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21種食源性致病微生物多重PCR檢測試劑盒的制作方法

文檔序號:12635983閱讀:687來源:國知局
21種食源性致病微生物多重PCR檢測試劑盒的制作方法與工藝

本實(shí)用新型屬于分子生物學(xué)檢測領(lǐng)域,涉及一種21種食源性致病微生物多重PCR檢測試劑盒,特別涉及(結(jié)腸彎曲菌、空腸彎曲菌、阪崎腸桿菌、大腸桿菌、腸侵襲性大腸桿菌、腸出血性大腸桿菌、腸致病性大腸桿菌、腸產(chǎn)毒性大腸桿菌、出血性大腸桿菌、單核增生性李斯特菌、沙門氏菌、志賀菌、金黃色葡萄球菌、蠟樣芽孢桿菌、霍亂弧菌CTX型、霍亂弧菌OMPW型、副溶血弧菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-yst型、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-ail型、輪狀病毒和諾瓦克病毒)的多重PCR檢測試劑盒。



背景技術(shù):

食源性致病微生物是引起食物中毒的重要生物學(xué)因素。隨著國家對食品安全工作的重視,快速篩查食物中毒原因成為當(dāng)務(wù)之急。食源性微生物性疾病的病原菌種類繁多,通過臨床癥狀難以區(qū)分病原菌種類,因此在以往的食源性疾病診斷中,明確的大便培養(yǎng)結(jié)果非常重要,但大便培養(yǎng)耗時(shí)長,一般需要3-4天,因此臨床醫(yī)生往往在無病原學(xué)診斷結(jié)果的前期就經(jīng)驗(yàn)性使用抗生素治療食源性腹瀉,從而導(dǎo)致抗生素濫用及病原菌耐藥。有關(guān)專家提出只有正確的細(xì)菌病原學(xué)診斷,是抗生素合理應(yīng)用的基礎(chǔ)。因此快速的病原學(xué)檢查是解決這一問題的關(guān)鍵。食源性致病微生物中的病原菌主要是副溶血性弧菌、沙門菌、變形桿菌和致瀉性大腸埃希菌等。其他如志賀菌屬、霍亂弧菌、葡萄球菌、彎曲菌等病原菌都是常見的致病菌。

多重PCR技術(shù)因具有較高的靈敏度和特異性,縮短了檢測時(shí)間,提高檢測效率和通量,是一種快速檢測病原體的方法,可彌補(bǔ)糞便培養(yǎng)及其他PCR檢測的不足,是現(xiàn)在食源性疾病病原學(xué)檢測技術(shù)的一種重要補(bǔ)充。多重PCR能避免費(fèi)時(shí)費(fèi)力的大海撈針式的排查,根據(jù)癥狀,選擇合適的靶序列組合,即對可能的病原體在一次反應(yīng)獲得結(jié)果。為處理“微生物性”食物中毒導(dǎo)致的“群體性腹瀉、嘔吐”等突發(fā)事件提供科學(xué)依據(jù),爭取寶貴時(shí)間。

然而,傳統(tǒng)的多重PCR檢測試劑盒只能對幾種特定的病原菌進(jìn)行檢測。發(fā)生食品安全突發(fā)事件的時(shí)候,如果檢測人員需要前往現(xiàn)場進(jìn)行檢測,同時(shí)攜帶多個(gè)試劑盒,不但攜帶不方便,而且試劑盒的固定就成為一個(gè)問題,若固定不穩(wěn),試劑瓶會相互碰撞并產(chǎn)生破裂或者泄露。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本實(shí)用新型針對現(xiàn)有技術(shù)的缺點(diǎn),提供了食源性致病微生物多重PCR檢測試劑盒,能夠很好的固定在試劑盒中方便攜帶,并且含有食源性疾病中常見的(結(jié)腸彎曲菌、空腸彎曲菌、阪崎腸桿菌、大腸桿菌、腸侵襲性大腸桿菌、腸出血性大腸桿菌、腸致病性大腸桿菌、腸產(chǎn)毒性大腸桿菌、出血性大腸桿菌、單核增生性李斯特菌、沙門氏菌、志賀菌、金黃色葡萄球菌、蠟樣芽孢桿菌、霍亂弧菌CTX型、霍亂弧菌OMPW型、副溶血弧菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-yst型、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-ail型、輪狀病毒和諾瓦克病毒)等21種致病微生物的所有檢測試劑,能夠快速、有效、準(zhǔn)確的篩查檢測出結(jié)腸彎曲菌、空腸彎曲菌、阪崎腸桿菌、大腸桿菌、腸侵襲性大腸桿菌、腸出血性大腸桿菌、腸致病性大腸桿菌、腸產(chǎn)毒性大腸桿菌、出血性大腸桿菌、單核增生性李斯特菌、沙門氏菌、志賀菌、金黃色葡萄球菌、蠟樣芽孢桿菌、霍亂弧菌CTX型、霍亂弧菌OMPW型、副溶血弧菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-yst型、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-ail型、輪狀病毒和諾瓦克病毒的目的。

為實(shí)現(xiàn)上述目的,本實(shí)用新型可采取下述技術(shù)方案:

21種食源性致病微生物多重PCR檢測試劑盒,包括盒體,盒蓋和位于盒體內(nèi)的卡板,所述卡板上設(shè)有七個(gè)限位孔,每個(gè)限位孔中設(shè)有一個(gè)試劑管;

其中七個(gè)試劑管分別為1個(gè)多重PCR引物組反應(yīng)液管,1個(gè)多重RT-PCR引物組反應(yīng)液管,2個(gè)酶反應(yīng)混合液管,1個(gè)陰性對照品管和2個(gè)陽性對照品管;

所述七個(gè)限位孔分為四排,左起第一排設(shè)有兩個(gè)限位孔;左起第二排設(shè)有兩個(gè)限位孔;左起第三排設(shè)有一個(gè)限位孔;左起第四排設(shè)有兩個(gè)限位孔;

所述盒體下部還設(shè)有固定底座;

所述固定底座上設(shè)有與七個(gè)試劑管位置一致的凹槽。

進(jìn)一步,于本發(fā)明的實(shí)施例中,所述兩個(gè)陽性對照品管中分別包括了19種致病細(xì)菌的核酸模板,和2種致病病毒的核酸模板。

進(jìn)一步,于本發(fā)明的實(shí)施例中,陰性對照品管內(nèi)含無菌去離子水。

進(jìn)一步,于本發(fā)明的實(shí)施例中,所述卡板設(shè)置在盒體上部。

進(jìn)一步,于本發(fā)明的實(shí)施例中,所述盒體下部還設(shè)有固定底座。

進(jìn)一步,于本發(fā)明的實(shí)施例中,所述固定底座上設(shè)有與七個(gè)試劑管位置一致的凹槽。

進(jìn)一步,于本發(fā)明的實(shí)施例中,所述凹槽形狀為半球形,其形狀與試劑管的底部結(jié)構(gòu)形狀一致。

進(jìn)一步,于本發(fā)明的實(shí)施例中,所述試劑管為1.5mL的離心管。

進(jìn)一步,于本發(fā)明的實(shí)施例中,所述七個(gè)限位孔分為四排,左起第一排設(shè)有兩個(gè)限位孔,限位孔內(nèi)分別設(shè)有1個(gè)裝有檢測19種致病細(xì)菌的特異基因位點(diǎn)的多重PCR引物組反應(yīng)液管,1個(gè)裝有檢測2種致病病毒的特異基因位點(diǎn)的多重RT-PCR引物組反應(yīng)液管;左起第二排設(shè)有兩個(gè)限位孔,限位孔內(nèi)分別為酶反應(yīng)混合液管;左起第三排設(shè)有一個(gè)限位孔,限位孔內(nèi)為陰性對照品管;左起第四排設(shè)有兩個(gè)限位孔,限位孔內(nèi)分別為裝有19種致病細(xì)菌的核酸模板的陽性對照品管,和裝有2種致病病毒的核酸模板的陽性對照品管。

本實(shí)用新型具有以下的顯著技術(shù)效果:

本實(shí)用新型使用特殊設(shè)計(jì)的引物,擴(kuò)增提取到的21種食源性致病微生物的致病基因片段,能夠?qū)崿F(xiàn)快速檢測相關(guān)致病微生物的特征基因片段,從而就可以篩查出樣本中是否含有上述致病微生物。從結(jié)構(gòu)上來說,本實(shí)用新型所述的試劑盒優(yōu)點(diǎn)在于:首先在同一反應(yīng)體系中分別進(jìn)行19種細(xì)菌和2種病毒的2個(gè)多重反應(yīng),多重PCR方法操作簡單快速,能同時(shí)檢測21種常見致病微生物;而普通的單一PCR分子生物學(xué)檢測技術(shù)在檢測時(shí)效性、操作簡便性和成本控制方面均差強(qiáng)人意。其次,本試劑盒中的陽性對照包含待測21種微生物的核酸模版,能監(jiān)控多重體系中每對引物的工作情況是否正常,避免實(shí)驗(yàn)出現(xiàn)假陰性結(jié)果。

進(jìn)一步的,本發(fā)明的試劑盒中還設(shè)置了固定底座,并且在固定底座上設(shè)置凹槽,與試劑管的底部相匹配,通過該固定底座的設(shè)置可以更好的實(shí)現(xiàn)試劑管的穩(wěn)固放置。

進(jìn)一步的,本發(fā)明的試劑盒通過將試劑管分為四排,根據(jù)功能分區(qū),更清晰明了,操作簡單,不容易產(chǎn)生混淆。

附圖說明

圖1為21種食源性致病微生物多重PCR檢測試劑盒的結(jié)構(gòu)示意圖。

圖2為圖1中固定底座的結(jié)構(gòu)示意圖。

圖3為圖1中固定底座和盒體相結(jié)合的結(jié)構(gòu)示意圖。

具體實(shí)施方式

下面結(jié)合實(shí)施例對本實(shí)用新型作進(jìn)一步的詳細(xì)描述。

實(shí)施例1

一種21種食源性致病微生物多重PCR檢測試劑盒,如圖1、2和3所示,包括盒體1,盒蓋2,卡板3。

其中盒體1和盒蓋2一側(cè)相連,盒蓋2可以實(shí)現(xiàn)密封盒體1。

卡板3設(shè)置在盒體1的上部,設(shè)有七個(gè)限位孔,每個(gè)限位孔內(nèi)均設(shè)有試劑管。

其中左起第一排分別為裝有檢測19種致病細(xì)菌的特異基因位點(diǎn)的多重PCR引物組反應(yīng)液管4和裝有檢測2種致病病毒的特異基因位點(diǎn)的多重RT-PCR引物組反應(yīng)液管5。

其中19種致病細(xì)菌分別為結(jié)腸彎曲菌、空腸彎曲菌、阪崎腸桿菌、大腸桿菌、腸侵襲性大腸桿菌、腸出血性大腸桿菌、腸致病性大腸桿菌、腸產(chǎn)毒性大腸桿菌、出血性大腸桿菌、單核增生性李斯特菌、沙門氏菌、志賀菌、金黃色葡萄球菌、蠟樣芽孢桿菌、霍亂弧菌CTX型、霍亂弧菌OMPW型、副溶血弧菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-yst型、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-ail型;2種致病病毒為輪狀病毒和諾瓦克病毒。

左起第二排分別為第一酶反應(yīng)混合液管6和第二酶反應(yīng)混合液管7。

左起第三排為陰性對照品管8,陰性對照品管8內(nèi)含無菌去離子水。

左起第四排為第一陽性對照品管9和第二陽性對照品管10,其中第一陽性對照品管9中包括了19種致病細(xì)菌的核酸模板,第二陽性對照品管10包括了2種致病病毒的核酸模板。

本發(fā)明一個(gè)實(shí)施例中,所述盒體1下部還設(shè)有固定底座11,所述固定底座11上設(shè)有與七個(gè)試劑管位置一致的凹槽12。

固定底座11材料為泡沫塑料,可將反應(yīng)液管和對照品管做很好的固定;不僅適用于分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室檢測,也適用于檢測人員前往現(xiàn)場進(jìn)行檢測。

進(jìn)一步,于本發(fā)明的實(shí)施例中,所述凹槽12形狀為半球形,其形狀與試劑管的底部結(jié)構(gòu)形狀一致。通過設(shè)置凹槽12,與試劑管的底部相匹配,可以更好的實(shí)現(xiàn)試劑管的穩(wěn)固放置。

本實(shí)用新型中試劑管為1.5mL的離心管。該規(guī)格的試管可以大規(guī)模便捷地應(yīng)用于分子生物學(xué)檢測領(lǐng)域。

優(yōu)選的,本實(shí)用新型的多重PCR引物組反應(yīng)液管中包含21組特殊設(shè)計(jì)的引物對,可實(shí)現(xiàn)擴(kuò)增提取到的(結(jié)腸彎曲菌、空腸彎曲菌、阪崎腸桿菌、大腸桿菌、腸侵襲性大腸桿菌、腸出血性大腸桿菌、腸致病性大腸桿菌、腸產(chǎn)毒性大腸桿菌、出血性大腸桿菌、單核增生性李斯特菌、沙門氏菌、志賀菌、金黃色葡萄球菌、蠟樣芽孢桿菌、霍亂弧菌CTX型、霍亂弧菌OMPW型、副溶血弧菌、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-yst型、小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-ail型、輪狀病毒和諾瓦克病毒)21種食源性致病微生物的致病基因片段,能夠?qū)崿F(xiàn)快速檢測相關(guān)致病微生物的特征基因片段,從而就可以篩查出樣本中是否含有上述21種致病微生物。

其中檢測空腸彎曲菌的引物(說明:以下引物對的核酸序列均為5端到3端的核酸序列)為:

上游引物:AATACTAGACTTACAAGGCGAAT

下游引物:AATCCTCACTTGCCATTAAAG

檢測結(jié)腸彎曲菌的引物為:

上游引物:CMTTTAGGAAGATCTTATGG

下游引物:TAAGCTGCCAAGCTCTTG

檢測阪崎腸桿菌的引物為:

上游引物:CAGAACGCCTTCTGGAAC

下游引物:CTTCGCCGATGATCCAGT

檢測大腸桿菌的引物為:

上游引物:TTGTTTGCCTCCCTGCTGC

下游引物:AAGCGTGGTGATGCTGC

檢測腸侵襲性大腸桿菌的引物為:

上游引物:

TCAAGGTTGTTGCACTAACACATGTTTGGTTACTATCTGAGTAT

下游引物:GACTCTAGTTGTTGTTAATATCTCTAGCAGTACTATTAGCGC

檢測腸出血性大腸桿菌(EHEC)的引物為:

上游引物:CCCGTTCGGCACAAGCATAAGA

下游引物:CCCGGARCCGRCRCGCCAGRARRCG

檢測腸致病性大腸桿菌(EPEC)的引物為:

上游引物:GTTCCTTGACCGCCTTTCCGATACCGTC

下游引物:GCCGGTCAGCCACCCTCTGAGAGTAC

檢測腸產(chǎn)毒性大腸桿菌(ETEC)的引物為:

上游引物:CAGTTAATGTGGTGGCGAAGG

下游引物:CACCAGACAATGTAACCTCTG

檢測出血性大腸桿菌(O157)的引物為:

上游引物:ACAGGTGAAGGTGGAATG

下游引物:CGCAGATATTTGTCATCCTA

檢測單核增生性李斯特菌的引物為:

上游引物:AGCATCTCCGCCTGCAAG

下游引物:AGTAACAGCTTTGCCGAAA

檢測沙門氏菌的引物為:

上游引物:CCGGKGAAATTATACCAT

下游引物:CTTTACCGGGCATACCAT

檢測志賀菌的引物為:

上游引物:TCACATGGAACAATCTCCG

下游引物:GTTTCTCTGCGAGCATGG

檢測金黃色葡萄球菌的引物為:

上游引物:CCTGAAGCAAGTGCATTTAC

下游引物:AGCATAAATATACGCTAAGC

檢測蠟樣芽孢桿菌的引物為:

上游引物:GTTGCGGATTTAAAAGTCATTG

下游引物:GCWGTTAAACCTTCACGA

檢測霍亂弧菌CTX型的引物為:

上游引物:CTGTAAAGATGCCAATATCTC

下游引物:CGATGCGTTAAACACRAAG

檢測霍亂弧菌OMPW型的引物為:

上游引物:CTGTAAAGATGCCAATATCTC

下游引物:CGATGCGTTAAACACRAAG

檢測副溶血弧菌的引物為:

上游引物:GCCCGCTTTCTTCAGACTCA

下游引物:TCATACGAGTGGTTGCTG

檢測小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-yst型的引物為:

上游引物:ACCGCATAACGTCTTCGG

下游引物:GTAACGTCAATCACAAAGGT

檢測小腸結(jié)腸炎耶爾森菌-ail型的引物為:

上游引物:ACCGCATAACGTCTTCGG

下游引物:GTAACGTCAATCACAAAGGT

檢測輪狀病毒的引物為:

上游引物:CTTTAAAAGAGAGATTTCCGTCTGG

下游引物:TCACATCATACAATTCTAATCTAAG

檢測諾瓦克病毒的引物為:

上游引物:CCYAGACAAGAGCCAATGTTC

下游引物:GACGYCATCTTCATTCACAAAK

實(shí)施例1

以下實(shí)施例中未注明具體條件的實(shí)驗(yàn)方法,通常按照常規(guī)條件。

按照下列方式制備含病原菌DNA的待測樣品:

病原菌核酸提取和PCR體系構(gòu)建

從平板上挑取適量菌落,加入含有200μL的無菌去離子水的滅菌離心管中,震蕩混勻,菌懸液肉眼可見混濁即可。菌液煮沸10min,冷卻至室溫后,在13,000rpm下離心2min。將上清液移至新離心管中,即得到可用于本試劑盒檢測的細(xì)菌DNA模版。目前,也可以使用市售試劑盒(如北京天根生化或德國qigen品牌)提取病原菌DNA。按照比例制備20μL的PCR反應(yīng)體系,其中無菌去離子水4μL、2×Master Mix10μL、Primer Mix4μL、病原菌DNA2μL。

PCR反應(yīng)

在96孔梯度熱循環(huán)儀(杭州朗基)中進(jìn)行,具體的參數(shù)條件如下:

94℃預(yù)變性6min;94℃變性30sec,59℃復(fù)性30sec,72℃延伸30sec,30個(gè)循環(huán);72℃延伸7min。

PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒定

用1×TAE緩沖液配置成2%的瓊脂糖凝膠溶液,微波爐加熱使瓊脂糖完全溶解,加入1/20000體積的Dye Gene Green核酸染料(天根生化科技(北京)有限公司),倒膠后取適量PCR產(chǎn)物(15μL)與6×LoadingBuffer混勻后,上樣分析。90V電壓下電泳30min后,在紫外凝膠成像系統(tǒng)下觀察結(jié)果并拍照記錄,對照核酸產(chǎn)物的條帶大小來鑒定PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。

實(shí)施例2

按照實(shí)施例1的要求進(jìn)行病原菌核酸提取和PCR體系構(gòu)建,PCR反應(yīng);然后利用DW-800A多重食源性致病菌核酸檢測系統(tǒng)的QSEP全自動毛細(xì)管電泳模塊進(jìn)行全自動的凝膠分離、成像及自動化條帶分析。

實(shí)施例3

按照實(shí)施例1的要求進(jìn)行病原菌核酸提取,并按照本實(shí)用新型技術(shù)方案的介紹在美國ICUBATE4000平臺上構(gòu)建專用的多重PCR檢測卡盒,利用ICUBATE卡盒的多重、全自動、全封閉PCR反應(yīng)和檢測能力來進(jìn)行多重PCR體系自動構(gòu)建、擴(kuò)增和多重PCR產(chǎn)物檢測。

總之,以上所述僅為本實(shí)用新型的較佳實(shí)施例,凡依本實(shí)用新型申請專利范圍所作的均等變化與修飾,皆應(yīng)屬本實(shí)用新型專利的涵蓋范圍。

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