多肽和多核苷酸及其用于治療免疫相關失調(diào)和癌癥的用途
【專利摘要】本發(fā)明涉及LY6G6F、VSIG10、TMEM25以及LSR蛋白，它們是免疫療法，癌癥、感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的治療，以及藥物開發(fā)的適合的靶標。本發(fā)明進一步涉及可溶性LY6G6F、VSIG10、TMEM25以及LSR分子，LY6G6F、VSIG10、TMEM25以及LSR的細胞外結構域和偶聯(lián)物，它們是針對免疫療法，癌癥、感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的治療的適合的藥物。本發(fā)明進一步涉及特異性針對LY6G6F、VSIG10、TMEM25或LSR分子的抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代性支架，它們是針對免疫療法，癌癥、感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的治療的適合的藥物。
【專利說明】多肽和多核苷酸及其用于治療免疫相關失調(diào)和癌癥的用途
發(fā)明領域
[0001]本發(fā)明涉及LY6G6F、VSIGlO、TMEM25以及LSR蛋白連同可溶性分子和偶聯(lián)物以及針對此類的抗體，LY6G6F、VSIG10、TMEM25以及LSR蛋白是免疫療法，癌癥、感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的治療，以及藥物開發(fā)的適合的靶標。
[0002]發(fā)明背景
[0003]為了變得有成效地活化，原始T細胞必須接受來自抗原呈遞細胞(APC)的兩個獨立信號。第一信號I是抗原特異性的，并且當T細胞抗原受體碰到APC上的適當?shù)目乖?MHC復合體時發(fā)生。免疫應答的命運是由第二、抗原獨立性信號(信號2)決定的，該信號被通過一種T細胞共刺激分子來遞送，該T細胞共刺激分子接合其APC-表達性配體。這種第二信號可以是刺激的(正向共刺激)亦或抑制的(負向共刺激或共抑制)。在共刺激信號不存在的情況下，或在共抑制信號存在的情況下，T-細胞活化是受損的或夭折的，這可以導致抗原特異性無反應性(稱為T-細胞無反應性)的狀態(tài)，或可以導致T-細胞凋亡性死亡。
[0004]共刺激分子對通常由APC上表達的配體和T細胞上表達的其同源受體組成。共刺激分子的原型配體/受體對是B7/⑶28和⑶40/⑶40L。B7家族由結構上相關的細胞表面蛋白配體組成，這些細胞表面蛋白配體可以為免疫應答提供刺激性或抑制性輸入。B7家族的成員是結構上相關的，其中細胞外結構域包含至少一個可變的或恒定的免疫球蛋白功能區(qū)。
[0005]正向和負向共刺激信號在細胞介導的免疫應答的調(diào)節(jié)中都發(fā)揮關鍵作用，并且已經(jīng)證明介導這些信號的分子對于免疫調(diào)節(jié)是有效的靶標?；谶@一知識，已經(jīng)研發(fā)了若干種涉及共刺激分子的靶向的治療途徑，并且示出它們對于在癌癥患者上通過開啟或阻止免疫應答的關閉來預防和治療癌癥是有用的，并且對于自體免疫性疾病和炎性疾病連同同種異體移植的排斥的預防和治療是有用的，每種都是通過在患有這些病理學病癥的受試者上關閉不受控的免疫應答、或通過經(jīng)由負向共刺激(或共抑制)來誘導“關閉信號”的。
[0006]已經(jīng)示出由B7配體遞送的這些信號的處理在自體免疫、炎性疾病、以及移植排斥的治療中是有潛力的。治療策略包括使用至一個共刺激對的配體或受體的單克隆抗體、或使用由可以結合并且阻斷其適當配體的共刺激受體組成的可溶性融合蛋白來阻斷共刺激。另一種途徑是使用一種抑制性配體的可溶性融合蛋白來誘導共抑制。這些途徑依賴，至少部分地依賴自體反應性T細胞或異體反應性T細胞(它們分別對自體免疫性疾病或移植中的致病過程負責)的最終缺失，大概因為在共刺激(誘導細胞存活基因)不存在的情況下，T細胞對凋亡的誘導變得高度易感。因此，能夠調(diào)節(jié)共刺激信號而不使免疫系統(tǒng)對抗病原體的能力妥協(xié)的新穎試劑對于此類病理學病癥的治療和預防是高度有利的。
[0007]共刺激通路在腫瘤發(fā)展中發(fā)揮重要作用。有趣地，已經(jīng)示出腫瘤通過以下來逃脫免疫破壞:通過抑制B7-⑶28和TNF家族中的共刺激因子來阻礙T細胞的活化，連同通過吸引調(diào)節(jié)性T細胞(它們抑制抗腫瘤T細胞反應)(參見王(Wang) (2006)Immune Suppressionby Tumor Specific CD4+Regulatory T cells in Cancer(通過癌癥中的腫瘤特異性 CD4+調(diào)節(jié)性T細胞的免疫抑制)，Semin.Cancer.Biol.(《癌癥生物學研討會》)16:73-79 ;格林沃爾德(Greenwald)等人，(2005) The B7Family Revisited.Ann.Rev.1mmunol (《免疫學年報》)，23:515-48 ;瓦特(Watts) (2005) TNF/TNFR Family Members in Co-stimulationof T Cell Responses (T細胞反應的共刺激中的TNF/TNFR家族成員)Ann.Rev.1mmunol(《免疫學年報》)，23:23-68 ;賽杜姆(Sadum)等人，(2007) Immune Signatures of Murineand Human Cancers Reveal Unique Mechanisms of Tumor Escape and New Targets forCancer Immunotherapy.(鼠科動物和人類的免疫特征標志揭示腫瘤逃逸的獨特機制和用于癌癥免疫療法的新靶標)Clin.Cane.Res.(《臨床癌癥研究》)13 (13):4016-4025)。此類表達腫瘤的共刺激分子已經(jīng)變?yōu)橛形Φ陌┌Y生物標記并且可以充當腫瘤相關抗原(TAA)0此外，已經(jīng)鑒定共刺激通路為免疫學檢驗點，在起始水平和腫瘤轉移酶內(nèi)的效應器功能方面，這些免疫學檢驗點減弱T細胞依賴性免疫應答。隨著工程化癌癥疫苗持續(xù)改善，此類免疫學檢驗點是這些疫苗誘導治療性抗腫瘤反應的能力的一個主要障礙變得越來越清楚。在那方面，共刺激分子可以充當用于主動(疫苗接種)和被動(抗體介導的)癌癥免疫療法的佐劑，來提供阻礙免疫耐受性并且刺激免疫系統(tǒng)的策略。
[0008]此外，此類試劑在其他類型的癌癥免疫療法，例如過繼性免疫治療中可以是有用的，其中腫瘤特異性T細胞群體被擴大并且被引導以攻擊并且殺死腫瘤細胞。能夠增加此類抗腫瘤反應的試劑具有很大的治療潛力，并且可以在克服腫瘤免疫療法的障礙的嘗試中是有價值的。最近，的確將調(diào)節(jié)若干共刺激通路的新穎試劑引入到了臨床中來作為癌癥免疫療法。
[0009]來自對急性和慢性傳染病的廣泛研究的新興數(shù)據(jù)為負向共刺激受體還有控制傳染支持了一個重要作用。在急性病毒感染后產(chǎn)生的記憶CD8T細胞是高度功能性的并且構成保護性免疫的一種重要組分。還已經(jīng)證明通過將記憶T細胞反應限制在其保護能力之內(nèi)來調(diào)節(jié)共刺激通路在優(yōu)化抗病毒性免疫中是有效的(臺亞若(Tei jaro)等人，《免疫學雜志》(J Immunol.) 2009:182 ;5430_5438)。這已經(jīng)在流行性感冒傳染的模型中得到了證明，在感染流行性感冒的初試的小鼠中用CTLA4-1g抑制性初次免疫應答來抑制CD28共刺激，但是對流行性感冒的記憶CD4T細胞介導的再次應答是顯著有療效的，這導致對流行性感冒激發(fā)的改善的臨床結果和增加的存活。
[0010]慢性傳染病通常特征在于病毒特異性T-細胞反應的不同程度功能性損傷，并且這種缺陷是宿主沒有能力消除持久性病原體的主要原因。盡管在感染的早期階段過程中最初產(chǎn)生了功能性效應器T細胞，但是由于持續(xù)性暴露于外源抗原，它們在慢性感染的過程中逐漸失去功能，這導致T細胞耗盡。耗盡的T細胞表達高水平的多重共抑制受體，例如 CTLA_4、PD_1、以及 LAG3 (克勞福德(Crawford)等人,Curr Opin Immunol.(《免疫學當前觀點》)2009 ；21:179-186 ;考夫曼(Kaufmann)等人，J Immunol (《免疫學雜志》)2009 ；182:5891-5897，夏普(Sharp)等人，Nat Immunol (《自然免疫學》)2007 ;8:239_245)。從遭受慢性病毒感染(包括HIV、HCV以及HBV)的患者中臨床上觀察到由于耗盡的T細胞的F1D-1過表達(克勞福德(Crawford)等人,Curr Opin Immunol.(《免疫學當前觀點》)2009 ;21:179-186 ;考夫曼(Kaufmann)等人，J Immunol (《免疫學雜志》)2009 ; 182:5891-5897，夏普(Sharp)等人，Nat Immunol (《自然免疫學》)2007 ;8:239_245)。已經(jīng)存在對這條通路中的額外病原體(包括其他病毒、細菌、以及寄生蟲)的一些調(diào)查研究(霍夫米易(Hofmeyer)等人，J Biomed Biotechn ol.(《生物醫(yī)學生物工程雜志》)Vol2011, Art.1D451694，巴德拉(Bhadra)等人，Proc Natl Acad Sc1.(《美國科學院院刊》)2011; 108 (22):9196_201)。例如，使用一種通過標準盲腸結扎術和穿孔方法誘導的敗血癥模型，已經(jīng)示出控制細菌感染中涉及到了 ro-1通路。在這個模型中，在敲除的小鼠中ro-1的不存在保護其免受敗血癥誘導的死亡(黃(Huang)等人，PNAS2009:106; 6303-6308)。
[0011]T細胞耗盡可以通過阻斷共抑制通路(例如ro-1或CTLA-4)來逆轉(里瓦斯(Rivas)等人，J Tmmun01.(《免疫學雜志》)2009 ;183:4284_91 ;金-梅森(Golden-Mason)等人，J Virol.(《病毒學雜志》)2009 ;83:9122-30 ；霍夫米易(Hofmeyer)等人，JBiomed Biotechnol.(《生物醫(yī)學生物工程雜志》)Vol2011, Art.1D451694)，因此允許抗病毒性免疫功能的恢復。用于治療病毒性感染的共抑制阻斷的治療潛力已經(jīng)通過阻斷ro-1/PD-Ll通路而進行了廣泛地研究，這在若干感染的動物模型中示出是有效的，包括恒河猴中的急性和慢性猴免疫缺陷病毒(SIV)感染(沃盧(Valu)等人，Nature (《自然》)2009 ；458:206-210)，和小鼠模型中的慢性病毒性感染，例如淋巴細胞性脈絡叢腦膜炎病毒(LCMV)(巴伯(Barber)等人，Nature.(《自然》)2006 ;439:682-7)，以及在S JL/J小鼠中的泰勒鼠腦脊髓炎病毒(TMEV )模型(鄧肯(Duncan )和米勒(Mi 11 er ) PLoSOne.2011;6:el8548)。在這些模型中，PD_l/ro_Ll阻斷改善了抗病毒性反應并且促進了持久性病毒的清除。此外，PD-1/PD-L1阻斷增加了體液免疫，如在血漿中的特異性抗病毒抗體的提高的產(chǎn)量所證明的，這與改善的細胞反應聯(lián)合導致血漿病毒載量的減少和增加的存活。
[0012]阻斷負向信號通路(例如I3D-1和CTLA-4)可以恢復宿主免疫系統(tǒng)，使它能夠對另外的刺激進行反應。將治療性疫苗接種連同抑制性信號的阻斷進行合并可以協(xié)同地增強慢性感染個體的功能性CD8T-細胞應答，并且改善病毒控制，來為慢性病毒(例如人類免疫缺陷病毒、乙型肝炎病毒以及丙型肝炎病毒)感染的治療提供一個有前途的策略(哈(Ha)等人，Immunol Rev.(《免疫學評論》)2008年6月；223:317-33)。一項最近的研究的結果表明I3D-1通路的阻斷改善了患有HCV感染的受試者對HBV疫苗接種的T細胞應答，并且提高了阻斷這條通路可能改善在慢性病毒性感染的環(huán)境下的免疫法的成功率的可能性(穆爾曼(Moorman)等人，Vaccine· (《疫苗》)，2011年4月12日；29 (17): 3169-76)。作為與預防性和治療性疫苗兩者聯(lián)合的有希望的候選物，PD-1和CTLA-4抗體目前在慢性丙型肝炎中處于臨床試驗中(代波爾德(Diepolder)和奧布斯特(Obst)，Expert Rev Vaccines (《疫苗專家評論》).2010三月；9(3):243-7)。TO-1阻斷還增強了預防接種的有效性，導致表位特異性T細胞的增加(范尼弗勞克(Finnefrock)等人，《免疫學雜志》(J Immunol) 2009 ；182;980-987)
[0013]除了用于治療慢性感染的共抑制通路的阻斷之外，目前使用病毒感染模型的研究已經(jīng)強調(diào)了正向共刺激信號在針對病毒的記憶應答過程中的重要性。共刺激分子(例如⑶28、4_1BB、以及0X40)也已經(jīng)被牽涉到病毒特異性記憶⑶8+T細胞的存活、產(chǎn)生、維持、以及品質(zhì)之中。共刺激信號的遞送可以幫助增加病毒特異性記憶⑶8+T細胞的產(chǎn)生和功能。在疫苗中使用作為佐劑的共刺激分子連同病毒抗原可以協(xié)助有效的抗原特異性記憶⑶8+T-細胞應答的產(chǎn)生，并且可以因此導致改善的疫苗(達塔古普塔(Duttagupta)等人，Crit Rev Immunol.(《免疫學關鍵性評論》)2009 ;29 (6): 469-86)。
[0014]一項最近的研究還評估了作為ro-1和ro-Li的阻斷的可溶性ro-1 (sPD-1)在小鼠中對疫苗引起的(vaccine-elicited)抗原特異性T-細胞應答的作用。將Sp1D-1與一種DNA疫苗或與一種基于腺病毒的疫苗的共給予增加了抗原特異性CD8 (+)T-細胞應答，表明了 Sp1D-1 的疫苗類型獨立性佐劑作用(vaccine type-1ndependent adjuvant effect)(宋(Song)等人，J Immunother.《免疫療法雜志》2011年4月;34 (3): 297-306)。這項研究的這些以及額外的結果提示，使用負向共刺激蛋白的可溶性細胞外結構域(ECD)作為佐劑的免疫策略，可以用來增加由疫苗接種引起的抗原特異性T-細胞免疫。
[0015]還一直認為B細胞在通過病原性自體抗體的產(chǎn)生的許多自體免疫性疾病(例如系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)和修格蘭氏疾病)的發(fā)展和維持中具有關鍵作用。然而，清楚的是多個其他B細胞功能在器官特異性自體免疫性疾病的發(fā)病機制中也是關鍵性的，以前認為這些器官特異性自體免疫性疾病主要是T細胞介導的，例如類風濕性關節(jié)炎(RA)和I型糖尿病(TlD)(王(Wong)等人 2010，Curr Opin Immunol.(《免疫學當前觀點》)22:723-731 )。T 細胞輔助B細胞是獲得性免疫應答的一個關鍵過程。濾泡輔助性T(Tfh)細胞是在B細胞輔助中特化的⑶4+T細胞的一個亞群(由克羅蒂(Crotty)綜述,Annu.Rev.1mmunol.(《免疫學年報》)29:621-663，2011)。Tfh細胞表達B細胞歸巢趨化因子受體CXCR5，CXCR5驅使Tfh細胞以一種CXCL13-依賴性方式遷移至淋巴結中的B細胞卵泡中。Tfh細胞首先在T細胞-B細胞邊界處與同源B細胞相互作用，并且隨后在卵泡內(nèi)誘導生發(fā)中心B細胞分化以及生發(fā)中心形成(由克羅蒂(Crotty)綜述,Annu.Rev.1mmunol.(《免疫學年報》)29:621-663，2011)。B細胞輔助和T細胞依賴性抗體反應對Tfh細胞的需求表明這種細胞類型對于針對不同類型的傳染劑的保護性免疫連同對于合理的疫苗設計是十分重要的。毫不出人意料地，Tfh細胞的調(diào)節(jié)異常和異常累積也已經(jīng)被與自體免疫性疾病(例如修格蘭氏疾病和自體免疫性關節(jié)炎)聯(lián)系起來(宇(￥11)和比努埃薩(￥1皿68&)，2010，0611^01.1mmunol,(《細胞分子免疫學》)7:198-203)。
[0016]Tfh細胞選擇性 表達豐富的表面蛋白，這些表面蛋白涉及在其選擇性定位(例如CXCR5)以及與B細胞的直接物理性相互作用來提供B細胞輔助。在后面的組中的是Tfh細胞中高度表達的共刺激蛋白家族的若干成員，包括可誘導性共刺激受體IC0S、以及負向共刺激分子(抑制性受體)PD-1和BTLA (克羅蒂(Crotty), Annu.Rev.1mmunol.(《免疫學年報》)29:621-663, 2011)，因此這種細胞亞群還可以由共刺激通路和共抑制通路的調(diào)節(jié)來控制，這有助于對B細胞功能的作用。
[0017]使用不同共刺激蛋白的激動劑和/或拮抗劑來調(diào)節(jié)共刺激也已經(jīng)作為治療自體免疫性疾病、移植排斥、過敏癥以及癌癥的策略而被廣泛地研究。這個領域已經(jīng)由被批準用于RA的治療的CTLA4-1g (阿巴西普，Orencia?)、用于預防急性腎臟移植排斥的突變的CTLA4-1g (貝拉西普，Nulojix?)以及最近被批準用于黑色素瘤的治療的抗-CTLA4抗體(易普利姆瑪，Nulojix?)臨床上首創(chuàng)。其他共刺激調(diào)節(jié)劑當前處于臨床研發(fā)的晚期，包括抗-PD-1抗體((MDX-1106)，抗-PD-1抗體處于用于晚期/轉移性透明細胞腎細胞癌(RCC)的治療的研發(fā)；以及用于治療腎臟同種異體移植物移植的抗-⑶40L抗體(BG9588，Antova?)。此外，此類試劑也處于病毒感染的臨床研發(fā)中，例如正在測試用于治療丙型肝炎的抗ro-lAb、MDX-1106，以及在患有肝細胞癌、被丙型肝炎病毒感染的患者中處于臨床試驗中的抗_CTLA_4Ab CP-675, 206 (曲美木單抗(tremeIimumab));本研究的目的是測試其對癌和對病毒的復制的作用。[0018]發(fā)明簡要概述
[0019]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了包含以下的新穎的治療組合物和診斷組合物:LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白的胞外結構域或其可溶性形式或分泌形式、和/或變體和/或直向同源物和/或片段，和/或包含它們的偶聯(lián)物，和/或對它們進行編碼的核酸序列。
[0020]已知(野生型)LY6G6F蛋白(淋巴細胞抗原6復合基因座蛋白G6f，Genbank登錄號:NP_001003693，SEQ ID NO:1)的全長氨基酸序列示出于圖1A中。已知(野生型)VSIGlO蛋白(包含V-set和免疫球蛋白功能區(qū)的蛋白10，Genbank登錄號:NP_061959，SEQ ID NO:3)的全長氨基酸序列以及VSIGlO新穎變體(SEQ ID NO:5)的氨基酸序列分別展示出于圖1B和IC中。VSIGlO新穎變體(SEQ ID NO:5)和已知(野生型)VSIGlO蛋白(SEQ ID NO:3)的氨基酸序列比對示出于圖2A中。已知(野生型)TMEM25蛋白(跨膜蛋白25，Swiss-Prot登錄號:Q86YD3，SEQ ID NO:7)的全長氨基酸序列示出于圖1D中。已知(野生型)LSR蛋白(刺激脂解的脂蛋白受:體同種型2, Genbank登錄號:NP_991403)的全長氣基酸序列被提供于SEQ ID N0:62中。LSR變體SEQ ID NO: 11、13、15、16、17以及18的氨基酸序列分別示出于圖 1E、1F、1G、1H、11、以及 IJ 中。LSR變體 SEQ ID NO:11、13、15、16、17 以及 18 與預先已知的LSR序列(SEQ ID NO:62-67)的氨基酸序列比對分別展示于圖2B、2C、2D、2E、2F、2G中。
[0021]根據(jù)至少一些實施例，提供了一種分離的多肽，這一分離的多肽包括一個選自下組的序列的可溶性胞外結構域的至少98個氨基酸，該組由SEQ ID NO:11、13、15_18、67、以及143組成；一個選自下組的序列的可溶性胞外結構域的至少62個氨基酸，該組由SEQ IDNO:1和58組成；一個選自下組的序列的可溶性胞外結構域的至少36個氨基酸，該組由SEQID NO:3和5組成；或SEQ ID NO:7的可溶性胞外結構域的至少46個氨基酸，或一種基本上由如在SEQ ID NO:5中所闡明的氨基酸序列或與其擁有至少95%序列一致性的變體組成的分離的多肽；或其變體、或直向同源物、或片段。
[0022]可任選地，這種分離的多肽只包`括選自下組的序列的98至180個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:11、13、15-18、67、以及143組成；選自下組的序列的62至228個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:1和58組成；選自下組的序列的36與393個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:3和5組成；或SEQ ID NO:7的46與216個之間的氨基酸。
[0023]還可任選地，這種分離的多肽選自下組，該組由只包括以下的多肽組成:選自下組的序列的98至118、135至155、以及160至180個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:11、13、15-18、67、以及143組成；選自下組的序列的62至82、95至115、208至228個之間的氨基酸，該組由SEQ ID N0:1和58組成；選自下組的序列的36至70、80至100、170至200、265至290、365至393個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:3和5組成；或SEQ ID NO:7的46至66、84至104、196至216個之間的氨基酸。
[0024]還可任選地，這種分離的多肽只包括:選自下組的序列的約72、106、或218個氨基酸，該組由SEQ ID NO:1和58組成；選自下組的序列的約108、145、或170個氨基酸，該組由 SEQ ID NO:11、13、15-18、67、以及 143 組成；SEQ ID NO:7 的約 56、94、或 206 個氨基酸;或 SEQ ID NO:3 和 5 的約 46、49、58、60、87、89、93、94、178、182、185、187、273、279、282、374
或383個氨基酸。[0025]還可任選地，這種分離的多肽基本上由與在任一 SEQ ID NO:12、2、4_6、8、14、47-50、10、15-18、22、39、59-61 ;81_102中所列舉的氨基酸序列具有至少95%序列一致性的氨基酸序列組成。可任選地并且優(yōu)選地，這種分離的多肽基本上由在任一 SEQ ID NO:12,
2、4-6、8、14、47-50、10、15-18、22、39、59-61 ;81_102 中所列舉的氨基酸序列組成。
[0026]可任選地，這種分離的多肽阻斷或抑制LSR、TMEM25、VSIG10、LY6G6F、或其片段或變體與一種相對應的功能性對應物的相互作用。可任選地，這種分離的多肽替代或增加LSR、TMEM25、VSIG10、LY6G6F、或其片段或變體與一種相對應的功能性對應物的相互作用。 [0027]可任選地，這種分離的直向同源物是一種選自SEQ ID NO:9以及19_21的小鼠多肽。
[0028]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了包括VSIGlO蛋白的不連續(xù)部分(片段)的分離多肽，對應于:
[0029]A.一種分離的嵌合體多肽，包括一個與以下至少95%同源的第一氨基酸序列
[0030]MAAGGSAPEPRVLVCLGALLAGWVAVGLEAVVIGEVHENVTLHCGNISGLRGQVTWYRNNSEPVFLLSSNSSLRPAEPRFSLVDATSLHIESLSLGDEGIYTCQEILNVT QffFQVffLQVA 對應于已知 VSIGlO 蛋白(SEQID NO:3)的氨基酸1-120，它還對應于VSIGlO變體(SEQ ID NO:5)的氨基酸1-120 ;—個包括N的第二橋聯(lián)氨基酸序列；以及一個與以下至少95%同源的第三氨基酸序列
[0031]PPPSAPQCWAQMASGSFMLQLTCRWDGGYPDPDFLWIEEPGGVIVGKSKLGVEMLSESQLSDGKKFKCVTSHIVGPESGASCMVQIRGPSLLSEPMKTCFTGGNVTLTCQVSGAYPPAKILWLRNLTQPEVIIQPSSRHLITQDGQNSTLTIHNCSQDLDEGYYICRADSPVGVREMEIWLSVKEPLNIGGIVGTIVSLLLLGLAIISGLLLHYSPVFCWKVGNTSRGQNMDDVMVLVDSEEEEEEEEEEEEDAAVGEQEGAREREELPKEIPKQ DHIHRVTALVNGNIEQMGNGFQDLQDDSSEEQSDIVQEEDRPV 對應于已知 VSIGlO 蛋白(SEQ ID NO:3)的氨基酸 223-540，它還對應于VSIGlO變體(SEQ ID NO:5)的氨基酸122-439 ;其中所述第一氨基酸序列、第二橋聯(lián)氨基酸序列以及第三氨基酸序列是連續(xù)的并且以一種順序的次序。
[0032]B.VSIGlO變體(SEQ ID NO:5)的邊緣部分的分離多肽，包括一種具有長度為“n”的多肽，其中n至少10個氨基酸長，可任選是至少約20個氨基酸長，優(yōu)選是至少約30個氨基酸長，更優(yōu)選是至少約40個氨基酸長并且最優(yōu)選是至少約50個氨基酸長，其中至少3個氨基酸包括具有如下結構的ANP (根據(jù)VSIGlO變體(SEQ ID NO:5)編號):一種起始于任一氨基酸號120-x至120并且終止于任一氨基酸號122+( (n_3) _x)的序列,其中x從0至n_3變化。
[0033]根據(jù)至少一些實施例，本主題發(fā)明進一步提供了一種對應于以下的氨基酸殘基的序列的分離多肽=VSIGlO蛋白的不連續(xù)部分，VSIGlO變體(SEQ ID NO:5)的新接合處和邊緣部分。VSIGlO變體(SEQ ID NO:5)的新接合處的獨特序列展示于圖2A中的蛋白序列比對中。
[0034]根據(jù)至少一些實施例，本主題發(fā)明提供了包括LSR蛋白的不連續(xù)部分(片段)的分離多肽，對應于:
[0035]A.一種分離的嵌合體多肽，包括一個與以下至少95%同源的第一氨基酸序列
[0036]MALLAGGLSRGLGSHPAAAGRDAVVFVWLLLSTWCTAPARAIQVTVSNPYHVVILFQPVTLPCTYQMTSTPTQPIVIWKYKSFCRDRIADAFSPASVDNQLNAQLAAGNPGYNPYVECQDSVRTVRVVATKQGNAVTLGDYYQGRRITITGNADLTFDQTAWGDSGVYYCSVVSAQDLQGNNEAYAELIVLGRTSGVAELLPGFQAGPIE[0037]對應于已知LSR蛋白(SEQ ID NO:62)的氨基酸49_258，它還對應于LSR變體同種型f (SEQ ID NO:18)的氨基酸1-210 個包括V的第二橋聯(lián)氨基酸序列；以及一個與以下至少 95% 同源的第三氨基酸序列 YAAGKAATSGVPSIYAPSTYAHLSPAKTPPPPAMIPMGPAYNGYPGGYP⑶VDRSSSAGGQGSYVPLLRDTDSSVASEVRSGYRIQASQQDDSMRVLYYMEKELANFDPSRPGPPSGRVERAMSEVTSLHEDDWRSRPSRGPALTPIRDEEWGGHSPRSPRGWDQEPAREQAGGGffRARRPRARSVDALDDLTPPSTAESGSRSPTSNGGRSRAYMPPRSRSRDDLYDQDDSRDFPRSRDPHYDDFRSRERPPADPRSHHHRTRDPRDNGSRSGDLPYDGRLLEEAVRKKGSEERRRPHKEEEEEAYYPPAPPPYSETDSQASRERRLKKNLALSRESLVV
[0038]對應于已知LSR蛋白(SEQ ID NO:62)的氨基酸309-649，它還對應于LSR變體同種型f (SEQ ID NO:18)的氨基酸212-552 ;其中所述第一氨基酸序列、第二橋聯(lián)氨基酸序列以及第三氨基酸序列是連續(xù)的并且以一種順序的次序。
[0039]B.LSR變體同種型f (SEQ ID NO: 18)的邊緣部分的分離多肽，包括一種具有長度為“n”的多肽，其中n至少10個氨基酸長，可任選是至少約20個氨基酸長，優(yōu)選是至少約30個氨基酸長，更優(yōu)選是至少約40個氨基酸長并且最優(yōu)選是至少約50個氨基酸長，其中至少3個氨基酸包括具有如下結構的EVY (根據(jù)SEQ ID NO: 18編號):一種起始于任一氨基酸號210-x至210并且終止于任一氨基酸號212+( (n-3) -x)的序列，其中x從0至n_3變化。
[0040]C.一種分離的嵌合體多肽，包括一個與以下至少95%同源的第一氨基酸序列
[0041]MALLAGGLSRGLGSHPAAAGRDAVVFVWLLLSTWCTAPARAIQVTVSNPYHVVILFQPVTLPCTYQMTSTPTQPIVIWKYKSFCRDRIADAFSPASVDNQLNAQLAAGNPGYNPYVECQDSVRTVRVVATKQGNAVTLGDYYQGRRITITGNADLTFDQTAWGDSGVYYCSVVSAQDLQGNNEAYAELIVL [0042]對應于已知LSR蛋白(SEQ ID NO:66)的氨基酸49_239，它還對應于LSR變體同種型f (SEQ ID NO:18)的氨基酸1-191 ;一個與具有序列GRTSGVAELLPGFQAGPIE的多肽至少80%、優(yōu)選是至少85%、更優(yōu)選是至少90%并且最優(yōu)選是至少95%同源的第二氨基酸序列，對應于LSR變體同種型f (SEQ ID N0:18)的氨基酸192-218 ;以及一個與以下至少95%同源
的第三氨基酸序列
[0043]VYAAGKAATSGVPSIYAPSTYAHLSPAKTPPPPAMIPMGPAYNGYPGGYP⑶VDRSSSAGGQGSYVPLLRDTDSSVASEVRSGYRIQASQQDDSMRVLYYMEKELANF DPSRPGPPSGRVERAMSEVTSLHEDDWRSRPSRGPALTPIRDEEWGGHSPRSPRGWDQEPAREQAGGGWRARRPRARSVDALDDLTPPSTAESGSRSPTSNGGRSRAYMPPRSRSRDDLYDQDDSRDFPRSRDPHYDDFRSRERPPADPRSHHHRTRDPRDNGSRS⑶LPYDGRLLEEAVRKKGSEERRRPHKEEEEEAYYPPAPPPYSETDSQASRERRLKKNLALSRESLVV對應于已知 LSR蛋白 SEQ ID NO:66 的氨基酸240-581，它還對應于LSR變體同種型f (SEQ ID NO:18)的氨基酸211-552 ;其中所述第一氨基酸序列、第二氨基酸序列以及第三氨基酸序列是連續(xù)的并且以一種順序的次序。
[0044]D.一種LSR變體同種型f (SEQ ID NO:18)的邊緣部分的分離多肽，包括一個與LSR變體同種型f (SEQ ID NO: 18)的序列GRTSGVAELLPGFQAGPIE至少約80%、優(yōu)選是至少約85%、更優(yōu)選是至少約90%并且最優(yōu)選是至少約95%同源的氨基酸序列。
[0045]根據(jù)至少一些實施例，本主題發(fā)明進一步提供了一種對應于以下的氨基酸殘基的序列的分離多肽=LSR的不連續(xù)部分，LSR變體LSR同種型f (SEQ ID NO:18)的新接合處和邊緣部分。LSR同種型-f (SEQ ID NO:18)的新接合處的獨特序列展示于圖2G中的蛋白序列比對中。
[0046]根據(jù)至少一些實施例，本主題發(fā)明提供了包括一個對應于LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白的不連續(xù)部分的氨基酸殘基的序列的多肽，包括對應于以下的細胞外結構域的不同部分:LY6G6F (SEQ ID NO:1)的殘基17-234，對應描述于SEQ ID NO:2中的氨基酸序列；VSIG10(SEQ ID NO:3)的殘基31-413，對應描繪于SEQ ID NO:4中的氨基酸序列；VSIGlO (SEQ ID NO:5)的殘基31-312，對應描繪于SEQ ID NO:6中的氨基酸序列；TMEM25(SEQ ID NO:7)的殘基27-232，對應描繪于SEQ ID NO:8中的氨基酸序列；LSR (SEQ IDNO:lUP/*SEQ ID NO:143)的殘基42-211，對應描繪于SEQ ID NO:12中的氨基酸序列；LSR (SEQ ID NO:13)的殘基42-192，對應描繪于SEQ ID NO:14中的氨基酸序列；LSR(SEQ ID NO:15)的殘基42-533，對應描繪于SEQ ID NO:47中的氨基酸序列；LSR (SEQ IDNO:16)的殘基42-532，對應描繪于SEQ ID NO:48中的氨基酸序列；LSR (SEQ ID NO:17)的殘基42-493，對應描繪于SEQ ID NO:49中的氨基酸序列；LSR (SEQ ID NO:18)的殘基42-552，對應描繪于SEQ ID NO:50中的氨基酸序列；和/或與其擁有至少85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%序列同源性的其片段和/或變體。根據(jù)仍另外的實施例，如在所描述，LY6G6F E⑶片段選自任一 SEQ ID NO:81、96及其變體。根據(jù)仍另外的實施例，如在此描述，VSIG10ECD片段選自任一 SEQ ID NO:82-93、97_100及其變體。根據(jù)仍另外的實施例，如在此描述，LSR E⑶片段選自任一 SEQ ID NO:95、102及其變體。根據(jù)仍另外的實施例，如在此描述，TMEM25E⑶片段選自任一 SEQ ID NO:94、101及其變體。根據(jù)仍另外的實施例，LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白的不連續(xù)部分可以包括或可以不包括一個信號(前導序列)肽(SP)序列(圖1)。根據(jù)本發(fā)明的至少一些實施例，提供了包括LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白的SP序列的ECD部分的實例。包括LY6G6F蛋白(SEQ ID NO:1)的SP序列的E⑶部分的一個實例是在SEQ ID NO:59中所闡明的氨基酸序列。包括VSIGlO蛋白(SEQ ID NO:3)的SP 序列的ECD部分的一個實例是在SEQ ID NO:60中所闡明的氨基酸序列。包括VSIGlO蛋白(SEQ ID NO:5)的SP序列的ECD部分的一個實例是在SEQ ID NO:61中所闡明的氨基酸序列。包括TMEM25蛋白(SEQ ID NO:7)的SP序列的E⑶部分的一個實例是在SEQ ID NO:39中所闡明的氨基酸序列。包括LSR蛋白(SEQ ID NO:11)的SP序列的E⑶部分的一個實例是在SEQ ID NO:10中所闡明的氨基酸序列。包括LSR蛋白(SEQID NO:14)的SP序列的E⑶部分的一個實例是在SEQ ID NO:22中所闡明的氨基酸序列。
[0047]根據(jù)另外的實施例，本發(fā)明提供了包括一個對應于SEQ ID NO:18中描繪的可溶性LSR蛋白的氨基酸殘基的序列的多肽，包括與其擁有至少85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%序列同源性的其不同部分或其變體。根據(jù)另外的實施例，本發(fā)明提供了包括一個對應于任一 SEQ ID NO:15-16中描繪的可溶性LSR蛋白的氨基酸殘基的序列的多肽，包括與其擁有至少95%、96%、97%、98%或99%序列同源性的其不同部分或其變體。根據(jù)另外的實施例，本發(fā)明提供了包括一個對應于任一 SEQ ID NO:15-18中描繪的可溶性LSR蛋白的氨基酸殘基的序列的多肽。根據(jù)仍另外的實施例，在任一 SEQ ID NO:15-18中描繪的可溶性LSR蛋白可以包括或可以不包括信號(前導序列)肽序列(圖1G、G、I以及J)。
[0048]根據(jù)仍另外的實施例，本發(fā)明提供了包括一個對應于TMEM25、LY6G6F、VSIG10、LSR變體I和/或LSR變體2蛋白的氨基酸殘基的序列的多肽，特別是小鼠直向同源物(分別是SEQ ID NO:28、29、30、31和/或32)，包括但不局限于:對應SEQ ID NO:9、19-21中描繪的氨基酸序列的小鼠直向同源物細胞外結構域，或與其擁有至少85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%序列同源性的其部分或變體。[0049]根據(jù)仍另外的實施例，本發(fā)明提供了包括一個對應于任一 VSIGlO (SEQ ID NO:5)和LSR (SEQ ID NO:11、13、15、16以及18)的新穎變體的氨基酸序列的多肽。
[0050]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了一種融合蛋白，該融合蛋白包括連接至一種異源序列的任一上述多肽?？扇芜x地，這種異源序列包括免疫球蛋白分子的至少一個部分?？扇芜x地并且優(yōu)選地，這種免疫球蛋白分子部分是一個免疫球蛋白重鏈恒定區(qū)Fe片段?？扇芜x地并且更優(yōu)選地，這種免疫球蛋白重鏈恒定區(qū)來源于一種選自下組的免疫球蛋白同種型，該組由以下各項組成=IgGU IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgE、IgA以及IgD?？扇芜x地并且最優(yōu)選地，這種融合蛋白具有在任一 SEQ ID NO:71-80、172-181中所闡明的或在任一 SEQID NO:23-26中所闡明的氨基酸序列，并且還可任選地在體外或在體內(nèi)調(diào)節(jié)免疫細胞反應。
[0051]根據(jù)至少一些實施例，本主題發(fā)明提供了分離的核酸序列，這些分離的核酸序列對以下進行編碼:TMEM25、VSIG10、和/或LSR的任一前述新穎變體，和/或任一前述LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR細胞外結構域多肽或其片段或同系物或直向同源物。
[0052]根據(jù)至少一些實施例，提供了一種選自下組的分離的核酸序列，該組由以下各項組成:SEQ ID勵:33-37、40-46、132、155、182-198，或與其擁有至少95%序列一致性的其變體，或其退化變體。
[0053]根據(jù)至少一些實施例，本主題發(fā)明提供了一種對以下進行編碼的分離的多核苷酸:一種包括任一在 SEQ ID NO:2、4、5、6、8-16、18-22、39、47-50、59-61、143 中所闡明的氨基酸序列的多肽，與其擁有至少85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%序列一致性的其片段或變體，或其退化變體。
[0054]根據(jù)至少一些實施例，本主題發(fā)明提供了一種分離的多核苷酸，這一分離的多核苷酸包括如在任一 SEQ ID NO:33-37、40-46、132、145、155、182-188中所闡明的核酸、或其序列同源物或其退化變體。根據(jù)另一個實施例，這一分離的多核苷酸與如在任一 SEQ IDNO:33-37、40-46、145 中所闡 明的核酸序列至少 85%、90%、95%、96%、97%、98% 或 99% 同源。
[0055]根據(jù)至少一些實施例,提供了一種表達載體或病毒,該表達載體或病毒包含至少一種如在此所描述的分離的核酸序列。根據(jù)至少一些實施例，提供了一種重組細胞，該重組細胞包括一種表達載體或病毒，該表達載體或病毒包含一種如在此所描述的分離的核酸序列，其中該細胞組成性地表達或可誘導地表達由該DNA區(qū)段編碼的多肽。根據(jù)至少一些實施例，提供了一種生產(chǎn)LSR、TMEM25、VSIGlO、LY6G6F可溶性胞外結構域多肽、或其片段或融合蛋白的方法，該方法包括將如在此所描述的重組細胞在由此該細胞表達由該DNA區(qū)段或核酸編碼的多肽的條件下培養(yǎng)，并且回收所述多肽。
[0056]根據(jù)本發(fā)明的至少一些實施例，提供了一種藥物組合物，該藥物組合物包括一種任一 LY6G6F、VSIG10、TMEM25、LSR蛋白、或變體或直向同源物或片段或包含它們的偶聯(lián)物的胞外結構域的分離的氨基酸序列或其可溶性形式或分泌形式。
[0057]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了 LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白的可溶性和/或細胞外結構域的一種分離的或純化的氨基酸序列或對其進行編碼的核酸序列，這一分離的或純化的氨基酸序列或對其進行編碼的核酸序列可以可任選地被直接地或間接地附接至非LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白或核酸序列，例如可溶性免疫球蛋白功能區(qū)或片段。
[0058]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了載體(例如質(zhì)粒和重組病毒載體)以及包含載體的宿主細胞，它們表達LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白的分泌形式或可溶性形式和/或其ECD、或其片段或變體或其直向同源物或包含任一前述項的多肽偶聯(lián)物。
[0059]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了這些載體(例如質(zhì)粒和重組病毒載體)以及包含載體的宿主細胞的用途，它們表達任一 LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR、分泌形式和/或可溶性形式和/或ECD和/或其片段和/或變體、和/或其直向同源物和/或包含任一前述項的多肽偶聯(lián)物來生產(chǎn)所述LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白。
[0060]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了包含任何前述項的藥物組合物或診斷組合物。
[0061]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了任一以下化合物或藥物組合物作為用于治療或預防如在此所列舉的癌癥、如在此所列舉的感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)(包括但不局限于如在此所列舉的自體免疫性疾病、移植排斥和移植物抗宿主疾病)，和/或用于阻斷或促進由任一 LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR多肽介導的免疫共刺激、如在此所列舉的免疫相關疾病和/或用于免疫治療(促進或抑制免疫共刺激)的療法的用途；這些化合物包含LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR胞外結構域、其可溶性形式或分泌形式或片段或直向同源物或變體、或偶聯(lián)物、或對其進行編碼的核酸序列中至少之一，這些藥物組合物包括這些化合物。根據(jù)至少一些實施例，該自體免疫性疾病包括任何自體免疫性疾病，并且可任選地并優(yōu)選地包括但不局限于任一以下的任一類型和亞型:多發(fā)性硬化癥、類風濕性關節(jié)炎、I型糖尿病、銀屑病、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、炎性腸病、葡萄膜炎、或修格蘭氏綜合征。
[0062]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了任一以下化合物或藥物組合物用于作為抗癌疫苗、作為抗癌疫苗的佐劑、和/或用于過繼性免疫治療、和/或用于如在此所列舉的癌癥免疫治療來給予的用途；這些化合物包含LY6G6F、VSIGlO、TMEM25和/或LSR胞外結構域、其可溶性形式或分泌形式或片段或直向同源物或變體、或偶聯(lián)物、或對其進行編碼的核酸序列中至少之一，這些藥物組合物包括這些化合物。
·[0063]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了任一 LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白、和/或核酸序列作為用于藥物研發(fā)的靶標的用途，這些靶標特異性結合至任一 LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白和/或藥物，這些蛋白和/或藥物激動或拮抗其他部分與LY6G6F、VSIGlO、TMEM25 和 / 或 LSR 蛋白的結合。
[0064]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了以下藥物，這些藥物調(diào)節(jié)(激動或拮抗)LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR相關生物活性中至少之一。通過舉例，此類藥物包括抗體、小分子、肽、核酶、適體、反義分子、SiRNA等。這些分子可以直接結合或調(diào)節(jié)由任一LY6G6F、VSIG10、TMEM25 和 / 或 LSR 蛋白或 LY6G6F、VSIGlO、TMEM25 和 / 或 LSR DNA 或其部分或變體引起的活性，或可以間接調(diào)節(jié)任一 LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR相關活性，或將分子結合至任一 LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR及其部分和變體，例如通過調(diào)節(jié)任一 LY6G6F、VSIGlO、TMEM25 和 / 或 LSR 至其反受體(counter receptor)或內(nèi)源配體。
[0065]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了新穎的單克隆抗體或多克隆抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，它們特異性結合任一如在此所描述的LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白或與其具有至少95%同源性的多肽?？扇芜x地，此類抗體結合至選自下組的蛋白，該組由以下各項組成:SEQ ID NO:1-8、10-18、22、39、47-50、59-61、9、19-21，或對應于任一 SEQ ID NO:5和18的獨特邊緣的氨基酸序列；特別地，其中對這些抗體、抗原結合片段和包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架進行適配來用作治療劑和/或診斷劑(在體外和體內(nèi)診斷方法兩者中)，特別是用于如在此所列舉的感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)(包括但不局限于如在此所列舉的自體免疫性疾病、如在此所列舉的免疫相關疾病、移植排斥以及移植物抗宿主疾病)、；連同如在此所列舉的癌癥和惡性腫瘤的治療和/或診斷。
[0066]根據(jù)至少一些實施例，提供了抗體，其中該抗原結合位點包括一個構象的或線性的表位，并且其中該抗原結合位點包含約3-7個連續(xù)的或非連續(xù)的氨基酸。可任選地，該抗體是一種完全人類抗體、嵌合抗體、人化或靈長化抗體。
[0067]還可任選地，該抗體選自下組，該組由以下各項組成:Fab、Fab’、F (ab’)2、F (ab’)、F (ab)、Fv或scFv片段和最小識別單位。
[0068]還可任選地，，該抗體被偶聯(lián)至一個選自以下的部分:一種藥物、放射性核素、熒光團、酶、毒素、治療劑、或化學治療劑；并且其中該可檢測的標記是一種放射性同位素、金屬螫合劑、酶、熒光化合物、生物發(fā)光化合物或化學發(fā)光化合物。
[0069]還可任選地，該抗體阻斷或抑制任一 LSR、TMEM25、VSIGlO、LY6G6F多肽、或其片段或變體與一種對應物的相互作用。
[0070]還可任選地，該抗體替代或增加LSR、TMEM25、VSIGlO、LY6G6F多肽、或其片段或變體與一種對應物的相互作用。
[0071]還可任選地，該抗體引起癌細胞的凋亡或溶解，這些癌細胞表達任一 LSR、TMEM25、VSIG10、LY6G6F 蛋白。
[0072]還可任選地，凋亡或溶解涉及該抗體的⑶C或ADCC活性，其中⑶C(補體依賴性細胞毒性)或ADCC (抗體依賴性細胞毒性)活性被用來靶向這些免疫細胞。
`[0073]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了針對LY6G6F蛋白的不連續(xù)部分的抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，LY6G6F蛋白的不連續(xù)部分包括對應于以下的細胞外結構域的不同部分:LY6G6F (SEQ ID NO:1)的殘基17-234，闡明于SEQ IDNO:2中，和/或對應任一 SEQ ID NO:81和96中闡明的氨基酸序列。根據(jù)另外的實施例，本發(fā)明提供了針對小鼠LY6G6F蛋白(SEQ ID NO:29)的不連續(xù)部分的抗體、抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，小鼠LY6G6F蛋白的不連續(xù)部分包括對應于SEQID NO:20的細胞外結構域的不同部分。
[0074]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了針對VSIGlO蛋白的不連續(xù)部分的抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，VSIGlO蛋白的不連續(xù)部分包括對應于以下細胞外結構域的不同部分:VSIG10(SEQ ID NO:3)的氨基酸殘基31-413，描繪于SEQID NO:4 中；VSIGlO (SEQ ID NO:5)的氨基酸殘基 31-312，描繪于 SEQ ID N0:6 中，和 / 或對應任一 SEQ ID N0:82-93、97-100中所闡明的氨基酸序列。根據(jù)另外的實施例，本發(fā)明提供了針對小鼠VSIGlO蛋白(SEQ ID NO:30)的不連續(xù)部分的抗體、抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，小鼠VSIGlO蛋白的不連續(xù)部分包括對應于SEQ ID NO:19的細胞外結構域的不同部分。根據(jù)至少一些實施例，如在此所描述的，本發(fā)明提供了針對VSIGlO蛋白的不連續(xù)部分的抗體、抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，VSIGlO蛋白的不連續(xù)部分包括VSIGlO變體(SEQ ID NO:5)的邊緣部分。
[0075]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了針對TMEM25蛋白的不連續(xù)部分的抗體、抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，TMEM25蛋白的不連續(xù)部分包括對應于以下的細胞外結構域的不同部分:TMEM25(SEQ ID NO:7)的氨基酸殘基27-232，描繪于SEQID NO:8中，和/或對應任一 SEQ ID NO:94、101中闡明的氨基酸序列。根據(jù)另外的實施例，本發(fā)明提供了針對小鼠TMEM25蛋白(SEQ ID NO:28)的不連續(xù)部分的抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，小鼠TMEM25蛋白的不連續(xù)部分包括SEQ ID NO:9中所闡明的細胞外結構域的不同部分。
[0076]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了針對LSR蛋白的不連續(xù)部分的抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，LSR蛋白的不連續(xù)部分包括對應于以下的細胞外結構域的不同部分:LSR (SEQ ID NO:11)的氨基酸殘基42-211，描繪于SEQ ID NO:12 中；LSR (SEQ ID NO:13)的氨基酸殘基 42-192，描繪于 SEQ ID NO:14 中，LSR (SEQ IDNO:15)的氨基酸殘基42-533，描繪于SEQ ID NO:47中，LSR (SEQ ID NO:16)的氨基酸殘基42-532，描繪于SEQ ID NO:48中，LSR (SEQ ID NO: 17)的氨基酸殘基42-493，描繪于SEQ ID N0:49 中，LSR (SEQ ID NO: 18)的氨基酸殘基 42-552，描繪于 SEQ ID 勵:50，和/或對應任一 SEQ ID NO:95、102中所闡明的氨基酸序列。根據(jù)另外的實施例，本發(fā)明提供了針對小鼠LY6G6F蛋白(SEQ ID NO:31-32)的不連續(xù)部分的抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，小鼠LY6G6F蛋白的不連續(xù)部分包括對應于SEQ ID NO:21的細胞外結構域的不同部分。
[0077]根據(jù)至少一些實施例，如在此所描述的，本發(fā)明提供了針對LSR蛋白的不連續(xù)部分的抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，LSR蛋白的不連續(xù)部分包括LSR變體同種型-f (SEQ ID NO: 18)的獨特邊緣部分。
[0078]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了針對可溶性LSR蛋白的不連續(xù)部分的抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，可溶性LSR蛋白的不連續(xù)部分包括SEQ ID N0:15-18、47-5 0中所描繪的LSR蛋白的不同部分。
[0079]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明涉及具有類似于特異性抗體的范圍的特異性和親和性的蛋白支架。根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明涉及一種抗原結合構建體，這種抗原結合構建體包括一個被連接至一個或多個表位結合結構域的蛋白支架。此類工程化蛋白支架通常是通過設計一個具有聚焦于環(huán)區(qū)或另外的可允許表面區(qū)域的誘變的隨機文庫并且通過經(jīng)由噬菌體展示或相關技術針對給定的靶標選擇變體來獲得的。根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明涉及替代支架，包括，但不局限于:anticalin、DARPin、猶餘重復序列蛋白(Armadillorepeat proteins)、蛋白A、脂質(zhì)運載蛋白、纖維連接蛋白結構域、錨蛋白共有序列重復結構域(ankyrin consensus repeat domain)、硫氧還蛋白、化學約束妝(chemicallyconstrained peptides)等。根據(jù)至少一些實施例,本發(fā)明涉及替代支架,這些替代支架被用作治療以下的治療劑:如在此所列舉的癌癥、如在此所列舉的免疫相關疾病、如在此所列舉的自體免疫性疾病和傳染病，連同用于體內(nèi)診斷學。
[0080]根據(jù)本發(fā)明的至少一些實施例，提供了一種藥物組合物，該藥物組合物包括一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體，并且進一步包括一種藥學上可接受的稀釋劑或運載體。
[0081]根據(jù)至少一些實施例，提供了任一以下的用途:任一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或如在此所描述的藥物組合物，其中將此類給予至受試者來抑制或減少T細胞活化。
[0082]根據(jù)至少一些實施例，提供了任一以下項用于治療癌癥的用途:任一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或如在此所描述的藥物組合物。
[0083]根據(jù)至少一些實施例，提供了以下項用于治療感染性失調(diào)的用途:一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或如在此所描述的藥物組合物。
[0084]根據(jù)至少一些實施例，提供了一種在受試者上進行以下的一種或多種的方法:
[0085]a.上調(diào)細胞因子；
[0086]b.誘導T細胞的增殖；
[0087]c.促進抗原特異性T細胞免疫；
[0088]d.促進⑶4+和/或⑶8+T細胞活化；該方法包括向該受試者給予任何一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或如在此所描述的藥物組合物。
[0089]根據(jù)至少一些實施例，提供了一種用于治療或預防免疫系統(tǒng)相關病癥的方法，該方法包括向一個對其有需要的受試者給予一個有效量的任何一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或藥物組合物。
[0090]可任選地，該免疫系統(tǒng)相關病癥包括一種免疫相關病癥、如在此所列舉的自體免疫性疾病、移植排斥和移植物抗宿主疾病和/或用于阻斷或促進由任一 LSR、TMEM25、VSIGlO和/或LY6G6F多肽介導的免疫共刺激、如在此所列舉的免疫相關疾病和/或用于免疫療法(促進或抑制免疫共刺激)。
[0091]可任選地，將這種治療與另一個用于治療免疫相關病癥的部分進行合并。
[0092]可任選地，該部分選自下組，該組由以下各項組成:免疫抑制劑(例如皮質(zhì)類固醇、環(huán)孢霉素、環(huán)磷酰胺、潑尼松、硫唑嘌呤、甲氨蝶呤、西羅莫司、他克莫司)，生物劑(例如TNF- a阻斷劑或拮抗劑、或靶向任何炎性細胞因子的任何其他生物劑)，非甾體抗炎藥物/Cox-2抑制劑,羥基氯喹,柳氮磺胺吡啶(sulphasalazopryine),氯金酸鈉,依那西普,英利昔單抗，嗎替麥考酚酯，巴利昔單抗，阿塞西普，利妥昔單抗，環(huán)磷酰胺，干擾素P -1a,干擾素@ _lb，醋酸格拉默，鹽酸米托蒽醌，阿那白滯素和/或其他生物制劑和/或靜脈注射免疫球蛋白(IVIG)，干擾素類(例如IFN-e-la (REBIF?和AVONEX? )以及IFN-P-1b
(BETASERON?));醋酸格拉默〔COPAXONE?),多肽；那他珠單抗(TYSABRI?
)，米托蒽醌(NOVANTRONF k )，細胞毒素劑，鈣調(diào)神經(jīng)磷酸酶抑制劑(例如環(huán)孢霉素A或FK506 ); —種免疫抑制大環(huán)內(nèi)酯，例如西羅莫司或其衍生物；例如40-0- (2-羥基)乙基-西羅莫司，一種淋巴細胞歸巢試劑，例如FTY720或其類似物，皮質(zhì)類固醇；環(huán)磷酰胺；硫唑嘌呤；甲氨蝶呤；來氟米特或其類似物；咪唑立賓；麥考酚酸；嗎替麥考酚酯；15-deoxyspergualine或其類似物；免疫抑制單克隆抗體,例如，白細胞受體的單克隆抗體，例如，MHC、CD2、CD3、CD4、CDlla/CD18、CD7、CD25、CD27、B7、CD40、CD45、CD58、CD137、IC0S、CD150 (SLAM)、0X40、4_1BB或其配體；或其免疫調(diào)節(jié)化合物，例如CTLA4_Ig (阿巴西普，ORENCIA? )、CD28-1g、B7-H4-1g、或其他共刺激試劑，或粘附分子抑制劑，例如mAbs或低分子量抑制劑(包括LFA-1拮抗劑、選擇素拮抗劑以及VLA-4拮抗劑)，或另一種免疫調(diào)節(jié)試劑。
[0093] 可任選地，這種免疫病癥選自自體免疫性疾病、移植排斥、或移植物抗宿主疾病。
[0094]可任選地，該自體免疫性疾病選自下組，該組由以下各項組成:多發(fā)性硬化癥，包括復發(fā)型多發(fā)性硬化癥，原發(fā)性進展型多發(fā)性硬化癥，以及繼發(fā)進展型多發(fā)性硬化癥；牛皮癬；類風濕性關節(jié)炎；牛皮癬關節(jié)炎，系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE);潰瘍性結腸炎；克羅恩??；良性淋巴細胞脈管炎,血小板減少性紫癜,特發(fā)性血小板減少,特發(fā)性自體免疫性溶血性貧血，純紅細胞再生失調(diào)，修格蘭氏綜合征，風濕性疾病，結締組織疾病，炎性風濕病，退行性風濕病，關節(jié)外風濕病，幼年型類風濕性關節(jié)炎，痛風性關節(jié)炎(arthritis uratica),肌肉性風濕病，慢性多關節(jié)炎，冷球蛋白血癥性脈管炎(cryoglobulinemic vasculitis),ANCA-關聯(lián)性脈管炎，抗磷脂綜合征，重癥肌無力，自體免疫性溶血性貧血，格林-巴利綜合征，慢性免疫多神經(jīng)病，自體免疫性甲狀腺炎，胰島素依賴型糖尿病，I型糖尿病，阿狄森病，膜性腎小球性腎病，古德帕斯丘病(Goodpasture’s disease),自體免疫性胃炎，自體免疫性萎縮性胃炎，惡性貧血，天皰瘡，尋常型天皰瘡，肝硬化，原發(fā)性膽汁性肝硬化，皮肌炎，多肌炎，纖維肌炎，肌硬化，腹腔疾病，免疫球蛋白A腎病，過敏性紫癜，埃文斯綜合征(Evanssyndrome),異位性皮炎,牛皮癖,關節(jié)病性牛皮癖(psoriasis arthropathica), Graves氏病，Graves氏眼病，硬皮病，系統(tǒng)性硬皮病，進行性系統(tǒng)性硬皮病，哮喘，過敏癥，原發(fā)性膽汁性肝硬化，橋本氏甲狀腺炎(Hashimoto’s thyroiditis),原發(fā)性粘液性水腫，交感性眼炎，自體免疫性葡萄膜炎，肝炎，慢性活動性肝炎，膠原病，強直性脊柱炎，肩周炎，結節(jié)性全身動脈炎，軟骨鈣質(zhì)沉著病，韋格納氏肉芽腫病，顯微鏡下多血管炎，慢性蕁麻疹，大皰性皮膚病，類天皰瘡，異位性濕疫，德維克病(Devic’ s disease),兒童自體免疫性溶血性貧血，難治性或慢性自體免疫性血細胞減少，在獲得性A型血友病中阻止自體免疫性抗VIII因子抗體的發(fā)展，冷凝集素病，視神經(jīng)脊髓炎，僵人綜合征，牙齦炎，牙周炎，胰腺炎，心肌炎，脈管炎，胃炎，痛風，痛風性關節(jié)炎，以及炎性皮膚失調(diào)，選自下組，該組由以下各項組成:牛皮癖，異位性皮炎，濕疫，酒洛鼻，蕁麻疫，和痤瘡，normocomp lementemi c蕁麻疫性脈管炎，心包炎，肌炎，抗合成酶綜合征，鞏膜炎，巨噬細胞活化綜合征，貝凱特綜合征，PAPA綜合征，布勞綜合征，痛風，成年和少年斯蒂爾氏病(adult and juvenile Still’s disease),cryropyrinopathy,穆克勒-威爾斯綜合征(Muckle-Wells syndrome),家族性寒冷誘導自體炎癥綜合征，新生兒發(fā)病多系統(tǒng)炎性疾病，家族性地中海熱，慢性小兒神經(jīng)系統(tǒng)、皮膚和關節(jié)綜合征，系統(tǒng)性幼年特發(fā)性關節(jié)炎，超IgD綜合征(Hyper IgD syndrome),施尼茨勒綜合征(Schnitzler’s syndrome),自體免疫性視網(wǎng)膜病,年齡相關性黃斑變性,動脈硬化,慢性前列腺炎以及TNF受體-關聯(lián)性周期性綜合征(TRAPS)。
[0095]可任選地，該自體免疫性疾病選自下組，該組由任何以下各項的任何類型和亞型組成:多發(fā)性硬化癥、類風濕性關節(jié)炎、I型糖尿病、銀屑病、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、炎性腸病、葡萄膜炎以及修格蘭氏綜合征。
[0096]根據(jù)至少一些實施例，提供了一種用于治療或預防一種傳染病的方法，該方法包括向一個對其有需要的受試者給予一個有效量的任何一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或藥物組合物。
[0097]可任選地，該傳染病選自由細菌感染、病毒感染、真菌感染和/或其他寄生蟲感染導致的疾病。
[0098]可任選地，該傳染病選自乙型肝炎、丙型肝炎、感染性單核細胞增多癥、EBV、巨細胞病毒、AIDS、HIV-l、HIV-2、結核病、瘧疾以及血吸蟲病。
[0099]根據(jù)至少一些實施例，提供了一種用于治療或預防癌癥的方法，該方法包括向一個對其有需要的受試者給予一個有效量的任何一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或藥物組合物。
[0100]可任選地，將這種治療與另一個用于治療癌癥的部分或療法進行合并。
[0101]可任選地，該療法是放射療法、抗體療法、化學療法、光動力學療法、過繼性T細胞療法、Treg耗盡、手術或與常規(guī)藥物的聯(lián)合療法。
[0102]可任選地，該部分選自下組，該組由以下各項組成:免疫抑制劑、細胞毒類藥物、腫瘤疫苗、抗體(例如貝伐單抗、愛必妥)、肽、百普素體(pept1-bodies)、小分子、化學治療劑(例如細胞毒素劑以及細胞生長抑制劑(例如紫杉醇、順鉬、長春瑞賓、多西他賽、吉西他濱、替莫唑胺、伊立替康、5FU、卡鉬))、免疫學修飾劑(例如干擾素和白細胞介素)、免疫刺激抗體、生長激素或其他細胞因·子、葉酸、維生素、礦物質(zhì)、芳香酶抑制藥、RNA1、組蛋白脫酰酶抑制劑、以及蛋白酶抑制劑。
[0103]可任選地，這種癌癥選自下組，該組由以下各項組成:乳腺癌、宮頸癌、卵巢癌、子宮內(nèi)膜癌、黑色素瘤、膀胱癌、肺癌、胰腺癌、結腸癌、前列腺癌、白血病、急性淋巴細胞白血病、慢性淋巴細胞白血病、B-細胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、多發(fā)性骨髓瘤、何杰金氏淋巴瘤、非何杰金氏淋巴瘤、骨髓性白血病、急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病、甲狀腺癌、甲狀腺濾泡癌、骨髓增生異常綜合癥(MDS)、纖維肉瘤和橫紋肌肉瘤、黑色素瘤、葡萄膜黑色素瘤、畸胎癌、成神經(jīng)細胞瘤、神經(jīng)膠質(zhì)瘤、惡性膠質(zhì)瘤、皮膚的良性瘤、角化棘皮瘤、腎癌、間變性大細胞淋巴瘤、食管鱗狀細胞癌、肝細胞癌、濾泡樹突細胞癌、腸癌、肌肉浸潤性癌、精囊腫瘤、表皮癌、脾癌、膀胱癌、頭頸癌、胃癌、肝癌、骨癌、腦癌、視網(wǎng)膜癌、膽道癌、小腸癌、唾液腺癌、子宮癌、睪丸癌、結締組織癌、前列腺肥大、脊髓發(fā)育不良、瓦爾登斯特巨球蛋白血癥(Waldenstrom’s macroglobulinemia)、鼻咽癌、神經(jīng)內(nèi)分泌癌、骨髓增生異常綜合癥、間皮瘤、血管肉瘤、卡波濟氏肉瘤、良性腫瘤、食管癌、輸卵管癌、腹膜癌、乳頭狀漿液性勒氏癌、惡性腹水、胃腸道間質(zhì)瘤(GIST)、李弗勞明綜合征以及希佩爾-林道綜合征(VHL)，并且其中該癌癥是非轉移性的、浸潤性的或轉移性的。
[0104]可任選地，這種癌癥是黑色素瘤、肝癌、腎癌、腦癌、乳腺癌、結腸癌、肺癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、胃癌、多發(fā)性骨髓瘤、何杰金氏淋巴瘤、非何杰金氏淋巴瘤、急性和慢性淋巴性白血病以及急性和慢性骨髓性白血病中之一。[0105]根據(jù)至少一些實施例，提供了一種用于在一個患者上加強對一種抗原再次免疫應答的方法，該方法包括向一個受試者給予有效量的任何一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或藥物組合物。
[0106]可任選地，這種抗原是一種癌癥抗原、病毒性抗原或細菌性抗原，并且其中該患者已經(jīng)接受了使用一種抗癌劑疫苗或病毒性疫苗的治療。
[0107]—種在一個患者上的免疫療法，包括:
[0108]體內(nèi)或離體耐受性誘導，包括為了誘導耐受原性調(diào)節(jié)細胞的分化，向一個患者或向從該患者分離的白細胞給予有效量的任何以下各項:一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或藥物組合物；
[0109]所述細胞的離體富集和增殖；
[0110]向所述患者再輸注這些耐受原性調(diào)節(jié)細胞。
[0111]一種使用以下至少之一作為癌癥疫苗佐劑的方法:任何一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；一種如在此所描述的核苷酸序列；一種如在此所描述的表達載體；一種如在此所描述的宿主細胞，或一種如在此所描述的抗體；或一種藥物組合物，該方法包括向一個患者給予一個免疫原性量的感興趣的腫瘤相關抗原制劑；以及一種適合于免疫法的配制品中的癌癥疫苗佐劑，其中在該癌癥疫苗佐劑存在的情況下，針對該腫瘤相關抗原的免疫反應比在該癌癥疫苗佐劑不存在的情況下要強。
[0112]根據(jù)至少一些實施例，提供了一種將使用抗原的治療疫苗接種連同任一以下項的給予進行合并來治療感染的方法:一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或藥物組合物。
[0113]根據(jù)至少一些實施例，為了增加免疫應答，提供了一種將任一以下各項與一種佐劑、以及一種疫苗中的抗原進行合并的方法:一種如在此所描述的分離的多肽、或如在此所描述的融合蛋白；如在此所描述的核苷酸序列；如在此所描述的表達載體；如在此所描述的宿主細胞、或如在此所描述的抗體或藥物組合物。
[0114]可任選地，這種抗原是一種病毒性抗原、細菌性抗原、真菌抗原、寄生蟲抗原、和/或其他病原體的抗原。
[0115]根據(jù)至少一些實施例，任何一種根據(jù)本發(fā)明的至少一些實施例所述的前述治療劑可以用于過繼性免疫療法，包括針對以下的抗體和抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和 / 或替代支架:任一 LY6G6F、VSIG10、TMEM25 和 / 或 LSR 蛋白；LY6G6F、VSIGlO、TMEM25 和/或LSR分泌形式或可溶性形式或ECD和/或其變體、和/或直向同源物、和/或偶聯(lián)物。免疫耐受(immune tolerance或immunological tolerance)是通過它免疫系統(tǒng)不攻擊一種抗原的過程。它可以是‘天然的’或‘自體耐受’，其中身體不加載對自體抗原的免疫應答；或‘誘導耐受’，其中對外部抗原的耐受性可以通過處理免疫系統(tǒng)產(chǎn)生。它以三種形式出現(xiàn):中心耐受、外周耐受以及獲得性耐受。不希望被單一理論所束縛，除了自然殺傷細胞(MO、NKT細胞、樹突細胞(DC)以及細胞之外，耐受性還采用調(diào)節(jié)性免疫細胞-包括Tregs-直接抑制自體反應細胞，連同一些其他的具有免疫調(diào)節(jié)特性的細胞亞群-包括⑶8+T細胞以及其他類型的CD4+T細胞(Tr1、Tr3)。
[0116]可以通過阻斷共刺激或使共抑制性B7與其反受體接合來誘導耐受性。耐受性的轉移涉及已經(jīng)在體內(nèi)(即細胞分離之前)亦或離體用于耐受性的誘導的細胞的分離，這些細胞離體的富集和增殖，隨后是將這些增殖的細胞向該患者再輸注。這種方法可以被用來治療如在此所列舉的自體免疫性疾病、如在此所列舉的免疫相關疾病、移植排斥(transplantation rejection 和 graft rejection)。因此，根據(jù)至少一些實施例，為了誘導耐受原性調(diào)節(jié)細胞的分化，本發(fā)明提供了用于耐受性誘導的方法，這些方法包括向一個患者或向從該患者分離的白細胞體內(nèi)或離體治療給予有效量的以下各項:任一分離的可溶性 LY6G6F、VSIG10、TMEM25、LSR 多肽，或包括 LY6G6F、VSIG10、TMEM25、LSR、或其片段、或其至一種異源序列的融合物的細胞外結構域的多肽，和/或一種特異性針對任一 LY6G6F、VSIG10.TMEM25和/或LSR蛋白的多克隆抗體或單克隆抗體或抗原結合片段以及包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架，隨后是所述細胞的離體富集和增殖以及向所述患者再輸注這些耐受原性調(diào)節(jié)細胞。
[0117]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了用于在體外或在體內(nèi)檢測一個生物樣品或個體中的LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白的存在的測定，包括使該樣品與一種對于LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR多肽具有特異性的抗體和/或抗原結合片段和/或包含它們的偶聯(lián)物、和/或替代支架進行接觸，并且檢測在該樣品和/或個體中LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白的結合。
[0118]根據(jù)至少一些實施例，提供了在一個樣品中，用于檢測任一具有任一 SEQ ID NO:1-8、11-18、47-50、58、143的多肽，或與其至少95%相同的變體的存在的測定。
[0119]根據(jù)至少一些實施例，提供了一種用于診斷一個患者的疾病的方法，包括在該受試者或從所述受試者獲得的樣品中檢測任一具有任一 SEQ ID NO:1-8、11-18、47-50、58、143的多肽，或與其至少95%相同的變體、或其片段。
[0120]可任選地，在體內(nèi)或體外進行該多肽的檢測。
[0121]可任選地，該檢測是通過免疫測定進行的。
[0122]可任選地，使用如在此所描述的抗體或片段進行該檢測。
[0123]根據(jù)至少一些實施例，本發(fā)明提供了用于檢測一種疾病、診斷一種疾病、監(jiān)測一種疾病的疾病進展或療效或復發(fā)、或為一種疾病選擇一種療法、檢測被前述疾病感染的細胞的方法，包括檢測LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR的表達，其中這種疾病選自癌癥、如在此所列舉的感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)。
[0124]根據(jù)一個實施例，檢測這種多肽的存在指示該疾病的存在和/或其嚴重性和/或其進展。根據(jù)另一個實施例，與在一個健康受試者或從其獲得的一個樣品中該多肽的表達和/或水平相比，其表達和/或水平的變化指示該疾病的存在和/或其嚴重性和/或其進展。根據(jù)一個另外的實施例，與更早期在所述受試者或從其獲得的一個樣品中該多肽的表達和/或水平相比，其表達和/或水平的變化指示該疾病的進展。根據(jù)仍另外的實施例，檢測該多肽的存在和/ 或其在表達和/或水平上的相對變化對于選擇一種治療和/或監(jiān)測該疾病的治療來說是有用的。
[0125]附圖簡要說明
[0126]圖1 呈現(xiàn)了以下的氨基酸序列:LY6G6F (圖 1A，SEQ ID NO:1),VSIGlO (圖 1B、SEQID NO:3，和 1C, SEQ ID NO:5)、TMEM25 (圖1D, SEQ ID NO:7)、LSR (圖1E (SEQ ID NO:IDUF (SEQ ID NO:13)UG (SEQ ID NO:15)UH (SEQ ID NO:16),11 (SEQ ID N0:17)、和IJ (SEQ ID NO:18)蛋白、片段、E⑶以及對其進行編碼的相對應的核酸序列。對應于信號肽(SP)的氨基酸殘基以粗斜體出現(xiàn)。Ig-V和/或Ig-C結構域示于框中。對應于跨膜區(qū)(TM)的氨基酸殘基以粗體和下劃線形式出現(xiàn)。對應于一些亞型(在圖1B、和IE中)中的替代外顯子跳躍的氨基酸殘基以斜體和加下劃線形式出現(xiàn)。對應于VSIGlO(跳躍外顯子3)和LSR (同種型-e，跳躍外顯子3、4以及5)的替代外顯子跳躍變體的核酸序列分別以粗體出現(xiàn)在圖1C、和II中。對應于跨膜區(qū)(TM)的核酸序列以粗體和下劃線形式出現(xiàn)在圖1C中。對應于信號肽(SP)的核酸序列以粗斜體出現(xiàn)在圖1C、1E、1G、1H、11、以及IJ中。TGA終止密碼子突出于圖1C、和II中。
[0127]圖2呈現(xiàn)了以下之間的氨基酸序列比較:VSIG10變體SEQ ID NO:5與已知的VSIGlO 蛋白，SEQ ID NO:3 (genbank 登錄號 ΝΡ_061959.2)(圖 2Α) ；LSR_ 同種型 _a，SEQID NO:11 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 NP_991403SEQ ID NO:62 (圖 2B_1);LSR_ 同種型-a，SEQ ID NO:11 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 XP_002829104，SEQ ID NO:68(圖 2B-2) ；LSR_ 同種型-b, SEQ ID NO:13 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 NP_057009,SEQ ID NO:63 (圖 2C-1) ;LSR_ 同種型 _b，SEQ ID NO:13 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 BAC11614，SEQ ID NO:65 (圖 2C-2) ;LSR_ 同種型 _c，SEQ ID NO: 15 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 NP_991404，SEQ ID NO:66 (圖 2D-1) ；LSR_ 同種型 _c，SEQ ID NO:15與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 XP_002829105.1，SEQ ID NO:69 (圖 2D-2) ;LSR_ 同種型-d，SEQ ID NO:16 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 NP_991404，SEQ ID NO:66 (圖2E-1);LSR_ 同種型-d，SEQ ID NO: 16 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 XP002829105.1，SEQ ID NO:69 (圖 2E_2);LSR_ 同種型 _e，SEQ ID NO:17 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 BAG59226.1，SEQ ID NO:67 (圖 2F);LSR_ 同種型-f，SEQ ID NO:18 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 NP_991403，SEQ ID NO:62 (圖 2G-1) ;LSR_ 同種型-f，SEQ ID N0:18 與已知的 LSR 蛋白，genbank 登錄號 NP_991404，SEQ ID NO:66 (圖 2G-2)。VSIGlO 變體(SEQ IDNO:5)和LSR變體(SEQ ID NO:18)的獨特邊緣部分(獨特接合處)的序列是粗體并且是突出的(分別是圖2A和2G)。
`[0128]圖3示出了一幅散點圖，使用MED發(fā)現(xiàn)引擎在所有組織和病癥的虛擬面板上展示了編碼VSIGlO蛋白的VSIGlO轉錄本的表達，展示了在來自免疫系統(tǒng)的若干組細胞(主要是在白細胞)中，以及在不同癌癥病癥的若干組細胞(例如來自ALL的CDlO+白細胞以及來自AML的BM-CD34+細胞)中VSIGlO轉錄本的差異表達。
[0129]圖4示出了一幅散點圖，使用MED發(fā)現(xiàn)引擎在所有組織和病癥的虛擬面板上展示了編碼LSR蛋白的LSR轉錄本的表達，展示了在來自免疫系統(tǒng)的若干組細胞(主要是在骨髓細胞)中，以及在不同組織的癌性病癥的若干組細胞(例如在乳腺癌、肺癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌以及皮膚癌中)中LSR轉錄本的差異表達。
[0130]圖5A 呈現(xiàn)了 LY6G6F 人類(SEQ ID NO:1)和小鼠(reflNP_001156664.1，SEQ IDNO:29)的氨基酸序列比較。圖5B呈現(xiàn)了 VSIGlO人類(SEQ ID NO:3)和小鼠(splD3YX43.2，SEQ ID NO:30)的氨基酸序列比較。圖5C呈現(xiàn)了 LSR人類(SEQ ID N0:11)和小鼠(reflNP_059101.1，SEQ ID NO:31)亦或小鼠(reflNP_001157656.1，SEQ ID NO:32)的氨基酸序列比較.圖顯示了 TMEM25人類(SEQ ID NO:7)和小鼠(ref: lcll4109，SEQ IDNO:28)的氨基酸序列比較。
[0131]圖6呈現(xiàn)了一個表，該表匯總了用來克隆融合至EGFP的LY6G6F轉錄本的引物?；蛱禺愋蛄幸院隗w字示出；用于克隆目標的限制位點延伸是斜體的；并且Kozak序列是加下劃線的。
[0132]圖7呈現(xiàn)了融合至EGFP的LY6G6F全長DNA序列。對應于LY6G6F的全長序列的基因特異序列以黑體字標示，對應于EGFP序列的基因特異序列是非加粗斜體加下劃線的。
[0133]圖8呈現(xiàn)了融合至EGFP的生成的LY6G6F的全長氨基酸序列。對應于LY6G6F的全長序列的基因特異序列以黑體字標示；對應于EGFP序列的基因特異序列是非加粗斜體加下劃線的。
[0134]圖9呈現(xiàn)了在HEK293T細胞中瞬時表達的G6F_EGFP融合蛋白的細胞定位。這個圖像是使用共聚焦顯微鏡的40x物鏡獲得的。
[0135]圖10呈現(xiàn)了如下融合至小鼠IgG2a Fe的小鼠E⑶:小鼠LY6G6F (也稱為LY6G6F-1g,圖 10A),小鼠 VSIGlO (圖 10B),小鼠 TMEM25 (也稱為 TMEM25_Ig，圖 10C)或小鼠 LSR (也稱為 LSR-1g，圖 10D)ECD-mIgG2aFc 融合蛋白(分別是 SEQ ID NO:23、24、25、或26)。對應于信號肽(SP)的氨基酸殘基以斜體示出。對應于ECD序列的氨基酸殘基是加下劃線的。對應于小鼠IgG2a Fe的氨基酸殘基以黑體字示出(SEQ ID NO:27)。
[0136]圖11呈現(xiàn)了 融合至人類IgGl Fe的人類E⑶的氨基酸序列，其中在位置220處的Cys (根據(jù)全長人類IgGl7SEQ ID NO:70中的位置5)被一個Ser (SEQ ID NO:156)所替代，如下:融合至人類IgGl Fe的人類LY6G6F (圖11A)，人類VSIGlO (圖11B)，人類VSIGlO-跳躍外顯子3變體(圖11C)，人類TMEM25(圖11D)，人類LSR同種型a(圖11E)，人類LSR同種型b (圖11F)，人類LSR同種型c (圖11G)，人類LSR同種型d (圖11H)，人類LSR同種型e(圖111)，人類LSR同種型f (圖11J)ECD (分別是SEQ ID NO:71_80)。對應于信號肽(SP)的氨基酸殘基以粗斜體示出。對應于人類ECD序列的氨基酸殘基是加下劃線的。對應于人類IgGl Fe的氨基酸殘基是未標示的，其中在位置220處的Cys被一個Ser所替代(SEQ IDNO:156)。
[0137]圖12是一個直方圖，示出了通過或根據(jù)相對于正常樣品的癌性卵巢樣品中的LSR_seg24-36_200-309/310_擴增子(SEQ ID NO:140)可檢測的LSR轉錄本的過表達。
[0138]圖13是一個直方圖，示出了通過或根據(jù)相對于正常樣品的癌性乳腺樣品中的LSR_seg24-36_200-309/310_擴增子(SEQ ID NO:140)可檢測的LSR轉錄本的過表達。
[0139]圖14是一個直方圖，示出了通過或根據(jù)相對于正常樣品的癌性肺樣品中的LSR_seg24-36_200-309/310_擴增子(SEQ ID NO:140)可檢測的LSR轉錄本的過表達。
[0140]圖15是一個直方圖，示出了通過或根據(jù)相對于癌性樣品的正常組織樣品中的LSR_seg24-36_200-309/310_擴增子(SEQ ID NO:140)可檢測的LSR轉錄本的過表達。
[0141]圖16是一個直方圖，示出了通過或根據(jù)相對于正常樣品的癌性腎臟樣品中的LSR_seg24-36_200-309/310_擴增子(SEQ ID NO:140)可檢測的LSR轉錄本的過表達。
[0142]圖17是一個直方圖，示出了通過或根據(jù)相對于正常樣品的癌性肝臟樣品中的LSR_seg24-36_200-309/310_擴增子(SEQ ID NO:140)可檢測的LSR轉錄本的過表達。
[0143]圖18展示了在穩(wěn)定轉染的重組HEK293T細胞中LSR_P5a_Flag_m蛋白(SEQ ID NO:144)的表達的蛋白印跡分析,如用如下抗Flag (Sigma cat#A8592)(圖18A)和抗LSR抗體所檢測的:Abnova, cat#H00051599-B01P (圖 18B), Abeam, cat ab59646 (圖 18C)以及 Sigmacat#HPA007270(圖 18D)。條帶 1:HEK293T_pIRESpuro3 ;條帶 2:HEK293T_pIRESpuro3_LSR_P5a_Flag。
[0144] 圖19 展示了 LSR_P5a_Flag_m 的亞細胞定位。LSR_P5a_Flag_m (SEQ ID NO:144)主要定位至細胞的細胞質(zhì)，但是也可以在細胞表面檢測到，如用如下抗Flag (Sigmacat#A9594)(圖 19A)和抗 LSR 抗體所檢測的:Abeam, cat ab59646 (圖 19B), Abnova,cat#H00051599-B01P (圖 19C)以及 Sigma cat#HPA007270 (圖 19D)。
[0145]圖20展示了在不同細胞系中的LSR的內(nèi)源表達。在以下的提取物中用抗LSR抗體檢測到了對應于 LSR 的 72kDa 的一個條帶:(l)Caov3，(2)ES2，(3)0V_90，(4) 0VCAR3, (5)SK-0V3, (6)T0V112D, (7)CaCo2, (8) HeLa, (9) Hep G2, (10)MCF_7，(ll)SkBR3 以及(12)293T_LSR_P5a_Flag (圖 20A)?？?GAPDH (Abeam cat#ab9484)充當一個上樣對照(圖 20B)。
[0146]圖21是一個直方圖，示出了通過或根據(jù)在正常和癌性乳腺組織中的eg21-27-TMEM25_seg_21-27_200-344/346_擴增子(SEQ ID NO:123)可檢測的了]\^]\125轉錄本的表達。
[0147]圖22是一個直方圖，示出了通過或根據(jù)在不同正常組織中的eg21-27_TMEM25_seg_21-27_200-344/346_ 擴增子(SEQ ID NO:123)可檢測的 TMEM25 轉錄本的表達。
[0148]圖23展示了蛋白印跡結果，示出了(A)兔抗TMEM25抗體與TMEM25_P5蛋白(SEQID NO:7)和 TMEM25_P5_Flag (SEQ ID NO:129)而不是 HEK_293T_pRp3 之間的特異性相互作用。(B)TMEM25_P5_Flag蛋白(SEQ ID NO: 129)與抗-Flag抗體之間的特異性相互作用。條帶 1:HEK293T_pIRESpuro3 ;條帶 2:HEK293T_pIRESpuro3_TMEM25-P5 ;條帶 3:HEK293T_PIRESpuro3_TMEM25-P5-FIag。
[0149]圖24 呈現(xiàn)了使用抗 TMEM25 抗體的 TMEM25_P5 (SEQ ID NO:132)(圖 24A)和TMEM25_P5_Flag (SEQ ID NO:129)(圖24B)的細胞表面定位。圖24C展示了使用抗flag抗體(Sigma，目錄號:A9594)的 TMEM25_P5_Flag (SEQ ID NO:129)定位。
[0150]圖25展示了與被用作陰性對照的小鼠血清(1:2250)(圖25B)相比，在表達TMEM25_P5_Flag蛋白(1:2250)(圖25A)的HEK293T重組細胞中，抗TMEM25抗體結合至全長TMEM25蛋白，表明TMEM25蛋白的膜定位。
[0151]圖26呈現(xiàn)了蛋白印跡結果，示出了在不同細胞系種內(nèi)源TMEM25蛋白的表達:(1):HEK293T_pIRESpuro3, (2)HEK293T_pIRESpuro3_TMEM25-P5-Flag, (3)KARPAS, (4)G_361，(5)RPMI8226, (6)DAUDI, (7)Jurkat。
[0152]圖27 展示了使用抗 TMEM25 抗體(Sigma，cat#HPA012163),與穩(wěn)定表達 TMEM25_P5_FLAG、被亂序-SiRNA (Scrambled-SiRNA)(條帶 I) (Dharmacon，D-001810-10-05)轉染的 HEK293T 細胞相比，在穩(wěn)定表達 TMEM25_P5_Flag (SEQ ID NO: 129)、被 TMEM25_P5siRNA(L-018183-00-0005，Dharmacon)(條帶 2)轉染的 HEK293T 細胞中 TMEM25_P5_Flag 蛋白(SEQ ID NO:129)的特異性敲減。
[0153]圖28展示了在pH9抗原檢索方法中，與陰性對照細胞系空載體HEK293T細胞(第2列，圖B、D以及F)相比，在陽性對照細胞系(LSR_P5a_Flag_m轉染的HEK293T細胞)的切片中分別處于劑量依賴性濃度3ug/ml、lug/ml和0.3ug/ml的抗LSR (Cat n0.ab59646,Abeam)(第I列，圖A、C以及E)示出了特異免疫反應性。
[0154]圖29展示了在pH9抗原檢索方法中，與陰性對照細胞系空載體HEK293T細胞(第2列，圖B、D以及F)相比，在陽性對照細胞系(TMEM25_P5_Flag轉染的HEK293T細胞)的切片中分別處于劑量依賴性濃度3ug/ml、lug/ml和0.3ug/ml的抗TMEM25(Cat n0.HPA012163,Sigma)(第I列，圖A、C以及E)示出了特異免疫反應性。
[0155]圖 30A-F 示出了可溶性 LY6G6F-1g (SEQ ID NO:23)、TMEM25_Ig (SEQ ID NO:25)以及LSR-1g(SEQ ID NO:26)對小鼠T細胞活化的體外抑制作用。在來自充當APC的Balb/c小鼠的經(jīng)輻射處理的脾細胞的存在下，用20ug/ml (圖30A-C、E)或2ug/ml (圖D和F)的0VA323-339來誘導從D011.10小鼠的脾臟分離的T細胞的活化。在這些研究中，CTLA4_Ig或B7-H4-1g被用作陽性對照，而小鼠IgG2a被用作Ig對照。
[0156]圖31示出了珠粒結合的LSR-1g (SEQ ID NO:26)對由抗-CD3和抗-CD28包衣的珠粒誘導的T細胞增殖的體外抑制作用。
[0157]圖 32 示出了 LY6G6F、VSIG10、TMEM25 以及 LSR 融合蛋白(分別是 SEQ ID NO:23-26)對⑶4T細胞活化的作用，如通過減少的IFNy分泌(A)和活化標記⑶69 (B)減少的表達所證明的。每個條是兩份培養(yǎng)的平均值，誤差條表示標準差(與對照mIgG2a相比，學生 t 檢驗，*Ρ〈0.05，**ρ〈0.01)。
[0158]圖33 示出了表達對人類 LY6G6F、ΤΜΕΜ25 或 LSR (分別是 SEQ ID N0:l、7 或 11)進行編碼的cDNA的刺激細胞(一種鼠科胸腺瘤細胞系，Bw5147，將其工程化以表達膜結合的抗人類⑶3抗體片段)對bulk人類T細胞(圖33A)、⑶4+人類T細胞(圖33B)、⑶8+人類T細胞(圖33C)、或原始⑶4⑶45RA+人類T細胞(圖33D)的增生(CPM)的作用。結果顯示為6個(圖33A)或3個(圖33B、C、以及D)實驗的平均數(shù)+/-SEM0 *Ρ〈0.05、**ρ〈0.01、***ρ〈0.001、并且#ρ〈0.0001 (學生t檢驗)表示與空載體相比的顯著不同結果。
[0159]圖 34 示出了 LSR- 1g (SEQ ID NO:26)或 TMEM25_Ig (SEQ ID NO:25)治療在 SJL小鼠中的PLP139-151-誘導的R-EAE模型中的治療效果。將LSR-1g (SEQ ID NO:26)或TMEM25-1g (SEQ ID NO:25)以IOOmicrog/只小鼠從疾病緩解開始(第18天)以治療方式給予，1.p.(腹腔注射)每周3次，持續(xù)兩周。LSR-1g和TMEM25-1g對臨床癥狀的治療效果展示為平均臨床分數(shù)的減少(圖34A)。此外，在R-EAE誘導后的第35天(圖34B)，LSR-1g和TMEM25-1g治療抑制誘導表位(PLP139-151)或擴展表位(PLP178-191)的DTH應答。在這項研究中，與類似于測試蛋白的方案來給予的mIgG2a Ig陰性對照和CTLA4_Ig陽性對照相t匕，研究了 LSR-1g或TMEM25-1g的作用。
[0160]圖35示出了在SJL小鼠中的R-EAE模型中TMEM25_Ig (SEQ ID NO:25)的作用的劑量依賴性和作用方式。在這項研究中，從疾病緩解開始(第19天)以100、30或IOmicrog/只小鼠給予治療，1.P.(腹腔注射)每周3次，持續(xù)兩周，與以一種類似計劃給予的IOmicrog/只小鼠IgG2a對照進行比較，示出的是TMEM25-1g治療對疾病進程(圖35A)、在R-EAE誘導后第45天和第76天對擴展表位PLP178-191和MBP84-104的DTH應答(圖35B)、在疾病誘導后第45天和第75天分離的脾細胞的離體召回應答(recall response)(圖35C)以及、在疾病誘導后第45天分離的LN細胞(圖35D)的作用，如通過TMEM25_Ig治療對細胞增殖和細胞因子(IFNg、IL-17、IL-10以及IL-4)分泌的作用所證明的。用IOOug/劑量的TMEM25_Ig處理時，TMEM25-1g對脾臟、淋巴結和CNS連同CNS中存在的不同譜系(lineage)的細胞計數(shù)的作用示出于圖35E中。
[0161]圖36 示出了 VSIGlO-1g (SEQ ID NO:24)治療在 SJL 小鼠中的 PLP139-151-誘導的R-EAE模型中的治療效果。將VSIGlO-1g (SEQ ID NO:24)以IOOmicrog/只小鼠從疾病緩解開始(第19天)以治療方式給藥，1.p.(腹腔注射)每周3次，持續(xù)兩周。VSIGlO-1g對臨床癥狀的治療效果展示為平均臨床分數(shù)的減少(圖36A)。另此外，VSIGlO-1g治療抑制在R-EAE誘導后第45天和第76天對擴展表位(PLP178-191和MBP MBP84-104)的DTH應答(圖36B)。還示出了 VSIGlO-1g對在疾病誘導后第45天和第75天分離的脾細胞的離體召回應答(recall response)(圖36C)以及在疾病誘導后第45天分離的LN細胞(圖36D)的作用，如通過VSIGlO-1g治療對細胞增殖和細胞因子(IFNg、IL-17、IL-10以及IL-4)分泌的作用所證明的。用IOOug/劑量的VSIGlO-1g處理后，VSIGlO-1g對脾臟、淋巴結和CNS以及每種這些組織內(nèi)存在的不同譜系(lineage)的細胞計數(shù)的作用示出于圖36E中。在這項研究中，與類似于VSIGlO-1g的劑量和方案來給予的mIgG2a Ig對照相比，研究了 VSIGlO-1g的作用。
[0162]圖37 示出了以 IOOmicrog/ 只小鼠給予的 LSR-1g (SEQ ID NO:26), 1.p.(腹腔注射)每周3次，持續(xù)10天，在類風濕性關節(jié)炎的膠原誘導的關節(jié)炎(CIA)模型中的治療效果。對臨床分數(shù)(A)、爪腫脹(B)以及組織學損害(C)進行了測量，使用CTLA4-1g (lOOmicrog/只小鼠)和TNFR-1g (依那西普)作為陽性對照,而使用mIgG2a Ig對照(lOOmicrog/只小鼠)作為陰性對照。
[0163]圖38 示出了以 25mg/kg 給予的 LY6G6F-1g (SEQ ID NO:23), 1.p.(腹腔注射)每周3次，持續(xù)2周，在類風濕性關節(jié)炎的膠原誘導的關節(jié)炎(CIA)模型中的治療效果，其中根據(jù)臨床分數(shù)給出測量值。
[0164]對于圖12_17、21、22，將其分為單獨的部分等，僅是由于空間的原因，以便能夠示出所有結果。
[0165]發(fā)明詳細說明
[0166]在至少一些實施例中，本發(fā)明涉及任一被稱為LY6G6F、VSIGlO、TMEM25和/或LSR的蛋白，及其相對應的核酸序列，及其部分和變體和包含它們的融合蛋白以及偶聯(lián)物，和/或多克隆抗體和單克隆抗體和/或抗原結合片段和/或包含它們的偶聯(lián)物，和/或其結合LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR和/或其部分和/或變體的替代支架，和它們作為治療劑和/或診斷劑的用途，以及如在此所描述的不同用途。
[0167]轉讓給Genentech公司的美國專利申請?zhí)朥S2009117566、US20090017473、以及其他同族成員披露了一種在殘基234-254與354-374之間具有一個跨膜結構域的382個氨基酸的LY6G6F蛋白序列(DNA234441，腫瘤相關抗原靶標(TAT)TAT201，SEQ ID NO:92在其中)。來自這個專利家族的’566、’473申請以及其他申請披露TAT201在結腸癌和直腸癌中是過表達的。PCT申請?zhí)朩02003083074和W02004046342披露了一種382個氨基酸的LY6G6F蛋白序列，該蛋白序列作為在結腸癌細胞中過表達的許多基因之一。這些專利申請進一步據(jù)稱涉及使用LY6G6F用于檢測和治療結腸癌的方法。然而，這些專利申請沒有教導或提示或提供指導技術人員使用特異性針對LY6G6F和/或LY6G6F ECD的抗體用于治療和/或診斷除了結腸直腸癌之 外的癌癥、和/或感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的任何動機。這些專利申請沒有描述LY6G6F ECD并且沒有教導或提示或提供指導技術人員使用LY6G6FECD用于治療癌癥和/或感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的任何動機。
[0168]作為許多(數(shù)以百計至數(shù)以千計)對于診斷、預防、和治療與這些蛋白的異常表達或活性相關聯(lián)的失調(diào)而言有用的蛋白之一，TMEM25被披露于PCT申請?zhí)朩09958642和W02003087300,以及美國專利申請?zhí)朥S2007041963和US2005202526中。然而，這些申請沒有教導或提示或提供指導技術人員使用特異性針對TMEM25和/或TMEM25ECD的抗體來治療和/或診斷癌癥、和/或感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的任何動機。作為對于診斷、治療、預防或緩解疾病或失調(diào)(例如癌癥、貧血癥、關節(jié)炎、哮喘、炎性腸病或阿耳茨海默病)而言有用的數(shù)以百計的白蛋白融合蛋白之一，TMEM25還被披露于美國專利申請?zhí)朥S2004010134中。然而，這個申請沒有教導或提示或提供指導技術人員使用特異性針對TMEM25和/或TMEM25ECD的抗體來治療和/或診斷癌癥、和/或感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的任何動機。作為一種對于乳腺癌診斷有利的預后性以及預測性生物標記，TMEM25還被披露于杜蘭P (Doolan P)等人,《腫瘤生物學》(Tumour Biol )30 (4): 200-9中。然而，這個出版物沒有教導或提示或提供指導技術人員使用特異性針對TMEM25和/或TMEM25ECD的抗體來治療癌癥、和/或感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的任何動機。
[0169]為了使不同實施例中的本發(fā)明可更容易理解，首先定義某些術語。額外的定義貫穿詳細說明而闡明。
[0170]如在此使用，術語“分離的”是指一種處于不同于它天然發(fā)生的環(huán)境中的感興趣的化合物(例如多核苷酸或多肽)，例如分離自其天然的環(huán)境，例如通過將一種肽濃縮成一種在自然界中未發(fā)現(xiàn)的濃縮物。“分離的”包括樣品中的化合物，這些樣品實質(zhì)上富含感興趣的化合物和/或其中這種感興趣的化合物被部分地或充分地純化。
[0171]“免疫細胞”是指任何來自造血源的細胞，包括但不局限于T細胞、B細胞、單核細胞、樹突細胞、以及巨噬細胞。
·[0172]如在此使用，術語“多肽”是指一個任意長度的氨基酸鏈，無論是否被修飾(例如，磷酸化或糖基化)。
[0173]如在此使用，“共刺激多肽”或“共刺激分子”是一種一旦與T細胞上的細胞表面分子相互作用便調(diào)節(jié)T細胞應答的多肽。
[0174]如在此使用，“共刺激信號”是在抗原特異性T細胞應答過程中，來源于抗原遞呈細胞上的共刺激多肽與T細胞上的其受體之間的相互作用的信號活性。不希望受單一假設限制，相信抗原特異性T細胞應答由兩種信號介導:1)τ細胞受體(TCR)與在MHC的背景下呈遞的抗原性肽的接合，(信號1)，以及2)通過在不同共刺激受體/配體對之間的接觸遞送的一個第二抗原獨立性信號(信號2)。不希望受單一假設限制，此“第二信號”在決定T細胞應答的類型(活化vs抑制)以及該應答的強度和持續(xù)時間中是關鍵的，并且此“第二信號”由來自共刺激分子(例如Β7蛋白家族)的正信號和負信號兩者調(diào)節(jié)。
[0175]如在此使用，術語“Β7”多肽是指共刺激T細胞的Β7蛋白家族的一個成員，包括但不局限于:Β7-1、Β7-2、B7-DC、Β7-Η5、Β7-Η1、Β7-Η2、Β7-Η3、Β7-Η4、Β7-Η6、B7-S3 以及其生物活性的片段和/或變體。代表性生物活性片段包括共刺激T細胞的細胞外結構域或細胞外結構域片段。
[0176]如在此使用，與相對應的野生型多肽的氨基酸序列相比，“變體”多肽包含至少一個氨基酸序列改變。[0177]如在此使用，“保守的”氨基酸取代是指其中取代的氨基酸具有類似結構特性或化學特性的取代。如在此使用，術語“宿主細胞”是指可以向其中引入一個重組載體的原核細胞和真核細胞。
[0178]如在此使用，術語“邊緣部分”或“新接合處”是指根據(jù)本發(fā)明所述的剪接變體的兩個部分之間的連接，這兩個部分在野生型或已知蛋白中沒有被連接。例如，歸因于一種變體的上面“已知蛋白”部分與尾部之間的連接，一個邊緣能可任選地出現(xiàn)，和/或如果野生型序列的內(nèi)部部分不再存在，邊緣可以出現(xiàn)，這樣使得在該剪接變體中該序列的兩個部分現(xiàn)在是連續(xù)的，在已知蛋白中，這兩個部分是不連續(xù)的?！皹蚪印蹦芸扇芜x地是一種如上所述的邊緣部分，但是還可以包括頭部與一種變體的“已知蛋白”部分之間的一個連接、或尾部與一種變體的“已知蛋白”部分之間的一個連接、或一個插入與一種變體的“已知蛋白”部分之間的一個連接。
[0179]在一些實施例中，一個尾部或頭部或獨特插入與一種變體的“已知蛋白”部分之間的橋接包括至少約10個氨基酸，或在一些實施例中至少約20個氨基酸、或在一些實施例中至少約30個氨基酸、或在一些實施例中至少約40個氨基酸，其中至少一個氨基酸來自尾部/頭部/插入并且至少一個氨基酸來自一種變體的“已知蛋白”部分。在一些實施例中，該橋接可以包括從約10至約40個氨基酸的任意數(shù)目的氨基酸(例如，長為10、11、12、13...37、38、39、40個氨基酸、或中間的任意數(shù)目)。
[0180]應該指出的是，橋接不能在任一方向延伸超過該序列的長度，并且應該假設的是每個橋接描述都應以這樣的方式來解讀，使得該橋接的長度不延伸超過該序列自身。
[0181]此外，在下面的某些背景下，相對于滑動窗口對橋接進行了描述。例如，這些橋接的某些描述按以下格式為特征:兩個邊緣之間的橋接(其中已知蛋白的一個部分在變體中不存在)能可任選地描述 如下:C0NTIG-NAME_P1 (代表該蛋白的名稱)的一個橋接部分，包括一個具有長度“η”的多肽，其中η至少長約10個氨基酸，可任選地是至少長約20個氨基酸、至少長約30個氨基酸、至少長約40個氨基酸、或至少長約50個氨基酸，其中至少兩個氨基酸包括具有如下結構的XX (位于該橋接中心的2個氨基酸，一個來自該邊緣的每個末端)，具有如下結構(根據(jù)C0NTIG-NAME_P1的序列進行編碼):起始于任一氨基酸號49_x至49 (例如)并且終止于任一氨基酸號50+((n-2)-x)(例如)的序列，其中x從O至n_2變化。在這個實例中，應該還被解讀為包括其中η是長為10-50個氨基酸之間的任意數(shù)目的氨基酸的橋接。此外，該橋接多肽不能延伸超過該序列，因此應該這樣解讀，這樣使得49-χ (例如)不小于1，而50+((η-2)-χ)(例如)不大于總序列長度。
[0182]如在此使用，術語“癌癥”應該被理解為涵蓋任何腫瘤疾病(無論是浸潤性的還是轉移性的)，這種腫瘤疾病特征在于導致惡性生長或腫瘤的異常的并且不受控的細胞分裂?？梢杂酶鶕?jù)本發(fā)明的至少一些實施例所述的化合物來治療的癌癥的非限制性實例是實體瘤、肉瘤以及血液惡性腫瘤，包括但不局限于:乳腺癌(例如乳腺腫瘤)、宮頸癌、卵巢癌(卵巢腫瘤)、子宮內(nèi)膜癌、黑色素瘤、膀胱癌(膀胱腫瘤)、肺癌(例如腺癌和非小細胞肺癌)、胰腺癌(例如胰腺腫瘤，例如外分泌胰腺腫瘤)、結腸癌(例如結腸直腸腫瘤，例如結腸腺癌和結腸腺瘤)、前列腺癌(包括晚期疾病)、淋巴譜系的造血腫瘤(包括白血病、急性淋巴細胞白血病、慢性淋巴細胞白血病、B-細胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、多發(fā)性骨髓瘤、何杰金氏淋巴瘤、非何杰金氏淋巴瘤)、骨髓性白血病(例如，急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病)、甲狀腺癌、甲狀腺濾泡癌、骨髓增生異常綜合癥(MDS)、間充質(zhì)源的腫瘤(例如纖維肉瘤和橫紋肌肉瘤)、黑色素瘤、葡萄膜黑色素瘤、畸胎癌、成神經(jīng)細胞瘤、神經(jīng)膠質(zhì)瘤、惡性膠質(zhì)瘤、皮膚的良性瘤(例如角化棘皮瘤)、腎癌、間變性大細胞淋巴瘤、食管鱗狀細胞癌、肝細胞癌、濾泡樹突細胞癌、腸癌、肌肉浸潤性癌、精囊腫瘤、表皮癌、脾癌、膀胱癌、頭頸癌、胃癌、肝癌、骨癌、腦癌、視網(wǎng)膜癌、膽道癌、小腸癌、唾液腺癌、子宮癌、睪丸癌、結締組織癌、前列腺肥大、脊髓發(fā)育不良、瓦爾登斯特巨球蛋白血癥(Waldenstrom’s macroglobulinemia)、鼻咽癌、神經(jīng)內(nèi)分泌癌、骨髓增生異常綜合癥、間皮瘤、血管肉瘤、卡波濟氏肉瘤、良性腫瘤、食管癌、輸卵管癌、腹膜癌、乳頭狀漿液性勒氏癌、惡性腹水、胃腸道間質(zhì)瘤(GIST)，以及遺傳性癌癥綜合征，例如李弗勞明綜合征以及希佩爾-林道綜合征(VHL)，并且其中這種癌癥可以是非轉移性的、浸潤性的或轉移性的。
[0183]根據(jù)本發(fā)明的至少一些優(yōu)選的實施例，這種癌癥選自下組，該組由以下各項組成:黑色素瘤、肝癥、腎癥、腦癥、乳腺癥、結腸癥、肺癥、卵巢癥、胰腺癥、前列腺癥、胃癥、多發(fā)性骨髓瘤以及造血性癌癥，包括但不局限于淋巴瘤(何杰金氏和非何杰金氏)、急性和慢性淋巴性白血病以及急性和慢性骨髓性白血病，并且其中這種癌癥可以是非轉移性的、浸潤性的或轉移性的。
[0184]如在此使用，術語“自體免疫性疾病”應該被理解為涵蓋任何自體免疫性疾病以及慢性炎性病癥。根據(jù)本發(fā)明的至少一些實施例，這些自體免疫性疾病應該被理解為涵蓋選自下組的任何疾病失調(diào)或病癥，包括但不局限于:多發(fā)性硬化癥，包括復發(fā)型多發(fā)性硬化癥，原發(fā)性進展型多發(fā)性硬化癥，以及繼發(fā)進展型多發(fā)性硬化癥；牛皮癬；類風濕性關節(jié)炎；牛皮癬關節(jié)炎，系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE);潰瘍性結腸炎；克羅恩?。涣夹粤馨图毎}管炎,血小板減少性紫癜,特發(fā)性血小板減少,特發(fā)性自體免疫性溶血性貧血,純紅細胞再生失調(diào)，修格蘭氏綜合征，風濕性疾病，結締組織疾病，炎性風濕病，退行性風濕病，關節(jié)外風濕病，幼年型類風濕性關節(jié)炎，痛風性關節(jié)炎(arthritis uratica),肌肉性風濕病,慢性多關節(jié)炎，冷球蛋白血癥性脈管炎(cryoglobulinemic vasculitis),ANCA-關聯(lián)性脈管炎,抗磷脂綜合征，重癥肌無力，自體免疫性溶血性貧血，格林-巴利綜合征，慢性免疫多神經(jīng)病，自體免疫性甲狀腺炎，胰島素依賴型糖尿病，I型糖尿病，阿狄森病，膜性腎小球性腎病，古德帕斯丘病(Goodpasture’s disease),自體免疫性胃炎，自體免疫性萎縮性胃炎，惡性貧血，天皰瘡，尋常型天皰瘡，肝硬化，原發(fā)`性膽汁性肝硬化，皮肌炎，多肌炎，纖維肌炎，肌硬化，腹腔疾病，免疫球蛋白A腎病,過敏性紫癜,埃文斯綜合征(Evans syndrome),異位性皮炎，牛皮癖，關節(jié)病性牛皮癖(psoriasis arthropathica), Graves氏病，Graves氏眼病,硬皮病，系統(tǒng)性硬皮病，進行性系統(tǒng)性硬皮病，哮喘，過敏癥，原發(fā)性膽汁性肝硬化，橋本氏甲狀腺炎(Hashimoto’ s thyroiditis),原發(fā)性粘液性水腫,交感性眼炎，自體免疫性葡萄膜炎，肝炎，慢性活動性肝炎，膠原病，強直性脊柱炎，肩周炎，結節(jié)性全身動脈炎，軟骨鈣質(zhì)沉著病，韋格納氏肉芽腫病，顯微鏡下多血管炎，慢性蕁麻疹，大皰性皮膚病，類天皰瘡，異位性濕疫，德維克病(Devic’ s disease),兒童自體免疫性溶血性貧血,難治性或慢性自體免疫性血細胞減少，在獲得性A型血友病中阻止自體免疫性抗VIII因子抗體的發(fā)展，冷凝集素病，視神經(jīng)脊髓炎，僵人綜合征，牙齦炎，牙周炎，胰腺炎，心肌炎，脈管炎，胃炎，痛風，痛風性關節(jié)炎，以及炎性皮膚失調(diào)，選自下組，該組由以下各項組成:牛皮癬，異位性皮炎，濕疫，酒洛鼻，蕁麻疫，和痤瘡，normocomplementemic蕁麻疫性脈管炎,心包炎,肌炎，抗合成酶綜合征，鞏膜炎，巨噬細胞活化綜合征，貝凱特綜合征，PAPA綜合征，布勞綜合征，痛風，成年和少年斯蒂爾氏病(adult and juvenile Still’s disease), cryropyrinopathy,穆克勒-威爾斯綜合征(Muckle-Wells syndrome),家族性寒冷誘導自體炎癥綜合征,新生兒發(fā)病多系統(tǒng)炎性疾病，家族性地中海熱，慢性小兒神經(jīng)系統(tǒng)、皮膚和關節(jié)綜合征，系統(tǒng)性幼年特發(fā)性關節(jié)炎，超IgD綜合征(Hyper IgD syndrome),施尼茨勒綜合征(Schnitzler’ssyndrome),自體免疫性視網(wǎng)膜病，年齡相關性黃斑變性，動脈硬化，慢性前列腺炎以及TNF受體-關聯(lián)性周期性綜合征(TRAPS)。
[0185]可任選地并且優(yōu)選地，該自體免疫性疾病包括但不局限于任何以下各項的任何類型和亞型:多發(fā)性硬化癥、類風濕性關節(jié)炎、I型糖尿病、銀屑病、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、炎性腸病、葡萄膜炎、或修格蘭氏綜合征。
[0186]如在此使用，“多發(fā)性硬化癥”包括以下各項中的一種或多種:多發(fā)性硬化癥、良性多發(fā)性硬化癥、復發(fā)緩和多發(fā)性硬化癥、繼發(fā)進展型多發(fā)性硬化癥、原發(fā)性進展型多發(fā)性硬化癥、進展型復發(fā)多發(fā)性硬化癥、慢性進展型多發(fā)性硬化癥、過渡性/進展型多發(fā)性硬化癥、迅速惡化多發(fā)性硬化癥、臨床上確切的多發(fā)性硬化癥、惡性多發(fā)性硬化癥(也被稱為馬爾堡的變體(Marburg’s Variant))、以及急性多發(fā)性硬化癥?？扇芜x地,“涉及多發(fā)性硬化癥的病癥”包括，例如，德維克病(也被稱為視神經(jīng)脊髓炎)；急性播散性腦脊髓炎、急性脫髓鞘性視神經(jīng)炎、脫髓鞘橫貫性脊髓炎、米勒費歇爾綜合征(Miller-Fisher syndrome)、腦脊髓神經(jīng)根神經(jīng)病(encephalomyelradiculoneuropathy)、急性脫髓鞘多神經(jīng)病、腫瘤樣多發(fā)性硬化癥以及巴洛同心圓硬化癥。
[0187]如在此使用，“類風濕性關節(jié)炎”包括以下各項中的一種或多種:類風濕性關節(jié)炎、痛風和假性痛風、幼年特發(fā)性關節(jié)炎、幼年類風濕性關節(jié)炎、斯蒂爾病、強直性脊柱炎、類風濕性脈管炎。任選地，與類風濕性關節(jié)炎有關的病狀包括例如骨關節(jié)炎、肉狀瘤病、亨-舍二氏紫癜(Henoch-Schonlein purpura)、銀屑病性關節(jié)炎、反應性關節(jié)炎、脊柱關節(jié)病、膿毒性關節(jié)炎、血色病、肝炎、脈管炎、韋格納氏肉芽腫病(Wegener’s granulomatosis)、萊姆氏病(Lyme disease)、家族性地中海熱、具有回歸熱的高免疫球蛋白血癥D、TNF受體相關周期性綜合征，以及與炎性腸病相關的腸病性關節(jié)炎。
[0188]如在此使用，“葡萄膜炎”包括以下各項中的一種或多種:葡萄膜炎、前葡萄膜炎(或虹膜睫狀體炎)、中間型葡萄膜炎(睫狀體扁平部炎)、后葡萄膜炎(或脈絡膜視網(wǎng)膜炎)以及全葡萄膜炎(panuveitic)形式。
[0189]如在此使用，“炎性腸病”包括以下各項中的一種或多種:炎性腸病、克羅恩氏病、潰瘍性結腸炎(UC)、膠原性結腸炎、淋巴細胞性結腸炎、缺血性結腸炎、轉向性結腸炎、白塞氏病、不確定性結腸炎。
[0190]如在此使用，“銀屑病”包括以下各項中的一種或多種:銀屑病，非膿包型銀屑病(包括尋常型銀屑病和銀屑病性紅皮病(紅皮病型銀屑病))，膿包型銀屑病(包括泛化膿包型銀屑病(馮宗布什(von Zumbusch)的膿包型銀屑病))，掌跖膿皰病(持續(xù)性掌跖膿皰病、巴伯類型的膿包型銀屑病、肢末端的膿包型銀屑病)，環(huán)形膿皰型銀屑病，連續(xù)性肢末端皮炎，皰疹樣膿皰病?？扇芜x地，與銀屑病有關的病癥包括例如藥物誘導的銀屑病、皮褶銀屑病、尿布區(qū)銀屑病、脂溢性皮炎樣銀屑病、滴狀銀屑病、指甲銀屑病、銀屑病性關節(jié)炎。
[0191]如在此使用，“1型糖尿病”包括以下各項中的一種或多種:1型糖尿病、胰島素依賴型糖尿病、特發(fā)性糖尿病、幼年I型糖尿病、青年的成熟型發(fā)病型糖尿病、成人的隱匿性自體免疫糖尿病、妊娠期糖尿病。與I型糖尿病有關的病癥包括:神經(jīng)病變，包括多神經(jīng)病變、單神經(jīng)病變、周圍神經(jīng)病變以及自主神經(jīng)病變；眼睛并發(fā)癥:青光眼、白內(nèi)障、視網(wǎng)膜病。
[0192]如在此使用，“修格蘭氏綜合征”包括以下各項中的一種或多種:修格蘭氏綜合征、原發(fā)性修格蘭氏綜合征和繼發(fā)性修格蘭氏綜合征、以及涉及修格蘭氏綜合征的病癥，包括結締組織病，例如類風濕性關節(jié)炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、或硬皮病。其他并發(fā)癥包括肺炎，肺纖維化，間質(zhì)性腎炎，腎臟過濾器周圍組織的炎癥，腎小球性腎炎，腎小管性酸中毒，腕管綜合征，周圍神經(jīng)病變，顱神經(jīng)病變，原發(fā)性膽汁性肝硬變(PBC)，肝硬化，食道、胃、胰腺以及肝臟的炎癥(包括肝炎)，多肌炎，雷諾氏現(xiàn)象(Raynaud’s phenomenon),脈管炎，自體免疫甲狀腺問題，淋巴瘤。
[0193]如在此使用，“系統(tǒng)性紅斑狼瘡”包括以下各項中的一種或多種:系統(tǒng)性紅斑狼瘡、盤狀狼瘡、狼瘡性關節(jié)炎、狼瘡性肺炎、狼瘡性腎炎。與全身性紅斑狼瘡有關的病狀包括骨關節(jié)結核、抗磷脂抗體綜合征、心臟各個部分的炎癥(例如心包炎、心肌炎以及心內(nèi)膜炎)、肺以及胸膜炎癥、胸膜炎、胸膜腔積液、慢性彌散性間質(zhì)性肺病、肺動脈高壓、肺栓塞、肺出血，以及肺萎縮綜合征、狼瘡性頭痛、格-巴二氏綜合征(Guillain-Barre syndrome)、無菌性腦膜炎、脫髓鞘性綜合征、單神經(jīng)病變、多發(fā)性單神經(jīng)炎、重癥肌無力、脊髓病變、顱神經(jīng)病變、多神經(jīng)病變、脈管炎。
[0194]如在此使用，“免疫相關疾病(或失調(diào)或病癥)”應該被理解為涵蓋任何選自下組的疾病失調(diào)或病癥，包括但不 局限于:自體免疫性疾病，與移植物移植排斥反應相關聯(lián)的炎性失調(diào)和免疫失調(diào)，例如器官移植、同種異體干細胞移植、自體干細胞移植、骨髓移植的急性和慢性排斥反應，以及移植物抗宿主疾病。
[0195]如在此使用，可交換使用的術語“炎性失調(diào)”和/或“炎癥”包括特征在于對有害刺激(例如病原體、受損細胞、或刺激物)的失調(diào)的免疫應答的炎性異常。炎性失調(diào)構成非常多的人類疾病的基礎。在炎性過程中具有病因學源的非免疫性疾病包括癌癥、動脈硬化、以及缺血性心臟病。與炎癥相關聯(lián)的失調(diào)的實例包括:慢性前列腺炎，腎小球腎炎，超敏反應，盆腔炎，再灌注損傷，結節(jié)病，脈管炎，間質(zhì)性膀胱炎，normocomp lementemi c蕁麻疫性脈管炎，心包炎，肌炎，抗合成酶綜合征，鞏膜炎，巨噬細胞活化綜合征，白塞氏綜合征，PAPA綜合征，布勞氏綜合征，痛風，成人和幼年斯蒂爾病，cryropyrinopathy,穆克勒-威爾斯綜合征(Muckle-Wells syndrome),家族性寒冷誘導自體炎癥綜合征,新生兒發(fā)病多系統(tǒng)炎性疾病，家族性地中海熱，慢性嬰兒型神經(jīng)系統(tǒng)，皮膚和關節(jié)綜合征，系統(tǒng)性幼年特發(fā)性關節(jié)炎,超 IgD 綜合征(Hyper IgD syndrome),施尼茨勒綜合征(Schnitzler’s syndrome),TNF受體-關聯(lián)性周期性綜合征(TRAPSP)，牙齦炎，牙周炎，肝炎，肝硬化，胰腺炎，心肌炎，脈管炎，胃炎，痛風，痛風性關節(jié)炎，以及選自下組的炎性皮膚失調(diào)，該組由以下各項組成:銀屑病、異位性皮炎、濕疹、紅斑痤瘡、蕁麻疹、以及痤瘡。
[0196]如在此使用，可交換使用的術語“感染性失調(diào)和/或疾病”和/或“感染”包括由在一個單獨的宿主有機體中的病原性生物劑的存在和/或生長導致的任何失調(diào)、疾病和/或病癥。如在此使用，術語“感染”包括如上的展示出臨床上明顯的疾病(即，疾病的典型醫(yī)學征象和/或癥狀)和/或在其許多或全部過程中是無癥狀的失調(diào)、疾病和/或病癥。如在此使用，術語“感染”還包括由外源抗原的存留導致的失調(diào)、疾病和/或病癥，該外源抗原導致耗盡T細胞表型，耗盡T細胞表型特征在于減少的增殖以及細胞因子生產(chǎn)所證明的受損的功能性。如在此使用，術語“感染性失調(diào)和/或疾病”和/或“感染”進一步包括由細菌感染、病毒感染、真菌感染和/或寄生蟲感染導致的任何以下所列的感染性失調(diào)、疾病和/或病癥。
[0197]如在此使用，術語“病毒感染”由病毒導致的任何感染，可任選地包括但不局限于:逆轉錄病毒(例如人類免疫缺陷病毒，例如HIV-1或HIV-2，獲得性免疫缺陷(AIDS)(也被稱為HTLV-1I1、！^乂或耵…-^/^^或^乂-^”以及其他隔離群“列如HIV-LP ;小核糖核酸病毒科(例如脊髓灰質(zhì)炎病毒、甲肝病毒；腸道病毒、人類柯薩奇病毒、鼻病毒、?？刹《?；杯狀病毒科(例如導致腸胃炎的品系)；披膜病毒科(例如馬腦炎病毒、風疹病毒)；黃病毒科(例如登革熱病毒、腦炎病毒、黃熱病病毒)；冠狀病毒科(例如冠狀病毒)；彈狀病毒科(例如水泡性口炎病毒、狂犬病病毒);絲狀病毒科(例如埃博拉病毒);副粘病毒科(例如副流感病毒、腮腺炎病毒、麻疹病毒、呼吸道合胞體病毒);正粘病毒科(例如流感病毒);布尼亞病毒科(例如漢坦病毒、布尼亞病毒(bunga virus)、白蛉病毒以及Nairo病毒)；沙粒病毒科(出血熱病毒)；呼腸孤病毒科(例如呼腸孤病毒、環(huán)狀病毒以及輪狀病毒)；雙核糖核酸病毒科；噬肝病毒科(乙型肝炎病毒)；細小病毒科(細小病毒)；乳多空病毒科(乳頭狀瘤病毒、多瘤病毒)；腺病毒科(大多數(shù)腺病毒)；皰疫病毒科(herpesviridae)(單純性皰疫病毒(HSV)I和2、水痘帶狀皰疫病毒、巨細胞病毒(CMV)、皰疫病毒);痘病毒科(天花病毒、牛痘病毒、痘病毒);和虹彩病毒科(例如非洲豬瘟病毒);以及未分類的病毒(例如海綿狀腦病的病原學試劑，δ肝炎的試劑(被認為是乙型肝炎病毒的缺陷衛(wèi)星)，the agents of非甲型、非乙型肝炎的試劑(類別1-內(nèi)部傳輸?shù)?；類別2-腸道外傳輸?shù)?即，丙型肝炎)；諾瓦克和相關病毒，以及星狀病毒)連同嚴重急 性呼吸綜合征病毒和呼吸道合胞體病毒(RSV)。
[0198]如在此使用，術語“真菌感染”包括由真菌導致的任何感染，可任選地包括但不局限于:新型隱球菌，莢膜組織胞漿菌，粗球孢子菌，皮炎芽生菌，沙眼衣原體，白色念珠菌。
[0199]如在此使用，術語“寄生蟲感染”包括由寄生蟲導致的任何感染，可任選地包括但不局限于:原生動物，例如阿米巴原蟲(Amebae)、鞭毛蟲、惡性瘧原蟲、剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii)、纖毛蟲、球蟲、微孢子蟲、孢子蟲；螺蟲，線蟲(蛔蟲)，絳蟲(帶蟲(Tapeworm)),吸蟲(吸蟲(Fluke)),節(jié)肢動物，以及被稱為朊病毒的異常蛋白。
[0200]由細菌導致的感染性失調(diào)和/或疾病能可任選地包括以下各項中的一種或多種:敗血癥，感染性休克，鼻竇炎，皮膚感染，肺炎，支氣管炎，腦膜炎，細菌性陰道炎，泌尿道感染(UCI)，細菌性腸胃炎，膿皰病和丹毒，丹毒，蜂窩組織炎，炭疽，百日咳，萊姆氏病(lyme disease),布魯菌病,腸炎,急性腸炎,破傷風，白喉，偽膜性結腸炎，氣性壞疽，急性食品中毒，厭氧性蜂窩組織炎，醫(yī)院內(nèi)感染，腹瀉，嬰兒腦膜炎，旅行者腹瀉(Traveller’sdiarrhea),出血性結腸炎，溶血性尿毒癥綜合征，兔熱病，胃潰瘍，胃和十二指腸潰瘍，萊金奈爾病，龐蒂亞克熱，鉤末端螺旋體病，李斯特菌病，麻風病(韓森氏病(Hansen’sdisease))，結核病，淋病，新生兒眼炎，膿毒性關節(jié)炎，腦膜炎球菌病(包括腦膜炎、沃-弗綜合征)，假單胞菌感染，落磯山斑點熱，傷寒型沙門氏菌病，腸胃炎和小腸結腸炎沙門氏菌病，桿菌性痢疾/細菌性痢疾，凝固酶陽性金黃色葡萄球菌感染(coagulase-positivestaphylococcal infection):局部皮膚感染,包括彌漫性皮膚感染(膿皰病)、深層局部感染，急性感染性心內(nèi)膜炎，敗血癥，壞死性肺炎，Toxinoses (例如中毒性休克綜合征和葡萄球菌性食物中毒)，膀胱炎，子宮內(nèi)膜炎，中耳炎，鏈球菌性咽炎，猩紅熱，風濕熱，產(chǎn)褥熱，壞死性筋膜炎，霍亂，瘟疫(包括腺鼠疫和肺鼠疫)；以及由選自但不局限于以下的細菌導致的任何感染:幽門螺桿菌，伯氏疏螺旋體，嗜肺軍團菌，分枝桿菌屬(例如，結核分枝桿菌、鳥分枝桿菌、胞內(nèi)分枝桿菌、堪薩斯分枝桿菌、戈登分枝桿菌(M gordonae)),金黃色葡萄球菌，淋球菌，腦膜炎奈瑟氏球菌，單核細胞增生李斯特氏菌，釀膿鏈球菌(A組鏈球菌屬)，無乳鏈球菌(B組鏈球菌屬),鏈球菌屬(綠色群(viridans group)),糞鏈球菌,牛鏈球菌，鏈球菌屬(厭氧屬)，肺炎鏈球菌，致病性彎曲桿菌屬，腸球菌屬，流感嗜血桿菌，炭疽芽孢桿菌(Bacillus anthracis),白喉棒狀桿菌,棒狀桿菌屬，紅斑丹毒絲菌,產(chǎn)氣莢膜梭狀芽孢桿菌(Clostridium perfringers),破傷風梭菌,產(chǎn)氣腸桿菌,肺炎克雷伯氏菌，多殺性巴氏桿菌，擬桿菌屬，具核梭桿菌，Sreptobacillus moniliformis,梅毒螺旋體,雅司螺旋體,鉤末端螺旋體，以及 Actinomeyces israelii。
[0201]由病毒導致的感染性失調(diào)和/或疾病的非限制性實例選自下組，該組由以下各項組成，但不局限于:獲得性免疫缺陷(AIDS),西尼羅河腦炎(West Nile encephalitis),冠狀病毒感染，鼻病毒感染，流感，登革熱，出血熱；耳科感染；嚴重急性呼吸道綜合癥(SARS)，急性發(fā)熱性咽炎，咽結膜熱，流行性角膜結膜炎，嬰兒腸胃炎，感染性單核細胞增多癥，伯基特淋巴瘤，急性肝炎，慢性肝炎，肝硬化，肝細胞癌，原發(fā)性HSV-1感染(兒童齦口炎、成人扁桃體炎和咽炎，角膜結膜炎)，潛伏型HSV-1感染(唇皰疹(herpes labialis、cold sores))，無菌腦膜炎，巨細胞病毒感染，巨細胞包涵體病，卡波西肉瘤，卡斯爾曼病(Castleman disease),原發(fā)性滲出性淋巴瘤,流感,麻疫,腦炎，感染后腦脊髓炎，腿腺炎，增生性上皮病變(常見的平坦足底和肛門生殖器疣、喉部乳頭狀瘤，疣狀表皮發(fā)育不良)，義膜性喉炎，肺炎，細支氣管炎，脊髓灰質(zhì)炎，狂犬病，細支氣管炎，肺炎，德國風疹，先天性風疹，出血熱，水痘，登革熱，埃博拉病毒感染，埃可病毒感染，EBV感染，五號病(FifthDisease)，纖絲病毒，黃病毒，手足口病，帶狀皰疹病毒(帶狀皰疹(Shingle))，人類乳頭狀瘤病毒相關的表皮病變，拉沙熱，淋巴細胞性脈絡叢腦膜炎病毒，副流感病毒感染，副粘病毒，細小病毒B19感染,小核糖核酸病毒，痘病毒感染，輪狀病毒腹灣，風疫，麻疫，水痘，天花感染。
[0202]由真菌導致的感染性失調(diào)和/或疾病可任選地包括但不局限于:過敏性支氣管肺曲霉病，曲霉病(aspergilloma、aspergillosis),娃幾霉病(basidiobolomycosis),芽生菌病，念珠菌病，慢性肺曲菌病，壺菌病，球孢子菌病，耳霉病(Conidiobolomycosis)，覆蓋黑穗病(covered smut)(大麥)，隱球菌病，皮膚癖菌(dermatophyte),癖菌疫(dermatophytid),皮膚真菌病，毛內(nèi)癬菌(endothrix),昆蟲病原真菌，流行性淋巴管炎，流行性潰瘍綜合征，食管念珠菌病，Exothrix,真菌血癥，組織胞漿菌病，洛博芽生菌病(Lobomycosis), Massospora cicadina,霉菌病，草毒球月空菌(Mycosphaerellafragariae),鼓膜霉菌病(Myringomycosis),副球孢子菌病，致病性真菌,青霉菌病，千潰瘍病(Thousand cank ers disease),癖，Zeaspora,接合菌病。由寄生蟲導致的感染性失調(diào)和/或疾病的非限制性實例選自下組，該組由以下各項組成，但不局限于:棘阿米巴屬，阿米巴病，蛔蟲病，鉤蟲病，異尖線蟲病，巴貝蟲病，小袋蟲病，Baylisascariasis,Blastocystosis,寄生鲇(Candiru),美洲錐蟲病，支睪吸蟲病，錐蜆屬(Cochliomyia),球蟲，中國肝吸蟲隱孢子蟲病，雙核阿米巴病(Dientamoebiasis),裂頭絳蟲病，腎膨結線蟲感染(Dioctophyme renalis infection),龍線蟲病，棘球蝴病，象皮腫，蟯蟲病，片吸蟲病，姜片蟲病，絲蟲病，賈弟蟲病，腭口線蟲病，膜殼絳蟲病，片吸蟲病綜合征(HalzounSyndrome ),等孢球蟲病，片山熱(Katayama f ever ),利什曼病,淋巴絲蟲病,拒疾,后殖吸蟲病，蠅蛆病，蟠尾絲蟲病，虱病，原發(fā)性阿米巴腦膜炎，寄生性肺炎，肺吸蟲病，疥瘡，血吸蟲病，昏睡病，類圓線蟲病，裂頭蝴病，鼻孢子菌病，盤尾絲蟲病，絳蟲病(囊尾蝴病的原因)，弓蛔蟲病，弓形體病，旋毛蟲病，滴蟲病，鞭蟲病，錐體蟲病，帶蟲感染(Tapeworm infection)。
[0203]傳染病的一個優(yōu)選實例是由任一以下項導致的疾病:乙型肝炎、丙型肝炎、傳染性單核細胞增多癥、EBV、巨細胞病毒、AIDS、HIV-1、HIV-2、結核病、瘧疾以及血吸蟲病。
[0204]如在此使用，術語“疫苗”是指改善對一種具體疾病的免疫性的一種生物制劑，其中該疫苗包括一種抗原，例如削弱形式或殺死形式的病原體，引起針對其毒素或其表面蛋白之一的免疫應答。一種疫苗典型地包括一種作為免疫增強劑來刺激免疫系統(tǒng)的佐劑。如在此使用，術語“治療疫苗”和/或“治療疫苗接種”是指一種用于治療持續(xù)性疾病(例如傳染病或癌癥)的疫苗。
[0205]如在此使用，術語“佐劑”是指一種用于刺激免疫系統(tǒng)并且增加對一種疫苗的應答、而本身不具有任何特異性抗原作用的試劑。
[0206]如在此使用，術語LY6G6F和/或一種或多種LY6G6F蛋白是指在SEQ ID NO:1中所闡明的任一蛋白、和/或其變體、和/或其直向同源物和/或片段、和/或對其進行編碼的核酸序列，它們在如在此所列舉的癌癥和/或在如在此所列舉的感染性失調(diào)、和/或如在此所列舉的免疫相關失調(diào)中分化表達，和/或在癌癥、和/或在感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的病因學中發(fā)揮作用。
[0207]根據(jù)優(yōu)選實施·例，一個LY6G6F片段包括在任一 SEQ ID NO:2、59、81、96中所闡明的LY6G6F胞外結構域的氨基酸序列，和/或其變體。根據(jù)優(yōu)選實施例，一種LY6G6F直向同源物包括任一 SEQ ID N0:20、29。根據(jù)優(yōu)選實施例，一種編碼LY6G6F蛋白的核酸序列包括SEQ ID NO:33,57 或 182。
[0208]如在此使用，術語VSIGlO和/或一種或多種VSIGlO蛋白是指在任一 SEQ ID NO:
3、5中所闡明的任一蛋白、和/或其變體、和/或其直向同源物和/或片段、和/或對其進行編碼的核酸序列，它們在如在此所列舉的癌癥和/或在如在此所列舉的感染性失調(diào)、和/或如在此所列舉的免疫相關失調(diào)中分化表達，和/或在癌癥和/或在感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的病因學中發(fā)揮作用。
[0209]根據(jù)優(yōu)選實施例，一個VSIGlO片段包括在任一 SEQ ID NO:4、6、60、61、82_93、97-100中所闡明的VSIGlO胞外結構域的氨基酸序列，和/或其變體，和/或包括展示于圖2A中的VSIGlO變體(SEQ ID NO:5)獨特邊緣部分的氨基酸序列。根據(jù)優(yōu)選實施例，一種VSIGlO直向同源物包括任一 SEQ ID NO: 19、30。根據(jù)優(yōu)選實施例，一種編碼VSIGlO蛋白的核酸序列包括任一 SEQ ID NO:34、35、36、183、或 184。
[0210]如在此使用，術語TMEM25和/或一種或多種TMEM25蛋白是指在任一 SEQ ID NO:7,39中所闡明的任一蛋白、和/或其變體、和/或其直向同源物和/或片段、和/或對其進行編碼的核酸序列，它們在如在此所列舉的癌癥和/或在如在此所列舉的感染性失調(diào)、和/或如在此所列舉的免疫相關失調(diào)中分化表達，和/或在癌癥和/或在感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的病因學中發(fā)揮作用。
[0211]根據(jù)優(yōu)選實施例，一個TMEM25片段包括在任一 SEQ ID NO:8、39、94、101中所闡明的TMEM25胞外結構域的氨基酸序列，和/或其變體。根據(jù)優(yōu)選實施例，一種TMEM25直向同源物包括具有根據(jù)任一 SEQ ID NO:9、和/或28的序列的蛋白。根據(jù)優(yōu)選實施例，一種編碼TMEM25蛋白的核酸序列包括任一 SEQ ID NO:37或185。
[0212]如在此使用，術語LSR和/或一種或多種LSR蛋白是指在任一 SEQ ID N0:ll、13、15-18、143中所闡明的任一蛋白、和/或其變體、和/或其直向同源物和/或片段、和/或對其進行編碼的核酸序列，它們在如在此所列舉的癌癥和/或在如在此所列舉的感染性失調(diào)、和/或如在此所列舉的免疫相關失調(diào)中分化表達，和/或在癌癥和/或在感染性失調(diào)、和/或免疫相關失調(diào)的病因學中發(fā)揮作用。
[0213]根據(jù)優(yōu)選實施例，一個LSR片段包括在任一 SEQ ID NO: 10、12、14、22、47_50、95、102中所闡明的LSR胞外結構域的氨基酸序列，和/或其變體，和/或包括展示于圖2G中的LSR變體(SEQ ID NO:18)獨特邊緣部分的氨基酸序列。LSR直向同源物的一個實例呈現(xiàn)于任一 SEQ ID NO:21、31、32中。根據(jù)優(yōu)選實施例，一種編碼LSR蛋白的核酸序列包括任一SEQ ID NO:40-46、132、155、188、186、187、145、154。
[0214]不希望受單一假設限制，根據(jù)本發(fā)明的至少一些實施例，每種LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白被預測為一種免疫共刺激蛋白，例如在B7免疫共刺激中涉及的B7蛋白家族成員(包括例如針對癌細胞引起的T細胞應答)，以及引起對免疫性的作用(例如自體免疫作用的觸發(fā))的B7蛋白家族成員。
[0215]如在此使用，LY6G6F、VSIGlO、TMEM25和/或LSR的“可溶性胞外結構域(ECD)”或“胞外結構域”或“一種或多種可溶性LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR蛋白/分子”是指非細胞表面結合的(即循環(huán)的)LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR分子或其任何部分，包括但不局限于:LY6G6F、VSIG10、TMEM25 和 / 或LSR-1g 融合蛋白，其中 LY6G6F、VSIGlO、TMEM25和/或LSR的細胞外結構域被融合至一個免疫`球蛋白(Ig)部分，使得該融合分子可溶，或其片段和衍生物；具有與一部分生物活性或化學物活性蛋白融合或與其連接的LY6G6F、VSIG10.TMEM25和/或LSR的細胞外結構域的蛋白，例如乳頭狀瘤病毒E7基因產(chǎn)物、黑色素瘤相關抗原P97或HIV env蛋白，或其片段和衍生物；雜種(嵌合體)融合蛋白，例如LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR-1g，或其片段和衍生物。此類融合蛋白在下面更加詳細地進行了描述。
[0216]“一種或多種可溶性LY6G6F、VSIGlO、TMEM25和/或LSR蛋白/分子”還包括其中跨膜結構域被除去以使得該蛋白可溶的LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR分子，或其片段和衍生物；其片段、部分或衍生物，以及可溶性LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR突變分子。在根據(jù)本發(fā)明的至少一些實施例所述的方法中使用的可溶性LY6G6F、VSIG10、TMEM25和/或LSR分子可以包括或可以不包括信號(前導序列)肽序列。
[0217]LY6G6F多肽的片段
[0218]術語LY6G6F的“可溶性胞外結構域(E⑶)”或“胞外結構域”或“可溶性”形式還指對LY6G6F “可溶性胞外結構域(E⑶)”或“胞外結構域”或“可溶性LY6G6F蛋白/分子”)的相對應的蛋白進行編碼的核酸序列。可任選地，LY6G6F ECD是指任一下面的多肽序列和/或任一在下表A中所列的多肽序列，和/或與其擁有至少80%序列同一性，更優(yōu)選至少90%序列同一性并且甚至更優(yōu)選至少95%、96%、97%、98%或99%序列同一性的其片段或變體，和/或其偶聯(lián)物，和/或對其進行編碼的多核苷酸:
[0219]SEQ ID NO:2，氨基酸殘基17-234 (不包括信號肽，直到跨膜)(圖1A):
[0220]ADNMQAIYVALGEAVELPCPSPPTLHGDEHLSWFCSPAAGSFTTLVAQVQVGRPAPDPGKPGRESRLRLLGNYSLWLEGSKEEDAGRYWCAVLGQHHNYQNWRVYDVLVLKGSQLSARAADGSPCNVLLCSVVPSRRMDSVTWQEGKGPVRGRVQSFWGSEAALLLVCPGEGLSEPRSRRPRIIRCLMTHNKGVSFSLAASIDASPALCAPSTGWDMP,
[0221]以及與其擁有至少80%序列一致性、更優(yōu)選至少90%序列一致性并且甚至更優(yōu)選至少95%、96%、97%、98%或99%序列一致性的其片段和變體。SEQ ID NO:59代表LY6G6F ECD(包括信號肽)的一個實例。
[0222]表A
[0223]
【權利要求】
1.一種分離的多肽，包括一個選自下組的序列的可溶性胞外結構域的至少98個氨基酸，該組由SEQ ID NO:11、13、15-18、67、以及143組成;一個選自下組的序列的可溶性胞外結構域的至少62個氨基酸，該組由SEQ ID NO:1和58組成；一個選自下組的序列的可溶性胞外結構域的至少36個氨基酸，該組由SEQ ID NO:3和5組成；或SEQ ID NO:7的可溶性胞外結構域的至少46個氨基酸，或一種基本上由如在SEQ ID NO:5中所闡明的氨基酸序列或與其擁有至少95%序列一致性的變體組成的分離的多肽；或變體、或直向同源物、或片段。
2.如權利要求1所述的多肽，所述分離的多肽只包括:選自下組的序列的98至180個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:11、13、15-18、67、以及143組成；選自下組的序列的62至228個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:1和58組成；選自下組的序列的36與393個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:3和5組成；或SEQ ID NO:7的46與216個之間的氨基酸。
3.如權利要求1所述的多肽，所述分離的多肽選自下組，該組由只包括以下的多肽組成:選自下組的序列的98至118、135至155、以及160至180個之間的氨基酸，該組由SEQID NO:11、13、15-18、67、以及143組成；選自下組的序列的62至82、95至115,208至228個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:1和58組成；選自下組的序列的36至70、80至100、170至200、265至290、365至393個之間的氨基酸，該組由SEQ ID NO:3和5組成；或SEQID NO:7的46至66、84至104、196至216個之間的氨基酸。
4.如權利要求1所述的多肽，所述分離的多肽只包括:選自下組的序列的約72、106、或218個氨基酸，該組由SEQ ID NO:l和58組成；選自下組的序列的約108、145、或170個氨基酸，該組由 SEQ ID NO:11、13、15-18、67、以及 143 組成；SEQ ID NO:7 的約 56、94、或 206個氨基酸；或 SEQ ID NO:3 和 5 的約 46、49、58、60、87、89、93、94、178、182、185、187、273、279、282、374或383個氨基酸。
5.如權利要求1所述 的多肽，基本上由與在任一SEQ ID NO:12、2、4-6、8、14、47-50、10、15-18、22、39、59-61 ;81_102中所闡明的氨基酸序列具有至少95%序列一致性的氨基酸序列組成。
6.如權利要求5所述的多肽，其中所述多肽基本上由在任一SEQ ID NO:12、2、4-6、8、14、47-50、10、15-18、22、39、59-61 ;81_102 中所闡明的氨基酸序列組成。
7.如權利要求1-6中任一項所述的多肽，其中所述多肽阻斷或抑制LSR、TMEM25、VSIG10、LY6G6F、或其片段或變體與一種相對應的功能性對應物的相互作用。
8.如權利要求1-6中任一項所述的多肽，其中所述多肽替代或增加LSR、TMEM25、VSIG10、LY6G6F、或其片段或變體與相對應的功能性對應物的相互作用。
9.如權利要求1-6中任一項所述的多肽，其中所述直向同源物是選自SEQID NO:9,19-21的小鼠多肽。
10.一種融合蛋白，包括連接至一種異源序列的如權利要求1-6中任一項所述的多肽。
11.根據(jù)權利要求10所述的融合蛋白，其中該異源序列包括一個免疫球蛋白分子的至少一部分。
12.如權利要求11所述的融合蛋白，其中該免疫球蛋白分子部分是一個免疫球蛋白重鏈恒定區(qū)Fe片段。
13.如權利要求12所述的融合蛋白，其中該免疫球蛋白重鏈恒定區(qū)來源于一種選自下組的免疫球蛋白同種型，該組由以下各項組成:IgGl、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgE、IgA以及IgD。
14.根據(jù)權利要求13所述的融合蛋白，具有任一SEQ ID N0:71-80、172-181中所闡明的氨基酸序列。
15.根據(jù)權利要求13所述的融合蛋白，具有在任一SEQ ID NO:23-26中所闡明的氨基酸序列。
16.如權利要求15所述的融合蛋白，該融合蛋白調(diào)節(jié)體外或體內(nèi)的免疫細胞應答。
17.一種對如權利要求1-16中任一項所述的多肽進行編碼的核酸序列。
18.根據(jù)權利要求17所述的核酸序列，選自下組，該組由以下各項組成:SEQID NO:33-37、40-46、132、155、182-198，或與其擁有至少95%序列一致性的其變體，或其退化變體。
19.一種表達載體或病毒,包含至少一種根據(jù)權利要求17或18所述的核酸序列。
20.—種重組細胞,包括一種表達載體或病毒，該表達載體或病毒包含一種根據(jù)權利要求19所述的核酸序列，其中該細胞組成性地表達或可誘導地表達由DNA區(qū)段編碼的多肽。
21.一種生產(chǎn)LSR、TMEM25、VSIG10、LY6G6F可溶性胞外域多肽、或其片段或融合蛋白的方法，該方法包括將根據(jù)權利要求20所述的重組細胞在由此該細胞表達由該DNA區(qū)段或核酸編碼的多肽的條件下培養(yǎng)，并且回收所述多肽。
22.一種單克隆抗體或多克隆抗體或其抗原結合片段，包括一個特異性結合至權利要求1-9中任一項所述的任一多 肽、或其一個片段、或與其至少95%相同的變體、或其表位的抗原結合位點。
23.如權利要求22所述的抗體或抗原結合片段，其中該抗原結合位點包括一個構象的或線性的表位，并且其中該抗原結合位點包含約3-7個連續(xù)的或非連續(xù)的氨基酸。
24.根據(jù)權利要求22或23所述的抗體或片段，其中該抗體是一種完全人類抗體、嵌合抗體、人化或靈長化抗體。
25.根據(jù)權利要求22或23所述的抗體或抗原結合片段，其中該抗體選自下組，該組由以下各項組成:Fab、Fab’、F (ab') 2、F (ab')、F (ab)、Fv或scFv片段和最小識別單位。
26.根據(jù)權利要求22-25中任一項所述的抗體或抗原結合片段，其中該抗體被偶聯(lián)至一個選自以下的部分:一種藥物、放射性核素、熒光團、酶、毒素、治療劑、或化學治療劑；并且其中可檢測的標記是一種放射性同位素、金屬螫合劑、酶、熒光化合物、生物發(fā)光化合物或化學發(fā)光化合物。
27.如權利要求22-26中任一項所述的抗體或抗原結合片段，其中所述抗體阻斷或抑制任一 LSR、TMEM25、VSIGlO、LY6G6F多肽、或其片段或變體與一種對應物的相互作用。
28.如權利要求22-26中任一項所述的抗體或抗原結合片段，其中所述抗體替代或增加任一 LSR、TMEM25、VSIG10、LY6G6F多肽、或其片段或變體與一種對應物的相互作用。
29.如權利要求22-26中任一項所述的抗體或抗原結合片段，其中所述抗體引起癌細胞的凋亡或溶解，這些癌細胞表達任一 LSR、TMEM25、VSIG10、LY6G6F蛋白。
30.如權利要求29所述的抗體或抗原結合片段，其中所述凋亡或溶解涉及該抗體的CDC或ADCC活性。
31.一種藥物組合物，包括:一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，或根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體，并且進一步包括一種藥學上可接受的稀釋劑或運載體。
32.以下任一項的用途:任一根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體，或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物，其中向受試者的這樣的給藥抑制或減少T細胞的活化。
33.以下任一項用于治療癌癥的用途:任何一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體，或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
34.以下任一項用于治療感染性失調(diào)的用途:任何一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體，或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
35.在一個受試者上進行以下一種或多種的方法: a.上調(diào)細胞因子； b.誘導T細胞的增殖； c.促進抗原特異性T細胞免疫； d.促進⑶4+和/或⑶8+T細胞活化； 該方法包括向該受試者給予以下任一項:任一根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體，或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
36.一種用于治療或預防免疫系統(tǒng)相關病癥的方法，該方法包括向一個對其有需要的受試者給予一個有效量的以下任一項:任何一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體，或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
37.如權利要求36所述的方法，其中該免疫系統(tǒng)相關病癥包括一種免疫相關病癥、如在此所列舉的自體免疫性疾病、移植排斥和移植物抗宿主疾病和/或用于阻斷或促進由任一 LSR、TMEM25、VSIG10和/或LY6G6F多肽介導的免疫共刺激、如在此所列舉的免疫相關疾病和/或用于免疫療法(促進或抑制免疫共刺激)。
38.如權利要求36或37所述的方法，其中將該治療與對于治療免疫相關病癥有用的另一個部分進行合并。
39.如權利要求38所述的方法，其中該部分選自下組，該組由以下各項組成:免疫抑制劑(例如皮質(zhì)類固醇、環(huán)孢霉素、環(huán)磷酰胺、潑尼松、硫唑嘌呤、甲氨蝶呤、西羅莫司、他克莫司)，生物劑(例如TNF- a阻斷劑或拮抗劑、或任何其他靶向任何炎性細胞因子的生物劑)，非甾體抗炎藥物/Cox-2抑制劑,羥基氯喹,柳氮磺胺吡啶(sulphasalazopryine),氯金酸鈉，依那西普，英利昔單抗，嗎替麥考酚酯，巴利昔單抗，阿塞西普，利妥昔單抗，環(huán)磷酰胺，干擾素卩-la，干擾素3 _lb，醋酸格拉默，鹽酸米托蒽醌，阿那白滯素和/或其他生物制劑和/或靜脈注射免疫球蛋白(IVIG)，干擾素類(例如IFN-P-1a (REBIF?和AVONEX?)以及l(fā)FN-3-lb (BETASERON?));醋酸格拉默(COPAXONE?),多肽；那他珠單抗(TYSABRI?)，米托蒽醌(NOVANTRONE?)，細胞毒素劑，鈣調(diào)神經(jīng)磷酸酶抑制齊lj(例如環(huán)孢霉素A或FK506)種免疫抑制大環(huán)內(nèi)酯，例如西羅莫司或其衍生物；例如40-0- (2-羥基)乙基-西羅莫司，一種淋巴細胞歸巢試劑，例如FTY720或其類似物，皮質(zhì)類固醇；環(huán)磷酰胺；硫唑嘌呤；甲氨蝶呤；來氟米特或其類似物；咪唑立賓；麥考酚酸；嗎替麥考酹酯；15_deoxyspergualine或其類似物；免疫抑制單克隆抗體，例如，白細胞受體的單克隆抗體，例如，MHC、CD2、CD3、CD4、CDlla/CD18、CD7、CD25、CD27、B7、CD40、CD45、CD58、CD137、I COS, CD150 (SLAM)、0X40、4_1BB或其配體；或其免疫調(diào)節(jié)化合物，例如CTLA4_Ig(阿巴西普，ORENCIA?)、CD28-1g、B7-H4-1g、或其共刺激試劑，或粘附分子抑制劑，例如mAbs或低分子量抑制劑(包括LFA-1拮抗劑、選擇素拮抗劑以及VLA-4拮抗劑)，或另一種免疫調(diào)節(jié)試劑。
40.如權利要求36-39中任一項所述的方法，其中所述免疫病癥選自自體免疫性疾病、移植排斥、或移植物抗宿主疾病。
41.如權利要求40所述的方法，其中該自體免疫性疾病選自下組，該組由以下各項組成:多發(fā)性硬化癥，包括復 發(fā)型多發(fā)性硬化癥，原發(fā)性進展型多發(fā)性硬化癥，以及繼發(fā)進展型多發(fā)性硬化癥；銀屑病；類風濕性關節(jié)炎；銀屑病關節(jié)炎；系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)；潰瘍性結腸炎；克羅恩??；良性淋巴細胞脈管炎，血小板減少性紫癜，特發(fā)性血小板減少，特發(fā)性自體免疫性溶血性貧血,純紅細胞再生失調(diào)，修格蘭氏綜合征,風濕性疾病，結締組織疾病，炎性風濕病，退行性風濕病，關節(jié)外風濕病，幼年型類風濕性關節(jié)炎，痛風性關節(jié)炎(arthritis uratica),肌肉性風濕病，慢性多關節(jié)炎，冷球蛋白血癥性脈管炎(cryoglobulinemic vasculitis), ANCA-關聯(lián)性脈管炎,抗磷脂綜合征,重癥肌無力，自體免疫性溶血性貧血,格林-巴利綜合征,慢性免疫多神經(jīng)病，自體免疫性甲狀腺炎,胰島素依賴型糖尿病，I型糖尿病，阿狄森病，膜性腎小球性腎病，古德帕斯丘病(Goodpasture’sdisease),自體免疫性胃炎，自體免疫性萎縮性胃炎，惡性貧血，天皰瘡，尋常型天皰瘡，肝硬化，原發(fā)性膽汁性肝硬化，皮肌炎，多肌炎，纖維肌炎，肌硬化，腹腔疾病，免疫球蛋白A腎病，過敏性紫癜，埃文斯綜合征(Evans syndrome),異位性皮炎,銀屑病，關節(jié)病性銀屑病(psoriasis arthropathica), Graves氏病，Graves氏眼病，硬皮病，系統(tǒng)性硬皮病，進行性系統(tǒng)性硬皮病，哮喘，過敏癥，原發(fā)性膽汁性肝硬化，橋本氏甲狀腺炎(Hashimoto’ sthyroiditis),原發(fā)性粘液性水腫，交感性眼炎，自體免疫性葡萄膜炎，肝炎，慢性活動性肝炎，膠原病，強直性脊柱炎，肩周炎，結節(jié)性全身動脈炎，軟骨鈣質(zhì)沉著病，韋格納氏肉芽腫病，顯微鏡下多血管炎，慢性蕁麻疹，大皰性皮膚病，類天皰瘡，異位性濕疹，德維克病(Devic's disease)，兒童自體免疫性溶血性貧血，難治性或慢性自體免疫性血細胞減少，在獲得性A型血友病中阻止自體免疫性抗VIII因子抗體的發(fā)展，冷凝集素病，視神經(jīng)脊髓炎，僵人綜合征，牙齦炎，牙周炎，胰腺炎，心肌炎，脈管炎，胃炎，痛風，痛風性關節(jié)炎，以及炎性皮膚失調(diào)，選自下組，該組由以下各項組成:銀屑病，異位性皮炎，濕疹，酒渣鼻，蕁麻疫，和痤瘡，normocomplementemic蕁麻疫性脈管炎，心包炎,肌炎，抗合成酶綜合征，鞏膜炎，巨噬細胞活化綜合征，貝凱特綜合征，PAPA綜合征，布勞綜合征，痛風，成年和少年斯蒂爾氏病(adult and juvenile Still’s disease), cryropyrinopathy,穆克勒-威爾斯綜合征(Muckle-Wells syndrome),家族性寒冷誘導自體炎癥綜合征,新生兒發(fā)病多系統(tǒng)炎性疾病，家族性地中海熱，慢性小兒神經(jīng)系統(tǒng)、皮膚和關節(jié)綜合征，系統(tǒng)性幼年特發(fā)性關節(jié)炎，超IgD 綜合征(Hyper IgD syndrome),施尼茨勒綜合征(Schnitzler’s syndrome),自體免疫性視網(wǎng)膜病，年齡相關性黃斑變性，動脈硬化，慢性前列腺炎以及TNF受體-關聯(lián)性周期性綜合征(TRAPS)。
42.如權利要求41所述的方法，其中該自體免疫性疾病選自下組，該組由任何以下各項的任何類型和亞型組成:多發(fā)性硬化癥、類風濕性關節(jié)炎、I型糖尿病、銀屑病、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、炎性腸病、葡萄膜炎以及修格蘭氏綜合征。
43.一種用于治療或預防一種傳染病的方法，該方法包括向一個對其有需要的受試者給予一個有效量的以下任一項:任何一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體；或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
44.如權利要求43所述的方法，其中該傳染病選自由細菌感染、病毒感染、真菌感染和/或其他寄生蟲感染導致的疾病。
45.如權利要求44所述 的方法，其中該傳染病選自乙型肝炎、丙型肝炎、感染性單核細胞增多癥、EBV、巨細胞病毒、AIDS、HIV-1、HIV-2、結核病、瘧疾以及血吸蟲病。
46.一種用于治療或預防癌癥的方法，該方法包括向一個對其有需要的受試者給予一個有效量的以下任一項:任何一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體；或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
47.如權利要求46所述的方法，其中將該治療與對于治療癌癥有用的另一個部分或療法進行合并。
48.如權利要求47所述的方法，其中該療法是放射療法、抗體療法、化學療法、光動力學療法、過繼性T細胞療法、Treg耗盡、手術或與常規(guī)藥物的聯(lián)合療法。
49.如權利要求48所述的方法，其中該部分選自下組，該組由以下各項組成:免疫抑制劑、細胞毒類藥物、腫瘤疫苗、抗體(例如貝伐單抗、愛必妥)、肽、百普素體(pept1-bodies)、小分子、化學治療劑(例如細胞毒素劑以及細胞生長抑制劑(例如紫杉醇、順鉬、長春瑞賓、多西他賽、吉西他濱、替莫唑胺、伊立替康、5FU、卡鉬))、免疫學修飾劑(例如干擾素和白細胞介素)、免疫刺激抗體、生長激素或其他細胞因子、葉酸、維生素、礦物質(zhì)、芳香酶抑制藥、RNA1、組蛋白脫酰酶抑制劑、以及蛋白酶抑制劑。
50.如權利要求46-49中任一項所述的方法，其中該癌癥選自下組，該組由以下各項組成:乳腺癌、宮頸癌、卵巢癌、子宮內(nèi)膜癌、黑色素瘤、膀胱癌、肺癌、胰腺癌、結腸癌、前列腺癌、白血病、急性淋巴細胞白血病、慢性淋巴細胞白血病、B-細胞淋巴瘤、伯基特淋巴瘤、多發(fā)性骨髓瘤、何杰金氏淋巴瘤、非何杰金氏淋巴瘤、骨髓性白血病、急性骨髓性白血病(AML)、慢性骨髓性白血病、甲狀腺癌、甲狀腺濾泡癌、骨髓增生異常綜合癥(MDS)、纖維肉瘤和橫紋肌肉瘤、黑色素瘤、葡萄膜黑色素瘤、畸胎癌、成神經(jīng)細胞瘤、神經(jīng)膠質(zhì)瘤、惡性膠質(zhì)瘤、皮膚的良性瘤、角化棘皮瘤、腎癌、間變性大細胞淋巴瘤、食管鱗狀細胞癌、肝細胞癌、濾泡樹突細胞癌、腸癌、肌肉浸潤性癌、精囊腫瘤、表皮癌、脾癌、膀胱癌、頭頸癌、胃癌、肝癌、骨癌、腦癌、視網(wǎng)膜癌、膽道癌、小腸癌、唾液腺癌、子宮癌、睪丸癌、結締組織癌、前列腺肥大、脊髓發(fā)育不良、瓦爾登斯特巨球蛋白血癥(Waldenstrom’s macroglobulinemia)、鼻咽癌、神經(jīng)內(nèi)分泌癌、骨髓增生異常綜合癥、間皮瘤、血管肉瘤、卡波濟氏肉瘤、良性腫瘤、食管癌、輸卵管癌、腹膜癌、乳頭狀漿液性勒氏癌、惡性腹水、胃腸道間質(zhì)瘤(GIST)、李弗勞明綜合征以及希佩爾-林道綜合征(VHL)，并且其中該癌癥是非轉移性的、浸潤性的或轉移性的。
51.如權利要求50所述的方法，其中該癌癥是黑色素瘤、肝癌、腎癌、腦癌、乳腺癌、結腸癌、肺癌、卵巢癌、胰臟癌、前列腺癌、胃癌、多發(fā)性骨髓瘤、何杰金氏淋巴瘤、非何杰金氏淋巴瘤、急性和慢性淋巴性白血病以及急性和慢性骨髓性白血病中之一。
52.一種用于在一個患者上加強對一種抗原再次免疫應答的方法，該方法包括給予有效量的以下任一項:一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體；或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
53.如權利要求52所述的方法，其中該抗原是一種癌癥抗原、病毒性抗原或細菌性抗原，并且其中患者已經(jīng)接受了用一種抗癌劑疫苗或病毒性疫苗的治療。
54.一種在一個患者中的免疫療法，包括: a.體內(nèi)或離體耐受性誘導，包括為了誘導耐受原性調(diào)節(jié)細胞的分化，向一個患者或向從該患者分離的白細胞給予有效量的以下各項:一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體；或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物； b.所述細胞的離體富集和增殖； c.向所述患者再輸注這些耐受原性調(diào)節(jié)細胞。
55.—種使用以下至少之一作為癌癥疫苗佐劑的方法:一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體；或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物,該方法包括向一個患者給予一個免疫原性量的感興趣的腫瘤相關抗原制劑；以及一種適合于免疫法的配制品中的癌癥疫苗佐劑，其中在該癌癥疫苗佐劑存在的情況下，針對該腫瘤相關抗原的免疫應答比在該癌癥疫苗佐劑不存在的情況下更強。
56.一種將使用抗原的治療疫苗接種連同任一以下項的給予進行合并來治療感染的方法:一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體，或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
57.為了增加免疫應答，一種將任一以下各項與一種佐劑、以及一種疫苗中的抗原進行合并的方法:一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體，或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
58.如權利要求56或57所述的方法，其中該抗原是一種病毒性抗原、細菌性抗原、真菌抗原、寄生蟲抗原、和/或其他病原體的抗原。
59.在一個樣品中，用于檢測任一具有任一SEQ ID NO:1-8、11-18、47-50、58、143的多肽，或與其至少95%相同的變體的存在的測定。
60.一種用于診斷一個受試者的疾病的方法，包括在該受試者或從所述受試者獲得的樣品中檢測任一具有任一 SEQ ID NO:1-8、11-18、47-50、58、143的多肽，或與其至少95%相同的變體、或其片段。
61.根據(jù)權利要求60所述的方法，其中在體內(nèi)或體外進行該多肽的檢測。
62.根據(jù)權利要求60 所述的方法，其中該檢測是通過免疫測定進行的。
63.根據(jù)權利要求60所述的方法，其中使用根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體或片段來進行該檢測。
64.一種使用一種生物活性劑來調(diào)節(jié)免疫細胞活性的方法，該生物活性劑能夠以一個有效調(diào)節(jié)至少一種免疫細胞活性的量來調(diào)節(jié)LY6G6F、VSIGlO、TMEM25、或LSR-介導的信號轉導。
65.根據(jù)權利要求64所述的方法，其中所述試劑抑制或減弱免疫細胞活性。
66.根據(jù)權利要求64所述的方法，其中所述試劑誘導或增加免疫細胞活性。
67.如權利要求64所述的方法，用于通過調(diào)節(jié)LY6G6F、VSIG10、TMEM25、或LSR蛋白的活性來治療或預防癌癥。
68.如權利要求64所述的方法，其中這一被給予的試劑是一種增強針對癌細胞的T細胞活性的抗體或片段。
69.如權利要求64-67中任一項所述的方法,其中所述試劑包括以下任一項:一種根據(jù)權利要求1-9中任一項所述的分離的多肽、或根據(jù)權利要求10-16中任一項所述的融合蛋白；一種根據(jù)權利要求17或18所述的核苷酸序列；一種根據(jù)權利要求19所述的表達載體；一種根據(jù)權利要求20所述的宿主細胞，一種根據(jù)權利要求22-30中任一項所述的抗體，或一種根據(jù)權利要求31所述的藥物組合物。
【文檔編號】C07K14/715GK103596974SQ201280028877
【公開日】2014年2月19日 申請日期:2012年4月16日 優(yōu)先權日:2011年4月15日
【發(fā)明者】阿米爾·托波里克, 阿米特·諾維克, 羅南·謝梅什 申請人:卡姆普根有限公司