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采用Denovo轉(zhuǎn)錄組分析鑒定隱甲藻中與DHA生物合成相關(guān)的脂肪酸去飽和酶基因的方法與流程

文檔序號(hào):12794131閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開了一種通過De?novo轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,轉(zhuǎn)錄本拼接和差異表達(dá)分析,鑒定蔻氏隱甲藻中與二十二碳六烯酸(DHA)生物合成相關(guān)脂肪酸去飽和酶基因的方法。具體步驟包括:(1)對(duì)隱甲藻進(jìn)行DHA發(fā)酵培養(yǎng);(2)收集不同生長和DHA積累階段的菌體并進(jìn)行RNA提取與轉(zhuǎn)錄組Illumina深度測(cè)序;(3)測(cè)序數(shù)據(jù)的分析與預(yù)處理;(4)對(duì)拼接后的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行功能注釋與相關(guān)性統(tǒng)計(jì)分析,鑒定發(fā)現(xiàn)隱甲藻中與DHA生物合成相關(guān)的脂肪酸去飽和酶,并獲得其基因全長序列;(5)通過qRT?PCR分析技術(shù),對(duì)隱甲藻中與DHA生物合成相關(guān)的脂肪酸去飽和酶的基因進(jìn)行表達(dá)驗(yàn)證。發(fā)明為研究隱甲藻DHA的生物合成機(jī)制以及提高隱甲藻中DHA合能力成提供重要的方法和知識(shí)基礎(chǔ)。

技術(shù)研發(fā)人員:張衛(wèi)文;陳磊;裴廣勝;劉璐
受保護(hù)的技術(shù)使用者:昆明藻能生物科技有限公司
技術(shù)研發(fā)日:2017.02.24
技術(shù)公布日:2017.07.04
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