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基于環(huán)介導(dǎo)等溫擴增消光技術(shù)的轉(zhuǎn)基因水稻TT51?1檢測方法與流程

文檔序號:12577838閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.用于檢測轉(zhuǎn)基因水稻TT51-1的LAMP引物組合,其特征在于,所述引物組合根據(jù)TT51-1的外源基因3’端設(shè)計,包括:

外側(cè)正向引物TT51-1-F3:5’-CTGGGAGGGAGGGAGGGCCGGCGTCAATACGGGATA-3’;

外側(cè)反向引物TT51-1-B3:5’-CTGGGAGGGAGGGAGGGTCGTAGCCCCACCACTAC-3;’以及

內(nèi)側(cè)正向引物TT51-1-FIP:5’-CGGTCATTGACTGGAGCGAGGCTGGGAGGGAGGGAGGGATACCGCGCCACATAGCA-3’;

內(nèi)側(cè)反向引物TT51-1-BIP:5’-AGAGACTGGTGATTTCAGCGGGCTGGGAGGGAGGGAGGGCTTATCTGCCCCAGCACTC-3’。

2.含有權(quán)利要求1所述LAMP引物組合用于檢測轉(zhuǎn)基因水稻TT51-1的試劑盒。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒還包括dNTPs、Bst DNA聚合酶、甜菜堿、ABTS顯色液、hemin工作液、H2O2溶液、Thermopol緩沖液、標(biāo)準(zhǔn)陽性模板中的至少一種。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒,其特征在于,所述ABTS顯色液的濃度為36mM,配制溶劑為1×DMSO;

所述hemin工作液的組成如下:50μM hemin、10mM NaH2PO4、100mM KCl、2mM MgCl2和0.003%Triton X-100。

5.權(quán)利要求1所述LAMP引物組合或權(quán)利要求2-4任一項所述試劑盒在檢測轉(zhuǎn)基因水稻TT51-1中的應(yīng)用。

6.基于環(huán)介導(dǎo)等溫擴增消光技術(shù)的轉(zhuǎn)基因水稻TT51-1檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:

1)將樣品磨成粉末,稱100mg±10mg樣品,用CTAB法提取基因組DNA;

2)顯色反應(yīng),并通過肉眼觀察反應(yīng)混合液的顏色,或利用紫外分光光度計測定反應(yīng)混合液在419nm處的OD值:

3)以步驟1)中提取的DNA為模板,利用權(quán)利要求1所述LAMP引物組合,進(jìn)行環(huán)介導(dǎo)等溫擴增消光反應(yīng):

4)分析擴增產(chǎn)物。

7.根據(jù)權(quán)利要求6所述的方法,其特征在于,步驟2)具體為:將hemin工作液與權(quán)利要求1所述LAMP引物組合混合,35-45℃孵育20-30min,然后添加ABTS顯色液和H2O2,立即用肉眼觀察顏色或利用紫外分光光度計測定OD419nm值;

顯色反應(yīng)的反應(yīng)體系為:40-60μM hemin工作液90μL,10μM引物TT51-1-F3和TT51-1-B3各0.5μL,10μM引物TT51-1-FIP和TT51-1-BIP各3-4μL,30-40mM ABTS顯色液30μL,30%H2O21μL,用dd H2O補足至總體系130μL。

8.根據(jù)權(quán)利要求6或7所述的方法,其特征在于,步驟3)具體為:向步驟2)顯色反應(yīng)所得混合液中添加16μL擴增試劑,所述擴增試劑包括1.8-3.0mM dNTP、6-9mM MgSO4、1-2M甜菜堿、3.6-10.0U Bst DNA聚合酶、1×Thermopol緩沖液和2μL DNA模板,配制反應(yīng)體系,然后60-65℃孵育40-60min,80-85℃放置2-3分鐘,最后冰上終止反應(yīng)。

9.根據(jù)權(quán)利要求6-8任一項所述的方法,其特征在于,步驟4)具體為:目測判定反應(yīng)前后反應(yīng)混合液顏色變化,或利用紫外分光光度計測定步驟3)所得反應(yīng)混合液在419nm處的OD值;若顏色由反應(yīng)前的藍(lán)色變成淺藍(lán)色或無色,或者反應(yīng)后OD419nm值變小,表明待測樣品中含有轉(zhuǎn)基因水稻TT51-1成分。

10.根據(jù)權(quán)利要求6-9任一項所述的方法,其特征在于,包括以下步驟:

①將樣品磨成粉末,稱100mg±10mg樣品,用CTAB法提取基因組,作為DNA模板;

②顯色反應(yīng):將hemin工作液與LAMP引物組合混合,40℃孵育30min,然后添加ABTS顯色液和H2O2,立即用肉眼觀察顏色或利用紫外分光光度計測定OD419nm值;

顯色反應(yīng)的反應(yīng)體系為:50μM hemin工作液90μL,10μM引物TT51-1-F3和TT51-1-B3各0.5μL,10μM引物TT51-1-FIP和TT51-1-BIP各4μL,36mM ABTS顯色液30μL,30%H2O2 1μL,用dd H2O補足至總體系130μL;

③環(huán)介導(dǎo)等溫擴增消光反應(yīng):向步驟②顯色反應(yīng)所得混合液中添加16μL擴增試劑,所述擴增試劑包括2.5mM dNTP、7.8mM MgSO4、1.6M甜菜堿、8.0U Bst DNA聚合酶、1×Thermopol緩沖液和2μL DNA模板,配制反應(yīng)體系,然后65℃孵育40min,85℃放置3分鐘,最后冰上終止反應(yīng);

④目測判定反應(yīng)前后反應(yīng)混合液顏色變化,或利用紫外分光光度計測定步驟③所得反應(yīng)混合液在419nm處的OD值;若顏色由反應(yīng)前的藍(lán)色變成淺藍(lán)色或無色,或者反應(yīng)后OD419nm值變小,表明待測樣品中含有轉(zhuǎn)基因水稻TT51-1成分。

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