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含有FGFR,磷脂雙分子層和膜骨架蛋白MSP的類膜體系及其制備方法與流程

文檔序號:11455088閱讀:868來源:國知局
含有FGFR,磷脂雙分子層和膜骨架蛋白MSP的類膜體系及其制備方法與流程

本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,尤其是涉及含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系及其組裝方法。



背景技術(shù):

成纖維細胞生長因子受體屬于酪氨酸(fibroblastgrowthfactorreceptor,fgfrs)激酶超家族中的成員。人類fgfr家族具有四個成員,fgfr1、fgfr2、fgfr3、fgfr4。fgfr家族在生物體的生理和代謝活動中具有十分重要的功能,包括胚胎發(fā)育、受傷組織修復、血管的生成、細胞增殖、細胞遷移和細胞分化等,異常的信號通路可能會導致癌癥的發(fā)生。因此,fgfrs成為了腫瘤學中潛在的藥物靶標,研究fgfrs的信號通路、作用機制和原理對相關(guān)的疾病研究和藥物開發(fā)具有十分重要的意義。

fgfr在結(jié)構(gòu)上一般分為三個部分,膜外配體結(jié)合區(qū)、跨膜區(qū)、膜內(nèi)激酶區(qū)。在蛋白質(zhì)水平上fgfr1、fgfr2、fgfr3和fgfr4大約有55%~72%的同源序列,因此具有很高的同源性。膜外區(qū)主要包括一個疏水的信號肽段,2~3個類免疫球蛋白結(jié)構(gòu)域(d1~d3),在d1區(qū)和d2區(qū)之間有一個~30個蘇氨酸的酸盒,d2和d3結(jié)構(gòu)區(qū)是結(jié)合配體(fgf)和硫酸肝素(hpsg)的區(qū)域;跨膜區(qū)的功能是把物質(zhì)和信號從膜外區(qū)傳送到膜內(nèi)區(qū);在膜內(nèi)區(qū)的部分,靠近細胞膜的區(qū)段被稱為近膜區(qū),近膜區(qū)連接著膜內(nèi)的酪氨酸激酶區(qū)域;在膜內(nèi)區(qū)最末端是c端。體外對fgfr的研究還只限制在fgfr的單結(jié)構(gòu)域的研究,沒有在整體的結(jié)構(gòu)水平下對fgfr的功能進行研究,因此,如果能夠在體外構(gòu)建一種含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系(包括fgfr的包含跨膜區(qū),膜外配體結(jié)合區(qū),膜內(nèi)激酶區(qū)),模擬天然的fgfr的生理條件,對于真實和準確的研究fgfr的功能具有深遠的意義,同時利用所述類膜體系為fgfr的功能研究,fgfr抗體的制備及fgfr抑制劑的篩選及改造,提供了有利的工具。



技術(shù)實現(xiàn)要素:

為了解決上述問題,本發(fā)明人經(jīng)過深入研究,開發(fā)出人造的含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系及其制備方法,并在多個方面利用所述人造的含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系。

具體而言,本發(fā)明提供一種人造的含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系,所述類膜體系包含:

1)成纖維細胞生長因子受體(fibroblastgrowthfactorreceptor,fgfr),

2)磷脂雙分子層,

3)膜骨架蛋白(membranescaffoldprotein,msp),

其中,msp包裹磷脂形成磷脂雙分子層,fgfr的胞外區(qū)在磷脂雙分子層的一側(cè),fgfr的胞內(nèi)區(qū)在磷脂雙分子層的另一側(cè),fgfr的跨膜區(qū)由磷酸雙分子層包裹,并貫穿整個磷脂雙分子層。

在優(yōu)選的實施方案中,所述磷脂雙分子層是碟狀的。

在優(yōu)選的實施方案中,所述fgfr包括fgfrlc(其氨基酸序列如seqidno:1所示)、fgfr1b(其氨基酸序列如seqidno:2所示)、fgfr2c(其氨基酸序列如seqidno:3所示)、fgfr2b(其氨基酸序列如seqidno:4所示)、fgfr3c(其氨基酸序列如seqidno:5所示)、fgfr3b(其氨基酸序列如seqidno:6所示)、fgfr4(其氨基酸序列如seqidno:7所示),或在包含跨膜區(qū)的前提下與上述任意一種具有60%以上,優(yōu)選80以上,還優(yōu)選95%以上,更優(yōu)選99%以上的同源性的氨基酸序列。

在優(yōu)選的實施方案中,用于形成類膜體系的所述磷脂包括所有的磷脂,優(yōu)選選自popg(1-棕櫚酰-2-油酰-sn-甘油基-3-磷酸-(1′-rac-甘油))或popc(1-棕櫚酰-2-油酰-sn-甘油基-3-磷酸膽堿)或pope(1-十六?;?2-(9z-十八碳烯酰)-sn-甘油基-3-磷酸乙醇胺)或pops(1-棕櫚酰-2-油酰-sn-甘油基-3-磷酸-l-絲氨酸)或dopg(1,2-二-(9z-十八碳烯酰)-sn-甘油基-3-磷酸-(1′-rac-甘油))或dopc(1,2-二-(9z-十八碳烯酰)-sn-甘油基-3-磷酸膽堿)或dope(1,2-二-(9z-十八碳烯酰)-sn-甘油基-3-磷酸乙醇胺)或dops(1,2-二-(9z-十八碳烯酰)-sn-甘油基-3-磷酸-l-絲氨酸)或pi(3,4)p21-十七酰-2-(5z,8z,11z,14z-花生四烯酰)-sn-甘油基-3-磷酸-(1′-肌肉-肌醇-3′,4′-二磷酸)或pi(4,5)p2(1-十七酰-2-(5z,8z,11z,14z-花生四烯酰)-sn-甘油基-3-磷酸-(1′-肌肉-肌醇-4′,5′-二磷酸))或pi(3,4,5)p3(1-十七酰-2-(5z,8z,11z,14z-花生四烯酰)-sn-甘油基-3-磷酸-(1′-肌肉-肌醇-3′,4′,5′-三磷酸))。所述磷脂最優(yōu)選選自popg和popc,其中磷脂的組成由它們中的一種及多種按照不同比例混合。

在優(yōu)選的實施方案中,所述比例是其中一種磷脂可以是1%-100%。

在優(yōu)選的實施方案中,膜骨架蛋白msp包括msp1d1(其氨基酸序列如seqidno:8所示),msp1d1dh7-10(其氨基酸序列如seqidno:9所示),msp1d1dh5(其氨基酸序列如seqidno:10所示),或與msp序列具有70%以上,優(yōu)選80%以上,還優(yōu)選90%上,更優(yōu)選95%以上,最優(yōu)選98%以上的同源性的氨基酸序列。

在優(yōu)選的實施方案中,所述人造的含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系通過以下步驟構(gòu)建:

1)將fgfr編碼基因插入到真核表達載體中,并用真核細胞表達fgfr蛋白;

2)將純化的所述fgfr蛋白與msp,磷脂和去污劑混合;

3)去除步驟2)中多余的去污劑;

4)分離含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系。

在優(yōu)選的實施方案中,所述真核表達載體可以是哺乳動物表達載體和或昆蟲細胞表達載體。

在優(yōu)選的實施方案中,fgfr蛋白與msp,磷脂和去污劑的比例為1∶1-2:50-100∶100-200,優(yōu)選比例為為1∶1∶50∶100。

在優(yōu)選的實施方案中,其中fgfr蛋白,msp,磷脂和去污劑中任意兩種成分的可選比例是原比例的0.01-100倍,優(yōu)選比例為0.1-10倍更優(yōu)選比例為0.5-5倍,最優(yōu)選比例為0.8-2.5倍。

在優(yōu)選的實施方案中,所述去污劑選自聚乙二醇辛基苯基醚(triton)或膽酸鈉,更優(yōu)選膽酸鈉。

在優(yōu)選的實施方案中,所述磷脂選自popg、popc、pope、pops、dopg、dopc、dope、dops、dmpc、pi(3,4)p2、pi(4,5)p2、pi(3,4,5)p3或其組合,優(yōu)選為popg。

本發(fā)明還提供一種制備所述人造的含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系的方法,所述方法包括以下步驟:

1)將fgfr編碼基因插入到真核中,并用真核細胞表達fgfr蛋白;

2)將純化的所述fgfr蛋白與msp,磷脂和去污劑按照一定比例混合;

3)去除來自步驟2)中的去污劑;和

4)分離含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系。

在優(yōu)選的實施方案中,所述真核表達載體可以是哺乳動物表達載體和或昆蟲細胞表達載體。

在優(yōu)選的實施方案中,fgfr蛋白與msp,磷脂和去污劑的比例中可選比例為1∶1-2∶30-100∶100-200,優(yōu)選為1∶1∶40∶80。

在優(yōu)選的實施方案中,其中任意兩種成分的可選比例是原比例的0.01-100倍,優(yōu)選比例為0.1-10倍更優(yōu)選比例為0.5-5倍,最優(yōu)選比例為0.8-2.5倍。

在優(yōu)選的實施方案中,所述去污劑選自壬基酚聚氧乙烯醚(np-40),聚乙二醇辛基苯基醚(triton),或膽酸鈉,更優(yōu)選膽酸鈉。

在本發(fā)明中,msp是由apolipoproteina-i(apoa-i)蛋白改造得到的兩親性蛋白,其包裹磷脂形成的納米級碟狀磷脂雙分子層,進一步的,將fgfr遷入到納米盤中,其中fgfr的胞外區(qū)在納米盤的磷脂雙分子層的一側(cè),fgfr的胞內(nèi)區(qū)在納米盤的磷脂雙分子成的另一側(cè),fgfr的跨膜區(qū)由磷酸雙分子層包裹,并貫穿整個磷脂雙分子層。

需要注意的是,本領(lǐng)域技術(shù)人員知曉成纖維細胞生長因子受體酪氨酸(fgfr)家族包括fgfr1c、fgfr1b、fgfr2c、fgfr2b、fgfr3c、fgfr3b、fgfr4等7個成員,它們具有很高的同源性,都為單跨膜的膜蛋白,所以在納米盤的組裝方法上具有共性。

因此,本發(fā)明中所述的“fgfr蛋白”是指天然存在于人中的成熟fgfr蛋白,在典型的情況下,fgfr蛋白包括七種,分別是fgfr1c、fgfr1b、fgfr2c、fgfr2b、fgfr3c、fgfr3b、fgfr4,其氨基酸序列分別如seqidno:1-7所示,或在包含所述fgfr的跨膜區(qū)的前提下與seqidno:1-7具有60%以上,優(yōu)選80%以上,還優(yōu)選95%以上,更優(yōu)選99%以上的同源性的氨基酸序列。

在優(yōu)選的實施方案中,所述真核表達載體是pfastbactm1,pfastbactm-gus,pfastbactmht,pfastbactmht-cat,pfastbactmdual或pfastbactmdual-gus/cat,用藍白斑篩選法篩選出插入有目的片段,即fgfr編碼基因的表達載體。

在優(yōu)選的實施方案中,所述真核細胞是昆蟲細胞,優(yōu)選sf9或sf21細胞。

在優(yōu)選的實施方案中,通過用含有tritonx-100的裂解緩沖液裂解細胞,通過肝素層析柱進行純化,獲得fgfr蛋白。所述去污劑是本領(lǐng)域技術(shù)人員公知和常用的。

在優(yōu)選的實施方案中,步驟3)中所述的多余的去污劑用biobeads去除。

在優(yōu)選的實施方案中,步驟4)中所述分離利用分子篩進行。用于本發(fā)明的分子篩是本領(lǐng)域技術(shù)人員已知的,例如fplc分子篩(superdex20010/300gl,ge)。、

在優(yōu)選的實施方案中,磷脂(lipid)是popg或popc或pope或pops或dopg或dopc或dope或dops,或pip2或pip3或clp的一種,或是其中兩種及兩以上的混合物,其中混合比例可以是任意的。

在優(yōu)選的實施方案中,所加入的去污劑是膽酸鈉。

在優(yōu)選的實施方案中,所述msp:磷脂:膽酸鈉:fgfr1c的比例是1∶50∶100∶1。

本發(fā)明還提供所述的人造的含有磷脂雙分子層的fgfr的類膜體系用于制備抗體、藥物篩選或開發(fā)fgfr活性檢測試劑盒的用途,所述藥物優(yōu)選為fgfr抑制劑。

本發(fā)明制備的含有fgfr的納米盤(nanodisc)的主要優(yōu)點是能夠使不易溶解的蛋白如fgfr等跨膜蛋白在沒有去污劑的條件下溶解,并且使fgfr存在于一種接近天然磷脂雙分子層環(huán)境中,形成的納米盤大小均一,且尺寸可控。

附圖說明

圖1fgfr1c核酸電泳圖

圖2.fgfr1c蛋白sds-page凝膠電泳圖

圖3.msp蛋白sds-page凝膠電泳圖

圖4.fgfr1c的納米盤分子排阻層析圖

圖5.fgfr1c的納米盤的sds-page凝膠電泳圖

圖6.fgfr1c的納米盤的透射電鏡圖

圖7.fgfr1c的納米盤的磷酸化及抑制劑藥效的westernblot圖

具體實施方式

下面結(jié)合具體實施例來進一步描述本發(fā)明,本發(fā)明的優(yōu)點和特點將會隨著描述而更為清楚。但這些實施例僅是范例性的,并不對本發(fā)明的范圍構(gòu)成任何限制。本領(lǐng)域技術(shù)人員應該理解的是,在不偏離本發(fā)明的精神和范圍下可以對本發(fā)明技術(shù)方案的細節(jié)和形式進行修改或替換,但這些修改和替換均落入本發(fā)明的保護范圍內(nèi)。

實施中實驗主要試劑耗材及儀器:克隆所用引物均為上海生工合成。聚合酶鏈式反應(pcr)中dna聚合酶(primerstar)、限制性內(nèi)切酶、連接酶、dpnl均購于takara公司;dnamarker購于thermo公司;普通dna產(chǎn)物回收試劑盒、瓊脂糖凝膠回收試劑盒購于tiangen公司。e.colidh5α菌株,e.colidh10菌株,e.colibl21菌株,pet22b-sumo-fgf21質(zhì)粒,sumo蛋白酶購于北京索萊寶科技有限公司。

s.o.c培養(yǎng)基、tris、咪唑、抗生素購置于上海生工,其他鹽類購于國藥,濃縮管購于millipore。fplc儀器使用的是ge公司的系統(tǒng),使用的肝素親和層析柱,ni-sepharose層析柱和分子排阻層析柱hiload16/60superdex75pg均購于ge公司。昆蟲細胞培養(yǎng)基(sf-900tmiisfm),購自gibco。bca試劑盒購于thermo,fgfr酪氨酸磷酸化抗體購自r&d。實施例1.fgfr1c的克隆與陽性篩選

以合成的fgfr1c為模板,進行pcr擴增,所述fgfr1c的序列如seqidno:1所示。所使用的兩條引物的序列分別為:

p1:5’-cccggatccatgtggagctggaagtgcctcctc-3’(seqidno:12),

p2:5’-cgcaagcttcaagcggcgtttgagtccgccattg-3’(seqidno:13)。

在它們的兩端分別含有限制性內(nèi)切酶bamhi和hindiii的酶切位點。pcr反應條件為:94℃,5min;60℃,30s;72℃,3min,循環(huán)次數(shù)為30次,72℃,5min。瓊脂糖電泳檢測,如圖1所示。pcr產(chǎn)物純化試劑盒進行回收并將產(chǎn)物送交生工公司測序。pfastbactm1載體(購置invitrogen)與pcr擴增的fgfr1c的dna片段用限制性內(nèi)切酶bamhi和hindiii雙酶切,以獲得兩端分別為bamhi和hindiii酶切產(chǎn)生的粘性末端的pfastbactm1載體和fgfr1c(22-765)的dna片段。將它們分別用瓊脂糖電泳分離純化,紫外燈下切割含有pfastbactm1載體及fgfr1c目標片段的區(qū)域,dna小量回收試劑盒回收目標片段。瓊脂糖電泳結(jié)果估測載體和目的基因含量,將目的基因片段與載體按照摩爾比約3∶1的比例進行混合,takara連接試劑盒于16℃恒溫連接2h。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化dh5a感受態(tài)細胞,挑選轉(zhuǎn)化菌株進行菌落pcr檢測并送交生工公司測序。

取測序正確的1ngpfastbactm1-fgfrlc重組質(zhì)粒加入至100μldh10bac的感受態(tài)細胞中,冰上孵育30min,42℃熱激45s,冰上孵育2min,加入900μls.o.c培養(yǎng)基(2%蛋白胨,0.5%酵母粉,0.05%nacl2,2.5mmkcl,10mmmgcl2,20mm葡萄糖),37℃震蕩4h。用s.o.c培養(yǎng)基將細胞稀釋為原濃度的10-1,10-2,10-3,取稀釋后的溶液100μl分別涂于含有50μg/ml卡那霉素、7μg/ml慶大霉素、10μg/ml四環(huán)素、100ug/mlbluo-gal以及40μg/mliptg的lb平板中,37℃培養(yǎng)48h。取平板上的10個白色單克隆,接種于含有50μg/ml卡那霉素、7μg/ml慶大霉素、10μg/ml四環(huán)素、100μg/mlbluo-gal以及40μg/mliptg的lb培養(yǎng)基中,37℃過夜培養(yǎng)。異丙醇沉淀法提取病毒桿粒,提取方法步驟如下:

1.用離心方法收集3ml過夜培養(yǎng)的細菌,用300ul溶液1(50mm葡萄糖,25mmtris-cl,10mmedta,100ug/mlrna酶)將菌體重懸,輕輕震蕩并混合均勻。

2.將300ul溶液2(0.2mnaoh,1%sds)加入到混合均勻的菌液中,輕輕混勻,孵育3-5分鐘,溶液變的澄清,到半透明狀態(tài)。

3.緩慢加入300ul溶液3(3m醋酸鉀,ph5.5),輕輕混勻,形成白色沉淀。

4.在4℃下14000rpm離心20mins

5.輕輕將上清液轉(zhuǎn)移到含有0.9的異丙醇溶液中,混合均勻,冰上孵育20mins

6.在4℃下14000rpm離心10mins

7.去掉上清,用0.5ml的70%的乙醇溶液清洗三次。

8.室溫放置20-30分鐘完全去掉乙醇,加入40ul去離子水溶解提取的桿粒。

用pcr法檢測病毒桿粒。該pcr法中所使用的兩條引物序列分別為:

p1:5’-gcggatccatggctgtgctggtcacagccacactctgcacc-3’(seqidno:14),

p2:5’-cccaagcttttactcctggttggaggtcaaggccacgatgcg-3’(seqidno:15)。

pcr反應條件為:94℃,3min;94℃,45s;55℃,45s;72℃,3min,從第二到第4步循環(huán)次數(shù)為30次,72℃,5min。瓊脂糖凝膠電泳法檢測pcr產(chǎn)物。結(jié)果如圖1所示,pcr鑒定目的條帶在2200bp處,與理論值一致。

實施例2.fgfr1c病毒包裝

首先將2×106個sf9細胞放入t25培養(yǎng)瓶中并加入無抗體的昆蟲細胞培養(yǎng)基5ml,靜置30分鐘以上。另一方面利用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑進行轉(zhuǎn)染,將12ul的轉(zhuǎn)染試劑和2ug的桿粒(實施例1中分離的)分別放入100ul無血清無抗性的培養(yǎng)基中,孵育30分鐘后再將兩種含有2ug的桿粒的培養(yǎng)基放入含有12ul轉(zhuǎn)染試劑的培養(yǎng)基中,孵育30分鐘后將混合物滴入預先準備好的t25培養(yǎng)瓶中。培養(yǎng)4天,收集上清病毒即是第一代病毒p1,將1mlp1加入到含有1×107個細胞的t75培養(yǎng)瓶中(15-20ml昆蟲細胞培養(yǎng)基),培養(yǎng)4天,收集上清病毒即是第二代病毒p2,將1mlp2加入到含有1×107個細胞的t75培養(yǎng)瓶中(15-20ml培養(yǎng)基),培養(yǎng)4天。收集上清,即為p3代病毒,可用于表達蛋白使用。

實施例3.fgfr1c蛋白的表達

用無菌的容量2l的三角燒瓶中加入500ml的s.o.c培養(yǎng)基,并加入sf9細胞使其細胞濃度達到0.5×106個/ml,培養(yǎng)約20h,待細胞濃度達到1.0×106個/ml時,每瓶加入5mlfgfr1c的p3代病毒,繼續(xù)培養(yǎng)36-48h,收集細胞,將收集的細胞進行sds-page凝膠電泳分析其表達。

實施例4.fgfr蛋白的純化

將收集的sf9細胞按照一定比例加入裂解液,以1g細胞(濕重)加入10ml細胞裂解液(20mmtris,100mmnacl,1mmdtt,0.2%triton,0.2mmnavo3,ph7.2)裂解1h后,利用超速離心機進行離心,5萬rpm離心1h,收集上清,用肝素親和層析純化蛋白。用平衡緩沖液(20mmtris,100mmnacl,1mmdtt,0.2%triton,0.2mmnavo3)平衡肝素親和層析柱,將上清液與肝素孵育1h,進行純化,利用洗脫緩沖液(20mmtris,300mmnacl,1mmdtt,0.2%triton,0.2mmnavo3)洗脫雜蛋白,最后用緩沖液(20mmtris,1mnacl,1mmdtt,0.2%triton,0.2mmnavo3)緩沖洗脫fgfr1c蛋白,并利用sds-page凝膠電泳進行鑒定。如圖2所示。凝膠電泳中純化后fgfr條帶的分子量在9萬左右,與理論分子分子量一致。

實施例5.msp1d1dh5載體構(gòu)建

在金斯瑞公司根據(jù)msp1d1dh5氨基酸序列進行大腸桿菌表達密碼子優(yōu)化,并合成cdna,(序列如seqidno:11所示),推導的氨基酸序列如(seqidno:10)。

使用的引物包括:

正向引物:

5’-cgccatatgggtcatcatcatcatcatcatcacgattatgatattc-3’(seqidno:16),

反向引物:

5’-ccggaatccttactgggtattcagctttttagt-3’(seqidno:17)。利用引物進行msp1d1dh5基因的擴增。

將msp1d1dh5的pcr產(chǎn)物用和pet28a質(zhì)粒分別用限制性內(nèi)切酶ndei和ecori酶切。將它們分別用瓊脂糖電泳分離純化,紫外燈下切割含有pet28a載體及msp1d1dh5目標片段的區(qū)域,dna小量回收試劑盒(購置于tiangen公司)回收目標片段,按照試劑盒提供的方法進行提取。瓊脂糖電泳結(jié)果檢測載體和目的基因含量,將目的基因片段與載體按照摩爾比約3∶1的比例進行混合,takara連接試劑盒于16℃恒溫連接2h。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化dh5a感受態(tài)細胞,挑選轉(zhuǎn)化菌株進行菌落pcr檢測并送交生工公司測序。對正確的克隆進行質(zhì)粒提取,將提取的pet28a-msp1d1dh5質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到大腸桿菌bl21(de3)菌種(novagen)中,得到具有卡那霉素抗性的陽性單克隆,將其作為表達菌種存于-80℃超低溫冰箱。

實施例6.msp1d1dh5蛋白表達

實驗的具體步驟如下:

(1)從-80℃中取出保存的msp1d1dh5菌種置于冰上,取出200ul接種到含有5mllb培養(yǎng)基試管中,加入終濃度為50mg的卡那霉素,37℃過夜培養(yǎng);

(2)按1∶100(5ml)轉(zhuǎn)接至500mllb培養(yǎng)基,加入終濃度為50mg的卡那霉素,;

(3)37℃培養(yǎng)至od600達0.8-1.0之間時,加iptg250ul(終濃度為0.5m),25℃誘導表達3.5-4h,離心收集菌體。

(4)將離心沉淀存入-80℃中,誘導前后樣品需進行sds-page檢測。

實施例7.msp1d1dh5蛋白純化

pet28a-msp1d1dh5載體來源于本實驗室,其中,msp的編碼序列為seqidno:11,在msp的n端插入有6*histag以方便對目的蛋白的純化,這里msp系列蛋白我們采用的是兩步層析法,分別是ni-nta親和柱層析法和fplc分子篩層析法。實驗的具體步驟如下:

(1)超聲破碎:從-80℃中取出保存的菌液,常溫水浴融化菌液,其間要不時搖勻幾次;待完全解凍后,倒出至玻璃小燒杯中,冰浴,超聲破碎儀參數(shù)設(shè)定為工作3s,間歇4s,時長5min,反復三次;然后將細胞破碎后溶液14000rpm30min(46#轉(zhuǎn)子)離心;取出上清存4℃;超聲破碎后離心前取20ul樣品,13000rpm1min離心,其中上清加4ul6*sdsloadingbuffer制成破碎上清電泳樣品,而沉淀部分加20ul2*sdsloadingbuffer重懸制成破碎后沉淀電泳樣品,均存放于-20℃。

(2)ni-nta親和柱純化:使用前需先對ni-nta親和柱進行再生處理和緩沖液平衡處理,處理方法是:分別用0.5mnaoh,100mmedta,100mmni2so4,20%乙醇各洗2個柱體積,各個環(huán)節(jié)前后均需穿插水洗5個柱體積,以去除之前掛在柱上的雜蛋白,最后用懸菌緩沖液平衡5個柱體積;將超聲破碎離心后的上清與適量鎳填料混勻在4℃中結(jié)合大于2h;結(jié)合完成后緩慢上樣,并收集穿出液;上樣結(jié)束后用平衡緩沖液洗2個柱體積,收集沒掛到柱上的雜蛋白峰;接著分別用不斷升高咪唑濃度的梯度緩沖液進行洗脫,收集各段蛋白峰;從各洗脫峰接收管中取出20ul用于sds-page檢測,其余分別保存至4℃。

(3)濃縮:根據(jù)sds-page檢測結(jié)果對洗脫峰接收管用超濾濃縮管(10kdcutoff)進行濃縮,3000rpm4℃離心,直至濃縮至約5ml。

(4)fplc分子篩進一步純化:組建好分子篩(hiload16/60superdex75,ge),并用已抽濾的fplc平衡緩沖液平衡1個柱體積以上;將上步得到的濃縮液在4℃13000rpm離心10min,將上清液轉(zhuǎn)移至另一新的ep管中;從此管中取5ul作為sds-page電泳樣品;將剩余處理好的濃縮液進行分子篩上樣(千萬不要吸進氣泡及沉淀);進樣速度要控制好,關(guān)注柱壓;收集各峰蛋白液,并在各管中取出10ul用于sds-page電泳檢測,其余保存至4℃。

(5)二次濃縮:根據(jù)sds-page電泳檢測結(jié)果對分子篩各峰接收管用超濾濃縮管(10kdcutoff)進行濃縮,3000rpm4℃離心,直至濃縮至約1.5ml,保存至4℃。

(6)濃度測定:從最終獲得的蛋白樣品中取出5ul用分子篩緩沖液稀釋至200ul,通過紫外分光光度計測定a280吸光值;經(jīng)過計算可獲得蛋白的濃度。

實施例8.磷脂母液的制備

(1)本實驗中所購買的磷脂均為粉末,而組裝中常用磷脂母液,這樣所用磷脂均需先溶解在膽酸鈉溶液中,其母液制備過程如下:

(2)稱量所需的磷脂粉末,將其溶于氯仿溶液中,用緩慢的氮氣吹干使其平鋪于容器底部形成透明或是白色的薄膜,本實施例中稱取30mgpopc;

(3)將此容器用封口膜密封并留有少許氣孔,接著放入凍干瓶中使用真空冷凍凍干機進行凍干3-4h,以去除殘留的氯仿。

(4)往凍干過后的磷脂薄膜中加入適量的預先配置好的膽酸鈉溶液(通常膽酸鈉的濃度是磷脂濃度的兩倍),然后在旋轉(zhuǎn)搖床上低速混勻過夜即可得到磷脂母液,本實施例中加入1ml80mm的膽酸鈉溶液(20mmtris,100mmnacl,ph7.2)

(5)混勻后的磷脂母液可長時間儲存在-80℃中。

實施例9.fgfr的納米盤組裝

(1)將純化好的msp蛋白和實施例8中制備的磷脂母液按照一定的比例混合,這里mspdh5∶磷脂∶膽酸鈉∶fgfr1c的物質(zhì)的量比=1∶50∶100∶0.2;4℃孵育2h。

(2)孵育結(jié)束后,加入適量的疏水吸附劑bio-beadssm-2(bio-rad,hercules,ca)去除膽酸鈉分子;這里疏水吸附劑bio-beads的量與組裝溶液的膽酸鈉的含量成正比,通常是0.5-0.8g的bio-beads可以吸附去除過程在室溫條件下旋轉(zhuǎn)搖床中混合4-8h。

(3)混合結(jié)束后吸取上清,4℃13000rpm離心10min,通過fplc分子篩進一步純化(superdex20010/300gl,ge);如圖3所示。取峰1進行sds-pag凝膠電泳檢測后用超濾濃縮管(30kdcutoff)進行濃縮,3000rpm4℃離心。進行sds-page凝膠電泳進行分析,如圖4所示。fgfr1c,msp,同時在峰1中出現(xiàn)。

實施例10.fgfr的納米盤的電鏡表征

將純化的樣品加入磷鎢酸進行染色,并吸取10ul滴定到400目的銅網(wǎng)上進行表征,電鏡圖片清晰可見nanodiscs,如圖5所示。成功的組裝了納米盤。

實施例11.fgfr的nanodisc的磷酸化驗證

活性驗證試驗,將實施例9中的含有fgfr1c的納米盤(溶于20mmtris,100mmnacl,ph7.2)分別分裝于4個ep管中,并分別加入多韋替尼,使多韋替尼終濃度為1000nm,500nm,250nm和0nm。隨后在4個ep管中分別加入終濃度為10mmmgcl2和20μmatp在37℃反應15min,加入2倍的上樣緩沖液(20mmtris-hclph8.0,100mmdtt,2%sds,20%甘油和0.016%考馬斯亮藍),95℃加熱10min。反應之后進行westernblot,使用fgfr酪氨酸磷酸化抗體(r&d)進行驗證,如圖7所示。組裝進入納米盤中的fgfr能夠在體外自磷酸化,說明組裝之后的fgfr具有生物活性。圖7的結(jié)果還說明了組裝之后的fgfr能夠被fgfr抑制劑多韋替尼所抑制。綜上所述,含有fgfr的納米盤可以被用來做為藥物篩選,進一步地,其也可以被用來作為fgfr抗體的制備,還可以被用來作為fgfr活性檢測試劑盒的開發(fā)。

含有fgfr,磷脂雙分子層和膜骨架蛋白msp的類膜體系及其制備方法

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王俊峰

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趙宏鑫

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劉娟娟

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