本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種基于芽孢桿菌的無抗表達系統(tǒng)及構(gòu)建方法。
背景技術(shù):
蛋白表達技術(shù)是現(xiàn)代生物學(xué)的核心技術(shù)之一,表達蛋白不僅可用于生物學(xué)研究,也可以提供商業(yè)化的蛋白制品,如重組疫苗、重組胰島素、細(xì)胞因子等產(chǎn)品。目前常用的表達系統(tǒng)有大腸桿菌、酵母、昆蟲細(xì)胞和哺乳動物細(xì)胞等,但是它們都各有明顯的優(yōu)缺點。大腸桿菌表達系統(tǒng)研究最充分,有多種選擇,最常用的是Novagen的pET表達系統(tǒng),其利用噬菌體的T7RNA聚合酶可專一性地轉(zhuǎn)錄T7啟動子后的目的基因,在最佳條件下,目的蛋白可以達到大腸桿菌總蛋白的50%以上。盡管具有表達效率高,培養(yǎng)成本低等優(yōu)點,但是缺點也非常明顯:蛋白容易形成包涵體,復(fù)性難度和成本較高;大腸桿菌不能對蛋白進行糖基化修飾;細(xì)胞壁含有脂多糖(內(nèi)毒素),不易完全去除。另外一個常用的表達系統(tǒng)是酵母表達系統(tǒng),其具有表達量高,可誘導(dǎo),蛋白分泌到胞外易于純化,并且具有一定的翻譯后修飾能力等優(yōu)點,但是缺點是部分表達產(chǎn)物易降解,表達量不可控,大于30KDa的蛋白幾乎不能分泌。動物細(xì)胞和昆蟲細(xì)胞表達系統(tǒng)的特點是具有完整的修飾系統(tǒng),表過產(chǎn)物具有或者類似的天然活性,沒有內(nèi)毒素污染,但是表達量低,周期長,技術(shù)要求高,生產(chǎn)成本高。這些表達系統(tǒng)還有一個共有的缺點,就是在構(gòu)建表達系統(tǒng)的過程中需要使用篩選標(biāo)記,一般都選擇抗生素篩選標(biāo)記,部分表達系統(tǒng)在生產(chǎn)使用的過程中仍然需要使用抗生素篩選標(biāo)記和抗生素篩選,這都會帶來一個問題——抗抗生素基因漂移,尤其是大規(guī)模生產(chǎn)的時候,將導(dǎo)致環(huán)境中耐藥致病菌的產(chǎn)生。
枯草芽孢桿菌是一種廣泛存在于水體、空氣、土壤中的革蘭氏陽性菌,其可以在環(huán)境不適宜的時候產(chǎn)生孢子,孢子可以抵御高溫、干旱等極端環(huán)境,待環(huán)境適宜時再萌發(fā)進行營養(yǎng)生長??莶菅挎邨U菌的分泌能力強,在進行高密度發(fā)酵時,蛋白分泌量可以達到20—25g/L(Developments in the use of Bacillus species for industrial production,2004)。其發(fā)酵生產(chǎn)的蛋白酶、淀粉酶、次黃嘌呤核苷、核糖甙等產(chǎn)品,早已經(jīng)進入我們的日常生活。由于其具有生物安全性,被FDA評委GRAS類添加劑,其生產(chǎn)的益生菌及利用其生產(chǎn)的發(fā)酵產(chǎn)品已廣泛應(yīng)用于醫(yī)藥和養(yǎng)殖業(yè)中。
上世紀(jì)八十年代就開始利用枯草芽孢桿菌進行蛋白表達,其表達產(chǎn)物不僅包括細(xì)菌來源的各種酶類,如淀粉酶、蛋白酶、內(nèi)葡聚糖酶、脂肪酶等,還包括hEGF、IFN-alpha 2、Proinsulin、Streptavidin、cathelicidin-BF等不同來源的蛋白。利用枯草芽孢桿菌的分泌途徑,可將表達蛋白分泌到發(fā)酵液中,極大地降低了后期分離純化的難度??莶菅挎邨U菌屬于革蘭氏陽性菌,不含有脂多糖,便于生產(chǎn)注射用藥品??莶菅挎邨U菌的營養(yǎng)要求簡單,由于其已經(jīng)實現(xiàn)規(guī)模工業(yè)化生產(chǎn),大規(guī)模培養(yǎng)技術(shù)成熟,培養(yǎng)成本低。目前,枯草芽孢桿菌中的多個菌株及芽孢桿菌屬中的多個種都已經(jīng)完成了基因組測序工作,遺傳背景清楚,安全性高,也便于進行基因組改造。但是枯草芽孢桿菌表達系統(tǒng)并不是一個廣泛應(yīng)用的表達系統(tǒng),還有許多缺點待克服。
枯草芽孢桿菌的模式菌168菌的野生型菌株已經(jīng)丟失,目前可以得到的菌株都是其突變體。盡管其滿足于科學(xué)研究的要求,但是其蛋白分泌能力差,是營養(yǎng)缺陷性突變體的特性,并不能滿足建立商業(yè)化表達系統(tǒng)的要求。目前建立的轉(zhuǎn)化系統(tǒng)都是基于模式菌株168建立的,盡管野生型來源的菌株和已經(jīng)生產(chǎn)應(yīng)用的枯草芽孢桿菌種非常多,不易轉(zhuǎn)化都阻礙了對這些菌株的進一步改造??莶菅挎邨U菌來源的質(zhì)粒也幾乎都是隱蔽性質(zhì)粒,不易構(gòu)建載體;來源于其它革蘭氏陽性菌的質(zhì)粒多數(shù)都是滾環(huán)復(fù)制性質(zhì)粒,在枯草芽孢桿菌中復(fù)制不穩(wěn)定,易丟失,拷貝數(shù)較少;這些特性都限制了直接使用質(zhì)粒構(gòu)建穩(wěn)定表達系統(tǒng)的可能性??莶菅挎邨U菌有四種分泌途徑,Sec途徑、Tat途徑、Com系統(tǒng)和ABC轉(zhuǎn)運途徑,目前研究較清楚的是Sec途徑,一些表達系統(tǒng)也利用Sec途徑分泌表達蛋白。但是Sec途徑具有調(diào)控機制,會抑制不正確折疊的蛋白分泌,而外源蛋白一般折疊較慢,折疊過程需要伴侶蛋白的參與,容易被Sec分泌途徑降解。枯草芽孢桿菌還會分泌多達八種蛋白酶到發(fā)酵液中,其同樣會降解表達的目的蛋白。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
為了解決以上技術(shù)問題,本發(fā)明提供一種基于芽孢桿菌的無抗表達系統(tǒng)及構(gòu)建方法,其將低背景的木糖操縱子誘導(dǎo)表達的T7RNA聚合酶,T7RNA聚合酶再專一性轉(zhuǎn)錄T7啟動子后目的基因的級聯(lián)放大表達系統(tǒng)轉(zhuǎn)入芽孢桿菌基因組中,并且刪除了中間使用的篩選標(biāo)記基因。其克服了抗生素篩選標(biāo)記基因易發(fā)生漂移,質(zhì)粒表達系統(tǒng)不穩(wěn)定,表達不可誘導(dǎo)表達量不高的缺點,建立了一種低背景可控誘導(dǎo)且高效表達的無抗表達系統(tǒng)。
解決以上技術(shù)問題的本發(fā)明中的一種基于芽孢桿菌的無抗表達系統(tǒng),其特征在于:將表達系統(tǒng)元件插入芽孢桿菌的基因組中,刪除抗性標(biāo)記元件,建立無抗的表達系統(tǒng)。避免抗生素篩選標(biāo)記基因漂移,其次可避免使用不穩(wěn)定的質(zhì)粒載體,提高系統(tǒng)穩(wěn)定性。
優(yōu)化方案所述表達系統(tǒng)為木糖—T7RNA聚合酶的級聯(lián)放大表達系統(tǒng)。建立了一種基于低背景的木糖操縱子誘導(dǎo)表達T7RNA聚合酶,T7RNA聚合酶再特異性轉(zhuǎn)錄T7啟動子后目的基因的級聯(lián)放大表達系統(tǒng),可有效解決可控誘導(dǎo)和增加表達量的問題,并且該表達系統(tǒng)利用溫度敏感質(zhì)粒pBAV1K的復(fù)制特性,被成功導(dǎo)入芽孢桿菌中的基因組中,刪除抗生素標(biāo)記基因,為低背景可控誘導(dǎo)且高效表達的無抗的表達系統(tǒng)。
所述表達系統(tǒng)的構(gòu)建方法的具體步驟如下:
(1)PCR擴增wprA基因上游片段wprA-F和wprA基因下游片段wprA下游片段wprA-R,全基因合成xylR操縱子的xylR基因啟動子及CDS區(qū)域和xylAB的啟動子區(qū)域(xylR),全基因合成T7RNA聚合酶基因的CDS片段(T7RP),通過同源重組構(gòu)建載體pBTS-T7RP。
pBTS-T7RP載體中的wprA基因片段,可以被芽孢桿菌基因組中的任意片段替換掉,其僅作為xylR-T7RP片段的插入位點,但是最佳片段為wprA基因片段,其可以敲除wprA基因,敲除后可以促進分泌蛋白分泌到發(fā)酵液中。
(2)轉(zhuǎn)化pBTS-T7RP質(zhì)粒進入枯草芽孢桿菌Z12,通過限制性培養(yǎng)和傳代培養(yǎng),分別在wprA-F和wprA-R兩個片段處完成兩次重組,得到不具有抗性的含有xylR-T7RP片段的菌株ZT7RP。
(3)PCR擴增xylAB基因上游片段xyl-F和xylAB基因下游片段xyl-R,全基因合成T7啟動子(PT7)、xylR結(jié)合位點、RBS位點、多克隆位點(MCS)和T7終止子片段(T7ter),通過同源重組,構(gòu)建pBTS-FR載體。
pBTS-FR載體中的xylAB基因片段,可以被芽孢桿菌基因組中的任意片段替換掉,其僅作為T7啟動子終止子等片段的插入位點,但是最佳的片段為xylAB基因片段,其可以敲除木糖代謝基因,促進誘導(dǎo)表達。
(4)通過PCR擴增或者全基因合成任一需要表達的基因片段,通過酶切或者同源重組等方式插入到pBTS-FR的多克隆位點,構(gòu)建表達載體pBTS-FR-X。
(5)轉(zhuǎn)化pBTS-FR-X質(zhì)粒進入枯草芽孢桿菌ZT7RP菌株,通過限制性培養(yǎng)和傳代培養(yǎng),分別在xyl-F和xyl-R兩個片段處完成兩次重組,得到不具有抗性的含有PT7-X-T7ter片段的菌株Z-X。
(6)接種Z-X到培養(yǎng)基中,培養(yǎng)溫度為25-40℃,接種后0-8h加入0.01%-1%濃度的木糖進行誘導(dǎo),如果培養(yǎng)基成分中含有木糖,可適當(dāng)減少木糖添加量或者不添加木糖,培養(yǎng)一定時間后,即可收獲菌體或者發(fā)酵液中的目標(biāo)蛋白。
所述步驟(2)中菌株為枯草芽孢桿菌Z12菌株、其它芽孢桿菌和pBTS質(zhì)粒進行溫敏復(fù)制的革蘭氏陽性菌株。
所述其它芽孢桿菌為枯草芽孢桿菌、解淀粉芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌、短小芽孢桿菌和多粘芽孢桿菌。
所述步驟(4)中的表達載體還包括含有信號肽的表達載體,其將枯草芽孢桿菌的信號肽序列,尤其是sec途徑中的信號肽,插入到待表達目的基因前,該融合蛋白在表達的時候?qū)⑼ㄟ^枯草芽孢桿菌的分泌途徑直接將目的蛋白分泌到發(fā)酵液中。
所述pBTS-T7RP核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
所述pBTS-FR核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
本發(fā)明中的表達系統(tǒng)的有益效果如下:
A、該表達系統(tǒng)的表達菌株,不含有抗性標(biāo)記片段,避免了在大規(guī)模發(fā)酵生產(chǎn)時,表達菌株中的抗性標(biāo)記片段通過基因漂移到其它致病菌中,產(chǎn)生耐藥性致病菌的危險。
B、該表達系統(tǒng)的的表達系統(tǒng)元件已經(jīng)插入到芽孢桿菌的基因組中,可以隨基因組繼續(xù)穩(wěn)定復(fù)制,避免采用質(zhì)粒載體時,表達菌株不能穩(wěn)定傳代的缺點。
C、該表達系統(tǒng)利用木糖誘導(dǎo)T7RNA聚合酶表達,T7RNA聚合酶專一性表達T7啟動子后目的基因的級聯(lián)放大表達系統(tǒng),其具有表達量大,表達量可通過誘導(dǎo)進行調(diào)控的優(yōu)點。
D、表達系統(tǒng)中含有xylR基因,其可增加芽孢桿菌xylR蛋白的量,在培養(yǎng)基中不含有木糖的情況下,可特異性地結(jié)合到T7RNA聚合酶前的xylR結(jié)合位點和待表達目的基因前的xylR結(jié)合位點,抑制T7RNA聚合酶和待表達目的基因的表達,整個表達系統(tǒng)的背景表達量極低,這樣可以利用該表達系統(tǒng)表達一些具有毒性的目的蛋白。
E、該表達系統(tǒng)不僅可以進行胞內(nèi)蛋白表達,也可以進行胞外表達,具有非常高的靈活性。
F、該表達系統(tǒng)的菌株為枯草芽孢桿菌菌株,其具有生物安全性高的特點。
附圖說明
圖1:pBTS-T7RP結(jié)構(gòu)圖
圖2:pBTS-FR結(jié)構(gòu)圖
圖3:pBTS-FR-GFP結(jié)構(gòu)圖
圖4:Z12和ZGFP菌株表達效果圖
具體實施方式
下面結(jié)合具體實施方式對本發(fā)明作進一步的詳細(xì)描述:
實施例1
1、通過EcoR I和Apa I內(nèi)切酶切割pBAV1K-T5-GFP質(zhì)粒,與合成的MCS片段進行同源重組,得到質(zhì)粒pBAV1K。
本實驗及后續(xù)試驗中的內(nèi)切酶采用Thermo公司的快速內(nèi)切酶,片段回收采用成都福際生物公司的膠回收試劑盒(DE-02011),MCS片段由金唯智生物科技有限公司合成(序列如SEQ ID NO.4所示),同源重組采用天根的EsayGeno快速重組克隆試劑盒(VI201-02),大腸桿菌菌株為top10,制備感受態(tài)采用KCM法,質(zhì)粒抽提采用福際生物的通用質(zhì)粒小量提取試劑盒(DE-01001)。
2、設(shè)計引物,擴增同義突變刪除Nde I酶切位點的pBAV1K片段,采用同源重組克隆的方式連接片段,獲得質(zhì)粒命名為pBTS。
本實驗及后續(xù)實驗中的引物由金唯智生物科技有限公司合成提供。
實施例2:
1、設(shè)計引物擴增wprA基因上游602bp的片段wprA-F;設(shè)計引物擴增wprA下游601bp的片段wprA-R;全基因合成xylR啟動子以及CDS和xylAB的啟動子區(qū)域片段xylR;全基因合成T7RNA聚合酶片段T7RP;通過同源重組構(gòu)建載體pBTS-T7RP。
高保真酶采用toyobo的KOD-Plus高保真性聚合酶(KOD-201)。
2、電轉(zhuǎn)化pBTS-T7RP進入Z12菌株,得到菌Z12-pBTS-T7RP。
3、取菌Z12-pBTS-T7RP接種到3ml LB培養(yǎng)基中,45℃,180rpm,培養(yǎng)24h;另接菌Z12-pBTS做對照。
4、取3中的菌液200ul涂布到含有30mg/L卡那霉素的LB平板上,45℃過夜培養(yǎng)。若Z12-pBTS沒有菌落生長,Z12-pBTS-T7RP有菌落生長,則得到的菌株完成第一次重組,命名為Z12-pBTS-T7RP-45。
5、接菌Z12-pBTS-T7RP-45到3ml LB培養(yǎng)基中,過夜培養(yǎng),抽提基因組(成都福際生物技術(shù)有限公司,細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒,DE-05311),PCR擴增xylR-T7RP片段進行驗證(成都福際生物技術(shù)有限公司,2×快速PCR反應(yīng)預(yù)混體系,DP-20041)。
6、取5中驗證為陽性的Z12-pBTS-T7RP-45菌株,接種到3ml LB培養(yǎng)基中,37℃,180rpm培養(yǎng),每隔8-16h傳代一次,連續(xù)傳代10次后,取菌液稀釋106倍,涂布于無抗的LB平板上,得到單菌落。
7、取5中的單菌落,同時劃線到LB和含有30mg/L卡那霉素的LB平板上,篩選無抗的菌落,需要得到5-10株無抗菌落。
8、取7中的無抗菌落,接種到3ml LB培養(yǎng)基中,37℃,180rpm過夜培養(yǎng),抽提細(xì)菌基因組,通過PCR擴增xylR-T7RP片段驗證同源重組結(jié)果(野生型或者插入T7RP片段)。取陽性的片段,進行測序驗證后得到陽性的菌株即為插入xylR-T7RP片段的菌株ZT7RP。
實施例3:
1、菌株轉(zhuǎn)化方法參見高滲轉(zhuǎn)化法(High osmolarity improves the electro-transformation efficiency of the gram-positive bacteria Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis,1999)。取待轉(zhuǎn)化菌株的新劃線單菌落,接種到約3ml GM(LB+0.5M山梨糖醇)培養(yǎng)基中,37℃,180rpm過夜培養(yǎng)。第二天早上按1:100接種到50ml GM培養(yǎng)基中,37℃,180rpm培養(yǎng),待菌液生長到OD達到0.85-0.95之間時,將菌液放到冰上預(yù)冷10min;4℃,5000g,5min,離心去上清,用等體積預(yù)冷的EM(0.5M山梨糖醇+0.5M甘露糖醇+10%甘油水溶液)重懸菌體,再次4℃,5000g,5min,離心去上清,一共重復(fù)洗滌4次;加入約1/40體積的EM重懸菌體,保證菌液濃度在1-1.3×1010cfu/ml之間。取60ul上述菌液,加入1ul待轉(zhuǎn)化質(zhì)粒,質(zhì)粒濃度大于100ng/ul,吹打混勻,然后加入預(yù)冷的1mm電擊杯。電轉(zhuǎn)化儀(Eppendorf Eporator)參數(shù)設(shè)定,2.1kV,實際電擊時間在4.0-5.0ms時,才可能有轉(zhuǎn)化菌落生長。電擊后。立即加1ml RM(LB+0.5M山梨糖醇+0.38M甘露糖醇),吹打混勻,轉(zhuǎn)入5ml無菌離心管中,37℃,180rpm培養(yǎng)3h。將菌液離心,去上清后按一定比例稀釋,取200ul涂布到含有30mg/L卡那霉素的LB平板上,37℃過夜培養(yǎng),同時涂布未經(jīng)電轉(zhuǎn)化的菌液做陰性對照。第二天早上觀察菌落生長情況,若轉(zhuǎn)化板有菌落生長,陰性對照沒有,則表明轉(zhuǎn)化成功。
實施例4:
1、設(shè)計引物擴增xylAB基因上游493bp片段xyl-F;設(shè)計引物擴增xylAB基因下游585bp片段xyl-R;全基因合成T7啟動子、xylR結(jié)合位點、RBS位點、多克隆位點、T7 終止子位點片段;通過同源重組上述三個片段與pBTS載體連接,構(gòu)建質(zhì)粒pBTS-FR。
實施例5:
1、全基因合成信號肽SPwapA和綠色熒光蛋白(GFP)片段,形成融合蛋白表達片段SPwapA-GFP,通過同源重組插入到pBTS-FR載體中,構(gòu)建成載體pBTS-FR-GFP。pBTS-FR-GFP核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
2、電轉(zhuǎn)化pBTS-FR-GFP進入ZT7RP菌株,得到菌ZT7RP-pBTS-FR-GFP。
3、取菌ZT7RP-pBTS-FR-GFP接種到3ml LB培養(yǎng)基中,45℃,180rpm,培養(yǎng)24h;另接菌ZT7RP-pBTS做對照。
4、取3中的菌液200ul涂布到含有30mg/L卡那霉素的LB平板上,45℃過夜培養(yǎng)。若Z12-pBTS沒有菌落生長,ZT7RP-pBTS-FR-GFP有菌落生長,則得到的菌株完成第一次重組,命名為ZT7RP-pBTS-FR-GFP-45。
5、接菌ZT7RP-pBTS-FR-GFP-45到3ml LB培養(yǎng)基中,過夜培養(yǎng),抽提基因組(成都福際生物技術(shù)有限公司,細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒,DE-05311),PCR擴增xyl片段進行驗證(成都福際生物技術(shù)有限公司,2×快速PCR反應(yīng)預(yù)混體系,DP-20041)。
6、取5中驗證為陽性的Z12-pBTS-FR-GFP-45菌株,接種到3ml LB基中37℃,180rpm培養(yǎng),每隔8-16h傳代一次,連續(xù)傳代10次后,取菌液稀釋106倍,涂布于無抗的LB平板上,得到單菌落。
7、取6中的單菌落,同時劃線到LB和含有30mg/L卡那霉素的LB平板上,篩選無抗的菌落,需要得到5-10株無抗菌落。
8、取7中的無抗菌落,接種到3ml LB培養(yǎng)基中,37℃,180rpm過夜培養(yǎng),抽提細(xì)菌基因組,通過PCR擴增GFP片段驗證同源重組結(jié)果(野生型或者插入GFP基因)。取陽性的片段,送金唯智生物科技有限公司進一步進行測序驗證,得到陽性的菌株即為插入GFP基因的菌株ZGFP。
7、取ZGFP菌株同時劃線到LB平板和LB平板+0.25%木糖,另劃線Z12做對照,37℃過夜培養(yǎng)。觀察發(fā)現(xiàn)添加木糖誘導(dǎo)的ZGFP菌株有明顯的綠色熒光蛋白表達,未添加木糖誘導(dǎo)的ZGFP菌株沒有綠色熒光蛋白表達;Z12菌株不管在什么培養(yǎng)基中,都沒有綠色熒光蛋白表達。詳見附件圖4。
8、接種ZGFP菌株到3ml液體LB培養(yǎng)基和3ml液體LB培養(yǎng)基+0.25%木糖,另接種Z12做對照。37℃,180rpm培養(yǎng)24h,離心去掉菌體沉淀,可以看到ZGFP菌添加木糖誘導(dǎo)后,發(fā)酵液呈現(xiàn)綠色熒光,但是未誘導(dǎo)的ZGFP菌株和Z12菌株發(fā)酵液并未出現(xiàn)綠色熒光。
實施例6:
1、全基因合成綠色熒光蛋白(GFP)片段,通過同源重組插入到pBTS-FR載體中,構(gòu)建成載體pBTS-FR-GFP2。
2、電轉(zhuǎn)化pBTS-FR-GFP2進入ZT7RP菌株,得到菌ZT7RP-pBTS-FR-GFP2。
3、取菌ZT7RP-pBTS-FR-GFP2接種到3ml LB培養(yǎng)基中,45℃,180rpm,培養(yǎng)24h;另接菌ZT7RP-pBTS做對照。
4、取3中的菌液200ul涂布到含有30mg/L卡那霉素的LB平板上,45℃過夜培養(yǎng)。若Z12-pBTS沒有菌落生長,ZT7RP-pBTS-FR-GFP2有菌落生長,則得到的菌株完成第一次重組,命名為ZT7RP-pBTS-FR-GFP2-45。
5、接菌ZT7RP-pBTS-FR-GFP2-45到3ml LB培養(yǎng)基中,過夜培養(yǎng),抽提基因組(成都福際生物技術(shù)有限公司,細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒,DE-05311),PCR擴增xyl片段進行驗證(成都福際生物技術(shù)有限公司,2×快速PCR反應(yīng)預(yù)混體系,DP-20041)。
6、取5中驗證為陽性的Z12-pBTS-FR-GFP2-45菌株,接種到3ml LB基中37℃,180rpm培養(yǎng),每隔8-16h傳代一次,連續(xù)傳代10次后,取菌液稀釋106倍,涂布于無抗的LB平板上,得到單菌落。
7、取6中的單菌落,同時劃線到LB和含有30mg/L卡那霉素的LB平板上,篩選無抗的菌落,需要得到5-10株無抗菌落。
8、取7中的無抗菌落,接種到3ml LB培養(yǎng)基中,37℃,180rpm過夜培養(yǎng),抽提細(xì)菌基因組,通過PCR擴增GFP片段驗證同源重組結(jié)果(野生型或者插入GFP基因)。取陽性的片段,送金唯智生物科技有限公司進一步進行測序驗證,得到陽性的菌株即為插入GFP基因的菌株ZGFP2。
7、接種ZGFP2菌株到3ml液體LB培養(yǎng)基和3ml液體LB培養(yǎng)基+0.25%木糖,另接種Z12做對照。37℃,180rpm培養(yǎng)24h,離心去掉上清,可以看到ZGFP2菌添加木糖誘導(dǎo)后,菌體呈現(xiàn)綠色熒光,但是未誘導(dǎo)的ZGFP2菌株和Z12菌株的菌體并未出現(xiàn)綠色熒光。
實施例7:
1、全基因合成BPN蛋白酶基因(BPN是解淀粉芽孢桿菌的蛋白酶基因,本身含有信號肽,可以直接分泌到發(fā)酵液中)片段,通過NdeI和XhoI酶切插入到pBTS-FR載體中,構(gòu)建成載體pBTS-FR-BPN。
2、電轉(zhuǎn)化pBTS-FR-BPN進入ZT7RP菌株,得到菌ZT7RP-pBTS-FR-BPN。
3、取菌ZT7RP-pBTS-FR-BPN接種到3ml LB培養(yǎng)基中,45℃,180rpm,培養(yǎng)24h;另接菌ZT7RP-pBTS做對照。
4、取3中的菌液200ul涂布到含有30mg/L卡那霉素的LB平板上,45℃過夜培養(yǎng)。若Z12-pBTS沒有菌落生長,ZT7RP-pBTS-FR-BPN有菌落生長,則得到的菌株完成第一次重組,命名為ZT7RP-pBTS-FR-BPN-45。
5、接菌ZT7RP-pBTS-FR-BPN-45到3ml LB培養(yǎng)基中,過夜培養(yǎng),抽提基因組(成都福際生物技術(shù)有限公司,細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒,DE-05311),PCR擴增BPN片段進行驗證(成都福際生物技術(shù)有限公司,2×快速PCR反應(yīng)預(yù)混體系,DP-20041)。
6、取5中驗證為陽性的Z12-pBTS-FR-BPN-45菌株,接種到3ml LB基中37℃,180rpm培養(yǎng),每隔8-16h傳代一次,連續(xù)傳代8次后,取菌液稀釋106倍,涂布于無抗的LB平板上,得到單菌落。
7、取6中的單菌落,同時劃線到LB和含有30mg/L卡那霉素的LB平板上,篩選無抗的菌落,需要得到5-10株無抗菌落。
8、取7中的無抗菌落,接種到3ml LB培養(yǎng)基中,37℃,180rpm過夜培養(yǎng),抽提細(xì)菌基因組,通過PCR擴增BPN片段驗證同源重組結(jié)果(野生型或者插入BPN基因)。取陽性的片段,送金唯智生物科技有限公司進一步進行測序驗證,得到陽性的菌株即為插入BPN基因的菌株ZBPN。
7、接種ZBPN菌株到3ml液體LB培養(yǎng)基和3ml液體LB培養(yǎng)基+0.25%木糖,另接種Z12 做對照。37℃,180rpm培養(yǎng)24h,離心去掉菌體沉淀,采用SB/T 10317-1999中的方法測定上清液中的酶活,確認(rèn)ZBPN菌株誘導(dǎo)后酶活達到約1000U/ml,未誘導(dǎo)的ZBPN菌株以及Z12菌株的酶活都低于檢測限。
8、針對ZBPN菌株進行發(fā)酵優(yōu)化,最終確定最佳培養(yǎng)條件如下:接種量為1%;培養(yǎng)基為豆粕粉25g/L,玉米漿粉5g/L,磷酸二氫鉀5g/L,pH8.5,121℃滅菌;培養(yǎng)溫度為30℃;250ml錐形瓶中含有30ml培養(yǎng)基,轉(zhuǎn)速為200rpm;在接種同時加入0.25%的木糖進行誘導(dǎo);培養(yǎng)36h時,BPN蛋白酶酶活可以達到最大值,可以達到約15000U/ml。
以上所述僅為本發(fā)明的較佳實施例而已,并不用以限制本發(fā)明,凡在本發(fā)明的精神和原則之內(nèi)所作的任何修改、等同替換和改進等,均應(yīng)包含在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。
SEQUENCE LISTING
<110> 成都美溢德生物技術(shù)有限公司
<120> 一種基于芽孢桿菌的無抗表達系統(tǒng)及構(gòu)建方法
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<170> PatentIn version 3.3
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<211> 8118
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<213> 人工合成
<220>
<223> pBTS序列
<400> 1
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<223> pBTS-FR-GFP序列
<400> 3
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<210> 4
<211> 2847
<212> DNA
<213> 人工合成
<220>
<223> pBTS(含MCS片段)序列
<400> 4
gacgtcgaattcgaggtacctgcggccgcaggatccatctagacgctcgagagctgcagtgaagcttcagggcccgatcgatgccgccgcttaattaattaatccagaggcatcaaataaaacgaaaggctcagtcgaaagactgggcctttcgttttatctgttgtttgtcggtgaacgctctcctgagtaggacaaatccgccgccctagacctagtgtcattttatttcccccgtttcagcatcaagaacctttgcataacttgctctatatccacactgataattgccctcaaaccataatctaaaggcgctagagtttgttgaaacaatatcttttacatcattcgtatttaaaattccaaactccgctcccctaaggcgaataaaagccattaaatcttttgtatttaccaaattatagtcatccactatatctaagagtaaattcttcaattctcttttttggctttcatcaagtgttatatagcggtcaatatcaaaatcattaatgttcaaaatatcttttttgtcgtatatatgtttattcttagcaatagcgtcctttgattcatgagtcaaatattcataagaacctttgatataatcaagtatctcaacatgagcaactgaactattccccaattttcgcttaatcttgttcctaacgctttctattgttacaggatttcgtgcaatatatataacgtgatagtgtggttttttatagtgctttccatttcgtataacatcactactattccatgtatctttatcttttttttcgtccatatcgtgtaaaggactgacagccatagatacgcccaaactctctaatttttccttccaatcattaggaattgagtcaggatataataaaaatccaaaatttctagctttagtatttttaatagccatgatataattaccttatcaaaaacaagtagcgaaaactcgtatccttctaaaaacgcgagctttcgcttattttttttgttctgattcctttcttgcatattcttctatagctaacgccgcaaccgcagattttgaaaaacctttttgtttcgccatatctgttaattttttatcttgctcttttgtcagagaaatcataactctttttttcgattctgaaatcaccatttaaaaaactccaatcaaataattttataaagttagtgtatcactttgtaatcataaaaacaacaataaagctacttaaatatagatttataaaaaacgttggcgaaaacgttggcgattcgttggcgattgaaaaaccccttaaacccttgagccagttgggatagagcgtttttggcacaaaaattggcactcggcacttaatggggggtcgtagtacggaagcaaaattcgcttcctttccccccatttttttccaaattccaaatttttttcaaaaattttccagcgctaccgctcggcaaaattgcaagcaatttttaaaatcaaacccatgagggaatttcattccctcatactcccttgagcctcctccaaccgaaatagaagggcgctgcgcttattatttcattcagtcatcggctttcataatctaacagacaacatcttcgctgcaaagccacgctacgctcaagggcttttacgctacgataacgcctgttttaacgattatgccgataactaaacgaaataaacgctaaaacgtctcagaaacgattttgagacgttttaataaaaaatcgcctagtgcttggattctcaccaataaaaaacgcccggcggcaaccgagcgttctgaacaaatccagatggagttctgaggtcattactggatctatcaacaggagtccaagcgagctcggtactaaaacaattcatccagtaaaatataatattttattttctcccaatcaggcttgatccccagtaagtcaaaaaatagctcgacatactgttcttccccgatatcctccctgatcgaccggacgcagaaggcaatgtcataccacttgtccgccctgccgcttctcccaagatcaataaagccacttactttgccatctttcacaaagatgttgctgtctcccaggtcgccgtgggaaaagacaagttcctcttcgggcttttccgtctttaaaaaatcatacagctcgcgcggatctttaaatggagtgtcttcttcccagttttcgcaatccacatcggccagatcgttattcagtaagtaatccaattcggctaagcggccgtctaagctattcgtatagggacaatccgatatgtcgatggagtgaaagagcctgatgcactccgcatacagctcgatagtcttttcagggctttgttcatcttcatacccttccgagcaaaggacgccatcggcctcactcatgagcagattgctccagccatcatgccgttcaaagtgcaggacctttggaacaggcagctttccttccagccatagcatcatgtccttttcccgttccacatcataggtggtccctttataccggctgtccgtcatttttaaatataggatttcattttctcccaccagcttatataccttagcaggagacattccttccgtatcttttacgcagcggtattcttcgatcagttttttcaattccggtgatattctcattttagccatttattatttccttcctcttttctacagtatttaaagataccccaagaagctaattataacaagacgaactccaattcactgttccttgcattctaaaaccttaaatacagaaaacagccttttcaaagttgttttcaaagttggcgtataacatagtatcgacggagccgattttgaaaccacaattatgatagaattt 2847