本發(fā)明屬于生物醫(yī)學(xué)或生物制藥技術(shù)領(lǐng)域,涉及針對(duì)于HER3的納米抗體及其編碼序列。
背景技術(shù):
1993年比利時(shí)科學(xué)家Hamers.R在駱駝體內(nèi)發(fā)現(xiàn),與傳統(tǒng)抗體相比,在駱駝血液中的抗體,有一半沒(méi)有輕鏈,只包含一個(gè)重鏈可變區(qū)(VHH)和兩個(gè)常規(guī)的CH2與CH3區(qū),是目前已知的可結(jié)合目標(biāo)抗原的最小單位。VHH晶體直徑為2.5nm,長(zhǎng)4nm,分子量只有15KD,因此也被稱為納米抗體(Nanobody,Nb)。與常規(guī)抗體相比,基于駱駝重鏈抗體的VHH單域抗體具有諸多優(yōu)勢(shì):1)分子量小,可穿透血腦屏障,較易作用于病灶區(qū);2)在原核或者真核系統(tǒng)中可高表達(dá);3)特異性強(qiáng)、親和力高;4)高耐熱性和化學(xué)穩(wěn)定性;5)對(duì)人的免疫原性弱。其在腫瘤、感染性疾病、腸炎、淀粉樣變疾病、血栓以及動(dòng)脈粥樣硬化病變的診斷和治療方面具有良好的應(yīng)用效果,同時(shí)可以顯著降低成本。
在中國(guó),癌癥的健康負(fù)擔(dān)逐年增長(zhǎng),每年超過(guò)160萬(wàn)人診斷為癌癥,120萬(wàn)人因癌癥而死亡。與其他大多數(shù)國(guó)家一樣,乳腺癌也成為了中國(guó)女性最常見(jiàn)的癌癥,發(fā)病率占全身各種惡性腫瘤的7~10%;每年中國(guó)乳腺癌新發(fā)數(shù)量和死亡數(shù)量分別占全世界的12.2%和9.6%,在乳腺癌患者中約有1/4是HER3過(guò)表達(dá)。目前常規(guī)檢測(cè)是對(duì)患者的活檢組織進(jìn)行定性、半定量方法免疫組化(IHC),但此法耗時(shí)較長(zhǎng)且操作繁瑣。因此為了及時(shí)對(duì)乳腺癌HER3表達(dá)的特異性檢測(cè)過(guò)表達(dá)患者進(jìn)行個(gè)體化、靶向性有效的治療,制備乳腺癌過(guò)表達(dá)表皮生長(zhǎng)因子受體3(HER3)的納米抗體來(lái)進(jìn)行疾病檢測(cè)及治療具有廣闊的前景。
目前,也沒(méi)有針對(duì)乳腺癌過(guò)表達(dá)表皮生長(zhǎng)因子受體3(HER3)為靶標(biāo)的特異性納米抗體的研究報(bào)道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
發(fā)明目的:本發(fā)明所要解決的技術(shù)問(wèn)題是提供一種 針對(duì)HER3的納米抗體,同時(shí)提供該納米抗體的編碼序列及該納米抗體在制備檢測(cè)的應(yīng)用。
技術(shù)方案:本發(fā)明的技術(shù)方案為:
本發(fā)明的第一方面,提供了一種針對(duì)HER3重鏈抗體VHH,包括框架區(qū)FR和互補(bǔ)決定區(qū)CDR,所述框架區(qū)FR選自下組的FR的氨基酸序列:SEQ ID NO:1所示的FR1,SEQ ID NO:2所示的FR2,SEQ ID NO:3所示的FR3,SEQ ID NO:4所示的FR4。
所述互補(bǔ)決定區(qū)CDR選自下組的CDR的氨基酸序列:SEQ ID NO:5所示的CDR1,SEQ ID NO:6所示的CDR2,SEQ ID NO:7所示的CDR3。
優(yōu)選地,所述的HER3納米抗體的VHH鏈,它具有SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列。
本發(fā)明第二方面,一種針對(duì)HER3重鏈抗體VHH,此抗體特異性識(shí)別HER3抗原,包括一條具有SEQ ID NO:8所示氨基酸序列的VHH鏈。
本發(fā)明第三方面,提供了一種DNA分子,它編碼選自下組的蛋白質(zhì):本發(fā)明所述的HER3重鏈抗體VHH。
優(yōu)選地,所述的DNA分子,其特征在于,它具有選自下組的DNA序列:SEQ ID NO:9。
有益效果:與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)如下:本發(fā)明將血液中提取的HER3免疫新疆單峰駝,隨后利用該駱駝外周血淋巴細(xì)胞建立了針對(duì)于HER3的納米抗體基因庫(kù),試驗(yàn)中將HER3偶聯(lián)在酶標(biāo)板上,以此形式的抗原利用噬菌體展示技術(shù)篩選免疫性的納米抗體基因庫(kù)(駱駝重鏈抗體噬菌體展示基因庫(kù)),從而獲得了針對(duì)HER3特異性的納米抗體基因,將此基因轉(zhuǎn)至大腸桿菌中,從而建立了能在大腸桿菌中高效表達(dá)的納米抗體株。
附圖說(shuō)明
圖1是HER3納米抗體的基因電泳圖;其中泳道1是DNA分子標(biāo)準(zhǔn),泳道2是PCR擴(kuò)增重鏈抗體引導(dǎo)肽和抗體CH2之間的片段,PCR產(chǎn)物條帶約為700bp。
圖2是HER3納米抗體的DNA瓊脂糖凝膠電泳圖,從左到右凝膠孔的DNA條帶分別是:第一道為1000bp的分子標(biāo)記,其余孔道為PCR擴(kuò)增重鏈抗體可變區(qū)片段產(chǎn)物,PCR產(chǎn)物條帶約為500bp;
圖3是是構(gòu)建的單域抗體文庫(kù)的插入率檢測(cè)結(jié)果,從左到右凝膠孔的DNA條帶分別是:第一道為DNA分子標(biāo)記,其余孔道為檢測(cè)插入片段的PCR產(chǎn)物,經(jīng)檢測(cè),該文庫(kù)的插入率達(dá)到90%以上。
圖4是用噬菌體的酶聯(lián)免疫方法(ELISA)篩選特異性單個(gè)陽(yáng)性克隆的模式圖;其中1是將HER3蛋白偶聯(lián)在酶標(biāo)板上,2是納米抗體,3是鼠抗HA抗體,4是山羊抗小鼠堿性磷酸酶標(biāo)記的抗體,5是堿性磷酸酶顯色液。
圖5是表達(dá)的HER3納米抗體,經(jīng)鎳柱樹(shù)脂凝膠親和層析純化后的SDS-PAGE的電泳圖;其中泳道1是蛋白分子標(biāo)準(zhǔn),其余泳道是 250毫摩爾咪唑洗脫液所洗脫下來(lái)的納米抗體,結(jié)果顯示HER3納米抗體經(jīng)過(guò)該純化過(guò)程,其純度可達(dá)到95%以上。
圖6是HER3納米抗體檢測(cè)特異性分析的結(jié)果圖。
具體實(shí)施方式
本發(fā)明首先將HER3的可溶性蛋白作為抗原免疫一只新疆單峰駝,經(jīng)過(guò)5次免疫之后提取該單峰駝外周血淋巴細(xì)胞并構(gòu)建了HER3特異的單域重鏈抗體文庫(kù)。將HER3偶聯(lián)在NUNC酶標(biāo)板上,展示蛋白質(zhì)的正確空間結(jié)構(gòu),使得HER3的抗原表位得以暴露出來(lái),以此形式的抗原利用噬菌體展示技術(shù)篩選HER3免疫性的納米抗體基因庫(kù)(駱駝重鏈抗體噬菌體展示基因庫(kù)),而獲得了能在大腸桿菌中高效表達(dá)的納米抗體株。
下面結(jié)合具體實(shí)施例,進(jìn)一步闡述本發(fā)明。
實(shí)施例1
針對(duì)于HER3的納米抗體文庫(kù)的構(gòu)建:
(1)首先合成抗原HER3,用于免疫所用的HER3的濃度為500μg/mL,每次免疫將0.5mgHER3與弗氏佐劑等體積混合,免疫一只新疆單峰駝(句容圣龍家畜養(yǎng)殖廠),每周一次,共免疫5次,除第一次使用完全的弗氏佐劑(購(gòu)自sigma),剩余幾次全部使用弗式不全佐劑(購(gòu)自sigma),免疫過(guò)程中刺激B細(xì)胞表達(dá)抗原特異性的納米抗體。(2)5次免疫結(jié)束后,提取駱駝外周血淋巴細(xì)胞100mL并提取總RNA參照QIAGEN公司提供的RNA提取試劑盒。(3)按照Super-Script III FIRST STRANDSUPERMIX試劑盒說(shuō)明書,將提取的RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。用巢式PCR擴(kuò)增重鏈抗體的可變區(qū)片段:
第一輪PCR:
上游引物GTCCTGGCTGCTCTTCTACAAGGC
下游:GGTACGTGCTGTTGAACTGTTCC
擴(kuò)增重鏈抗體引導(dǎo)肽和抗體CH2之間的片段,54℃退火,25個(gè)循環(huán);結(jié)果如圖1顯示該片段的大小約為700bp,即從左到右的DNA條帶分別是:第一為DNA的分子Marker,第二單域抗體基因電泳帶約為700bp。
第二輪PCR:
以第一輪PCR產(chǎn)物作模板,
上游引物:GATGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGRGGAGG
下游引物:GGACTAGTGCGGCCGCTGGAGACGGTGACCTGGGT
擴(kuò)增重鏈抗體FR1區(qū)和長(zhǎng)、短鉸鏈區(qū)之間的片段(長(zhǎng)片段和短片段),60℃退火,17個(gè)循環(huán),回收目的片段,結(jié)果如圖2顯示,該片段的大小約為500bp,即從左到右的DNA條帶分別是:第一為DNA分子Marker,第二納米抗體基因電泳帶約為500bp。(4)使用限制性的內(nèi)切酶(購(gòu)自NEB)PstI及NotI酶切20μg pComb3噬菌體展示載體(Biovector供應(yīng))及10μg VHH并用T4 DNA連接酶(購(gòu)自TaKaRa公司)連接兩個(gè)片段。(5)將連接產(chǎn)物電轉(zhuǎn)化至電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞TG1(北京神州紅葉科技有限公司)中,構(gòu)建HER3的納米抗體噬菌體展示文庫(kù)并測(cè)定庫(kù)容,庫(kù)容的大小為3.1×108。與此同時(shí),通過(guò)菌落PCR檢測(cè)引物使用第二輪PCR引物,Tm55℃。文庫(kù)構(gòu)建完成后,為檢測(cè)文庫(kù)的插入率,隨機(jī)選取單顆克隆做菌落PCR。結(jié)果如圖3顯示插入率已達(dá)到90%以上。
實(shí)施例2
針對(duì)HER3的納米抗體篩選過(guò)程:
(1)將溶解在PBS中的100μg/mL的HER3包被在NUNC酶標(biāo)板上,4℃放置過(guò)夜,同時(shí)設(shè)立負(fù)對(duì)照。(2)第二天兩個(gè)孔中分別加入200μL1%牛奶,室溫封閉2小時(shí)。(3)2小時(shí)后,加入100μL噬菌體(8×1011tfu免疫駱駝納米抗體噬菌展示基因庫(kù)),在室溫下作用1小時(shí)。(4)用 PBST(PBS中含有0.05%吐溫20)洗5遍,以洗掉不結(jié)合的噬菌體。(5)用三乙基胺(100mM)將與HER3特異性結(jié)合的噬菌體解離下,并感染處于對(duì)數(shù)期生長(zhǎng)的大腸桿菌TG1,產(chǎn)生并純化噬菌體用于下一輪的篩選,相同篩選過(guò)程重復(fù)2輪。結(jié)果如圖4顯示:在不斷地篩選的過(guò)程中,陽(yáng)性的克隆將不斷的被富集,從而達(dá)到了利用噬菌體展示技術(shù)篩取抗體庫(kù)中HER3特異抗體的目的。
實(shí)施例3
用噬菌體的酶聯(lián)免疫方法(ELISA)篩選特異性單個(gè)陽(yáng)性克?。?/p>
該實(shí)驗(yàn)的原理模式圖如圖4所示,具體檢測(cè)如下:
(1)從3-4輪篩選后含有噬菌體的細(xì)胞培養(yǎng)皿中,挑選96個(gè)單個(gè)菌落并接種于含有100μg/mL的氨芐青霉素的TB培養(yǎng)基(1L TB培養(yǎng)基中含有2.3g磷酸二氫鉀,12.52g磷酸氫二鉀,12g蛋白胨,24g酵母提取物,4mL甘油)中,生長(zhǎng)至對(duì)數(shù)期后,加終濃度1mmol的IPTG,28℃培養(yǎng)過(guò)夜。(2)利用滲透法獲得粗提抗體,并將抗體轉(zhuǎn)移到經(jīng)抗原包被的ELISA板中,在室溫下放置1小時(shí)。(3)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入一抗mouse anti-HA tag antibody(抗鼠抗HA抗體,購(gòu)自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司),在室溫下放置1小時(shí)。(4)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入二抗anti-mouse alkaline phosphatase conjugate(山羊抗小鼠堿性磷酸酶標(biāo)記抗體,購(gòu)自艾美捷科技有限公司),在室溫下放置1小時(shí)。(5)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入堿性磷酸酶顯色液,于ELISA儀上,在405nm波長(zhǎng),讀取吸收值。(6)當(dāng)樣品孔OD值大于對(duì)照孔OD值3倍以上時(shí),判為陽(yáng)性克隆孔。(7)將陽(yáng)性克隆孔的菌轉(zhuǎn)搖在含有100μg/mL的LB液體中以便提取質(zhì)粒并進(jìn)行測(cè)序。
根據(jù)序列比對(duì)軟件Vector NTI分析各個(gè)克隆株的基因序列,把CDR1,CDR2,CDR3序列相同的株視為同一克隆株,而其序列不同的株視為不同克隆株,最終得到氨基酸序列SEQ ID NO:8所示的納米抗體。
實(shí)施例4
納米抗體在宿主菌大腸桿菌中表達(dá)、純化:
(1)將前面測(cè)序分析所獲得兩種納米抗體亞克隆至表達(dá)性的載體PET32a中,并將測(cè)序鑒定正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到表達(dá)型宿主菌DE3中,其涂布在含有100μg/mL氨芐青霉素的LB固體培養(yǎng)基的板上,37℃過(guò)夜。(2)挑選單個(gè)菌落接種在15mL含有氨芐青霉素的LB培養(yǎng)液中,37℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜。(3)接種1mL的過(guò)夜菌種至330mLLB培養(yǎng)基中,37℃搖床培養(yǎng),培養(yǎng)到OD值達(dá)到0.6-1時(shí),加入IPTG,28℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜。(4)第二天,離心收菌。(5)將菌體破碎以獲得抗體粗提液。(6)經(jīng)鎳柱離子親和層析純化抗體蛋白,為獲得高純度的抗體,采用咪唑梯度洗脫法,低濃度咪唑洗脫液(50mmol)用于洗去雜帶,高濃度咪唑洗脫液(250mmol,500mmol)最終可制備純度達(dá)90%以上的蛋白。圖5所示從左到右的條帶分別是:第一為標(biāo)準(zhǔn)蛋白分子,第二第三250mmol咪唑的洗脫液洗脫的蛋白樣品;結(jié)果顯示,納米抗體經(jīng)過(guò)該純化后,其純度可達(dá)到95%以上。
實(shí)施例5
生物素化納米抗體及其純化方法:
(1)將針對(duì)HER3的納米抗體基因片段亞克隆至pBAD載體上,隨后構(gòu)建好的質(zhì)粒pBAD與質(zhì)粒BirA共轉(zhuǎn)至大腸桿菌WK6中,并將其涂布在含有氨芐青霉素、氯霉素和葡萄糖的LB培養(yǎng)平板上,37℃培養(yǎng)過(guò)夜;(2)挑選單個(gè)菌落接種在5mL含有氨芐青霉素和氯霉素的LB培養(yǎng)液中,37℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜;(3)接種1mL的過(guò)夜菌種至330mL含氨芐青霉素和氯霉素的TB培養(yǎng)液中,37℃搖床培養(yǎng),培養(yǎng)到OD值達(dá)到0.4-0.5時(shí),加入330μl50mM的D-生物素(D-biotion)溶液,37℃慢搖1h;(4)加入終濃度為1mMIPTG,28℃搖床培養(yǎng)過(guò)夜;(4)離心,收菌;(5)利用滲透法,獲得抗體粗提液;(6)使用鏈霉親和素磁珠純化偶聯(lián)生物素的納米抗體。
實(shí)施例6
HER3納米抗體檢測(cè)特異性分析:
(1)將HER3包被在酶標(biāo)板上,同時(shí)做空白孔對(duì)照,各包被兩個(gè)孔,將HER3蛋白納米抗體及對(duì)照抗體前白蛋白納米抗體分別轉(zhuǎn)移到經(jīng)抗原包被的ELISA板中,在室溫下放置1小時(shí)。(2)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入一抗mouse anti-HA tag antibody(抗鼠抗HA抗體,購(gòu)自北京康為世紀(jì)生物科技有限公司),在室溫下放置1小時(shí)。(3)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入二抗anti-mouse alkaline phosphatase conjugate(山羊抗小鼠堿性磷酸酶標(biāo)記抗體,購(gòu)自艾美捷科技有限公司),在室溫下放置1小時(shí)。(4)用PBST洗去未結(jié)合的抗體,加入堿性磷酸酶顯色液,于ELISA儀上,在405nm波長(zhǎng),讀取吸收值。結(jié)果如圖6顯示HER3納米抗體能特異性的識(shí)別HER3蛋白。
以上所述僅是本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方式,應(yīng)當(dāng)指出:對(duì)于本技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來(lái)說(shuō),在不脫離本發(fā)明原理的前提下,還可以做出若干改進(jìn)和潤(rùn)飾,這些改進(jìn)和潤(rùn)飾也應(yīng)視為本發(fā)明的保護(hù)范圍。
本發(fā)明提供一個(gè)HER3納米抗體,每個(gè)納米抗體提供骨架區(qū)和互補(bǔ)決定區(qū),其中所述的骨架區(qū)FR1、FR2、FR3、FR4和互補(bǔ)決定區(qū)CDR1、CDR2、CDR3的核苷酸和氨基酸序列分別為:
HER3納米抗體
骨架區(qū)和互補(bǔ)決定區(qū)的核苷酸序列:
FR1:CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGGGGAGGCCCGGTGCAGTCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCT
FR2: TGGTTCCGCCAGGCTCCAGGAAAGGAGCGCGAGGGGGTCGCAACT
FR3:GTCTACGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTTACCATCTCCCGAGACGACGCCAAGACGAATCTGTTTCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACAGTGCCATGTACTACTGT
FR4: TGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCAGCGGCCGCATAC
CDR1: GGAAACATCTACAGTAGGCACTCCATGGGC
CDR2: ATTAATCGTGATGGCGAGATA
CDR3: GCCGCTAAACCAGGCTGGATGGCGACCCTGGCGTGGAGCGACTGGTTTTAC
骨架區(qū)和互補(bǔ)決定區(qū)的氨基酸序列:
FR1: QVQLQESGGGPVQSGGSLRLSCAAS
FR2: WFRQAPGKEREGVAT
FR3: VYADSVKGRFTISRDDAKTNLFLQMNSLKPEDSAMYYC
FR4: WGQGTQVTVSSAAG
CDR1: GNIYSRHSMG
CDR2: INRDGEI
CDR3: AAKPGWMATLAWSDWFY
整體核苷酸序列:
CAGGTGCAGCTGCAGGAGTCTGGGGGAGGCCCGGTGCAGTCTGGAGGGTCTCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAAACATCTACAGTAGGCACTCCATGGGCTGGTTCCGCCAGGCTCCAGGAAAGGAGCGCGAGGGGGTCGCAACTATTAATCGTGATGGCGAGATAGTCTACGCAGACTCCGTGAAGGGCCGATTTACCATCTCCCGAGACGACGCCAAGACGAATCTGTTTCTGCAAATGAACAGCCTGAAACCTGAGGACAGTGCCATGTACTACTGTGCCGCTAAACCAGGCTGGATGGCGACCCTGGCGTGGAGCGACTGGTTTTACTGGGGCCAGGGGACCCAGGTCACCGTCTCCTCAGCGGCCGCATAC
整體氨基酸序列:QVQLQESGGGPVQSGGSLRLSCAASGNIYSRHSMGWFRQAPGKEREGVATINRDGEIVYADSVKGRFTISRDDAKTNLFLQMNSLKPEDSAMYYCAAKPGWMATLAWSDWFYWGQGTQVTVSSAAG