或沉淀劑和類似運(yùn)載體。例如溶于PBS的siRNA是“裸siRNA”。然而，在一些實(shí)施方案中本發(fā)明的siRNA分子在脂質(zhì)體或脂質(zhì)體制劑等中遞送并通過本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知的方法制備。這些方法描述于如美國專利號5，593，972，5，589，466，和5，580，859，其在此通過引用并入。已開發(fā)了專門為提高和改善siRNA遞送入哺乳動(dòng)物細(xì)胞的遞送系統(tǒng)，(參見，例如Shen等人FEBSLet.2003，539:111_114；Xia等人，2002，201006-1010；Reich等人，Mol.Vision2003,9:210_216；Sorensen等人，J.Mol.Biol.2003.327:761_766；Lewis等人，Nat.Gen.2002,32107-108和Simeoni等人，NAR2003，31，11:2717_2724)。最近siRNA已被成功用于靈長類基因表達(dá)的抑制(參見，例如Tolentino等人，Retina24(4):660.)。藥學(xué)上可接受的載體、溶劑、稀釋劑、賦形劑、佐劑和溶媒以及植入載體通常是指不與本發(fā)明的活性成分起作用的惰性非毒性的固態(tài)或液態(tài)填充劑、稀釋劑或封裝材料，并且其包括脂質(zhì)體和微球體。用于本發(fā)明的遞送系統(tǒng)的實(shí)例包括美國專利號5，225，182；5，169，383；5，167，616；4，959，217；4，925，678；4，487，603；4，486，194；4，447，233；4，447，224；4,439，196；和4，475，196。許多其他類似的植入體、遞送系統(tǒng)和模塊是本領(lǐng)域技術(shù)人員所熟知的。在本發(fā)明一個(gè)具體實(shí)施方案中可選擇局部和經(jīng)皮制劑。本發(fā)明的siRNA或藥物組合物根據(jù)良好的醫(yī)學(xué)慣例、考慮患者個(gè)體的臨床病癥、要治療的疾病、施用的部位和方法、施用時(shí)間安排、患者年齡、性別、體重和醫(yī)生已知的其他因素來施用和定劑量。用于本文目的的“治療有效劑量”由此通過本領(lǐng)域已知的此類因素決定。劑量必須有效實(shí)現(xiàn)改善，包括但不限于提高存活率或更迅速恢復(fù)，或改善或消除癥狀和本領(lǐng)域技術(shù)人員選擇作為適當(dāng)措施的其他指標(biāo)。一般來說，對人類化合物的有效劑量為每天從lng/kg到約20_100mg/kg體重，優(yōu)選每天約0.Olmg到約2-10mg/kg體重，在以下方案中每天1個(gè)劑量、或每天2次或3次或更多次，持續(xù)1-4周或更久。本發(fā)明的化合物可以通過任何傳統(tǒng)的施用路徑施用。應(yīng)該注意的是，所述化合物作為化合物本身或作為藥學(xué)上可接受的鹽施用，并且單獨(dú)施用或作為活性成分與藥學(xué)上可接受的載體、溶劑、稀釋劑、賦形劑、佐劑和溶媒聯(lián)合施用。該化合物口服、局部，皮下，或胃腸外包括靜脈內(nèi)、動(dòng)脈內(nèi)、肌肉內(nèi)、腹腔內(nèi)和鼻內(nèi)，吸入，經(jīng)鼓膜內(nèi)施用以及鞘內(nèi)注射和灌輸技術(shù)施用。該化合物的植入體也是有用的。可制備液體形式以用于注射，該術(shù)語包括皮下、經(jīng)皮、靜脈內(nèi)、肌肉內(nèi)、鞘內(nèi)和其他胃腸外施用路徑。液體組合物包括水溶液，含或不含有機(jī)共溶劑、水或油懸浮液、食用油乳劑以及類似的藥學(xué)溶媒。在特定實(shí)施方案中，施用包含靜脈內(nèi)施用。在另一個(gè)實(shí)施方案中施用包含局部(topical)或區(qū)域(local)施用。此外，在某些實(shí)施方案中用于本發(fā)明的新治療的組合物可以配制為氣溶膠，例如用于鼻內(nèi)施用。在某些實(shí)施方案中，口腔組合物(如片劑、懸浮液、溶液)可對口腔局部遞送是有效的，如適于作為漱口水用于治療口腔粘膜炎的口腔組合物。在優(yōu)選實(shí)施方案中接受治療的受試者是溫血?jiǎng)游锖吞貏e是哺乳動(dòng)物包括人類。在另外的實(shí)施方案中，修飾是磷酸部分的修飾，其中修飾的磷酸部分選自包含磷硫酰的基團(tuán)或無磷酸基團(tuán)。本發(fā)明的分子包含siRNA、合成siRNA、合成shRNA，以及編碼此類分子或其他抑制性核苷酸分子的其他核酸序列或分子。進(jìn)一步的末端修飾是生物素基團(tuán)。該生物素基團(tuán)可優(yōu)選結(jié)合于第一和/或第二鏈最5'或3'核苷酸或兩個(gè)末端。在更優(yōu)選實(shí)施方案中生物素與多肽或蛋白質(zhì)偶聯(lián)。通過任何其他前述末端修飾結(jié)合多肽或蛋白質(zhì)也在本發(fā)明的范圍內(nèi)。在此公開的各種末端修飾優(yōu)選位于根據(jù)本發(fā)明的核酸的核苷酸的核糖部分。更特別地，末端修飾可結(jié)合或置換核糖部分的任何OH-基，包括但不限于2'0H,3'OH和5'OH位置，條件是因此修飾的核苷酸是末端核苷酸。反向脫堿基或脫堿基是無核堿基部分的核苷酸，無論是脫氧核糖核苷酸或核糖核苷酸。這種化合物尤其是Sternberger，M等人描述的(2002，AntisenseNucleicAcidDrugDev，12，131-43)。siNA化合物描述于國際專利申請WO03/070918。應(yīng)理解，在本發(fā)明的情況下，在此公開的任何siRNA分子，或任何長雙鏈RNA分子(通常25-500個(gè)核苷酸長度)，其由內(nèi)源細(xì)胞復(fù)合體(如DICER，參見上文)加工以形成在此公開的siRNA分子，或包含在此公開的siRNA分子的分子，包括在本發(fā)明的分子內(nèi)以形成其他新分子，和用于治療在此描述的疾病或疾患。特別地，考慮包含一個(gè)或多個(gè)莖和環(huán)結(jié)構(gòu)的長寡核苷酸(通常約80-500個(gè)核苷酸長度)，其中莖區(qū)域包含本發(fā)明的寡核苷酸，可由載體遞送，優(yōu)選藥學(xué)上可接受的載體，或可通過內(nèi)源細(xì)胞復(fù)合體(例如通過上文描述的DROSHA和DICER)在細(xì)胞內(nèi)加工以產(chǎn)生為本發(fā)明的寡核苷酸的一個(gè)或多個(gè)更小的雙鏈寡核苷酸(siRNA)。此寡核苷酸稱為串聯(lián)shRNA結(jié)構(gòu)?？紤]此長寡核苷酸是包含一個(gè)或多個(gè)莖和環(huán)結(jié)構(gòu)的單鏈寡核苷酸，其中每個(gè)莖區(qū)域包含有義和相應(yīng)的反義siRNA序列。任何分子，例如包含在此公開的抑制序列的反義DNA分子(具有合適的核酸修飾)是特別需要的，并可以與相應(yīng)的RNA/siRNA相同的能力用于在此公開的所有用途和方法。此外，可制備多核苷酸的類似物，其中核苷酸的結(jié)構(gòu)根本地改變和更適合作為治療或?qū)嶒?yàn)試劑。核苷酸類似物的實(shí)例是肽核酸(PNA)其中DNA(或RNA)中的脫氧核糖(或核糖)磷酸主鏈包含與肽中發(fā)現(xiàn)的主鏈類似的聚酰胺主鏈。PNA類似物已顯示酶降解抗性并在體內(nèi)和體外具有延長的壽命。另外，已顯示PNA比DNA分子更強(qiáng)地結(jié)合互補(bǔ)的DNA序列。這個(gè)發(fā)現(xiàn)被歸因于PNA鏈和DNA鏈之間缺乏電荷排斥。用于合成寡核苷酸的其他修飾的單體包括具有聚合物主鏈、環(huán)主鏈或無環(huán)主鏈的部分。治療方法本發(fā)明的另一方面涉及需要治療的受試者的與靶基因，即表A的促凋亡基因，的異常表達(dá)相關(guān)的疾病或疾患的治療方法，該方法包括給受試者施用減少或抑制這些基因表達(dá)的量的抑制劑。在優(yōu)選實(shí)施方案中，治療的受試者是溫血?jiǎng)游锖吞貏e是哺乳動(dòng)物包括人類。本發(fā)明的方法包括以治療有效劑量給受試者施用下調(diào)表A中的促凋亡基因表達(dá)的一種或多種抑制性化合物，并且特別是siRNA從而治療受試者。術(shù)語“治療”指治療方法和預(yù)防治療或預(yù)防措施，其中受試者能夠被阻止或延遲(減少)在此所列的疾患。需要治療的受試者包括已經(jīng)經(jīng)歷該疾病或病癥的人，易患該疾病或病癥的人，和要預(yù)防該疾病或病癥的人。本發(fā)明的化合物在該疾病或病癥或與其相關(guān)的癥狀發(fā)作之前、之中或之后施用。在以預(yù)防為目的的治療的情況中，本發(fā)明涉及延遲該疾病或疾患發(fā)作或防止該疾病或疾患發(fā)展的方法。本發(fā)明涉及下調(diào)本發(fā)明促凋亡基因表達(dá)的化合物特別是新的小干擾RNA(SiRNA)在治療下列疾病或病癥中的用途，其中抑制所述促凋亡基因表達(dá)有益于治療所述疾病或病癥聽力損失，急性腎功能衰竭(ARF)，青光眼，急性呼吸窘迫綜合征(ARDS)及其他急性肺和呼吸損傷，肺移植后缺血再灌注損傷，器官移植包括肺、肝臟、心臟、骨髓、胰腺、角膜和腎移植包括DGF，脊髓損傷，壓瘡，年齡相關(guān)性黃斑變性(AMD)，干眼綜合征，包括ION和AION的眼缺血病癥，口腔粘膜炎和慢性阻塞性肺病(COPD)。其他適應(yīng)癥包括化學(xué)誘導(dǎo)的腎毒性和化學(xué)誘導(dǎo)的神經(jīng)毒性，如由順鉬和順鉬樣化合物、氨基糖苷、環(huán)利尿劑以及對苯二酚及其類似物誘導(dǎo)的毒性。在此詳述本發(fā)明的抑制促凋亡基因的方法、分子和組合物，且任何所述分子和/或組合物可有利地用于治療患有任何所述病癥的受試者。本發(fā)明也提供制備藥物組合物的方法，該方法包括提供一種或多種本發(fā)明的化合物；和將所述化合物與藥學(xué)上可接受的載體混合。本發(fā)明還提供包含制備藥物組合物的方法，該方法包括將一種或多種本發(fā)明的化合物與藥學(xué)上可接受的載體混合。在優(yōu)選實(shí)施方案中，用于制備藥物組合物的化合物以藥學(xué)有效劑量與載體混合。在特別實(shí)施方案中本發(fā)明的化合物軛合到類固醇或脂質(zhì)或其他合適的分子例如膽固醇。修飾的化合物的合成本發(fā)明的化合物可通過本領(lǐng)域已知的用于合成核糖核酸(或脫氧核糖核酸)寡核苷酸的任何方法來合成。其中這些合成描述于Beaucage和Iyer，Tetrahedron1992；48-.2223-2311；Beaucage禾口Iyer，Tetrahedronl993；496123-6194禾口Caruthers等人，MethodsEnzymo1.1987；154:287_313；其中硫酯的合成描述于Eckstein，Annu.Rev.Biochem.1985；54367-402,RNA^^Wπ^^δΤSproat,HumanaPress2005HerdewijnP.編著；Kap.217-31和其中相應(yīng)的下游過程描述于Pingoud等人，IRLPress198901iverR.W.Α.編著；Kap.7183-208。其他合成方法是本領(lǐng)域已知的，例如描述于Usman等人，J.Am.Chem.Soc，1987，1097845；Scaringe等人，NAR，1990，185433；Wincott等人，NAR1995，23:2677_2684；和Wincott等人，MethodsMol.Bio.，1997，7459的方法，并且這些方法可使用常見的核酸保護(hù)和偶聯(lián)基團(tuán)，如5'-末端的二甲氧三苯甲基，和3'-末端的亞磷酰胺。修飾的(例如2'-0-甲基化)核苷酸和未修飾的核苷酸依照需要并入。本發(fā)明的寡核苷酸可單獨(dú)合成，并在合成后連接在一起，例如通過連接反應(yīng)(Moore等人，Science1992，2569923；國際專利公布號W093/23569；Shabarova等人，NAR1991，194247；Bellon等人，Nucleosides&Nucleotides,1997，16951；Bellon等人，BioconjugateChem1997，8:204)，或通過合成和/或脫保護(hù)后的雜交反應(yīng)。應(yīng)該注意的是可使用市場上可獲得的設(shè)備(可獲得的，特別是來自AppliedBiosystems)；根據(jù)本文公開的序列制備寡核苷酸。通過本領(lǐng)域已知的方法連接化學(xué)合成片段的重疊對(例如參見美國專利號6，121，426)。單獨(dú)合成鏈然后在試管中互相退火。然后，經(jīng)HPLC將雙鏈siRNA與沒有退火(例如由于其中之一過量)的單鏈寡核苷酸中分離出來。關(guān)于本發(fā)明的siRNA或siRNA片段，可合成兩個(gè)或多個(gè)這樣的序列并連接到一起以供本發(fā)明使用。本發(fā)明的化合物也可通過串聯(lián)合成方法合成，例如美國專利公布號2004/0019001(McSwiggen)所描述，其中兩條siRNA鏈作為單一的連續(xù)寡核苷酸片段或是通過可裂解的連接體分開的鏈，隨后裂解該連接體以提供分離的siRNA片段或是雜交并允許siRNA雙鏈體純化的鏈。該連接體選自多核苷酸連接體或者非核苷酸連接體。本發(fā)明進(jìn)一步提供包含用于治療本文提到的任何疾病和病癥的兩種或多種siRNA分子的藥物組合物，其中所述兩個(gè)分子可在藥物組合物中物理混合到一起以產(chǎn)生相同或其他有益活性的量，或可共價(jià)或非共價(jià)地結(jié)合，或通過長度介于2-100，優(yōu)選2-50或2-30個(gè)核苷酸，的核酸連接體連接到一起。在一個(gè)實(shí)施方案中，siRNA分子包含在此描述的雙鏈核酸結(jié)構(gòu)，其中兩個(gè)siRNA序列選自表B(B1-B74)、表C(C1-C4)和表D(D1-D34)。因此，siRNA分子可能共價(jià)或非共價(jià)地結(jié)合或通過連接體連接以形成串聯(lián)siRNA化合物。包含兩個(gè)siRNA序列的該串聯(lián)siRNA化合物通常為約38-150個(gè)核苷酸長度，更優(yōu)選38或40-60個(gè)核苷酸長度，并且如果串聯(lián)分子中含有兩個(gè)以上siRNA序列則相應(yīng)的更長。還考慮了包含編碼由內(nèi)部細(xì)胞過程產(chǎn)生的siRNA的兩個(gè)或多個(gè)更長的序列的更長的串聯(lián)化合物，以及編碼兩個(gè)或多個(gè)shRNA的串聯(lián)分子。合成的修飾的串聯(lián)分子也被認(rèn)為是本發(fā)明的部分?？紤]了包含兩個(gè)或多個(gè)本發(fā)明siRNA序列的串聯(lián)化合物。靶向本發(fā)明促凋亡基因的SiRNA分子可以是藥物組合物中的主要活性成分，或可以是是含有兩個(gè)或以上siRNA(或者編碼或內(nèi)源產(chǎn)生兩個(gè)或多個(gè)siRNA的分子，分子混合物或編碼兩個(gè)或多個(gè)siRNA的一個(gè)或多個(gè)串聯(lián)分子)的藥物組合物中的一種活性成分，所述藥物組合物還包含靶向一個(gè)或多個(gè)其他基因的一個(gè)或多個(gè)其他siRNA分子組成。所述其他基因的同時(shí)抑制可能對在此公開疾病的治療具有加成或協(xié)同效應(yīng)。另外，為了實(shí)現(xiàn)對在此公開疾病治療的增強(qiáng)的靶向，在此公開的促凋亡siRNA或包含該siRNA的任何核酸分子或編碼該siRNA的任何核酸分子可任選地連接或結(jié)合(共價(jià)或者非共價(jià))到針對表達(dá)于靶細(xì)胞的細(xì)胞表面內(nèi)化分子的抗體(包括適體分子)。例如抗-Fas抗體(優(yōu)選中和抗體)可與任何促凋亡siRNA結(jié)合(共價(jià)或者非共價(jià))。本發(fā)明的化合物例如作為雙鏈化合物、作為雙鏈發(fā)夾化合物或作為串聯(lián)化合物遞送。還考慮包含一個(gè)或多個(gè)莖和環(huán)結(jié)構(gòu)的長寡核苷酸(典型地25-500個(gè)核苷酸長度)，其莖區(qū)域包含本發(fā)明的寡核苷酸序列，可在載體優(yōu)選藥學(xué)上可接受的載體中遞送，并且可通過內(nèi)源細(xì)胞復(fù)合物在胞內(nèi)加工(例如通過上述DROSHA和DICER)以產(chǎn)生為本發(fā)明的寡核苷酸的一個(gè)或多個(gè)更小的雙鏈寡核苷酸(siRNA)。該寡核苷酸稱為串聯(lián)shRNA結(jié)構(gòu)。考慮該長寡核苷酸是包含一個(gè)或多個(gè)莖和環(huán)結(jié)構(gòu)的單鏈寡核苷酸，其中每個(gè)莖區(qū)域包含本發(fā)明促凋亡基因的有義和相應(yīng)反義siRNA序列。特別地，考慮該寡核苷酸包含描述于表B-D(B1-B74；C1-C4,D1-D34)的如SEQIDNOS=97-87,178所示的有義和反義siRNA序列。RNA干擾最近公開了許多涉及RNAi現(xiàn)象的PCT申請。這些包括PCT公布W000/44895、PCT公布W000/49035、PCT公布W000/63364、PCT公布W001/36641、PCT公布W001/36646、PCT公布W099/32619、PCT公布W000/44914、PCT公布W001/29058和PCT公布W001/75164。RNA干擾(RNAi)是基于dsRNA物類(species)進(jìn)入胞質(zhì)蛋白復(fù)合物的能力，然后dsRNA在該復(fù)合物中靶向互補(bǔ)的細(xì)胞RNA并將其特異性降解。RNA干擾反應(yīng)的特征是包含siRNA的核酸內(nèi)切酶復(fù)合物，該復(fù)合物通常稱為RNA-誘導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RISC)，其介導(dǎo)具有與siRNA雙鏈體反義鏈互補(bǔ)的序列的單鏈RNA的裂解。靶RNA的裂解可發(fā)生在互補(bǔ)于siRNA雙鏈體的反義鏈的區(qū)域的中間位置(Elbashir等人，GenesDev.2001,15(2)188-200)。更詳細(xì)地，長dsRNA被III型核糖核酸酶(DICER、DROSHA等；Bernstein等人，Nature,2001,409(6818):363_6；Lee等人，Nature,2003,425(6956):415_9)消化成短(17-29bp)dsRNA片段(也稱為短抑制性RNA，“siRNA”)。RISC蛋白質(zhì)復(fù)合物識別這些片段和互補(bǔ)的mRNA。整個(gè)過程以核酸內(nèi)切酶裂解靶mRNA結(jié)束(McManus和Sharp，NatureRevGenet,2002,3(10)737-47；Paddison禾口Hannon，CurrOpinMolTher.2003,5(3)217-24)。(關(guān)于這些術(shù)語和建議機(jī)理的更多信息，參見例如Bernstein等人，RNA2001，7(11)1509-21；Nishikura,Cell2001,107(4):415_8和PCT公布W001/36646)?！﹫F(tuán)體已描述了具有在細(xì)胞內(nèi)生成siRNA能力的基于DNA的載體的開發(fā)。方法通常包括在細(xì)胞內(nèi)經(jīng)有效處理以形成siRNA的短發(fā)夾RNA的轉(zhuǎn)錄(Paddison等人，PNASUSA2002,991443-1448；Paddison等人，Genes&Dev2002，16:948_958；Sui等人，PNASUSA2002，8:5515-5520；和Brummelkamp等人，Science2002，296:550_553)。這些報(bào)道描述了具有特異性靶向眾多內(nèi)源和外源表達(dá)基因的siRNA的生成方法。以例證性方式描述了本發(fā)明，并且應(yīng)理解為使用的專業(yè)術(shù)語目的在于描述的文字的本質(zhì)，而不是限制。明顯地，根據(jù)上述教導(dǎo)本發(fā)明的許多修飾和變化是可能的。因此，應(yīng)理解在所附權(quán)利要求的范圍內(nèi)，本發(fā)明可不同于特定的描述而實(shí)施。本發(fā)明以實(shí)施例為參考詳細(xì)說明如下，但是不應(yīng)視為是對其的限制。本文所引用的任何文獻(xiàn)并不是對該文獻(xiàn)作為相關(guān)先有技術(shù)的承認(rèn)，或者認(rèn)為是本申請的任何權(quán)利要求的取得專利可能性的材料。關(guān)于任何文獻(xiàn)內(nèi)容和日期的任何聲明是基于申請人在申請時(shí)可獲得的信息，并且不構(gòu)成承認(rèn)關(guān)于該聲明的正確性。實(shí)施例無需進(jìn)一步闡述，相信本領(lǐng)域的技術(shù)人員可以利用前面的描述，最大程度地使用本發(fā)明。以下優(yōu)選的具體實(shí)施方案因此僅視為是說明性的，而不以任何方式限制所要求保護(hù)的發(fā)明。在此沒有專門描述的本領(lǐng)域已知的標(biāo)準(zhǔn)分子生物學(xué)方案，通?；咀裱鏢ambrook等人，Molecularcloning:Alaboratorymanual(分子克隆實(shí)驗(yàn)手冊)，ColdSpringsHarborLaboratory，New-York(1989，1992)，禾口Ausubel等人，CurrentProtocolsinMolecularBiology(分子生物學(xué)最新方案)，JohnWileyandSons，Baltimore，Maryland(1988)，禾口如Ausubel等人，CurrentProtocolsinMolecularBiology(分子生物學(xué)最新方案)，JohnWileyandSons，Baltimore，Maryland(1989)，和如Perbal，APracticalGuidetoMolecularCloning(分子克隆實(shí)踐指南)，JohnWiley&Sons，NewYork(1988)，禾口如Watson等人，RecombinantDNA(重組DNA)，ScientificAmericanBooks(科學(xué)美國人叢書)，NewYork和Birren等人(編輯)，GenomeAnalysis:ALaboratoryManualSeries(基因組分析實(shí)驗(yàn)室手冊系列)，第1-4卷，ColdSpringHarborLaboratoryPress,NewYork(1998)和如美國專利號4，666，828；4，683，202；4，801，531；5，192，659和5，272，057中所述的方法，并在此通過引用并入。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)通常遵循PCRProtocols:AGuideToMethodsAndApplications(PCR方案方法與應(yīng)用指南)，AcademicPress,SanDiego,CA(1990)。原位(細(xì)胞內(nèi))PCR結(jié)合流式細(xì)胞術(shù)用于檢測含有特定DNA和mRNA序列的細(xì)胞(Testoni等人，Blood1996,87:3822)。執(zhí)行RT-PCR的方法也是本領(lǐng)域公知的。細(xì)胞培養(yǎng)HeLa細(xì)胞(美國典型培養(yǎng)物保藏中心)的培養(yǎng)如Czauderna等人(NAR，2003.31670-82)所描述。人角質(zhì)形成細(xì)胞在37°C培養(yǎng)于含有10%FCS的達(dá)爾伯克氏改良伊格爾培養(yǎng)基(Dulbecco'smodifiedEaglemedium，DMEM)。小鼠細(xì)胞系B16V(美國菌種保藏中心)在37°C培養(yǎng)于含有10%FCS的達(dá)爾伯克氏改良伊格爾培養(yǎng)基(DMEM)。培養(yǎng)條件描述于(MethodsFindExpClinPharmacol.1997May；19(4):231_9)。在每一種情況下，用的受試細(xì)胞以約50，000個(gè)細(xì)胞/孔的密度經(jīng)受在此描述的試驗(yàn)，并且以20nM添加根據(jù)本發(fā)明的雙鏈核酸，用lyg/ml如下所述的專用脂質(zhì)復(fù)合雙鏈核酸。缺氧樣(hypoxia-like)狀況的誘導(dǎo)用CoCl2處理細(xì)胞以誘導(dǎo)缺氧樣狀況，如下所示在ΙΟ-cm平板(30_50%融合度)中進(jìn)行siRNA轉(zhuǎn)染，如Czauderna等人，2003；Kretschmer等人，2003所描述。簡要地說，通過向完全培養(yǎng)基中的細(xì)胞添加在無血清培養(yǎng)基中預(yù)制的GB和脂質(zhì)的IOx濃縮復(fù)合物(complex)進(jìn)行siRNA轉(zhuǎn)染?？傓D(zhuǎn)染量為10ml。除另有說明外，最終脂質(zhì)濃度為1.0μg/ml，最終siRNA濃度為20nM。通過在溶解前24h直接向組織培養(yǎng)基中添加CoCl2(100μΜ)來誘導(dǎo)低氧反應(yīng)。細(xì)胞提取物的制備和免疫印跡細(xì)胞抽提物的制備和免疫印跡分析基本如所述地進(jìn)行(Klippel等人，MolCellBiol,1998.18:5699_711；Klippel,A等人，MolCellBiol,1996.16:4117_27)。實(shí)施例1:siRNA化合物的體外測試約1.5-2XIO5個(gè)測試細(xì)胞(對于靶向人基因的siRNA為HeLa細(xì)胞和/或293T細(xì)胞，對于靶向大鼠/小鼠基因的siRNA為NRK52細(xì)胞和/或NMUMG細(xì)胞)接種于6孔板(70-80%融合度)的每孔中。24小時(shí)后，利用終濃度為5nM或20nM的Lipofectamine2000試劑(Invitrogen)以siRNA化合物轉(zhuǎn)染細(xì)胞。細(xì)胞在37°C于C02培養(yǎng)箱中培養(yǎng)72h。用PTEN-Cy-3標(biāo)記的siRNA化合物作為轉(zhuǎn)染的陽性對照。使用的其他陽性對照為平端19-mersiRNA,即χ=y=19其中Z和Z'二者都不存在。該siRNA是非磷酸化的，并且具有在反義鏈和有義鏈兩條鏈上的糖殘基2'位置上修飾的交替的核糖核苷酸，其中在2'位置的部分是甲氧基(2'-0-甲基)，并且其中在反義鏈5'和3'末端的核糖核苷酸在其糖殘基上是修飾的，和在有義鏈5'和3'末端的核糖核苷酸在其糖基上是未修飾的。用GFPsiRNA化合物作為siRNA活性的陰性對照。轉(zhuǎn)染后72h，收獲細(xì)胞，并從細(xì)胞中抽提RWL通過熒光顯微鏡測試轉(zhuǎn)染率。利用特定的優(yōu)選SiRNA結(jié)構(gòu)時(shí)的基因表達(dá)抑制百分比通過使用qPCR分析表達(dá)所述內(nèi)在基因的細(xì)胞中的靶基因來測定。通常，選擇用于體外測試的具有特定序列的SiRNA對人和第二物種如大鼠或兔基因是特異的。利用具有這些RNA序列并如本文所述地修飾的siRNA獲得了相似的結(jié)果。用其他siRNA寡聚體得到特定基因表達(dá)降低的相似結(jié)果，該siRNA寡聚體的序列列于表B(B1-B74)、表C(C1-C4)和表D(D1_D34)。表B中的siRNA寡聚體如SEQIDNOS:97_68654所示(公開于美國序列號11/978，089和PCT專利申請?zhí)朠CT/IL2007/001278，其在此以其整體通過引用并入)。下面的表Cl、C2、C3和C4公開了優(yōu)選的siRNA序列，發(fā)現(xiàn)所有這些siRNA在上述測定中具有活性(表Cl、C3和C4-19mersiRNA分子；表C2-23mersiRNA分子)，通常，選定用于體外測試的有特定序列的siRNA對人類和大鼠/兔基因都是特異的。利用具有這些RNA序列并如本文所述地修飾的siRNA得到了相似結(jié)果。用其他siRNA寡聚體得到特定基因表達(dá)降低的相似結(jié)果，該siRNA寡聚體的序列列于表B(B1-B74)、表C(C1_C4)和表D(D1-D34)。表Cl優(yōu)選的19-mersiRNA序列。靶基因細(xì)胞系*受試siRNA序列TP53BP2293TTP53BP2_1SS:GAGG⑶GAAAUUCAACCCCSEQIDNOS97-98AS:GGGGUUGAAUUUCACCCUCTP53BP2293TTP53BP2_2SSCACCCAGAGAACAUUUAUUSEQIDNOS99-100AS:AAUAAAUGUUCUCUGG⑶GTP53BP2293TTP53BP2_3SS:GG⑶GAAAUUCAACCCCCUSEQIDN0S:101-102AS:AGGGGGUUGAAUUUCACCCTP53BP2293TTP53BP2_4SS:AGG⑶GAAAUUCAACCCCCSEQIDNo.103-104ASGGGGGUUGAAUUUCACCCUTP53BP2293TTP53BP2_5SS:AGGGA⑶⑶UUGAAUAAGCSEQIDNOS105-106AS:GCUUAUUCAAACACUCCCUTP53BP2293TTP53BP2_6SS:ACCCAGAGAACAUUUAUUCSEQIDNOS107-108AS:GAAUAAAU⑶UCUCUGGGU<table>tableseeoriginaldocumentpage60</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage61</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage62</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage63</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage64</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage65</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage66</column></row><table>表C2優(yōu)選的23-mersiRNA序列。<table>tableseeoriginaldocumentpage66</column></row><table>表C3另外的優(yōu)選的19-mersiRNA序列。<table>tableseeoriginaldocumentpage66</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage67</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage68</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage69</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage70</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage71</column></row><table>化合物的某些活性和或穩(wěn)定性的實(shí)例示于圖23，該化合物包含根據(jù)表C1-C4的反義序列和有義序列和結(jié)構(gòu)修飾。實(shí)施例2急件腎功能衰竭(ARF)樽型系統(tǒng)ARF是以腎功能急性退化為特征的臨床綜合征，該急性退化發(fā)生在幾天內(nèi)。不受理論束縛，急性腎損傷可能是腎缺血再灌注損傷引起的，如進(jìn)行大手術(shù)(majorsurgery)如大心臟手術(shù)的病人中的腎缺血再灌注損傷。ARF的主要特征是腎小球?yàn)V過率(GFR)突然下降，導(dǎo)致含氮廢物(尿素，肌酐)滯留。最近的研究支持腎組織中細(xì)胞凋亡在大多數(shù)人類ARF病例中是顯著的。凋亡性細(xì)胞死亡的主要位點(diǎn)是遠(yuǎn)端腎單位。在缺血性損傷的初始階段，肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架的完整性喪失導(dǎo)致上皮扁平，和刷狀緣喪失，焦點(diǎn)細(xì)胞接觸喪失，以及隨后細(xì)胞從深層基底脫離。利用缺血再灌注誘導(dǎo)的ARF的動(dòng)物模型來進(jìn)行活性siRNA化合物的測試。缺血-再灌注誘導(dǎo)的ARF的預(yù)防在雙側(cè)腎動(dòng)脈夾緊45分鐘及隨后解除夾緊以允許再灌注之后，于大鼠中誘導(dǎo)缺血-再灌注損傷。在再灌注之后七天處死大鼠。12mg/kg的Casp2_4siRNA化合物(Casp2_4有義序列GCCAGAAUGUGGAACUCCU，SEQIDNO139；反義序列AGGA⑶UCCACAUUCUGGC，SEQIDNO140)在夾緊之后4小時(shí)注入頸靜脈。ARF進(jìn)程通過測量手術(shù)之前(0天)和手術(shù)之后1天、3天、5天和7天的血清肌酐水平來監(jiān)測。在實(shí)驗(yàn)?zāi)┢?，大鼠?jīng)留置的股骨線灌注溫和的PBS，繼之以4%仲甲醛。手術(shù)移除左側(cè)腎，并保存于4%仲甲醛以用于隨后的組織學(xué)分析。急性腎功能衰竭經(jīng)常被定義為血清肌酐水平從基線急劇增加。血清肌酐至少0.5mg/dL或者44.2i!m0l/L的增加被認(rèn)為指示急性腎功能衰竭。血清肌酐在手術(shù)前時(shí)間零點(diǎn)和ARF手術(shù)后1天、3天、5天和7天測量。用于本試驗(yàn)的治療和預(yù)防ARF的特別優(yōu)選的化合物是根據(jù)結(jié)構(gòu)(IV)的實(shí)施方案的CASP2_4siRNA化合物，其中(N')y(有義鏈)包含在位置18的L-DNA(結(jié)果示于下文標(biāo)題為“組2”的表)或者其中(N')y(有義鏈)包含在位置17和18的L-DNA(結(jié)果示于下文標(biāo)題為“組3”的表)，并且其中(N)x(反義鏈)包含交替的修飾的和未修飾的核糖核苷酸，其中所述修飾的核糖核苷酸包含2'OMe修飾。使用安慰劑的結(jié)果示于下文標(biāo)題為“組1”的表中。SiRNA化合物還可包含(N')y中在位置15的DNA核苷酸和/或位置2的L-DNA核苷酸。如下文結(jié)果所顯示，在缺血-再灌注損傷后1和3天，繼夾緊后4小時(shí)施用的Casp2_4siRNA化合物降低了肌酐水平的升高。發(fā)現(xiàn)在夾緊前施用siRNA化合物對缺血再灌注也有預(yù)防作用。組1在夾緊后4小時(shí)注射安慰劑的動(dòng)物的血清肌酐水平(mg/dL)。<table>tableseeoriginaldocumentpage72</column></row><table>組2在夾緊后4小時(shí)注射CASP2_4siRNA(L-DNA位于有義鏈的位置18，12mg/kg)治療的動(dòng)物的血清肌酐水平。<table>tableseeoriginaldocumentpage72</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage73</column></row><table>組3在夾緊后4小時(shí)注射CASP2_4siRNA(L-DNA位于有義鏈的位置17和18，12mg/kg)治療的動(dòng)物的血清肌酐水平。<table>tableseeoriginaldocumentpage73</column></row><table>在上述模型系統(tǒng)中測試了表B(B1_B74)、表C(C1_C4)和表D(D1_D34)的siRNA化合物，特別是針對表A的特異性促凋亡基因，尤其是基因TP53BP2、LRDD、CYBA、ATF3、CASP2、HRK、CIQBP、BNIP3、MAPK8、MAPK14、RAC1、GSK3B、P2RX7、TRPM2、PARG、CD38、STEAP4、BMP2、CX43、TYROBP、CTGF和SPP1)的siRNA，并發(fā)現(xiàn)其對缺血再灌注有預(yù)防作用。實(shí)施例3壓瘡或壓迫件潰瘍樽型系統(tǒng)壓瘡或壓迫性潰瘍包括糖尿病性潰瘍，是在持續(xù)的壓力(通常來自床或輪椅)將循環(huán)截留到身體易損部分，尤其是臀部(buttock)、髖部(hip)和腳跟上的皮膚時(shí)，形成的損傷的皮膚和組織區(qū)域。缺乏充足血流致使受影響的組織的缺血性壞死和潰瘍。壓瘡最常發(fā)生于知覺減弱或缺失的病人，或者是虛弱、消瘦、癱瘓或長期臥床的人。覆蓋骶骨、坐骨、大轉(zhuǎn)子(greatertrochanters)、外踝和腳跟的組織是尤其易受影響的；視病人的情況而定，可包括其他位點(diǎn)。在小鼠模型中測試用于治療壓瘡、潰瘍及類似創(chuàng)傷的本發(fā)明的活性抑制劑(比如siRNA化合物)，該模型描述于Reid等人，JSurg.Res.116172-180，2004。此外的兔模型描述于Mustoe等人JCI，1991.87(2):694_703；Ahn和Mustoe，AnnPISurg,1991.24(1)17-23，并被用于測試本發(fā)明的siRNA化合物。根據(jù)表B(B1-B74)、表C(C1-C4)和表D(D1-D34)的siRNA化合物并且特別是針對基因CIQBP、RAC1、GSK3B、P2RX7、TRPM2、PARG、CD38、STEAP4、BMP2、CX43或TYR0BP的化合物在動(dòng)物模型中測試，該測試顯示這些siRNA化合物治療和預(yù)防壓瘡和潰瘍。實(shí)施例4慢件阻塞件肺病(C0PD)樽型系統(tǒng)慢性阻塞性肺病(C0PD)的主要特征是肺氣腫，肺氣腫是末端細(xì)支氣管遠(yuǎn)側(cè)的外周氣室的永久性損壞。肺氣腫也以炎性細(xì)胞如巨噬細(xì)胞和中性粒細(xì)胞在細(xì)支氣管和肺泡結(jié)構(gòu)中的積聚為特征。肺氣腫和慢性支氣管炎可作為慢性阻塞性肺病的部分發(fā)生或獨(dú)立地發(fā)生。在如下文所公開的動(dòng)物模型中測試用于治療C0PD/肺氣腫/慢性支氣管炎的本發(fā)明的活性抑制劑(比如siRNA)Starcher禾口Williams，1989.Lab.Animals，23:234_240;Peng等，2004;AmJRespirCritCareMed，169:1245_1251;Jey￡iseel￡m，2004.Infect。Immunol，72:7247-56。其他的模型描述于PCT專利公布WO2006/023544，其轉(zhuǎn)讓給本申請的受讓人，其在此通過引用并入本申請。根據(jù)表B(B1_B74)，表C(C1_C4)和表D(D1_D34)的siRNA，并且特別是針對基因CIQBP、BNIP3、GSK3B、P2RX7、TRPM2、PARG、CD38、STEAP4、BMP2、CX43、TYR0BP、CTGF和DU0X1的siRNA在這些動(dòng)物模型中進(jìn)行了測試，該測試表明這些siRNA化合物可治療和/或預(yù)防肺氣腫、慢性支氣管炎和C0PD。實(shí)施例5脊髓損傷模型系統(tǒng)脊髓損傷，或脊髓病，是脊導(dǎo)致感覺和/或運(yùn)動(dòng)喪失的髓障礙。兩種最常見的類型是創(chuàng)傷引起的脊髓損傷和疾病引起的脊髓損傷。創(chuàng)傷常常是由車禍、跌倒、槍擊、潛水事故等引起的，并且可影響脊髓的疾病包括脊髓灰質(zhì)炎、脊柱裂、腫瘤和弗里德賴希共濟(jì)失調(diào)。注射到損傷脊索后神經(jīng)元對siRNA分子的吸收在脊髓挫傷后和未受傷大鼠中檢察了不同類型細(xì)胞中Cy3標(biāo)記的siRNA(注射到受傷脊索)的吸收。制備低溫切片，并利用四種不同抗體組進(jìn)行免疫染色，以測定神經(jīng)元、星形神經(jīng)膠質(zhì)、少突膠質(zhì)細(xì)胞和/或巨噬細(xì)胞/小神經(jīng)膠質(zhì)是否發(fā)生了吸收。神經(jīng)元的標(biāo)志物包括NeuN或GAP43；星形神經(jīng)膠質(zhì)和潛能神經(jīng)干細(xì)胞的標(biāo)志物包括GFAP、巢蛋白或波形蛋白；少突膠質(zhì)細(xì)胞的標(biāo)記物包括NG2或APC；巨噬細(xì)胞/小神經(jīng)膠質(zhì)的標(biāo)志物包括ED1或Iba-1(Hasegawa等人，2005.ExpNeurol193:394_410)。大鼠被注入兩種不同劑量的Cy3標(biāo)記siRNA(1Pg/yl，10yg/yl)，放置1天和3天后處死。組織學(xué)分析表明許多長的細(xì)絲狀側(cè)影(filamentousprofile)吸收標(biāo)記的siRNA及其他突起(process)和細(xì)胞體。用針對MAP2的抗體免疫染色識別標(biāo)記被吸收進(jìn)入到樹突和神經(jīng)元包括運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元的細(xì)胞體。用對星形細(xì)胞或巨噬細(xì)胞特異的其他抗體的染色揭示與神經(jīng)元相比有較低的Cy3標(biāo)記siRNA的吸收。這些結(jié)果表明注射到損傷脊索的siRNA分子將到達(dá)神經(jīng)元包括運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元的細(xì)胞體和樹突。根據(jù)表B(B1_B74)、表C(C1_C4)和表D(D1_D34)的siRNA化合物，并且特別是針對基因LRDD、CYBA、ATF3、CASP2、HRK、CIQBP、BNIP3、MAPK8、MAPK14、RACKGSK3B、P2RX7、TRPM2、PARG、CD38、STEAP4、BMP2、CX43、TYROBP、CTGF和RH0A的siRNA在所述動(dòng)物模型中進(jìn)行測試，該測試顯示這些siRNA化合物促進(jìn)脊髓損傷后的功能恢復(fù)，并因此可用來治療脊髓損傷。實(shí)施例6青光眼樽型系統(tǒng)在動(dòng)物模型中測試用于治療或預(yù)防青光眼的本發(fā)明的活性抑制劑，例如如Pease等人J.Glaucoma，2006，15(6):512_9所描述(ManometriccalibrationandcomparisonofTonoLabandTonoPentonometersinratswithexperimentalglaucomaandinnormalmice(具有實(shí)驗(yàn)性青光眼的大鼠和正常小鼠中的壓力計(jì)校正以及TonoLab和TonoPen眼壓計(jì)的比較))。根據(jù)表B(B1-B74)、表C(C1-C4)和表D(D1-D34)的siRNA,特別是針對基因TP53BP2、LRDD、CYBA、ATF3、CASP2、HRK、BNIP3、MAPK8、MAPK14、RAC1和RH0A的siRNA在所述動(dòng)物模型中進(jìn)行測試，該測試顯示這些siRNA化合物治療和/或預(yù)防青光眼。實(shí)施例6A缺血件視神經(jīng)病變(I0N)樽型系統(tǒng)使用視神經(jīng)壓軋傷(crushinjury)方案在成年Wistar大鼠中建立缺血性視神經(jīng)病變的動(dòng)物模型。視神經(jīng)壓軋前七天，通過向上丘施用逆向示蹤劑FlUoroGold(2%，F(xiàn)luorochrome,Englewood,CO)選擇性標(biāo)記視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞(RGC)。示蹤劑通過沿RGC軸突的逆向運(yùn)輸而運(yùn)輸，致使所有RGC在熒光示蹤劑注射后1周內(nèi)完全和特異的標(biāo)記。在逆向示蹤后7天，動(dòng)物接受視神經(jīng)壓軋?？魞?nèi)視神經(jīng)通過眶上方法暴露，并且通過在距篩板2mm處用鑷子壓軋10秒橫切視神經(jīng)中的所有軸突。在視神經(jīng)壓軋的同時(shí)，將CaSp2_4SiRNA化合物的PBS以20Pg/5iU的單一劑量用玻璃微量吸液管顯微注射到距視神經(jīng)乳頭前2mm的玻璃體(Casp2_4有義序列GCCAGAAUGUGGAACUCCU，SEQIDNO139；反義序列AGGAGUUCCACAUUCUGGC,SEQIDNO140；有義鏈包含在位置17和18的L-DNA并且反義鏈包含交替的修飾的和未修飾的核糖核苷酸，其中所述修飾的核糖核苷酸包含2'OMe修飾)。視神經(jīng)壓軋后7天通過計(jì)算平鋪的視網(wǎng)膜上FluoroGold-標(biāo)記的RGC測定RGC的存活率。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物在視神經(jīng)壓軋后1周用4%仲甲醛進(jìn)行快速灌注(perfusedtranscardially)。解剖出兩個(gè)視網(wǎng)膜，另外固定30min，并平鋪在載玻片上，以定量神經(jīng)節(jié)細(xì)胞層，在各視網(wǎng)膜的16個(gè)不同區(qū)計(jì)算出熒光性RGC的數(shù)量，測定與樣品相比的RGC的存活百分比，該樣品獲自根本未經(jīng)視神經(jīng)壓軋傷的大鼠，或獲自在視神經(jīng)壓軋傷以外注射PBS、對照siRNA或GFPsiRNA的大鼠。其可能在染色RGC的吞噬后結(jié)合FluoroGold的小神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞通過其特征形態(tài)學(xué)區(qū)分，并排除于定量分析。下表所示的結(jié)果揭示與非相關(guān)siRNA化合物治療的動(dòng)物相比，用Casp2_4化合物治療的動(dòng)物中RGC的存活％的超過兩倍的增加。RGC存活率的定量N=4視網(wǎng)膜/處理PBSsiGFPCasp2—4siRNA對照siRNARGC的存活％25.5257726.1214259.0419725.4434575<table>tableseeoriginaldocumentpage76</column></row><table>利用另一視神經(jīng)軸突切斷(axotomy)模型獲得相似的結(jié)果，在該模型中通過橫斷接近于眼的視神經(jīng)而軸突切斷RGC的整個(gè)群體(ChengL、SapiehaP、KittlerovaP、HauswirthWW、DiPoloATrkBGeneTransferProtectsRetinalGanglionCellsfromAxotomy-InducedDeathInVivo(基因轉(zhuǎn)移在體內(nèi)保護(hù)視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞免于軸突切斷誘導(dǎo)的死亡)J.Neurosci.May15,20022002;22:3977-3986)。ti^i丨7大鼠沖fl市首后缺血/wMmmmmm^t用于治療或預(yù)防肺移植后缺血/再灌注損傷或缺氧損傷的本發(fā)明的活性抑制劑的測試是在一個(gè)或多個(gè)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型中完成的，例如如以下所描述的MiZObUChi等，2004年，J.HeartLungTransplant，23:889_93;Huang等，1995，J.HeartLungTransplant.14:S49；Matsumura1995,Transplantation591509-1517；Wilkes等，1999.Transplantation67890-896；Naka^1996,CirculationResearch,79:773_783。在這些動(dòng)物模型中測試根據(jù)表B(B1-B74)、表C(C1_C4)和表D(D1_D34)的siRNA，且特別是針對TP53BP2、LRDD、CYBA、CASP2、BNIP3、RAC1、和DU0X1的siRNA，該測試顯示這些siRNA化合物治療和/或預(yù)防肺移植后缺血_再灌注損傷，并因此可與移植手術(shù)聯(lián)合使用。^施徹丨8■.^MmAmim^mm^在動(dòng)物模型中測試用于治療急性呼吸窘迫綜合征的本發(fā)明的活性抑制劑，該動(dòng)物模型如Chen等人描述(JBiomedSci.200310(6Ptl):588_92)。根據(jù)表B(B1-B74)、表C(C1-C4)和表D(D1-D34)的siRNA化合物，特別是針對基因CYBA、HRK、BNIP3、MAPK8、MAPK14、RACKGSK3B、P2RX7、TRPM2、PARG、SPP1和DU0X1的siRNA化合物在該動(dòng)物模型中測試，該測試顯示這些siRNA治療和/或預(yù)防急性呼吸窘迫綜合征并因此可用于治療該病癥。實(shí)施例9聽力損失病癥的樽型系統(tǒng)(i)在耳圓窗局部應(yīng)用后耳蝸中Cy3_PTENsiRNA的分布1ug/100u1的Cy3_PTENsiRNA(總計(jì)0.3-0.4iig)PBS溶液應(yīng)用于南美洲栗鼠的圓窗。處死南美洲栗鼠后，分析圓窗施用siRNA后24-48小時(shí)治療的耳蝸中Cy3_標(biāo)記的細(xì)胞。在24h和48h后耳蝸中標(biāo)記模式相似且包括耳蝸底轉(zhuǎn)、耳蝸中轉(zhuǎn)和耳蝸頂轉(zhuǎn)中的標(biāo)記。Cy3-PTENsiRNA在鼓階上的應(yīng)用揭示標(biāo)記主要位于耳蝸底轉(zhuǎn)和耳蝸中轉(zhuǎn)。Cy3信號持續(xù)到施用Cy3-PTENsiRNA后的15天。本發(fā)明的siRNA化合物在動(dòng)物模型中測試，該測試顯示這些siRNA化合物向耳蝸底轉(zhuǎn)、中轉(zhuǎn)和頂轉(zhuǎn)的顯著滲透，而且這些化合物可用于聽力損失的治療。(ii)碳鉬誘導(dǎo)的或順鉬誘導(dǎo)的耳蝸毛細(xì)胞死亡的南美洲栗鼠模型通過向每只動(dòng)物的左耳直接施用溶于鹽水中的特異性siRNA對南美洲栗鼠進(jìn)行預(yù)處理。向各動(dòng)物右耳施用鹽水作為安慰劑。在本發(fā)明的特異性siRNA化合物施用后兩天，用碳鉬(75mg/kgip)或順鉬(腹膜內(nèi)灌輸13mg/kg持續(xù)30分鐘)處理動(dòng)物。在南美洲栗鼠處死(碳鉬處理后兩周)后，計(jì)算左耳(siRNA處理)和右耳(鹽水處理)內(nèi)毛細(xì)胞(IHC)和外毛細(xì)胞(0HC)中死細(xì)胞的％。計(jì)算結(jié)果是左耳(siRNA處理)中內(nèi)毛細(xì)胞(IHC)和外毛細(xì)胞的死細(xì)胞％比右耳(鹽水處理)低。(iii)聲音誘導(dǎo)的耳蝸毛細(xì)胞死亡的南美洲栗鼠模型在南美洲栗鼠中研究聲損傷模型中特異性siRNA的活性。動(dòng)物暴露于105dB的居中于4kHz的噪聲倍頻帶2.5h。暴露于噪音的南美洲栗鼠的左耳用10iiL鹽水中的30iigsiRNA預(yù)處理，右耳用溶媒(鹽水)預(yù)處理?；衔锏膭?dòng)作電位(CAP)是測定從耳蝸傳播的神經(jīng)活動(dòng)的方便和可靠的電生理學(xué)方法。為了檢測當(dāng)聲刺激，如咔噠聲或短純音突然打開時(shí)產(chǎn)生的局部場電位，用安置在接近耳蝸基底的電極記錄CAP。聲損傷后2.5周評定各耳的功能狀況。特別地，為了測定siRNA-處理的耳朵的閾值是否比未經(jīng)處理的(鹽水)耳朵的閾值低(好)，在聲損傷后2.5周測定從圓窗記錄的化合物動(dòng)作電位的平均閾值。另外，測定siRNA-處理和對照耳朵中內(nèi)毛細(xì)胞和外毛細(xì)胞的損失水平。在該動(dòng)物模型中測試根據(jù)表B(B1-B74)、表C(C1_C4)和表D(D1_D34)的siRNA分子，特別是針對基因TP53BP2、LRDD、CYBA、ATF3、CASP2、N0X3、HRK、CIQBP、BNIP3、MAPK8、MAPK14、RAC1、GSK3B、P2RX7、TRPM2、PARG、CD38、STEAP4、BMP2、CX43、TYR0BP和CTGF的siRNA分子，該測試顯示siRNA-處理耳朵的閾值比未經(jīng)處理的(鹽水)耳朵的低(好)。另外在siRNA-治療耳朵中內(nèi)毛細(xì)胞和外毛細(xì)胞損失的數(shù)量比對照耳朵低。實(shí)施例10骨關(guān)節(jié)炎(OA)動(dòng)物樽型膠原誘導(dǎo)的關(guān)節(jié)炎(CIA)小鼠中CIA描述于Trentham等(1977.J.Exp.Med.146857-868)。佐劑誘導(dǎo)的關(guān)節(jié)炎(AA):AA描述于Kong等(1999.Nature，402:304_308)。半月軟骨切除術(shù)(menisectomy)模型描述于Han等(1999.NagoyaJMedSci62(3-4)115-26)。用除本領(lǐng)域中已知的體外模型以外，使用上述模型中的一種或多種來評價(jià)不同siRNA抑制劑如針對SSP1的siRNA對0A相關(guān)的參數(shù)，如軟骨細(xì)胞增殖、末端分化和關(guān)節(jié)炎發(fā)展的效應(yīng)。在這些動(dòng)物模型中測試針對表A中特定的促凋亡基因，特別是針對SSP1的siRNA化合物，該測試顯示這些siRNA治療和/或預(yù)防0A并因此可用來治療該病癥。實(shí)施例11移植-相關(guān)急性腎損傷的大鼠模型系統(tǒng)熱缺血-切除測試大鼠中的左腎，繼之以自體移植產(chǎn)生45分鐘的熱腎移植保存期。繼自體移植之后，切除同一大鼠的右腎。在收獲腎移植物之前(模擬供體治療)(“前”)，或腎自體移植后(模擬受體治療)，或在收獲前和移植后(聯(lián)合的供體和受體治療)(“前-后”)，經(jīng)股靜脈靜脈內(nèi)施用針對靶的化學(xué)修飾的siRNA。冷缺血_切除供體動(dòng)物的左腎，然后低溫保存(在冰上)收獲的腎5小時(shí)的時(shí)間段。這一時(shí)間段結(jié)束時(shí)，對受體大鼠進(jìn)行雙側(cè)腎切除，繼之以移植低溫保存的腎移植物。熱缺血時(shí)間總計(jì)(包括手術(shù)過程)為約30分鐘?；蛟谀I收獲前(“前”)向供體動(dòng)物，或在移植后15分鐘(15min后)或4小時(shí)(4小時(shí)后)向受體動(dòng)物經(jīng)股靜脈靜脈內(nèi)施用化學(xué)修飾的siRNA。為評價(jià)siRNA在改善移植后腎功能中的效力，測量熱缺血和冷缺血模型中移植后1、2和7天的血清肌酐水平。77實(shí)施例12針對促凋亡基因的活件siRNA化合物序列的產(chǎn)牛及siRNA的產(chǎn)牛利用專有算法和任何基因，任選地此處公開的促凋亡基因的已知序列，形成許多潛在siRNA的序列。除算法外，23-mer寡聚體序列中的一些是通過5'和/或3'延伸19-mer序列產(chǎn)生的。用該方法產(chǎn)生的序列與相應(yīng)mRNA序列完全互補(bǔ)。表B(B1_B74)、表C(C1_C4)和表D(D1_D34)顯示以下促凋亡基因的siRNA腫瘤蛋白P53結(jié)合蛋白，2(TP53BP2)；含有富含亮氨酸重復(fù)序列和死亡結(jié)構(gòu)域(LRDD)；細(xì)胞色素b-245，a多肽(CYBA)；激活轉(zhuǎn)錄因子3(ATF3)；半胱天冬酶2，凋亡相關(guān)半胱氨酸肽酶(神經(jīng)前體細(xì)胞表達(dá)，發(fā)育下調(diào)2)(CASP2)；NADPH氧化酶3(N0X3)；harakiri,BCL2相互作用蛋白(只包括BH3結(jié)構(gòu)域)(HRK)；補(bǔ)體成分l，q子成分結(jié)合蛋白(C1QBP)；BCL2/腺病毒E1B19kDa相互作用蛋白3(BNIP3)；絲裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)；絲裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)；ras相關(guān)C3肉毒桿菌毒素底物1(Rho家族小GTP結(jié)合蛋白Racl)；糖原合酶激酶30(GSK3B)；嘌呤能受體P2X，配體門控離子通道，7(P2RX7)；瞬時(shí)受體電位陽離子通道，亞家族M，成員2(TRPM2)；聚(ADP-核糖)糖原水解酶(PARG)；CD38分子(CD38)；STEAP家族成員4(STEAP4)；骨形態(tài)發(fā)生蛋白2-BMP2；間隙連接蛋白，al，43kDa(連接蛋白43)(GJA1)；TYR0蛋白酪氨酸激酶結(jié)合蛋白(TYR0BP)；結(jié)締組織生長因子(CTGF)；分泌磷蛋白1(骨橋蛋白，SPP1)；ras同源基因家族成員A(RH0A)；雙氧化酶1(DU0X1)。對于每個(gè)基因有獨(dú)立的19-mer、21-mer和23-mersiRNA序列的列表，所述序列基于它們在專有性算法中作為靶向人類基因表達(dá)的最佳序列的得分按優(yōu)先次序列出。實(shí)施例13修飾的siRNA用于siRNA化合物中的某些結(jié)構(gòu)基序已被測試，并顯示具有活性或穩(wěn)定性。對于表B(B1-B74)、表C(C1-C4)和表D(D1_D34)中所示的任一序列，結(jié)構(gòu)C_H被證明有活性和或穩(wěn)定性。其它活性結(jié)構(gòu)包括具有根據(jù)結(jié)構(gòu)(IX)-(XI)的結(jié)構(gòu)基序的siRNA。包含如表B(B1-B74)，表C(C1-C4)和表D(D1_34)所示的序列和如結(jié)構(gòu)(I)_(XI)所示的基序的化合物顯示于本文的圖23。在一實(shí)例中，用不同的結(jié)構(gòu)基序測試其中x=y=19的CASP2siRNA并比較活性和穩(wěn)定性。在第一個(gè)化合物(CASP2-i)中(N)x(反義)由交替的2'-0Me修飾的和未修飾的核糖核苷酸組成；位于(N')y(有義鏈)3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵連接并且在(N')y的5'末端的三個(gè)核苷酸是LNA。在第二個(gè)化合物(CASP2-ii)中(N)x由未修飾的核糖核苷酸組成；在(N')y的3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過兩個(gè)2'-5'磷酸二酯鍵相連并且在(N')y的5'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸是LNA。在第三個(gè)化合物(Casp2-iii)中，位于(N)x的5'末端的兩個(gè)連續(xù)核苷酸(最末端和倒數(shù)第二位的核苷酸)是2'_0Me修飾的核糖核苷酸并且在(N')y的3'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸通過2'-5'磷酸二酯鍵相連并且在(N')y的5'末端的三個(gè)連續(xù)核苷酸是LNA。這些分子顯示于下表E并且其活性由人HeLa細(xì)胞中的％抑制表示，而且IC50顯示于表F。該化合物在HeLa細(xì)胞中被證明具有活性(>50%抑制)。進(jìn)一步測試該化合物的血清穩(wěn)定性。結(jié)構(gòu)CASP2-1在人血清中穩(wěn)定24小時(shí)。CASP2-ii和CASP2_iii顯示出超過24小時(shí)的穩(wěn)定性，只鑒定出低水平的降解產(chǎn)物。寡聚體是基于CASP2的序列，其可被示于表B(B1-B74)、表C(C1-C4)或表D(D1-D34)的任何有義和反義對或多個(gè)有義和反義對替代。<table>tableseeoriginaldocumentpage79</column></row><table>表g顯示基于結(jié)構(gòu)(e)的19-mer和23-mersirna化合物(大鼠p53)，其中加下劃線的核苷酸是l-dna核苷酸。在這些化合物中，(n)x和(n')y中的每一個(gè)包含未修飾的核糖核苷酸，其中3'倒數(shù)第二位的核苷酸或3'倒數(shù)第二位的兩個(gè)連續(xù)核苷酸是l-dna核苷酸。寡聚體是基于p53的序列，該序列可被示于表b(b1-b74)、表c(c1-c4)或表d(d1_d34)的任何有義和反義對或多個(gè)有義和反義對替代。表g<table>tableseeoriginaldocumentpage79</column></row><table><table>tableseeoriginaldocumentpage80</column></row><table>a)在表達(dá)內(nèi)源p53的細(xì)胞中，測試了具有圖6A所示結(jié)構(gòu)的針對p53基因的siRNA化合物(20nM)抑制基因表達(dá)的能力。在圖6A中5=2'-5〃橋接核糖尿苷；6=2‘_5〃橋接核糖腺嘌呤；7=2'-5"橋接核糖胞嘧啶；和8=2'-5"橋接核糖鳥嘌呤。下劃線表明2'-0-甲基化核苷。MM結(jié)構(gòu)號1-3、10和12轉(zhuǎn)染后觀察到90_95%抑制。結(jié)構(gòu)#4和#15轉(zhuǎn)染后觀察到80-85%抑制。其它結(jié)構(gòu)有較小活性。圖6B顯示上述結(jié)構(gòu)中的一些結(jié)構(gòu)的血清穩(wěn)定性。b)與CASP2有關(guān)的2'結(jié)構(gòu)的結(jié)果在上述測定中測試針對CASP2的圖7A所示的siRNA化合物。由2'-5'橋連接的核苷酸用在它們之間的星號(*)顯示。結(jié)果示于圖7B，表明針對CASP2的全部4個(gè)siRNA有活性并產(chǎn)生75_92%抑制。c)與DDIT4(REDD2)有關(guān)的2'結(jié)構(gòu)的結(jié)果在上述測定中測試針對DDIT4并顯示于圖8A的siRNA化合物。由2'-5'橋連接的核苷酸用它們之間的星號顯示。在上述測定中siRNA化合物1和3是有活性的，并且產(chǎn)生內(nèi)源基因的60%抑制。d)與QM5有關(guān)的2'-5'結(jié)構(gòu)的結(jié)果在上述測定中測試針對小鼠p53的圖8B所示的siRNA化合物。由2'-5'橋連接的核苷酸用它們之間的星號顯示。結(jié)構(gòu)1和3產(chǎn)生90-95%抑制；結(jié)構(gòu)4產(chǎn)生70%抑制和結(jié)構(gòu)2產(chǎn)生大約50%抑制。e)具有2'和2'_0_甲基組合修飾的其他結(jié)構(gòu)在上述測定中測試針對p53(QM5siRNA)的圖9A-9B所示的siRNA化合物。經(jīng)2'-5'橋連接的核苷酸用它們之間的星號表明。2'-OMe修飾的核苷酸加下劃線顯示。結(jié)果表示于圖9C、9D和9E；上述結(jié)構(gòu)中的許多結(jié)構(gòu)引起超過90%抑制。f)具有2'-5'和2'-0-甲基組合修飾的其他23-mer結(jié)構(gòu)在上述測定中測試針對p53的圖IOA所示的siRNA化合物。用2’-5'橋連接的核苷酸用它們之間的星號顯示。2’-OMe修飾的核苷酸加下劃線顯示。結(jié)果表示于圖10B。結(jié)構(gòu)1-3引起80-95%抑制。圖IOC和IOD表示在SS具有2'5'鍵合并在AS有交替的甲基化模式的結(jié)構(gòu)的血清穩(wěn)定性結(jié)果。g)在上述測定中測試針對CASP2的圖IlA所示的siRNA化合物。2’-OMe修飾的核苷酸用下劃線顯示并且經(jīng)2'-5'橋連接的核苷酸用它們之間的星號顯示。結(jié)果顯示于圖11B，并且表明結(jié)構(gòu)3-5引起大約70_95%抑制。h)在上述測定中測試針對CASP2的圖12A所示的siRNA化合物。由2’-5'橋連接的核苷酸用它們之間的星號顯示。結(jié)果表示于圖12B，并且表明結(jié)構(gòu)3-5引起大約80_95%抑制。^mm16在表達(dá)內(nèi)源p53的細(xì)胞中，測試了針對p53基因并具有如圖13A所示結(jié)構(gòu)的siRNA化合物(5nM和20nM)抑制基因表達(dá)的能力。注意下劃線顯示的核苷酸是鏡像DNA核苷酸即L-脫氧核糖核苷酸。MM在結(jié)構(gòu)1-3、10、12和15轉(zhuǎn)染后觀察到80_95%抑制。在兩條鏈上包含交替的核苷酸的結(jié)構(gòu)16作為陽性對照。其它結(jié)構(gòu)顯示低到中等活性。結(jié)果顯示于圖13B。圖13C顯示了包含L-DNA核苷酸單體(以共價(jià)鍵連接到相鄰核苷酸單體)的siRNA化合物的血清穩(wěn)定性。用siRNA#l的活性測定的更多結(jié)果表明0.09nM的IC50。該活性水平比在兩條鏈上有交替的甲基化結(jié)構(gòu)的相同序列大2倍，該相同序列具有0.23nM的IC50(參見圖13D)。_仿丨丨17伺含LNA■一棘_果在表達(dá)內(nèi)源p53的細(xì)胞中，測試了針對p53基因并具有如圖14A所示結(jié)構(gòu)的siRNA化合物(5nM和20nM)抑制基因表達(dá)的能力。注意下劃線顯示的是LNA核苷酸。使用實(shí)施例1中呈現(xiàn)的相同測定。MM在結(jié)構(gòu)10、12和15轉(zhuǎn)染后觀察到80_95%抑制。其它結(jié)構(gòu)顯示低到中等活性。結(jié)果顯示于圖14B。實(shí)施例18串聯(lián)和星形結(jié)構(gòu)圖15和16分別顯示了串聯(lián)siRNA和“星形”siRNA結(jié)構(gòu)的實(shí)例和血清穩(wěn)定性。實(shí)施例19具有多重修飾類型的siRNA化合物圖17A-17C顯示了包含在多個(gè)位置的修飾的核苷酸單體(以共價(jià)鍵與相鄰核苷酸單體連接)的CASP2siRNA化合物，及測量于20nM并顯示％靶基因敲低(knockdown,KD)的該化合物的活性。在圖17A中，粗體下劃線字母表示2'甲氧基修飾的核苷酸；大寫斜體字母表示包含2'5'核苷酸間鍵合和3'甲氧基修飾的核苷酸。在圖17B中粗體下劃線字母表示2'甲氧基修飾的核苷酸；大寫斜體字母表示包含P-乙氧基核苷酸間鍵合的核苷酸。在圖17C中粗體下劃線字母表示2'甲氧基修飾的核苷酸；大寫斜體字母表示包含2'5'核苷酸間鍵合的核苷酸，斜體字小寫字母表示L-DNA修飾的核苷酸，并且小寫字母表示LNA(2‘0-4'C)核苷酸。實(shí)施例20包含脫氧核糖核苷酸的結(jié)構(gòu)圖18顯示CASP2_4siRNA反義鏈(AS)和有義鏈⑶的實(shí)例，其鏈包含在多個(gè)位置的DNA單體(粗斜體字母，并共價(jià)連接到相鄰核苷酸單體)。siRNA化合物通過組合任何有義鏈和任何反義鏈而合成。在圖18中5=2'0甲基化核糖尿苷；6=2'0甲基化核糖腺嘌呤；7=2'0甲基化核糖胞嘧啶；和8=2'0甲基化核糖鳥嘌呤。圖19A-19D表示以CASP2_4和RhoA_24序列為例說明的L-DNA基序的實(shí)例。圖19A顯示了在RNAi中有用的靶向CASP2的兩個(gè)優(yōu)選的雙鏈的雙鏈體。圖19B表示包含L-DNA核苷酸的CASP2_4雙鏈體(n=L-DNA(L-脫氧核糖核苷酸)(加下劃線并大寫)_2'-0Me核糖核苷酸；Lc-L-脫氧胞嘧啶核苷5'-突出端；ab_脫堿基假脫氧核糖核苷酸類似物。圖19C顯示了包含未修飾核糖核苷酸、DNA核苷酸和L-DNA核苷酸類似物的組合的CASP2_4有義寡核苷酸和包含交替的未修飾的和修飾的核糖核苷酸的CASP2_4反義寡核苷酸，它們用于制備展示出RNAi活性的雙鏈體。圖19D顯示了CASP2_4修飾的雙鏈體的活性和穩(wěn)定性。圖19E顯示了以在一個(gè)或兩個(gè)3'末端有和沒有3'磷酸酯的RhoA_24序列為例說明的某些雙鏈體基序。棚列21伺邏堿某、躺-脫纖、2'0-鴨、辦i咸·力··_廹圖20描述這樣的結(jié)構(gòu)，其在治療在此公開的任何病癥中是有效的。在圖20A-20G中核苷酸類似物和假核苷酸的圖例如下所示加下劃線的大寫字母“N”-2'OMe核糖核苷酸；“ab“-脫堿基假核苷酸；I-反向脫堿基假核苷酸；斜體“5N”=5'OMeDNA；白色大寫“N”_LNA；斜體小寫下劃線η=L-DNA；刪除線N-錯(cuò)配。圖20Α集合1顯示包含靶序列的脫堿基錯(cuò)配的反義鏈；寡核苷酸缺少3'磷酸酯；圖20Β集合2顯示用于制備在ds結(jié)構(gòu)中具有少于15bp的雙鏈體化合物的寡核苷酸；寡核苷酸缺少3'磷酸酯；圖20C集合3顯示具有至少一個(gè)靶序列錯(cuò)配的插入的寡核苷酸。圖20D-20E集合4和5顯示包含脫堿基假核苷酸或核苷酸(“ab”)的AS鏈，該鏈與集合1中的有義鏈配對。圖20F集合6顯示包含脫堿基假核苷酸或者核苷酸(“ab”)的AS鏈，該鏈與未修飾的有義鏈配對；圖20G集合7顯示與集合1中的有義鏈配對的未修飾的AS鏈。圖21顯示在制備具有RNAi活性的寡核苷酸中有用的非堿基配對核苷酸類似物中堿基修飾的實(shí)例。(顯示化學(xué)結(jié)構(gòu)的列中，dR表示與脫氧核糖部分的連接點(diǎn)；R表示與核糖部分的連接點(diǎn))。權(quán)利要求一種化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(IX)(IX)5′(N)x-Z3′(反義鏈)3′Z′-(N′)y-z″5′(有義鏈)其中N和N′中的每一個(gè)為可以是未修飾的或修飾的核糖核苷酸或非常規(guī)部分；其中(N)x和(N′)y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N′通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N′連接的寡核苷酸；其中Z和Z′可存在或不存在，但是如果存在，則獨(dú)立地是共價(jià)連接到其所存在的鏈的3′末端的1-5個(gè)連續(xù)核苷酸；其中z″可存在或不存在，但是如果存在，則是共價(jià)連接到(N′)y的5′末端的加帽部分；其中x＝18到27；其中y＝18到27；其中(N)x包含修飾的和未修飾的核糖核苷酸，每個(gè)修飾的核糖核苷酸在其糖基上具有2′-O-甲基，其中在(N)x的3′末端的N是修飾的核糖核苷酸，(N)x包含從3′末端開始的至少5個(gè)交替的修飾的核糖核苷酸和共計(jì)至少9個(gè)修飾的核糖核苷酸，并且每個(gè)剩余的N是未修飾的核糖核苷酸；其中在(N′)y中存在至少一個(gè)非常規(guī)部分，該非常規(guī)部分可能是脫堿基核糖部分、脫堿基脫氧核糖部分、修飾的或未修飾的脫氧核糖核苷酸、鏡像核苷酸，和通過2′-5′核苷酸間磷酸鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸；和其中(N)x的序列與(N′)y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N′)y的序列與靶基因編碼的mRNA的序列基本上相同。2.根據(jù)權(quán)利要求10所述的化合物，其中χ=y=19。3.根據(jù)權(quán)利要求10所述的化合物，其中χ=y=23。4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的化合物，其中所述至少一個(gè)非常規(guī)部分存在于位置15、16、17或18。5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的化合物，其中所述至少一個(gè)非常規(guī)部分是鏡像核苷酸。6.根據(jù)權(quán)利要求5所述的化合物，其中鏡像核苷酸存在于位置17、位置18或位置17和18。7.根據(jù)權(quán)利要求1所述的化合物，其中(N')y包含至少5個(gè)脫堿基核糖部分或脫堿基脫氧核糖部分。8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的化合物，其中至少一個(gè)N'是LNA。9.根據(jù)權(quán)利要求1所述的化合物，其中(N)x包含9個(gè)交替的修飾的核糖核苷酸。10.根據(jù)權(quán)利要求1所述的化合物，其中存在Z“。11.根據(jù)權(quán)利要求1所述的化合物，其中(N)y包含在位置17、位置18或兩個(gè)位置17和18的鏡像核苷酸；其中(N')y包含在位置1、3、5、7、9、11、13、15、17、19的2'O-Me修飾的核糖核苷酸；且其中所述靶基因是CASP2。12.一種化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(X)(X)5'(N)x-Z3'(反義鏈)3'Z'-(N')y-z"5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)為可以是未修飾的或修飾的核糖核苷酸或非常規(guī)部分；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'可存在或不存在，但是如果存在，則獨(dú)立地是共價(jià)連接到其所存在的鏈的3'末端的1-5個(gè)連續(xù)核苷酸；其中Z“可存在或不存在，但是如果存在，則是共價(jià)連接到(N')y的5'末端的加帽部分；其中χ=18到27；其中y=18到27；其中(N)x包含修飾的或未修飾的核糖核苷酸，和任選地至少一個(gè)非常規(guī)部分；其中在(N')y中存在至少一個(gè)非常規(guī)部分，該非常規(guī)部分可能是脫堿基核糖部分、脫堿基脫氧核糖部分、修飾的或未修飾的脫氧核糖核苷酸、鏡像核苷酸、非堿基配對的核苷酸類似物或通過2'-5'核苷酸間磷酸鍵與相鄰核苷酸連接的核苷酸；和其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N')y的序列與靶基因編碼的mRNA的序列基本上相同。13.根據(jù)權(quán)利要求12所述的化合物，其中χ=y=19。14.根據(jù)權(quán)利要求12所述的化合物，其中X=y=23。15.根據(jù)權(quán)利要求12所述的化合物，其中(N)x包含修飾的和未修飾的核糖核苷酸，和至少一個(gè)非常規(guī)部分。16.根據(jù)權(quán)利要求15所述的化合物，其中(N)x包含與所述mRNA互補(bǔ)的少于15個(gè)連續(xù)核苷酸。17.根據(jù)權(quán)利要求15所述的化合物，其中在(N)x中，3'末端的N是修飾的核糖核苷酸，并且(N)x包含至少8個(gè)修飾的核糖核苷酸。18.根據(jù)權(quán)利要求17所述的化合物，其中所述至少8個(gè)修飾的核糖核苷酸中的至少5個(gè)交替開始于3'末端。19.根據(jù)權(quán)利要求12或15中任一項(xiàng)所述的化合物，其中(N')y中所述至少一個(gè)非常規(guī)部分是鏡像核苷酸。20.根據(jù)權(quán)利要求19所述的化合物，其中鏡像核苷酸存在于位置17、位置18或位置17和18。21.根據(jù)權(quán)利要求12或15中任一項(xiàng)所述的化合物，其中(N')y中所述至少一個(gè)非常規(guī)部分是脫堿基核糖部分或脫堿基脫氧核糖部分。22.根據(jù)權(quán)利要求12所述的化合物，其中存在Z“。23.一種化合物，該化合物具有如下所列的結(jié)構(gòu)(XI)(XI)5'(N)X-Z3'(反義鏈)3'Z'-(N')y-z"5'(有義鏈)其中N和N'中的每一個(gè)為可以是未修飾的或修飾的核糖核苷酸或非常規(guī)部分；其中(N)x和(N')y中的每一個(gè)是其中每個(gè)連續(xù)的N或N'通過共價(jià)鍵與下一個(gè)N或N'連接的寡核苷酸；其中Z和Z'可存在或不存在，但是如果存在，則獨(dú)立地是共價(jià)連接到其所存在的鏈的3'末端的1-5個(gè)連續(xù)核苷酸；其中ζ“可存在或不存在，但是如果存在，則是共價(jià)連接到(N')y的5'末端的加帽部分；其中χ=18到27；其中y=18到27；其中(N)x包含修飾的或未修飾的核糖核苷酸和非常規(guī)部分的組合，任何修飾的核糖核苷酸在其糖基上具有2'-O-甲基；其中(N')y包含修飾的或未修飾的核糖核苷酸和任選地非常規(guī)部分，任何修飾的核糖核苷酸在其糖基上具有2'OMe；其中(N)X的序列與(N')y的序列基本上互補(bǔ)；并且(N')y的序列與靶基因編碼的mRNA的序列基本上相同；和其中存在與所述mRNA互補(bǔ)的少于15個(gè)連續(xù)核苷酸。24.根據(jù)權(quán)利要求23所述的化合物，其中χ=y=19。25.根據(jù)權(quán)利要求23所述的化合物，其中χ=y=23。26.權(quán)利要求23所述的化合物，其中至少一個(gè)非常規(guī)部分存在于(N)X，并且是脫堿基核糖部分或脫堿基脫氧核糖部分。27.權(quán)利要求23所述的化合物，其中至少一個(gè)非常規(guī)部分存在于(N)X，并且是非堿基配對的核苷酸類似物。28.權(quán)利要求26所述的化合物，其中(N')y包含未修飾的核糖核苷酸。29.權(quán)利要求27所述的化合物，其中(N')y包含未修飾的核糖核苷酸。30.根據(jù)權(quán)利要求23-29中任一項(xiàng)所述的化合物，其中(N)x包含與mRNA互補(bǔ)的少于15個(gè)連續(xù)核苷酸。31.權(quán)利要求26所述的化合物，其中(N)x包含至少5個(gè)脫堿基核糖部分或者脫堿基脫氧核糖部分。32.權(quán)利要求23所述的化合物，其中(N)x和/或(N')y包含不與(N')y和/或(N)χ中相應(yīng)的修飾的或未修飾的核糖核苷酸堿基配對的修飾的核糖核苷酸。33.根據(jù)權(quán)利要求1-32中任一項(xiàng)所述的化合物，其中所述靶基因選自哺乳動(dòng)物和非哺乳動(dòng)物基因。34.根據(jù)權(quán)利要求33所述的化合物，其中所述哺乳動(dòng)物基因是人類基因，其中該基因編碼的mRNA如SEQIDNO:1_41或46-48之一所示。35.根據(jù)權(quán)利要求34所述的化合物，其中(N)x和(N')y的寡核苷酸序列如表B(Bl-74)、C(C1-C4)禾口D(D1_D34)(SEQIDNO:97_87，178)所示。36.一種藥物組合物，該藥物組合物包含根據(jù)權(quán)利要求1-35中任一項(xiàng)所述的化合物，和藥學(xué)上可接受的載體。37.一種在需要其的受試者中治療或預(yù)防疾病或病癥的發(fā)病率或嚴(yán)重程度的方法，其中所述疾病或病癥和/或與之相關(guān)的癥狀選自由聽力損失，急性腎功能衰竭(ARF)，青光目艮，急性呼吸窘迫綜合征(ARDS)及其他急性肺和呼吸損傷，肺移植后缺血再灌注損傷，目艮缺血病癥包括前部缺血性視神經(jīng)病變，器官移植包括肺、肝臟、心臟、胰腺和腎臟移植和包括DGF，腎毒性和神經(jīng)毒性，脊髓損傷，壓瘡，年齡相關(guān)性黃斑變性(AMD)，干眼綜合征，ION,口腔粘膜炎和慢性阻塞性肺病(COPD)組成的組，所述方法包括給受試者施用有效預(yù)防或治療所述疾病或病癥的量的根據(jù)權(quán)利要求36所述的藥物組合物。全文摘要本發(fā)明涉及具有新序列和結(jié)構(gòu)基序的siRNA化合物，所述siRNA化合物下調(diào)特定人類基因的表達(dá)。本發(fā)明還涉及包含此類化合物和藥學(xué)上可接受的載體的藥物組合物。本發(fā)明還提供了治療和/或預(yù)防與所述基因相關(guān)的各種疾病或病癥和/或與此類疾病或病癥相關(guān)的癥狀的發(fā)病率或嚴(yán)重程度的方法，所述方法包括給需要治療此類疾病或病癥和/或癥狀的受試者施用治療有效劑量的該化合物或所述藥物組合物從而治療受試者。文檔編號C07H21/02GK101815521SQ200880110087公開日2010年8月25日申請日期2008年9月4日優(yōu)先權(quán)日2007年10月3日發(fā)明者R·斯卡里特,伊戈·邁特,侯賽因·阿依古恩,列昂尼德·拜格爾曼,埃萊娜·范斯坦,夏甲·卡林斯基,詹姆士·麥克斯威根申請人:夸克醫(yī)藥公司