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植物抗旱相關(guān)蛋白AsTMK1及其編碼基因和應(yīng)用的制作方法

文檔序號(hào):11145130閱讀:869來(lái)源:國(guó)知局
本發(fā)明涉及基因工程領(lǐng)域,具體地,本發(fā)明涉及植物抗旱相關(guān)蛋白AsTMK1及其編碼基因和應(yīng)用。
背景技術(shù)
:小麥作為我國(guó)重要的糧食作物之一,在國(guó)民經(jīng)濟(jì)中占有非常重要的地位。然而,每年因干旱、鹽堿等逆境脅迫條件嚴(yán)重影響著小麥的產(chǎn)量和品質(zhì),制約著我國(guó)小麥糧食安全。蛋白激酶是一類催化蛋白質(zhì)磷酸化反應(yīng)的酶,目前研究比較多的是絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶的促分裂原活化蛋白激酶(MitogenActivatedProteinKinase,MAPK)。在擬南芥原生質(zhì)體中,MKK2能被冷、鹽脅迫激活,因此,克隆、分離抗逆相關(guān)MAPK蛋白激酶基因改良和提高作物的抗逆性具有非常重要的意義。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明的目的是提供一種植物抗旱相關(guān)蛋白AsTMK1。本發(fā)明的再一目的是提供編碼上述植物抗旱相關(guān)蛋AsTMK1的基因。本發(fā)明的另一目的是提供包含上述基因的重組載體。本發(fā)明的另一目的是提供包含上述基因的轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系。本發(fā)明的另一目的提供上述植物抗旱相關(guān)蛋白AsTMK1的應(yīng)用。本發(fā)明所提供的抗旱相關(guān)蛋白AsTMK1,來(lái)源于燕麥,其氨基酸序列如SEQIDNO.1所示。本發(fā)明的蛋白激酶由371個(gè)氨基酸殘基組成,是MAPK類蛋白激酶。自SEQIDNO.1的氨基末端第20-40位氨基酸殘基是ATP結(jié)合域,自SEQIDNO.1的第116-138位氨基酸殘基為絲氨酸/蘇氨酸結(jié)合域。為了使蛋白AsTMK1便于純化,可在由SEQIDNO.1所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì)的氨基末端或羧基末端連接上如表1所示的標(biāo)簽。表1標(biāo)簽的序列標(biāo)簽殘基序列Poly-Arg5-6(通常為5個(gè))RRRRRPoly-His2-10(通常為6個(gè))HHHHHHFLAG8DYKDDDDKStrep-tagII8WSHPQFEKc-myc10EQKLISEEDL根據(jù)本發(fā)明所公開(kāi)的SEQIDNO.1序列,本發(fā)明的轉(zhuǎn)錄因子AsTMK1可人工合成,也可先合成其編碼基因,再進(jìn)行生物表達(dá)得到。根據(jù)本發(fā)明的AsTMK1編碼基因具有如SEQIDNO.2所示cDNA序列。含有AsTMK1基因的表達(dá)盒、重組表達(dá)載體、轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系及重組菌均屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍??捎矛F(xiàn)有的植物表達(dá)載體構(gòu)建含有AsTMK1基因的重組表達(dá)載體。所述植物表達(dá)載體包括雙元農(nóng)桿菌載體和可用于植物微彈轟擊的載體等。所述植物表達(dá)載體還可包含外源基因的3’端非翻譯區(qū)域,即包含聚腺苷酸信號(hào)和任何其它參與mRNA加工或基因表達(dá)的DNA片段。所述聚腺苷酸信號(hào)可引導(dǎo)聚腺苷酸加入到mRNA前體的3’端,如農(nóng)桿菌冠癭瘤誘導(dǎo)(Ti)質(zhì)粒基因(如胭脂合成酶Nos基因)、植物基因3’端轉(zhuǎn)錄的非翻譯區(qū)均具有類似功能。使用AsTMK1構(gòu)建重組植物表達(dá)載體時(shí),在其轉(zhuǎn)錄起始核苷酸前可加上任何一種增強(qiáng)型啟動(dòng)子或組成型啟動(dòng)子,如花椰菜花葉病毒(CaMV)35S啟動(dòng)子、玉米的泛素啟動(dòng)子(Ubiquitin),它們可單獨(dú)使用或與其它植物啟動(dòng)子結(jié)合使用;此外,使用本發(fā)明的基因構(gòu)建植物表達(dá)載體時(shí),還可使用增強(qiáng)子,包括翻譯增強(qiáng)子或轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子,這些增強(qiáng)子區(qū)域可以是ATG起始密碼子或鄰接區(qū)域起始密碼子等,但必需與編碼序列的閱讀框相同,以保證整個(gè)序列的正確翻譯。所述翻譯控制信號(hào)和起始密碼子的來(lái)源是廣泛的,可以是天然的,也可以是合成的。翻譯起始區(qū)域可以來(lái)自轉(zhuǎn)錄起始區(qū)域或結(jié)構(gòu)基因。為了便于對(duì)轉(zhuǎn)基因植物細(xì)胞或植物進(jìn)行鑒定及篩選,可對(duì)所用植物表達(dá)載體進(jìn)行加工,如加入可在植物中表達(dá)的編碼可產(chǎn)生顏色變化的酶或發(fā)光化合物的基因(GUS基因、螢光素酶基因等)、具有抗性的抗生素標(biāo)記物(慶大霉素標(biāo)記物、卡那霉素標(biāo)記物等)或是抗化學(xué)試劑標(biāo)記基因(如抗除莠劑基因)等。從轉(zhuǎn)基因植物的安全性考慮,可不加任何選擇性標(biāo)記基因,直接以逆境篩選轉(zhuǎn)化植株。本發(fā)明的另一個(gè)目的是提供一種培育耐逆植物的方法。本發(fā)明所提供的培育耐逆植物的方法,是將上述任一種含有AsTMK1基因的重組表達(dá)載體導(dǎo)入植物細(xì)胞中,得到耐逆植物。利用任何一種可以引導(dǎo)外源基因在植物中表達(dá)的載體,將本發(fā)明所提供的MAPK蛋白激酶AsTMK1基因?qū)胫参锛?xì)胞,可獲得對(duì)干旱和鹽等非生物逆境脅迫耐受力增強(qiáng)的轉(zhuǎn)基因細(xì)胞系及轉(zhuǎn)基因植株。攜帶有編碼基因的表達(dá)載體可通過(guò)使用Ti質(zhì)粒、Ri質(zhì)粒、植物病毒載體、直接DNA轉(zhuǎn)化、顯微注射、電導(dǎo)、農(nóng)桿菌介導(dǎo)等常規(guī)生物學(xué)方法轉(zhuǎn)化植物細(xì)胞或組織,并將轉(zhuǎn)化的植物組織培育成植株。被轉(zhuǎn)化的植物宿主既可以是單子葉植物,也可以是雙子葉植物,如:擬南芥、小麥、燕麥、擬南芥、水稻、玉米、黃瓜、番茄、楊樹(shù)、草坪草、苜宿等。本發(fā)明以燕麥(AvenasativaL.)為實(shí)驗(yàn)材料,得到了抗逆相關(guān)的AsTMK1蛋白及其編碼基因,并將其導(dǎo)入小麥,顯著提高了轉(zhuǎn)基因小麥的抗旱性。本發(fā)明的抗旱相關(guān)蛋白及其編碼基因?qū)Ω牧肌⒃鰪?qiáng)小麥抗逆性,提高產(chǎn)量、加速抗逆分子育種進(jìn)程,以及有效節(jié)省水資源具有十分重要的理論和實(shí)際意義。下面結(jié)合附圖及具體實(shí)施例對(duì)本發(fā)明做進(jìn)一步說(shuō)明。附圖說(shuō)明圖1顯示AsTMK1轉(zhuǎn)基因小麥分子檢測(cè),其中,M:Marker;1:H2O對(duì)照;2:陰性對(duì)照;3-10:AsTMK1轉(zhuǎn)基因植株樣品。圖2顯示AsTMK1轉(zhuǎn)基因小麥的抗旱鑒定結(jié)果。具體實(shí)施方式以下實(shí)施例中未作具體說(shuō)明的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)方法,均參照《分子克隆實(shí)驗(yàn)指南》(第三版)J.薩姆布魯克一書(shū)中所列的具體方法進(jìn)行,或者按照試劑盒和產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。以下的實(shí)施例便于更好地理解本發(fā)明,但并不限定本發(fā)明。實(shí)施例1:燕麥抗旱、耐鹽相關(guān)AsTMK1基因的cDNA克隆。對(duì)生長(zhǎng)30天左右的燕麥幼苗進(jìn)行干旱處理5小時(shí),用Trizol提取燕麥總RNA。應(yīng)用5’RACE試劑盒(GIBCOBRL,CAT.NO.18374-058)和3’RACE試劑盒(GIBCOBRL,CAT.NO.18373-019)獲得AsTMK1基因的全長(zhǎng)序列1113bp。用Trizol提取燕麥幼苗的總RNA,用superscriptII(invitrogen)反轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄獲得到cDNA。根據(jù)AsTMK1基因編碼區(qū)序列設(shè)計(jì)引物P1和P2。以反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板,用引物P1和P2進(jìn)行PCR擴(kuò)增。引物P1和P2的序列如下:P1:5’-ATGGACGGCGCTCCGGTGCC-3’,P2:5’-TTACGCGTCGACGTATCGGAA-3’。對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),得到分子量約為1kb左右的條帶。用瓊脂糖凝膠回收試劑盒(TIANGEN)回收該片段。將該回收片段與pGEM-TEasy(Promega)連接,參照Cohen等的方法(ProcNatlAcadSci,69:2110),將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,根據(jù)pGEM-TEasy載體上的氨卞青霉素抗性標(biāo)記篩選陽(yáng)性克隆,得到含有回收片段的重組質(zhì)粒。以該重組質(zhì)粒載體上的T7和SP6啟動(dòng)子序列為引物對(duì)其進(jìn)行核苷酸序列測(cè)定,測(cè)序結(jié)果表明擴(kuò)增到的AsTMK1基因的開(kāi)放閱讀框(ORF)為SEQIDNo.2的自5’末端第1至1113位脫氧核糖核苷酸,編碼氨基酸序列是SEQIDNo.1的蛋白質(zhì)。將含序列SEQIDNo.2所示AsTMK1基因的重組載體命名為pTE-AsTMK1。將AsTMK1基因的序列進(jìn)行比對(duì),在燕麥中未發(fā)現(xiàn)同源蛋白基因,證明AsTMK1基因是一個(gè)新的基因。進(jìn)一步用引物P1和P2在燕麥基因組中進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果顯示該基因的基因組序列大小與cDNA長(zhǎng)度大小一致,不含有內(nèi)含子序列。實(shí)施例2:用AsTMK1基因增強(qiáng)植物的抗旱性1、重組表達(dá)載體的構(gòu)建1)Ubi-AsTMK1重組表達(dá)載體的構(gòu)建以燕麥的總RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板,用含有KpnI和BamHI接頭序列的特異引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增;然后KpnI和BamHI雙酶切PCR產(chǎn)物回收,將酶切產(chǎn)物正向插入載體pNT112的Ubi啟動(dòng)子之后的KpnI和BamHI酶切位點(diǎn)之間,得到重組載體Ubi::AsTMK1。引物序列如下:AsTMK1[KpnI]5’-TCAGGTACCATGGACGGCGCTCCGGTGCC-3’AsTMK1[BamHI]5’-GGGGATCCTTACGCGTCGACGTATCGGAA-3’2、轉(zhuǎn)基因小麥獲得和功能鑒定1)轉(zhuǎn)基因小麥材料的獲得將上述構(gòu)建的重組表達(dá)載體pUbi::AsTMK1分別用凍融法轉(zhuǎn)化根癌農(nóng)桿菌C58C1,再用pUbi::AsTMK1的根癌農(nóng)桿菌C58C1轉(zhuǎn)化小麥,用含200mg/LBasta的MS培養(yǎng)基進(jìn)行篩選,得到陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因植株。將篩選得到的陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因植株用PCR做進(jìn)一步鑒定篩選,PCR所用的一對(duì)引物為P3和P4。P3(上游引物):5’-ATTGATGAACATGTTCAAAG-3’,P4(下游引物):5’-CTCCGTGACGGCGTGTTCAT-3’。對(duì)Ubi::AsTMK1轉(zhuǎn)基因小麥進(jìn)行PCR鑒定,陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因植株經(jīng)PCR擴(kuò)增可獲得650bp左右條帶,結(jié)果獲得轉(zhuǎn)Ubi::AsTMK1小麥60株(圖1)。同時(shí)將pNT112空載體導(dǎo)入小麥,方法同上,作為對(duì)照,獲得10個(gè)株系的轉(zhuǎn)空載體小麥,篩選獲得的轉(zhuǎn)基因小麥用T2代表示。2)AsTMK1轉(zhuǎn)基因小麥抗旱性鑒定對(duì)AsTMK1轉(zhuǎn)基因品系進(jìn)行水旱地產(chǎn)量鑒定。在北京房山水地小區(qū)中,HF-1、HF-17、HF-33、HS-18、HS-19等5個(gè)AsTMK1轉(zhuǎn)基因品系小區(qū)產(chǎn)量比對(duì)照京冬18分別增產(chǎn)4.8-9.4%之間,穗粒數(shù)、千粒重均比對(duì)照明顯增加。在旱地小區(qū)中,HF-1、HF-17、HF-33、HS-18、HS-19轉(zhuǎn)基因品系分別比對(duì)照京冬18增產(chǎn)4.03%至10.59%,這些轉(zhuǎn)基因品系在水旱地增產(chǎn)穩(wěn)定,穗粒數(shù)、千粒重別比對(duì)照均有增加,提高了轉(zhuǎn)基因小區(qū)產(chǎn)量及抗旱性(表2,圖2)。HS-19轉(zhuǎn)基因品系具有繁茂性、豐產(chǎn)性好,持綠性和抗旱性顯著增強(qiáng)等特點(diǎn)(圖2)。表2、AsTMK1轉(zhuǎn)基因品系在北京房山旱地小區(qū)產(chǎn)量比較<110>北京市農(nóng)林科學(xué)院<120>植物抗旱相關(guān)蛋白AsTMK1及其編碼基因和應(yīng)用<160>2<210>1<211>371<212>PRT<213>燕麥<400>1MDGAPVPEFRPTMTHGGRFLLYNIFGNQFEITVKYQPPIMPIGRGAYGIVCSVMNFETRE60MVAIKKIANAFDNNMDAKRTLRETKLLRHLDHENIVGLRDVIPPAIPQSFNDVYIATELM120DTDLHHIIHSNQELSEEHCQYFLCQLLRGLKYIHSTNVIHRDLKPSNLLLNASCDLKICD180FGLARPSSESDMMTEYVVTRWYRAPELLLNSTDYSAAIDVWSVGCIFMELINCAPLFPGR240DHMHQMRLITEVFGTPTDDLGSIRNEEARRYMRHLPQFPCRPFPGQFPQVQPAALDLIER300MLTFNPLQRITVEEALEHPYLERLHDVADEPICTDPFSFDFEQHPLTEDQMKLLIFNEAL360KLNPNFRYVDA371<210>2<211>1080<212>DNA<213>燕麥<400>1atggacggcgctccggtgcccgagttccggccgacgatgacgcacggcggccgcttcctc60ctgtacaacatattcggcaaccagttcgagatcacggtcaagtaccagccgccgatcatg120cccatcggccgcggcgcctacgggatcgtctgctcggtgatgaacttcgagacgagggag180atggtggcaatcaagaagatcgcaaacgcctttgacaacaacatggatgccaagcgcacg240ctccgggagaccaagctcctcaggcacctcgaccacgagaacatagtaggcctccgagat300gtgatcccaccggcgatcccgcagtccttcaacgacgtctacatcgccaccgagctcatg360gacacggacctccaccacataatccactccaaccaagaactctcagaagaacactgccag420tacttcttgtgccaactgctgcgcggcctcaagtacatccactcgacgaacgtgatccac480cgcgacctcaagccgagcaacctgctgctgaacgccagctgcgacctcaagatctgcgac540ttcggcctcgcgcggccgtcgtcggagagcgacatgatgacggagtacgtggtcacgcgg600tggtaccgggccccggagctgctgctcaactccaccgactactccgcggccatcgacgtc660tggtcggtcggctgcatcttcatggagctcatcaactgcgcgccgctgttcccggggagg720gaccacatgcaccagatgcggctcatcacagaggtgttcggcacccccaccgacgacctg780ggctccatccggaacgaggaggccaggagatacatgaggcacctgccgcagttcccctgt840cggccgttcccgggacagttcccccaggtgcagccggccgcgctggacctcatcgagagg900atgctcaccttcaacccgctgcagaggatcacagttgaagaggcgctggagcacccgtac960ctagagcggctgcacgacgtcgccgacgagcccatctgcacggaccccttctccttcgac1020ttcgagcagcacccactgacggaagaccagatgaagctgctcatattcaacgaagccctg1080當(dāng)前第1頁(yè)1 2 3 
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