本發(fā)明涉及生物技術(shù)領(lǐng)域,特別地,涉及一種96孔板磁珠提取口腔拭子dna的方法。
背景技術(shù):
dna提取是分子生物學(xué)的基本實(shí)驗(yàn),它是不斷發(fā)展的基因芯片檢測(cè)中最基本的方法,也是基因芯片制備、分析和診斷的前提,因此,dna提取是生物學(xué)最基礎(chǔ)的技術(shù)之一。
成功的核酸分離純化需要四個(gè)重要的步驟:組織或細(xì)胞的破碎和裂解、核蛋白復(fù)合體的變性、核酸酶的滅活以及污染物的去除,通過(guò)理想的抽提方法可以獲取高質(zhì)量的靶核酸,同時(shí)沒(méi)有蛋白、糖、脂和其它核酸污染等。
目前,常用的dna提取方法主要有玻璃珠法、超聲波法、研磨法、凍融法等物理方法,ctab法、異硫氰酸胍法、堿裂解法等化學(xué)方式,以及酶提取法等生物提取方式;根據(jù)核酸分離純化方式的不同有硅質(zhì)材料、陰離子交換樹脂提取等。其中,植物來(lái)源的dna提取方法主要有十六烷基三乙基澳化按(ctab)法、sds法和高鹽低ph法等;細(xì)菌、真菌來(lái)源的dna提取方法為堿裂解法、煮沸法、sds裂解法以及triton-溶菌酶裂解法等;動(dòng)物來(lái)源的dna最為經(jīng)典的提取方法主要有酚抽提法、異丙醇沉淀法、甲酞胺裂解法,現(xiàn)行的很多方法都是在此基礎(chǔ)上改進(jìn)得來(lái)。
口腔黏膜為復(fù)層鱗狀上皮,具有代謝旺盛、更新快、易脫落的特點(diǎn),它由多層細(xì)胞組成,基底層具有旺盛分裂能力,其上皮脫落細(xì)胞雖然細(xì)胞核固縮,但與其他組織細(xì)胞一樣具有完整的基因組dna,從而成為法醫(yī)學(xué)和遺傳學(xué)dna多態(tài)性檢測(cè)分型的生物性檢驗(yàn)材料。既往多采用酚氯仿法或chelex-100等方法,存在酚、氯仿污染或收獲率低、純度不高等缺點(diǎn)。
采用口腔拭子法(口腔脫落細(xì)胞)提取口腔上皮細(xì)胞是一種非介入、無(wú)痛苦、無(wú)創(chuàng)傷、簡(jiǎn)單的dna標(biāo)本采集方法,該方法適用于采集任何年齡段人群的dna樣本,同時(shí)也可應(yīng)用于新生兒、嬰幼兒或老弱病殘者等不便采血人群之用。
目前,口腔拭子dna的提取多采用96孔板磁珠提取,處理口腔拭子樣本時(shí),需要先將拭子頭剪下放入1.5ml左右離心管中,加入消化液及蛋白酶k,進(jìn)行細(xì)胞的裂解和酶解反應(yīng)后,再轉(zhuǎn)入96深孔板進(jìn)行后續(xù)的實(shí)驗(yàn)。一方面,兩次分步操作的方式增加了操作步驟、造成時(shí)間浪費(fèi),同時(shí)在樣品轉(zhuǎn)移的過(guò)程中,也極大的增加了混樣的風(fēng)險(xiǎn)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明提供了一種96孔板磁珠提取口腔拭子dna的方法,解決了現(xiàn)有技術(shù)中口腔拭子dna提取樣品易混樣的問(wèn)題。
為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提出了一種裂解及酶解口腔拭子dna的方法,包括如下步驟:
(1)取細(xì)胞培養(yǎng)板,按照順序一一對(duì)應(yīng)空位,將口腔拭子頭置于深孔板中;
(2)向所述細(xì)胞培養(yǎng)板中加入消化液和蛋白酶k;
(3)密封所述細(xì)胞培養(yǎng)板;
(4)將所述細(xì)胞培養(yǎng)板于振蕩器上充分混勻并水浴處理,得到dna酶解液。
所述細(xì)胞培養(yǎng)板為96孔板。
所述細(xì)胞培養(yǎng)板為96深孔板。
所述步驟(3)中,使用所述細(xì)胞培養(yǎng)板的專用膠墊進(jìn)行密封。
所述水浴處理步驟的溫度為56℃。
所述消化液為blbuffer。
所述消化液的加入量為500ul。
所述蛋白酶k的加入量為20ul。
本發(fā)明還公開(kāi)了一種96孔板磁珠提取口腔拭子dna的方法,包括如下步驟:
(a)按照所述裂解及酶解口腔拭子dna的方法,得到所述dna酶解液;
(b)將所述dna酶解液轉(zhuǎn)移到新的細(xì)胞培養(yǎng)板上,按照現(xiàn)有技術(shù)常規(guī)方法進(jìn)行后續(xù)的dna提取。
所述步驟(b)中,還包括加入磁珠進(jìn)行提取的步驟。
本發(fā)明所述96孔板磁珠提取口腔拭子dna的方法,在處理拭子樣品時(shí),直接以96深孔板為載體,并處理獲得dna酶解液,可以直接將所述dna酶解液置于新的細(xì)胞培養(yǎng)板上進(jìn)行常規(guī)后續(xù)處理,整個(gè)過(guò)程將從離心管轉(zhuǎn)移時(shí)混樣的風(fēng)險(xiǎn)降到最低,同時(shí)減少操作步驟,節(jié)省了操作時(shí)間。
附圖說(shuō)明
圖1是本發(fā)明實(shí)施例1中96孔板提取口腔拭子dna的操作示意圖;
圖2是本發(fā)明實(shí)施例1中96孔板提取口腔拭子dna的另一角度操作示意圖;
圖3是本發(fā)明對(duì)比例中單管離心管提取口腔拭子dna的操作示意圖。
具體實(shí)施方式
為使本發(fā)明的上述目的、特征和優(yōu)點(diǎn)能夠更加明顯易懂,下面結(jié)合附圖和具體實(shí)施方式對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)的說(shuō)明。
實(shí)施例1
如圖1、2所示,本實(shí)施例所述96孔板磁珠提取口腔拭子dna的方法是以96孔板進(jìn)行,包括如下步驟:
(a)口腔拭子dna的裂解及酶解,具體包括:
(1)取96深孔板為細(xì)胞培養(yǎng)板,按照《樣本提取表》的順序,一一對(duì)應(yīng)空位,使用手術(shù)剪將口腔拭子頭剪下,置于所述96深孔板中;
(2)向所述細(xì)胞培養(yǎng)板中加入500ul的消化液blbuffer和20ul的蛋白酶k;
(3)以所述96深孔板專用膠墊密封所述96深孔板;
(4)將所述96深孔板于振蕩器上充分混勻并控制56℃水浴處理,得到dna酶解液;
(b)將所述dna酶解液轉(zhuǎn)移到新的細(xì)胞培養(yǎng)板上,按照現(xiàn)有技術(shù)常規(guī)方法進(jìn)行后續(xù)的dna提取,具體包括:
(1)加入350ul無(wú)水乙醇,加入30ul磁珠,置于混勻儀上1200rpm,混勻1分鐘;靜置吸附10分鐘,并在靜置第3分鐘、第6分鐘分別混勻1次;
(2)吸附結(jié)束后,混勻磁珠,將深孔板置于磁力架上,至溶液澄清后,撕去膠墊,棄去深孔板內(nèi)上清液,注意不要觸碰到磁珠;
(3)加入600ul已加乙醇的洗滌液bw1,蓋上膠墊,置于混勻儀上1350rpm,混勻1分鐘;并將深孔板置于磁力架上,至溶液澄清后,撕去膠墊,棄去深孔板內(nèi)上清液,注意不要觸碰到磁珠;
(4)加入600ul已加乙醇的洗滌液bw1,蓋上膠墊,按照上述方法再洗滌一次;
(5)隨后加入500ul80%乙醇溶液,蓋上膠墊,按照上述方法洗滌一次;
(6)將96深孔板置于干式加熱器上,40℃烘干5分鐘;
(7)加入50ul洗脫液ce,置于混勻儀上1600rpm,混勻1分鐘,于56℃水浴孵育10分鐘進(jìn)行dna洗脫,并在第5分鐘混勻1次;
(8)孵育結(jié)束后混勻磁珠,置于磁力架上至溶液澄清,吸取上清;使用nanodrop測(cè)定濃度,將濃度填寫到《樣本濃度表》中,于-20℃保存待用。
對(duì)比例
所述對(duì)比例中提取口腔拭子dna的方法與實(shí)施例1相同,其區(qū)別僅在于,如圖3所示,所述步驟(a)中,所述裂解及酶解dna的步驟中,在處理口腔拭子樣本時(shí),先將口腔拭子頭剪下放入1.5ml左右離心管中,加入相同的消化液及蛋白酶k,在相同條件下,進(jìn)行細(xì)胞的裂解和酶解反應(yīng),得到所述dna酶解液;待消化完畢后,再轉(zhuǎn)入96深孔板中,按照現(xiàn)有技術(shù)常規(guī)方法進(jìn)行后續(xù)的dna提取,所述dna提取步驟同實(shí)施例1。
實(shí)驗(yàn)例
對(duì)上述實(shí)施例1中以96深孔板進(jìn)行操作和對(duì)比例中以現(xiàn)有單管提取口腔拭子的方法中所提取得到的dna樣本濃度和純度進(jìn)行檢測(cè)并對(duì)比,記錄數(shù)據(jù)如下表1。
表1兩種方法dna樣本濃度和純度對(duì)比
由上表可看出使用96深孔板和單管孵育樣本得到dna樣本的濃度,其純度近似,沒(méi)有顯著的差異,但本發(fā)明所述方法使用96深孔板進(jìn)行dna提取操作相比于單管提取操作能大大的減少操作的時(shí)間、且有效降低轉(zhuǎn)移時(shí)混樣的風(fēng)險(xiǎn)。
以上對(duì)本發(fā)明實(shí)施例進(jìn)行了詳細(xì)介紹,本文中應(yīng)用了具體個(gè)例對(duì)本發(fā)明的原理及實(shí)施方式進(jìn)行了闡述,以上實(shí)施例的說(shuō)明只是用于幫助理解本發(fā)明的方法及其核心思想;同時(shí),對(duì)于本領(lǐng)域的一般技術(shù)人員,依據(jù)本發(fā)明的思想,在具體實(shí)施方式及應(yīng)用范圍上均會(huì)有改變之處,綜上所述,本說(shuō)明書內(nèi)容不應(yīng)理解為對(duì)本發(fā)明的限制。