本發(fā)明涉及分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,具體涉及一種結(jié)直腸癌遺傳性易感基因篩查試劑盒。
背景技術(shù):
結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC),也稱為大腸癌,為結(jié)腸癌和直腸癌的總稱,指大腸粘膜上皮在環(huán)境或遺傳等多種致癌因素作用下發(fā)生的癌變,是常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,其死亡率較高。全球范圍而言,結(jié)直腸癌是常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率和死亡率在消化道的惡性腫瘤中僅次于胃癌,在所有惡性腫瘤中排名第四。結(jié)直腸癌容易被誤診,早期出現(xiàn)的大便次數(shù)增多、大便有粘液和膿血時(shí),易誤診為痢疾、腸炎或痔瘡等疾病,因而失去了早期 治療的機(jī)會(huì)。
結(jié)直腸癌易感基因?yàn)槌醪窖芯靠赡芘c結(jié)直腸癌有關(guān)聯(lián)的基因,其中各易感基因的關(guān)聯(lián)度有高有低。目前,采用檢測(cè)結(jié)直腸癌易感基因的常見(jiàn)方法是Sanger測(cè)序法,該方法只能對(duì)一個(gè)樣品的某一段區(qū)域進(jìn)行測(cè)序,檢測(cè)效率低,成本高。
基于此,研究并開(kāi)發(fā)設(shè)計(jì)一種結(jié)直腸癌遺傳性易感基因篩查試劑盒。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提供一種結(jié)直腸癌遺傳性易感基因篩查試劑盒,檢測(cè)效率高,檢測(cè)成本低。
本發(fā)明的通過(guò)下述技術(shù)方案實(shí)現(xiàn):
一種結(jié)直腸癌遺傳性易感基因篩查試劑盒,包括用于對(duì)待側(cè)樣品中的對(duì)多個(gè)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增的結(jié)直腸癌易感基因特異性引物,所述結(jié)腸癌易感基因包括rs10795668、MMP2、SMAD7、ADH2、ALDH2、CYP1A2、MMP-1、MTHFR、TP53、VEGF、COX-2、DNMT3B、hMLH1、LOC727677、MMP9、MTRR和TGF-β1中的至少一個(gè)。
優(yōu)選,所述每個(gè)目標(biāo)區(qū)域?qū)?yīng)的特異性引物中,至少有一條引物與目標(biāo)區(qū)域部分互補(bǔ),且該引物的C端帶有第二標(biāo)簽序列,用于在擴(kuò)增目標(biāo)區(qū)域中,對(duì)不同待側(cè)樣品的目標(biāo)區(qū)域擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記。
優(yōu)選,所述試劑盒還包括用于與擴(kuò)增產(chǎn)物結(jié)合構(gòu)件測(cè)序文庫(kù)的接頭部。
優(yōu)選,所述接頭部采用分叉接頭。
優(yōu)選,所述分叉接頭包含第一標(biāo)簽序列,用于對(duì)不同待測(cè)樣品的測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行標(biāo)記。
本發(fā)明與現(xiàn)有技術(shù)相比,具有如下的優(yōu)點(diǎn)和有益效果:
本發(fā)明試劑盒能同時(shí)對(duì)結(jié)直腸癌易感基因的多個(gè)區(qū)域進(jìn)行同時(shí)檢測(cè),提高檢測(cè)效率,且降低檢測(cè)成本,檢測(cè)的準(zhǔn)確性和靈敏度高。
具體實(shí)施方式
為使本發(fā)明的目的、技術(shù)方案和優(yōu)點(diǎn)更加清楚明白,下面結(jié)合實(shí)施例,對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步的詳細(xì)說(shuō)明,本發(fā)明的示意性實(shí)施方式及其說(shuō)明僅用于解釋本發(fā)明,并不作為對(duì)本發(fā)明的限定。
實(shí)施例1:
一種結(jié)直腸癌遺傳性易感基因篩查試劑盒,操作方法,包括以下步驟,
1)利用結(jié)直腸癌易感基因特異性引物,對(duì)待測(cè)樣品中的多個(gè)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增,并基于擴(kuò)增產(chǎn)物構(gòu)件測(cè)序文庫(kù);
2)對(duì)測(cè)序文庫(kù)進(jìn)行單分子擴(kuò)增,得到與多個(gè)目標(biāo)區(qū)域?qū)?yīng)的單分子擴(kuò)增產(chǎn)物;
3)同時(shí)對(duì)多個(gè)單分子擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行高通量基因測(cè)序,得到所述多個(gè)目標(biāo)區(qū)域的序列信息。
其中,目標(biāo)區(qū)域?yàn)榻Y(jié)直腸癌易感基因的任意序列,可根據(jù)需要進(jìn)行選擇,包括基因的內(nèi)部序列,基因的外部調(diào)控區(qū)域,其中基因的內(nèi)部序列包括結(jié)直腸癌易感基因的內(nèi)含子區(qū)域、外顯子區(qū)域,含有內(nèi)含子的外顯子區(qū)域。
本實(shí)施例1中采用高通量測(cè)序方法對(duì)結(jié)直腸癌易感基因的多個(gè)區(qū)域同時(shí)進(jìn)行區(qū)域掃描,能夠同時(shí)提高檢測(cè)效率,降低檢測(cè)成本;同時(shí)利用高通量基因測(cè)序方法與傳統(tǒng)檢測(cè)方法不同,可有效提高檢測(cè)的準(zhǔn)確性和靈敏度。
以上使用結(jié)直腸癌遺傳性易感基因篩查試劑盒獲得的結(jié)直腸癌易感基因序列信息,可以結(jié)合分子生物學(xué)試驗(yàn)、臨床試驗(yàn)、臨床觀察及綜合數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)分析,建立結(jié)直腸癌疾病模型,實(shí)現(xiàn)早期評(píng)估結(jié)直腸癌的易感性。
以上所述的具體實(shí)施方式,對(duì)本發(fā)明的目的、技術(shù)方案和有益效果進(jìn)行了進(jìn)一步詳細(xì)說(shuō)明,所應(yīng)理解的是,以上所述僅為本發(fā)明的具體實(shí)施方式而已,并不用于限定本發(fā)明的保護(hù)范圍,凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi),所做的任何修改、等同替換、改進(jìn)等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。