本發(fā)明屬于生物化學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及生物樣品中病毒基因組核酸提取。
背景技術(shù):
在臨床病毒核酸定量檢測(cè)中,病毒基因組核酸提取是首先進(jìn)行的第一步。目前,國(guó)內(nèi)pcr試劑生產(chǎn)廠家很多,對(duì)于核酸提取方法各異,在檢測(cè)靈敏度、特異性、定量準(zhǔn)確性及檢測(cè)范圍等方面存在一定的差異。因此,導(dǎo)致不同醫(yī)院之間的檢測(cè)結(jié)果難以進(jìn)行比較,其中核酸提取量多少與純度直接影響檢測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性,選擇良好的提取方法和試劑是提高檢測(cè)靈敏度的有效途徑。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是提供一種病毒基因組核酸快速提取試劑,該體系試劑能快速?gòu)难?、血漿、淋巴液、無(wú)細(xì)胞體液、細(xì)胞培養(yǎng)上清液、尿液或各種病毒基因組核酸快速釋放提取,獲得的核酸適用于熒光pcr等下游檢測(cè),具有操作簡(jiǎn)便、使用安全、成本低廉的優(yōu)點(diǎn),適合在臨床基因檢測(cè)中推廣應(yīng)用。
本發(fā)明提供一種核酸基因組快速提取試劑,包括裂解液和洗滌液,其中裂解液成分含有異硫氰酸胍、檸檬酸鈉、十二烷基肌氨酸鈉、tritonx-100、edta-2na;洗滌液成分含有氯化鋰和無(wú)水乙醇。
其中裂解液的配制方法為:稱(chēng)取47.2g異硫氰酸胍、0.6gtris、1.5g檸檬酸鈉,0.83g十二烷基肌氨酸鈉、用去離子水溶解后,調(diào)整ph值至6.0-6.5,加入8mltritonx-100、2ml0.5medta-2na混勻后,用去離子水定容至100ml。
洗滌液配制方法為:氯化鋰12.6g、無(wú)水乙醇80ml,混勻后,用去離子水定容至100ml。
本發(fā)明的核酸基因組快速提取試劑可在室溫保存。
本發(fā)明的核酸基因組快速提取試劑使用方法為:取上述配制的病毒裂解液,按照緩沖液和樣品的比例3∶1混合,用移液器反復(fù)吹打5-10次混勻,室溫放置5-10分鐘后,取混合物過(guò)吸附柱離心或者硅基磁珠吸附,通過(guò)洗滌液漂洗后直接洗脫病毒核酸基因組,獲得的核酸可直接作為模板用于熒光pcr下游檢測(cè)。
本發(fā)明的核酸基因組快速提取試劑具有操作簡(jiǎn)便、使用安全的特點(diǎn),優(yōu)于傳統(tǒng)提取方法,無(wú)需用到較多有揮發(fā)性的化學(xué)試劑、也無(wú)需蛋白酶k消化。該體系試劑能快速破壞病毒顆粒外殼蛋白結(jié)構(gòu),釋放核酸基因組,獲得的核酸可適用于各種常規(guī)操作,包括rt-pcr、熒光定量pcr等各種下游實(shí)驗(yàn)。整個(gè)過(guò)程安全、便捷,提取的病毒dna/rna得率高、純度高、質(zhì)量穩(wěn)定可靠,也可適合高通量工作站的自動(dòng)化提取。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合具體實(shí)施例,并結(jié)合陽(yáng)性樣品進(jìn)行不同方法的提取,進(jìn)一步闡述本發(fā)明。
(1)hbv陽(yáng)性血清核酸提取
選取5例hbv陽(yáng)性血清樣品,采用本發(fā)明內(nèi)容中的提取試劑分別用兩種方法進(jìn)行提取。
吸附離心柱法提取步驟:
(a)吸取300ul的病毒裂解液和100ul樣品混合,振蕩混勻、室溫放置5分鐘。
(b)吸取混合物至離心柱,12000rpm離心1分鐘,棄廢液。
(c)吸取500ul病毒洗滌液至離心柱,離心3分鐘,棄廢液。
(d)取出ct2號(hào)柱(帶蓋),放入一個(gè)無(wú)rnase的離心管中,在吸附膜的中間部位加30μl無(wú)dnase和rnase的水,室溫放置1分鐘,12,000rpm離心1分鐘。
(e)洗脫的dna/rna備用或者儲(chǔ)存-70℃保存。
硅基磁珠法提取步驟:
(a)加入磁珠裂解樣品吸取300ul的病毒裂解液和100ul樣品,分別加入有磁珠的離心管中,蓋緊上蓋,顛倒混勻,裂解5分鐘,期間重復(fù)顛倒離心管幾次,使其完全裂解。
(b)磁分離把ep管放到磁架上,靜置半分鐘,磁珠自動(dòng)被吸附在管壁上,吸棄上清。(磁分離操作要在磁架上完成,以避免吸掉磁珠)
(c)洗滌從磁架上取下ep管,加人病毒洗滌液0.5ml,吸10s使磁珠與洗滌液混合均勻,磁分離,吸棄上清。重復(fù)洗滌一次,開(kāi)蓋放置3min,使磁珠干燥,管內(nèi)及管蓋上殘液要抽凈。注意:乙醇?xì)埩魰?huì)抑制后續(xù)的酶反應(yīng),所以晾干時(shí)要確保乙醇揮發(fā)干凈。但也不要干燥太長(zhǎng)時(shí)間,以免難以洗脫核酸。
(d)洗脫加人無(wú)dnase和rnase的水30ul,抽吸10s混勻,蓋緊上蓋,室溫放置,取出ep管后立即放到磁架上10s,吸取上清至新的ep管中。
(e)將提取好的核酸溶液適當(dāng)條件保存。
本提取試劑方法同堿裂解法提取熒光pcr檢測(cè)結(jié)果,熒光定量pcr儀(bio-radcxf96)
(2)hiv陽(yáng)性血清核酸提取
本提取試劑方法同酚氯仿抽提方法提取熒光pcr檢測(cè)結(jié)果,熒光定量pcr儀(bio-radcxf96)