取代的5-氟-嘧啶的制作方法
【專利摘要】本發(fā)明涉及如本文中所描述和定義的通式(I)的二取代的5-氟-嘧啶，及其制備方法、其在治療和/或預防病癥中的用途，特別是在治療和/或預防過度增殖性病癥和/或病毒誘導的感染性疾病和/或心血管疾病中的用途。本發(fā)明還涉及可用于制備所述通式(I)的化合物的中間體化合物。
【專利說明】取代的5-氟-嘧啶
[0001] 本發(fā)明涉及如本文中所描述和定義的通式(I)的二取代的5-氟-嘧啶，及其制備方法、其在治療和/或預防病癥中的用途，特別是在治療和/或預防過度增殖性病癥和/或病毒誘導的感染性疾病和/或心血管疾病中的用途。本發(fā)明還涉及可用于制備所述通式
[1]的化合物的中間體化合物。
[0002]細胞周期蛋白依賴性激酶(CDK)蛋白家族由為參與基因轉錄調節(jié)(轉錄CDK)的細胞分裂周期的關鍵調節(jié)物的成員(細胞周期CDK)以及具有其它功能的成員組成。CDK要求激活與調節(jié)性細胞周期蛋白亞基的聯(lián)系。細胞周期CDK CDKl/細胞周期蛋白B、CDK2/細胞周期蛋白A、CDK2/細胞周期蛋白E、CDK4/細胞周期蛋白D和CDK6/細胞周期蛋白D被順序地激活，以驅動細胞進入并通過細胞分裂周期。轉錄CDK CDK9/細胞周期蛋白T和CDK7/細胞周期蛋白H通過羧基末端域(CTD)的磷酸化調節(jié)RNA聚合酶II的活性。正轉錄因子b (P-TEFb)為CDK9和四種細胞周期蛋白配偶子(細胞周期蛋白Tl、細胞周期蛋白K、細胞周期蛋白T2a或T2b)之一的異二聚體。
[0003]而CDK9(NCBI GenBank Gene ID1025)排它性地參與轉錄調節(jié)，此外CDK7作為CDK激活激酶(CAK)參與細胞周期調節(jié)。
[0004]基因通過RNA聚合酶II的轉錄由在啟動子區(qū)域的預引發(fā)復合物的組裝以及CTD的Ser5和Ser7通過⑶K7/細胞周期蛋白H的磷酸化而引發(fā)。對于大部分的基因，RNA聚合酶II在其沿DNA模板移動20-40個核苷酸后停止mRNA轉錄。RNA聚合酶II的這種啟動子近側暫停由負向延長因子調節(jié)，并且被認為是響應多種刺激調節(jié)快速誘導的基因的表達的主要控制機制(Cho等人，Cell Cycle9, 1697，2010)。P-TEFb關鍵性地參與克服RNA聚合酶II的啟動子近側暫停并通過CTD的Ser2的磷酸化以及負向延長因子的磷酸化和失活轉為生產延長狀態(tài)。
[0005]P-TEFb自身的活性通過數種機制調節(jié)。大約一半的細胞P-TEFb以與7SK核小RNA (7SK snRNA)、La相關蛋白7 (LARP7/PIP7S)和六亞甲基雙乙酰胺誘導蛋白1/2(ΗΕΧΙΜ1/2)的無活性復合物的形式存在(He等人，Mol Cell29, 588，2008)。其余的一半P-TEFb以包含布羅莫結構域(bromodomain)蛋白Brd4的活性復合物的形式存在(Yang等人，Mol Celll9，535，2005)。Brd4通過與乙?；慕M蛋白的相互作用將P-TEFb募集至預備為基因轉錄的染色質區(qū)域。通過可選地與其正調節(jié)物和負調節(jié)物的相互作用，使P-TEFb保持作用平衡:與7SK snRNA復合物結合的P-TEFb表示儲庫，根據細胞轉錄和細胞增殖的要求可以由其釋放活性 P-TEFb (Zhou & Yik, Microbiol Mol Biol Rev70, 646，2006)。此外，P-TEFb的活性通過包括磷酸化/去磷酸化、泛素化和乙酰化的翻譯后修飾調節(jié)(在Cho等人，Cell Cycle9, 1697，2010 中綜述)。
[0006]P-TEFb異二聚體的⑶K9激酶活性的活性下調與多種人病理學環(huán)境有關，例如過度增殖性疾病(例如癌癥)、病毒誘導的感染性疾病或心血管疾病。
[0007]癌癥被認為是通過增殖和細胞死亡(細胞凋亡)的失衡介導的過度增殖性病癥。在多種人腫瘤中發(fā)現高水平的抗凋亡Bcl-2-家族蛋白，并且其導致腫瘤細胞的存活延長以及治療抵抗。已證明P-TEFb激酶活性的抑制降低導致短壽的抗凋亡蛋白(特別是Mcl-1和XIAP)的下降的RNA聚合酶II的轉錄活性，恢復腫瘤細胞經歷細胞凋亡的能力。與轉化的腫瘤表型相關的許多其它蛋白(例如Myc、NF-kB應答基因轉錄物、有絲分裂激酶)為短壽蛋白或由短壽轉錄物編碼，其對于由P-TEFb抑制介導的RNA聚合酶II活性的降低敏感(在 ffang&Fischer, Trends Pharmacol Sci29, 302, 2008 中綜述)。
[0008]許多病毒依賴宿主細胞的轉錄機來轉錄它們自身的基因組。在HIV-1的情況下，RNA聚合酶II被募集至病毒LTR的啟動子區(qū)域。病毒轉錄激活劑(Tat)蛋白與初生的病毒轉錄物結合，并克服通過P-TEFb的募集發(fā)生的啟動子近側RNA聚合酶II暫停，其繼而促進了轉錄延長。此外，Tat蛋白通過代替7SKsnRNA復合物中的P-TEFb抑制蛋白HEXM1/2來增加活性P-TEFb的部分。近期的數據已證明P-TEFb的激酶活性的抑制足以在對宿主細胞無細胞毒性的激酶抑制濃度下阻斷HIV-1復制(在Wang&Fischer, Trends PharmacolSci29, 302, 2008中綜述)。相似地，已報道其它病毒(例如B-細胞癌癥相關Epstein-Barr病毒)的通過病毒蛋白的P-TEFb的募集，其中核抗原EBNA2蛋白與P-TEFb (Bark-Jones等人，0ncOgene25，1775，2006)和人T-淋巴細胞病毒I型(HTLV-1)相互作用，其中轉錄激活劑 Tax 募集 P-TEFb (Zhou 等人，J Virol.80，4781，2006)。
[0009]心臟肥大(心臟對于機械過載和壓力(血流動力壓力，例如高血壓、心肌梗死)的適應性響應)長期可導致心力衰竭和死亡。已證明心臟肥大與心肌細胞中的轉錄活性增加和RNA聚合酶II CTD磷酸化相關。發(fā)現P-TEFb通過從無活性的7SK snRNA/HEXMl/2復合物解離來活化。這些發(fā)現提示將P-TEFb激酶活性的藥理學抑制作為治療心臟肥大的治療方法(在Dey等人，Cell Cycle6, 1856，2007中綜述)。
[0010]總之，多種證據提示P-TEFb異二聚體(=⑶K9和四種細胞周期蛋白配偶子(細胞周期蛋白Tl、細胞周期蛋白K、細胞周期蛋白T2a或T2b)之一)的CDK9激酶活性的選擇性抑制為對于治療疾病(例如癌癥、病毒性疾病和/或心臟疾病)的創(chuàng)新方法。CDK9屬于至少13種密切相關的激酶的家族，其中細胞周期CDK亞群在細胞增殖的調節(jié)中實現其多種作用。因此，預計對細胞周期CDK (例如CDKl/細胞周期蛋白B、CDK2/細胞周期蛋白A、CDK2/細胞周期蛋白E、CDK4/細胞周期蛋白D、CDK6/細胞周期蛋白D)和CDK9的共同抑制影響會正常增殖組織，例如腸粘膜、淋巴和造血器官以及生殖器官。為了使⑶K9激酶抑制劑的治療范圍最大化，需要對于CDK9具有高選擇性的分子。
[0011]在許多不同的出版物中描述普通的⑶K抑制劑以及⑶K9抑制劑:
[0012]W02008129070和W02008129071均描述了 2，4- 二取代的氨基嘧啶作為普通的⑶K抑制劑。還聲稱這些化合物中的一些可以分別地起選擇性⑶K9抑制劑的作用(W02008129070)和起CDK5抑制劑作用(W02008129071)，但沒有給出具體的CDK9IC50 (W02008129070)或 CDK5IC5(I(W02008129071)數據。這些化合物的嘧啶核的 5 位不包含氟原子。
[0013]W02008129080公開了 4，6_ 二取代的氨基嘧啶，并且證明這些化合物顯示對于多種蛋白激酶(例如⑶K1、⑶K2、⑶K4、⑶K5、⑶K6和⑶K9)的蛋白激酶活性的抑制作用，優(yōu)選對于CDK9的抑制(實施例80)。
[0014]W02005026129公開了 4，6_ 二取代的氨基嘧啶，并且證明這些化合物顯示對于多種蛋白激酶的蛋白激酶活性的抑制作用，特別是對于CDK2、CDK4和CDK9的抑制。
[0015]W02011116951公開了取代的三嗪衍生物作為選擇性⑶K9抑制劑。[0016]EP1218360B1 (其對應于 US2004116388A1、US7074789B2 和 W02001025220A1)描述了作為激酶抑制劑的三嗪衍生物，但沒有公開有效的或選擇性的CDK9抑制劑。
[0017]W02008079933公開了氨基吡啶衍生物和氨基嘧啶衍生物及它們作為CDK1、CDK2、CDK3、CDK4、CDK5、CDK6、CDK7、CDK8 或 CDK9 抑制劑的用途。
[0018]W02011012661記載了可用作⑶K抑制劑的氨基吡啶衍生物。
[0019]W02011026917公開了衍生自取代的4_苯基吡啶_2_胺的甲酰胺作為CDK9抑制劑。
[0020]W02012066065公開了苯基-雜芳基胺作為⑶K9抑制劑。優(yōu)選相對于其它⑶K亞型，對于⑶K9的選擇性，然而公開的⑶K-抑制數據僅限于⑶K9。未公開將二環(huán)環(huán)系連接至嘧啶核的C4位。在連接至嘧啶核C4的基團中，可視作涵蓋烷氧基苯基，但未提示以連接至嘧啶環(huán)C5的氟原子和嘧啶C2的苯胺(特點是在間位的取代的磺酰基-亞甲基)為特征的具體取代型式。實施例中的化合物的代表性特征為取代的環(huán)烷基作為R1，而不是苯基。
[0021]W02012066070公開了 3_(氨基芳基)-吡啶化合物作為CDK9抑制劑。二芳基核必須由兩個雜芳環(huán)組成。
[0022]W02012101062公開了以2_氨基吡啶核為特征的取代的二 -雜芳基化合物作為⑶K9抑制劑。二芳基核必須由兩個雜芳環(huán)組成。
[0023]W02012101063公開了衍生自取代的4_(雜芳基)-吡啶_2_胺的甲酰胺作為CDK9抑制劑。
[0024]W02012101064公開了 N-酰基嘧啶二芳基化合物作為CDK9抑制劑。
[0025]W02012101065公開了嘧啶二芳基化合物作為⑶K9抑制劑。二芳基核必須由兩個
雜芳環(huán)組成。
[0026]W02012101066公開了嘧啶二芳基化合物作為⑶K9抑制劑。連接至雜芳核的氨基的取代R1僅限于非芳族基團而不涵蓋取代的苯基。此外二芳基核必須由兩個雜芳環(huán)組成。
[0027]Wang 等人(Chemistry & Biologyl7, 1111-1121, 2010)記載了 2_ 苯胺基 _4_(噻唑-5-基)嘧啶轉錄CDK抑制劑，其在動物模型中顯示抗癌活性。
[0028]W02004009562公開了取代的三嗪激酶抑制劑。示出了選擇的化合物的⑶Kl和⑶K4試驗數據，但是沒有⑶K9數據。
[0029]W02004072063記載了雜芳基(嘧啶、三嗪)取代的吡咯作為蛋白激酶(例如ERK2、GSK3、PKA 或 CDK2)抑制劑。
[0030]W02010009155公開了三嗪衍生物和嘧啶衍生物作為組蛋白脫乙?；负?或細胞周期蛋白依賴性激酶(CDK)的抑制劑。記載了選擇的化合物CDK2的試驗數據。
[0031]W02003037346(對應于 US7618968B2、US7291616B2、US2008064700A1、US2003153570A1)涉及芳基三嗪及其用途(包括抑制溶血磷脂酸?；D移酶β (LPAAT-β)活性和/或細胞(例如腫瘤細胞)的增殖的用途)。
[0032]W02008025556記載了具有嘧啶核的氨基甲酰基砜酰亞胺，其可用作激酶抑制劑。未示出CDK9數據。沒有舉例說明具有氟嘧啶核的分子。
[0033]W02002066481記載了作為細胞周期蛋白依賴性激酶抑制劑的嘧啶衍生物，未提及⑶Κ9且未示出⑶Κ9數據。
[0034]W02008109943涉及苯基氨基吡(嘧)啶化合物及它們作為激酶抑制劑(特別是JAK2激酶抑制劑)的用途。具體的實例主要集中于具有嘧啶核的化合物。
[0035]W02009032861記載了取代的嘧啶基胺作為JNK激酶抑制劑。具體的實例主要集中于具有嘧啶核的化合物。
[0036]W02011046970涉及氨基嘧啶化合物作為TBKL和/或IKK ε的抑制劑。具體的實例主要集中于具有嘧啶核的化合物。
[0037]盡管已知多種CDK的抑制劑的事實，仍存在對于用于疾病(例如過度增殖性疾病、病毒性疾病和/或心臟疾病)的治療的選擇性CDK9抑制劑的需求，其提供優(yōu)于現有技術已知化合物的一種或多種益處的,所述益處例如:
[0038].改善的活性和/或有效性，
[0039].根據各自的治療需求有利的激酶選擇性特征，
[0040].改善的副作用特征，如較少的不期望的副作用，較低強度的副作用或減少的(細胞)毒性，
[0041 ].改善的物理化學性質(如在水和體液中的溶解度)，
[0042].改善的藥物代謝動力學性質,例如允許劑量減少或更容易的劑量方案，
[0043].更容易的藥物物質制備，如較短的合成路線或更容易純化。
[0044]本發(fā)明的具體目的是提供CDK9激酶抑制劑，與現有技術已知的化合物相比，相對于CDK2/細胞周期蛋白Ε，其顯示提高的對于CDK9/細胞周期蛋白Tl的選擇性。
[0045]本發(fā)明的另一目的是提供⑶Κ9激酶抑制劑，與現有技術已知的化合物相比，其顯示提高的抑制CDK9活性(由對于CDK9/細胞周期蛋白Tl較低的IC5tl值證明)的能力。
[0046]本發(fā)明的另一目的是提供CDK9激酶抑制劑，與現有技術已知的化合物相比，其在高ATP濃度下，顯示提高的抑制⑶Κ9活性的能力。
[0047]本發(fā)明的另一目的是提供CDK9激酶抑制劑，與現有技術已知的化合物相比，其在腫瘤細胞系(例如HeLa)中顯示改善的抗增殖活性。
[0048]此外，本發(fā)明的另一目的是提供CDK9激酶抑制劑，與現有技術已知的化合物相t匕，其顯示與CDK2/細胞周期蛋白E相比，對于CDK9/細胞周期蛋白Tl的高度選擇性，和/或顯示增加的抑制CDK9活性的能力，和/或在腫瘤細胞系(例如HeLa)中顯示改善的抗增殖活性，和/或與現有技術已知的化合物相比，其在高ATP濃度下，顯示提高的抑制CDK9活性的能力。本發(fā)明涉及通式(I)的化合物或其鹽、溶劑合物或溶劑合物的鹽:
[0049]
【權利要求】
1.通式(I)的化合物或其鹽、溶劑合物或溶劑合物的鹽:Cl)
2.權利要求1的通式(I)的化合物或其鹽、溶劑合物或溶劑合物的鹽，其中 R1表不選自下列的基團=C1-C6-烷基-、C3-C 5-環(huán)烷基-，其中所述基團任選地被一個或兩個取代基取代，所述取代基相同地或不同地選自羥基、C1-C2-烷氧基-、鹵代-C1-C2-烷基-、C1-C2-氟烷氧基-;R2表示選自下列的基團:
3.權利要求1的通式(I)的化合物或其鹽、溶劑合物或溶劑合物的鹽，其中 R1表不選自下列的基團=C1-C6-烷基-、C3_C5-環(huán)烷基-，其中所述基團任選地被一個或兩個取代基取代，所述取代基相同地或不同地選自羥基、C1-C6-烷氧基-; R2表示選自下列的基團:


4.權利要求1的通式(I)的化合物或其鹽、溶劑合物或溶劑合物的鹽，其中 R1表不選自下列的基團=C1-C6-烷基-、C3_C5-環(huán)烷基-，其中所述基團任選地被一個或兩個取代基取代，所述取代基相同地或不同地選自羥基、C1-C6-烷氧基-; R2表示選自下列的基團:
5.權利要求1的通式(I)的化合物或其鹽、溶劑合物或溶劑合物的鹽，其中 R1表示選自下列的基團:甲基、乙基、丙-2-基-、環(huán)丙基、叔丁基_、環(huán)己基，其中所述基團任選地被一個選自下列的取代基取代:羥基、甲氧基'C1-C6-烷氧基-; R2表不選自下列的基團:4_氟-2-甲氧基苯基-、2_(節(jié)氧基)-4-氟苯基-、3，4- 二氫-2H-色烯-8-基-; R3表不氫原子或氟原子； R4表不氫原子。
6.權利要求1的通式(I)的化合物或其鹽、溶劑合物或溶劑合物的鹽，其中 R1表不甲基； R2表不選自下列的基團:4_氟-2-甲氧基苯基-、2_(節(jié)氧基)-4-氟苯基-、3，4- 二氫-2H-色烯-8-基-; R3表不氫原子或氟原子； R4表不氫原子。
7.權利要求1的化合物或其鹽、溶劑合物或溶劑合物的鹽，所述化合物選自 -5-氟-4-(4-氟-2-甲氧基苯基)-N-{3-[(甲磺?；?甲基]苯基}嘧啶-2-胺，-4-[2-(芐氧基)-4-氟苯基]-5-氟-N-{3-[(甲磺?；?甲基]苯基}嘧啶-2-胺，-4- [2-(芐氧基)-4-氟苯基]-5-氟-N- (3- {[ (2-甲氧基乙基)磺?；鵠甲基}苯基)嘧啶-2-胺， -4- [2-(芐氧基)-4-氟苯基]-N- {3-[(叔丁基磺?；?甲基]苯基} -5-氟嘧啶-2-胺，-4_[2-(芐氧基)-4-氟苯基]-5-氟-N-{3-[(丙-2-基磺?；?甲基]苯基}嘧啶-2-胺， -4-[2-(芐氧基)-4-氟苯基]-N-{3-[(環(huán)己基磺?；?甲基]苯基}-5-氟嘧啶-2-胺， -5-氟-4- (4-氟-2-甲氧基苯基)-N- {3-[(丙-2-基磺?；?甲基]苯基}嘧啶_2_胺， -2-[(3-{[5-氟-4-(4-氟-2-甲氧基苯基)嘧啶-2-基]氨基}芐基)磺?；鵠乙醇， -4-(3，4-二氫-2H-色烯-8-基)-5-氟-N-{3-[(甲磺?；?甲基]苯基}嘧啶-2-胺， -N-{3-[(環(huán)丙基磺?；?甲基]苯基}-4-(3，4- 二氫-2H-色烯-8-基)_5_氟嘧啶-2-胺， -4-[2-(芐氧基)-4-氟苯基]-5-氟-N-{3-氟-5-[(甲磺酰基)甲基]苯基}嘧啶-2-胺， -5-氟-4- (4-氟-2-甲氧基苯基)-N- {3-氟-5-[(甲磺酰基)甲基]苯基}嘧啶_2_胺，-4-(2，3-二氫-1，4-苯并二氧雜環(huán)己烯-5-基)-5-氟-N-{3-[(甲磺?；?甲基]苯基}嘧啶-2-胺， -N-{3-[(環(huán)丙基磺酰基)甲基]苯基}-5-氟-4-(4-氟-2-甲氧基苯基)嘧啶-2-胺，-N-{3-[(芐基磺?；?甲基]苯基}-5-氟-4-(4-氟-2-甲氧基苯基)嘧啶-2-胺，-5-氟-4-[4-氟-2-(吡啶-3-基甲氧基)苯基]-N-{3-[(甲磺酰基)甲基]苯基}嘧啶-2-胺， -5-氟-4-{2-氟-4-[(4-氟芐基)氧基]苯基}-N-{3-[(甲磺?；?甲基]苯基}嘧啶-2-胺， -5-氟-4-{2-氟-4-[(3-氟芐基)氧基]苯基}-N-{3-[(甲磺?；?甲基]苯基}嘧啶-2-胺。
8.權利要求1-7中任一項的通式(I)的化合物，其用于治療和/或預防過度增殖性病癥、病毒誘導的感染性疾病和/或心血管疾病。
9.權利要求8的通式(1)的化合物，其用于治療和/或預防肺癌、前列腺癌、宮頸癌、結直腸癌、黑色素瘤或卵巢癌。
10.藥物組合，其包含權利要求1-7中任一項的化合物與至少一種或多種另外的活性成分的組合。
11.藥物組合物，其包含權利要求1-7中任一項的化合物與惰性的、無毒的、藥學適合的輔料的組合。
12.權利要求10的藥物組合，其用于治療和/或預防過度增殖性病癥、病毒誘導的感染性疾病和/或心血管疾病。
13.權利要求11的藥物組合物，其用于治療和/或預防過度增殖性病癥、病毒誘導的感染性疾病和/或心血管疾病。
14.制備權利要求1-7中任一項的式(I)的化合物的方法，在所述方法中將式(3)的化合物






【文檔編號】C07D239/42GK103917527SQ201280054032
【公開日】2014年7月9日 申請日期:2012年9月13日 優(yōu)先權日:2011年9月16日
【發(fā)明者】U·呂金, D·科澤蒙德, A·肖爾茨, P·利瑙, G·西邁斯特, U·伯默, R·博爾曼 申請人:拜耳知識產權有限責任公司