一種公斤級(jí)合成Fmoc-PNA-T-OH的方法
【專利摘要】本發(fā)明公開了一種公斤級(jí)合成Fmoc-PNA-T-OH的方法,包括以下步驟:乙二胺為原料,與鹵代乙酸反應(yīng),用DMSO重結(jié)晶得到N-(2-氨乙基)甘氨酸;以N-(2-氨乙基)甘氨酸為原料,與Fmoc-osu反應(yīng),得到N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸,再與甲醇反應(yīng)制得N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸甲酯鹽酸鹽;以胸腺嘧啶為原料,加入原料,反應(yīng)得1-乙酸基胸腺嘧啶;以1-乙酸基胸腺嘧啶為原料,與N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸甲酯反應(yīng),得Fmoc-PNA-T-OMe;以Fmoc-PNA-T-OMe為原料,水解即得產(chǎn)品。
【專利說明】—種公斤級(jí)合成Fmoc-PNA-T-OH的方法
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001]本發(fā)明涉及一種合成PNA的方法,具體涉及的是一種公斤級(jí)合成Fmoc-PNA-T-OH的方法。
【背景技術(shù)】
[0002]寡核苷酸在治療用藥物、分子生物學(xué)研究工具及診斷試劑上應(yīng)用廣泛。寡核苷酸應(yīng)用的主要制約在于它容易被核酸酶所降解、雜交后熱穩(wěn)定性差以及會(huì)與蛋白等非特異性結(jié)合等。為改造寡核苷酸的理化和生物學(xué)特性,許多寡核苷酸類似物被研究出來。肽核酸是寡核苷酸模擬物中的較為重要的一種。1991年Nielsen等報(bào)道了用N-(2-氨基乙基)甘氨酸骨架代替糖-磷酸酯骨架作為重復(fù)結(jié)構(gòu)單元,合成了以肽鍵連接的寡核苷酸模擬物,稱為肽核酸(Pept ide nucleicacid, PNA)。盡管PNA在結(jié)構(gòu)上相對(duì)寡核苷酸有了顯著的改變,但PNA與互補(bǔ)核酸之間的結(jié)合仍遵循堿基互補(bǔ)配對(duì)原則,甚至比天然核苷酸具有更高的親和性,有較強(qiáng)的抗核酸酶和蛋白水解酶降解的能力??蒲腥藛T設(shè)計(jì)合成了各種結(jié)構(gòu)的PNA,以優(yōu)化其生物學(xué)穩(wěn)定性和利用度、靶結(jié)合特性以及藥代動(dòng)力學(xué)特性,并將PNA應(yīng)用于診斷和治療等方面,從而開創(chuàng)了一個(gè)新的研究領(lǐng)域。
[0003]各種各樣的構(gòu)建模塊被用于合成PNA及其類似物,包括骨架結(jié)構(gòu)、在N- (2-氨基乙基)甘氨酸上連接手性和非手性的基團(tuán)、堿基的類型等。經(jīng)典的PNA的骨架單體是N-(2-氨基乙基)甘氨酸,在甘氨酸的氮上連接堿基的衍生物。通常先合成端基N有保護(hù)基的氨基乙基甘氨酸酯,然后再將堿基衍生物連在未受保護(hù)的氮上。常用的方法有:烷基化反應(yīng)、席夫堿的還原反應(yīng)、Mit sunobu反應(yīng)。
[0004]四種堿基都是經(jīng)胺的烷基化反應(yīng)形成堿基乙酸衍生物,再采用通常的多肽合成的方法,聯(lián)結(jié)堿基乙酸和骨架上`的未受保護(hù)的氮。胸腺嘧啶的烷基化反應(yīng)通常不需要使用保護(hù)基團(tuán),因此當(dāng)與溴乙酸酯反應(yīng)再經(jīng)皂化或直接與溴乙酸反應(yīng)即可得胸腺嘧啶乙酸。其余三種堿基上都有活潑基團(tuán),需先加以保護(hù)。胞嘧啶上的活潑基團(tuán)為4位上的氨基,可選擇的保護(hù)基有:節(jié)氧羰基(benzy loxycarbonyl, Cbz)、對(duì)叔丁基苯甲?;?4-tert-butylbenzoyl,4-t_BuBz)、苯甲酸基(benzoyl, Bz)以及 Mmt 等,再與溴乙酸酯進(jìn)行烷基化反應(yīng),然后皂化即得胞嘧啶乙酸的衍生物。腺嘌呤的保護(hù)過程與胞嘧啶基本相同,可用的保護(hù)基有Cbz, Mmt,對(duì)甲氧基苯基(anisoly, An)。鳥嘌呤的保護(hù)比較復(fù)雜,需要在N9的烷基化的過程中避免N7烷基化的副反應(yīng)干擾。一種常用的方法是在烷基化中用2-氨基-6-氯嘌呤,烷基化后再在酸性或堿性條件下回流,將氯水解轉(zhuǎn)化為羰基,或是直接烷基化N2連有保護(hù)基的腺嘌呤,色譜分離N7/N9兩種烷基化產(chǎn)物,然后皂化得鳥嘌呤乙酸的衍生物。
[0005]目前國(guó)內(nèi)已經(jīng)有部分公司可以定制合成PNA系列產(chǎn)品,但是他們的合成規(guī)模很小,一般在毫克級(jí)別,這種局面大大制約了 PNA這種化合物的應(yīng)用以及研究工作。
【發(fā)明內(nèi)容】
[0006]本發(fā)明的目的在于克服現(xiàn)有技術(shù)存在的以上問題,提供一種公斤級(jí)合成Fmoc-PNA-T-OH的方法,通過簡(jiǎn)單工藝,大量生產(chǎn)高純度的Fmoc-PNA-T-OH。
[0007]為實(shí)現(xiàn)上述技術(shù)目的,達(dá)到上述技術(shù)效果,本發(fā)明通過以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn):
[0008]一種公斤級(jí)合成Fmoc-PNA-T-OH的方法,包括以下步驟:
[0009]步驟I)乙二胺與鹵代乙酸反應(yīng),用DMSO重結(jié)晶得到N-(2-氨乙基)甘氨酸;
[0010]步驟2)以N-(2_氛乙基)甘氛酸為原料,與Fmoc-osu反應(yīng),得到N-(2-Fmoc-氛乙基)甘氨酸;
[0011]步驟3)N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸與甲醇在氯化亞砜參與下反應(yīng)制得N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸甲酯鹽酸鹽;
[0012]步驟4)以胸腺嘧啶為原料,加入鹵代乙酸,反應(yīng)得1-乙酸基胸腺嘧啶;
[0013]步驟5)以1-乙酸基胸腺嘧啶為原料,與N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸甲酯鹽酸鹽反應(yīng),得到 Fmoc-PNA-T-OMe ;
[0014]步驟6)以N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸甲酯_2_(胸腺嘧啶-1)-乙酰胺為原料,水解即得產(chǎn)品Fmoc-PNA-T-OH ;
[0015]步驟1、2、3、4、5、6的反應(yīng)公式為:
[0016]
【權(quán)利要求】
1.一種公斤級(jí)合成Fmoc-PNA-T-OH的方法,其特征在于,包括以下步驟: 步驟I)乙二胺與鹵代乙酸反應(yīng),用DMSO重結(jié)晶得到N-(2-氨乙基)甘氨酸; 步驟2)以N-(2-氨乙基)甘氨酸為原料,與Fmoc-osu反應(yīng),得到N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸; 步驟3) N- (2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸與甲醇在氯化亞諷參與下反應(yīng)制得N- (2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸甲酯鹽酸鹽; 步驟4)以胸腺嘧啶為原料,加入鹵代乙酸,反應(yīng)得1-乙酸基胸腺嘧啶; 步驟5)以1-乙酸基胸腺嘧啶為原料,與N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸甲酯鹽酸鹽反應(yīng),得到 Fmoc-PNA — T-OMe ; 步驟6)以N-(2-Fmoc-氨乙基)甘氨酸甲酯_2_ (胸腺嘧啶-1)-乙酰胺為原料,水解即得產(chǎn)品 Fmoc-PNA-T-OH ; 步驟1、2、3的反應(yīng)公式為:
【文檔編號(hào)】C07D239/54GK103524428SQ201310480283
【公開日】2014年1月22日 申請(qǐng)日期:2013年10月14日 優(yōu)先權(quán)日:2013年10月14日
【發(fā)明者】凌靜, 杜建坤, 劉金永, 黃忠林 申請(qǐng)人:蘇州維泰生物技術(shù)有限公司