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蛋白質(zhì)及其編碼基因在調(diào)控植物抗黃萎病性中的應(yīng)用的制作方法

文檔序號:11124289閱讀:930來源:國知局
本發(fā)明涉及生物
技術(shù)領(lǐng)域
,具體涉及蛋白質(zhì)及其編碼基因在調(diào)控植物抗黃萎病性中的應(yīng)用。
背景技術(shù)
:黃萎病是目前危害棉花生產(chǎn)的重要病害之一,被稱為棉花的“癌癥”,遍布世界各產(chǎn)棉區(qū),其病原為大麗輪枝菌。棉花黃萎病是一種土傳、沿維管束系統(tǒng)侵染的真菌性病害,嚴(yán)重危害棉花生長發(fā)育,導(dǎo)致棉花纖維的產(chǎn)量和品質(zhì)大大降低,給棉花生產(chǎn)造成巨大經(jīng)濟(jì)損失,嚴(yán)重影響棉花產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。棉花是世界性的重要纖維作物,同時(shí)也是一種重要的油料與生物能源作物,在國民經(jīng)濟(jì)和社會發(fā)展中占有重要地位。但是我國的基本國情是人多地少,糧棉爭地矛盾非常突出,因此,培育抗病的棉花新品種對于棉花生產(chǎn)至關(guān)重要。僅靠單一的常規(guī)傳統(tǒng)育種方法由于缺乏有效抗源等問題,很難達(dá)到理想效果。因此,分離控制棉花發(fā)育和/或提高棉花抗病性的相關(guān)基因,有助于加快通過分子育種手段培育新的優(yōu)質(zhì)棉花品種。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題是如何提高植物的抗黃萎病性。為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明首先提供了一種蛋白質(zhì)。本發(fā)明所提供的蛋白質(zhì),自N末端至C末端依次包括N端元件和C端元件;所述N端元件的氨基酸序列如序列表中序列2自N末端起第1至158位所示;所述C端元件的氨基酸序列如序列表中序列2自N末端起第166至313位所示。所述蛋白質(zhì),可為如下a1)或a2)或a3)或a4)或a5)或a6):a1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白質(zhì);a2)氨基酸序列是序列表中序列4所示的蛋白質(zhì);a3)氨基酸序列是序列表中序列6所示的蛋白質(zhì);a4)氨基酸序列是序列表中序列8所示的蛋白質(zhì);a5)在a1)或a2)或a3)或a4)所示的蛋白質(zhì)的N端或/和C端連接標(biāo)簽得到的融合蛋白質(zhì);a6)將a1)或a2)或a3)或a4)所示的蛋白質(zhì)經(jīng)過一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加得到的與植物抗病性和/或發(fā)育性狀相關(guān)的蛋白質(zhì);所述發(fā)育性狀為株型和/或葉柄長度和/或株高和/或器官大小。其中,序列表中序列2可由313個(gè)氨基酸殘基組成。序列表中序列4可由306個(gè)氨基酸殘基組成。序列表中序列6可由312個(gè)氨基酸殘基組成。序列表中序列8可由313個(gè)氨基酸殘基組成。為了使a1)中的蛋白質(zhì)便于純化,可在序列表中序列2所示的蛋白質(zhì)的氨基末端或羧基末端連接上如表1所示的標(biāo)簽。為了使a2)中的蛋白質(zhì)便于純化,可在序列表中序列4所示的蛋白質(zhì)的氨基末端或羧基末端連接上如表1所示的標(biāo)簽。為了使a3)中的蛋白質(zhì)便于純化,可在序列表中序列6所示的蛋白質(zhì)的氨基末端或羧基末端連接上如表1所示的標(biāo)簽。為了使a4)中的蛋白質(zhì)便于純化,可在序列表中序列8所示的蛋白質(zhì)的氨基末端或羧基末端連接上如表1所示的標(biāo)簽。表1標(biāo)簽的序列標(biāo)簽殘基序列Poly-Arg5-6(通常為5個(gè))RRRRRFLAG8DYKDDDDKStrep-tagII8WSHPQFEKc-myc10EQKLISEEDL上述a6)中的蛋白質(zhì),所述一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加為不超過10個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加。上述a6)中的蛋白質(zhì)可人工合成,也可先合成其編碼基因,再進(jìn)行生物表達(dá)得到。上述a6)中的蛋白質(zhì)的編碼基因可通過將序列表中序列1、序列表中序列3、序列表中序列5或序列表中序列7所示的DNA序列中缺失一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的密碼子,和/或進(jìn)行一個(gè)或幾個(gè)堿基對的錯(cuò)義突變,和/或在其5′端和/或3′端連上表1所示的標(biāo)簽的編碼序列得到。所述植物可為如下c1)至c8)中的任一種:c1)雙子葉植物;c2)單子葉植物;c3)棉花;c4)棉花品種陸地棉TM-1;c5)棉花品種徐州142;c6)十字花科植物;c7)擬南芥;c8)擬南芥bri1-5。所述抗病性可為抗黃萎病。所述抗病性可為抗黃萎病菌引起的病害。所述黃萎病菌具體可為黃萎病強(qiáng)致病菌臨西2-1。編碼所述蛋白質(zhì)的核酸分子也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。編碼所述蛋白質(zhì)的核酸分子,具體可為如下(b1)或(b2)或(b3)或(b4)或(b5)或(b6)所示的DNA分子:(b1)核苷酸序列是序列表中序列1或序列表中序列1自5’末端起第1至939位所示的DNA分子;(b2)核苷酸序列是序列表中序列3所示的DNA分子;(b3)核苷酸序列是序列表中序列5所示的DNA分子;(b4)核苷酸序列是序列表中序列7所示的DNA分子;(b5)與(b1)或(b2)或(b3)或(b4)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性,且編碼所述蛋白質(zhì)的DNA分子;(b6)在嚴(yán)格條件下與(b1)或(b2)或(b3)或(b4)限定的核苷酸序列雜交,且編碼所述蛋白質(zhì)的DNA分子。其中,所述核酸分子可以是DNA,如cDNA、基因組DNA或重組DNA;所述核酸分子也可以是RNA,如mRNA或hnRNA等。序列表中序列1由942個(gè)核苷酸組成,序列表中序列1的核苷酸編碼序列表中序列2所示的氨基酸序列。序列表中序列3由918個(gè)核苷酸組成,序列表中序列3的核苷酸編碼序列表中序列4所示的氨基酸序列。序列表中序列5由936個(gè)核苷酸組成,序列表中序列5的核苷酸編碼序列表中序列6所示的氨基酸序列。序列表中序列7由939個(gè)核苷酸組成,序列表中序列7的核苷酸編碼序列表中序列8所示的氨基酸序列。本領(lǐng)域普通技術(shù)人員可以很容易地采用已知的方法,例如定向進(jìn)化和點(diǎn)突變的方法,對本發(fā)明的編碼所述蛋白質(zhì)的核苷酸序列進(jìn)行突變。那些經(jīng)過人工修飾的,具有與本發(fā)明分離得到的所述蛋白質(zhì)的核苷酸序列75%或者更高同一性的核苷酸,只要編碼所述蛋白質(zhì),均是衍生于本發(fā)明的核苷酸序列并且等同于本發(fā)明的序列。這里使用的術(shù)語“同一性”指與天然核酸序列的序列相似性?!巴恍浴卑ㄅc本發(fā)明的編碼序列表的序列2、序列表的序列4、序列表的序列6或序列表的序列8所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì)的核苷酸序列具有75%或更高,或80%或更高,或85%或更高,或90%或更高,或95%或更高同一性的核苷酸序列。同一性可以用肉眼或計(jì)算機(jī)軟件進(jìn)行評價(jià)。使用計(jì)算機(jī)軟件,兩個(gè)或多個(gè)序列之間的同一性可以用百分比(%)表示,其可以用來評價(jià)相關(guān)序列之間的同一性。含有所述核酸分子的表達(dá)盒、重組載體、重組微生物或轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍。所述重組載體為向載體插入所述核酸分子得到的重組質(zhì)粒。所述載體具體可為載體pENTR/SD/D-TOPO或載體pMDC83。所述重組載體具體可為重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1。所述重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1可為向載體pENTR/SD/D-TOPO插入序列表中序列1所示的DNA分子。所述重組載體具體可為重組質(zhì)粒35S::GhBZR1-GFP。所述重組質(zhì)粒35S::GhBZR1-GFP中含有序列表中序列1自5'末端起第1至939位所示的DNA分子,表達(dá)序列表中序列2所示的蛋白質(zhì)。所述重組載體具體可為重組質(zhì)粒pGW-△GhBZR1或重組質(zhì)粒35S::△GhBZR1-GFP。所述重組質(zhì)粒pGW-△GhBZR1或重組質(zhì)粒35S::△GhBZR1-GFP中均含有序列表中序列3所示的DNA分子,表達(dá)序列表中序列4所示的蛋白質(zhì)。所述重組載體具體可為重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160或重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160-GFP。所述重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160或重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160-GFP中均含有序列表中序列5所示的DNA分子,表達(dá)序列表中序列6所示的蛋白質(zhì)。所述重組載體具體可為重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G或重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G-GFP。所述重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G或重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G-GFP中含有序列表中序列7所示的DNA分子,表達(dá)序列表中序列8所示的蛋白質(zhì)。所述重組微生物為將所述重組載體導(dǎo)入出發(fā)微生物得到的重組菌。所述重組微生物具體可為將所述重組質(zhì)粒35S::GhBZR1-GFP、所述重組質(zhì)粒35S::△GhBZR1-GFP、所述重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160-GFP或所述重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G-GFP導(dǎo)入出發(fā)微生物得到的重組菌。所述出發(fā)微生物可為根癌農(nóng)桿菌。所述根癌農(nóng)桿菌具體可為根癌農(nóng)桿菌GV3101。所述轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系均不包括繁殖材料。d1)或d2)的應(yīng)用也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍:d1)所述蛋白質(zhì),或,所述核酸分子,或,含有所述核酸分子的表達(dá)盒、重組載體、重組微生物或轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系,在調(diào)控植物抗病性中的應(yīng)用;d2)所述蛋白質(zhì),或,所述核酸分子,或,含有所述核酸分子的表達(dá)盒、重組載體、重組微生物或轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系,在培育發(fā)育性狀改變的轉(zhuǎn)基因植物中的應(yīng)用;所述發(fā)育性狀為株型和/或葉柄長度和/或株高和/或器官大小。上述應(yīng)用中,所述植物可為如下c1)至c8)中的任一種:c1)雙子葉植物;c2)單子葉植物;c3)棉花;c4)棉花品種陸地棉TM-1;c5)棉花品種徐州142;c6)十字花科植物;c7)擬南芥;c8)擬南芥bri1-5。上述應(yīng)用中,所述抗病性可為抗黃萎病。上述應(yīng)用中,所述抗病性可為抗黃萎病菌引起的病害。所述黃萎病菌具體可為黃萎病強(qiáng)致病菌臨西2-1。為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明還提供了培育轉(zhuǎn)基因植物的方法。本發(fā)明所提供的培育轉(zhuǎn)基因植物的方法,具體可為方法一,包括在受體植物中過表達(dá)所述蛋白質(zhì),得到轉(zhuǎn)基因植物的步驟;與所述受體植物相比,所述轉(zhuǎn)基因植物具有如下表型:抗病性增加和/或葉柄長度增加和/或株高增加。本發(fā)明所提供的培育轉(zhuǎn)基因植物的方法,具體可為方法二,包括向受體植物中導(dǎo)入抑制所述蛋白質(zhì)表達(dá)的物質(zhì),得到轉(zhuǎn)基因植物的步驟;與所述受體植物相比,所述轉(zhuǎn)基因植物具有如下表型:抗病性降低和/或株高減少和/或第一節(jié)間距減小和/或第四節(jié)間距減小和/或第五節(jié)間距減小和/或株型緊湊和/或第一果枝夾角減小和/或第二果枝夾角減小和/或第三果枝夾角減小和/或葉柄長度減少和/或棉纖維長度減少。所述株高減少具體體現(xiàn)在主莖的第一節(jié)間距、第四節(jié)間距和五節(jié)間距的減小。所述株型緊湊具體體現(xiàn)在主莖的第一果枝夾角、第二果枝夾角和三果枝夾角減小。上述方法中,編碼所述蛋白質(zhì)的核酸分子,具體可為如下(b1)或(b2)或(b3)或(b4)或(b5)或(b6)所示的DNA分子:(b1)核苷酸序列是序列表中序列1或序列表中序列1自5’末端起第1至939位所示的DNA分子;(b2)核苷酸序列是序列表中序列3所示的DNA分子;(b3)核苷酸序列是序列表中序列5所示的DNA分子;(b4)核苷酸序列是序列表中序列7所示的DNA分子;(b5)與(b1)或(b2)或(b3)或(b4)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性,且編碼所述蛋白質(zhì)的DNA分子;(b6)在嚴(yán)格條件下與(b1)或(b2)或(b3)或(b4)限定的核苷酸序列雜交,且編碼所述蛋白質(zhì)的DNA分子。其中,所述核酸分子可以是DNA,如cDNA、基因組DNA或重組DNA;所述核酸分子也可以是RNA,如mRNA或hnRNA等。序列表中序列1由942個(gè)核苷酸組成,序列表中序列1的核苷酸編碼序列表中序列2所示的氨基酸序列。序列表中序列3由918個(gè)核苷酸組成,序列表中序列3的核苷酸編碼序列表中序列4所示的氨基酸序列。序列表中序列5由936個(gè)核苷酸組成,序列表中序列5的核苷酸編碼序列表中序列6所示的氨基酸序列。序列表中序列7由939個(gè)核苷酸組成,序列表中序列7的核苷酸編碼序列表中序列8所示的氨基酸序列。上述方法一中,所述“在受體植物中過表達(dá)所述蛋白質(zhì)”可通過向受體植物中導(dǎo)入編碼所述蛋白質(zhì)的核酸分子實(shí)現(xiàn)。所述“向受體植物中導(dǎo)入編碼所述蛋白質(zhì)的核酸分子”可通過向受體植物中導(dǎo)入重組載體甲實(shí)現(xiàn);所述重組載體甲可為向載體插入編碼所述蛋白質(zhì)的核酸分子得到的重組質(zhì)粒。所述重組載體甲具體可為重組質(zhì)粒35S::GhBZR1-GFP。所述重組質(zhì)粒35S::GhBZR1-GFP中含有序列表中序列1自5'末端起第1至939位所示的DNA分子,表達(dá)序列表中序列2所示的蛋白質(zhì)。上述方法二中,所述“抑制所述蛋白質(zhì)表達(dá)的物質(zhì)”可為抑制編碼所述蛋白質(zhì)的核酸分子的表達(dá)的物質(zhì)。所述“抑制編碼所述蛋白質(zhì)的核酸分子的表達(dá)的物質(zhì)”可通過向受體植物中導(dǎo)入重組質(zhì)粒PTRV2-GhBZR1和載體PTRV1實(shí)現(xiàn)。所述重組質(zhì)粒PTRV2-GhBZR1具體可為向載體PTRV2的限制性內(nèi)切酶PstⅠ的識別序列間插入序列表中序列1自5'末端起第231至531位所示的DNA分子。上述方法中,所述受體植物可為如下c1)至c8)中的任一種:c1)雙子葉植物;c2)單子葉植物;c3)棉花;c4)棉花品種陸地棉TM-1;c5)棉花品種徐州142;c6)十字花科植物;c7)擬南芥;c8)擬南芥bri1-5。上述方法中,所述抗病性可為抗黃萎病。上述方法中,所述抗病性可為抗黃萎病菌引起的病害。所述黃萎病菌具體可為黃萎病強(qiáng)致病菌臨西2-1。上文中,所述轉(zhuǎn)基因植物理解為不僅包含將所述核酸分子轉(zhuǎn)化受體植物得到的第一代轉(zhuǎn)基因植物,也包括其子代。對于轉(zhuǎn)基因植物,可以在該物種中繁殖所述核酸分子,也可用常規(guī)育種技術(shù)將所述核酸分子轉(zhuǎn)移進(jìn)入相同物種的其它品種,特別包括商業(yè)品種中。所述轉(zhuǎn)基因植物包括種子、愈傷組織、完整植株和細(xì)胞。實(shí)驗(yàn)證明,利用本發(fā)明提供的蛋白質(zhì)及其編碼基因能調(diào)控植物抗黃萎病性和發(fā)育性狀(如株型和/或葉柄長度和/或株高和/或器官大小):向擬南芥中導(dǎo)入蛋白質(zhì)的編碼基因,得到葉柄長度增加和抗黃萎病性增加的轉(zhuǎn)基因植物;向徐州142或陸地棉TM-1中導(dǎo)入抑制所述蛋白質(zhì)表達(dá)的物質(zhì),得到株高減少、株型緊湊、棉纖維長度減少和抗黃萎病性降低的轉(zhuǎn)基因植物。因此,本發(fā)明提供的蛋白質(zhì)對培育抗黃萎病的植物具有重要的理論意義和實(shí)用價(jià)值。附圖說明圖1為實(shí)施例2步驟三中2的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。圖2為實(shí)施例2步驟三中3的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。圖3為實(shí)施例3步驟三中1的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。圖4為實(shí)施例3步驟三中2的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。圖5為實(shí)施例3步驟三中3的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。具體實(shí)施方式下面結(jié)合具體實(shí)施方式對本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步的詳細(xì)描述,給出的實(shí)施例僅為了闡明本發(fā)明,而不是為了限制本發(fā)明的范圍。下述實(shí)施例中的實(shí)驗(yàn)方法,如無特殊說明,均為常規(guī)方法。下述實(shí)施例中所用的材料、試劑等,如無特殊說明,均可從商業(yè)途徑得到。以下實(shí)施例中的定量試驗(yàn),均設(shè)置三次重復(fù)實(shí)驗(yàn),結(jié)果取平均值。擬南芥bri1-5記載于如下文獻(xiàn)中:XueluWang,XiaoqingLi,Ji11Mwisenhelder,TonyHunter,ShigeoYoshida,TadaoAsami,andJoanneChory.AutoregulationandHomodimerizationAreInvolvedintheActivationofthePlantSteroidReceptorBRI1.Deve1opmentCe11,2005年第8期855-865.公眾可以從中國科學(xué)院植物研究所(即申請人處)獲得,以重復(fù)本申請實(shí)驗(yàn)。在下文中,擬南芥bri1-5簡稱bri1-5。陸地棉TM-1記載于如下文獻(xiàn)中:TronlinderNLetal,1989,PlantCellRep8:133-136.。徐州142記載于如下文獻(xiàn)中:于曉紅等,2000,中國科學(xué)(C輯),30(5):517-522。陸地棉TM-1和徐州142均為國家棉花種質(zhì)資源中期庫的產(chǎn)品。在下文中,陸地棉TM-1簡稱為TM-1,徐州142簡稱為Xu-142。根癌農(nóng)桿菌GV3101記載于如下文獻(xiàn)中:鄭銀英,崔百明,常明進(jìn),彭明.轉(zhuǎn)擬南芥ICE1基因增強(qiáng)煙草抗寒性的研究.西北植物學(xué)報(bào).2009年29卷1期.75-79.公眾可以從中國科學(xué)院植物研究所(即申請人處)獲得,以重復(fù)本申請實(shí)驗(yàn)。載體PTRV1和載體PTRV2均記載于如下文獻(xiàn)中:DongY,Burch-SmithTM,LiuY,MamillapalliP,Dinesh-KumarSP.Aligation-independentcloningtobaccorattlevirusvectorforhigh-throughputvirus-inducedgenesilencingidentifiesrolesforNbMADS4-1and-2infloraldevelopment.Plantphysiol.2007年145期.1161-1170.公眾可以從中國科學(xué)院植物研究所(即申請人處)獲得,以重復(fù)本申請實(shí)驗(yàn)。載體pENTR/SD/D-TOPO和載體pMDC83均為Invitrogen公司產(chǎn)品。PDA培養(yǎng)基:去皮的馬鈴薯200g切成小塊,加入1L蒸餾水煮沸30分鐘,過濾,向?yàn)V液中加入葡萄糖20g和瓊脂1g,用蒸餾水定容至1L,pH值自然,121℃高壓滅菌15min。查氏液體培養(yǎng)基:將硝酸鈉3g、磷酸氫二鉀1g、MgSO4·7H2O0.5g、氯化鉀0.5g、硫酸亞鐵0.01g、蔗糖30g和瓊脂15g溶于蒸餾水,用蒸餾水定容至1000mL。黃萎病強(qiáng)致病菌臨西2-1記載于如下文獻(xiàn)中:王國寧,趙貴元,岳曉偉,李志坤,張艷,張桂寅,吳立強(qiáng),王省芬,馬峙英,河北省棉花黃萎病菌致病性與ISSR遺傳分化,棉花學(xué)報(bào),2012,24(4):348-357.在下文中,黃萎病強(qiáng)致病菌臨西2-1簡稱為臨西2-1。侵染溶液:含10mMMES、10mMMgCl2和200mM乙酰丁香酮的水溶液。實(shí)施例1、蛋白GhBZR1的編碼基因和GhBZR1突變蛋白的編碼基因的克隆一、蛋白GhBZR1的編碼基因的克隆本發(fā)明的發(fā)明人從陸地棉TM-1中克隆出蛋白GhBZR1的編碼基因,即GhBZR1基因。1、采用Trizo1法提取生長至14天的陸地棉TM-1幼苗的葉片的總RNA,然后利用反轉(zhuǎn)錄酶AMV反轉(zhuǎn)錄出第一鏈cDNA。2、人工合成引物F:5'-CACCATGACGTCAGATGGGGCGACGT-3'和R:5'-ACATCGAGCTTTCCCACTTCCG-3'。3、完成步驟1和2后,以步驟1提取的cDNA為模板,以F和R為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到約940bp的雙鏈DNA分子。4、將雙鏈DNA分子和載體pENTR/SD/D-TOPO進(jìn)行連接,得到重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1。根據(jù)測序結(jié)果,重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1含有序列表中序列1自5'末端起第1至939位所示的DNA分子,表達(dá)序列表中序列2所示的蛋白質(zhì)(以下簡稱蛋白質(zhì)GhBZR1或蛋白GhBZR1)。二、GhBZR1突變蛋白的編碼基因的克隆GhBZR1突變蛋白具體為蛋白△GhBZR1、蛋白GhBZR1△I160和蛋白GhBZR1S163G。1、蛋白△GhBZR1的編碼基因的克隆1)人工合成引物F△GhBZR:5'-TCGTCTCTGCCTCCTCTCGTGACACCACCACTTTCT-3'和R△GhBZR:5'-TCGTCTCTGCCTCCTCTCGTGACACCACCACTTTCT-3'。2)完成步驟1)后,以重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1為模板,以R△GhBZR和步驟一中2合成的F為引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到雙鏈DNA分子1;以重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1為模板,以F△GhBZR和步驟一中2合成的R為引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到雙鏈DNA分子2。3)將雙鏈DNA分子1和雙鏈DNA分子2按照摩爾比1:1混合并以此為模板,以步驟一中2合成的F和R為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到約920bp的雙鏈DNA分子。4)將約920bp的雙鏈DNA分子和載體pENTR/SD/D-TOPO進(jìn)行連接,得到重組質(zhì)粒pGW-△GhBZR1。根據(jù)測序結(jié)果,重組質(zhì)粒pGW-△GhBZR1含有序列表中序列3所示的DNA分子(以下簡稱突變體基因1),表達(dá)序列表中序列4所示的蛋白質(zhì)(以下簡稱突變體蛋白1或蛋白△GhBZR1)。序列表中序列3所示的DNA分子與序列表中序列1自5'末端起第1至939位所示的DNA分子的唯一不同在于將后者的第475至495位核苷酸進(jìn)行了刪除。序列表中序列4所示的蛋白質(zhì)與序列表中序列2所示的蛋白質(zhì)的唯一不同在于將后者的第159至165位的氨基酸殘基進(jìn)行了刪除。2、蛋白GhBZR1△I160的編碼基因的克隆1)人工合成引物F△I160:5'-TCTCTGCCTCCTCTCAGATCTAATAGTGCCCCCGTG-3'和R△I160:5'-CACGGGGGCACTATTAGATCTGAGAGGAGGCAGAGA-3'。2)完成步驟1)后,以重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1為模板,以R△I160和步驟一中2合成的F為引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到雙鏈DNA分子3;以重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1為模板,以F△I160和步驟一中2合成的R為引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到雙鏈DNA分子4。3)將雙鏈DNA分子3和雙鏈DNA分子4按照摩爾比1:1混合并以此為模板,以步驟一中2合成的F和R為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到約940bp的雙鏈DNA分子。4)將約940bp的雙鏈DNA分子和載體pENTR/SD/D-TOPO進(jìn)行連接,得到重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160。根據(jù)測序結(jié)果,重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160含有序列表中序列5所示的DNA分子(以下簡稱突變體基因2),表達(dá)序列表中序列6所示的蛋白質(zhì)(以下簡稱突變體蛋白2或蛋白GhBZR1△I160)。序列表中序列5所示的DNA分子與序列表中序列1自5'末端起第1至939位所示的DNA分子的唯一不同在于將后者的第478至480位核苷酸進(jìn)行了刪除。序列表中序列6所示的蛋白質(zhì)與序列表中序列2所示的蛋白質(zhì)的唯一不同在于將后者的第160位的異亮氨酸殘基進(jìn)行了刪除。3、蛋白GhBZR1S163G的編碼基因的克隆1)人工合成引物FS163G:5'-ATCTCTAATGGTGCCCCCGTG-3'和RS163G:5'-CACGGGGGCACCATTAGAGAT-3'。2)完成步驟1)后,以重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1為模板,以RS163G和步驟一中2合成的F為引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到雙鏈DNA分子5;以重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1為模板,以F163G和步驟一中2合成的R為引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到雙鏈DNA分子6。3)將雙鏈DNA分子5和雙鏈DNA分子6按照摩爾比1:1混合并以此為模板,以步驟一中2合成的F和R為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到約940bp的雙鏈DNA分子。4)將約940bp的雙鏈DNA分子和載體pENTR/SD/D-TOPO進(jìn)行連接,得到重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G。根據(jù)測序結(jié)果,重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G含有序列表中序列7所示的DNA分子(以下簡稱突變體基因3),表達(dá)序列表中序列8所示的蛋白質(zhì)(以下簡稱突變體蛋白3或蛋白GhBZR1S163G)。序列表中序列7所示的DNA分子與序列表中序列1自5'末端起第1至939位所示的DNA分子的唯一不同在于將后者的第487位的A替換為了G。序列表中序列8所示的蛋白質(zhì)與序列表中序列2所示的蛋白質(zhì)的唯一不同在于將后者的第163位的絲氨酸殘基替換為了甘氨酸殘基。實(shí)施例2、轉(zhuǎn)基因擬南芥的獲得及鑒定一、重組載體和重組農(nóng)桿菌的構(gòu)建1、重組質(zhì)粒35S::GhBZR1-GFP和GV3101/35S::GhBZR1-GFP的獲得將實(shí)施例1步驟一構(gòu)建的重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1和載體pMDC83進(jìn)行LR重組反應(yīng),得到LR反應(yīng)產(chǎn)物。將LR反應(yīng)產(chǎn)物加入TOP10感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)化,得到的克隆即為目標(biāo)克隆,該目標(biāo)克隆中的質(zhì)粒為目標(biāo)質(zhì)粒,將該目標(biāo)質(zhì)粒命名為重組質(zhì)粒35S::GhBZR1-GFP。測序結(jié)果表明,重組質(zhì)粒35S::GhBZR1-GFP中含有序列表中序列1自5'末端起第1至939位所示的DNA分子,表達(dá)序列表中序列2所示的蛋白GhBZR1。將重組質(zhì)粒35S::GhBZR1-GFP導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌GV3101,得到重組農(nóng)桿菌,命名為GV3101/35S::GhBZR1-GFP。2、重組質(zhì)粒35S::△GhBZR1-GFP和GV3101/35S::△GhBZR1-GFP的獲得將實(shí)施例1步驟二中1構(gòu)建的重組質(zhì)粒pGW-△GhBZR1和載體pMDC83進(jìn)行LR重組反應(yīng),得到LR反應(yīng)產(chǎn)物。將LR反應(yīng)產(chǎn)物加入TOP10感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)化,得到的克隆即為目標(biāo)克隆,該目標(biāo)克隆中的質(zhì)粒為目標(biāo)質(zhì)粒,將該目標(biāo)質(zhì)粒命名為重組質(zhì)粒35S::△GhBZR1-GFP。測序結(jié)果表明,重組質(zhì)粒35S::△GhBZR1-GFP中含有突變體基因1,表達(dá)突變體蛋白1。將重組質(zhì)粒35S::△GhBZR1-GFP導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌GV3101,得到重組農(nóng)桿菌,命名為GV3101/35S::△GhBZR1-GFP。3、重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160-GFP和GV3101/pGW-GhBZR1△I160-GFP的獲得將實(shí)施例1步驟二構(gòu)建的重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160和載體pMDC83進(jìn)行LR重組反應(yīng),得到LR反應(yīng)產(chǎn)物。將LR反應(yīng)產(chǎn)物加入TOP10感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)化,得到的克隆即為目標(biāo)克隆,該目標(biāo)克隆中的質(zhì)粒為目標(biāo)質(zhì)粒,將該目標(biāo)質(zhì)粒命名為重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160-GFP。測序結(jié)果表明,重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160-GFP中含有突變體基因2,表達(dá)突變體蛋白2。將重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1△I160-GFP導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌GV3101,得到重組農(nóng)桿菌,命名為GV3101/pGW-GhBZR1△I160-GFP。4、重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G-GFP和GV3101/pGW-GhBZR1S163G-GFP的獲得將實(shí)施例1步驟二構(gòu)建的重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G和載體pMDC83進(jìn)行LR重組反應(yīng),得到LR反應(yīng)產(chǎn)物。將LR反應(yīng)產(chǎn)物加入TOP10感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)化,得到的克隆即為目標(biāo)克隆,該目標(biāo)克隆中的質(zhì)粒為目標(biāo)質(zhì)粒,將該目標(biāo)質(zhì)粒命名為重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G-GFP。測序結(jié)果表明,重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G-GFP中含有突變體基因3,表達(dá)突變體蛋白3。將重組質(zhì)粒pGW-GhBZR1S163G-GFP導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌GV3101,得到重組農(nóng)桿菌,命名為GV3101/pGW-GhBZR1S163G-GFP。5、GV3101/pMDC83的獲得將載體pMDC83導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌GV3101,得到重組農(nóng)桿菌,命名為GV3101/pMDC83。二、轉(zhuǎn)基因擬南芥的獲得1、采用擬南芥花序浸花轉(zhuǎn)化法(記載于如下文獻(xiàn)中Clough,S.J.,andBent,A.F..Floraldip:asimplifiedmethodforAgrobacterium-mediatedtransformationofArabidopsisthaliana.PlantJ.(1998)16,735-743.),將步驟一中1獲得的GV3101/35S::GhBZR1-GFP轉(zhuǎn)至擬南芥bri1-5中,獲得T1代轉(zhuǎn)GhBZR1基因擬南芥種子。2、將步驟1獲得的T1代轉(zhuǎn)GhBZR1基因擬南芥種子播種于含有30mg/L的潮霉素的1/2MS培養(yǎng)基上,能夠正常生長的擬南芥(抗性苗)即為T1代轉(zhuǎn)GhBZR1基因陽性苗,T1代轉(zhuǎn)GhBZR1基因陽性苗收到的種子即為T2代轉(zhuǎn)GhBZR1基因擬南芥種子。3、將步驟2篩選出的不同株系的T2代轉(zhuǎn)GhBZR1基因擬南芥種子播種于含有30mg/L的潮霉素的1/2MS培養(yǎng)基上進(jìn)行篩選,如果某株系中能夠正常生長的擬南芥(抗性苗)的數(shù)目與不能夠正常生長的擬南芥(非抗性苗)的數(shù)目比例為3:1,則該株系為GhBZR1基因插入一個(gè)拷貝的株系,該株系中的抗性苗收到的種子即為T3代轉(zhuǎn)GhBZR1基因擬南芥種子。4、將步驟3篩選出的T3代轉(zhuǎn)GhBZR1基因擬南芥種子再次播種于含有30mg/L的潮霉素的1/2MS培養(yǎng)基上進(jìn)行篩選,均為抗性苗的即為T3代純合轉(zhuǎn)GhBZR1基因擬南芥。將其中2個(gè)T3代純合轉(zhuǎn)GhBZR1基因擬南芥株系分別命名為OEGhBZR11-2和OEGhBZR11-4,并進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。按照上述方法,將GV3101/35S::GhBZR1-GFP替換為GV3101/35S::△GhBZR1-GFP,其它步驟均相同,得到T3代純合轉(zhuǎn)突變體基因1擬南芥,將其中2個(gè)T3代純合轉(zhuǎn)突變體基因1擬南芥株系分別命名為OE△GhBZR12-5和OE△GhBZR12-9,并進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。按照上述方法,將GV3101/35S::GhBZR1-GFP替換為GV3101/pGW-GhBZR1△I160-GFP,其它步驟均相同,得到T3代純合轉(zhuǎn)突變體基因2擬南芥,將其中2個(gè)T3代純合轉(zhuǎn)突變體基因2擬南芥株系分別命名為OEGhBZR1△I1603-22和OEGhBZR1△I1603-26,并進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。按照上述方法,將GV3101/35S::GhBZR1-GFP替換為GV3101/pGW-GhBZR1S163G-GFP,其它步驟均相同,得到T3代純合轉(zhuǎn)突變體基因3擬南芥,將其中2個(gè)T3代純合轉(zhuǎn)突變體基因3擬南芥株系分別命名為OEGhBZR1△S163G4-7和OEGhBZR1△S163G4-13,并進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。按照上述方法,將GV3101/35S::GhBZR1-GFP替換為GV3101/pMDC83,其它步驟均相同,得到T3代純合轉(zhuǎn)空載體擬南芥的植株,簡稱轉(zhuǎn)空載體擬南芥。三、轉(zhuǎn)基因擬南芥的鑒定1、分別取OEGhBZR11-2的T3代種子、OEGhBZR11-4的T3代種子、OE△GhBZR12-5的T3代種子、OE△GhBZR12-9的T3代種子、OEGhBZR1△I1603-22的T3代種子、OEGhBZR1△I1603-26的T3代種子、OEGhBZR1△S163G4-7的T3代種子、OEGhBZR1△S163G4-13的T3代種子、轉(zhuǎn)空載體擬南芥的T3代種子和擬南芥bri1-5的種子,種植于營養(yǎng)土中,25℃培養(yǎng)4周,依次得到OEGhBZR11-2的幼苗、OEGhBZR11-4的幼苗、OE△GhBZR12-5的幼苗、OE△GhBZR12-9的幼苗、OEGhBZR1△I1603-22的幼苗、OEGhBZR1△I1603-26的幼苗、OEGhBZR1△S163G4-7的幼苗、OEGhBZR1△S163G4-13的幼苗、轉(zhuǎn)空載體擬南芥的幼苗和擬南芥bri1-5的幼苗。2、轉(zhuǎn)基因擬南芥的表型鑒定(1)觀察步驟1各幼苗的表型。實(shí)驗(yàn)結(jié)果見圖1中A。結(jié)果表明,轉(zhuǎn)空載體擬南芥的幼苗和擬南芥bri1-5的幼苗的表型無顯著差異。與轉(zhuǎn)空載體擬南芥的幼苗相比,OE△GhBZR12-5的幼苗、OE△GhBZR12-9的幼苗、OEGhBZR1△S163G4-7的幼苗和OEGhBZR1△S163G4-13的幼苗的葉柄變長,OEGhBZR1△S163G4-13的幼苗的葉柄最長。(2)Real-TimePCR檢測GhBZR1基因的表達(dá)量實(shí)驗(yàn)重復(fù)三次,每次重復(fù)的步驟如下:①樣本的獲得取步驟1得到的OEGhBZR11-2的幼苗,放入液氮保存,得到樣本1。取步驟1得到的OEGhBZR11-4的幼苗,放入液氮保存,得到樣本2。取步驟1得到的OE△GhBZR12-5的幼苗,放入液氮保存,得到樣本3。取步驟1得到的OE△GhBZR12-9的幼苗,放入液氮保存,得到樣本4。取步驟1得到的OEGhBZR1△I1603-22的幼苗,放入液氮保存,得到樣本5。取步驟1得到的OEGhBZR1△I1603-26的幼苗,放入液氮保存,得到樣本6。取步驟1得到的OEGhBZR1△S163G4-7的幼苗,放入液氮保存,得到樣本7。取步驟1得到的OEGhBZR1△S163G4-13的幼苗,放入液氮保存,得到樣本8。取步驟1得到的擬南芥bri1-5的幼苗,放入液氮保存,得到樣本9。取步驟1得到的轉(zhuǎn)空載體擬南芥的幼苗,放入液氮保存,得到樣本10。②Real-TimePCR檢測GhBZR1基因的表達(dá)量采用Trizo1法提取樣本(樣本1、樣本2、樣本3、樣本4、樣本5、樣本6、樣本7、樣本8、樣本9或樣本10)的總RNA,然后利用反轉(zhuǎn)錄酶AMV反轉(zhuǎn)錄出第一鏈cDNA,將該cDNA作為模板,實(shí)時(shí)定量PCR檢測GhBZR1基因的表達(dá)量。鑒定GhBZR1基因的引物為5’-GAAAGGGATGTAAGCCACCT-3’和5’-GGAAGAGGAGGAAGGACTGA-3’,目的片段如序列表中序列1自5’末端第242至384位所示。將樣本1中GhBZR1基因的表達(dá)量作為1,其它樣本中GhBZR1基因的相對表達(dá)量見圖1中B:樣本2中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為0.8,樣本3中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為0.5,樣本4中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為1.4,樣本5中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為0.6,樣本6中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為0.4,樣本7中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為0.7,樣本8中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為1.6,樣本9中GhBZR1基因的相對表達(dá)量幾乎檢測不到。樣本10和樣本9中GhBZR1基因的表達(dá)量無顯著差異??梢?,步驟(1)中幼苗的葉柄越長,則步驟(2)中相應(yīng)幼苗的GhBZR1基因的相對表達(dá)量越高。3、轉(zhuǎn)基因擬南芥的黃萎病抗性鑒定實(shí)驗(yàn)重復(fù)三次,每個(gè)株系每次種植10株,具體步驟如下:(1)在PDA培養(yǎng)基上接種臨西2-1,25℃活化培養(yǎng)3~4天。(2)完成步驟(1)后,挑選單菌落,接種于查氏液體培養(yǎng)基,25℃、180rpm恒溫振蕩培養(yǎng)3周,得到培養(yǎng)菌液。(3)完成步驟(2)后,取培養(yǎng)菌液,使用紗布過濾收集病原菌孢子,得到孢子菌液,孢子菌液中臨西2-1的濃度為106個(gè)/mL。(4)完成步驟(3)后,取轉(zhuǎn)空載體擬南芥的幼苗、擬南芥bri1-5的幼苗、OEGhBZR11-2的幼苗、OE△GhBZR12-5的幼苗、OEGhBZR1△I1603-22的幼苗或OEGhBZR1△S163G4-13的幼苗,采用根部接種的方法接種步驟(3)得到的孢子菌液或侵染溶液(接種侵染溶液的幼苗作為對照),每株擬南芥接種200μL孢子菌液或侵染溶液。完成步驟(4)的第五天,觀察記錄擬南芥的黃萎病發(fā)病情況,并按照黃萎病病級劃分標(biāo)準(zhǔn)(記載于如下文獻(xiàn)中:Wang,G.N.,Zhao,G.Y.,Yue,X,W.,Li,Z.K.,Zhang,Y.,ZhangG.Y.,Wu,L.Q.,Wang,S,F.,Ma,Z.Y.PathogenicityandISSRGeneticDifferentiationofVerticilliumdahliaeIsolatesfromCottonGrowingAreasofHebeiProvince.CottonScience.24,348-357)進(jìn)行病級調(diào)查比例統(tǒng)計(jì)結(jié)果。實(shí)驗(yàn)結(jié)果見圖2(A為擬南芥的生長狀態(tài),CK為接種侵染溶液,處理為接種孢子菌液;B為病級調(diào)查比例統(tǒng)計(jì)結(jié)果)。結(jié)果表明,轉(zhuǎn)空載體擬南芥的幼苗和擬南芥bri1-5的幼苗的黃萎病病級無顯著差異。與擬南芥bri1-5的幼苗相比,OEGhBZR11-2的幼苗、OE△GhBZR12-5的幼苗、OEGhBZR1△I1603-22的幼苗和OEGhBZR1△S163G4-13的幼苗對黃萎病的抗性均顯著增強(qiáng)??梢姡跀M南芥bri1-5中過表達(dá)GhBZR1基因、突變體基因1、轉(zhuǎn)突變體基因2或轉(zhuǎn)突變體基因3均可提高擬南芥bri1-5對黃萎病的抗性。實(shí)施例3、棉花沉默株的獲得及鑒定一、重組質(zhì)粒PTRV2-GhBZR1的構(gòu)建和重組農(nóng)桿菌的獲得1、采用Trizo1法提取生長至14天的陸地棉TM-1幼苗的葉片的總RNA,然后利用反轉(zhuǎn)錄酶AMV反轉(zhuǎn)錄出第一鏈cDNA。2、人工合成引物F1:5'-CGACGACAAGACCCTCACCACTTATCGAAAGGG-3'和R1:5'-GAGGAGAAGAGCCCTATTTCTGGAGGTTGGAG-3'。3、完成步驟1和2后,以步驟1提取的cDNA為模板,以F1和R1為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后純化、回收,得到約300bp的雙鏈DNA分子。4、將步驟3中得到雙鏈DNA分子置于含有dATP的T4DNA合成酶緩沖液中,22℃處理30min,然后70℃放置20min,得到片段甲。5、將載體PTRV2用限制性內(nèi)切酶PstⅠ酶切8h,回收酶切產(chǎn)物。將該酶切產(chǎn)物置于含有dTTP的T4DNA合成酶緩沖液中,22℃處理30min,然后70℃放置20min,得到載體骨架。6、將片段甲和載體骨架混合,65℃連接2min,得到重組質(zhì)粒PTRV2-GhBZR1。根據(jù)測序結(jié)果,重組質(zhì)粒PTRV2-GhBZR1為向載體PTRV2的限制性內(nèi)切酶PstⅠ的識別序列間插入序列表中序列1自5'末端起第231至531位所示的DNA分子。將重組質(zhì)粒PTRV2-GhBZR1導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌GV3101,得到重組農(nóng)桿菌,命名為GV3101/PTRV2-GhBZR1。將載體PTRV1導(dǎo)入根癌農(nóng)桿菌GV3101,得到重組農(nóng)桿菌,命名為GV3101/PTRV1。二、棉花沉默株的獲得1、取GV3101/PTRV2-GhBZR1的單菌落,接種至4mL含50mg/L利福平(Rif)和50g/L卡那霉素(Kan)的YEP液體培養(yǎng)基中,28℃、200rpm振蕩培養(yǎng)24h,得到培養(yǎng)菌液1。2、完成步驟1后,取培養(yǎng)菌液1,按體積比為1:100接種至含50mg/L利福平(Rif)和50g/L卡那霉素(Kan)的YEP液體培養(yǎng)基中,28℃、200rpm振蕩培養(yǎng)6h,得到培養(yǎng)菌液2。培養(yǎng)菌液2的0D600為0.5左右。3、完成步驟1后,取培養(yǎng)菌液2,5000rpm離心5min,得到沉淀1,然后用50mL侵染溶液重懸,得到侵染液甲。4、將步驟1~3中的GV3101/PTRV2-GhBZR1替換為GV3101/PTRV1,其它步驟均不變,得到侵染液乙。5、將步驟3得到的侵染液甲和步驟4得到的侵染液乙混合(體積比為1:1),得到侵染工作液;用該侵染工作液侵染生長至10天的陸地棉TM-1幼苗的子葉,得到10株陸地棉TM-1擬沉默株,依次將其命名為T1~T10。6、完成步驟5兩周后,采用Trizo1法分別提取10株陸地棉TM-1擬沉默株和生長至24天的陸地棉TM-1幼苗的總RNA,然后利用反轉(zhuǎn)錄酶AMV反轉(zhuǎn)錄出第一鏈cDNA。以該cDNA為模板,實(shí)時(shí)定量PCR檢測GhBZR1基因的表達(dá)量。鑒定GhBZR1基因的引物為5’-GAAAGGGATGTAAGCCACCT-3’和5’-GGAAGAGGAGGAAGGACTGA-3’,目的片段如序列表中序列1自5’末端第242至384位所示。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,與陸地棉TM-1幼苗的GhBZR1基因的表達(dá)量相比,T1、T3、T5和T8中GhBZR1基因的表達(dá)量均顯著降低。因此,T1、T3、T5和T8均為陸地棉TM-1沉默株。以T1、T3、T5和T8為研究材料進(jìn)行后續(xù)的實(shí)驗(yàn),在下文統(tǒng)一命名為VIGS-GhBZR1。按照上述方法,將步驟5中陸地棉TM-1替換為徐州142,得到徐州142沉默株。徐州142沉默株在下文稱為VIGS-GhBZR1-Xu142。三、陸地棉TM-1沉默株的表型鑒定和黃萎病抗性鑒定1、陸地棉TM-1沉默株現(xiàn)蕾期的表型鑒定(1)觀察陸地棉TM-1和VIGS-GhBZR1現(xiàn)蕾期的表型實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:自現(xiàn)蕾期開始,與陸地棉TM-1相比,VIGS-GhBZR1表現(xiàn)出主要由主莖的第一、四、五節(jié)間距縮短引起的植株矮化(即株高降低)(圖3中A、B和C,CK為陸地棉TM-1,1st為第一節(jié)間距,2nd為第二節(jié)間距,3rd為第三節(jié)間距,4th為第四節(jié)間距,5th為第五節(jié)間距,6th為第六節(jié)間距)、主要由主莖的第一、二、三果枝的夾角減小引起的株型緊湊(圖3中D,CK為陸地棉TM-1,1st為第一果枝的夾角,2nd為第二果枝的夾角,3rd為第三果枝的夾角)和葉柄變短(見圖3中E,CK為陸地棉TM-1)。(2)實(shí)時(shí)定量PCR檢測GhBZR1基因的表達(dá)量實(shí)驗(yàn)重復(fù)三次,每次重復(fù)的步驟如下:①樣本的獲得取處于現(xiàn)蕾期的VIGS-GhBZR1的幼嫩葉片,放入液氮保存,得到樣本1。取處于現(xiàn)蕾期的陸地棉TM-1的幼嫩葉片,放入液氮保存,得到樣本2。②實(shí)時(shí)定量PCR檢測GhBZR1基因的表達(dá)量采用Trizo1法提取樣本1或樣本2的總RNA,然后利用反轉(zhuǎn)錄酶AMV反轉(zhuǎn)錄出第一鏈cDNA,將該cDNA作為模板,實(shí)時(shí)定量PCR檢測GhBZR1基因的表達(dá)量。鑒定GhBZR1基因的引物為5’-GAAAGGGATGTAAGCCACCT-3’和5’-GGAAGAGGAGGAAGGACTGA-3’,目的片段如序列表中序列1自5’末端第242至384位所示。將樣本2中GhBZR1基因的表達(dá)量作為1,樣本1中GhBZR1基因的相對表達(dá)量見圖3中F。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,VIGS-GhBZR1中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為0.35。(3)葉柄細(xì)胞的電鏡掃描和實(shí)時(shí)定量PCR檢測苯丙烷代謝相關(guān)酶類的九個(gè)基因的表達(dá)量對陸地棉TM-1或VIGS-GhBZR1的葉柄細(xì)胞進(jìn)行電鏡掃描。結(jié)果表明(圖3中G),與陸地棉TM-1相比,VIGS-GhBZR1的葉柄細(xì)胞變短。細(xì)胞壁是植物細(xì)胞特有的細(xì)胞結(jié)構(gòu),由初生壁與次生壁組成,其中次生壁的合成影響著細(xì)胞的大小。在次生壁的木質(zhì)素合成過程中,苯丙烷的代謝起了重要作用。對陸地棉TM-1或VIGS-GhBZR1中的苯丙烷代謝相關(guān)酶類的九個(gè)基因(GhPAL1基因、GhC4H1基因、Gh4CL1基因、GhC3H1基因、GhCCoAOMT1基因、GhCCR1基因、GhF5H1基因、GhCOMT基因、GhCAD6基因和GhExp1基因,上述基因均記載于如下文獻(xiàn)中:Xu,L.,Zhu,L.,Tu,L.,Liu,L.,Yuan,D.,Jin,L.,Long,L.,andZhang,X.(2011)LigninmetabolismhasacentralroleintheresistanceofcottontothewiltfungusVerticilliumdahliaeasrevealedbyRNA-Seq-dependenttranscriptionalanalysisandhistochemistry.J.Exp.Bot.62,5607-5621.)的表達(dá)量進(jìn)行檢測,結(jié)果表明,與陸地棉TM-1相比,VIGS-GhBZR1中GhCCoAOMT1基因、GhCCR1基因、GhF5H1基因、GhCOMT基因、GhCAD6基因的表達(dá)均受到不同程度的抑制(圖3中H)。鑒定GhPAL1基因的引物為5’-CCTGGGTCAATCTTTGCTTC-3’和5’-AGGTCTCACCACCGAGTTTC-3’;鑒定GhC4H1基因的引物為5’-GATGCAAAGCTTGGTGGGTATGAC-3’和5’-ACTTGTTAAATCAAAACACCCTTGGCTT-3’;鑒定Gh4CL1基因的引物為5’-AATCATCAAATTCAAAGGCTTTCAAGTG-3’和5’-AGGCGTTGCAATTTAAAAGCCAAATAGATTA-3’;鑒定GhC3H1基因的引物為5’-ACTCTTCAGGGTCCTTCCAC-3’和5’-GAGGCTGCTCGTGTAGTGG-3’;鑒定GhCCoAOMT1基因的引物為5’-AAAGAAGGGCCTGCAATGCCAGTT-3’和5’-GGTAACGGTGGTTCATTTGAGGCGA-3’;鑒定GhCCR1基因的引物為5’-AGGATTGTTGATGACGCCTGAC-3’和5’-GTAGATTCTGCCTTCTCCCAAC-3’;鑒定GhF5H1基因的引物為5’-CGACGGTAGCATAGAACATCC-3’和5’-CAACAAGCAAGATCATTGACCT-3’;鑒定GhCOMT基因的引物為5’-CTTCCTGATTACCCCGACC-3’和5’-TAATTCCAGAAAATCCACCTTTT-3’;鑒定GhCAD6基因的引物為5’-GCTTCCAGCAACATCCACGAC-3’和5’-AGGATTGTTGATGACGCCTGAC-3’;鑒定GhExp1基因的引物為5’-GAAAGGGATGTAAGCCACCT和5’-GGAAGAGGAGGAAGGACTGA-3’。2、陸地棉TM-1沉默株的棉鈴和棉纖維的表型鑒定(1)觀察陸地棉TM-1和VIGS-GhBZR1的棉鈴和棉纖維的表型觀察陸地棉TM-1和VIGS-GhBZR1的棉鈴和棉纖維,實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:與陸地棉TM-1相比,結(jié)鈴期時(shí)VIGS-GhBZR1的棉鈴生長受到抑制(圖4中A,CK為陸地棉TM-1);與陸地棉TM-1相比,棉纖維成熟后,VIGS-GhBZR1的棉纖維變短,即棉纖維長度減少(圖4中B和C,CK為陸地棉TM-1)。(2)實(shí)時(shí)定量PCR檢測GhBZR1基因、GhExp1基因、GhPFN基因和GhTBU1基因的表達(dá)量GhExp1基因、GhPFN基因和GhTBU1基因(記載于如下文獻(xiàn)中:WangJ,WangH,ZhaoP,HanL,JiaoG,ZhengY,HuangS,XiaG(2010)OverexpressionofaProfilin(GhPFN2)PromotestheProgressionofDevelopmentalPhasesinCottonFibersPlantCellPhysiol.51(8):1276-1290)均為已知的與纖維相關(guān)的基因。實(shí)驗(yàn)重復(fù)三次,每次重復(fù)的步驟如下:①樣本的獲得取VIGS-GhBZR1的開花授粉3天后的棉纖維,放入液氮保存,得到樣本1。取陸地棉TM-1的開花授粉3天后的棉纖維,放入液氮保存,得到樣本2。取VIGS-GhBZR1的開花授粉15天后的棉纖維,放入液氮保存,得到樣本3。取陸地棉TM-1的開花授粉15天后的棉纖維,放入液氮保存,得到樣本4。②實(shí)時(shí)定量PCR檢測GhBZR1基因、GhExp1基因、GhPFN基因和GhTBU1基因的表達(dá)量采用Trizo1法提取樣本(樣本1、樣本2、樣本3或樣本4)的總RNA,然后利用反轉(zhuǎn)錄酶AMV反轉(zhuǎn)錄出第一鏈cDNA,將該cDNA作為模板,以5’-GAAAGGGATGTAAGCCACCT-3’和5’-GGAAGAGGAGGAAGGACTGA-3’為引物,實(shí)時(shí)定量PCR檢測GhBZR1基因的表達(dá)量。按照上述方法,將GhBZR1基因替換為GhExp1基因,得到GhExp1基因的表達(dá)量。鑒定GhExp1基因的引物為5’-GAGGGAGCCATTGACAACATCTT-3’和5’-GCGAACAGTTCACAGCTATGTTCA-3’。按照上述方法,將GhBZR1基因替換為GhPFN基因,得到GhPFN基因的表達(dá)量。鑒定GhPFN基因的引物為5’-ACCTTTCTGCCGCTGCTATCG-3’和5’-CGCCCAACCTCTCCACAACC-3’。按照上述方法,將GhBZR1基因替換為GhTBU1基因,得到GhTBU1基因的表達(dá)量。鑒定GhTBU1基因的引物為5’-AAGGAAGCCGAGAATTGCGATTG-3’和5’-CGAGGGAATGGAATAAGGTTTACAGC-3’。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,與陸地棉TM-1相比,VIGS-GhBZR1中GhBZR1基因、GhExp1基因、GhPFN基因和GhTBU1基因的表達(dá)均受到不同程度的抑制(圖4中D)。開花授粉3天后的棉纖維中:將陸地棉TM-1中GhBZR1基因的表達(dá)量作為1,VIGS-GhBZR1中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為0.4;將陸地棉TM-1中GhExp1基因的表達(dá)量作為1,VIGS-GhBZR1中GhExp1基因的相對表達(dá)量約為0.2;將陸地棉TM-1中GhPFN基因的表達(dá)量作為1,VIGS-GhBZR1中GhPFN基因的相對表達(dá)量約為0.1;將陸地棉TM-1中GhTBU1基因的表達(dá)量作為1,VIGS-GhBZR1中GhTBU1基因的相對表達(dá)量約為0.2。開花授粉15天后的棉纖維中:將陸地棉TM-1中GhBZR1基因的表達(dá)量作為1,VIGS-GhBZR1中GhBZR1基因的相對表達(dá)量約為0.5;將陸地棉TM-1中GhExp1基因的表達(dá)量作為1,VIGS-GhBZR1中GhExp1基因的相對表達(dá)量約為0.1;將陸地棉TM-1中GhPFN基因的表達(dá)量作為1,VIGS-GhBZR1中GhPFN基因的相對表達(dá)量約為0.3;將陸地棉TM-1中GhTBU1基因的表達(dá)量作為1,VIGS-GhBZR1中GhTBU1基因的表達(dá)量幾乎檢測不到。3、棉花沉默株的黃萎病抗性鑒定(1)陸地棉TM-1沉默株的黃萎病抗性鑒定實(shí)驗(yàn)重復(fù)三次,每個(gè)株系每次種植10株,具體步驟如下:①同實(shí)施例2步驟三3中(1)。②同實(shí)施例2步驟三3中(2)。③同實(shí)施例2步驟三3中(3)。④完成步驟③后,取25℃、培養(yǎng)4周的VIGS-GhBZR1的幼苗和陸地棉TM-1幼苗,采用莖部接種的方法接種步驟③得到的孢子菌液或侵染溶液(接種侵染培養(yǎng)基的作為對照),每株棉花幼苗接種10mL孢子菌液或侵染溶液。完成步驟④的第五周,觀察記錄棉花的黃萎病發(fā)病情況并計(jì)算致病系數(shù)(Wang,G.N.,Zhao,G.Y.,Yue,X,W.,Li,Z.K.,Zhang,Y.,ZhangG.Y.,Wu,L.Q.,Wang,S,F.,Ma,Z.Y.PathogenicityandISSRGeneticDifferentiationofVerticilliumdahliaeIsolatesfromCottonGrowingAreasofHebeiProvince.CottonScience.24,348-357.)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果見圖5(A為接種孢子菌液的單株棉花的葉片,TM-1為陸地棉TM-1;B為接種孢子菌液的致病系數(shù),TM-1為陸地棉TM-1)。結(jié)果表明,與陸地棉TM-1相比,VIGS-GhBZR1的葉片嚴(yán)重黃化甚至枯萎,致病系數(shù)較高,對黃萎病的抗性也顯著降低。(2)徐州142沉默株的黃萎病抗性鑒定實(shí)驗(yàn)重復(fù)三次,每個(gè)株系每次種植10株,具體步驟如下:①同實(shí)施例2步驟三3中(1)。②同實(shí)施例2步驟三3中(2)。③同實(shí)施例2步驟三3中(3)。④完成步驟③后,取25℃、培養(yǎng)4周的VIGS-GhBZR1-Xu142的幼苗和徐州142的幼苗,采用莖部接種的方法接種步驟③得到的孢子菌液或侵染溶液(接種侵染溶液的作為對照),每株棉花幼苗接種10mL孢子菌液或侵染溶液。完成步驟④的第五周,觀察記錄棉花的黃萎病發(fā)病情況并計(jì)算致病系數(shù)(Wang,G.N.,Zhao,G.Y.,Yue,X,W.,Li,Z.K.,Zhang,Y.,ZhangG.Y.,Wu,L.Q.,Wang,S,F.,Ma,Z.Y.PathogenicityandISSRGeneticDifferentiationofVerticilliumdahliaeIsolatesfromCottonGrowingAreasofHebeiProvince.CottonScience.24,348-357.)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果見圖5中C。結(jié)果表明,與徐州142相比,VIGS-GhBZR1-Xu142的致病系數(shù)較高,對黃萎病的抗性也顯著降低。上述結(jié)果表明,在徐州142或陸地棉TM-1中沉默GhBZR1基因均可降低其對黃萎病的抗性。當(dāng)前第1頁1 2 3 
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