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一種全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒及提取方法與流程

文檔序號:11145194閱讀:574來源:國知局

本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,尤其是涉及一種全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒及提取方法。



背景技術(shù):

公知的,自1990年起,國際人類基因組計劃正式啟動,社會各界對人類基因組的研究進(jìn)入了飛速發(fā)展階段,人類全血基因組DNA提取對于人類基因組遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建、測序和基因識別是最為重要的基礎(chǔ)性工作,DNA提取的質(zhì)量與產(chǎn)量直接影響下游實驗?zāi)芊耥樌M(jìn)行。

目前,全血基因組DNA提取試劑盒種類繁多,但大部分試劑盒都需要沉淀、離心等操作,提取過程復(fù)雜、耗時長、效率低,并且無法實現(xiàn)高通量、自動化操作;即使少數(shù)試劑盒可以實現(xiàn)高通量、自動化操作,也需要搭配昂貴的自動化儀器,無法實現(xiàn)高通量提取方案的良好普及,因此提供一種高通量、方便快捷、結(jié)果穩(wěn)定的全血基因組DNA提取試劑盒成為本領(lǐng)域技術(shù)人員的基本訴求。



技術(shù)實現(xiàn)要素:

為了克服背景技術(shù)中的不足,本發(fā)明公開了一種全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒及提取方法,實現(xiàn)了無需離心或搭配自動化儀器,可在50分鐘內(nèi)實現(xiàn)96個樣本同時提取的目的。

為了實現(xiàn)所述發(fā)明目的,本發(fā)明采用如下技術(shù)方案:

一種全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,包括裂解液1、裂解液2、結(jié)合液和磁珠,其中裂解液1包括以下組分:鹽酸胍2~8mol/L,1%~10%的曲拉通-100(V/V),1%~10%的吐溫-20(V/V), 1%~10%的chelex-100 (m/V),2~10mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,20~100mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,鹽酸調(diào)節(jié)溶液pH至4.5,溶劑為去離子水;裂解液2包括以下組分:20mg/ml的蛋白酶K,50mmol/L的三甲基氨基甲烷,鹽酸調(diào)節(jié)溶液pH至8.0;結(jié)合液包括以下組分:1~3mol/L的氯化鈉,40%~90%的異丙醇 (V/V),溶劑為去離子水。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,還包括洗滌液I,洗滌液I包括以下組分:2~8mol/L的鹽酸胍,1~3mol/L的氯化鈉,20%~30%的異丙醇(V/V),20%~30%的乙醇(V/V),1~4mol/L的PEG-6000,2~10mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,20~100mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,溶劑為去離子水,鹽酸調(diào)節(jié)溶液pH至4.5。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,還包括洗滌液II,洗滌液II為60%~80%的乙醇 (V/V)。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,還包括洗脫液,洗脫液包括以下組分:1~20mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,1~20mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,溶劑為去離子水,鹽酸調(diào)節(jié)pH至8.0。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,所述磁珠為洛陽吉恩特生物科技有限公司生產(chǎn)的DNA提取磁珠,固含量為50~100mg/ml。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,還包括耗材,所述耗材包括96孔深孔板、96針攪拌套和磁力板,所述96孔深孔板分離的設(shè)置在磁力板上,所述96針攪拌套設(shè)置在96孔深孔板內(nèi)。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,所述去離子水的用量根據(jù)所需體積而定量。

一種全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒及提取方法,具體包括以下步驟:

(1)、將全血樣本送至96孔深孔板內(nèi),加入裂解液1和裂解液2,金屬浴37度,30min后取下;

(2)、接上一步驟,加入結(jié)合液與磁珠,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(3)、接上一步驟,加入洗滌液I,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(4)、接上一步驟,加入洗滌液II,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(5)、接上一步驟,將96孔深孔板置于37度金屬浴,5min后取下,加入洗脫液,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于37度金屬浴,10min后取下;將96孔深孔板置于磁力板上,磁分離完全后,將上清轉(zhuǎn)移至新板中,進(jìn)行下游實驗。

由于采用了上述技術(shù)方案,本發(fā)明所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒及提取方法具有如下有益效果:

1、通過裂解液1和裂解液2的配合使用,整個操作過程無需離心,操作更加簡便;通過結(jié)合液、磁珠和96針攪拌套的配合使用,可實現(xiàn)高通量的全血DNA提取;通過96孔深孔板和96針攪拌套的配合使用,本方案可在50分鐘內(nèi)完成96個樣本的同時提取,大大提高了工作效率;

2、通過結(jié)合液和磁珠的配合使用,本方案的靈敏度明顯提高,可從200ul全血中提取5ug以上的DNA,現(xiàn)有技術(shù)為3ug以上,且無需使用昂貴的自動化儀器,成本較低,能夠普及與各種類型的實驗室;

3、本方案不使用氯仿、酚等有毒物質(zhì);

4、本方案的提取過程均在37度下進(jìn)行,相比于現(xiàn)有技術(shù)的55度-70度的提取過程,本方案有效避免了高溫對人體的潛在燙傷風(fēng)險。

具體實施方式

通過下面的實施例可以詳細(xì)的解釋本發(fā)明,公開本發(fā)明的目的旨在保護(hù)本發(fā)明范圍內(nèi)的一切技術(shù)改進(jìn)。

本發(fā)明所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,包括裂解液1、裂解液2、結(jié)合液和磁珠,其中裂解液1包括以下組分:鹽酸胍2~8mol/L,1%~10%的曲拉通-100(V/V),1%~10%的吐溫-20(V/V), 1%~10%的chelex-100 (m/V),2~10mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,20~100mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,鹽酸調(diào)節(jié)溶液pH至4.5,溶劑為去離子水;裂解液2包括以下組分:20mg/ml的蛋白酶K,50mmol/L的三甲基氨基甲烷,鹽酸調(diào)節(jié)溶液pH至8.0;結(jié)合液包括以下組分:1~3mol/L的氯化鈉,40%~90%的異丙醇 (V/V),溶劑為去離子水。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,還包括洗滌液I,洗滌液I包括以下組分:2~8mol/L的鹽酸胍,1~3mol/L的氯化鈉,20%~30%的異丙醇(V/V),20%~30%的乙醇(V/V),1~4mol/L的PEG-6000,2~10mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,20~100mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,溶劑為去離子水,鹽酸調(diào)節(jié)溶液pH至4.5。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,還包括洗滌液II,洗滌液II為60%~80%的乙醇 (V/V)。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,還包括洗脫液,洗脫液包括以下組分:1~20mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,1~20mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,溶劑為去離子水,鹽酸調(diào)節(jié)pH至8.0,。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,所述磁珠為洛陽吉恩特生物科技有限公司生產(chǎn)的DNA提取磁珠,固含量為50~100mg/ml。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,還包括耗材,所述耗材包括96孔深孔板、96針攪拌套和磁力板,所述96孔深孔板分離的設(shè)置在磁力板上,所述96針攪拌套設(shè)置在96孔深孔板內(nèi)。

所述的全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒,所述去離子水的用量根據(jù)所需體積而定量。

一種全血基因組DNA高通量板式提取試劑盒及提取方法,具體包括以下步驟:

(1)、將全血樣本送至96孔深孔板內(nèi),加入裂解液1和裂解液2,金屬浴37度,30min后取下;

(2)、接上一步驟,加入結(jié)合液與磁珠,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(3)、接上一步驟,加入洗滌液I,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(4)、接上一步驟,加入洗滌液II,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(5)、接上一步驟,將96孔深孔板置于37度金屬浴,5min后取下,加入洗脫液,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于37度金屬浴,10min后取下;將96孔深孔板置于磁力板上,磁分離完全后,將上清轉(zhuǎn)移至新板中,進(jìn)行下游實驗。

實施例1

1)、裂解液1的配置:先在容量瓶中加入去離子水,加入濃度為4mol/L的鹽酸胍,3%的曲拉通-100(V/V),5%的吐溫-20(V/V),3%的Chelex-100(m/V),6mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,40mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,用去離子水定容至所需體積,用鹽酸調(diào)節(jié)PH值至4.5;

2)、裂解液2的配置:20mg/ml的蛋白酶K,50mmol/L的三甲基氨基甲烷,鹽酸調(diào)節(jié)溶液pH至8.0;

3)、結(jié)合液的配置:先在容量瓶中加入去離子水,加入濃度為1.5mol/L的氯化鈉,50%的異丙醇(V/V),用去離子水定容至所需體積;

4)、洗滌液I的配置:先在容量瓶中加入去離子水,加入濃度為3 mol/L的鹽酸胍,1.5 mol/L的氯化鈉,25%的異丙醇(V/V),20%的乙醇(V/V),2 mol/L的PEG-6000,2mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,30mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,用去離子水定容至所需體積,用鹽酸調(diào)節(jié)PH值至4.5;

5)、洗滌液II的配置:75%的乙醇(V/V);

6)、洗脫液的配置:先在容量瓶中加入少量去離子水,加入濃度為10mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,5mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,用去離子水定容至所需體積,用鹽酸調(diào)節(jié)PH值至8.0;

提取方法:

(1)、將100ul全血樣本送至96孔深孔板內(nèi),加入300ul裂解液1和10ul裂解液2,金屬浴37度,30min后取下;

(2)、接上一步驟,加入300ul結(jié)合液與10ul磁珠,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(3)、接上一步驟,加入600ul洗滌液I,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(4)、接上一步驟,加入400ul洗滌液II,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(5)、接上一步驟,將96孔深孔板置于37度金屬浴,5min后取下,加入100ul洗脫液,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于37度金屬浴,10min后取下;將96孔深孔板置于磁力板上,磁分離完全后,將上清轉(zhuǎn)移至新板中,進(jìn)行下游實驗。

實施例2

1)、裂解液1的配置:先在容量瓶中加入去離子水,加入濃度為6mol/L的鹽酸胍,7%的曲拉通-100(V/V),3%的吐溫-20(V/V),6%的Chelex-100(m/V),3mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,70mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,用去離子水定容至所需體積,用鹽酸調(diào)節(jié)PH值至4.5;

2)、裂解液2的配置:20mg/ml的蛋白酶K,50mmol/L的三甲基氨基甲烷,鹽酸調(diào)節(jié)溶液pH至8.0;

3)、結(jié)合液的配置:先在容量瓶中加入去離子水,加入濃度為2mol/L的氯化鈉,70%的異丙醇(V/V),用去離子水定容至所需體積;

4)、洗滌液I的配置:先在容量瓶中加入去離子水,加入濃度為6 mol/L的鹽酸胍,2 mol/L的氯化鈉,20%的異丙醇(V/V),25%的乙醇(V/V),3 mol/L的PEG-6000,6mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,70mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,用去離子水定容至所需體積,用鹽酸調(diào)節(jié)PH值至4.5;

5)、洗滌液II的配置:70%的乙醇(V/V);

6)、洗脫液的配置:先在容量瓶中加入少量去離子水,加入濃度為15mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,10mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,用去離子水定容至所需體積,用鹽酸調(diào)節(jié)PH值至8.0;

提取方法:

(1)、將100ul全血樣本送至96孔深孔板內(nèi),加入300ul裂解液1和10ul裂解液2,金屬浴37度,30min后取下;

(2)、接上一步驟,加入300ul結(jié)合液與10ul磁珠,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(3)、接上一步驟,加入600ul洗滌液I,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(4)、接上一步驟,加入400ul洗滌液II,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(5)、接上一步驟,將96孔深孔板置于37度金屬浴,5min后取下,加入100ul洗脫液,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于37度金屬浴,10min后取下;將96孔深孔板置于磁力板上,磁分離完全后,將上清轉(zhuǎn)移至新板中,進(jìn)行下游實驗。

實施例3

1)、裂解液1的配置:先在容量瓶中加入去離子水,加入濃度為8mol/L的鹽酸胍,9%的曲拉通-100(V/V),10%的吐溫-20(V/V),10%的Chelex-100(m/V),9mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,100mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,用去離子水定容至所需體積,用鹽酸調(diào)節(jié)PH值至4.5;

2)、裂解液2的配置:20mg/ml的蛋白酶K,50mmol/L的三甲基氨基甲烷,鹽酸調(diào)節(jié)溶液pH至8.0;

3)、結(jié)合液的配置:先在容量瓶中加入去離子水,加入濃度為3mol/L的氯化鈉,90%的異丙醇(V/V),用去離子水定容至所需體積;

4)、洗滌液I的配置:先在容量瓶中加入去離子水,加入濃度為8 mol/L的鹽酸胍,3mol/L的氯化鈉,30%的異丙醇(V/V),30%的乙醇(V/V),4 mol/L的PEG-6000,10mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,100mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,用去離子水定容至所需體積,用鹽酸調(diào)節(jié)PH值至4.5;

5)、洗滌液II的配置:70%的乙醇(V/V);

6)、洗脫液的配置:先在容量瓶中加入少量去離子水,加入濃度為15mmol/L的乙二胺四乙酸二鈉,10mmol/L的三羥甲基氨基甲烷,用去離子水定容至所需體積,用鹽酸調(diào)節(jié)PH值至8.0;

提取方法:

(1)、將300ul全血樣本送至96孔深孔板內(nèi),加入500ul裂解液1和20ul裂解液2,金屬浴37度,30min后取下;

(2)、接上一步驟,加入500ul結(jié)合液與15ul磁珠,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(3)、接上一步驟,加入800ul洗滌液I,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(4)、接上一步驟,加入500ul洗滌液II,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于磁力板上,等待磁分離完全后,吸棄廢液;

(5)、接上一步驟,將96孔深孔板置于37度金屬浴,5min后取下,加入100ul洗脫液,利用96針攪拌套進(jìn)行攪拌,將96孔深孔板置于37度金屬浴,10min后取下;將96孔深孔板置于磁力板上,磁分離完全后,將上清轉(zhuǎn)移至新板中,進(jìn)行下游實驗。

本發(fā)明所述的本發(fā)明未詳述部分為現(xiàn)有的技術(shù)。

為了公開本發(fā)明的發(fā)明目的而在本文中選用的實施例,當(dāng)前認(rèn)為是適宜的,但是,應(yīng)了解的是,本發(fā)明旨在包括一切屬于本構(gòu)思和發(fā)明范圍內(nèi)的實施例的所有變化和改進(jìn)。

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