本申請是申請?zhí)枮椤?01180020642.2”，申請日為2011年2月24日，優(yōu)先權(quán)日為2010年2月24日，發(fā)明名稱為“確定基因-營養(yǎng)物的相互作用的方法”的發(fā)明專利申請的分案申請。發(fā)明領(lǐng)域本發(fā)明涉及基于基因-營養(yǎng)物的相互作用，以及基于谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶pi基因(gstp1)和/或白介素il-6基因(il-6)的多態(tài)性，預(yù)測對飲食因素的代謝反應(yīng)的方法，并提供對飲食和生活方式的建議。發(fā)明背景二十世紀(jì)后半葉以來，生活在工業(yè)化國家的人的飲食習(xí)慣發(fā)生了相當(dāng)大的變化。以植物為基礎(chǔ)的傳統(tǒng)飲食被高脂肪或者熱量并且含有大量基于動(dòng)物的食品的飲食所取代。并且由于工業(yè)化國家的人們逐步轉(zhuǎn)向久坐不動(dòng)的生活方式，他們的體力活動(dòng)也普遍下降。飲食和缺乏體力活動(dòng)被稱為是與體重增加或肥胖癥的發(fā)展有關(guān)的關(guān)鍵風(fēng)險(xiǎn)因素。臨床上被診斷為超重或肥胖的人的數(shù)量不斷增加，對于許多健康咨詢機(jī)構(gòu)，過度的體重增加和肥胖是一個(gè)重要的健康問題。肥胖是一種影響到所有年齡組的慢性疾病，并且與許多健康風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)，例如高血壓、冠心病或糖尿病。一個(gè)人如果有過多的體脂和/或如果他們嚴(yán)重超重，即他們的體重顯著大于一般認(rèn)為對該年齡、身高和國籍的人來說是健康的體重，則該人是肥胖的。過多體脂的存在也增加了一個(gè)人發(fā)生身體殘疾的風(fēng)險(xiǎn)。幾十年來，各國政府、慈善機(jī)構(gòu)及健康咨詢機(jī)構(gòu)已發(fā)出過關(guān)于例如飲食、運(yùn)動(dòng)、吸煙和日光浴的各種健康忠告。此類組織提供的旨在防止體重增加或肥胖的飲食或運(yùn)動(dòng)指導(dǎo)往往是把公眾作為一個(gè)整體，或者最多是分成幾個(gè)群體，比如老人、兒童和孕婦。因此，這種建議可能非常籠統(tǒng)，其性質(zhì)決定了無法考慮個(gè)體的危險(xiǎn)因素，比如個(gè)體的遺傳特征。此外，近年來，關(guān)于特定食品、藥品等和醫(yī)學(xué)狀況之間的關(guān)聯(lián)的研究結(jié)果被大量宣傳，往往引起健康方面的恐慌。造成健康狀況和對醫(yī)學(xué)狀況的易感性的因素在群體之間和群體內(nèi)個(gè)體之間是不同的，所以個(gè)體從這些一般性的報(bào)告和研究中獲取適合他/她的具體情況的有用建議往往是不可能的。為了使醫(yī)生和其他專業(yè)人士能夠更針對個(gè)人需求來提供意見，希望對個(gè)體的基因組成進(jìn)行分析從而識別與積極或消極影響相關(guān)的任何基因。通過確定營養(yǎng)物或營養(yǎng)學(xué)方案的影響的機(jī)制，營養(yǎng)遺傳學(xué)(也被稱為營養(yǎng)基因組學(xué))試圖界定這些特定的營養(yǎng)物質(zhì)和特定的營養(yǎng)方案對人體健康的關(guān)系。在個(gè)體的基因組中對多種基因變異進(jìn)行研究的技術(shù)目前進(jìn)展順利。營養(yǎng)遺傳學(xué)領(lǐng)域目前的問題是要找到足夠大的變異集合，從而能夠以有助于他們的健康和健身的方式給個(gè)體提供有意義的建議。發(fā)明概述本發(fā)明包括用于給個(gè)體選擇減重方案的方法。一方面中，所述方法包括：確定個(gè)體在基因座位點(diǎn)313、341或兩者的gstp1基因型，和根據(jù)個(gè)體包含的下述基因型給個(gè)體選擇減重方案：在位點(diǎn)313是g等位基因的純合子、位點(diǎn)313是雜合子(a/g)、位點(diǎn)341是t等位基因純合子、位點(diǎn)341是雜合子(c/t)，以及它們的組合，其中所述減重方案是由位點(diǎn)313和341均為野生型的有可比性個(gè)體的減重方案改進(jìn)的。所述方法還顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型包含位點(diǎn)313的g等位基因純合子或者位點(diǎn)313的雜合子(a/g)時(shí)，預(yù)計(jì)所述個(gè)體比位點(diǎn)313是a等位基因純合子的個(gè)體對減重方案的反應(yīng)更強(qiáng)。本發(fā)明該方法的另一個(gè)方面還顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型包含位點(diǎn)341的t等位基因純合子或雜合子(c/t)時(shí)，預(yù)計(jì)所述個(gè)體比位點(diǎn)341是c等位基因純合子的個(gè)體對減重方案的反應(yīng)更強(qiáng)。本發(fā)明另一方面中，所述方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型包含位點(diǎn)313的g等位基因純合子或雜合子(a/g)時(shí)，選定的減重方案與位點(diǎn)313具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，包括的膳食方案能量攝入高或者持續(xù)時(shí)間短。該方法還可以包括選定的減重方案與位點(diǎn)313具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，包括更高的鈣攝入量。本發(fā)明又一方面中，所述方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型包含位點(diǎn)341的c等位基因純合子時(shí)，減重方案與具有位點(diǎn)341g等位基因的基因型個(gè)體的相比，包括能量攝入較低或者持續(xù)時(shí)間更長的膳食方案。本發(fā)明另一方面中，所述方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型在位點(diǎn)313是a等位基因純合子和/或位點(diǎn)341是c等位基因純合子時(shí)，減重方案與具有位點(diǎn)313g等位基因純合子或位點(diǎn)313雜合子(a/g)和具有位點(diǎn)341t等位基因純合子或位點(diǎn)341雜合子(c/t)的個(gè)體相比，包括的膳食方案能量攝入較低或者持續(xù)時(shí)間更長。本發(fā)明還有一個(gè)方面中，所述方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型在位點(diǎn)341是t等位基因純合子或者位點(diǎn)341是雜合子(c/t)時(shí)，選定的減重方案與位點(diǎn)341具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，包括十字花科蔬菜攝入量更高的膳食方案。本發(fā)明又一方面中，所述方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型在位點(diǎn)313是g等位基因純合子或者位點(diǎn)313是雜合子(a/g)時(shí)，選定的減重方案與位點(diǎn)313具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，包括維生素a攝入量更高的膳食方案。本發(fā)明另一方面中，該方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型在位點(diǎn)313是g等位基因純合子或者位點(diǎn)313是雜合子(a/g)時(shí)，選定的減重方案與位點(diǎn)313具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，包括鈣攝入量更高的膳食方案。本發(fā)明還有一個(gè)方面中，所述方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型在位點(diǎn)313是g等位基因純合子或者位點(diǎn)313是雜合子(a/g)并且在位點(diǎn)341是t等位基因純合子或者位點(diǎn)341是雜合子(c/t)時(shí)，選定的減重方案所包含的膳食方案與位點(diǎn)313具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，維生素a攝入更高，與位點(diǎn)341具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，十字花科蔬菜攝入更高。本發(fā)明又一方面中，所述方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型在位點(diǎn)313是g等位基因純合子或者位點(diǎn)313是雜合子(a/g)并且在位點(diǎn)341是t等位基因純合子或者位點(diǎn)341是雜合子(c/t)時(shí)，選定的減重方案所包含的膳食方案與位點(diǎn)313具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，鈣攝入更高，與位點(diǎn)341具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，十字花科蔬菜攝入更高。本發(fā)明還提供了一種用于給需要增重的個(gè)體選擇膳食方案的方法。所述方法包括確定個(gè)體在gstp1基因的基因座位點(diǎn)313的gstp1基因型，和當(dāng)個(gè)體在位點(diǎn)313是a等位基因純合子時(shí)選擇膳食方案，其中所述膳食方案與不需要增重的個(gè)體的膳食方案相比，鈣攝入較低。本發(fā)明另一方面中顯示，gstp1等位基因是作為一組至少5個(gè)基因的基因組群的一部分被確定的，所述基因組群中的基因都具有一或多個(gè)等位基因。所述方法還提供了從下列基因中選出的該組群中的其它基因：亞甲基四氫葉酸還原酶(mthfr)；甲硫氨酸合成酶還原酶(ms-mtrr)；甲硫氨酸合酶(mtr)；β胱硫醚合成酶(cbs)；錳超氧化物歧化酶(mnsod)；超氧化物歧化酶3(sod3)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶m1(gstm1)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶t1(gstt1)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶pi(gstp1)；載脂蛋白c-iii(apoc3)；載脂蛋白a-v(apoa5)；膽固醇酯轉(zhuǎn)移蛋白(cetp)；脂蛋白脂酶(lpl)；內(nèi)皮型一氧化氮合酶(enos)；血管緊張素轉(zhuǎn)換酶基因(ace)；維生素d受體(vdr)；i型膠原α-1(col1a1)；腫瘤壞死因子-α(tnf-a)；過氧化物酶體增殖物激活受體γ2(ppar-y2)；環(huán)氧化物水解酶i(ephx1)；肝脂酶(lipc)；對氧磷酶1(pon1)；乙醇脫氫酶ib(adh1b)；乙醇脫氫酶ic(adh1c)；血管緊張素原(agt)；細(xì)胞色素p4501a1(cyp1a1)；細(xì)胞色素p4501a2*1b(cyp1a2_1b)，細(xì)胞色素p4501a2*1e(cyp1a2_1e)和細(xì)胞色素p4501a2*1f(cyp1a2_1f)。本發(fā)明還提供了用于給50歲以下個(gè)體選擇減重方案的方法。所述方法還包括：確定個(gè)體在基因座位點(diǎn)-174的il-6基因型。所述方法進(jìn)一步包括當(dāng)個(gè)體包含下述基因型時(shí)給個(gè)體選擇減重方案：在位點(diǎn)-174是g等位基因的純合子和位點(diǎn)-174是雜合子(c/g)，其中所述減重方案是由位點(diǎn)-174是c等位基因純合子的有可比性個(gè)體的減重方案改進(jìn)的。所述方法還顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型是位點(diǎn)-174的c等位基因純合子時(shí)，預(yù)計(jì)該個(gè)體比位點(diǎn)-174是g等位基因純合子和位點(diǎn)-174是雜合子的個(gè)體對減重方案的反應(yīng)更強(qiáng)。在本發(fā)明所述方法的再一方面中，方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型選自位點(diǎn)-174是g等位基因純合子和位點(diǎn)-174是雜合子(c/g)時(shí)，選定的減重方案所包含的膳食方案與包含位點(diǎn)-174是c等位基因純合子基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，能量攝入更低和/或持續(xù)時(shí)間更長。在所述方法的還有一個(gè)方面中，il-6等位基因是作為一組至少5個(gè)基因的基因組群的一部分被確定的，所述基因組群中的基因都具有一或多個(gè)等位基因。所述方法還提供了從下列基因中選出的該組群中的其它基因：亞甲基四氫葉酸還原酶(mthfr)；甲硫氨酸合成酶還原酶(ms-mtrr)；甲硫氨酸合酶(mtr)；β胱硫醚合成酶(cbs)；錳超氧化物歧化酶(mnsod)；超氧化物歧化酶3(sod3)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶m1(gstm1)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶t1(gstt1)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶pi(gstp1)；載脂蛋白c-iii(apoc3)；載脂蛋白a-v(apoa5)；膽固醇酯轉(zhuǎn)移蛋白(cetp)；脂蛋白脂酶(lpl)；內(nèi)皮型一氧化氮合酶(enos)；血管緊張素轉(zhuǎn)換酶基因(ace)；維生素d受體(vdr)；i型膠原α-1(col1a1)；腫瘤壞死因子-α(tnf-a)；過氧化物酶體增殖物激活受體γ2(ppar-y2)；環(huán)氧化物水解酶i(ephx1)；肝脂酶(lipc)；對氧磷酶1(pon1)；乙醇脫氫酶ib(adh1b)；乙醇脫氫酶ic(adh1c)；血管緊張素原(agt)；細(xì)胞色素p4501a1(cyp1a1)；細(xì)胞色素p4501a2*1b(cyp1a2_1b)，細(xì)胞色素p4501a2*1e(cyp1a2_1e)和細(xì)胞色素p4501a2*1f(cyp1a2_1f)。發(fā)明詳述本發(fā)明人確定了gstp1的兩個(gè)等位基因和身體質(zhì)量指數(shù)之間的關(guān)聯(lián)，并進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)了某些飲食因素和這些等位基因之間的關(guān)系。此外，本發(fā)明人確定了與年齡相關(guān)的il-6的位點(diǎn)-174等位基因和身體質(zhì)量指數(shù)之間的關(guān)聯(lián)。通過評估個(gè)體中是否存在這些等位基因，有可能給個(gè)體選擇體重管理方案。本發(fā)明涉及通過確定個(gè)體在基因座位點(diǎn)313、341或者兩者的gstp1基因型，給個(gè)體選擇體重管理方案，比如減重方案的方法。谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶pi基因(gstp1)是一個(gè)多形態(tài)基因，其編碼有活性的功能不同的gstp1變體蛋白，這些蛋白被認(rèn)為具有參與外源物質(zhì)代謝的功能，以及對癌癥和其他疾病的易感性中發(fā)揮作用。但目前還沒有關(guān)于它們與正常膳食因素的關(guān)聯(lián)的報(bào)告。gstp1基因的序列(開放閱讀框)及其翻譯分別如seqidno：1和seqidno：2所示。野生型(cdna)序列如seqidno：3所示。編號基于開放閱讀框，其中第一個(gè)甲硫氨酸atg在序列中被編號為1-3。有兩種常見的gstp1等位基因變體。一個(gè)是在核酸的開放閱讀框位點(diǎn)313，由a變?yōu)間(seqidno：4)，另一個(gè)是位點(diǎn)341的c到t的改變(seqidno：6)。這兩種變化都導(dǎo)致編碼序列的變化，產(chǎn)生蛋白變體ile105val(seqidno：5)和alal114val(seqidno：7)。該基因是常染色體顯性遺傳，因此個(gè)體在每個(gè)等位基因可以是純合子或雜合子。gstp1基因的序列(開放閱讀框)及其翻譯分別如seqidno：1和seqidno：2所示。野生型(cdna)序列如seqidno：3所示。編號基于開放閱讀框，其中第一個(gè)甲硫氨酸atg在序列中被編號為1-3。正如上面指出的，位點(diǎn)313和341的變化也會(huì)產(chǎn)生編碼序列，在文獻(xiàn)中分別又被稱為ile105val和alal114val。在本發(fā)明中，因?yàn)檫z傳篩查主要是通過參考核苷酸分析進(jìn)行的，提及等位基因時(shí)引用了核苷酸編號和變化。單核苷酸多態(tài)性在databaseofsinglenucleotidepolymorphisms(dbsnp),bethesda(md):nationalcenterforbiotechnologyinformation,nationallibraryofmedicine中被給予分類(參見sherryst,etal；dbsnp:thencbidatabaseofgeneticvariation.nucleicacidsres.2001jan1；29(1):308-11)。snps通過獨(dú)特的登錄號進(jìn)行了編目。在本例中，gstp1a313g多態(tài)性是snp登錄號rsl695，gstp1c341t多態(tài)性是rsl138272。本發(fā)明的一個(gè)實(shí)施方案包括確定個(gè)體在基因座位點(diǎn)313、341或者兩者的gspt1基因型。個(gè)體的基因型一般是通過對從個(gè)體獲得的核酸(通常是dna)樣品，例如腮抹試或者類似樣品進(jìn)行分析確定的。分析利用本領(lǐng)域已知的常規(guī)方法進(jìn)行?？赡馨▽ξ稽c(diǎn)313和341中的一個(gè)或兩個(gè)使用pcr進(jìn)行擴(kuò)增并測序；或者包括使用核酸探針，所述探針能夠通過與野生型和變體序列的差異雜交來區(qū)分等位基因。由于等位基因也反映在蛋白編碼的變化中，因此有可能在蛋白水平上檢測等位基因，例如，通過免疫測定法或其他蛋白分析方法。利用來自個(gè)體的含有可檢測水平gstp1蛋白的樣品即可實(shí)施這樣的方法。本發(fā)明的這個(gè)實(shí)施方案還包括當(dāng)個(gè)體基因型在位點(diǎn)313是g等位基因純合子或位點(diǎn)313雜合子(a/g)時(shí)，預(yù)計(jì)該個(gè)體比位點(diǎn)313是a等位基因純合子的個(gè)體對減重方案的反應(yīng)更強(qiáng)。此外，當(dāng)個(gè)體的基因型被確定為位點(diǎn)341的t等位基因純合子或位點(diǎn)341的雜合子(c/t)時(shí)，也預(yù)計(jì)該個(gè)體比位點(diǎn)341是c等位基因純合子的個(gè)體對減重方案的反應(yīng)更強(qiáng)。本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施例包括當(dāng)個(gè)體的基因型是位點(diǎn)313的g等位基因純合子或者位點(diǎn)313雜合子(a/g)時(shí)，選定的減重方案與位點(diǎn)313具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，包括的膳食方案能量攝入高或者持續(xù)時(shí)間短。該方法還提供了選擇與位點(diǎn)313具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，包括更高鈣攝入量的減重方案。受試對象的bmi和鈣攝入與gstp1313多態(tài)性的不同等位基因之間存在關(guān)聯(lián)。那些是aa等位基因純合子的個(gè)體似乎得益于低鈣攝入，其中那些位點(diǎn)313g等位基因純合子或者位點(diǎn)313雜合子(a/g)的個(gè)體得益于高攝入。低攝入是指可能最多每天1000mg，例如最多每天900mg，比如最多每天800mg的攝入量。高攝入是指例如每天至少1100mg，例如每天至少1200mg，比如每天1300mg的攝入量。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中，所述方法進(jìn)一步顯示，當(dāng)個(gè)體的基因型包含位點(diǎn)341的t等位基因純合子或者位點(diǎn)341的雜合子(c/t)時(shí)，選定的減重方案與位點(diǎn)341具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，包括十字花科蔬菜攝入量更高的膳食方案?？墒承允只?brassicaceae或cruciferae)植物被稱為十字花科蔬菜。最常食用的這類蔬菜包括卷心菜、西蘭花、花椰菜、羽衣甘藍(lán)、抱子甘藍(lán)、蕪菁、油菜、芥菜、小蘿卜、辣根、水芹和西洋菜。使用本發(fā)明的方法，具有位點(diǎn)341gstp1t等位基因(即雜合ct或純合tt基因型)并且十字花科蔬菜攝入量高的個(gè)體與cc純合子相比，與較低的體重指數(shù)呈正相關(guān)。合適的是，與ct或tt基因型中觀察到的益處相關(guān)的最小十字花科蔬菜攝入水平是每周至少3個(gè)食用份量的十字花科蔬菜，例如每周至少5個(gè)食用份量，比如每周至少7個(gè)食用份量。一個(gè)食用份量的十字花科蔬菜被認(rèn)為是大約100g的蔬菜份額。在本發(fā)明的一些實(shí)施例中，所述方法進(jìn)一步提供當(dāng)個(gè)體的基因型包含位點(diǎn)313的g等位基因純合子或位點(diǎn)313雜合子(a/g)時(shí)，選定的減重方案所包含的膳食方案與位點(diǎn)313具有野生型基因型的有可比性個(gè)體的減重方案相比，維生素a攝入更高。個(gè)體的維生素a攝入可能是來自食物和維生素補(bǔ)充劑形式的組合，所述補(bǔ)充劑一般是視黃醇或在體內(nèi)轉(zhuǎn)化為視黃醇的胡蘿卜素形式。位點(diǎn)313g等位基因純合子或313位點(diǎn)雜合子(a/g)的個(gè)體具有與維生素?cái)z入量低相關(guān)的較高身體質(zhì)量指數(shù)。因此，這些個(gè)體可能會(huì)受益于通過增加含有該維生素的食物來源和/或服用維生素a補(bǔ)充劑來提高他們飲食中的維生素a攝入量。適宜地，與在ag和gg基因型中觀察到的益處相關(guān)的最小維生素a攝入水平可能是每天至少3000(國際單位)，例如，至少每天4000iu，比如每天至少5000iu。在本發(fā)明的這個(gè)和其他方法中，建議的食物亞類型(即，視情況可以是十字花科蔬菜、維生素a或鈣)攝入水平可以考慮目前的飲食有關(guān)問卷調(diào)查數(shù)據(jù)進(jìn)行改進(jìn)。例如，可能受益于高十字花科蔬菜攝入量的個(gè)體如果已經(jīng)超過了最低攝入量，可能現(xiàn)在的膳食攝入就能夠達(dá)到建議的最低水平。本發(fā)明再一個(gè)實(shí)施方案是用于給需要增重的個(gè)體選擇膳食方案(即增重計(jì)劃)的方法。所述方法包括：確定個(gè)體在gspt1基因的基因座位點(diǎn)313的gspt1基因型。具體來說，由于具有313a純合子基因型且高鈣飲食的個(gè)體比那些有g(shù)等位基因的個(gè)體的bmi更高，該個(gè)體應(yīng)當(dāng)被開高鈣膳食補(bǔ)充劑處方，或者被建議富含鈣的飲食來協(xié)助實(shí)現(xiàn)增重目標(biāo)。位點(diǎn)313是a等位基因純合子的個(gè)體應(yīng)當(dāng)被處方與不需增重的個(gè)體相比，鈣攝入較低的飲食方案。此外，本發(fā)明還設(shè)想了確定gspt1基因中位點(diǎn)341的gspt1基因型從而給需要增加體重的個(gè)體選擇膳食方案。本發(fā)明的另一個(gè)實(shí)施方案是用于通過確定基因座位點(diǎn)-174的個(gè)體il-6基因型來給個(gè)體選擇體重管理方案的方法。白介素-6(il-6)基因(seqidno：10代表編碼seqidno：11的野生型il-6)是一個(gè)多態(tài)性基因，其中啟動(dòng)子區(qū)域的位點(diǎn)-174的核苷酸序列可以是c或g(seqidno：8)。單核苷酸多態(tài)性在databaseofsinglenucleotidepolymorphisms(dbsnp),bethesda(md):nationalcenterforbiotechnologyinformation,nationallibraryofmedicine中被給予分類(參見sherryst,etal；dbsnp:thencbidatabaseofgeneticvariation.nucleicacidsres.2001jan1；29(1):308-11)。snps通過獨(dú)特的登錄號進(jìn)行了編目。在本實(shí)施方案中，il-6-174多態(tài)性是登錄號rsl800795(seqidno：9)。個(gè)體的基因型一般是通過對從個(gè)體獲得的核酸(通常是dna)樣品，例如腮抹試或者類似樣品進(jìn)行分析確定的。分析利用本領(lǐng)域已知的常規(guī)方法進(jìn)行?？赡馨▽ξ稽c(diǎn)-174使用pcr進(jìn)行擴(kuò)增并測序；或者包括使用核酸探針，所述探針能夠通過與野生型和變體序列的差異雜交來區(qū)分等位基因。本實(shí)施方案中提供了用于給50歲以下個(gè)體選擇減重方案的方法。所述方法包括確定個(gè)體在基因座位點(diǎn)-174的il-6基因型；和當(dāng)個(gè)體在位點(diǎn)-174是g等位基因純合子或者位點(diǎn)-174是雜合子(c/g)時(shí)選擇減重方案，所述減重方案是由位點(diǎn)-174為野生型的有可比性個(gè)體的減重方案改進(jìn)的。在本發(fā)明的許多實(shí)施方案中，在基因芯片陣列中確定gstp1和/或il-6的等位基因，其中還分析了與生活方式和飲食危險(xiǎn)因素相關(guān)的多個(gè)其他基因變體。雖然本發(fā)明可以通過分開檢驗(yàn)gstp1等位基因和/或il-6等位基因進(jìn)行實(shí)施，也考慮了將等位基因作為與飲食和健康相關(guān)的基因panel的一部分來確定。還考慮了個(gè)體的基因型使上述兩種或更多種膳食因素與有利或有害影響相關(guān)，本發(fā)明提供了與這些因素的任何組合有關(guān)的生活方式和飲食建議?！皞€(gè)體”或“受試對象”本發(fā)明意圖在人受試對象上進(jìn)行。一般來說，人是成年人，即18歲或以上。受試對象可以是男性或女性。本文所報(bào)告的相關(guān)性在高加索兩性受試者中均得到確認(rèn)，并且男性和女性之間沒有顯著差異。但是與連鎖不平衡可能會(huì)發(fā)生在不同種族亞群中的單倍型分析不同，本發(fā)明涉及蛋白質(zhì)編碼區(qū)的等位基因。這表明不同基因型之間的差異是結(jié)構(gòu)變化和由此產(chǎn)生的gstp1蛋白活性變化的結(jié)果。因此，本發(fā)明也可以實(shí)施在其他種族群體的受試對象上，例如非洲黑人或東方血統(tǒng)的受試對象，因?yàn)闊o論特定等位基因的具體出現(xiàn)頻率如何不同，蛋白質(zhì)的活性在所有人口群體中是類似的。就il-6的多態(tài)性來說，本文所報(bào)告的相關(guān)性在高加索兩性受試者中均得到確認(rèn)，并且男性和女性之間沒有顯著差異。相信il-6的多態(tài)性影響的是基因的表達(dá)水平，并且這種差別在所有種族亞群中都存在，即使等位基因的出現(xiàn)頻率不同也如此。因此，本發(fā)明也可以實(shí)施在其他種族群體的受試對象上，例如非洲黑人或東方血統(tǒng)的受試對象，因?yàn)檫@種基因的活性在所有人口群體中是類似的，無論特定等位基因的具體出現(xiàn)頻率如何不同都如此。在本發(fā)明中，對于本發(fā)明相關(guān)方法來說，有可比性個(gè)體是這樣的個(gè)體或個(gè)體群，所述個(gè)體或個(gè)體群經(jīng)確認(rèn)具有野生型gsptl313(a等位基因純合子)、341(t等位基因純合子)和/或il-6-174等位基因(c等位基因的純合子的)的個(gè)體。此外，有可比性個(gè)體與方法其他相關(guān)特征來說是方法的受試對象的個(gè)體類似。例如，相關(guān)特征包括年齡、體重、身高、健康史、性別、其他遺傳特征、生活方式因素和/或飲食。預(yù)測對減重計(jì)劃的反應(yīng)個(gè)體或者醫(yī)療人員可以利用本發(fā)明所述的gstp1或il-6基因多態(tài)性來預(yù)測對減重方案的反應(yīng)。本發(fā)明的數(shù)據(jù)顯示，在平衡的控制熱量的飲食情況下，具有g(shù)stp1313g或gstp1341t等位基因的受試對象的重量減少大于具有野生型等位基因的受試對象。此外，本發(fā)明的數(shù)據(jù)顯示對于il-6基因，既有年齡相關(guān)的也有il-6等位基因相關(guān)的對bmi的影響。該信息可用于向采用上述飲食的攜帶野生型等位基因的個(gè)體建議說，他們的重量減少可能會(huì)小于那些帶有變體等位基因的個(gè)體。這類信息對于例如臨床情景或者營利性或非營利性減重機(jī)構(gòu)的減重方案可能是有用的。確切的減重程度將取決于飲食性質(zhì)和/或伴隨該飲食的鍛煉狀況。對于每個(gè)方案，可以根據(jù)gstp1或il-6基因型的情況，對歷史性或預(yù)測的參與者平均體重下降進(jìn)行改進(jìn)，以便該個(gè)體的預(yù)期或目標(biāo)更好地適應(yīng)其特定基因組成。例如，帶有g(shù)stp1野生型等位基因的個(gè)體可能會(huì)被告知，他們的重量減少可能低于遵循同樣的飲食或運(yùn)動(dòng)計(jì)劃的參與者的平均水平，而那些帶有g(shù)stp1313g或gstp1341t等位基因的個(gè)體可以預(yù)期在類似方案的過程中減重超過平均水平。此外，帶有il-6g等位基因(“較高bmi相關(guān)性質(zhì)”)的50歲以下個(gè)體會(huì)被告知，他們的重量減少可能低于遵循同樣的飲食或運(yùn)動(dòng)計(jì)劃的參與者的平均水平，而那些不具備這種年齡-基因型組合的個(gè)體(“較低bmi相關(guān)性質(zhì)”)可以預(yù)期在類似方案的過程中減重超過平均水平。膳食方案除了預(yù)計(jì)具體飲食的相對可能重量減少，本發(fā)明還允許在這種方案的范圍內(nèi)，根據(jù)gstp1基因型或il-6基因型對方案進(jìn)行調(diào)適。例如，帶有野生型gstp1基因的個(gè)體不僅可以被告知他們可能預(yù)期的重量減少，還可以被給予關(guān)于如何通過降低飲食的熱量攝入、增加鍛煉或延長參加方案的時(shí)間來實(shí)現(xiàn)更多減重的指導(dǎo)和建議。類似地，那些帶有g(shù)spt1313g或gspt1341t等位基因的個(gè)體可以設(shè)定一個(gè)更加雄心勃勃的減重目標(biāo)，或者修改膳食方案以允許比帶有野生型等位基因的個(gè)體有更高的熱量。對于個(gè)體某個(gè)飲食的精確能量攝入需要由涉及的個(gè)體，在必要或適當(dāng)咨詢保健顧問的情況下來確定，因此精確的數(shù)字不可能適用于任何情況下的所有個(gè)體。一般來說，正在節(jié)食的個(gè)體的熱量攝入在1000-2000千卡/天(約4200–8400kj/天)的范圍內(nèi)。因此，對于參加特定減重計(jì)劃的一群個(gè)體，可能要將這個(gè)群體按照發(fā)明所述bmi-相關(guān)特性進(jìn)行分組，那些具有較高bmi相關(guān)特性(即，第313位的a等位基因的純合子或第341位的c等位基因的純合子)的個(gè)體相比具有較低bmi相關(guān)特性的個(gè)體(位點(diǎn)313有g(shù)等位基因的個(gè)體或者位點(diǎn)341有t等位基因的個(gè)體)，給他們制定的飲食要減少例如大約5-20％，比如大約5-10％的能量攝入。對于il-6基因型，具有較高bmi相關(guān)特性的個(gè)體不僅可以被告知他們可能預(yù)期的重量減少，還可以被給予關(guān)于如何通過降低飲食的熱量攝入、增加鍛煉或延長參加方案的時(shí)間來實(shí)現(xiàn)更多減重的指導(dǎo)和建議。類似地，那些具有較低bmi相關(guān)特性的個(gè)體可以設(shè)定一個(gè)更加雄心勃勃的減重目標(biāo)，或者修改膳食方案以允許比帶有野生型等位基因的個(gè)體有更高的熱量。此外，可以建議具有較低bmi相關(guān)特性的個(gè)體要在年輕時(shí)小心控制自己的體重，以減輕從50歲起增加的較高bmi風(fēng)險(xiǎn)。營養(yǎng)遺傳學(xué)篩選營養(yǎng)遺傳學(xué)篩選領(lǐng)域涉及對受試對象的一或多個(gè)基因的分析，所述基因參與對膳食或其他健康相關(guān)因素的響應(yīng)，其中鑒定到可能改變所述響應(yīng)的一個(gè)或多個(gè)等位基因。在一個(gè)典型過程中，提供來自受試對象的dna樣本。樣品可能是腮抹拭或其他身體樣品的形式。然后檢驗(yàn)dna，以確定存在的是目標(biāo)一或多個(gè)基因的哪個(gè)等位基因。如果確認(rèn)是會(huì)造成一或多個(gè)不良后果(例如較低的骨礦物質(zhì)密度，較高風(fēng)險(xiǎn)的心臟疾病等)的風(fēng)險(xiǎn)增加的基因等位基因，可能會(huì)建議個(gè)體根據(jù)這一風(fēng)險(xiǎn)來改變他或她的飲食。例如，意見可能包括建議的最小和/或最大量的食物亞型，如脂肪，蔬菜亞組(蕓苔屬植物、蔥蒜類蔬菜等)。這樣的方法可以是上面提到的us7054758的方法。在一些營養(yǎng)遺傳學(xué)篩選實(shí)施方案中，個(gè)體還可以結(jié)合dna樣品，提供有關(guān)生活方式詳細(xì)信息(例如，當(dāng)前飲食、年齡、性別、酒精攝入量和他們是否抽煙中的一或多個(gè)詳細(xì)信息)的問卷的回答。這可以使建議進(jìn)一步適合個(gè)人的要求。在典型的營養(yǎng)遺傳學(xué)篩選方法中，gstp1的等位基因是在5到100個(gè)，比如5-20個(gè)其他具有等位基因變體的與飲食或健康響應(yīng)或危險(xiǎn)因素有關(guān)的基因組群中被確定的。組群中可以包含的其他基因選自亞甲基四氫葉酸還原酶(mthfr)；甲硫氨酸合成酶還原酶(ms-mtrr)；甲硫氨酸合酶(mtr)；β胱硫醚合成酶(cbs)；錳超氧化物歧化酶(mnsod)；超氧化物歧化酶3(sod3)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶m1(gstm1)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶t1(gstt1)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶pi(gstp1)；載脂蛋白c-iii(apoc3)；載脂蛋白a-v(apoa5)；膽固醇酯轉(zhuǎn)移蛋白(cetp)；脂蛋白脂酶(lpl)；內(nèi)皮型一氧化氮合酶(enos)；血管緊張素轉(zhuǎn)換酶基因(ace)；維生素d受體(vdr)；i型膠原α-1(col1a1)；腫瘤壞死因子-α(tnf-a)；過氧化物酶體增殖物激活受體γ2(ppar-y2)；環(huán)氧化物水解酶i(ephx1)；肝脂酶(lipc)；對氧磷酶1(pon1)；乙醇脫氫酶ib(adh1b)；乙醇脫氫酶ic(adh1c)；血管緊張素原(agt)；細(xì)胞色素p4501a1(cyp1a1)；細(xì)胞色素p4501a2*1b(cyp1a2_1b)，細(xì)胞色素p4501a2*1e(cyp1a2_1e)和細(xì)胞色素p4501a2*1f(cyp1a2_1f)。同樣，在典型的營養(yǎng)遺傳學(xué)篩選方法中，il-6的等位基因是在5到100個(gè)，比如5-20個(gè)其他具有等位基因變體的與飲食或健康響應(yīng)或危險(xiǎn)因素有關(guān)的基因組群中被確定的。組群中可以包含的其他基因選自亞甲基四氫葉酸還原酶(mthfr)；甲硫氨酸合成酶還原酶(ms-mtrr)；甲硫氨酸合酶(mtr)；β胱硫醚合成酶(cbs)；錳超氧化物歧化酶(mnsod)；超氧化物歧化酶3(sod3)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶m1(gstm1)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶t1(gstt1)；谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶pi(gstp1)；載脂蛋白c-iii(apoc3)；載脂蛋白a-v(apoa5)；膽固醇酯轉(zhuǎn)移蛋白(cetp)；脂蛋白脂酶(lpl)；內(nèi)皮型一氧化氮合酶(enos)；血管緊張素轉(zhuǎn)換酶基因(ace)；維生素d受體(vdr)；i型膠原α-1(col1a1)；腫瘤壞死因子-α(tnf-a)；過氧化物酶體增殖物激活受體γ2(ppar-y2)；環(huán)氧化物水解酶i(ephx1)；肝脂酶(lipc)；對氧磷酶1(pon1)；乙醇脫氫酶ib(adh1b)；乙醇脫氫酶ic(adh1c)；血管緊張素原(agt)；細(xì)胞色素p4501a1(cyp1a1)；細(xì)胞色素p4501a2*1b(cyp1a2_1b)，細(xì)胞色素p4501a2*1e(cyp1a2_1e)和細(xì)胞色素p4501a2*1f(cyp1a2_1f)。對于以上基因的基因panel多態(tài)性，當(dāng)包括在面板中時(shí)，可以選自表1中列出的下列基因：表1因此，文中描述的本發(fā)明的各種方法可以對gstp1基因單獨(dú)實(shí)施從而確定位點(diǎn)313和341中的一個(gè)或兩個(gè)等位基因；或者作為營養(yǎng)遺傳學(xué)篩選方法的一部分。對于后一種情況，所述方法可以包括確定上表中一或多個(gè)基因的等位基因。此外，文中描述的本發(fā)明的各種方法可以對il-6基因單獨(dú)實(shí)施從而確定位點(diǎn)-174的等位基因；或者作為營養(yǎng)遺傳學(xué)篩選方法的一部分。對于后一種情況，所述方法可以包括確定表1中一或多個(gè)基因的等位基因。身體質(zhì)量指數(shù)(bmi)眾所周知本領(lǐng)域中，術(shù)語超重和肥胖是指大于通常認(rèn)為對于給定高度是健康的重量范圍。利用體重和高度測量值計(jì)算他們的體重質(zhì)量指數(shù)(bmi)可以將一個(gè)人歸類為超重或肥胖?？梢允褂孟旅娴墓接?jì)算身體質(zhì)量指數(shù)：bmi(kgm-2)＝體重(kg)÷[身高(m)]2。bmi往往被用來將個(gè)體歸類為超重或肥胖是因?yàn)閷τ诖蠖鄶?shù)人來說，bmi與他們的身體脂肪量有相關(guān)性。對于成年人來說，健康的bmi通常介于18.5-25kgm-2。如果成人的bmi為至少25kgm-2，但小于30kgm-2，他們一般被歸類為超重。bmi大于或等于30kgm-2表明該成年人是肥胖的。本發(fā)明可能對體重過輕、健康體重(bmi在18.5-25)、超重和肥胖個(gè)體都有用。本發(fā)明作為膳食方案的一部分使用時(shí)，可能對那些歸類為超重或肥胖的人特別有用。在健康體重的個(gè)體中使用本發(fā)明也可以提供將bmi維持在18.5-25的范圍內(nèi)的建議。us7054758中公開了用于給人受試對象確定個(gè)性化生活方式建議的各種方法，該專利的公開內(nèi)容通過引用并入本文。一般來說，方法包括以下通常由計(jì)算機(jī)輔助的步驟：(i)在第一數(shù)據(jù)處理裝置上提供第一數(shù)據(jù)組，所述第一數(shù)據(jù)組包含的信息指出個(gè)體等位基因與生活方式危險(xiǎn)因素的對應(yīng)關(guān)系，其中所述等位基因已知與增加或減少的疾病易感性有關(guān)；(ii)在第二數(shù)據(jù)處理裝置上提供第二數(shù)據(jù)組，所述第二個(gè)數(shù)據(jù)組包含的信息可以將每個(gè)所述危險(xiǎn)因素與至少一種生活方式建議匹配；(ⅲ)輸入確定所述受試對象中存在的等位基因的第三數(shù)據(jù)組，其中所述等位基因是所述第一數(shù)據(jù)組中的一或多個(gè)等位基因；(iv)通過所述第一數(shù)據(jù)組提供的等位基因與危險(xiǎn)因素的對應(yīng)關(guān)系，確定與所述人受試對象中存在的所述等位基因相關(guān)的危險(xiǎn)因素；；(v)在步驟(iv)確定的每個(gè)危險(xiǎn)因素的基礎(chǔ)上，通過來自所述第二數(shù)據(jù)組的所述危險(xiǎn)因素與生活方式建議的匹配，從而確定至少一種生活方式建議；(ⅵ)生成個(gè)性化的生活方式建議，其包含至少一種步驟(v)中確定的生活方式建議。個(gè)性化的生活方式建議書可能包括食品亞型的推薦最小和/或最大量。本文公開的與gstp1基因的關(guān)聯(lián)性可以用于給上述過程的步驟(i)提供等位基因，給步驟(ii)提供和bmi相關(guān)的危險(xiǎn)因素和當(dāng)前的膳食攝入，并給步驟(v)提供文中公開的建議，從而制定考慮了gstp1基因型(和其他遺傳標(biāo)記物)的個(gè)性化生活方式建議書。發(fā)明的另外一個(gè)實(shí)施方案提供了試劑盒和試劑盒的使用方法，其中所述試劑盒包含采集個(gè)體dna樣品的裝置，和任選的問卷調(diào)查用于收集與個(gè)體bmi和十字花科蔬菜、維生素a和鈣中的一或多個(gè)的攝入有關(guān)的數(shù)據(jù)?！芭cbmi有關(guān)的數(shù)據(jù)”可能是bmi本身或者可以用于計(jì)算bmi的身高和體重?cái)?shù)據(jù)。使用試劑盒的方法包括的步驟有對dna樣品進(jìn)行分析以確定個(gè)體在gstp1位點(diǎn)313和/或341和/或il-6的基因型；和根據(jù)確定的gstp1基因型和/或il-6基因型提供有關(guān)飲食和/或生活方式(例如，鍛煉或運(yùn)動(dòng)水平)的建議。本申請?jiān)诖送ㄟ^引用將美國專利申請61/307,522和61/307,526全文并入。雖然已經(jīng)詳細(xì)描述了本發(fā)明的各種實(shí)施方案，但很明顯本領(lǐng)域技術(shù)人員會(huì)想到這些實(shí)施方案的改進(jìn)和調(diào)適。然而應(yīng)當(dāng)明確地理解，這類改進(jìn)和調(diào)適包括在以下示范性權(quán)利要求給出的本發(fā)明的范圍內(nèi)。實(shí)施例以下實(shí)施例用于說明的目的，而不是意在限制文中所要求保護(hù)的發(fā)明范圍。本領(lǐng)域技術(shù)人員所想到的任何變化都落入本發(fā)明范圍內(nèi)。本申請中提到的所有文獻(xiàn)通過引用并入本文，與本公開沒有不一致。正如下面實(shí)施例1-5中描述的，發(fā)現(xiàn)個(gè)體對受控飲食的響應(yīng)(減重)在那些有一個(gè)或另一個(gè)變體基因型(位點(diǎn)313是ag或gg，位點(diǎn)341是ct或tt)的個(gè)體中大于具有野生型等位基因的個(gè)體。位點(diǎn)341具有變體基因型的個(gè)體被發(fā)現(xiàn)比具有野生型等位基因的個(gè)體的身體質(zhì)量指數(shù)(bmi)更低。實(shí)施例1-5中提供的數(shù)據(jù)顯示bmi和體重調(diào)節(jié)與gstp1基因型之間存在聯(lián)系。這種聯(lián)系使得可以根據(jù)基因型預(yù)測飲食和運(yùn)動(dòng)的可能結(jié)果，允許個(gè)體或健康專業(yè)人士給所述個(gè)體提供建議，從而決定可能有利于達(dá)到減重或保持健康體重的飲食和/或運(yùn)動(dòng)計(jì)劃。相應(yīng)地，本發(fā)明的發(fā)現(xiàn)可以被用來在gstp1基因型的基礎(chǔ)上提供一般的飲食和/或生活方式建議，也可以提供更具體的關(guān)于食物亞型(即一或多種十字花科蔬菜、維生素a和鈣)攝入量的建議。實(shí)施例1本實(shí)施例闡述了gspt1多態(tài)性與體重減少之間的遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)。41位有減重失敗歷史(定義為至少有兩次或兩次以上的不成功嘗試)的患者參加了希臘雅典的體重管理診所，遵循傳統(tǒng)體重管理方案，所述方案包括低血糖指數(shù)的地中海飲食、建議的日常鍛煉和在診所中的定期隨訪：早餐：一杯咖啡或茶，一薄片全麥面包或者黑麥餅干，和一片奶酪及一片火雞火腿，或者和人造黃油(beceltm)和少許蜂蜜，或一份谷物和1.5％低脂牛奶午餐-晚餐：第1天：新鮮或煮熟蔬菜沙拉，一片奶酪，一片面包。第2天：烤魚+沙拉第3天：烤雞+沙拉第4天：一份青豆，與番茄和橄欖油共同烹制。一片奶酪第5天：烤魚片+沙拉第6天：一份扁豆，一片奶酪，一片面包第7天：烤魚+沙拉患者的飲食方案是由標(biāo)準(zhǔn)飲食根據(jù)位點(diǎn)313或341的gst1變體結(jié)果改進(jìn)的。在谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶pi基因的位點(diǎn)313或341攜帶一或兩個(gè)拷貝變體等位基因的患者建議確保飲食中規(guī)律地包含十字花科(每周5次)和蔥蒜(每日)蔬菜，并提供給患者建議和食譜，而且如果需要的話添加西蘭花提取物和大蒜補(bǔ)充劑。定期由病人的臨床記錄進(jìn)行bmi測試結(jié)果分析。100天(平均隨訪167天或5.6個(gè)月)后測量了41個(gè)人的bmi。對于營養(yǎng)遺傳學(xué)測試，使用了scionabodybenefits試劑盒(scionaincboulderco)。臨床上用兩個(gè)頰黏膜拭子取頰細(xì)胞樣品，并且患者完成了全面的飲食和生活方式的調(diào)查問卷。拭子和樣品快遞發(fā)送到sciona，并使用sequenommassarray系統(tǒng)進(jìn)行了基因測試。統(tǒng)計(jì)方法：通過比較5.6個(gè)月隨訪時(shí)，野生型純合子基因型和攜帶一或兩個(gè)變體等位基因的體重減少、bmi減少和bmi減少評估了gstp1基因位點(diǎn)313和341多態(tài)性基因型與體重減少之間的遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)性。該關(guān)聯(lián)的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性利用helixtree軟件包(goldenhelixincbozeman，mtusa)的線性回歸模塊進(jìn)行了評價(jià)。線性回歸分析包括年齡和性別作為協(xié)變量。對于每個(gè)基因型，利用協(xié)變量分析并輸出s-plus6中調(diào)整最小的均值，來評估調(diào)整后的平均bmi減少、體重減少和bmi減少百分比(insightfulcorp，wa)。平均體重減少、bmi減少和bmi減少百分比(作為位于基線處的原始bmi的百分比)用于gstp1基因多態(tài)性。統(tǒng)計(jì)顯著性p-值以bmi的變化作為結(jié)果變量。表2a：5.6個(gè)月后的減重測量值-位點(diǎn)313等位基因表2b：5.6個(gè)月后的減重測量值–位點(diǎn)341等位基因?qū)嵤├?本實(shí)施例闡述了gspt1多態(tài)性和身體質(zhì)量指數(shù)之間的遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)?；蛐?、bmi和營養(yǎng)物攝入數(shù)據(jù)采集自3000名客戶，這些客戶參加了sciona營養(yǎng)遺傳學(xué)測試(所有數(shù)據(jù)在分析前是匿名的)，其自我報(bào)告的種族是白人。基因分型和營養(yǎng)物攝取分析如實(shí)施例1的描述進(jìn)行。在個(gè)體自我報(bào)告的種族群體中，按性別進(jìn)行基因-營養(yǎng)物-bmi相互作用的分析。通過比較野生型純合子基因型和攜帶一或兩個(gè)變體等位基因的bmi評估了gstp1基因位點(diǎn)341多態(tài)性基因型與體重減少之間的遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)性。該關(guān)聯(lián)的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性利用helixtree軟件包(goldenhelixincbozeman，mtusa)的線性回歸模塊進(jìn)行了評價(jià)。線性回歸分析包括了年齡和性別作為協(xié)變量。如表3所示，攜帶一或兩個(gè)拷貝變體等位基因(“t”)的個(gè)體比具有野生型基因型的有較更低的身體質(zhì)量指數(shù)。表3:cc比對(vs)ct/tt等位基因的bmi實(shí)施例3在這個(gè)和下面的實(shí)施例中，術(shù)語“基因-環(huán)境相互作用”或“基因-營養(yǎng)物相互作用”是指這樣的情形，所述情形中對某性狀的影響只在某些環(huán)境(比如個(gè)體的年齡)或營養(yǎng)物攝入情況下看到，或者是根據(jù)營養(yǎng)物攝入或環(huán)境條件看到對所述性狀的不同影響。本實(shí)施例闡述了就維生素a攝入而言，gstp1位點(diǎn)313多態(tài)性基因型對身體質(zhì)量指數(shù)的差別影響。利用線性回歸模型或方差分析對基因-營養(yǎng)物相互作用的統(tǒng)計(jì)學(xué)評價(jià)：統(tǒng)計(jì)學(xué)上，相互作用是在兩個(gè)或更多個(gè)變量的效應(yīng)不是簡單疊加時(shí)，統(tǒng)計(jì)模型中增加的術(shù)語。該術(shù)語反映了一個(gè)變量的效果依賴于一個(gè)或多個(gè)其他變量的值。這里的情況中，bmi＝ax1+bx2+e，其中x1可以代表個(gè)體對給定營養(yǎng)物的攝入量或者個(gè)體的年齡，x2可以代表個(gè)體的基因型，a和b是通過回歸模型估計(jì)的系數(shù)。與此相反，bmi＝ax1+bx2+c(x1xx2)+e是變量xi和x2之間有相互作用的模型例子(“e”是指隨機(jī)變量，其值是觀察到的bmi與線性模型擬合情況下bmi預(yù)期值的差別量)。相互作用的變量可以是分類變量(如基因型)或?qū)崝?shù)。相互作用的結(jié)果是一個(gè)變量帶來的影響取決于另一個(gè)變量的值。方差分析或多重線性回歸模型產(chǎn)生的值表明對于基因型變量、營養(yǎng)物變量和相互作用變量差異是由于它們的確不同(相對由于巧合造成的不同)產(chǎn)生的概率。獲取每個(gè)個(gè)體因素(即主效果)的顯著性值，以及因素相互作用(即交互效果)的顯著性。對于交互效果，當(dāng)考慮兩個(gè)或更多因素時(shí)，返回一個(gè)顯著性p值。如果因素(營養(yǎng)物攝入和基因型或年齡和基因型)之間發(fā)現(xiàn)有相互關(guān)系，anova或線性回歸模型會(huì)產(chǎn)生統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著性概率值(例如，<0.05)(jamesj.jaccard,robertturrisi,interactioneffectsinmultipleregression,sagepublications,2003,isbn0-7619-2742-5)。通過在s-plus6.0中的線性回歸模型中包括相互作用項(xiàng)(term)估計(jì)了基因-營養(yǎng)物相互作用或基因-年齡相互作用的統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性。位點(diǎn)313的gstp1基因型之間的遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)在個(gè)體中，即維生素a攝入量半數(shù)以下(bottomhalf)(小于11,000iu/天)和維生素a攝入量半數(shù)以上(tophalf)(11,000iu/天或以上)的個(gè)體中分開進(jìn)行了研究。表4a：維生素a攝入量低于50％的受試對象gstp1313基因型aaagggbmi27.1127.7227.996stderr0.2220.2280.454對這群人，通過方差分析發(fā)現(xiàn)位點(diǎn)313的基因型與bmi顯著相關(guān)(p<0.025)，所述方差分析包括按該多態(tài)性攜帶的“g”等位基因拷貝數(shù)把基因型作為分類變量0、1、2，以及年齡和性別作為協(xié)變量。表4b：維生素a攝入量高于50％的受試對象：這個(gè)群體中，經(jīng)方差分析發(fā)現(xiàn)位點(diǎn)313的基因型與bmi沒有顯著相關(guān)性(p<0.16)，所述方差分析包括按該多態(tài)性攜帶的“g”等位基因拷貝數(shù)把基因型作為分類變量0、1、2，以及年齡和性別作為協(xié)變量。利用軟件s-plus6.0進(jìn)行的線性回歸模型擬合顯示相互作用項(xiàng)是統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著的(p<0.01)，其中包括了位點(diǎn)313的gstp1基因型(簡稱為gstp1_313)、維生素a攝入量、年齡、性別以及維生素a和gstpl基因型的相互作用。gstp1_313對bmi的主效果不是統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著的，維生素a的主效果有統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性(p<0.0001)。因此，只在維生素a攝入量低的個(gè)體中看到g等位基因的較高bmi對bmi的顯著相關(guān)性。對于313等位基因的情況，在維生素a攝入量低的受試對象中沒有觀察到變體ag或gg基因型的有益效果。如果沒有足夠的維生素a攝入，ag和gg基因型與bmi增加相關(guān)。這種效果會(huì)被飲食中充足的維生素a攝入所抵消。實(shí)施例4本實(shí)施例闡述了位點(diǎn)341處有g(shù)stp1多態(tài)性的基因型對依賴于十字花科蔬菜攝入的身體質(zhì)量指數(shù)的不同影響。位點(diǎn)341的gstp1基因型之間的遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)在個(gè)體中，即十字花科蔬菜攝入量半數(shù)以下(每周小于三個(gè)食用份)和十字花科蔬菜攝入量半數(shù)以上(每周大于三個(gè)食用份)的個(gè)體中分開進(jìn)行了研究。表5a：十字花科蔬菜攝入量高于50％的個(gè)體gstp1341基因型ccct或ttbmi26.4725.315stderr0.2290.504對這群人，通過方差分析發(fā)現(xiàn)位點(diǎn)341的基因型與bmi顯著相關(guān)(p<0.036)，所述方差分析包括按個(gè)體攜帶t等位基因(1)還是不攜帶(0)把基因型作為分類變量0、1。年齡和性別作為協(xié)變量。表5b：十字花科蔬菜攝入量低于50％的個(gè)體gstp1341基因型ccct或ttbmi27.32227.098stderr0.130.314這個(gè)群體中，經(jīng)方差分析發(fā)現(xiàn)位點(diǎn)341的基因型與bmi沒有顯著相關(guān)性(p<0.43)。利用軟件s-plus6.0進(jìn)行的線性回歸模型擬合顯示相互作用項(xiàng)是統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著的(p<0.02)，其中包括了位點(diǎn)341的gstp1基因型(簡稱為gstp1_341)、十字花科蔬菜攝入量、年齡、性別以及十字花科蔬菜和gstpl_341基因型的相互作用。因此，只在十字花科蔬菜攝入量大的個(gè)體中優(yōu)先看到t等位基因的較低bmi對bmi的顯著相關(guān)性。在十字花科蔬菜攝入量高的個(gè)體中觀察到ct或tt341基因型的有益效果，這一有益效果在該食物亞群攝入量低的個(gè)體中沒有看到。實(shí)施例5本實(shí)施例闡述了根據(jù)鈣攝入，gstp1位點(diǎn)313多態(tài)性基因型對身體質(zhì)量指數(shù)的差別影響。這是以類似所述實(shí)施例3和4的方式確定的，在低(低于770mg/天)和高(770mg/天或以上)攝入群體中觀察到以下差別。表6a：鈣攝入量低于50％的個(gè)體gstp1313aaagggbmi26.85527.36427.210stderr0.1680.1720.345該組中根據(jù)年齡和性別對相關(guān)性進(jìn)行了調(diào)整p<0.083表6b：鈣攝入量高于50％的個(gè)體gstp1313aaagggbmi27.37626.53626.352stderr0.3830.3810.684與bmi的相關(guān)性根據(jù)年齡和性別進(jìn)行了調(diào)整p<0.084鈣攝入量和gstp1313基因型之間的相互作用p<0.027。野生型(aa)基因型在鈣攝入量高的個(gè)體中與較高bmi關(guān)聯(lián)，但在鈣攝入量低的個(gè)體中與較低bmi關(guān)聯(lián)。313基因型對bmi有和鈣攝入量有關(guān)的影響。具體來說，那些具有aa基因型的個(gè)體似乎受益(就較低的bmi而言)于較低的鈣攝入量，而高鈣攝入量似乎對這種基因型是不利的。相反，313帶有g(shù)等位基因(即ag和gg基因型)的個(gè)體受益于較高的鈣攝入量。實(shí)施例6術(shù)語“基因-環(huán)境相互作用”或“基因-營養(yǎng)物相互作用”是指這樣的情形，所述情形中對某性狀(例如身體質(zhì)量指數(shù))的影響只在某些環(huán)境(比如可以是個(gè)體的年齡)或營養(yǎng)物攝入情況下看到，或者根據(jù)營養(yǎng)物攝入或環(huán)境條件看到對所述性狀的不同影響。本實(shí)施例闡述了位點(diǎn)-174的il-6多態(tài)性對取決于年齡的身體質(zhì)量指數(shù)的差別影響。分別在年齡小于50歲以及年齡50歲或以上的個(gè)體中研究了位點(diǎn)-174的il-6基因型之間的遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)。表7a年齡在50歲以下的個(gè)體il6-174基因型cccgggbmi26.07226.43926.999stderr0.3460.2140.235通過anova發(fā)現(xiàn)il-6基因在位點(diǎn)-174的基因型與bmi在50歲以下個(gè)體中顯著相關(guān)(p<0.016)，其中g(shù)等位基因與較高的bmi關(guān)聯(lián)(表7a)。方差分析包括按該c(變體)等位基因拷貝數(shù)把基因型作為分類變量0、1、2。性別作為協(xié)變量。表7b年齡滿50歲或以上的個(gè)體il6-174基因型cccgggbmi28.15327.27627.649se0.3530.2190.242通過anova發(fā)現(xiàn)，il-6基因在位點(diǎn)-174的基因型與bmi在年滿50歲或以上的個(gè)體中不相關(guān)(p<0.49)，但是這個(gè)年齡組中帶有g(shù)等位基因的個(gè)體有較低的bmi(表7b)。利用軟件s-plus6.0進(jìn)行的線性回歸模型擬合顯示相互作用項(xiàng)不是統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著的(p<0.086)，其中包括了位點(diǎn)-174的il6基因型、年齡、性別以及年齡和il6-174基因型的相互作用。對本發(fā)明的以上描述是為了說明的目的。該描述并非意圖將發(fā)明限制在文中公開的形式。因此，與上述教導(dǎo)、相關(guān)領(lǐng)域的技能或知識相當(dāng)?shù)淖兓托薷木诒景l(fā)明的范圍內(nèi)。文中以上描述的實(shí)施方案進(jìn)一步旨在解釋用于實(shí)施本發(fā)明的已知最佳模式，以便本領(lǐng)域的其它普通技術(shù)人員能夠在這類或其他實(shí)施方案中利用本發(fā)明，并能根據(jù)本發(fā)明的具體應(yīng)用或用途進(jìn)行各種改進(jìn)。所附權(quán)利要求書應(yīng)當(dāng)被理解為包括現(xiàn)有技術(shù)能夠允許的范圍內(nèi)的替代實(shí)施例。文中提及的每份出版物和參考文獻(xiàn)通過引用全部并入本文。序列表<110>波蒂塞克股份有限公司(bodysync,inc.)gill,rosalynnd.grimaldi,keitha.<120>確定基因-營養(yǎng)物的相互作用的方法<130>5588-12-pct<140>未指定<141>2011-02-24<150>61/307,526<151>2010-02-24<150>61/307,522<151>2010-02-24<160>11<170>patentinversion3.5<210>1<211>633<212>dna<213>人(homosapiens)<220><221>misc_feature<223>gstp1編碼<400>1atgccgccctacaccgtggtctatttcccagttcgaggccgctgcgcggccctgcgcatg60ctgctggcagatcagggccagagctggaaggaggaggtggtgaccgtggagacgtggcag120gagggctcactcaaagcctcctgcctatacgggcagctccccaagttccaggacggagac180ctcaccctgtaccagtccaataccatcctgcgtcacctgggccgcacccttgggctctat240gggaaggaccagcaggaggcagccctggtggacatggtgaatgacggcgtggaggacctc300cgctgcaaatacatctccctcatctacaccaactatgaggcgggcaaggatgactatgtg360aaggcactgcccgggcaactgaagccttttgagaccctgctgtcccagaaccagggaggc420aagaccttcattgtgggagaccagatctccttcgctgactacaacctgctggacttgctg480ctgatccatgaggtcctagcccctggctgcctggatgcgttccccctgctctcagcatat540gtggggcgcctcagcgcccggcccaagctcaaggccttcctggcctcccctgagtacgtg600aacctccccatcaatggcaacgggaaacagtga633<210>2<211>210<212>prt<213>人(homosapiens)<220><221>misc_feature<223>gstp1<400>2metproprotyrthrvalvaltyrpheprovalargglyargcysala151015alaleuargmetleuleualaaspglnglyglnsertrplysgluglu202530valvalthrvalgluthrtrpglngluglyserleulysalasercys354045leutyrglyglnleuprolyspheglnaspglyaspleuthrleutyr505560glnserasnthrileleuarghisleuglyargthrleuglyleutyr65707580glylysaspglnglnglualaalaleuvalaspmetvalasnaspgly859095valgluaspleuargcyslystyrileserleuiletyrthrasntyr100105110glualaglylysaspasptyrvallysalaleuproglyglnleulys115120125prophegluthrleuleuserglnasnglnglyglylysthrpheile130135140valglyaspglnileserphealaasptyrasnleuleuaspleuleu145150155160leuilehisgluvalleualaproglycysleuaspalapheproleu165170175leuseralatyrvalglyargleuseralaargprolysleulysala180185190pheleualaserproglutyrvalasnleuproileasnglyasngly195200205lysgln210<210>3<211>986<212>dna<213>人(homosapiens)<220><221>misc_feature<223>gstp1<400>3tgggaaagagggaaaggcttccccggccagctgcgcggcgactccggggactccagggcg60cccctctgcggccgacgcccggggtgcagcggccgccggggctggggccggcgggagtcc120gcgggaccctccagaagagcggccggcgccgtgactcagcactggggcggagcggggcgg180gaccacccttataaggctcggaggccgcgaggccttcgctggagtttcgccgccgcagtc240ttcgccaccatgccgccctacaccgtggtctatttcccagttcgaggccgctgcgcggcc300ctgcgcatgctgctggcagatcagggccagagctggaaggaggaggtggtgaccgtggag360acgtggcaggagggctcactcaaagcctcctgcctatacgggcagctccccaagttccag420gacggagacctcaccctgtaccagtccaataccatcctgcgtcacctgggccgcaccctt480gggctctatgggaaggaccagcaggaggcagccctggtggacatggtgaatgacggcgtg540gaggacctccgctgcaaatacatctccctcatctacaccaactatgaggcgggcaaggat600gactatgtgaaggcactgcccgggcaactgaagccttttgagaccctgctgtcccagaac660cagggaggcaagaccttcattgtgggagaccagatctccttcgctgactacaacctgctg720gacttgctgctgatccatgaggtcctagcccctggctgcctggatgcgttccccctgctc780tcagcatatgtggggcgcctcagtgcccggcccaagctcaaggccttcctggcctcccct840gagtacgtgaacctccccatcaatggcaacgggaaacagtgagggttggggggactctga900gcgggaggcagagtttgccttcctttctccaggaccaataaaatttctaagagagctaaa960aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa986<210>4<211>708<212>dna<213>人(homosapiens)<220><221>allele<222>(313)..(313)<223>rs1695;第313位的r可以是a或g<400>4atgccgccctacaccgtggtctatttcccagttcgaggccgctgcgcggccctgcgcatg60ctgctggcagatcagggccagagctggaaggaggaggtggtgaccgtggagacgtggcag120gagggctcactcaaagcctcctgcctatacgggcagctccccaagttccaggacggagac180ctcaccctgtaccagtccaataccatcctgcgtcacctgggccgcacccttgggctctat240gggaaggaccagcaggaggcagccctggtggacatggtgaatgacggcgtggaggacctc300cgctgcaaatacrtctccctcatctacaccaactatgaggcgggcaaggatgactatgtg360aaggcactgcccgggcaactgaagccttttgagaccctgctgtcccagaaccagggaggc420aagaccttcattgtgggagaccagatctccttcgctgactacaacctgctggacttgctg480ctgatccatgaggtcctagcccctggctgcctggatgcgttccccctgctctcagcatat540gtggggcgcctcagcgcccggcccaagctcaaggccttcctggcctcccctgagtacgtg600aacctccccatcaatggcaacgggaaacagtgagggttggggggactctgagcgggaggc660agagtttgccttcctttctccaggaccaataaaatttctaagagagct708<210>5<211>210<212>prt<213>人(homosapiens)<220><221>misc_feature<223>變體313<220><221>misc_feature<222>(105)..(105)<223>第105位的xaa可以是ile或val<400>5metproprotyrthrvalvaltyrpheprovalargglyargcysala151015alaleuargmetleuleualaaspglnglyglnsertrplysgluglu202530valvalthrvalgluthrtrpglngluglyserleulysalasercys354045leutyrglyglnleuprolyspheglnaspglyaspleuthrleutyr505560glnserasnthrileleuarghisleuglyargthrleuglyleutyr65707580glylysaspglnglnglualaalaleuvalaspmetvalasnaspgly859095valgluaspleuargcyslystyrxaaserleuiletyrthrasntyr100105110glualaglylysaspasptyrvallysalaleuproglyglnleu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