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人Gal?3密碼子優(yōu)化及其重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)方法與流程

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人Gal?3密碼子優(yōu)化及其重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)方法與流程

本發(fā)明涉及一種人Gal-3重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)方法,屬于獲得肽的基因工程方法技術(shù)領(lǐng)域。



背景技術(shù):

人半乳糖凝集素(galectin)蛋白家族是動(dòng)物凝集素的一類,galectin具有大約135個(gè)氨基酸組成的高度保守的糖識(shí)別結(jié)構(gòu)域(carbohydrate recognition domain, CRD),能特異性性識(shí)別并結(jié)合β-半乳糖苷。目前已從多種動(dòng)物的組織和細(xì)胞中分離到15種galectin,其中半乳糖凝集素-3(galectin-3,簡(jiǎn)稱Gal-3)是galectin家族中唯一的嵌合型代表。Gal-3在正常細(xì)胞(如上皮細(xì)胞和免疫細(xì)胞)和腫瘤細(xì)胞中都廣泛表達(dá)。作為一個(gè)多功能蛋白,Gal-3參與細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、細(xì)胞黏附、血管發(fā)生、腫瘤演進(jìn)、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)移等多種生物過(guò)程。在20世紀(jì)80年代末90年代初,研究人員就發(fā)現(xiàn)Gal-3存在于結(jié)腸癌、胃癌、黑色素瘤、頭頸部鱗癌、卵巢癌、肺癌、淋巴瘤、顱后窩腫瘤等腫瘤組織,并具有一定的診斷、預(yù)后、治療價(jià)值。Gal-3因此成為備受關(guān)注的腫瘤診斷和治療新靶點(diǎn)。目前,包括多糖、Gal-3C(N-端截短型Gal-3)、多肽、抗體、核酸類等多種抑制劑已相繼被研發(fā)出來(lái),用于抗腫瘤或抗肺纖維化(IPF)等疾病治療。但如何實(shí)現(xiàn)人Gal-3的構(gòu)建、表達(dá)尚未見(jiàn)有報(bào)道。

基于此,做出本申請(qǐng)。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

針對(duì)現(xiàn)有人類半乳糖凝集素-3表達(dá)與合成過(guò)程中所存在的上述缺陷,本申請(qǐng)針對(duì)人Gal-3開放閱讀框的密碼子進(jìn)行優(yōu)化和化學(xué)合成,成功構(gòu)建原核表達(dá)重組質(zhì)粒pET-25b-Gal3-Homo,并對(duì)其重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)條件進(jìn)行了優(yōu)化。

為實(shí)現(xiàn)上述目的,本申請(qǐng)采取的技術(shù)方案如下:

人Gal-3重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)方法,具體步驟如下:

(1)密碼子優(yōu)化:

對(duì)大腸桿菌20個(gè)氨基酸所對(duì)應(yīng)的密碼子進(jìn)行統(tǒng)計(jì),然后對(duì)人Gal-3 ORF碼子優(yōu)化,將優(yōu)化的ORF進(jìn)行化學(xué)合成并連接至pET-28b的Nde I和Xho I克隆位點(diǎn)上,制備重組質(zhì)粒pET-28b-Gal3-Homo;

(2)重組蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)

①將pET-28b-Gal3重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞BL21中,將轉(zhuǎn)化液在含卡那霉素Kanamycin的瓊脂盤上劃線后37℃培養(yǎng)12 h,獲得大量單菌落;

②在誘導(dǎo)重組蛋白前一天,挑取單菌落接種于1 mL LB培養(yǎng)液中,進(jìn)行12h的前培養(yǎng);

③將前培養(yǎng)按1%的體積接種于20 mL LB培養(yǎng)液中,37℃震蕩培養(yǎng)至OD600 介于0.7~1.0時(shí),向菌液中加入IPTG,然后繼續(xù)37℃震蕩培養(yǎng)后,進(jìn)行離心,徹底去上清。

進(jìn)一步的,作為優(yōu)選:

步驟(1)中,所述的優(yōu)化是指:人Gal-3gORF中某種氨基酸所對(duì)應(yīng)的密碼子是大腸桿菌中出現(xiàn)頻率較高的,則保留該密碼子;反之,當(dāng)使用的密碼子是大腸桿菌中出現(xiàn)頻率很低的或不出現(xiàn)的時(shí),則對(duì)其進(jìn)行優(yōu)化,將原密碼子修改為大腸桿菌的密碼子。

步驟①中,所述的瓊脂盤中,卡那霉素Kanamycin的含量為50 μg ?mL-1

步驟②和步驟③中,所述的LB培養(yǎng)液中,卡那霉素Kanamycin的含量為50 μg?mL-1。

步驟③中,所述的IPTG在菌液中的終濃度為0-1 mmol?L-1,添加IPTG后,所述的培養(yǎng)時(shí)間為1-4小時(shí)。

人半乳糖凝集素(galectin)蛋白家族是動(dòng)物凝集素的一類,galectin具有大約135個(gè)氨基酸組成的高度保守的糖識(shí)別結(jié)構(gòu)域(carbohydrate recognition domain, CRD),能特異性性識(shí)別并結(jié)合β-半乳糖苷。目前已從多種動(dòng)物的組織和細(xì)胞中分離到15種galectin,其中半乳糖凝集素-3(galectin-3,簡(jiǎn)稱Gal-3)是galectin家族中唯一的嵌合型代表。Gal-3在正常細(xì)胞(如上皮細(xì)胞和免疫細(xì)胞)和腫瘤細(xì)胞中都廣泛表達(dá)。作為一個(gè)多功能蛋白,Gal-3參與細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、細(xì)胞黏附、血管發(fā)生、腫瘤演進(jìn)、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)移等多種生物過(guò)程。在20世紀(jì)80年代末90年代初,研究人員就發(fā)現(xiàn)Gal-3存在于結(jié)腸癌、胃癌、黑色素瘤、頭頸部鱗癌、卵巢癌、肺癌、淋巴瘤、顱后窩腫瘤等腫瘤組織,并具有一定的診斷、預(yù)后、治療價(jià)值。Gal-3因此成為備受關(guān)注的腫瘤診斷和治療新靶點(diǎn)。目前,包括多糖、Gal-3C(N-端截短型Gal-3)、多肽、抗體、核酸類等多種抑制劑已相繼被研發(fā)出來(lái),用于抗腫瘤或抗肺纖維化(IPF)等疾病治療。本申請(qǐng)針對(duì)人Gal-3開放閱讀框的密碼子進(jìn)行優(yōu)化和化學(xué)合成,成功構(gòu)建原核表達(dá)重組質(zhì)粒pET-25b-Gal-3-Homo,并對(duì)其重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)條件進(jìn)行了優(yōu)化。

附圖說(shuō)明

圖1為本申請(qǐng)中人重組Gal-3誘導(dǎo)表達(dá);

圖2為本申請(qǐng)中人重組Gal-3可溶性檢測(cè)、Western-blotting檢測(cè)。

其中,圖1中,泳道1、10為未加IPTG的陰性對(duì)照,2-5為誘導(dǎo)表達(dá)1h,6-9為誘導(dǎo)表達(dá)2h,11-14為誘導(dǎo)表達(dá)3h,15-18為誘導(dǎo)表達(dá)4h;2、6、11、15為0.001 mmol?L-1 IPTG誘導(dǎo)表達(dá),3、7、12、16為0.01 mmol?L-1 IPTG誘導(dǎo)表達(dá),4、8、13、17為0.1 mmol?L-1 IPTG誘導(dǎo)表達(dá),5、9、14、18為1.0 mmol?L-1 IPTG誘導(dǎo)表達(dá);圖2中,1-4為考馬斯亮藍(lán)染色、5-8為Western-blotting檢測(cè);泳道1、5為未加IPTG的陰性對(duì)照,2、6為全菌,3、7為上清,4、8為沉淀。

具體實(shí)施方式

1 材料與方法

1.1 主要材料與試劑

大腸桿菌(E.coli)感受態(tài)細(xì)胞BL21購(gòu)自天根生化科技有限公司;X-Tractor裂解液購(gòu)自TAKARA;Protein Ladder、脫脂奶粉、PVDF膜、小鼠抗His-tag 抗體、辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記山羊抗小鼠抗體、超敏ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒購(gòu)自碧云天生物技術(shù)研究所;DNA片段合成和載體質(zhì)粒構(gòu)建委托蘇州金唯智生物科技有限公司。

1.2 方法

1.2.1密碼子優(yōu)化

統(tǒng)計(jì)實(shí)驗(yàn)室常用的重組蛋白原核表達(dá)載體,對(duì)大腸桿菌20個(gè)氨基酸所對(duì)應(yīng)的密碼子進(jìn)行統(tǒng)計(jì),然后對(duì)人Gal-3 ORF碼子優(yōu)化。具體而言,ORF中某氨基酸所對(duì)應(yīng)的密碼子是大腸桿菌中出現(xiàn)頻率較高的,則保留該密碼子。反之,如果使用的密碼子是大腸桿菌中出現(xiàn)頻率很低的或不出現(xiàn)的,則對(duì)其進(jìn)行優(yōu)化,即將原密碼子修改為大腸桿菌的密碼子(具體參見(jiàn)序列1,即人Gal-3g 密碼子優(yōu)化前后ORF及其編碼氨基酸的推導(dǎo)序列)。將優(yōu)化的ORF進(jìn)行合成并連接至pET-28b的Nde I和Xho I克隆位點(diǎn)上,制備重組質(zhì)粒pET-28b-Gal3-Homo。

1.2.2 重組蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)

將pET-28b-Gal-3質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞BL21中,將轉(zhuǎn)化液在含卡那霉素Kanamycin(簡(jiǎn)稱Kan,50 μg?mL-1)的瓊脂盤上劃線后37℃培養(yǎng)12 h,獲得大量單菌落。在誘導(dǎo)重組蛋白前一天,挑取單菌落接種于1 mL LB培養(yǎng)液中(含50 μg?mL-1 Kan),進(jìn)行12h的前培養(yǎng)。將前培養(yǎng)按1%的體積接種于20 mL LB培養(yǎng)液中(含50 μg?mL-1 Kan),37℃震蕩培養(yǎng)至OD600 介于0.7~1.0時(shí),取2 mL菌液作為對(duì)照樣品,將剩余菌液分為4管,加入IPTG,使其終濃度分別為0.001 mmol?L-1、0. 01 mmol?L-1、0.1 mmol?L-1、1 mmol?L-1,然后繼續(xù)37℃震蕩培養(yǎng),在培養(yǎng)時(shí)間為1、2、3、4h時(shí)分別取兩個(gè)0.5 mL樣品進(jìn)行離心(13200rpm,1min),徹底去上清。將其中一管的菌體溶于50 μL的蛋白質(zhì)上樣緩沖液中,連同Protein Marker一起于干燥恒溫器中100℃處理3 min,取出后迅速置于冰上冷卻,最后將所有樣品分別取5μL進(jìn)行SDS-PAGE電泳,檢測(cè)人重組Gal3誘導(dǎo)表達(dá)情況。剩下的一管保存于-20℃用于后續(xù)的重組蛋白的可溶性檢測(cè)。

1.2.4重組蛋白的可溶性檢測(cè)

(1)分別取1mL經(jīng)IPTG(終濃度1mmol?L-1)誘導(dǎo)4h的菌液加入已知重量的1.5ml離心管,13200rpm離心1min,去上清,再次稱量離心管重量,得出菌體重量。

(2)按1μg菌體對(duì)應(yīng)20μL比例加入X-tractor裂解液,充分懸浮菌體。加入DNaseⅠ約0.1μL避免溶液出現(xiàn)粘稠,另加入一定量溶菌酶(終濃度為1mg?mL-1),室溫放置10min,每2min上下顛倒一次。4℃ 13 200rpm離心20min。

(3)取上清到另一個(gè)離心管中(作為上清樣品保留檢測(cè)用),再在離心管中加入與X-tractor等量的ddH2O,將沉淀充分懸浮。

(4)取上清和沉淀懸浮液各10μL,加入2.5μL的5×SDS上樣緩沖液,100℃處理5min后迅速置于冰上。

(5)取5μL處理過(guò)的樣品進(jìn)行SDS-PAGE電泳檢測(cè)重組蛋白水溶性。

按照說(shuō)明,將有表達(dá)重組蛋白的細(xì)菌溶解于X-Tractor裂解液。離心后,用SDS-PAGE檢測(cè)包涵體和沉淀??扇苄缘鞍追植加谏锨逯?,而不可溶性蛋白分布于包涵體中。

1.2.5 免疫印跡檢測(cè)

誘導(dǎo)表達(dá)的重組蛋白在15%分離膠,5%濃縮膠中進(jìn)行SDS-PAGE分析,電泳后用PVDF膜將凝膠在轉(zhuǎn)印緩沖溶液中轉(zhuǎn)移電泳,65 V恒壓轉(zhuǎn)印3 h,5%脫脂奶封閉,小鼠抗His-tag分別為一抗,HRP 標(biāo)記的羊抗小鼠IgG為二抗,超敏Ecl 化學(xué)發(fā)光試劑盒顯色。

2 結(jié)果與分析

(1)pET-28b-Gal3-Homo的構(gòu)建、重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)及條件優(yōu)化

將優(yōu)化的密碼子進(jìn)行化學(xué)合成并將其連接至pET28b的5’NdeI 和 3’XhoI克隆位點(diǎn),構(gòu)建pET-28b-Mitogalig-Homo,預(yù)測(cè)其重組蛋白的分子量為28.351 kD(參見(jiàn)序列2和序列3,即人Gal3優(yōu)化后的ORF插入pET28b的5’NdeI 和 3’XhoI克隆位點(diǎn)及其重組蛋白的推導(dǎo)氨基酸序列)。按材料與方法所述進(jìn)行重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)與檢測(cè)。SDS-PAGE結(jié)果表明,0.001mmol?L-1的IPTG不能誘導(dǎo)重組蛋白的表達(dá),當(dāng)IPTG濃度介于0.01-1mmol?L-1時(shí),均在標(biāo)準(zhǔn)分子量25.0-35.0 kD之間出現(xiàn)明顯過(guò)量表達(dá)的蛋白,與預(yù)期28.351 kD基本吻合(參見(jiàn)圖1和圖2)。當(dāng)IPTG介于達(dá)到0.1-1mmol?L-1時(shí)重組蛋白表達(dá)量沒(méi)有明顯區(qū)別。表達(dá)量亦隨誘導(dǎo)時(shí)間的延長(zhǎng)發(fā)生改變,4h時(shí)表達(dá)量最佳。根據(jù)可溶性檢測(cè)結(jié)果表明,該重組蛋白主要分布于上清中,表明是水溶性蛋白(參見(jiàn)圖2)?;谏鲜龇治?,誘導(dǎo)表達(dá)的最優(yōu)條件選擇為:37℃條件下,IPTG濃度為0.1mmol?L-1,誘導(dǎo)4 h。

以上內(nèi)容是結(jié)合本發(fā)明創(chuàng)造的優(yōu)選實(shí)施方式對(duì)所提供技術(shù)方案所作的進(jìn)一步詳細(xì)說(shuō)明,不能認(rèn)定本發(fā)明創(chuàng)造具體實(shí)施只局限于上述這些說(shuō)明,對(duì)于本發(fā)明創(chuàng)造所屬技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來(lái)說(shuō),在不脫離本發(fā)明創(chuàng)造構(gòu)思的前提下,還可以做出若干簡(jiǎn)單推演或替換,都應(yīng)當(dāng)視為屬于本發(fā)明創(chuàng)造的保護(hù)范圍。

SEQUENCE LISTING

<110> 浙江農(nóng)林大學(xué)

<120> 人Gal-3密碼子優(yōu)化及其重組蛋白誘導(dǎo)表達(dá)方法

<160> 3

<210> 1

<211> 753

<212> cDNA

<213> 人工序列

<220>

<222> (1)..(753)

<400> 1

Original:ATGGCAGACAATTTTTCGCTCCATGATGCGTTATCTGGGTCTGGAAACCCAAACCCTCAAGGATGGCCTGGCGCATGGGGGAACCAGCCT 90

Optimized:ATGGCAGATAATTTCTCGCTGCATGATGCGCTATCGGGCTCGGGAAATCCAAATCCACAAGGCTGGCCAGGCGCATGGGGCAATCAGCCA

Original:GCTGGGGCAGGGGGCTACCCAGGGGCTTCCTATCCTGGGGCCTACCCCGGGCAGGCACCCCCAGGGGCTTATCCTGGACAGGCACCTCCA 180

Optimized:GCTGGCGCAGGCGGCTATCCAGGCGCTTCCTATCCAGGCGCCTATCCAGGCCAGGCACCACCAGGCGCTTATCCAGGCCAGGCACCACCA

Original:GGCGCCTACCATGGAGCACCTGGAGCTTATCCCGGAGCACCTGCACCTGGAGTCTACCCAGGGCCACCCAGCGGCCCTGGGGCCTACCCA 270

Optimized:GGCGCCTATCATGGCGCACCAGGCGCTTATCCAGGCGCACCAGCACCAGGCGTCTATCCAGGCCCACCAAGCGGCCCAGGCGCCTATCCA

Original:TCTTCTGGACAGCCAAGTGCCCCCGGAGCCTACCCTGCCACTGGCCCCTATGGCGCCCCTGCTGGGCCACTGATTGTGCCTTATAACCTG 360

Optimized:TCGTCGGGCCAGCCAAGCGCCCCAGGCGCCTATCCTGCCACCGGCCCGTATGGCGCCCCAGCTGGCCCACTGATCGTCCCATATAATCTG

Original:CCTTTGCCTGGGGGAGTGGTGCCTCGCATGCTGATAACAATTCTGGGCACGGTGAAGCCCAATGCAAACAGAATTGCTTTAGATTTCCAA 450

Optimized:CCACTGCCAGGCGGCGTCGTCCCACGCATGCTGATCACCATCCTGGGCACCGTCAAGCCAAATGCAAATAGAATCGCTCTAGATTTCCAA

Original:AGAGGGAATGATGTTGCCTTCCACTTTAACCCACGCTTCAATGAGAACAACAGGAGAGTCATTGTTTGCAATACAAAGCTGGATAATAAC 540

Optimized:AGAGGCAATGATGTCGCCTTCCACTTCAATCCACGCTTCAATGAGAATAATCGGAGAGTCATCGTCTGCAATACCAAGCTGGATAATAAT

Original:TGGGGAAGGGAAGAAAGACAGTCGGTTTTCCCATTTGAAAGTGGGAAACCATTCAAAATACAAGTACTGGTTGAACCTGACCACTTCAAG 630

Optimized:TGGGGCAGAGAGGAGAGACAGTCGGTCTTCCCATTCGAGAGCGGCAAGCCATTCAAGATCCAAGTCCTGGTCGAGCCAGATCACTTCAAG

Original:GTTGCAGTGAATGATGCTCACTTGTTGCAGTACAATCATCGGGTTAAAAAACTCAATGAAATCAGCAAACTGGGAATTTCTGGTGACATA 720

Optimized:GTCGCAGTCAATGATGCTCACCTGCTGCAGTATAATCATCGGGTCAAGAAGCTGAATGAGATCAGCAAGCTGGGCATCTCGGGCGATATC

Original:GACCTCACCAGTGCTTCATATACCATGATATAA 753

Optimized:GATCTCACCAGCGCTTCGTATACCATGATCTAA

<210> 2

<211> 813

<212> cDNA

<213> 人工序列

<400> 2

ATGGGCAGCAGCCATCATCATCATCATCACAGCAGCGGCCTGGTGCCGCGCGGCAGCCATATGGCAGATAATTTCTCGCTGCATGATGCGCTATCGGGCTCGGGAAATCCAAATCCACAAGGCTGGCCAGGCGCATGGGGCAATCAGCCAGCTGGCGCAGGCGGCTATCCAGGCGCTTCCTATCCAGGCGCCTATCCAGGCCAGGCACCACCAGGCGCTTATCCAGGCCAGGCACCACCAGGCGCCTATCATGGCGCACCAGGCGCTTATCCAGGCGCACCAGCACCAGGCGTCTATCCAGGCCCACCAAGCGGCCCAGGCGCCTATCCATCGTCGGGCCAGCCAAGCGCCCCAGGCGCCTATCCTGCCACCGGCCCGTATGGCGCCCCAGCTGGCCCACTGATCGTCCCATATAATCTGCCACTGCCAGGCGGCGTCGTCCCACGCATGCTGATCACCATCCTGGGCACCGTCAAGCCAAATGCAAATAGAATCGCTCTAGATTTCCAAAGAGGCAATGATGTCGCCTTCCACTTCAATCCACGCTTCAATGAGAATAATCGGAGAGTCATCGTCTGCAATACCAAGCTGGATAATAATTGGGGCAGAGAGGAGAGACAGTCGGTCTTCCCATTCGAGAGCGGCAAGCCATTCAAGATCCAAGTCCTGGTCGAGCCAGATCACTTCAAGGTCGCAGTCAATGATGCTCACCTGCTGCAGTATAATCATCGGGTCAAGAAGCTGAATGAGATCAGCAAGCTGGGCATCTCGGGCGATATCGATCTCACCAGCGCTTCGTATACCATGATCTAA

<210> 3

<211> 271

<212> cDNA

<213> 人工序列

<400> 3

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMADNFSLHDALSGSGNPNPQGWPGAWGNQP 50

AGAGGYPGASYPGAYPGQAPPGAYPGQAPPGAYHGAPGAYPGAPAPGVYP 100

GPPSGPGAYPSSGQPSAPGAYPATGPYGAPAGPLIVPYNLPLPGGVVPRM 150

LITILGTVKPNANRIALDFQRGNDVAFHFNPRFNENNRRVIVCNTKLDNN 200

WGREERQSVFPFESGKPFKIQVLVEPDHFKVAVNDAHLLQYNHRVKKLNE 250

ISKLGISGDIDLTSASYTMI 271

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