本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域。具體地說,本發(fā)明涉及靶向人pd-1蛋白的多肽及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
免疫系統(tǒng)中存在著眾多的共刺激信號(hào)和共抑制信號(hào)精確調(diào)控t細(xì)胞反應(yīng)的強(qiáng)度和質(zhì)量,這些抑制信號(hào)被稱為免疫檢查點(diǎn)。腫瘤細(xì)胞通常會(huì)過表達(dá)這些免疫檢查點(diǎn)蛋白,從而抑制t細(xì)胞的激活,逃避免疫系統(tǒng)的殺傷。通過不同的策略增強(qiáng)t細(xì)胞的活性對(duì)腫瘤免疫治療具有重要意義,其中對(duì)免疫檢查點(diǎn)進(jìn)行阻斷是增強(qiáng)t細(xì)胞活性的有效策略之一。t細(xì)胞表面存在著一系列的免疫抑制性分子,如pd-1、ctla-4、tim-3、slam等,這些免疫抑制性分子可以與其相應(yīng)的配體結(jié)合從而激活免疫抑制調(diào)節(jié)通路,進(jìn)而導(dǎo)致t細(xì)胞功能的衰竭,其中,pd-1/pd-l1通路是目前的研究熱點(diǎn)。
pd-1是t細(xì)胞表面一個(gè)重要的抑制性受體,因最初在凋亡的t細(xì)胞淋巴瘤中發(fā)現(xiàn),并能促進(jìn)程序性細(xì)胞死亡而得名。pd-1蛋白可誘導(dǎo)性地表達(dá)于活化的t細(xì)胞、b細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞以及單核細(xì)胞等。其配體有兩個(gè),分別為pd-l1(cd274,b7-h1)和pd-l2(cd273,b7-dc)。pd-l1比pd-l2的分布更加廣泛,pd-l1可以在b細(xì)胞、dc、巨噬細(xì)胞、骨髓源肥大細(xì)胞、t細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、上皮細(xì)胞等細(xì)胞中表達(dá),而pd-l2僅在dc、巨噬細(xì)胞、記憶性b細(xì)胞等細(xì)胞中表達(dá),因此,阻斷pd-1/pd-l1通路比阻斷pd-1/pd-l2通路更為有效。pd-1/pd-l1抑制免疫通路的機(jī)理如下:腫瘤細(xì)胞存在著大量的基因突變以及蛋白的異常表達(dá),可以作為腫瘤抗原活化t細(xì)胞。腫瘤特異性細(xì)胞毒t細(xì)胞到達(dá)腫瘤部位后,通過t細(xì)胞抗原受體(tcr)識(shí)別腫瘤細(xì)胞,釋放干擾素γ(ifn-γ)以及t細(xì)胞顆粒,殺傷腫瘤細(xì)胞。但ifn-γ除具有抗腫瘤作用外,還能夠誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞表達(dá)pd-l1。這些pd-l1與活化的t細(xì)胞中的pd-1結(jié)合后,抑制t細(xì)胞的抗腫瘤作用。
雖然目前已經(jīng)有很多阻斷pd-1/pd-l1通路的藥物進(jìn)入臨床試驗(yàn)或者個(gè)別藥物已經(jīng)獲得美國(guó)fda的審批,例如:靶向pd-1蛋白的nivolumab、pembrolizumab和pidilizumab,以及靶向與pd-l1的mpdl3280a、mdx1105、medi4736等,但是這些藥物大部分都是抗體類藥物,具有生產(chǎn)成本高、組織滲透性差、易產(chǎn)生免疫原性等缺點(diǎn)。
與抗體類藥物相比,多肽分子因具有較高的特異性和組織親和性、生產(chǎn)成本低、不易產(chǎn)生免疫原性及較好的組織滲透性等優(yōu)點(diǎn),而成為最有吸引力的抗體替代物。因而,研究并開發(fā)出一些低分子量的有機(jī)小分子或者多肽類藥物成為阻斷pd-1/pd-l1通路的重要研究方向。
綜上所述,本領(lǐng)域急需低分子量的有機(jī)小分子或者多肽作為阻斷pd-1/pd-l1通路的候選藥物。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是提供能夠阻斷pd-1/pd-l1通路的低分子量的有機(jī)小分子或者多肽類。
在第一方面,本發(fā)明提供一種式i表示的多肽:
[xaa0]-[xaa1]-asp-tyr-[xaa2]-arg-[xaa3]-tyr-[xaa4](i)
其中,
[xaa0]為glyasn、thrglu、或pheasn構(gòu)成的肽段、或無;
[xaa1]為trp、lys或met;
[xaa2]為asnsergln、arghisglyasnile、serleuglugluleu、sertrplysserglu、glnasn、cysprocys、cyshisglyprocys、cysalagluproleu、sertrpcysprocys構(gòu)成的肽段;
[xaa3]為alaglnleu、metlysleuala、glulysalalys、leulysgluala、或glulyscyslys構(gòu)成的肽段;
[xaa4]為asngln、aspleu、lys、aspleu、或arg;
并且所述多肽具有pd-1結(jié)合活性,所述多肽的長(zhǎng)度為15-18個(gè)氨基酸。
在具體的實(shí)施方式中,所述多肽選自下組:
(a)氨基酸序列如seqidno:1-9中任一所示的多肽;
(b)將(a)所述的多肽經(jīng)過1-6個(gè)(較佳地1-4個(gè))氨基酸殘基的取代、缺失或添加而形成的,且具有pd-1結(jié)合活性的由(a)衍生的多肽。
在優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述多肽與pd-1的結(jié)合kd值為1-5μm,優(yōu)選1-4μm、更優(yōu)選1-3μm,最優(yōu)選與天然pd-l1與pd-1的結(jié)合kd值近似。
在具體的實(shí)施方式中,所述多肽選自氨基酸序列如seqidno:1-9中任一所示的多肽。
在具體的實(shí)施方式中,所述多肽是氨基酸序列如seqidno:1或6所示的多肽。
在第二方面,本發(fā)明提供一種分離的核酸分子,所述核酸分子編碼本發(fā)明第一方面所述的多肽。
在第三方面,本發(fā)明提供一種宿主細(xì)胞,所述宿主細(xì)胞包含本發(fā)明第二方面所述的分離的核酸分子。
在優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述宿主細(xì)胞包括但不限于:細(xì)菌、酵母、植物細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞或哺乳動(dòng)物細(xì)胞。
在優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述細(xì)菌包括但不限于:大腸桿菌、枯草桿菌;所述酵母包括但不限于:畢赤酵母、釀酒酵母。
在第四方面,本發(fā)明提供一種藥物組合物,所述藥物組合物包含本發(fā)明第一方面所述的多肽以及藥學(xué)上可接受的賦形劑。
在優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述的藥物組合物還包含:(c)藥學(xué)上可接受的其它阻斷pd-1/pd-l1通路的藥物。
在另一優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述其它阻斷pd-1/pd-l1通路的藥物包括但不限于:靶向pd-1蛋白的nivolumab、pembrolizumab、pidilizumab,以及靶向pd-l1的mpdl3280a、mdx1105、medi4736等。
在優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述的藥物組合物還可包含其它抗腫瘤藥物,所述抗腫瘤藥物包括但不限于:ipilimumab、ramucirumab、trametinib、ceritini、dabrafenib等。
在另一優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述藥物組合物的劑型適用于以下給藥方式,包括但不限于:注射給藥、輸注給藥、腹膜內(nèi)給藥、瘤內(nèi)給藥、肌肉內(nèi)給藥。
在第五方面,本發(fā)明提供本發(fā)明第一方面所述的多肽的用途,用于制備抑制pd-1與pd-l1結(jié)合或抑制腫瘤、或治療細(xì)菌、病毒或真菌引起的感染或治療炎性疾病的藥物。
在具體的實(shí)施方式中,所述腫瘤包括但不限于:黑色素瘤、肺癌(優(yōu)選非小細(xì)胞肺癌)、腎癌、卵巢癌、前列腺癌、乳腺癌、結(jié)腸癌、骨癌、胰腺癌、皮膚癌、頭頸癌、子宮癌、直腸癌、肛門癌、胃癌、睪丸癌、輸卵管癌、子宮內(nèi)膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、何杰金氏病、非何杰金淋巴瘤、食道癌、小腸癌、內(nèi)分泌系統(tǒng)癌、甲狀腺癌、甲狀旁腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、急性髓性白血病、慢性髓性白血病、急性淋巴細(xì)胞白血病、慢性淋巴細(xì)胞白血病、小兒實(shí)體瘤、淋巴細(xì)胞性淋巴瘤、膀胱癌、腎或輸尿管癌、腎盂癌、中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)腫瘤、原發(fā)性cns淋巴瘤、腫瘤血管生成、脊軸瘤、腦干神經(jīng)膠質(zhì)瘤、垂體腺瘤、卡波西肉瘤、表皮樣癌、鱗狀細(xì)胞癌、t細(xì)胞淋巴瘤等;
所述病毒包括但不限于:肝炎病毒(甲型、乙型和丙型)、孢疹病毒、流感病毒、腺病毒、冠狀病毒、麻疹病毒、登革熱病毒、脊髓灰質(zhì)炎病毒、狂犬病病毒等;
所述細(xì)菌包括但不限于:衣原體、立克次氏體、分枝桿菌、葡萄球菌、肺炎球菌、霍亂、破傷風(fēng)等;
所述真菌包括但不限于:假絲酵母、曲霉、皮炎芽酵母等;或者
所述炎性疾病包括但不限于:強(qiáng)直性脊柱炎、自身免疫性溶血性貧血、關(guān)節(jié)炎、重癥肌無力、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、惡性貧血、多肌炎等。
在第六方面,本發(fā)明提供一種抑制pd-1與pd-l1結(jié)合的方法,包括步驟:利用本發(fā)明第一方面所述的多肽或本發(fā)明第四方面所述的藥物組合物抑制pd-1與pd-l1結(jié)合。
在優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述抑制pd-1與pd-l1結(jié)合的方法是體外非治療性的。
應(yīng)理解,在本發(fā)明范圍內(nèi)中,本發(fā)明的上述各技術(shù)特征和在下文(如實(shí)施例)中具體描述的各技術(shù)特征之間都可以互相組合,從而構(gòu)成新的或優(yōu)選的技術(shù)方案。限于篇幅,在此不再一一累述。
附圖說明
圖1顯示實(shí)施例3構(gòu)建的人pd-1重組質(zhì)粒的pcr鑒定結(jié)果,其中marker代表dna分子量marker;泳道中出現(xiàn)的條帶為目的條帶(357bp)。
圖2顯示實(shí)施例4的經(jīng)純化人pd-1蛋白的sds-page電泳結(jié)果,其中m代表蛋白分子量marker;泳道1代表人的pd-1蛋白,該目的條帶大小為13kda,與理論值大小一致。
圖3a顯示人pd-1蛋白與氨基酸序列為seqidno:1的多肽結(jié)合的spr圖,測(cè)得的該條多肽與pd-1蛋白的kd值為1.38μm。
圖3b顯示人pd-1蛋白與氨基酸序列為seqidno:2的多肽結(jié)合的spr圖,測(cè)得的該條多肽與pd-1蛋白的kd值為3.13μm。
圖3c顯示人pd-1蛋白與氨基酸序列為seqidno:3的多肽結(jié)合的spr圖,測(cè)得的該條多肽與pd-1蛋白的kd值為3.14μm。
圖3d顯示人pd-1蛋白與氨基酸序列為seqidno:4的多肽結(jié)合的spr圖,測(cè)得的該條多肽與pd-1蛋白的kd值為3.39μm。
圖3e顯示人pd-1蛋白與氨基酸序列為seqidno:5的多肽結(jié)合的spr圖,測(cè)得的該條多肽與pd-1蛋白的kd值為3.32μm。
圖3f顯示人的pd-1蛋白與人pd-l1蛋白結(jié)合的spr圖,測(cè)得人pd-l1蛋白與pd-1蛋白的kd值為1.15μm。
圖4顯示人pd-l1蛋白與氨基酸序列為seqidno:1的多肽競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合人pd-1蛋白的spr圖。
圖5a顯示人pd-1蛋白與氨基酸序列為seqidno:6的多肽結(jié)合的spr圖,測(cè)得的該條多肽與pd-1蛋白的kd值為2.08μm。
圖5b顯示人pd-1蛋白與氨基酸序列為seqidno:7的多肽結(jié)合的spr圖,測(cè)得的該條多肽與pd-1蛋白的kd值為3.96μm。
圖5c顯示人pd-1蛋白與氨基酸序列為seqidno:8的多肽結(jié)合的spr圖,測(cè)得的該條多肽與pd-1蛋白的kd值為3.11μm。
圖5d顯示人pd-1蛋白與氨基酸序列為seqidno:9的多肽結(jié)合的spr圖,測(cè)得的該條多肽與pd-1蛋白的kd值為4.81μm。
具體實(shí)施方式
發(fā)明人經(jīng)過廣泛而深入的研究,出乎意料地發(fā)現(xiàn)了一組靶向人pd-1蛋白的多肽,該組多肽能夠競(jìng)爭(zhēng)性地與人pd-1蛋白結(jié)合,從而成為研究pd-1/pd-l1免疫檢查點(diǎn)阻斷劑的多肽類先導(dǎo)藥物,進(jìn)而為抗腫瘤藥物的發(fā)展提供基礎(chǔ)。在此基礎(chǔ)上完成了本發(fā)明。
除非另有定義,本文中使用的所有技術(shù)和科學(xué)術(shù)語(yǔ)具有與所公開的發(fā)明所屬領(lǐng)域的技術(shù)人員的普遍理解相同的含義。為便于理解本發(fā)明,對(duì)本發(fā)明涉及的相關(guān)術(shù)語(yǔ)作如下定義,但本發(fā)明的范圍并不限于這些具體的定義。
pd-1蛋白
本文所用的術(shù)語(yǔ)“pd-1蛋白”是指人體內(nèi)t細(xì)胞表面的一個(gè)重要的抑制性受體。其有兩個(gè)配體,分別為pd-l1和pd-l2。pd-l1與活化的t細(xì)胞中的pd-1結(jié)合后,起到抑制t細(xì)胞的抗腫瘤作用。因此,阻斷pd-1/pd-l1通路對(duì)于抑制或殺傷腫瘤有著積極作用。
本領(lǐng)域技術(shù)人員熟知,人體內(nèi)的蛋白有可能產(chǎn)生一定突變,而仍保留其活性。因此,本發(fā)明所述的pd-1蛋白包括包含一定突變的pd-1蛋白,只要該突變的pd-1蛋白在人體內(nèi)行使與野生型pd-1相同的功能。例如,在具體的實(shí)施方式中,本發(fā)明所述的pd-1蛋白具有seqidno:14所示氨基酸序列(pptfspallvvtegdnatftcsfsntsesfvlnwyrmspsnqtdklaafpedrsqpgqdcrfrvtqlpngrdfhmsvvrarrndsgtylcgaislapkaqikeslraelrvterrae),其相應(yīng)的編碼核苷酸序列如seqidno:13所示。
pd-1蛋白具有與其特異性結(jié)合的配體(pd-l1)。例如,在具體的實(shí)施方式中,本發(fā)明所述的pd-l1具有seqidno:12所示氨基酸序列。
本發(fā)明的多肽
本發(fā)明提供能夠競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合人pd-1蛋白的多肽,這些多肽具有結(jié)構(gòu)上的相似性,即,在特定的位置具有特定的氨基酸殘基。
在具體的實(shí)施方式中,本發(fā)明提供式i表示的多肽:
[xaa0]-[xaa1]-asp-tyr-[xaa2]-arg-[xaa3]-tyr-[xaa4](i)
其中,[xaa0]為glyasn、thrglu、或pheasn構(gòu)成的肽段、或無;[xaa1]為trp、lys或met;[xaa2]為asnsergln、arghisglyasnile、serleuglugluleu、sertrplysserglu、glnasn、cysprocys、cyshisglyprocys、cysalagluproleu、sertrpcysprocys構(gòu)成的肽段;[xaa3]為alaglnleu、metlysleuala、glulysalalys、leulysgluala、或glulyscyslys構(gòu)成的肽段;[xaa4]為asngln、aspleu、lys、aspleu、或arg;這些多肽的長(zhǎng)度為15-18個(gè)氨基酸。
這些多肽與人pd-1蛋白具有良好的結(jié)合親和力,其中結(jié)合親和力最高的多肽與人pd-1蛋白的天然配體pd-l1相當(dāng)。在優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述多肽為氨基酸序列如seqidno:1-9中任一所示的多肽;或者將氨基酸序列如seqidno:1-9中任一所示的多肽經(jīng)過1-6個(gè),(較佳地1-4個(gè))氨基酸殘基的取代、缺失或添加而形成的,且具有pd-1結(jié)合活性的衍生多肽。
在具體的實(shí)施方式中,本發(fā)明的多肽與pd-1的結(jié)合kd值為1-5μm,優(yōu)選1-4μm、更優(yōu)選1-3μm,最優(yōu)選與天然pd-l1與pd-1的結(jié)合kd值近似。
在優(yōu)選的實(shí)施方式中,本發(fā)明的多肽選自氨基酸序列如seqidno:1-9中任一所示的多肽;更優(yōu)選氨基酸序列如seqidno:1或6所示的多肽。
在本發(fā)明的多肽的基礎(chǔ)上,本發(fā)明提供一種分離的核酸分子以及宿主細(xì)胞,所述核酸分子編碼本發(fā)明的多肽,所述宿主細(xì)胞包含所述的分離的核酸分子。
本領(lǐng)域技術(shù)人員知曉如何選取宿主細(xì)胞并在其中進(jìn)行蛋白質(zhì)的表達(dá),例如,所述宿主細(xì)胞包括但不限于:細(xì)菌、酵母、植物細(xì)胞、昆蟲細(xì)胞或哺乳動(dòng)物細(xì)胞。在具體的實(shí)施方式中,所述細(xì)菌包括但不限于:大腸桿菌、枯草桿菌;所述酵母包括但不限于:畢赤酵母、釀酒酵母。
由于本發(fā)明的多肽與人pd-1蛋白具有良好的結(jié)合親和力,這些多肽能作為pd-1/pd-l1結(jié)合的抑制劑或調(diào)節(jié)pd-1/pd-l1結(jié)合程度的調(diào)節(jié)劑。因此,本發(fā)明還提供了一種藥物組合物,所述藥物組合物包含本發(fā)明的多肽以及藥學(xué)上可接受的賦形劑。
本發(fā)明的多肽顯然還可以與其它機(jī)理的阻斷pd-1/pd-l1通路的藥物以及其它抗腫瘤藥物聯(lián)用以增強(qiáng)彼此的作用。因此,上述藥物組合物中還可包含藥學(xué)上可接受的其它阻斷pd-1/pd-l1通路的藥物。例如,所述其它阻斷pd-1/pd-l1通路的藥物包括但不限于:靶向pd-1蛋白的nivolumab、pembrolizumab、pidilizumab,以及靶向pd-l1的mpdl3280a、mdx1105、medi4736等。在優(yōu)選的實(shí)施方式中,所述的藥物組合物還可包含其它抗腫瘤藥物,所述抗腫瘤藥物包括但不限于:ipilimumab、ramucirumab、trametinib、ceritini、dabrafenib等。
本領(lǐng)域技術(shù)人員知熟知,本發(fā)明的藥物組合物的具體劑型取決于要采用的給藥方式。例如,本發(fā)明的藥物組合物可采用的給藥方式包括但不限于:注射給藥、輸注給藥、腹膜內(nèi)給藥、瘤內(nèi)給藥、肌肉內(nèi)給藥,等等。而藥物組合物中活性成分的含量可由醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的技術(shù)人員根據(jù),例如患者的性別、年齡、總體健康狀況等實(shí)際情況自主決定。
基于本發(fā)明的多肽的活性,本領(lǐng)域技術(shù)人員不難想到可將其制備成抑制pd-1與pd-l1結(jié)合的藥物或抑制腫瘤的藥物。在具體的實(shí)施方式中,所述腫瘤包括但不限于:黑色素瘤、肺癌(優(yōu)選非小細(xì)胞肺癌)、腎癌、卵巢癌、前列腺癌、乳腺癌、結(jié)腸癌、骨癌、胰腺癌、皮膚癌、頭頸癌、子宮癌、直腸癌、肛門癌、胃癌、睪丸癌、輸卵管癌、子宮內(nèi)膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、何杰金氏病、非何杰金淋巴瘤、食道癌、小腸癌、內(nèi)分泌系統(tǒng)癌、甲狀腺癌、甲狀旁腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、急性髓性白血病、慢性髓性白血病、急性淋巴細(xì)胞白血病、慢性淋巴細(xì)胞白血病、小兒實(shí)體瘤、淋巴細(xì)胞性淋巴瘤、膀胱癌、腎或輸尿管癌、腎盂癌、中樞神經(jīng)系統(tǒng)(cns)腫瘤、原發(fā)性cns淋巴瘤、腫瘤血管生成、脊軸瘤、腦干神經(jīng)膠質(zhì)瘤、垂體腺瘤、卡波西肉瘤、表皮樣癌、鱗狀細(xì)胞癌、t細(xì)胞淋巴瘤。
在其它實(shí)施方式中,所述抑制pd-1與pd-l1結(jié)合的藥物還可用于治療細(xì)菌、病毒或真菌感染。例如,以下病毒引起的感染:肝炎病毒(甲型、乙型和丙型)、孢疹病毒、流感病毒、腺病毒、冠狀病毒、麻疹病毒、登革熱病毒、脊髓灰質(zhì)炎病毒、狂犬病病毒等;以下細(xì)菌引起的感染:衣原體、立克次氏體、分枝桿菌、葡萄球菌、肺炎球菌、霍亂、破傷風(fēng)等;或以下真菌引起的致病感染:假絲酵母、曲霉、皮炎芽酵母等。
在其它實(shí)施方式中,所述抑制pd-1與pd-l1結(jié)合的藥物還可用于治療炎性疾病,包括但不限于:強(qiáng)直性脊柱炎、自身免疫性溶血性貧血、關(guān)節(jié)炎、重癥肌無力、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、惡性貧血、多肌炎等。
在本發(fā)明的多肽或藥物組合物的基礎(chǔ)上,本發(fā)明進(jìn)一步提供了一種抑制pd-1與pd-l1結(jié)合的方法,包括利用本發(fā)明的多肽或藥物組合物抑制pd-1與pd-l1結(jié)合的步驟。在具體的實(shí)施方式中,所述抑制pd-1與pd-l1結(jié)合的方法是體外非治療性的。
本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn):
1.本發(fā)明提供了能夠競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合人pd-1蛋白的多肽;
2.本發(fā)明的多肽能與人pd-1蛋白良好結(jié)合,其中,結(jié)合親和力最高的多肽與人pd-1蛋白的結(jié)合情況與天然pd-l1蛋白無異;
3.本發(fā)明的多肽具有較高的特異性、組織親和性、不易產(chǎn)生免疫原性以及較好的組織滲透性;和
4.本發(fā)明的多肽的生產(chǎn)成本低。
下面結(jié)合具體實(shí)施例,進(jìn)一步闡述本發(fā)明。應(yīng)理解,這些實(shí)施例僅用于說明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。下列實(shí)施例中未注明具體條件的實(shí)驗(yàn)方法,通常按照常規(guī)條件,例如sambrook等人,分子克?。簩?shí)驗(yàn)室手冊(cè)(coldspringharborlaboratorypress,2001)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。除非另外說明,否則百分比和份數(shù)按重量計(jì)算。
實(shí)施例
實(shí)施例1.本發(fā)明多肽的合成
(1)實(shí)驗(yàn)儀器與材料
二甲基甲酰胺(dmf)、哌啶、樹脂、二氯甲烷(dcm)、茚三酮反應(yīng)試劑、苯并三氮唑-n,n,n',n'-四甲基脲六氟磷酸鹽(hbtu)、三異丙基硅烷(tis)、乙二硫醇(edt)、無水乙醚、三氟乙酸(tfa)、n-甲基嗎啉(nmm)、甲醇、乙醇、20種氨基酸、多肽固相合成管、質(zhì)譜儀器microtof-q11(brukerdaltonics)。
(2)實(shí)驗(yàn)步驟
稱量樹脂并投入到多肽固相合成管中,加入適量的dmf溶脹半小時(shí)以上。抽掉dmf,用脫保護(hù)液(哌啶:dmf=1:4)進(jìn)行fmoc去保護(hù)反應(yīng),置于搖床上10分鐘。抽掉脫保護(hù)液,用dmf、dcm洗滌三次,從固相合成管中取出少量樹脂于試管中,用乙醇洗滌2次,茚三酮法檢測(cè)并記錄顏色,準(zhǔn)備投料,進(jìn)行氨基酸縮合反應(yīng)。分別按照seqidno:1-9所示的氨基酸序列取相應(yīng)氨基酸、hbtu,并用少量的dmf溶解,投入到固相合成管中,加入10倍的nmm,攪拌反應(yīng)。1-2小時(shí)后,從固相合成管中取少量樹脂于試管中,用乙醇洗滌2次,茚三酮法檢測(cè)。抽掉固相合成管中的液體,用dmf、甲醇、dcm各洗滌2次,得到第一個(gè)氨基酸縮合后的肽樹脂。對(duì)所得肽樹脂重復(fù)進(jìn)行以上“fmoc去保護(hù)、氨基酸縮合”反應(yīng)步驟,至最后一個(gè)氨基酸反應(yīng)完畢,得到氨基酸序列如seqidno:1-9所示的肽。反應(yīng)完畢后,dmf、甲醇、dcm各洗滌2次,繼續(xù)抽干10-15分鐘。固相合成管中取出合成完的部分肽樹脂,于室溫下在裂解液(tfa94.5%;水2.5%;edt2.5%;tis1%)中裂解兩小時(shí)。將樹脂過濾后,于旋蒸儀中蒸干,用無水乙醚洗滌6次,然后常溫?fù)]干。粗肽使用分析級(jí)hplc純化,使用hplc檢測(cè)純度>90%。所得的純肽使用質(zhì)譜鑒定。最后將純化后的溶液凍干,即可得到純品。表1列出了本發(fā)明多肽的分子量的理論值和質(zhì)譜測(cè)定的實(shí)際值。
實(shí)施例3.人的pd-1重組質(zhì)粒的構(gòu)建
目的基因?yàn)閜d-1蛋白上34-150位氨基酸的編碼核酸。利用ncoi和ndei兩個(gè)酶切位點(diǎn)設(shè)計(jì)的特異性引物將目的片段克隆到pet-28a載體(novagen公司)上。正向引物為:5’-ttttccatgggtccccccaccttctccccag-3’(seqidno:10);反向引物為:5’-gccgccgcatatgttattctgcccttctctctg-3’(seqidno:11)。以人的pd-1基因?yàn)槟0?,進(jìn)行pcr擴(kuò)增。pcr體系為:2μlpd-1質(zhì)粒,2μl正向引物,2μl反向引物,5μl10×緩沖溶液,4μldntp,1μlpfu聚合酶,34μlddh2o。pcr擴(kuò)增條件:94℃預(yù)變性4min;94℃變性30s,60℃退火30s,72℃延伸48s,30個(gè)循環(huán);72℃10min。pcr擴(kuò)增完畢后,進(jìn)行核酸電泳,切下目的條帶,用pcr產(chǎn)物回收試劑盒回收pcr產(chǎn)物。將所得的pcr產(chǎn)物和質(zhì)粒pet-28a載體分別用ncoi和ndei兩個(gè)限制性核酸內(nèi)切酶進(jìn)行雙酶切,然后在t4連接酶的作用下連接,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌dh5α感受態(tài)細(xì)胞中。過夜培養(yǎng)后,挑取單克隆進(jìn)行菌液pcr鑒定(結(jié)果見圖1),然后取陽(yáng)性重組子測(cè)序,保留菌株和甘油菌。通過重組質(zhì)粒構(gòu)建的人的pd-1具有如seqidno:13所示的核苷酸序列。
實(shí)施例4.人的pd-1蛋白的表達(dá)與純化
本發(fā)明所用到的人的pd-1蛋白是經(jīng)原核生物表達(dá)、純化后獲得的。具體實(shí)驗(yàn)步驟如下:將測(cè)序正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到e.colibl21感受態(tài)細(xì)胞中進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)。挑取單個(gè)菌落接種于含有卡那霉素的tb培養(yǎng)基中,于37℃振蕩培養(yǎng)過夜。次日將小培產(chǎn)物擴(kuò)培到1l的tb培養(yǎng)基中,培養(yǎng)至od600為0.5-0.6,加入誘導(dǎo)劑iptg至終濃度為0.5mm,37℃誘導(dǎo)5-7h。在4,000rpm下收菌,先用裂解緩沖溶液(50mmtris-hcl,ph8.0,50mmnacl,,1mmdtt,0.5mmedta,5%甘油)裂解細(xì)菌,然后再高壓破碎,在12,000rpm下離心取沉淀。用洗雜緩沖液(20mmtris-hcl,ph8.0,2m尿素,2.5%tritonx-100)洗雜兩次,取沉淀。然后再用溶解緩沖溶液(20mmtris-hcl,ph8.0,8m尿素)溶解蛋白,離心取上清。取3kda的蛋白超濾濃縮管濃縮蛋白至5ml左右,將其加入到1l的復(fù)性緩沖液(50mmtris-hcl,ph8.0,50mml-arg,24mmnacl,1mmkcl,1mmedta)中,用稀釋法在4℃下復(fù)性24h。用3kda的濃縮管濃縮蛋白,至20ml左右,將蛋白裝入透析袋中,在透析緩沖液(50mmtris-hcl,ph8.0,150mmnacl,1mmdtt)中透析過夜,濃縮。對(duì)獲得的蛋白過陽(yáng)離子交換柱和分子篩進(jìn)行純化。將過完分子篩后的蛋白進(jìn)行14%sds-page凝膠電泳,鑒定純化后的蛋白純度。所得電泳圖如圖2所示,蛋白大小約為13kda,與人pd-1蛋白的理論值吻合,說明成功獲得了人pd-1蛋白。
實(shí)施例5.人pd-1蛋白與本發(fā)明多肽的spr結(jié)合實(shí)驗(yàn)
本發(fā)明的多肽與人pd-1蛋白的結(jié)合通過biacoret200進(jìn)行表面等離子體共振(surfaceplasmonresonances,spr)實(shí)驗(yàn)測(cè)定。具體實(shí)驗(yàn)步驟如下:用10mm醋酸鈉溶液將純化好的pd-1蛋白稀釋到50μg/ml,使用氨基偶聯(lián)試劑盒將pd-1蛋白偶聯(lián)到cm5芯片上,流速為10μl/min,結(jié)合時(shí)間為420s,最后的偶聯(lián)量約為5000ru。結(jié)合實(shí)驗(yàn)是在含有0.05%的表面活性劑p20的pbs溶液(137mmnacl,2.7mmkcl,8mmna2hpo4,2mmkh2po4,ph7.4)中進(jìn)行的。實(shí)驗(yàn)溫度設(shè)定為25℃,流速為30μl/min,結(jié)合時(shí)間90s,解離時(shí)間120s。將多肽用運(yùn)行溶液溶解后,成倍稀釋成不同濃度,隨著運(yùn)行溶液結(jié)合到pd-1上。得到的結(jié)合數(shù)據(jù)用biaevaluation2.0軟件分析,利用穩(wěn)態(tài)擬合得到親和力kd值。本發(fā)明的多肽與人pd-1蛋白的spr結(jié)合實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖3a-3e以及圖5a-5d所示。表1列出了本發(fā)明的多肽的序列及spr實(shí)驗(yàn)測(cè)得的kd值。
本發(fā)明人同時(shí)檢測(cè)了人pd-1蛋白與人pd-l1蛋白的結(jié)合親和力kd值,其為1.15μm(如圖3f所示)。
表1.本發(fā)明的多肽序列、分子量及它們與人pd-1蛋白結(jié)合的kd值
實(shí)施例6.人pd-l1蛋白與seqidno:1所示多肽競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合人pd-1蛋白的spr實(shí)驗(yàn)
根據(jù)實(shí)施例5中的spr實(shí)驗(yàn)結(jié)果,seqidno:1所示多肽與人pd-1蛋白的結(jié)合親和力最高。因而,本發(fā)明人以seqidno:1所示多肽為例,探究了該肽阻斷人pd-1蛋白與人pd-l1蛋白結(jié)合的能力。人pd-l1蛋白購(gòu)自北京義翹神州生物技術(shù)有限公司。
具體實(shí)驗(yàn)步驟如下:首先將50μg/ml人pd-l1蛋白通過氨基偶聯(lián)的方法偶聯(lián)到cm5芯片表面;然后將不同濃度的seqidno:1所示多肽(125nm,62.5nm,31.25nm,15.60nm,0nm)分別與100nm的人pd-1蛋白在冰上孵育15min,隨運(yùn)行緩沖溶液(10mm磷酸鹽緩沖液,2.7mmkcl,137mmnacl和0.05%表面活性劑p20,ph7.4)流經(jīng)芯片表面,流速為30μl/min,結(jié)合時(shí)間為90s,解離時(shí)間為120s;最后用biaevaluation2.0軟件分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4所示,隨著多肽濃度的升高,溶液中未結(jié)合的pd-1蛋白濃度逐漸下降,從而使得pd-1與pd-l1的結(jié)合減弱,響應(yīng)值隨之下降。spr實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4所示,該結(jié)果表明seqidno:1所示多肽能夠阻斷人pd-1與pd-l1的結(jié)合。
討論:本發(fā)明提供了靶向人pd-1蛋白,即,能夠競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合人pd-1蛋白的多肽,各多肽在特定的位置具有特定的氨基酸殘基,從而能夠具備相似的結(jié)構(gòu)。這些多肽均能與人pd-1蛋白發(fā)生良好的結(jié)合,其中,seqidno:1所示多肽與人pd-1蛋白的結(jié)合親和力最高,其kd值為1.38μm與pd-l1和pd-1的結(jié)合kd值相當(dāng)。因此,這些多肽能作為pd-1/pd-l1結(jié)合的抑制劑或調(diào)節(jié)pd-1/pd-l1結(jié)合程度的調(diào)節(jié)劑,以及為研究pd-1/pd-l1免疫檢查點(diǎn)阻斷劑和設(shè)計(jì)、開發(fā)阻斷pd-1/pd-l1通路提供了多肽類先導(dǎo)藥物。
在本發(fā)明提及的所有文獻(xiàn)都在本申請(qǐng)中引用作為參考,就如同每一篇文獻(xiàn)被單獨(dú)引用作為參考那樣。此外應(yīng)理解,在閱讀了本發(fā)明的上述講授內(nèi)容之后,本領(lǐng)域技術(shù)人員可以對(duì)本發(fā)明作各種改動(dòng)或修改,這些等價(jià)形式同樣落于本申請(qǐng)所附權(quán)利要求書所限定的范圍。