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一種難耐藥的天然抗菌蛋白的氨基酸序列的制作方法

文檔序號:11803089閱讀:1006來源:國知局
本發(fā)明涉及一種難耐藥的天然抗菌蛋白的氨基酸序列,屬于基因
技術(shù)領(lǐng)域
。
背景技術(shù)
:在當前的醫(yī)療,農(nóng)業(yè),水生生物以及動物養(yǎng)殖業(yè),細菌性疾病的防治是一個繞不開的過程。一方面,傳統(tǒng)抗生素可以被用作生物飼料添加劑,實現(xiàn)提高產(chǎn)能,降低飼養(yǎng)成本,提高經(jīng)濟效益的目的。另一方面,在臨床上,醫(yī)院或門診的抗細菌感染治療普遍依賴于傳統(tǒng)抗生素,這類傳統(tǒng)的抗生素(尤其是廣譜抗生素)可以實現(xiàn)及時地抗細菌感染治療,有效避免病情因拖延而惡化,尤其是對于目前尚無法迅速實現(xiàn)準確而特異的臨床診斷的受細菌感染的病人。在當前的醫(yī)療,農(nóng)業(yè),水生生物以及動物養(yǎng)殖業(yè),傳統(tǒng)抗生素的實際應(yīng)用存在一個兩難。一方面,為了細菌性疾病的防治,抗生素的使用是一個繞不開的過程。另一方面,從進化的角度看,傳統(tǒng)抗生素的濫用會加速耐藥細菌株的出現(xiàn),以至于傳統(tǒng)抗生素對該菌株不再有效。技術(shù)實現(xiàn)要素:本發(fā)明的目的在于提供一種難耐藥的天然抗菌蛋白,以便更好地克服上述不足,改善使用效果。為了實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明的技術(shù)方案如下。一種難耐藥的天然抗菌蛋白的氨基酸序列,用單個字母表示氨基酸,該蛋白的氨基酸序列為:RSALSCQMCELVVKKYEGSADKDANVIKKDFDAECKKLFHTIPFGTRECDHYVNSKVDPIIHELEGGTAPKDVCTKLNECP。用單個字母表示脫氧核糖核酸,編碼該抗菌蛋白的基因的DNA序列為:AGAAGCGCATTGAGCTGTCAAATGTGTGAGTTGGTTGTCAAGAAATACGAAGGATCCGCCGATAAGGATGCCAATGTCATCAAGAAGGATTTCGATGCTGAATGCAAGAAGCTTTTCCACACCATCCCATTCGGAACCAGAGAATGCGATCATTACGTCAACAGCAAGGTAGACCCAATCATTCACGAGCTGGAAGGAGGAACCGCTCCAAAGGATGTGTGCACCAAGCTTAACGAATGCCCATAA。隨著基礎(chǔ)與臨床研究的深入,抗菌蛋白被認為最具有臨床應(yīng)用前景的傳統(tǒng)抗生素代替品,其主要原因在于其難耐藥性(目前為止尚無對抗菌蛋白耐藥菌株出現(xiàn)的報道)和對原核生物/真核生物細胞膜的選擇性滲透性溶解功能,該類抗菌蛋白對病原菌的細胞膜具有滲透性溶解功能,對動物(包括人類)的細胞膜不具有滲透性溶解功能,即不破壞動物(包括人類)機體自身的生命單元。有鑒于抗菌蛋白相對于傳統(tǒng)抗生素在難耐藥方面的優(yōu)勢,本發(fā)明致力于提出一種難耐藥的天然抗菌蛋白,該抗菌蛋白的表達最初在秀麗線蟲的腸道內(nèi)被發(fā)現(xiàn),秀麗線蟲生存于土壤環(huán)境中,是一種壽命很短的長約1毫米的小蟲,被土壤中的微生物(包括細菌)等包圍,同時也以此為食物,后續(xù)研究表明該抗菌蛋白對秀麗線蟲構(gòu)成一種非常重要的抗細菌感染機制,對于秀麗線蟲在腸道內(nèi)順利消化土壤中的細菌(也即是它的食物)而不受到細菌對秀麗線蟲本身器官的感染具有重要作用。此外,該抗菌蛋白對病原菌的細胞膜具有滲透性溶解功能,從而造成細胞內(nèi)器官與內(nèi)容物的致命性擴散,造成細菌解體死亡,同時該抗菌蛋白對動物(包括人類)的細胞膜不具有滲透性溶解功能,即不破壞動物(包括人類)機體自身的生命單元。這樣一種特異的抗菌機制使得細菌很難(也許根本不可能)產(chǎn)生對該抗菌蛋白耐藥的進化行為。從進化史角度看,秀麗線蟲是比人類更古老的生物,而該抗菌蛋白被秀麗線蟲采用至今依舊有效地執(zhí)行其為秀麗線蟲抗細菌感染的功能。因此,本著師法自然的原則,本專利提出該抗菌蛋白的專利申請,以為替代傳統(tǒng)抗生素提供一種現(xiàn)實的可能性。鑒于當前基因工程生產(chǎn)重組蛋白的相關(guān)技術(shù)以及外包市場均已成熟,該抗菌蛋白生產(chǎn)制備方法采用常規(guī)技術(shù)進行。一種難耐藥的天然抗菌蛋白的氨基酸序列,直接利用基于該蛋白的生物制劑治療細菌感染,也可以通過基因重組技術(shù)編碼該蛋白的所有DNA片段,間接利用該蛋白相關(guān)的基因技術(shù)靶向精準治療細菌感染。該發(fā)明的有益效果在于:本發(fā)明提出的抗菌蛋白可以避免細菌/病原菌產(chǎn)生耐藥性為前提,在多領(lǐng)域應(yīng)用于細菌性疾病的防治,包括醫(yī)療,農(nóng)業(yè),水生生物以及動物養(yǎng)殖業(yè)。具體實施方式下面結(jié)合實施例對本發(fā)明的具體實施方式進行描述,以便更好的理解本發(fā)明。實施例本實施例中的難耐藥的天然抗菌蛋白的氨基酸序列,用單個字母表示氨基酸,該蛋白的氨基酸序列為:RSALSCQMCELVVKKYEGSADKDANVIKKDFDAECKKLFHTIPFGTRECDHYVNSKVDPIIHELEGGTAPKDVCTKLNECP。用單個字母表示脫氧核糖核酸,編碼該抗菌蛋白的基因的DNA序列為:AGAAGCGCATTGAGCTGTCAAATGTGTGAGTTGGTTGTCAAGAAATACGAAGGATCCGCCGATAAGGATGCCAATGTCATCAAGAAGGATTTCGATGCTGAATGCAAGAAGCTTTTCCACACCATCCCATTCGGAACCAGAGAATGCGATCATTACGTCAACAGCAAGGTAGACCCAATCATTCACGAGCTGGAAGGAGGAACCGCTCCAAAGGATGTGTGCACCAAGCTTAACGAATGCCCATAA。本發(fā)明中的難耐藥的天然抗菌蛋白的氨基酸序列,直接利用基于該蛋白的生物制劑治療細菌感染,也可以通過基因重組技術(shù)編碼該蛋白的所有DNA片段,間接利用該蛋白相關(guān)的基因技術(shù)靶向精準治療細菌感染。由于DNA與氨基酸之間并非一一對應(yīng)(對應(yīng)關(guān)系見表1),不同的DNA序列可以編碼同樣的蛋白分子。表1:氨基酸代碼編碼對應(yīng)氨基酸的脫氧核糖核酸代碼組合AGCT,GCC,GCA,GCGLTTA,TTG,CTT,CTC,CTA,CTGRCGT,CGC,CGA,CGG,AGA,AGGKAAA,AAGNAAT,AACMATGDGAT,GACFTTT,TTCCTGT,TGCPCCT,CCC,CCA,CCGQCAA,CAGSTCT,TCC,TCA,TCG,AGT,AGCEGAA,GAGTACT,ACC,ACA,ACGGGGT,GGC,GGA,GGGWTGGHCAT,CACYTAT,TACIATT,ATC,ATAVGTT,GTC,GTA,GTG理論上共有9094700285584521228370927550271062016種不同的DNA序列可以編碼與本專利提出的抗菌蛋白同樣的抗菌蛋白分子,該數(shù)字由附件中的Python腳本運行得出。任何一個氨基酸序列,通過常規(guī)的蛋白質(zhì)或者DNA序列比對軟件或者在線的序列比對工具進行序列比對之后,只要它與源序列的序列同源度高于75%,或者它與源序列之間互相匹配的氨基酸的個數(shù)大于60,則該氨基酸序列以及編碼他們的所有DNA序列同樣得到發(fā)明專利保護。當前第1頁1 2 3 
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