本發(fā)明屬于生物檢測技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種新型熱傳遞檢測設(shè)備。
背景技術(shù):
DNA基因擴(kuò)增的一個基本循環(huán)過程由變性--退火--延伸三個反應(yīng)階段構(gòu)成,經(jīng)歷過幾十個基本循環(huán)過程后,就能使待擴(kuò)增的基因放大百萬倍。在三個基本反應(yīng)階段中,DNA變性階段的溫度一般在93℃-95℃,雙鏈DNA模板在本階段的熱作用下, 氫鍵斷裂后形成單鏈DNA;退火階段的溫度一般在42℃-55℃,在本階段系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈;延伸階段的溫度一般在70℃-75℃,在本階段在酶作用下合成與DNA模板互補(bǔ)的DNA鏈。
將DNA聚合酶引入PCR的步驟是:DNA反應(yīng)液放在試管中,裝有反應(yīng)液的試管放在反應(yīng)室的PCR模塊各孔中,基因擴(kuò)增過程由控制程序自動完成。到目前為止,國內(nèi)外學(xué)者在控制程序上主要利用自動控制技術(shù)對PCR模塊的溫度變化進(jìn)行控制,Stephanie J. Culler課題組利用PCR設(shè)備分析了基因的內(nèi)在結(jié)構(gòu)表達(dá),但多數(shù)研究成果集中在改進(jìn)PCR技術(shù)和提高PCR設(shè)備的某些指標(biāo)。E.T. Lagally 早在2001年采用提高升降溫速率的方法對DNA擴(kuò)增過程進(jìn)行了研究,Grover J.和 Juncosa R.D于2008年對常規(guī)PCR設(shè)備的升降速率進(jìn)行了研究, T.M.H. Lee 等采用數(shù)字化控制方式提高了PCR的反應(yīng)控制精度。在PCR的臨床應(yīng)用中,一個普遍存在的問題是:位于模塊各孔試管中的DNA反應(yīng)液的狀態(tài)隨反應(yīng)階段的不同而發(fā)生變化,在這個過程中,DNA的化學(xué)鍵不斷斷裂或生成,伴隨著的吸、放熱狀態(tài)也不同,如何分析這些狀態(tài)變化規(guī)律,對提高DNA擴(kuò)增質(zhì)量和對放在模塊各孔中試管反應(yīng)液的溫度變化進(jìn)行精確控制有直接影響,現(xiàn)有技術(shù)裝置操作復(fù)雜,不能靈活地根據(jù)需要進(jìn)行準(zhǔn)確檢測,應(yīng)用在實(shí)際工程中有一定的局限性。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明克服現(xiàn)有技術(shù)的不足,提出了一種新型熱傳遞檢測設(shè)備,所述裝置利用光纖布拉格光柵傳感器及其分布特性模型,利用此特性對DNA反應(yīng)液的數(shù)據(jù)規(guī)律進(jìn)行采集和分析,分析DNA擴(kuò)增的熱傳遞規(guī)律,對DNA反應(yīng)傳熱規(guī)律。
本發(fā)明的技術(shù)方案為:一種新型熱傳遞檢測設(shè)備,包括DNA反應(yīng)室、光纖數(shù)據(jù)處理模塊、熱控制處理模塊、散熱空間和主處理器,所述DNA反應(yīng)室為一個密閉空間,所述散熱空間位于所述DNA反應(yīng)室的下部,并與DNA反應(yīng)室隔離,在所述DNA反應(yīng)室內(nèi)設(shè)有DNA擴(kuò)增模塊,在所述DNA擴(kuò)增模塊的上部設(shè)置有反應(yīng)孔,反應(yīng)孔內(nèi)設(shè)有布拉格傳感探頭,所述布拉格傳感探頭與光纖芯相連接,光纖芯連接一個解調(diào)模塊,所述解調(diào)模塊與所述光纖數(shù)據(jù)處理模塊相連接,所述光纖數(shù)據(jù)處理模塊通過信號線連接一個比較器,在所述DNA擴(kuò)增模塊的底部設(shè)有傳感單元和加熱單元,在所述加熱單元內(nèi)設(shè)有半導(dǎo)體加熱芯片,在所述半導(dǎo)體加熱芯片的下方設(shè)有一個阻熱帶,在所述傳感單元內(nèi)設(shè)有鉑電阻傳感器,所述鉑電阻傳感器通過信號線與一個數(shù)模轉(zhuǎn)換器相連接,所述數(shù)模轉(zhuǎn)換器位于散熱空間內(nèi),數(shù)模轉(zhuǎn)換器通過一個硬件接口單元與所述熱控制處理模塊相連接,所述熱控制處理模塊通過信號線與所述比較器相連接,所述比較器通過信號線與所述主處理器相連接。
所述半導(dǎo)體加熱芯片通過控制線與一個熱控制器相連接,所述熱控制器位于散熱空間內(nèi),熱控制器通過所述硬件接口單元與所述熱控制處理模塊相連接。
在散熱空間內(nèi)設(shè)有散熱裝置。
本發(fā)明具有如下有益效果
1) 本發(fā)明采用光纖布拉格光柵和鉑電阻傳感器分別檢測,集中處理,構(gòu)建數(shù)據(jù)控制模型,模擬DNA整個擴(kuò)增過程,揭示對DNA樣本的影響因素,為揭示DNA內(nèi)部反應(yīng)的客觀規(guī)律提供依據(jù) 。
2) 本發(fā)明建立光纖布拉格光柵隨溫度變化的分布特性,揭示DNA 擴(kuò)增階段的吸放熱規(guī)律,揭示DNA內(nèi)部反應(yīng)的客觀規(guī)律,提供一整套光纖布拉格光柵隨溫度變化的理論技術(shù)基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
3) 本發(fā)明建立了建立DNA擴(kuò)增過程切實(shí)可行的數(shù)據(jù)采集方式。
4)本發(fā)明揭示了DNA的反應(yīng)規(guī)律,將有利于PCR設(shè)備的可開發(fā),市場前景和社會效益巨大。
附圖說明
附圖是本發(fā)明的框架結(jié)構(gòu)示意圖。
圖中,1、反應(yīng)孔;2、布拉格傳感探頭;3、光纖芯;4、DNA反應(yīng)室;5、解調(diào)模塊;6、光纖數(shù)據(jù)處理模塊;7、比較器;8、主處理器;9、熱控制處理模塊;10、硬件接口單元;11、熱控制器;12、半導(dǎo)體加熱芯片;13、鉑電阻傳感器;14、散熱空間;15、模數(shù)轉(zhuǎn)換器。
具體實(shí)施方式
本發(fā)明包括DNA反應(yīng)室4、光纖數(shù)據(jù)處理模塊6、熱控制處理模塊9、散熱空間14和主處理器8,所述DNA反應(yīng)室4為一個密閉空間,所述散熱空間14位于所述DNA反應(yīng)室4的下部,并與DNA反應(yīng)室4隔離,在所述DNA反應(yīng)室4內(nèi)設(shè)有DNA擴(kuò)增模塊,在所述DNA擴(kuò)增模塊的上部設(shè)置有若干個反應(yīng)孔1,通常為96個孔,反應(yīng)孔1內(nèi)裝有DNA反應(yīng)液,在某些反應(yīng)孔1內(nèi)設(shè)有布拉格傳感探頭2,布拉格傳感探頭2的數(shù)量依據(jù)具體的檢測方案確定,在設(shè)置有布拉格傳感探頭2的反應(yīng)孔1內(nèi)可以裝有DNA反應(yīng)液,所述布拉格傳感探頭2與光纖芯3相連接,光纖芯3連接一個解調(diào)模塊5,所述解調(diào)模塊5與所述光纖數(shù)據(jù)處理模塊6相連接,所述光纖數(shù)據(jù)處理模塊6通過信號線連接一個比較器7,在所述DNA擴(kuò)增模塊的底部設(shè)有傳感單元和加熱單元,在所述加熱單元內(nèi)設(shè)有半導(dǎo)體加熱芯片12,在所述半導(dǎo)體加熱芯片12的下方設(shè)有一個阻熱帶,在所述傳感單元內(nèi)設(shè)有鉑電阻傳感器13,所述鉑電阻傳感器13通過信號線與一個數(shù)模轉(zhuǎn)換器15(模數(shù)轉(zhuǎn)換器)相連接,所述數(shù)模轉(zhuǎn)換器15位于散熱空間14內(nèi),數(shù)模轉(zhuǎn)換器15通過一個硬件接口單元10與所述熱控制處理模塊9相連接,所述熱控制處理模塊9通過信號線與所述比較器7相連接,所述比較器7通過信號線與所述主處理器8相連接。所述半導(dǎo)體加熱芯片12通過控制線與一個熱控制器11相連接,所述熱控制器11位于散熱空間14內(nèi),熱控制器11通過所述硬件接口單元10與所述熱控制處理模塊9相連接。在散熱空間14內(nèi)設(shè)有散熱裝置。
利用所述光纖布拉格光柵傳感器檢測溫度時,根據(jù)耦合模理論,光纖布拉格光柵的中心反射波長可以表示為
(1)
式中為導(dǎo)模的有效折射率,為光柵的周期。由(1)式可以看出,中心反射波長與有效折射率和光柵周期有關(guān);
當(dāng)光柵受到溫度的變化影響時,其有效折射率和光柵周期會隨之變化,從而反射波長也會發(fā)生變化,關(guān)系式為:
把上式代入(1)得到
(2)
由熱膨脹效應(yīng)引起的光柵周期變化式和熱光系數(shù)引起有效折射率變化式分別為:
其中和分別為光纖的熱膨脹系數(shù)和熱光系數(shù)。
把上述兩式代入(2)式可得:
令 ,則上式可以寫為:
(3)
通常光纖的中心反射波長=1200 nm,溫度靈敏度系數(shù)kT=7.5 x 10-6/C, 因此,是溫度的函數(shù)。公式(3)對某溫度是線性關(guān)系,但當(dāng)溫度變化較大時,上述的線性公式表現(xiàn)出非線性特征。溫度靈敏度系數(shù)較大的聚合材料,kT=87 x 10-6/C,此時,=9.88,即,對于每度的空間分辨率在0-9.88之間。
本發(fā)明采用96孔的常規(guī)模塊單元,數(shù)據(jù)控制單元分三路布置傳感器組,每路設(shè)置四個鉑電阻傳感器13,用于進(jìn)行試驗(yàn)控制數(shù)據(jù)采集單元,可以(在)條件許可的情況下,在模塊上部的反應(yīng)孔空隙中與鉑電阻傳感器13的對應(yīng)位置布置12個反應(yīng)室內(nèi)的鉑電阻傳感器13,簡稱反應(yīng)室傳感器,用于采集模塊溫度的均一和均衡性,建立起來的數(shù)據(jù)采集單元用于對實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,并做為布拉格光柵數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)的輔助基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
假設(shè)鉑電阻傳感器13為Aij(i=1-3,j=1-4),反應(yīng)室傳感器為Wij(i=1-3,j=1-4),
其中,Aij(i=1-3,j=1,2)和Wij(i=1-3,j=1-4)均為模擬量,設(shè)模擬量轉(zhuǎn)為數(shù)據(jù)量(十進(jìn)制溫度值)的函數(shù)為G,通過實(shí)驗(yàn)和耦合計(jì)算后可得:在任一時刻t,其鉑電阻傳感器獲得的溫度數(shù)據(jù)為:
Tij(t)= (4)
其中,i=1-3,j=1-4,上式表示的是自動控制系統(tǒng)加載的某個測試點(diǎn)的實(shí)際溫度值。
在任一時刻t,光纖的值是不斷變化的,依據(jù)測量的DNA樣本的DNA反應(yīng)液的數(shù)據(jù),依據(jù)(3)式可得:
(5)
從(5)式可知,在t時刻局部區(qū)間()內(nèi)的DNA反應(yīng)液的溫度變化量能夠依據(jù)布拉格光柵的解調(diào)設(shè)備通過計(jì)算而求出,而在任一t時刻溫度值可以由模塊溫度的三路傳感器聯(lián)合計(jì)算。
于是,在任一時刻t0,其自動控制系統(tǒng)加載的實(shí)際溫度數(shù)據(jù)可由(4)式計(jì)算得出,Tij(t0)=
其中,i=1-3,j=1-4。從上面的分析可知,到t0時刻為止的局部區(qū)間內(nèi),其反應(yīng)室內(nèi)的相對應(yīng)的測試點(diǎn)的實(shí)際溫度的變化量可由(5)式計(jì)算得出:
經(jīng)過(4)式和(5)式的比較,可以精確計(jì)算出在任一t0時刻,DNA反應(yīng)室內(nèi)反應(yīng)液的精確溫度變化值,即,
(6)
從(6)式可以推算出DNA反應(yīng)液在反應(yīng)過程中的吸熱和放熱的具體規(guī)律,并可以依據(jù)上述公式精確模擬出DNA生物反應(yīng)特性,進(jìn)而建立DNA反應(yīng)的數(shù)據(jù)模型,依據(jù)取得的數(shù)據(jù)Tij(t),通過與的對比即可確定DNA反應(yīng)階段和吸放熱狀態(tài)。